# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_226 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 4.3e-43 144.3 0.0 1 1 1.2e-46 5e-43 144.1 0.0 21 145 29 152 16 152 0.89 # 253201 # 253686 # 1 # ID=3_226;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.665 17_24 - 691 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 5.1e-07 29.0 7.6 1 1 3.5e-10 5.1e-07 29.0 7.6 34 206 472 640 445 681 0.77 # 26297 # 28369 # 1 # ID=17_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.708 39_16 - 348 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 1.5e-06 27.5 1.6 1 1 1e-09 1.5e-06 27.5 1.6 2 208 117 303 116 311 0.58 # 13570 # 14613 # -1 # ID=39_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.575 1_22 - 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188 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.0022 15.6 0.0 2 2 0.0041 2.5 5.6 0.0 104 156 93 145 76 181 0.67 # 85430 # 85993 # -1 # ID=19_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.640 3_170 - 636 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.0097 13.5 0.2 1 2 0.0085 5.3 4.6 0.0 3 24 36 57 35 71 0.85 # 191104 # 193011 # -1 # ID=3_170;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.647 3_170 - 636 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.0097 13.5 0.2 2 2 0.0026 1.6 6.3 0.0 3 24 347 368 346 373 0.87 # 191104 # 193011 # -1 # ID=3_170;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.647 5_39 - 659 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.01 13.4 0.0 1 1 3e-05 0.019 12.6 0.0 3 27 495 519 493 527 0.88 # 44907 # 46883 # 1 # ID=5_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.659 18_54 - 535 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.014 13.0 0.2 1 1 4.4e-05 0.027 12.1 0.2 3 29 335 361 335 367 0.90 # 68374 # 69978 # -1 # ID=18_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.708 4_87 - 459 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.016 12.8 0.0 1 1 2.6e-05 0.016 12.8 0.0 3 28 107 133 105 175 0.93 # 90752 # 92128 # -1 # ID=4_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.654 15_37 - 180 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.035 11.7 0.0 1 1 0.0002 0.12 9.9 0.0 3 20 21 38 19 44 0.90 # 48923 # 49462 # -1 # ID=15_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.672 4_129 - 351 GTP1_OBG PF01018.17 156 5.7e-66 219.2 8.8 1 1 1.7e-69 7.6e-66 218.8 8.8 1 156 3 158 3 158 0.99 # 145957 # 147009 # -1 # ID=4_129;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.655 6_87 - 761 Torsin PF06309.6 127 0.0063 14.6 0.0 1 1 1.1e-05 0.024 12.8 0.0 16 76 452 514 442 531 0.84 # 113595 # 115877 # -1 # ID=6_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 15_37 - 180 Torsin PF06309.6 127 0.013 13.6 0.0 1 2 3.2e-05 0.07 11.2 0.0 46 77 7 38 3 85 0.77 # 48923 # 49462 # -1 # ID=15_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.672 15_37 - 180 Torsin PF06309.6 127 0.013 13.6 0.0 2 2 0.062 1.3e+02 0.6 0.0 49 67 84 102 53 109 0.76 # 48923 # 49462 # -1 # ID=15_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.672 3_11 - 590 ABC_ATPase PF09818.4 448 1.2e-05 22.3 0.0 1 2 0.012 4.7 3.9 0.0 236 264 365 393 358 396 0.83 # 12686 # 14455 # -1 # ID=3_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 3_11 - 590 ABC_ATPase PF09818.4 448 1.2e-05 22.3 0.0 2 2 3.9e-06 0.0015 15.4 0.0 295 353 456 515 448 566 0.87 # 12686 # 14455 # -1 # ID=3_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 2_302 - 280 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00027 17.9 0.0 1 2 0.023 9 2.9 0.0 249 265 42 58 38 64 0.82 # 351379 # 352218 # -1 # ID=2_302;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 2_302 - 280 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00027 17.9 0.0 2 2 2.5e-05 0.01 12.7 0.0 324 366 142 184 134 217 0.87 # 351379 # 352218 # -1 # ID=2_302;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 14_59 - 265 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0006 16.7 0.1 1 2 3.7e-05 0.015 12.1 0.0 240 265 29 55 25 59 0.92 # 73643 # 74437 # 1 # ID=14_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.703 14_59 - 265 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0006 16.7 0.1 2 2 0.035 14 2.3 0.0 355 411 164 217 163 220 0.76 # 73643 # 74437 # 1 # ID=14_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.703 25_21 - 589 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00096 16.0 0.1 1 1 5.6e-06 0.0022 14.8 0.1 301 354 463 517 449 573 0.79 # 22792 # 24558 # -1 # ID=25_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.687 5_8 - 205 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0014 15.5 0.0 1 2 0.00021 0.082 9.7 0.0 245 277 24 59 2 64 0.75 # 9393 # 10007 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.647 5_8 - 205 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0014 15.5 0.0 2 2 0.013 5.1 3.7 0.0 320 354 127 161 123 179 0.85 # 9393 # 10007 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.647 3_236 - 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611 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1e-38 131.5 11.2 2 3 6.2e-07 5.9e-05 21.2 0.8 2 123 311 414 310 419 0.79 # 86617 # 88449 # 1 # ID=2_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.662 2_85 - 611 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1e-38 131.5 11.2 3 3 8.8e-13 8.4e-11 40.3 0.0 164 199 419 455 415 457 0.90 # 86617 # 88449 # 1 # ID=2_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.662 1_347 - 457 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 3.7e-38 129.6 0.4 1 1 5.2e-40 5e-38 129.2 0.4 1 196 8 311 8 315 0.95 # 410898 # 412268 # 1 # ID=1_347;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 25_24 - 479 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 5.8e-33 112.7 19.9 1 1 1.8e-33 1.7e-31 107.9 19.9 1 200 6 328 6 329 0.93 # 26116 # 27552 # -1 # ID=25_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.653 2_362 - 530 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 9.2e-33 112.0 0.0 1 1 9.7e-34 9.4e-32 108.7 0.0 1 199 214 491 214 493 0.90 # 410060 # 411649 # -1 # ID=2_362;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.645 8_26 - 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862 MobB PF03205.9 140 0.034 12.1 0.2 1 1 0.031 3.4 5.6 0.1 4 27 531 554 529 561 0.84 # 227665 # 230250 # -1 # ID=4_197;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.672 5_153 - 433 MobB PF03205.9 140 0.035 12.0 0.0 1 1 0.0011 0.11 10.4 0.0 9 35 17 43 9 46 0.91 # 182993 # 184291 # 1 # ID=5_153;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.694 53_1 - 418 MobB PF03205.9 140 0.041 11.8 0.0 1 1 0.00083 0.09 10.7 0.0 4 25 42 63 40 82 0.88 # 1 # 1254 # 1 # ID=53_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.602 39_3 - 292 MobB PF03205.9 140 0.044 11.7 0.1 1 1 0.0013 0.14 10.1 0.0 3 42 4 42 2 47 0.84 # 805 # 1680 # 1 # ID=39_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 17_17 - 211 MobB PF03205.9 140 0.044 11.7 0.0 1 1 0.00084 0.091 10.7 0.0 2 38 3 39 2 62 0.84 # 19945 # 20577 # 1 # ID=17_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.679 17_7 - 246 MobB PF03205.9 140 0.058 11.3 0.1 1 1 0.00095 0.1 10.5 0.1 2 21 29 48 28 51 0.90 # 6208 # 6945 # 1 # ID=17_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.696 25_4 - 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1052 Plug PF07715.10 108 1.1e-15 56.1 1.0 1 1 5.5e-17 3.4e-15 54.5 1.0 2 107 67 185 66 186 0.93 # 138590 # 141745 # 1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 6_4 - 683 Plug PF07715.10 108 1.2e-15 56.0 0.7 1 1 4.2e-17 2.7e-15 54.9 0.7 5 107 48 154 44 155 0.96 # 3574 # 5622 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 24_7 - 888 Plug PF07715.10 108 2e-15 55.2 1.4 1 1 8e-17 5e-15 54.0 1.4 2 108 76 181 75 181 0.94 # 8759 # 11422 # 1 # ID=24_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.687 5_49 - 979 Plug PF07715.10 108 3.3e-15 54.6 1.5 1 1 1.9e-16 1.2e-14 52.8 1.5 2 106 61 171 60 174 0.90 # 65165 # 68101 # 1 # ID=5_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 18_5 - 921 Plug PF07715.10 108 6e-15 53.7 2.8 1 1 1.8e-16 1.1e-14 52.9 0.9 2 106 65 168 64 170 0.95 # 6559 # 9321 # -1 # ID=18_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.645 5_4 - 905 Plug PF07715.10 108 7e-15 53.5 4.3 1 1 1.8e-16 1.1e-14 52.8 2.0 4 108 54 165 51 165 0.90 # 2565 # 5279 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 29_24 - 981 Plug PF07715.10 108 1.4e-14 52.6 0.6 1 1 2.2e-16 1.4e-14 52.6 0.6 3 104 76 183 74 188 0.90 # 29079 # 32021 # -1 # ID=29_24;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 1_44 - 914 Plug PF07715.10 108 2.8e-14 51.6 0.3 1 1 4.4e-16 2.8e-14 51.6 0.3 3 108 66 177 64 177 0.92 # 62656 # 65397 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 7_57 - 899 Plug PF07715.10 108 2.9e-14 51.5 0.3 1 1 4.6e-16 2.9e-14 51.5 0.3 2 108 101 213 100 213 0.96 # 62238 # 64934 # 1 # ID=7_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.626 1_265 - 793 Plug PF07715.10 108 6.9e-14 50.3 0.0 1 1 4.7e-15 3e-13 48.3 0.0 2 106 55 165 54 166 0.86 # 311889 # 314267 # -1 # ID=1_265;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 5_181 - 803 Plug PF07715.10 108 9.3e-14 49.9 2.3 1 1 1.5e-15 9.3e-14 49.9 2.3 4 102 62 170 60 177 0.86 # 222975 # 225383 # -1 # ID=5_181;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 6_63 - 892 Plug PF07715.10 108 2.1e-13 48.8 0.8 1 1 3.3e-15 2.1e-13 48.8 0.8 9 108 82 176 74 176 0.94 # 80142 # 82817 # -1 # ID=6_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 32_2 - 739 Plug PF07715.10 108 2.9e-13 48.3 1.2 1 1 3.7e-14 2.3e-12 45.4 0.3 2 103 65 158 64 163 0.93 # 382 # 2598 # -1 # ID=32_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 12_110 - 1039 Plug PF07715.10 108 7.4e-13 47.0 3.2 1 1 1.2e-14 7.4e-13 47.0 3.2 5 108 73 192 71 192 0.94 # 126141 # 129257 # 1 # ID=12_110;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 14_89 - 772 Plug PF07715.10 108 8.8e-13 46.8 1.8 1 1 1.4e-14 8.8e-13 46.8 1.8 6 93 55 150 52 166 0.79 # 111108 # 113423 # -1 # ID=14_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.639 9_40 - 912 Plug PF07715.10 108 9.5e-13 46.7 2.0 1 1 1.5e-14 9.5e-13 46.7 2.0 2 107 78 179 77 180 0.90 # 52730 # 55465 # -1 # ID=9_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.611 23_59 - 895 Plug PF07715.10 108 1e-12 46.5 0.3 1 1 5.2e-14 3.3e-12 44.9 0.3 6 101 85 178 80 185 0.89 # 59177 # 61861 # 1 # ID=23_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_102 - 790 Plug PF07715.10 108 1.2e-12 46.3 0.3 1 1 2e-14 1.2e-12 46.3 0.3 2 108 78 189 77 189 0.94 # 108502 # 110871 # -1 # ID=4_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 34_12 - 923 Plug PF07715.10 108 5.3e-12 44.2 0.5 1 1 3.4e-13 2.2e-11 42.3 0.5 6 106 66 174 62 176 0.82 # 13506 # 16274 # 1 # ID=34_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.653 11_54 - 775 Plug PF07715.10 108 6.1e-12 44.1 1.0 1 1 2.9e-13 1.8e-11 42.5 1.0 5 98 61 162 58 173 0.81 # 44470 # 46794 # -1 # ID=11_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.644 13_37 - 842 Plug PF07715.10 108 1.5e-11 42.8 0.3 1 1 7.3e-13 4.6e-11 41.2 0.3 3 106 69 176 67 178 0.89 # 41402 # 43927 # -1 # ID=13_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.654 11_143 - 739 Plug PF07715.10 108 1.9e-11 42.5 0.1 1 1 1.1e-12 6.7e-11 40.7 0.1 3 108 53 162 51 162 0.92 # 137528 # 139744 # 1 # ID=11_143;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 7_38 - 885 Plug PF07715.10 108 1.9e-11 42.5 1.0 1 1 2.5e-12 1.6e-10 39.5 0.1 5 108 70 168 66 168 0.92 # 40622 # 43276 # 1 # ID=7_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.638 9_41 - 971 Plug PF07715.10 108 2.9e-11 41.9 0.4 1 1 4.6e-13 2.9e-11 41.9 0.4 2 107 75 185 74 186 0.90 # 55803 # 58715 # -1 # ID=9_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.633 33_10 - 795 Plug PF07715.10 108 1e-10 40.1 0.2 1 1 3.6e-12 2.3e-10 39.0 0.2 3 108 60 172 58 172 0.94 # 13099 # 15483 # -1 # ID=33_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 19_63 - 764 Plug PF07715.10 108 3.3e-10 38.5 1.4 1 1 1.5e-11 9.3e-10 37.0 1.4 6 99 60 159 48 169 0.82 # 70297 # 72588 # -1 # ID=19_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 1_316 - 1035 Plug PF07715.10 108 6.9e-10 37.4 2.4 1 1 1.1e-11 6.9e-10 37.4 2.4 4 108 148 248 146 248 0.88 # 373000 # 376104 # -1 # ID=1_316;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.624 1_353 - 1016 Plug PF07715.10 108 1.3e-09 36.6 4.9 1 1 2.1e-11 1.3e-09 36.6 4.9 4 108 138 242 136 242 0.86 # 420960 # 424007 # -1 # ID=1_353;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 2_204 - 723 Plug PF07715.10 108 1.7e-09 36.2 0.4 1 1 6.4e-11 4e-09 35.0 0.4 3 107 64 161 62 162 0.94 # 233263 # 235431 # -1 # ID=2_204;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.664 19_54 - 606 Plug PF07715.10 108 3.4e-09 35.2 2.6 1 1 5.4e-11 3.4e-09 35.2 2.6 7 107 130 232 124 233 0.82 # 59284 # 61101 # -1 # ID=19_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 14_91 - 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