# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_8 - 366 TIGR01804 TIGR01804 467 6.3e-111 363.4 0.5 1 1 1.7e-112 7e-111 363.2 0.5 1 337 24 363 24 365 0.98 # 5681 # 6778 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 2_9 - 106 TIGR01804 TIGR01804 467 2.6e-40 130.5 0.2 1 1 6.9e-42 2.9e-40 130.4 0.2 371 467 1 98 1 98 0.98 # 6853 # 7170 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.343 2_8 - 366 TIGR01237 TIGR01237 511 4.1e-68 222.6 0.2 1 1 1.2e-69 5.1e-68 222.3 0.2 23 364 11 349 5 364 0.91 # 5681 # 6778 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 2_9 - 106 TIGR01237 TIGR01237 511 2.1e-17 55.3 0.1 1 1 5.5e-19 2.3e-17 55.2 0.1 407 508 2 101 1 104 0.95 # 6853 # 7170 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.343 1_31 - 581 AAA_19 PF13245.1 76 1.4e-06 20.7 0.4 1 2 0.00012 0.0096 8.4 0.0 14 50 30 61 23 71 0.87 # 26524 # 28266 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.309 1_31 - 581 AAA_19 PF13245.1 76 1.4e-06 20.7 0.4 2 2 4.7e-05 0.0039 9.6 0.2 17 50 344 373 337 384 0.89 # 26524 # 28266 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.309 1_31 - 581 DUF258 PF03193.11 161 1.3e-06 20.3 1.0 1 2 9.3e-05 0.0077 8.1 0.0 35 61 25 51 3 70 0.75 # 26524 # 28266 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.309 1_31 - 581 DUF258 PF03193.11 161 1.3e-06 20.3 1.0 2 2 2.8e-05 0.0023 9.8 0.1 25 62 324 364 312 395 0.75 # 26524 # 28266 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.309 1_38 - 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555 DAO PF01266.19 358 7.5e-07 20.9 0.0 4 4 0.028 0.59 1.5 0.0 153 214 195 259 192 282 0.82 # 24860 # 26524 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 1_15 - 351 TIGR01668 TIGR01668 170 0.00032 12.6 0.1 1 1 7.3e-06 0.0006 11.7 0.1 18 116 145 243 131 246 0.74 # 14893 # 15945 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.361 1_31 - 581 TIGR00041 TIGR00041 196 0.00019 13.5 3.0 1 2 0.00016 0.013 7.5 0.0 4 39 25 60 22 79 0.83 # 26524 # 28266 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.309 1_31 - 581 TIGR00041 TIGR00041 196 0.00019 13.5 3.0 2 2 0.00067 0.055 5.5 0.2 11 42 344 376 336 408 0.78 # 26524 # 28266 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.309 1_31 - 581 TIGR01085 TIGR01085 472 0.00018 12.8 2.1 1 2 5.2e-06 0.00043 11.5 0.1 92 138 34 81 25 91 0.76 # 26524 # 28266 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.309 1_31 - 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181 HTH_22 PF13309.1 64 0.00025 13.5 0.3 1 1 5.9e-05 0.00081 11.8 0.0 46 64 161 179 156 179 0.84 # 21995 # 22537 # 1 # ID=1_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 2_16 - 174 adh_short PF00106.20 167 1.7e-14 46.7 0.0 1 1 2.6e-16 2.1e-14 46.4 0.0 76 163 3 94 1 98 0.93 # 11242 # 11763 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.356 3_12 - 85 HTH_37 PF13744.1 80 6.9e-07 21.7 0.1 1 1 2.3e-08 9.4e-07 21.3 0.1 18 56 30 68 16 81 0.88 # 6384 # 6638 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.322 1_9 - 210 HTH_37 PF13744.1 80 0.00029 13.3 0.0 1 1 1.5e-05 0.00063 12.2 0.0 22 53 177 208 175 209 0.91 # 8947 # 9576 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 2_19 - 378 Peptidase_M20 PF01546.23 189 2.9e-38 123.9 0.0 1 1 9.4e-40 3.9e-38 123.5 0.0 1 188 69 373 69 374 0.91 # 12942 # 14075 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 6_1 - 32 Peptidase_M20 PF01546.23 189 6.3e-07 21.7 0.0 1 1 1.5e-08 6.3e-07 21.7 0.0 149 176 4 32 1 32 0.90 # 3 # 98 # -1 # ID=6_1;partial=10;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.375 1_30 - 555 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.3e-36 118.2 0.8 1 1 1.6e-37 4.5e-36 117.2 0.8 1 199 3 287 3 289 0.91 # 24860 # 26524 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 2_21 - 197 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.7e-06 20.7 0.0 1 1 8.5e-08 2.4e-06 20.2 0.0 2 53 7 58 6 125 0.68 # 14670 # 15260 # -1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 2_11 - 213 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 4.5e-06 19.3 0.0 1 1 2.5e-07 6.9e-06 18.7 0.0 1 34 3 34 3 51 0.83 # 8097 # 8735 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_2 - 133 NUMOD1 PF07453.8 37 2e-06 20.2 0.2 1 1 9.1e-08 7.5e-06 18.4 0.0 18 37 4 23 3 23 0.96 # 249 # 647 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.256 1_39 - 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