# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 5_230 - 163 UPF0054 PF02130.12 145 4.4e-46 152.8 0.9 1 1 2.9e-49 5.3e-46 152.5 0.9 16 145 19 148 5 148 0.93 # 217431 # 217919 # 1 # ID=5_230;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 5_196 - 284 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 0.0009 17.2 0.0 1 1 7.1e-07 0.0013 16.7 0.0 2 201 9 197 8 213 0.49 # 181687 # 182538 # -1 # ID=5_196;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.325 6_104 - 503 Mg_chelatase PF01078.16 207 4.1e-97 320.3 0.0 1 1 3.9e-99 5.6e-97 319.9 0.0 1 205 190 394 190 396 0.99 # 123937 # 125445 # -1 # ID=6_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.368 4_157 - 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343 MobB PF03205.9 140 0.00087 16.0 0.0 1 1 2.9e-05 0.002 14.9 0.0 3 31 127 155 125 192 0.89 # 69094 # 70122 # -1 # ID=6_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.362 3_51 - 631 MobB PF03205.9 140 0.0016 15.2 3.8 1 2 0.0087 0.6 6.8 0.8 3 20 30 47 29 70 0.85 # 46571 # 48463 # -1 # ID=3_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.329 3_51 - 631 MobB PF03205.9 140 0.0016 15.2 3.8 2 2 0.0079 0.54 7.0 0.1 2 21 341 360 340 365 0.89 # 46571 # 48463 # -1 # ID=3_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.329 5_135 - 406 MobB PF03205.9 140 0.0022 14.7 0.5 1 1 0.00012 0.0079 12.9 0.1 3 98 7 99 5 138 0.69 # 115605 # 116822 # -1 # ID=5_135;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.338 5_214 - 436 MobB PF03205.9 140 0.0023 14.7 0.0 1 1 7.3e-05 0.005 13.6 0.0 1 22 202 223 202 231 0.90 # 201770 # 203077 # -1 # ID=5_214;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.338 1_389 - 214 MobB PF03205.9 140 0.0027 14.4 0.0 1 1 9.7e-05 0.0067 13.2 0.0 10 45 17 46 13 89 0.82 # 382613 # 383254 # 1 # ID=1_389;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 3_229 - 614 MobB PF03205.9 140 0.0031 14.3 2.0 1 2 0.022 1.5 5.5 0.0 2 28 31 57 30 66 0.78 # 244896 # 246737 # -1 # ID=3_229;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.328 3_229 - 614 MobB PF03205.9 140 0.0031 14.3 2.0 2 2 0.0076 0.52 7.0 0.1 3 21 342 360 341 377 0.85 # 244896 # 246737 # -1 # ID=3_229;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.328 1_123 - 439 MobB PF03205.9 140 0.0032 14.2 0.1 1 1 0.00017 0.012 12.4 0.1 2 24 38 60 37 73 0.88 # 129179 # 130495 # 1 # ID=1_123;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.364 2_183 - 941 MobB PF03205.9 140 0.0044 13.7 0.1 1 1 0.0019 0.13 9.0 0.0 4 26 638 660 635 678 0.82 # 207430 # 210252 # 1 # ID=2_183;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.354 5_216 - 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275 MobB PF03205.9 140 0.0099 12.6 0.5 1 1 0.00028 0.019 11.7 0.5 4 46 12 53 9 146 0.85 # 300148 # 300972 # -1 # ID=1_301;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 3_295 - 254 MobB PF03205.9 140 0.011 12.5 0.1 1 1 0.00039 0.026 11.2 0.1 2 21 33 52 32 55 0.88 # 314074 # 314835 # 1 # ID=3_295;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_56 - 452 MobB PF03205.9 140 0.011 12.4 0.2 1 1 0.00037 0.025 11.3 0.2 11 81 112 185 105 239 0.76 # 61775 # 63130 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_162 - 226 MobB PF03205.9 140 0.017 11.9 0.4 1 1 0.00049 0.034 10.9 0.4 3 23 29 49 27 66 0.90 # 173863 # 174540 # -1 # ID=1_162;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.314 1_299 - 268 MobB PF03205.9 140 0.023 11.4 1.0 1 1 0.0055 0.38 7.5 0.3 2 24 31 53 30 62 0.82 # 299054 # 299857 # -1 # ID=1_299;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 2_242 - 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249 Mur_ligase PF01225.20 83 0.012 12.7 0.6 2 2 0.0088 3.3 4.9 0.0 30 50 178 201 171 234 0.75 # 390083 # 390829 # -1 # ID=2_362;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.329 3_317 - 130 Ribosomal_S9 PF00380.14 121 1.1e-47 158.2 0.3 1 1 6.9e-51 1.3e-47 158.1 0.3 1 121 9 129 9 129 1.00 # 336926 # 337315 # 1 # ID=3_317;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 6_5 - 1418 RNA_pol_Rpb1_4 PF05000.12 108 5.2e-19 65.0 3.3 1 1 9.7e-22 9e-19 64.3 2.1 1 79 671 747 671 762 0.87 # 3562 # 7815 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 1_42 - 878 RNA_pol_Rpb1_4 PF05000.12 108 0.0054 13.5 0.2 1 1 2.3e-05 0.022 11.6 0.0 18 77 58 113 44 134 0.74 # 48021 # 50654 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.364 3_130 - 177 SKI PF01202.17 158 5.4e-54 179.3 0.1 1 1 2.3e-56 6.1e-54 179.2 0.1 2 156 14 169 13 171 0.97 # 134451 # 134981 # -1 # ID=3_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.348 4_70 - 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591 UvrD_C PF13361.1 351 7.5e-07 25.9 7.9 3 3 4e-07 0.00011 18.8 0.0 284 348 511 563 492 566 0.76 # 223769 # 225541 # 1 # ID=4_207;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.311 6_15 - 472 UvrD_C PF13361.1 351 0.0003 17.4 2.5 1 1 1.3e-06 0.00035 17.1 1.3 231 343 357 467 291 471 0.61 # 17299 # 18714 # -1 # ID=6_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.314 3_213 - 93 UvrD_C PF13361.1 351 0.0028 14.2 0.1 1 1 1.1e-05 0.0028 14.2 0.1 47 93 44 92 11 92 0.85 # 227357 # 227635 # -1 # ID=3_213;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 4_232 - 393 PGK PF00162.14 384 4.6e-150 496.4 1.6 1 1 2.8e-153 5.3e-150 496.2 1.6 1 384 5 378 5 378 0.99 # 247668 # 248846 # 1 # ID=4_232;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 4_224 - 248 KR PF08659.5 181 1.5e-19 67.4 0.1 1 1 1.7e-21 2.2e-19 66.9 0.1 3 156 8 161 7 190 0.86 # 239809 # 240552 # -1 # ID=4_224;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 5_63 - 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198 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.1e-17 60.2 0.0 1 1 5.8e-19 2.8e-17 59.7 0.0 1 101 25 127 25 167 0.82 # 197326 # 197919 # -1 # ID=5_209;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.337 1_44 - 748 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.5e-17 59.5 0.6 1 1 1.8e-18 8.8e-17 58.2 0.6 2 115 3 116 2 128 0.73 # 51470 # 53713 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 6_100 - 846 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.5e-09 34.1 0.1 1 1 1.8e-10 8.9e-09 32.4 0.1 2 116 349 454 348 454 0.78 # 118110 # 120647 # -1 # ID=6_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.381 5_192 - 471 MMR_HSR1 PF01926.18 116 4.1e-09 33.5 0.0 1 1 2.4e-10 1.2e-08 32.0 0.0 5 116 30 166 26 166 0.79 # 176782 # 178194 # -1 # ID=5_192;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.347 2_87 - 296 MMR_HSR1 PF01926.18 116 5.2e-09 33.1 0.6 1 2 0.063 3.1 4.8 0.1 51 104 78 132 29 158 0.63 # 100771 # 101658 # -1 # ID=2_87;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.315 2_87 - 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439 Trigger_N PF05697.8 145 3.4e-42 140.7 8.1 3 3 0.0092 17 2.2 5.2 10 93 291 383 281 429 0.74 # 210652 # 211968 # -1 # ID=5_222;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 1_222 - 100 Ribosomal_L23 PF00276.15 92 9.8e-27 89.8 0.8 1 1 5.8e-30 1.1e-26 89.7 0.8 3 88 10 95 8 99 0.94 # 232984 # 233283 # 1 # ID=1_222;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 1_397 - 936 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 1.5e-08 30.8 0.0 1 2 0.043 16 1.0 0.0 15 69 41 96 30 100 0.76 # 388115 # 390922 # -1 # ID=1_397;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.358 1_397 - 936 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 1.5e-08 30.8 0.0 2 2 5.5e-10 2e-07 27.0 0.0 245 340 563 656 554 674 0.82 # 388115 # 390922 # -1 # ID=1_397;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.358 5_125 - 814 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 8.2e-08 28.3 0.4 1 2 0.0004 0.15 7.7 0.0 32 69 42 79 15 82 0.79 # 103636 # 106077 # 1 # ID=5_125;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.329 5_125 - 814 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 8.2e-08 28.3 0.4 2 2 8.8e-07 0.00033 16.4 0.0 275 354 568 660 556 665 0.71 # 103636 # 106077 # 1 # ID=5_125;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.329 1_285 - 460 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 2.7e-07 26.6 0.6 1 2 0.00037 0.14 7.8 0.0 25 73 23 71 8 100 0.81 # 287316 # 288695 # 1 # ID=1_285;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.348 1_285 - 460 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 2.7e-07 26.6 0.6 2 2 9.3e-07 0.00035 16.4 0.1 279 319 262 302 251 342 0.85 # 287316 # 288695 # 1 # ID=1_285;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.348 1_419 - 675 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 1.8e-05 20.6 0.1 1 1 1.6e-07 5.9e-05 18.9 0.0 262 323 310 371 289 381 0.84 # 411517 # 413541 # -1 # ID=1_419;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.340 4_69 - 335 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 2.6e-05 20.0 0.0 1 2 1.9e-05 0.0071 12.0 0.0 25 47 4 26 1 60 0.80 # 68595 # 69599 # -1 # ID=4_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 4_69 - 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718 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.1e-10 37.3 0.1 3 3 4.7e-09 9.7e-07 25.4 0.0 36 144 551 656 546 692 0.84 # 39490 # 41643 # 1 # ID=5_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.305 1_286 - 315 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 6.4e-10 35.7 0.0 1 1 6.8e-12 1.4e-09 34.6 0.0 27 130 121 219 115 235 0.75 # 288699 # 289643 # 1 # ID=1_286;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 4_21 - 285 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 8.7e-07 25.5 0.0 1 1 4.8e-08 9.8e-06 22.1 0.0 42 127 115 195 100 216 0.74 # 19699 # 20553 # 1 # ID=4_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.317 2_249 - 282 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00023 17.6 0.1 1 1 2.7e-06 0.00056 16.4 0.0 34 100 138 204 131 244 0.85 # 274367 # 275212 # 1 # ID=2_249;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.323 4_51 - 242 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00035 17.0 0.0 1 1 3.1e-06 0.00064 16.2 0.0 41 136 80 181 66 191 0.74 # 50587 # 51312 # -1 # ID=4_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.303 2_129 - 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