# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 19_31 - 136 UPF0054 PF02130.12 145 2.8e-36 121.1 0.5 1 1 1.6e-39 3.2e-36 120.9 0.5 34 144 21 122 4 123 0.91 # 21709 # 22116 # 1 # ID=19_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 9_39 - 502 Mg_chelatase PF01078.16 207 9.7e-75 247.4 0.0 1 1 1.4e-76 1.4e-74 246.9 0.0 1 204 198 400 198 403 0.98 # 31782 # 33287 # -1 # ID=9_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.303 2_160 - 407 Mg_chelatase PF01078.16 207 9.6e-08 28.5 0.2 1 2 3.5e-06 0.00035 16.9 0.1 24 46 110 132 107 150 0.90 # 147366 # 148586 # -1 # ID=2_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 2_160 - 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84 Ribosomal_S17 PF00366.15 69 3.6e-24 81.7 6.0 1 1 2.1e-27 4.1e-24 81.6 6.0 1 66 9 74 9 77 0.97 # 24904 # 25155 # 1 # ID=13_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 5_92 - 246 Rad17 PF03215.10 519 2e-05 20.6 0.1 1 1 1.5e-07 5.8e-05 19.0 0.1 31 64 15 48 5 52 0.88 # 92297 # 93034 # -1 # ID=5_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.312 4_130 - 206 Rad17 PF03215.10 519 2.3e-05 20.4 0.0 1 1 7.3e-08 2.9e-05 20.0 0.0 47 113 5 73 1 130 0.71 # 130319 # 130936 # 1 # ID=4_130;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.299 7_91 - 243 Rad17 PF03215.10 519 0.00085 15.2 0.4 1 1 3.4e-06 0.0014 14.5 0.4 35 124 17 109 8 197 0.78 # 72043 # 72771 # -1 # ID=7_91;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.329 4_127 - 212 Rad17 PF03215.10 519 0.00099 15.0 0.1 1 1 4.4e-06 0.0017 14.2 0.0 45 75 28 58 19 95 0.85 # 127560 # 128195 # 1 # ID=4_127;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 6_98 - 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942 ABC_tran PF00005.22 137 4e-20 69.6 1.8 2 3 0.01 0.36 8.2 0.0 101 135 475 511 415 513 0.80 # 77522 # 80347 # 1 # ID=2_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 2_87 - 942 ABC_tran PF00005.22 137 4e-20 69.6 1.8 3 3 6.3e-12 2.2e-10 38.1 0.1 2 136 616 852 615 853 0.76 # 77522 # 80347 # 1 # ID=2_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 3_134 - 332 ABC_tran PF00005.22 137 3.1e-17 60.3 0.0 1 1 1.6e-18 5.8e-17 59.4 0.0 4 137 20 158 17 158 0.86 # 122478 # 123473 # -1 # ID=3_134;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.232 1_160 - 174 ABC_tran PF00005.22 137 3.4e-16 56.9 0.0 1 1 2e-17 7.2e-16 55.9 0.0 2 125 18 171 17 172 0.83 # 148167 # 148688 # -1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 3_28 - 221 ABC_tran PF00005.22 137 8e-16 55.7 0.0 1 1 1e-16 3.7e-15 53.6 0.0 2 135 23 153 22 155 0.74 # 20219 # 20881 # -1 # ID=3_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.356 1_159 - 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166 ABC_tran PF00005.22 137 0.00078 16.9 0.0 1 1 3.3e-05 0.0012 16.3 0.0 13 42 6 31 2 160 0.69 # 39345 # 39842 # -1 # ID=2_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.285 8_29 - 292 ABC_tran PF00005.22 137 0.00093 16.6 1.1 1 1 0.00012 0.0041 14.5 0.4 13 37 5 29 2 138 0.80 # 28741 # 29616 # -1 # ID=8_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 12_52 - 129 ABC_tran PF00005.22 137 0.0011 16.4 0.1 1 1 4.6e-05 0.0016 15.8 0.1 11 79 22 86 15 122 0.56 # 48831 # 49217 # -1 # ID=12_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.248 8_21 - 200 ABC_tran PF00005.22 137 0.0012 16.3 0.6 1 1 7.5e-05 0.0027 15.2 0.6 12 52 24 67 18 194 0.67 # 18144 # 18743 # 1 # ID=8_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.262 6_114 - 344 ABC_tran PF00005.22 137 0.0015 16.0 0.0 1 1 8.9e-05 0.0032 14.9 0.0 8 43 55 90 53 188 0.74 # 104234 # 105265 # -1 # ID=6_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 8_13 - 508 ABC_tran PF00005.22 137 0.0017 15.8 13.3 1 2 7.5e-05 0.0027 15.2 2.6 4 80 16 115 13 235 0.66 # 11123 # 12646 # 1 # ID=8_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.276 8_13 - 508 ABC_tran PF00005.22 137 0.0017 15.8 13.3 2 2 0.098 3.5 5.1 3.0 46 122 296 400 257 421 0.55 # 11123 # 12646 # 1 # ID=8_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.276 1_247 - 443 ABC_tran PF00005.22 137 0.0023 15.4 1.5 1 1 0.00015 0.0053 14.2 1.0 8 43 211 266 204 365 0.54 # 231481 # 232809 # 1 # ID=1_247;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.318 14_6 - 164 ABC_tran PF00005.22 137 0.0023 15.3 0.0 1 1 6.6e-05 0.0023 15.3 0.0 13 66 5 59 2 152 0.76 # 4164 # 4655 # -1 # ID=14_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 2_160 - 407 ABC_tran PF00005.22 137 0.0025 15.2 0.1 1 1 0.00019 0.0067 13.9 0.1 13 37 110 134 105 210 0.71 # 147366 # 148586 # -1 # ID=2_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 2_18 - 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526 ATP-synt_ab PF00006.20 215 8.5e-05 19.2 0.0 1 2 0.00018 0.04 10.5 0.0 12 42 24 54 19 284 0.89 # 3608 # 5185 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 2_5 - 526 ATP-synt_ab PF00006.20 215 8.5e-05 19.2 0.0 2 2 0.0022 0.48 7.0 0.0 16 48 344 377 338 459 0.75 # 3608 # 5185 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 4_102 - 447 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.0067 13.1 0.2 1 1 5e-05 0.011 12.3 0.2 12 54 86 129 77 393 0.83 # 101106 # 102446 # 1 # ID=4_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.353 1_160 - 174 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.011 12.3 0.0 1 1 5.6e-05 0.013 12.2 0.0 12 41 24 53 19 127 0.89 # 148167 # 148688 # -1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 1_208 - 539 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.012 12.2 0.0 1 1 0.00013 0.03 10.9 0.0 19 63 189 510 185 527 0.61 # 198287 # 199903 # 1 # ID=1_208;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.285 3_43 - 230 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.3e-32 109.0 0.0 1 1 1e-34 2.9e-32 108.6 0.0 3 182 47 226 45 227 0.90 # 34323 # 35012 # 1 # ID=3_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.258 9_56 - 364 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 8e-06 22.5 0.4 1 2 0.023 6.6 3.2 0.0 33 57 30 55 27 108 0.83 # 49316 # 50407 # 1 # ID=9_56;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.286 9_56 - 364 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 8e-06 22.5 0.4 2 2 1.6e-06 0.00047 16.7 0.1 96 129 220 249 194 267 0.72 # 49316 # 50407 # 1 # ID=9_56;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.286 30_5 - 240 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 8e-06 22.5 0.0 1 1 4.7e-08 1.4e-05 21.7 0.0 24 120 17 111 7 129 0.86 # 3574 # 4293 # -1 # ID=30_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.253 5_67 - 234 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 5.7e-05 19.7 0.1 1 1 4.5e-07 0.00013 18.5 0.1 46 129 36 113 23 179 0.80 # 65179 # 65880 # -1 # ID=5_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.272 2_144 - 821 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00021 17.9 0.3 1 1 4.3e-06 0.0012 15.3 0.0 93 143 375 425 356 432 0.72 # 127163 # 129625 # 1 # ID=2_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.259 6_39 - 283 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00027 17.5 0.1 1 1 1.2e-05 0.0034 13.9 0.0 97 126 19 45 9 60 0.73 # 35367 # 36215 # 1 # ID=6_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 8_82 - 272 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0052 13.3 0.0 1 1 3.1e-05 0.0089 12.6 0.0 67 136 129 192 93 221 0.70 # 78758 # 79573 # -1 # ID=8_82;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.262 3_67 - 203 DUF2791 PF10923.3 417 0.0041 12.9 0.0 1 1 3.4e-06 0.0068 12.1 0.0 34 71 8 45 5 52 0.91 # 53523 # 54131 # -1 # ID=3_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.228 12_53 - 1253 Eco57I PF07669.6 106 3.7e-23 79.0 4.0 1 1 1.3e-25 6.5e-23 78.3 0.5 3 102 805 910 802 914 0.96 # 49220 # 52978 # -1 # ID=12_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.297 8_49 - 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531 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 2.2e-08 30.7 0.1 2 2 9.2e-08 3.1e-05 20.4 0.0 252 298 358 404 340 407 0.93 # 131189 # 132781 # 1 # ID=4_132;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 1_63 - 810 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 3.7e-08 29.9 0.0 1 2 0.00014 0.046 9.9 0.0 22 50 45 73 40 187 0.80 # 61917 # 64346 # 1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.311 1_63 - 810 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 3.7e-08 29.9 0.0 2 2 7.8e-07 0.00026 17.3 0.0 240 297 566 624 555 628 0.82 # 61917 # 64346 # 1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.311 1_93 - 918 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 2.8e-06 23.8 0.0 1 1 3.4e-08 1.1e-05 21.8 0.0 248 299 605 656 584 658 0.87 # 87549 # 90302 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.326 1_236 - 292 Methyltransf_9 PF08003.6 315 2.3e-82 273.3 0.0 1 1 7e-85 2.8e-82 273.0 0.0 48 311 23 287 3 290 0.91 # 223192 # 224067 # -1 # ID=1_236;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.293 4_124 - 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