# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_393 - 172 UPF0054 PF02130.12 145 9.4e-40 132.4 0.0 1 1 5.4e-43 1.1e-39 132.2 0.0 19 143 36 159 19 161 0.87 # 401026 # 401541 # 1 # ID=1_393;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.529 3_94 - 499 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.1e-96 318.2 0.0 1 1 3.4e-98 4.1e-96 317.2 0.0 1 206 192 396 192 397 0.98 # 96005 # 97501 # 1 # ID=3_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.600 2_204 - 437 Mg_chelatase PF01078.16 207 3.7e-08 29.9 0.1 1 2 1.9e-08 2.3e-06 24.1 0.0 2 44 22 69 21 91 0.79 # 261950 # 263260 # 1 # ID=2_204;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 2_204 - 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390 DNA_methylase PF00145.12 335 7.4e-72 239.4 0.0 1 2 4e-58 9.2e-56 186.5 0.0 1 197 87 290 87 305 0.90 # 142770 # 143939 # -1 # ID=5_133;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.426 5_133 - 390 DNA_methylase PF00145.12 335 7.4e-72 239.4 0.0 2 2 1.1e-17 2.4e-15 53.6 0.0 245 334 274 385 267 386 0.65 # 142770 # 143939 # -1 # ID=5_133;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.426 6_119 - 331 DNA_methylase PF00145.12 335 1.7e-69 231.6 0.0 1 1 3.4e-69 7.8e-67 222.9 0.0 1 333 1 292 1 294 0.93 # 125706 # 126698 # 1 # ID=6_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 1_8 - 394 DNA_methylase PF00145.12 335 4.6e-60 200.6 0.0 1 1 2.2e-60 5e-58 193.9 0.0 1 333 1 365 1 367 0.78 # 10052 # 11233 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_14 - 308 DNA_methylase PF00145.12 335 8.1e-05 19.0 0.0 1 1 4.4e-07 0.0001 18.7 0.0 237 331 67 194 19 198 0.68 # 25585 # 26508 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 10_33 - 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335 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 8.6e-05 19.2 0.1 1 2 0.03 3.8 4.0 0.0 37 57 23 42 7 44 0.73 # 73687 # 74691 # 1 # ID=4_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.404 4_88 - 335 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 8.6e-05 19.2 0.1 2 2 0.00015 0.019 11.5 0.0 96 132 191 221 163 239 0.72 # 73687 # 74691 # 1 # ID=4_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.404 9_30 - 306 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00019 18.0 0.0 1 1 4.1e-06 0.00052 16.6 0.0 39 132 134 221 127 234 0.78 # 38746 # 39663 # -1 # ID=9_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 3_243 - 368 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00036 17.1 0.1 1 1 1.2e-05 0.0016 15.0 0.1 38 123 198 295 168 314 0.66 # 263993 # 265096 # 1 # ID=3_243;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 2_234 - 368 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00038 17.1 0.0 1 1 5.4e-06 0.00069 16.2 0.0 34 124 179 262 171 275 0.79 # 298080 # 299183 # -1 # ID=2_234;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_71 - 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264 tRNA_Me_trans PF03054.11 356 9.9e-05 18.2 0.0 2 2 0.028 14 1.2 0.0 167 188 163 184 159 192 0.84 # 89255 # 90046 # -1 # ID=2_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.572 7_63 - 437 tRNA_Me_trans PF03054.11 356 0.0011 14.7 0.0 1 1 3.9e-06 0.002 13.9 0.0 2 70 23 88 22 92 0.78 # 63366 # 64676 # 1 # ID=7_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.533 4_25 - 145 Ribosomal_L18e PF00828.14 129 1.8e-23 80.5 4.4 1 1 1.2e-26 2.4e-23 80.1 4.4 3 126 27 142 26 144 0.85 # 11147 # 11581 # 1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 4_84 - 344 Ldh_1_N PF00056.18 141 0.0045 14.0 0.6 1 1 3.1e-05 0.032 11.2 0.0 1 45 3 43 3 68 0.75 # 67736 # 68767 # -1 # ID=4_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_110 - 335 Ldh_1_N PF00056.18 141 0.012 12.6 0.0 1 1 2e-05 0.021 11.8 0.0 2 35 2 34 1 63 0.77 # 117214 # 118218 # -1 # ID=1_110;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 36_1 - 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