# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_230 - 146 UPF0054 PF02130.12 145 4e-32 107.6 0.2 1 1 2.4e-35 4.8e-32 107.4 0.2 35 144 21 122 5 123 0.91 # 234233 # 234670 # -1 # ID=2_230;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 5_66 - 502 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.3e-75 249.4 0.0 1 1 4.1e-77 6.8e-75 247.9 0.0 1 203 200 401 200 405 0.97 # 68318 # 69823 # 1 # ID=5_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.450 14_4 - 411 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.1e-07 27.5 0.1 1 2 1.9e-06 0.00033 17.0 0.1 22 46 108 132 91 147 0.86 # 5172 # 6404 # -1 # ID=14_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.424 14_4 - 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411 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00046 16.8 0.0 1 1 7e-06 0.00089 15.9 0.0 47 68 108 129 98 132 0.92 # 5172 # 6404 # -1 # ID=14_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.424 1_310 - 617 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00065 16.3 0.0 1 1 1.3e-05 0.0017 15.0 0.0 36 81 116 161 92 180 0.88 # 320730 # 322580 # 1 # ID=1_310;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.447 1_152 - 559 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00091 15.8 0.1 1 1 2e-05 0.0025 14.4 0.1 48 71 194 217 187 231 0.89 # 161678 # 163354 # -1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 2_63 - 673 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00095 15.8 0.0 1 2 0.0011 0.14 8.7 0.0 46 80 233 267 214 271 0.85 # 63370 # 65388 # -1 # ID=2_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 2_63 - 673 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00095 15.8 0.0 2 2 0.045 5.7 3.4 0.0 46 63 466 483 451 502 0.81 # 63370 # 65388 # -1 # ID=2_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 12_42 - 453 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0023 14.5 0.2 1 2 0.0014 0.18 8.3 0.0 47 62 248 263 245 282 0.77 # 42858 # 44216 # 1 # ID=12_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.424 12_42 - 453 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0023 14.5 0.2 2 2 0.035 4.5 3.8 0.1 98 132 317 351 297 372 0.87 # 42858 # 44216 # 1 # ID=12_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.424 12_28 - 337 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0032 14.0 0.2 1 1 0.00013 0.017 11.7 0.2 49 117 54 112 43 133 0.72 # 31425 # 32435 # 1 # ID=12_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 14_9 - 227 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0036 13.9 0.0 1 2 0.0015 0.19 8.2 0.0 38 67 17 47 10 90 0.83 # 9623 # 10303 # -1 # ID=14_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 14_9 - 227 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0036 13.9 0.0 2 2 0.041 5.2 3.6 0.0 98 147 151 199 145 210 0.83 # 9623 # 10303 # -1 # ID=14_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 3_88 - 255 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0058 13.2 0.0 1 1 7.3e-05 0.0092 12.5 0.0 12 86 18 95 10 98 0.81 # 86344 # 87108 # -1 # ID=3_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 11_47 - 246 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.006 13.2 0.1 1 2 0.013 1.6 5.2 0.0 42 63 24 44 4 53 0.77 # 45688 # 46425 # 1 # ID=11_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.381 11_47 - 246 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.006 13.2 0.1 2 2 0.0085 1.1 5.8 0.0 109 153 160 205 121 211 0.77 # 45688 # 46425 # 1 # ID=11_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.381 2_152 - 261 MipZ PF09140.6 261 1.4e-15 54.2 1.1 1 1 3.3e-17 1.7e-14 50.7 1.1 2 150 4 170 3 177 0.70 # 158448 # 159230 # 1 # ID=2_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.395 9_59 - 367 MipZ PF09140.6 261 5.6e-08 29.3 0.0 1 1 1.7e-10 8.5e-08 28.7 0.0 2 119 97 224 96 258 0.66 # 57684 # 58784 # 1 # ID=9_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.453 12_43 - 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218 ABC_tran PF00005.22 137 6.6e-30 101.4 0.0 1 1 2.2e-31 8.9e-30 100.9 0.0 1 137 17 158 17 158 0.85 # 24836 # 25489 # -1 # ID=7_23;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 1_32 - 259 ABC_tran PF00005.22 137 3.8e-29 98.9 0.0 1 1 1.6e-30 6.3e-29 98.2 0.0 2 137 19 167 18 167 0.92 # 32829 # 33605 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 1_159 - 247 ABC_tran PF00005.22 137 5.9e-29 98.3 0.0 1 1 2.1e-30 8.5e-29 97.8 0.0 2 136 21 169 20 170 0.89 # 170203 # 170943 # -1 # ID=1_159;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.408 7_45 - 231 ABC_tran PF00005.22 137 7.4e-29 97.9 0.0 1 1 3e-30 1.2e-28 97.3 0.0 1 137 21 151 21 151 0.87 # 44788 # 45480 # -1 # ID=7_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 14_8 - 250 ABC_tran PF00005.22 137 8e-29 97.8 0.4 1 1 3.2e-30 1.3e-28 97.2 0.4 1 137 28 172 28 172 0.94 # 8877 # 9626 # -1 # ID=14_8;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 6_122 - 318 ABC_tran PF00005.22 137 1.5e-26 90.5 0.0 1 1 1.7e-27 6.7e-26 88.4 0.0 4 137 20 158 17 158 0.88 # 114120 # 115073 # -1 # ID=6_122;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.418 2_127 - 943 ABC_tran PF00005.22 137 3.3e-20 69.9 0.3 1 3 2.9e-06 0.00012 19.6 0.0 1 28 15 42 15 65 0.93 # 130603 # 133431 # 1 # ID=2_127;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.438 2_127 - 943 ABC_tran PF00005.22 137 3.3e-20 69.9 0.3 2 3 0.011 0.42 8.1 0.0 102 135 477 512 430 514 0.81 # 130603 # 133431 # 1 # ID=2_127;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.438 2_127 - 943 ABC_tran PF00005.22 137 3.3e-20 69.9 0.3 3 3 2.5e-11 9.8e-10 36.0 0.2 2 136 617 853 616 854 0.85 # 130603 # 133431 # 1 # ID=2_127;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.438 14_9 - 227 ABC_tran PF00005.22 137 4.1e-20 69.6 0.0 1 1 1.3e-21 5.3e-20 69.3 0.0 1 137 17 172 17 172 0.88 # 9623 # 10303 # -1 # ID=14_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 1_290 - 113 ABC_tran PF00005.22 137 4.5e-14 50.1 0.1 1 1 1.8e-15 7e-14 49.5 0.1 81 136 8 62 2 63 0.88 # 301693 # 302031 # 1 # ID=1_290;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 2_33 - 463 ABC_tran PF00005.22 137 8.4e-07 26.5 1.0 1 2 0.00036 0.014 12.8 0.1 12 80 2 87 1 198 0.74 # 35530 # 36918 # -1 # ID=2_33;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 2_33 - 463 ABC_tran PF00005.22 137 8.4e-07 26.5 1.0 2 2 0.00052 0.021 12.3 0.1 12 42 198 228 192 311 0.74 # 35530 # 36918 # -1 # ID=2_33;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_22 - 204 ABC_tran PF00005.22 137 1.5e-05 22.4 0.1 1 1 2.3e-06 9e-05 19.9 0.0 10 37 2 29 1 77 0.87 # 25765 # 26376 # 1 # ID=4_22;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 2_63 - 673 ABC_tran PF00005.22 137 2.8e-05 21.6 1.5 1 2 0.00073 0.029 11.8 0.1 4 66 227 287 224 365 0.78 # 63370 # 65388 # -1 # ID=2_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 2_63 - 673 ABC_tran PF00005.22 137 2.8e-05 21.6 1.5 2 2 0.012 0.49 7.8 0.0 9 80 465 545 461 583 0.66 # 63370 # 65388 # -1 # ID=2_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 3_232 - 507 ABC_tran PF00005.22 137 3.7e-05 21.2 5.4 1 2 3.2e-05 0.0013 16.2 1.8 2 80 14 110 13 233 0.65 # 221115 # 222635 # -1 # ID=3_232;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.396 3_232 - 507 ABC_tran PF00005.22 137 3.7e-05 21.2 5.4 2 2 0.071 2.8 5.4 0.1 53 125 309 403 274 421 0.57 # 221115 # 222635 # -1 # ID=3_232;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.396 2_275 - 387 ABC_tran PF00005.22 137 5e-05 20.8 0.0 1 1 3.3e-06 0.00013 19.4 0.0 14 122 129 260 123 267 0.59 # 282081 # 283241 # 1 # ID=2_275;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 12_42 - 453 ABC_tran PF00005.22 137 6.2e-05 20.5 0.2 1 1 7e-05 0.0028 15.1 0.0 9 51 246 294 242 378 0.62 # 42858 # 44216 # 1 # ID=12_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.424 5_58 - 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321 K_oxygenase PF13434.1 341 4.1e-10 36.2 0.4 3 3 0.054 22 0.9 0.0 288 338 207 251 201 254 0.78 # 192549 # 193511 # -1 # ID=1_180;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 1_250 - 380 K_oxygenase PF13434.1 341 4.6e-05 19.6 0.0 1 2 7e-06 0.0028 13.7 0.0 180 238 5 63 1 72 0.88 # 260363 # 261502 # 1 # ID=1_250;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 1_250 - 380 K_oxygenase PF13434.1 341 4.6e-05 19.6 0.0 2 2 0.014 5.7 2.9 0.0 301 340 286 325 246 326 0.82 # 260363 # 261502 # 1 # ID=1_250;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 3_72 - 447 K_oxygenase PF13434.1 341 6.8e-05 19.1 0.0 1 2 0.014 5.9 2.8 0.0 3 36 3 35 1 38 0.77 # 71911 # 73251 # -1 # ID=3_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 3_72 - 447 K_oxygenase PF13434.1 341 6.8e-05 19.1 0.0 2 2 8.7e-06 0.0035 13.4 0.0 131 232 114 205 94 221 0.77 # 71911 # 73251 # -1 # ID=3_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 5_31 - 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463 TIGR03263 TIGR03263 180 7.7e-08 29.0 0.1 2 2 3.7e-05 0.025 11.0 0.0 8 60 204 258 199 271 0.85 # 35530 # 36918 # -1 # ID=2_33;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 2_127 - 943 TIGR03263 TIGR03263 180 0.012 12.0 0.1 1 2 0.001 0.69 6.4 0.0 2 37 26 63 25 71 0.73 # 130603 # 133431 # 1 # ID=2_127;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.438 2_127 - 943 TIGR03263 TIGR03263 180 0.012 12.0 0.1 2 2 0.012 8 2.9 0.0 3 22 628 647 626 658 0.72 # 130603 # 133431 # 1 # ID=2_127;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.438 2_304 - 284 THF_DHG_CYH_C PF02882.14 161 7.5e-73 240.1 3.3 1 1 1.1e-75 1.1e-72 239.5 3.3 1 159 121 278 121 280 0.99 # 311929 # 312780 # -1 # ID=2_304;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.445 4_7 - 248 THF_DHG_CYH_C PF02882.14 161 0.011 11.9 0.0 1 1 2.3e-05 0.023 10.9 0.0 33 96 2 63 1 84 0.79 # 12335 # 13078 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_157 - 506 ATP-synt_ab PF00006.20 215 9.1e-75 248.0 0.1 1 1 5e-77 1.4e-74 247.3 0.1 1 215 150 366 150 366 0.99 # 161691 # 163208 # 1 # ID=2_157;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.418 5_60 - 436 ATP-synt_ab PF00006.20 215 1.4e-66 221.3 0.0 1 1 6.2e-69 1.8e-66 220.9 0.0 2 215 145 354 144 354 0.98 # 62820 # 64127 # -1 # ID=5_60;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 2_159 - 466 ATP-synt_ab PF00006.20 215 2.5e-66 220.4 0.0 1 1 1.2e-68 3.4e-66 220.0 0.0 1 215 131 345 131 345 0.97 # 164117 # 165514 # 1 # ID=2_159;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 3_56 - 448 ATP-synt_ab PF00006.20 215 9.2e-42 140.1 0.0 1 1 5e-44 1.5e-41 139.4 0.0 4 214 189 393 186 394 0.96 # 60387 # 61730 # 1 # ID=3_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 11_47 - 246 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.00073 16.2 0.0 1 1 4.7e-06 0.0014 15.3 0.0 11 33 24 46 17 93 0.88 # 45688 # 46425 # 1 # ID=11_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.381 1_280 - 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369 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 3.8e-05 20.3 0.0 1 2 0.02 6.8 3.2 0.0 42 56 44 58 36 60 0.81 # 80426 # 81532 # -1 # ID=8_69;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 8_69 - 369 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 3.8e-05 20.3 0.0 2 2 6.4e-06 0.0022 14.6 0.0 95 129 225 255 197 269 0.64 # 80426 # 81532 # -1 # ID=8_69;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 3_10 - 368 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0011 15.6 0.1 1 1 1.2e-05 0.0041 13.7 0.1 29 109 197 275 186 342 0.81 # 12439 # 13542 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.408 2_73 - 389 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0013 15.3 0.0 1 1 8.3e-06 0.0028 14.2 0.0 43 124 3 91 1 100 0.84 # 73765 # 74931 # 1 # ID=2_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.293 5_78 - 242 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0034 13.9 0.0 1 1 1.7e-05 0.0057 13.2 0.0 41 93 37 88 19 106 0.83 # 79164 # 79889 # 1 # ID=5_78;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_178 - 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