# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_442 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 3e-42 141.5 0.0 1 1 8.6e-46 3.5e-42 141.2 0.0 21 145 29 152 16 152 0.89 # 526421 # 526906 # 1 # ID=3_442;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.650 7_283 - 530 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 7e-17 60.9 5.8 1 1 6.9e-20 7e-17 60.9 5.8 1 212 282 470 282 473 0.60 # 345556 # 347145 # -1 # ID=7_283;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.665 2_239 - 268 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 7.9e-11 41.2 6.4 1 1 7.8e-14 7.9e-11 41.2 6.4 4 214 5 202 2 204 0.65 # 275906 # 276709 # 1 # ID=2_239;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.677 4_266 - 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659 Torsin PF06309.6 127 0.046 11.7 0.0 1 1 4.5e-05 0.092 10.8 0.0 49 83 484 518 453 550 0.84 # 728510 # 730486 # -1 # ID=1_589;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 3_223 - 590 ABC_ATPase PF09818.4 448 3.6e-05 20.7 0.0 1 2 0.013 4.5 3.8 0.0 237 264 366 393 359 397 0.83 # 276515 # 278284 # -1 # ID=3_223;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 3_223 - 590 ABC_ATPase PF09818.4 448 3.6e-05 20.7 0.0 2 2 1.4e-05 0.0047 13.7 0.0 295 353 456 515 448 573 0.86 # 276515 # 278284 # -1 # ID=3_223;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 2_547 - 590 ABC_ATPase PF09818.4 448 9.4e-05 19.3 0.7 1 1 4e-07 0.00014 18.7 0.1 296 394 459 556 448 573 0.79 # 637166 # 638935 # -1 # ID=2_547;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.685 5_247 - 278 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00023 18.0 0.0 1 2 0.026 8.9 2.9 0.0 248 265 39 56 35 61 0.83 # 299790 # 300623 # -1 # ID=5_247;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 5_247 - 278 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00023 18.0 0.0 2 2 2.4e-05 0.008 12.9 0.0 324 366 140 182 131 212 0.87 # 299790 # 300623 # -1 # ID=5_247;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 6_185 - 592 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0003 17.6 0.0 1 2 0.02 6.8 3.3 0.0 227 265 350 392 333 398 0.75 # 182082 # 183857 # -1 # ID=6_185;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.654 6_185 - 592 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0003 17.6 0.0 2 2 4.2e-05 0.014 12.1 0.0 304 352 462 511 448 514 0.90 # 182082 # 183857 # -1 # ID=6_185;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.654 3_450 - 378 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00095 16.0 0.3 1 2 0.00021 0.07 9.8 0.0 240 265 40 66 35 70 0.92 # 534315 # 535448 # -1 # ID=3_450;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 3_450 - 378 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00095 16.0 0.3 2 2 0.024 8.2 3.0 0.1 382 413 194 225 145 248 0.62 # 534315 # 535448 # -1 # ID=3_450;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 4_61 - 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407 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.8e-24 84.9 6.8 1 3 4.2e-16 3.5e-14 51.3 0.0 3 145 5 136 3 142 0.84 # 350980 # 352200 # 1 # ID=3_287;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.678 3_287 - 407 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.8e-24 84.9 6.8 2 3 2.2e-05 0.0019 16.3 0.4 1 33 145 177 145 193 0.87 # 350980 # 352200 # 1 # ID=3_287;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.678 3_287 - 407 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.8e-24 84.9 6.8 3 3 3.9e-06 0.00033 18.7 1.4 137 198 215 280 199 282 0.84 # 350980 # 352200 # 1 # ID=3_287;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.678 6_63 - 431 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 4.3e-24 83.6 0.0 1 1 2.1e-25 1.7e-23 81.7 0.0 2 199 12 309 11 311 0.88 # 68878 # 70170 # -1 # ID=6_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.696 10_54 - 438 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 3.9e-21 74.0 0.2 1 1 6.2e-23 5.2e-21 73.6 0.2 1 199 9 295 9 297 0.86 # 63515 # 64828 # 1 # ID=10_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.705 5_25 - 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478 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 4.4e-08 31.4 0.0 1 1 2.1e-09 1.8e-07 29.4 0.0 2 160 18 251 17 339 0.71 # 127529 # 128962 # -1 # ID=3_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.649 7_169 - 462 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.9e-07 28.7 0.0 1 1 4.9e-09 4.1e-07 28.2 0.0 1 51 26 76 26 182 0.76 # 187254 # 188639 # 1 # ID=7_169;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.657 3_215 - 421 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 3.9e-07 28.3 0.0 1 1 4.8e-08 4e-06 25.0 0.0 1 123 8 172 8 192 0.71 # 266473 # 267735 # 1 # ID=3_215;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.648 5_274 - 394 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.1e-06 26.8 0.4 1 1 9.3e-08 7.7e-06 24.0 0.5 1 139 8 189 8 258 0.74 # 326835 # 328016 # 1 # ID=5_274;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.692 3_253 - 404 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.4e-06 26.4 0.3 1 2 0.0004 0.033 12.2 0.7 2 31 31 60 30 110 0.78 # 316969 # 318180 # 1 # ID=3_253;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.644 3_253 - 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536 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.2e-05 23.4 0.0 1 1 4.9e-07 4.1e-05 21.7 0.0 1 34 56 89 56 105 0.87 # 838541 # 840148 # -1 # ID=1_681;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 10_52 - 426 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 4.9e-05 21.4 0.2 1 1 9.2e-07 7.7e-05 20.8 0.2 1 30 60 89 60 158 0.84 # 62003 # 63280 # 1 # ID=10_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.719 6_187 - 395 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 6.5e-05 21.0 0.0 1 1 1.3e-06 0.00011 20.3 0.0 1 41 23 64 23 121 0.86 # 185095 # 186279 # -1 # ID=6_187;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.628 1_106 - 417 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 7.7e-05 20.8 1.0 1 2 0.00013 0.011 13.8 0.8 1 30 7 36 7 68 0.83 # 126186 # 127436 # -1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.679 1_106 - 417 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 7.7e-05 20.8 1.0 2 2 0.061 5.1 5.0 0.0 63 125 207 260 169 282 0.69 # 126186 # 127436 # -1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.679 3_233 - 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233 Ubie_methyltran PF01209.13 233 1.8e-09 35.2 0.0 1 1 8.3e-12 2.6e-09 34.7 0.0 44 153 42 150 32 159 0.87 # 811783 # 812481 # 1 # ID=2_705;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.687 2_703 - 281 Ubie_methyltran PF01209.13 233 1.8e-07 28.6 0.0 1 1 7.9e-10 2.5e-07 28.2 0.0 10 150 23 162 13 171 0.84 # 809696 # 810538 # 1 # ID=2_703;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.670 4_86 - 389 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.00045 17.5 0.1 1 1 4.5e-06 0.0014 15.9 0.1 43 96 211 262 200 334 0.82 # 102745 # 103911 # -1 # ID=4_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.643 1_81 - 309 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.0016 15.7 0.0 1 1 7.8e-06 0.0024 15.1 0.0 44 104 126 185 118 190 0.83 # 90732 # 91658 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.658 5_309 - 287 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.0031 14.8 0.0 1 1 1.5e-05 0.0046 14.2 0.0 46 118 111 181 102 185 0.84 # 361439 # 362299 # 1 # ID=5_309;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.705 5_191 - 348 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.0045 14.2 0.0 1 1 6.1e-05 0.019 12.2 0.0 127 171 223 267 203 275 0.89 # 225997 # 227040 # 1 # ID=5_191;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.675 4_151 - 246 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.0053 14.0 0.1 1 1 2.2e-05 0.0068 13.7 0.1 56 161 37 147 20 175 0.82 # 189510 # 190247 # -1 # ID=4_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 1_112 - 279 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.017 12.4 0.0 1 1 7.5e-05 0.024 11.9 0.0 46 153 88 192 69 214 0.86 # 131843 # 132679 # -1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 2_16 - 106 TIGR01079 TIGR01079 104 2.4e-32 109.3 6.0 1 1 6.6e-36 2.7e-32 109.1 6.0 2 103 3 102 2 103 0.97 # 7673 # 7990 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.616 2_19 - 133 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 4.2e-47 157.3 0.1 1 1 1.1e-50 4.7e-47 157.2 0.1 1 128 5 131 5 132 0.99 # 9074 # 9472 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 7_222 - 724 UvrD_C PF13361.1 351 4e-97 323.9 0.0 1 1 5e-100 5.1e-97 323.6 0.0 2 350 274 616 273 617 0.97 # 262337 # 264508 # -1 # ID=7_222;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 11_51 - 659 UvrD_C PF13361.1 351 9.1e-83 276.7 0.0 1 1 4.8e-85 4.9e-82 274.3 0.0 1 350 269 603 269 604 0.93 # 67441 # 69417 # -1 # ID=11_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 4_53 - 1351 UvrD_C PF13361.1 351 4e-38 129.9 0.0 1 1 2e-39 2.1e-36 124.2 0.0 3 347 508 894 507 896 0.79 # 58265 # 62317 # -1 # ID=4_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 4_52 - 827 UvrD_C PF13361.1 351 0.024 12.2 0.0 1 1 4.1e-05 0.042 11.4 0.0 291 348 726 771 722 774 0.82 # 55687 # 58167 # -1 # ID=4_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.735 1_607 - 392 PGK PF00162.14 384 2.7e-142 472.0 0.0 1 1 7.5e-146 3.1e-142 471.8 0.0 2 384 6 378 5 378 0.99 # 751966 # 753141 # -1 # ID=1_607;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.668 7_157 - 244 KR PF08659.5 181 1.8e-28 97.6 6.7 1 1 3.3e-30 2.8e-28 96.9 6.7 4 174 9 180 7 192 0.87 # 178532 # 179263 # -1 # ID=7_157;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.657 3_406 - 247 KR PF08659.5 181 1.3e-27 94.7 0.3 1 1 2.5e-29 2.1e-27 94.1 0.3 3 168 6 171 5 185 0.88 # 483659 # 484399 # 1 # ID=3_406;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.644 1_741 - 247 KR PF08659.5 181 1.4e-18 65.3 1.0 1 1 2.2e-20 1.9e-18 64.9 1.0 5 172 8 177 5 188 0.91 # 925952 # 926692 # 1 # ID=1_741;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 4_150 - 300 KR PF08659.5 181 4.8e-18 63.6 8.0 1 1 9.9e-20 8.4e-18 62.8 8.0 3 166 5 174 4 186 0.85 # 188551 # 189450 # -1 # ID=4_150;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.691 2_153 - 248 KR PF08659.5 181 9.5e-18 62.6 5.1 1 1 1.7e-19 1.4e-17 62.0 4.5 3 165 10 170 9 189 0.80 # 152233 # 152976 # 1 # ID=2_153;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.653 4_44 - 248 KR PF08659.5 181 2.5e-16 58.0 4.9 1 1 1.2e-17 1.1e-15 56.0 4.8 2 165 9 167 8 178 0.90 # 48164 # 48907 # 1 # ID=4_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 6_151 - 261 KR PF08659.5 181 3.3e-15 54.3 4.4 1 1 5.7e-17 4.9e-15 53.8 4.4 3 165 19 176 18 187 0.91 # 149560 # 150342 # -1 # ID=6_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.640 1_62 - 267 KR PF08659.5 181 5.1e-15 53.7 0.8 1 1 8.8e-17 7.5e-15 53.2 0.8 4 162 9 167 7 181 0.85 # 70013 # 70813 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.680 3_34 - 245 KR PF08659.5 181 2.9e-14 51.3 0.4 1 1 4.5e-16 3.8e-14 50.9 0.4 2 157 15 164 14 182 0.84 # 39226 # 39960 # -1 # ID=3_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 4_151 - 246 KR PF08659.5 181 4.9e-14 50.5 5.9 1 1 7.5e-16 6.3e-14 50.2 5.9 2 165 7 169 6 184 0.83 # 189510 # 190247 # -1 # ID=4_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 3_259 - 253 KR PF08659.5 181 6.8e-13 46.8 6.6 1 1 1.4e-14 1.2e-12 46.0 6.6 3 162 4 160 3 173 0.90 # 322040 # 322798 # 1 # ID=3_259;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 6_190 - 289 KR PF08659.5 181 2.1e-12 45.2 0.0 1 1 3.2e-14 2.7e-12 44.8 0.0 4 125 48 168 46 205 0.85 # 189101 # 189967 # -1 # ID=6_190;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 6_74 - 259 KR PF08659.5 181 2.3e-12 45.1 1.1 1 1 3.4e-14 2.9e-12 44.7 1.1 2 161 12 173 11 192 0.83 # 82701 # 83477 # 1 # ID=6_74;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 2_520 - 244 KR PF08659.5 181 2.7e-12 44.8 0.9 1 1 4.7e-14 4e-12 44.3 0.9 3 104 7 104 6 154 0.76 # 606479 # 607210 # 1 # ID=2_520;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 3_35 - 255 KR PF08659.5 181 6.1e-12 43.7 2.6 1 1 1.1e-13 9.1e-12 43.1 2.6 3 175 15 185 14 190 0.81 # 39957 # 40721 # -1 # ID=3_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 4_21 - 278 KR PF08659.5 181 6.8e-12 43.5 5.1 1 1 1.3e-13 1.1e-11 42.8 5.1 2 166 4 165 4 177 0.88 # 26060 # 26893 # 1 # ID=4_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.691 7_23 - 252 KR PF08659.5 181 9.5e-12 43.1 3.1 1 1 1.4e-13 1.2e-11 42.7 3.1 2 166 4 166 3 184 0.83 # 23172 # 23927 # 1 # ID=7_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.680 8_98 - 253 KR PF08659.5 181 1.3e-11 42.7 3.9 1 1 2.3e-13 2e-11 42.0 3.9 3 165 11 169 10 185 0.86 # 113368 # 114126 # -1 # ID=8_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 9_68 - 257 KR PF08659.5 181 1.3e-11 42.6 10.1 1 1 4.7e-13 4e-11 41.0 10.1 4 153 9 166 7 191 0.87 # 99318 # 100088 # 1 # ID=9_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 1_31 - 248 KR PF08659.5 181 1.8e-11 42.2 3.8 1 1 3.2e-13 2.7e-11 41.6 3.8 2 164 17 182 16 191 0.83 # 37664 # 38407 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.699 5_117 - 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712 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.9e-14 51.6 0.7 2 2 5.9e-14 1.7e-11 42.0 0.0 38 128 547 634 542 658 0.84 # 708199 # 710334 # 1 # ID=2_610;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.675 4_86 - 389 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 8e-11 39.8 0.0 1 1 4.5e-13 1.3e-10 39.1 0.0 35 139 209 309 206 324 0.86 # 102745 # 103911 # -1 # ID=4_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.643 2_361 - 445 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 3.9e-06 24.5 0.0 1 1 2.4e-08 7e-06 23.7 0.0 43 123 298 376 286 393 0.84 # 426147 # 427481 # 1 # ID=2_361;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.661 5_309 - 287 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.9e-05 22.2 0.0 1 1 1.1e-07 3.1e-05 21.6 0.0 41 126 111 191 102 199 0.83 # 361439 # 362299 # 1 # ID=5_309;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.705 8_188 - 307 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 9.7e-05 20.0 0.0 1 1 5.7e-07 0.00017 19.2 0.0 36 98 164 227 158 241 0.85 # 213171 # 214091 # -1 # ID=8_188;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.686 2_705 - 233 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0003 18.3 0.0 1 1 1.5e-06 0.00044 17.8 0.0 37 78 40 81 33 99 0.88 # 811783 # 812481 # 1 # ID=2_705;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.687 1_81 - 309 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00088 16.8 0.0 1 1 8e-06 0.0023 15.5 0.0 35 129 124 211 112 223 0.77 # 90732 # 91658 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.658 6_145 - 234 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0013 16.2 0.0 1 2 0.00048 0.14 9.6 0.0 96 131 5 38 1 75 0.77 # 143548 # 144249 # 1 # ID=6_145;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.648 6_145 - 234 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0013 16.2 0.0 2 2 0.022 6.3 4.3 0.0 43 56 189 202 180 230 0.86 # 143548 # 144249 # 1 # ID=6_145;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.648 6_243 - 356 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0026 15.3 0.0 1 1 1.8e-05 0.0052 14.3 0.0 48 127 211 286 198 313 0.82 # 245510 # 246577 # 1 # ID=6_243;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.686 1_210 - 317 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0056 14.2 0.0 1 1 8e-05 0.023 12.2 0.0 106 151 184 230 114 242 0.66 # 250250 # 251200 # 1 # ID=1_210;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.690 7_239 - 213 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.01 13.4 0.0 1 1 4.8e-05 0.014 12.9 0.0 25 107 54 136 41 152 0.78 # 283849 # 284487 # -1 # ID=7_239;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.706 2_579 - 332 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.012 13.2 0.0 1 1 9e-05 0.026 12.0 0.0 41 118 146 215 133 246 0.84 # 674390 # 675385 # -1 # ID=2_579;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 2_95 - 291 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.018 12.6 0.1 1 1 0.00027 0.078 10.5 0.0 105 129 179 203 166 223 0.77 # 99215 # 100087 # -1 # ID=2_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.506 2_190 - 515 Eco57I PF07669.6 106 0.023 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.047 12.2 0.0 4 103 261 362 259 365 0.77 # 203991 # 205535 # -1 # ID=2_190;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 2_741 - 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252 Epimerase PF01370.16 236 8.4e-06 23.5 0.1 1 1 1.4e-07 1.1e-05 23.1 0.1 1 121 5 142 5 159 0.72 # 23172 # 23927 # 1 # ID=7_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.680 4_408 - 293 Epimerase PF01370.16 236 1.3e-05 22.9 1.9 1 1 2.7e-07 2.2e-05 22.1 0.2 1 73 8 79 8 132 0.74 # 488519 # 489397 # -1 # ID=4_408;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.689 3_259 - 253 Epimerase PF01370.16 236 1.5e-05 22.7 1.3 1 1 4.2e-07 3.4e-05 21.5 1.3 1 79 4 89 4 245 0.84 # 322040 # 322798 # 1 # ID=3_259;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 2_335 - 264 Epimerase PF01370.16 236 8.6e-05 20.2 0.0 1 1 1.7e-06 0.00014 19.5 0.0 1 116 11 145 11 151 0.72 # 389537 # 390328 # 1 # ID=2_335;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 5_117 - 246 Epimerase PF01370.16 236 0.00011 19.8 0.9 1 1 5.2e-06 0.00042 17.9 0.9 1 100 8 106 8 179 0.51 # 141928 # 142665 # -1 # ID=5_117;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.686 8_12 - 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259 Epimerase PF01370.16 236 0.00039 18.1 0.1 1 1 1e-05 0.00082 17.0 0.1 1 155 13 176 13 213 0.73 # 82701 # 83477 # 1 # ID=6_74;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 7_258 - 257 Epimerase PF01370.16 236 0.00039 18.0 0.2 1 1 1.1e-05 0.00088 16.9 0.2 10 103 27 122 18 187 0.77 # 304275 # 305045 # 1 # ID=7_258;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.665 2_201 - 301 Epimerase PF01370.16 236 0.00047 17.8 0.1 1 1 8.6e-06 0.0007 17.2 0.1 1 123 58 199 58 249 0.70 # 220429 # 221331 # -1 # ID=2_201;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 2_185 - 238 Epimerase PF01370.16 236 0.00069 17.2 0.1 1 1 2.1e-05 0.0017 16.0 0.1 1 71 9 81 9 176 0.68 # 198637 # 199350 # -1 # ID=2_185;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.686 6_151 - 261 Epimerase PF01370.16 236 0.0007 17.2 0.8 1 1 3.7e-05 0.003 15.1 0.8 1 63 19 83 19 190 0.69 # 149560 # 150342 # -1 # ID=6_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.640 4_44 - 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682 Plug PF07715.10 108 3.8e-16 57.5 0.2 1 1 1.2e-17 7.8e-16 56.5 0.2 4 107 47 154 44 155 0.97 # 144576 # 146621 # -1 # ID=5_120;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.639 4_142 - 886 Plug PF07715.10 108 1.3e-15 55.8 1.0 1 1 5e-17 3.3e-15 54.5 1.0 2 108 74 179 73 179 0.92 # 176228 # 178885 # -1 # ID=4_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.675 7_200 - 963 Plug PF07715.10 108 1.4e-15 55.6 3.4 1 1 2.3e-17 1.5e-15 55.6 1.1 6 108 153 260 148 260 0.93 # 238455 # 241343 # 1 # ID=7_200;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.669 2_171 - 909 Plug PF07715.10 108 2.2e-15 55.0 0.2 1 1 1.2e-16 7.8e-15 53.3 0.2 2 108 28 146 27 146 0.95 # 178759 # 181485 # 1 # ID=2_171;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.625 1_339 - 1053 Plug PF07715.10 108 2.2e-15 55.0 0.9 1 1 1.1e-16 7.2e-15 53.4 0.9 2 107 68 186 67 187 0.93 # 387499 # 390657 # -1 # ID=1_339;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.626 1_578 - 979 Plug PF07715.10 108 2.8e-15 54.7 1.8 1 1 1.7e-16 1.1e-14 52.7 1.8 2 104 61 170 60 174 0.90 # 705146 # 708082 # -1 # ID=1_578;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.619 1_626 - 905 Plug PF07715.10 108 5.7e-15 53.7 4.8 1 1 3.3e-16 2.2e-14 51.8 1.8 4 108 54 165 51 165 0.91 # 772074 # 774788 # 1 # ID=1_626;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.624 10_3 - 925 Plug PF07715.10 108 7.9e-15 53.3 3.1 1 1 1.6e-16 1.1e-14 52.8 0.9 2 106 69 172 68 174 0.95 # 2773 # 5547 # -1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.630 1_397 - 891 Plug PF07715.10 108 1.6e-14 52.3 2.3 1 1 2.4e-16 1.6e-14 52.3 0.3 3 108 62 173 60 173 0.92 # 464416 # 467088 # 1 # ID=1_397;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 11_30 - 978 Plug PF07715.10 108 1.9e-14 52.0 0.5 1 1 2.8e-16 1.9e-14 52.0 0.5 3 104 73 180 71 185 0.90 # 38199 # 41132 # 1 # ID=11_30;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.641 5_141 - 890 Plug PF07715.10 108 2.7e-14 51.6 0.3 1 1 4e-16 2.7e-14 51.6 0.3 2 108 92 204 91 204 0.96 # 169431 # 172100 # 1 # ID=5_141;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_183 - 794 Plug PF07715.10 108 5.5e-14 50.6 0.0 1 1 4.2e-15 2.8e-13 48.3 0.0 2 106 56 166 55 167 0.86 # 217238 # 219619 # 1 # ID=1_183;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.641 1_485 - 799 Plug PF07715.10 108 8.7e-14 49.9 2.3 1 1 1.3e-15 8.7e-14 49.9 2.3 4 102 58 166 56 173 0.86 # 585026 # 587422 # 1 # ID=1_485;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_305 - 790 Plug PF07715.10 108 2.5e-13 48.5 4.8 1 1 1e-14 7e-13 47.0 0.3 2 108 78 189 77 189 0.94 # 351844 # 354213 # 1 # ID=2_305;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_342 - 898 Plug PF07715.10 108 2.7e-13 48.3 0.4 1 1 1.5e-14 1e-12 46.5 0.4 3 101 85 181 83 188 0.90 # 401682 # 404375 # -1 # ID=2_342;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.644 3_99 - 888 Plug PF07715.10 108 5.3e-13 47.4 3.1 1 1 9.8e-15 6.5e-13 47.1 1.1 8 108 76 171 70 171 0.94 # 114598 # 117261 # 1 # ID=3_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 4_90 - 767 Plug PF07715.10 108 5.5e-13 47.3 1.6 1 1 2.2e-14 1.5e-12 45.9 1.6 6 93 50 145 47 161 0.79 # 108060 # 110360 # -1 # ID=4_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.633 4_243 - 733 Plug PF07715.10 108 9.5e-13 46.6 0.3 1 1 1.4e-14 9.5e-13 46.6 0.3 2 103 64 157 63 162 0.93 # 302340 # 304538 # 1 # ID=4_243;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 2_773 - 907 Plug PF07715.10 108 1.5e-12 46.0 1.9 1 1 2.2e-14 1.5e-12 46.0 1.9 2 107 78 179 77 180 0.90 # 884699 # 887419 # 1 # ID=2_773;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.624 4_212 - 927 Plug PF07715.10 108 1.5e-11 42.7 1.7 1 1 4.6e-13 3.1e-11 41.7 0.5 6 106 66 174 62 176 0.82 # 256187 # 258967 # 1 # ID=4_212;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.645 1_682 - 765 Plug PF07715.10 108 1.8e-11 42.4 1.0 1 1 6.6e-13 4.4e-11 41.2 1.0 6 99 61 160 58 170 0.82 # 840218 # 842512 # -1 # ID=1_682;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.633 2_168 - 739 Plug PF07715.10 108 1.9e-11 42.4 0.2 1 1 1.3e-12 8.8e-11 40.2 0.1 3 108 53 162 51 162 0.92 # 169410 # 171626 # 1 # ID=2_168;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_56 - 778 Plug PF07715.10 108 2.3e-11 42.1 1.0 1 1 9.3e-13 6.2e-11 40.7 1.0 5 98 64 165 61 176 0.81 # 46969 # 49302 # -1 # ID=2_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 5_123 - 886 Plug PF07715.10 108 2.5e-11 42.0 0.4 1 1 4.6e-12 3.1e-10 38.5 0.0 5 108 71 169 67 169 0.92 # 149515 # 152172 # 1 # ID=5_123;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 1_673 - 1061 Plug PF07715.10 108 2.9e-11 41.8 3.1 1 1 1.9e-12 1.3e-10 39.7 3.1 7 108 133 236 128 236 0.83 # 827226 # 830408 # -1 # ID=1_673;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 1_98 - 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