# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 4_17 - 440 DUF258 PF03193.11 161 4.3e-05 15.5 0.0 1 1 1.9e-06 8.6e-05 14.6 0.0 20 58 259 298 241 387 0.85 # 10683 # 12002 # 1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.317 4_13 - 98 DUF258 PF03193.11 161 0.0001 14.3 0.1 1 1 2.4e-06 0.00011 14.2 0.1 12 66 12 67 2 85 0.81 # 7678 # 7971 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.279 2_5 - 248 GerE PF00196.14 58 1e-05 17.6 1.1 1 2 0.00065 0.015 7.5 0.1 19 42 2 25 2 27 0.90 # 3064 # 3807 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 2_5 - 248 GerE PF00196.14 58 1e-05 17.6 1.1 2 2 0.00028 0.0064 8.7 0.1 21 45 97 121 93 133 0.87 # 3064 # 3807 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_8 - 230 GerE PF00196.14 58 8.2e-05 14.7 0.5 1 1 7.8e-06 0.00018 13.6 0.5 19 46 2 29 2 37 0.86 # 5149 # 5838 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.265 1_2 - 203 GerE PF00196.14 58 0.0003 12.9 0.1 1 1 2.6e-05 0.00061 11.9 0.1 11 35 168 192 166 196 0.94 # 966 # 1574 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 2_2 - 203 GerE PF00196.14 58 0.00031 12.9 0.1 1 1 2.6e-05 0.00061 11.9 0.1 11 35 168 192 166 196 0.94 # 1455 # 2063 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 3_18 - 119 TIGR00157 TIGR00157 247 0.00021 13.3 0.0 1 1 2.5e-06 0.00023 13.2 0.0 114 157 6 50 2 89 0.90 # 10670 # 11026 # 1 # ID=3_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 3_21 - 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