# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 5_74 - 172 UPF0054 PF02130.12 145 2.9e-40 134.2 0.0 1 1 1.5e-43 3.3e-40 134.0 0.0 19 143 36 159 19 161 0.89 # 82517 # 83032 # -1 # ID=5_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.529 16_39 - 499 Mg_chelatase PF01078.16 207 4.7e-96 317.1 0.0 1 1 6.2e-98 9.9e-96 316.1 0.0 1 206 192 396 192 397 0.98 # 40712 # 42208 # -1 # ID=16_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.591 6_27 - 437 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.8e-08 30.4 0.1 1 2 1.6e-08 2.6e-06 24.0 0.0 2 48 22 69 21 101 0.78 # 25622 # 26932 # 1 # ID=6_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 6_27 - 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588 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.4e-09 34.6 0.0 2 2 0.00015 0.019 12.1 0.0 62 198 137 390 117 392 0.76 # 12093 # 13856 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 7_3 - 420 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.2e-08 31.5 0.1 1 2 2.1e-07 2.6e-05 21.5 0.2 1 36 2 37 2 53 0.91 # 3613 # 4872 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 7_3 - 420 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.2e-08 31.5 0.1 2 2 0.005 0.62 7.2 0.0 62 124 199 259 171 269 0.75 # 3613 # 4872 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 19_20 - 462 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.6e-08 31.2 0.1 1 1 3.8e-10 4.7e-08 30.4 0.1 1 37 73 109 73 234 0.92 # 15801 # 17186 # -1 # ID=19_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 7_23 - 632 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 4.4e-07 27.2 0.6 1 1 1e-08 1.3e-06 25.7 0.6 1 119 11 159 11 174 0.64 # 24779 # 26674 # -1 # ID=7_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 43_9 - 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190 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.6e-50 167.6 0.0 1 1 1.9e-52 3e-50 167.4 0.0 1 181 13 182 13 184 0.91 # 1008 # 1577 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 20_23 - 316 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.1e-09 34.3 0.0 1 1 2.1e-11 3.4e-09 33.6 0.0 41 138 149 248 140 268 0.85 # 23013 # 23960 # 1 # ID=20_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 9_4 - 363 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 4.2e-06 23.5 0.0 1 1 1.2e-07 1.9e-05 21.4 0.0 17 125 177 297 168 314 0.68 # 2995 # 4083 # -1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 42_3 - 296 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.5e-05 21.8 0.0 1 1 6.9e-07 0.00011 18.9 0.0 35 92 156 213 151 230 0.86 # 927 # 1814 # -1 # ID=42_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 8_29 - 274 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 4.4e-05 20.2 0.0 1 1 4.2e-07 6.7e-05 19.6 0.0 22 127 85 182 68 191 0.79 # 29021 # 29842 # -1 # ID=8_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 15_37 - 336 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 5.1e-05 20.0 0.1 1 2 0.0013 0.2 8.3 0.0 36 92 21 81 13 104 0.69 # 38058 # 39065 # -1 # ID=15_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 15_37 - 336 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 5.1e-05 20.0 0.1 2 2 0.0006 0.094 9.4 0.1 105 126 212 228 179 237 0.71 # 38058 # 39065 # -1 # ID=15_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 2_135 - 304 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 9.8e-05 19.1 0.0 1 1 1.2e-06 0.00018 18.2 0.0 49 139 116 205 106 242 0.86 # 131860 # 132771 # 1 # ID=2_135;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.565 28_3 - 304 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00034 17.3 0.0 1 1 6.3e-06 0.00099 15.8 0.0 39 128 132 215 125 230 0.80 # 1137 # 2048 # 1 # ID=28_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.469 31_21 - 122 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00085 16.0 0.0 1 1 6.1e-06 0.00096 15.8 0.0 34 124 7 90 1 105 0.76 # 20917 # 21282 # -1 # ID=31_21;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.574 15_38 - 334 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0014 15.3 0.0 1 1 1.4e-05 0.0022 14.7 0.0 45 124 6 82 2 140 0.82 # 39058 # 40059 # -1 # ID=15_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 47_1 - 251 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0015 15.2 0.0 1 1 1.3e-05 0.002 14.8 0.0 68 134 108 181 74 216 0.68 # 537 # 1289 # -1 # ID=47_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.595 25_14 - 599 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0016 15.1 0.1 1 1 0.00025 0.04 10.6 0.0 97 128 41 73 24 83 0.70 # 16845 # 18641 # -1 # ID=25_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.461 23_26 - 126 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.013 12.2 0.0 1 1 0.0001 0.016 11.8 0.0 111 127 9 25 2 52 0.78 # 27494 # 27871 # -1 # ID=23_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.418 7_20 - 208 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.021 11.5 0.0 1 1 0.00019 0.03 11.0 0.0 44 100 70 125 54 145 0.79 # 21885 # 22508 # 1 # ID=7_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.588 6_33 - 534 Eco57I PF07669.6 106 2.4e-09 34.8 0.4 1 1 1.2e-11 9e-09 32.9 0.4 2 103 293 413 292 416 0.82 # 33058 # 34659 # 1 # ID=6_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_154 - 515 Eco57I PF07669.6 106 0.0025 15.4 0.0 1 1 4.7e-05 0.035 11.8 0.0 3 104 295 407 290 409 0.78 # 146598 # 148142 # 1 # ID=1_154;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 8_29 - 274 Eco57I PF07669.6 106 0.03 12.0 0.0 1 1 6.8e-05 0.05 11.3 0.0 2 20 169 186 168 199 0.80 # 29021 # 29842 # -1 # ID=8_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 4_28 - 314 IPPT PF01715.12 253 1.5e-84 280.2 0.0 1 1 8.4e-88 1.9e-84 279.9 0.0 2 245 39 286 38 292 0.97 # 27074 # 28015 # 1 # ID=4_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.587 8_50 - 474 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 1.1e-127 422.5 0.0 1 1 1.9e-129 8.3e-127 419.7 0.0 3 300 16 329 14 330 0.93 # 48961 # 50382 # -1 # ID=8_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.565 5_3 - 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