# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_34 - 221 DUF258 PF03193.11 161 4.4e-05 14.6 0.0 1 1 1.7e-06 8.2e-05 13.7 0.0 33 54 29 50 6 84 0.79 # 25662 # 26324 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 2_9 - 197 GerE PF00196.14 58 1.4e-07 22.6 0.2 1 1 2.1e-08 3.3e-07 21.5 0.2 19 49 2 32 2 34 0.91 # 8338 # 8928 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.244 1_4 - 228 GerE PF00196.14 58 0.00012 13.3 0.2 1 1 1.5e-05 0.00024 12.4 0.2 19 38 2 21 2 29 0.86 # 3542 # 4225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_8 - 203 GerE PF00196.14 58 0.00025 12.2 0.1 1 1 3.2e-05 0.00051 11.3 0.1 11 35 168 192 166 196 0.94 # 5977 # 6585 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 1_14 - 554 Peptidase_M56 PF05569.6 299 1.5e-88 288.4 12.1 1 1 6.9e-90 3.3e-88 287.3 12.1 32 299 2 266 1 266 0.99 # 10170 # 11831 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.265 1_34 - 221 TIGR01978 TIGR01978 243 2e-22 71.3 0.4 1 1 6.1e-24 2.9e-22 70.8 0.4 16 221 21 215 3 219 0.82 # 25662 # 26324 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 2_5 - 531 Glyco_tranf_2_4 PF13704.1 97 4.2e-06 18.9 0.4 1 1 5.9e-07 2.8e-05 16.3 0.0 22 86 13 77 4 82 0.84 # 3299 # 4891 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.274 1_34 - 221 AAA_18 PF13238.1 129 2.5e-08 26.2 1.0 1 1 2.6e-07 1.3e-05 17.4 1.0 1 94 34 211 34 219 0.75 # 25662 # 26324 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 1_34 - 221 AAA_13 PF13166.1 712 7.7e-07 19.7 0.1 1 2 0.013 0.62 0.2 0.0 21 41 36 56 18 83 0.79 # 25662 # 26324 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 1_34 - 221 AAA_13 PF13166.1 712 7.7e-07 19.7 0.1 2 2 9.5e-08 4.6e-06 17.1 0.0 526 580 156 209 146 215 0.87 # 25662 # 26324 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 1_11 - 198 MarR_2 PF12802.2 62 1.9e-07 22.6 0.0 1 2 0.012 0.28 2.8 0.1 23 45 112 134 101 137 0.86 # 8944 # 9537 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_11 - 198 MarR_2 PF12802.2 62 1.9e-07 22.6 0.0 2 2 3.6e-07 8.7e-06 17.3 0.0 6 48 148 187 144 188 0.91 # 8944 # 9537 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_9 - 197 MarR_2 PF12802.2 62 0.00046 11.8 0.0 1 1 3e-05 0.00072 11.2 0.0 23 45 3 25 1 25 0.94 # 8338 # 8928 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.244 1_25 - 301 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00042 12.7 0.0 1 1 1.8e-05 0.00088 11.7 0.0 4 66 175 241 173 264 0.87 # 18459 # 19361 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 1_11 - 198 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00024 12.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.00067 11.4 0.0 24 55 156 187 146 188 0.89 # 8944 # 9537 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_9 - 197 HTH_17 PF12728.2 51 1.6e-06 20.2 0.0 1 1 6.8e-08 3.3e-06 19.2 0.0 3 37 3 39 3 48 0.79 # 8338 # 8928 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.244 1_9 - 272 AAA_22 PF13401.1 131 5.4e-28 89.6 0.0 1 1 3.9e-29 9.3e-28 88.9 0.0 2 131 25 171 24 171 0.87 # 6722 # 7537 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 1_34 - 221 AAA_22 PF13401.1 131 1.9e-05 16.7 1.3 1 1 8.8e-06 0.00021 13.3 1.3 4 23 31 50 27 206 0.81 # 25662 # 26324 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 1_34 - 221 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 6.8e-05 14.2 0.0 1 1 2.6e-06 0.00013 13.4 0.0 28 55 21 48 7 62 0.83 # 25662 # 26324 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 2_9 - 197 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00025 12.4 0.1 1 1 2e-05 0.00049 11.5 0.1 28 48 3 23 2 24 0.92 # 8338 # 8928 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.244 1_4 - 228 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00035 12.0 0.0 1 1 3.2e-05 0.00077 10.8 0.0 28 50 3 25 2 25 0.92 # 3542 # 4225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_11 - 198 Mga PF05043.8 87 1.1e-06 20.8 0.4 1 2 0.0074 0.35 3.1 0.1 24 52 104 132 74 137 0.83 # 8944 # 9537 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_11 - 198 Mga PF05043.8 87 1.1e-06 20.8 0.4 2 2 1e-06 4.8e-05 15.5 0.0 17 56 148 186 144 189 0.93 # 8944 # 9537 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_11 - 198 HTH_30 PF13556.1 59 6.9e-05 14.3 0.0 1 1 2.9e-06 0.00014 13.3 0.0 3 38 151 186 150 187 0.94 # 8944 # 9537 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_9 - 197 MerR PF00376.18 38 9.8e-05 13.8 0.0 1 1 3.4e-06 0.00016 13.1 0.0 1 18 3 20 3 29 0.91 # 8338 # 8928 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.244 1_34 - 221 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00013 13.5 1.4 1 1 1.8e-05 0.00087 10.9 1.4 17 119 28 113 11 203 0.67 # 25662 # 26324 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 1_11 - 198 Mor PF08765.6 108 0.00032 12.4 0.0 1 1 1.4e-05 0.00066 11.4 0.0 71 103 159 191 121 194 0.80 # 8944 # 9537 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_34 - 221 AAA_23 PF13476.1 202 9.4e-06 17.9 9.3 1 1 2.6e-06 0.00012 14.2 9.3 11 43 22 54 10 209 0.57 # 25662 # 26324 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 1_11 - 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