# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 4_24 - 163 UPF0054 PF02130.12 145 7.1e-46 152.1 1.5 1 1 4.7e-49 8.5e-46 151.8 1.5 13 145 18 148 4 148 0.93 # 23891 # 24379 # 1 # ID=4_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 10_35 - 284 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 0.00019 19.4 0.0 1 1 1.4e-07 0.00025 19.0 0.0 2 208 9 204 8 213 0.53 # 29038 # 29889 # 1 # ID=10_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.330 2_55 - 503 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.7e-97 320.9 0.0 1 1 3e-99 3.9e-97 320.4 0.0 1 204 190 393 190 396 0.98 # 66595 # 68103 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.368 1_99 - 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173 MobB PF03205.9 140 0.00024 17.8 0.1 1 1 9.8e-06 0.00057 16.6 0.1 3 98 7 99 5 164 0.76 # 83667 # 84185 # -1 # ID=8_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.322 13_35 - 222 MobB PF03205.9 140 0.00028 17.6 0.4 1 1 2e-05 0.0012 15.6 0.2 2 35 9 42 8 46 0.88 # 38446 # 39111 # 1 # ID=13_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.302 12_40 - 860 MobB PF03205.9 140 0.00037 17.2 0.0 1 2 0.028 1.7 5.4 0.0 5 30 204 229 203 244 0.85 # 38539 # 41118 # -1 # ID=12_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 12_40 - 860 MobB PF03205.9 140 0.00037 17.2 0.0 2 2 0.0032 0.19 8.4 0.0 3 27 603 627 602 638 0.87 # 38539 # 41118 # -1 # ID=12_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 10_66 - 244 MobB PF03205.9 140 0.00047 16.9 0.6 1 2 0.049 2.9 4.6 0.1 2 22 33 53 32 72 0.79 # 60361 # 61092 # 1 # ID=10_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 10_66 - 244 MobB PF03205.9 140 0.00047 16.9 0.6 2 2 0.00091 0.053 10.2 0.0 17 75 178 232 177 237 0.87 # 60361 # 61092 # 1 # ID=10_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_118 - 610 MobB PF03205.9 140 0.00064 16.4 0.1 1 1 3.4e-05 0.002 14.8 0.1 2 25 399 422 398 431 0.85 # 134868 # 136697 # 1 # ID=2_118;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.344 7_29 - 594 MobB PF03205.9 140 0.00084 16.0 0.2 1 1 4.2e-05 0.0025 14.5 0.2 3 28 383 408 382 413 0.90 # 32752 # 34533 # -1 # ID=7_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.328 2_96 - 343 MobB PF03205.9 140 0.00087 16.0 0.0 1 1 3.3e-05 0.0019 14.9 0.0 3 31 127 155 125 192 0.89 # 112367 # 113395 # 1 # ID=2_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 3_32 - 214 MobB PF03205.9 140 0.0014 15.3 0.0 1 1 5.9e-05 0.0035 14.1 0.0 10 45 17 46 13 89 0.82 # 32303 # 32944 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.364 9_19 - 631 MobB PF03205.9 140 0.0019 14.9 3.5 1 2 0.0097 0.57 6.9 0.7 3 19 30 46 29 66 0.85 # 16352 # 18244 # -1 # ID=9_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.323 9_19 - 631 MobB PF03205.9 140 0.0019 14.9 3.5 2 2 0.0092 0.54 7.0 0.1 2 21 341 360 340 364 0.89 # 16352 # 18244 # -1 # ID=9_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.323 10_41 - 201 MobB PF03205.9 140 0.0022 14.7 0.0 1 1 7.9e-05 0.0046 13.7 0.0 2 34 27 59 26 98 0.91 # 35488 # 36090 # 1 # ID=10_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.308 4_9 - 436 MobB PF03205.9 140 0.0022 14.7 0.0 1 1 8.4e-05 0.0049 13.6 0.0 1 22 202 223 202 231 0.90 # 8279 # 9586 # -1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.337 5_38 - 439 MobB PF03205.9 140 0.003 14.3 0.1 1 1 0.0002 0.012 12.4 0.1 2 24 38 60 37 73 0.88 # 41195 # 42511 # -1 # ID=5_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.371 12_20 - 560 MobB PF03205.9 140 0.0032 14.1 1.9 1 2 0.022 1.3 5.7 0.2 3 21 36 54 35 59 0.88 # 19600 # 21279 # 1 # ID=12_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.379 12_20 - 560 MobB PF03205.9 140 0.0032 14.1 1.9 2 2 0.0079 0.46 7.2 0.1 2 20 354 372 353 380 0.91 # 19600 # 21279 # 1 # ID=12_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.379 4_108 - 298 MobB PF03205.9 140 0.0036 14.0 1.4 1 1 0.00053 0.031 11.0 0.1 3 25 7 29 6 93 0.84 # 111511 # 112404 # -1 # ID=4_108;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.329 7_52 - 941 MobB PF03205.9 140 0.0037 14.0 0.1 1 1 0.0019 0.11 9.2 0.0 4 27 638 661 635 682 0.81 # 58814 # 61636 # 1 # ID=7_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.356 5_29 - 261 MobB PF03205.9 140 0.0043 13.8 0.1 1 1 0.00014 0.0081 12.9 0.1 2 24 42 64 41 75 0.86 # 32490 # 33272 # 1 # ID=5_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_73 - 459 MobB PF03205.9 140 0.0066 13.1 0.1 1 2 0.014 0.83 6.3 0.0 5 32 146 173 143 234 0.80 # 85493 # 86869 # 1 # ID=2_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.386 2_73 - 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459 Zeta_toxin PF06414.7 201 5.3e-09 32.4 0.1 1 1 1.1e-10 1e-08 31.5 0.1 12 96 96 181 84 211 0.86 # 46762 # 48138 # -1 # ID=8_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.357 8_41 - 168 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.5e-08 30.9 0.1 1 1 6.3e-09 5.8e-07 25.8 0.1 16 179 2 150 1 165 0.72 # 40810 # 41313 # -1 # ID=8_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.321 2_129 - 332 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.8e-08 30.7 0.2 1 1 3.6e-10 3.3e-08 29.8 0.2 12 118 123 233 116 244 0.86 # 149344 # 150339 # 1 # ID=2_129;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.348 10_41 - 201 Zeta_toxin PF06414.7 201 3.7e-05 19.9 0.0 1 1 7.3e-07 6.6e-05 19.1 0.0 5 59 13 70 9 101 0.75 # 35488 # 36090 # 1 # ID=10_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.308 9_34 - 456 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.2e-05 19.7 0.0 1 1 1.2e-06 0.00011 18.3 0.0 4 79 40 116 37 148 0.71 # 33066 # 34433 # 1 # ID=9_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.358 7_54 - 638 Zeta_toxin PF06414.7 201 5.2e-05 19.4 0.0 1 1 1.1e-06 0.0001 18.4 0.0 15 56 194 234 183 256 0.85 # 63243 # 65156 # 1 # ID=7_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.379 12_40 - 860 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00029 17.0 0.0 1 2 0.07 6.4 2.8 0.0 17 40 200 223 185 228 0.78 # 38539 # 41118 # -1 # ID=12_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 12_40 - 860 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00029 17.0 0.0 2 2 0.00021 0.019 11.0 0.0 22 61 606 656 586 694 0.78 # 38539 # 41118 # -1 # ID=12_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 4_105 - 217 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00066 15.8 0.0 1 1 1.3e-05 0.0012 15.0 0.0 19 78 3 62 2 113 0.67 # 107541 # 108191 # 1 # ID=4_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.336 10_33 - 600 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.001 15.2 0.0 1 1 2.3e-05 0.0021 14.1 0.0 18 57 381 421 370 447 0.87 # 26261 # 28060 # -1 # ID=10_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 13_35 - 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275 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0056 12.8 0.1 1 1 0.00026 0.023 10.7 0.0 14 52 6 46 1 86 0.83 # 115117 # 115941 # 1 # ID=3_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 4_11 - 309 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0058 12.7 0.1 1 1 0.00015 0.014 11.5 0.1 20 49 7 35 2 38 0.88 # 10079 # 11005 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.337 4_99 - 177 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0088 12.1 0.0 1 1 0.00048 0.044 9.9 0.0 17 41 5 29 3 40 0.81 # 102200 # 102730 # -1 # ID=4_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.348 1_89 - 297 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.016 11.3 0.1 1 1 0.00028 0.025 10.6 0.1 69 128 9 69 2 71 0.81 # 99904 # 100794 # -1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.341 3_176 - 137 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.017 11.2 0.0 1 1 0.00033 0.03 10.4 0.0 10 44 19 54 10 59 0.76 # 165948 # 166358 # -1 # ID=3_176;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG(G)/GGAGG;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.331 1_144 - 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306 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.013 11.6 0.0 1 1 9e-05 0.027 10.5 0.0 129 187 211 271 190 296 0.82 # 31760 # 32677 # 1 # ID=13_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 3_202 - 106 TIGR01079 TIGR01079 104 1.2e-36 122.0 2.9 1 1 7.1e-40 1.3e-36 121.9 2.9 2 103 2 102 1 103 0.97 # 191177 # 191494 # -1 # ID=3_202;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.371 3_199 - 133 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 4.5e-45 149.6 0.0 1 1 2.8e-48 5e-45 149.5 0.0 1 128 5 131 5 132 0.98 # 189887 # 190285 # -1 # ID=3_199;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.353 2_130 - 741 UvrD_C PF13361.1 351 1.2e-93 311.4 10.1 1 2 0.091 24 1.2 0.9 173 230 119 206 45 239 0.56 # 150430 # 152652 # 1 # ID=2_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.337 2_130 - 741 UvrD_C PF13361.1 351 1.2e-93 311.4 10.1 2 2 4.6e-96 1.2e-93 311.4 10.1 1 350 274 627 274 628 0.95 # 150430 # 152652 # 1 # ID=2_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.337 11_14 - 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242 KR PF08659.5 181 8.3e-08 29.1 0.0 1 1 9.4e-09 1.3e-06 25.2 0.0 2 123 3 109 2 152 0.86 # 24301 # 25026 # -1 # ID=17_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.298 4_121 - 269 KR PF08659.5 181 1.1e-06 25.4 0.0 1 1 3e-08 4.2e-06 23.5 0.0 3 154 9 163 8 170 0.79 # 129224 # 130030 # 1 # ID=4_121;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.361 1_121 - 579 KR PF08659.5 181 1.2e-06 25.3 0.0 1 1 7e-08 9.7e-06 22.3 0.0 2 135 263 382 263 391 0.77 # 132301 # 134037 # -1 # ID=1_121;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.336 1_117 - 335 KR PF08659.5 181 4e-05 20.3 0.0 1 1 5.2e-07 7.2e-05 19.5 0.0 3 76 12 80 11 106 0.79 # 128675 # 129679 # -1 # ID=1_117;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 10_9 - 204 KR PF08659.5 181 7.4e-05 19.5 0.2 1 2 0.0047 0.66 6.6 0.1 4 26 5 27 3 40 0.80 # 6587 # 7198 # 1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.335 10_9 - 204 KR PF08659.5 181 7.4e-05 19.5 0.2 2 2 0.00022 0.031 10.9 0.0 59 161 41 141 36 148 0.86 # 6587 # 7198 # 1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.335 3_92 - 241 KR PF08659.5 181 0.00013 18.6 0.1 1 1 3.2e-06 0.00045 16.9 0.1 2 98 4 89 3 173 0.77 # 89784 # 90506 # -1 # ID=3_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 4_88 - 253 KR PF08659.5 181 0.0013 15.4 0.0 1 1 1.3e-05 0.0018 14.9 0.0 31 164 35 171 24 190 0.82 # 89591 # 90349 # 1 # ID=4_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.315 2_154 - 1418 RNA_pol_Rpb1_5 PF04998.12 277 2.9e-71 236.9 2.0 1 1 1.7e-74 3.1e-71 236.8 0.3 1 276 763 1309 763 1310 0.99 # 177735 # 181988 # 1 # ID=2_154;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.367 9_39 - 467 Thi4 PF01946.12 230 2.3e-07 27.1 1.2 1 2 1.1e-07 1.2e-05 21.5 0.2 18 61 5 47 2 60 0.87 # 37340 # 38740 # 1 # ID=9_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 9_39 - 467 Thi4 PF01946.12 230 2.3e-07 27.1 1.2 2 2 0.045 5.1 3.1 0.0 12 48 158 194 148 198 0.84 # 37340 # 38740 # 1 # ID=9_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 15_26 - 412 Thi4 PF01946.12 230 3.6e-06 23.2 0.1 1 1 6e-08 6.8e-06 22.3 0.1 14 49 4 39 1 81 0.88 # 26390 # 27625 # 1 # ID=15_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 1_176 - 471 Thi4 PF01946.12 230 5.7e-06 22.5 2.4 1 2 1.9e-06 0.00022 17.4 0.2 16 60 4 48 1 73 0.85 # 198052 # 199464 # -1 # ID=1_176;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 1_176 - 471 Thi4 PF01946.12 230 5.7e-06 22.5 2.4 2 2 0.014 1.5 4.8 0.1 19 47 177 205 161 214 0.85 # 198052 # 199464 # -1 # ID=1_176;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 2_188 - 397 Thi4 PF01946.12 230 1.3e-05 21.4 0.2 1 1 2.9e-07 3.3e-05 20.1 0.1 14 56 4 46 1 63 0.83 # 212877 # 214067 # -1 # ID=2_188;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.354 2_82 - 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