# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_5 - 117 HTH_12 PF08461.5 66 0.00012 13.7 0.1 1 1 4.2e-06 0.00019 13.0 0.1 21 64 42 91 27 92 0.90 # 3565 # 3915 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.305 2_2 - 720 DUF258 PF03193.11 161 5.3e-07 20.7 0.0 1 1 2.4e-08 1.1e-06 19.7 0.0 19 69 485 537 471 541 0.78 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_9 - 586 Peptidase_M56 PF05569.6 299 1.6e-94 307.9 14.2 1 1 3.6e-96 1.6e-94 307.9 14.2 2 299 4 298 3 298 0.99 # 7478 # 9235 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.263 2_2 - 720 TIGR01978 TIGR01978 243 3.2e-25 80.4 1.8 1 1 2e-26 9.2e-25 78.9 1.8 2 230 478 698 477 709 0.82 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_16 - 85 Phage_CI_repr PF07022.8 66 0.00011 14.1 0.1 1 1 5.5e-06 0.00025 13.0 0.0 13 35 2 23 1 54 0.80 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 2_2 - 720 AAA_18 PF13238.1 129 1.9e-06 20.0 0.3 1 1 5.2e-07 2.3e-05 16.5 0.3 1 23 506 554 506 686 0.71 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_7 - 140 MarR_2 PF12802.2 62 9.4e-14 42.7 0.0 1 1 8.1e-15 1.2e-13 42.4 0.0 1 61 29 87 29 88 0.95 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_11 - 193 MarR_2 PF12802.2 62 2e-05 16.0 0.0 1 2 0.015 0.23 3.1 0.1 23 45 112 134 90 137 0.88 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_11 - 193 MarR_2 PF12802.2 62 2e-05 16.0 0.0 2 2 6.8e-05 0.001 10.6 0.0 7 45 149 184 144 187 0.89 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_16 - 85 MarR_2 PF12802.2 62 0.0003 12.3 0.0 1 1 3.2e-05 0.00049 11.6 0.0 23 45 3 25 2 26 0.93 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 1_3 - 173 DJ-1_PfpI PF01965.19 147 3.5e-40 128.6 0.0 1 1 9.3e-42 4.2e-40 128.4 0.0 2 147 32 171 31 171 0.97 # 2220 # 2738 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.329 1_7 - 140 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00025 12.6 0.0 1 1 9.9e-06 0.00045 11.8 0.0 32 67 51 91 42 99 0.82 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 2_2 - 720 Zeta_toxin PF06414.7 201 8.8e-06 16.7 0.0 1 1 3.4e-07 1.5e-05 15.9 0.0 16 57 503 553 490 706 0.86 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 AAA_22 PF13401.1 131 8e-09 27.5 0.2 1 1 2.8e-09 6.2e-08 24.7 0.2 4 120 503 669 499 677 0.65 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_13 - 741 AAA_22 PF13401.1 131 1e-07 23.9 0.1 1 1 3.1e-08 7e-07 21.3 0.0 8 100 29 151 26 171 0.72 # 11456 # 13678 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.275 2_9 - 67 HTH_19 PF12844.2 64 3.8e-19 60.4 0.7 1 1 9.7e-21 4.4e-19 60.2 0.7 3 63 3 63 2 64 0.96 # 6799 # 6999 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 1_11 - 193 Mga PF05043.8 87 1.8e-07 23.2 0.7 1 2 0.0065 0.29 3.3 0.1 24 52 104 132 65 137 0.82 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_11 - 193 Mga PF05043.8 87 1.8e-07 23.2 0.7 2 2 1.8e-07 8.2e-06 17.9 0.1 16 56 147 186 143 187 0.94 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_14 - 601 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.2e-06 19.8 0.2 1 2 1.7e-06 7.5e-05 13.9 0.1 106 128 119 141 87 156 0.76 # 13671 # 15473 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.272 1_14 - 601 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.2e-06 19.8 0.2 2 2 0.004 0.18 2.9 0.0 42 56 433 447 420 453 0.80 # 13671 # 15473 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.272 2_2 - 720 NB-ARC PF00931.17 287 5.6e-05 13.8 0.0 1 1 4.2e-06 0.00019 12.1 0.0 18 43 502 527 488 547 0.83 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.0001 13.3 0.0 1 1 3.9e-06 0.00017 12.5 0.0 25 105 506 587 490 610 0.72 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_9 - 67 HTH_31 PF13560.1 64 2.2e-11 35.7 0.0 1 1 5.3e-13 2.4e-11 35.6 0.0 6 59 4 56 2 64 0.94 # 6799 # 6999 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 1_11 - 193 HTH_22 PF13309.1 64 1.2e-07 23.3 0.5 1 1 7.2e-08 1.1e-06 20.2 0.1 12 64 136 182 128 182 0.82 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_16 - 85 HTH_22 PF13309.1 64 3e-07 22.0 0.5 1 2 3.1e-06 4.7e-05 15.0 0.0 43 64 2 23 1 23 0.92 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 1_16 - 85 HTH_22 PF13309.1 64 3e-07 22.0 0.5 2 2 0.0039 0.058 5.0 0.5 3 36 47 80 43 84 0.78 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 1_12 - 204 HTH_22 PF13309.1 64 1.2e-06 20.1 2.1 1 2 0.0019 0.028 6.1 0.2 3 41 109 147 107 149 0.93 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_12 - 204 HTH_22 PF13309.1 64 1.2e-06 20.1 2.1 2 2 1.8e-05 0.00027 12.5 0.0 44 61 177 194 172 195 0.94 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 2_9 - 67 HTH_37 PF13744.1 80 7.4e-05 14.4 0.1 1 1 1.7e-06 7.4e-05 14.4 0.1 20 56 1 37 1 56 0.89 # 6799 # 6999 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 7_1 - 209 MULE PF10551.4 93 1.6e-05 16.9 0.1 1 1 2e-06 4.4e-05 15.4 0.0 19 78 92 148 77 165 0.82 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 6_1 - 225 MULE PF10551.4 93 6.2e-05 15.0 0.1 1 1 8.2e-06 0.00018 13.5 0.0 19 75 92 145 77 165 0.83 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 2_11 - 124 Thioredoxin_2 PF13098.1 112 5.9e-10 31.2 0.0 1 1 1.8e-11 8.3e-10 30.7 0.0 4 102 28 112 25 118 0.73 # 7277 # 7648 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.261 3_3 - 297 HTH_36 PF13730.1 55 7.2e-09 27.5 0.2 1 1 1.6e-09 1.8e-08 26.3 0.2 4 55 51 103 48 103 0.93 # 640 # 1530 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.263 1_1 - 268 HTH_36 PF13730.1 55 2.3e-07 22.7 0.6 1 1 4.2e-08 4.7e-07 21.7 0.6 2 54 32 95 31 96 0.85 # 3 # 806 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_17 - 328 HTH_36 PF13730.1 55 7.6e-05 14.7 0.6 1 1 1.7e-05 0.00019 13.4 0.6 2 55 31 95 30 95 0.75 # 16772 # 17755 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.280 1_11 - 193 HTH_36 PF13730.1 55 0.00012 14.0 0.1 1 1 2.2e-05 0.00025 13.0 0.1 28 49 163 184 145 186 0.93 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_10 - 127 Penicillinase_R PF03965.11 115 1.7e-37 119.8 1.3 1 1 8.6e-39 1.9e-37 119.7 1.3 1 114 8 121 8 122 0.99 # 9225 # 9605 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.257 1_7 - 140 Penicillinase_R PF03965.11 115 0.00023 13.0 0.0 1 1 1.5e-05 0.00035 12.5 0.0 1 58 31 84 31 126 0.83 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_13 - 741 Helicase_C PF00271.26 78 0.0001 13.9 0.1 1 2 0.0034 0.15 3.8 0.1 20 63 153 224 124 259 0.83 # 11456 # 13678 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.275 1_13 - 741 Helicase_C PF00271.26 78 0.0001 13.9 0.1 2 2 0.00029 0.013 7.2 0.0 35 76 306 347 260 349 0.86 # 11456 # 13678 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.275 2_2 - 720 AAA_33 PF13671.1 143 0.00012 13.7 0.0 1 1 4.9e-06 0.00022 12.9 0.0 2 21 506 525 505 562 0.82 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_5 - 117 PadR PF03551.9 75 0.00016 13.2 0.1 1 1 5.9e-06 0.00026 12.6 0.0 22 70 44 90 35 94 0.82 # 3565 # 3915 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.305 2_2 - 720 AAA_30 PF13604.1 196 0.00011 13.6 0.0 1 1 5.4e-06 0.00024 12.5 0.0 13 48 498 533 496 549 0.87 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_1 - 332 UxuA PF03786.8 351 3.5e-05 14.2 1.0 1 1 1.2e-06 5.5e-05 13.5 1.0 26 90 88 152 67 157 0.88 # 88 # 1083 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.255 2_2 - 720 AAA_17 PF13207.1 121 3.8e-07 22.8 0.1 1 1 7.3e-08 1.1e-06 21.3 0.1 2 32 506 538 505 654 0.58 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 7_1 - 209 AAA_17 PF13207.1 121 9.4e-05 15.0 0.8 1 1 9.4e-06 0.00014 14.5 0.8 23 112 24 121 20 175 0.80 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 6_1 - 225 AAA_17 PF13207.1 121 0.00018 14.1 1.5 1 1 2e-05 0.00029 13.4 1.5 22 113 23 122 15 206 0.81 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 2_2 - 720 Sigma54_activat PF00158.21 168 2.5e-05 15.6 0.0 1 1 1.1e-06 5.1e-05 14.6 0.0 9 51 490 532 483 558 0.78 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_4 - 435 HATPase_c PF02518.21 111 1.8e-08 25.9 0.2 1 1 6.6e-10 3e-08 25.2 0.2 4 87 328 408 325 423 0.93 # 3598 # 4902 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.195 1_7 - 140 B-block_TFIIIC PF04182.7 75 0.00012 13.7 0.2 1 2 0.073 3.3 -0.5 0.0 30 48 13 31 5 47 0.78 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_7 - 140 B-block_TFIIIC PF04182.7 75 0.00012 13.7 0.2 2 2 1e-05 0.00047 11.8 0.1 25 54 54 83 48 115 0.82 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_3 - 173 SNO PF01174.14 188 0.00021 12.7 0.0 1 1 5.4e-06 0.00024 12.5 0.0 32 98 63 128 25 155 0.82 # 2220 # 2738 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.329 1_13 - 741 ResIII PF04851.10 184 1.6e-18 58.9 1.5 1 2 3.6e-20 1.6e-18 58.9 1.5 2 183 2 175 1 176 0.77 # 11456 # 13678 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.275 1_13 - 741 ResIII PF04851.10 184 1.6e-18 58.9 1.5 2 2 0.014 0.62 1.6 1.1 49 145 198 294 191 310 0.66 # 11456 # 13678 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.275 1_6 - 324 ADH_N PF08240.7 109 5.2e-10 30.9 0.0 1 2 1.2e-09 5.3e-08 24.4 0.0 2 61 29 86 28 90 0.88 # 4511 # 5482 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_6 - 324 ADH_N PF08240.7 109 5.2e-10 30.9 0.0 2 2 0.0012 0.054 5.1 0.0 84 109 88 113 80 113 0.81 # 4511 # 5482 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_7 - 140 HTH_34 PF13601.1 80 0.00015 13.6 0.1 1 1 1.4e-05 0.00032 12.6 0.1 4 63 37 95 34 107 0.87 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_20 - 116 HTH_34 PF13601.1 80 0.00016 13.5 0.2 1 1 1.1e-05 0.00024 12.9 0.2 2 49 44 91 43 96 0.93 # 19911 # 20258 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.256 1_12 - 204 HTH_29 PF13551.1 112 2.5e-06 19.5 0.1 1 1 6.4e-07 1.4e-05 17.0 0.0 4 34 168 197 166 200 0.91 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_11 - 193 HTH_29 PF13551.1 112 3.3e-06 19.0 0.4 1 2 0.018 0.41 2.7 0.2 32 69 121 156 118 159 0.73 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_11 - 193 HTH_29 PF13551.1 112 3.3e-06 19.0 0.4 2 2 3.1e-06 6.9e-05 14.8 0.0 7 39 156 187 151 190 0.91 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_7 - 140 MarR PF01047.17 59 7.1e-15 46.3 0.0 1 1 7.8e-16 1.2e-14 45.7 0.0 1 59 31 89 31 89 0.98 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_10 - 127 MarR PF01047.17 59 6.9e-09 27.2 0.1 1 1 8e-10 1.2e-08 26.4 0.1 1 54 8 65 8 65 0.97 # 9225 # 9605 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.257 1_11 - 193 MarR PF01047.17 59 0.00028 12.4 0.2 1 1 4.9e-05 0.00074 11.1 0.0 1 41 145 184 145 188 0.89 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_20 - 116 HTH_20 PF12840.2 61 2.8e-05 15.7 0.0 1 1 7.7e-07 3.5e-05 15.4 0.0 15 57 48 89 34 93 0.87 # 19911 # 20258 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.256 1_11 - 193 RuvB_C PF05491.8 76 0.00035 12.0 0.4 1 2 0.038 1.7 0.2 0.1 55 67 121 133 117 139 0.82 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_11 - 193 RuvB_C PF05491.8 76 0.00035 12.0 0.4 2 2 8.6e-05 0.0039 8.7 0.0 6 43 145 178 142 182 0.86 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_20 - 116 HTH_5 PF01022.15 47 1.8e-17 54.6 1.6 1 1 1.4e-18 3.1e-17 53.9 1.6 1 45 41 86 41 88 0.95 # 19911 # 20258 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.256 1_11 - 193 HTH_5 PF01022.15 47 0.00017 13.1 0.0 1 1 1.4e-05 0.00032 12.2 0.0 5 42 150 187 147 188 0.86 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 2_4 - 435 HATPase_c_5 PF14501.1 100 3.5e-16 50.6 5.8 1 1 7.8e-18 3.5e-16 50.6 5.8 4 99 328 431 325 432 0.83 # 3598 # 4902 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.195 1_6 - 324 TIGR02817 TIGR02817 336 2.9e-17 54.5 0.0 1 1 9.1e-19 4.1e-17 54.0 0.0 23 215 22 218 8 231 0.85 # 4511 # 5482 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_11 - 193 Terminase_5 PF06056.7 58 0.0003 12.2 0.1 1 1 1.2e-05 0.00056 11.3 0.1 7 36 154 183 153 189 0.91 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_11 - 193 HTH_24 PF13412.1 48 3.5e-10 31.0 0.2 1 1 4e-11 6e-10 30.2 0.2 1 41 145 184 145 188 0.96 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_16 - 85 HTH_24 PF13412.1 48 4.6e-05 14.6 0.8 1 1 5.7e-06 8.5e-05 13.8 0.1 19 41 3 25 2 26 0.95 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 1_7 - 140 HTH_24 PF13412.1 48 9e-05 13.7 0.0 1 1 1e-05 0.00016 12.9 0.0 8 48 38 78 32 78 0.89 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_4 - 212 TIGR01740 TIGR01740 216 1.2e-19 62.3 8.0 1 1 5.4e-21 2.4e-19 61.3 8.0 3 215 5 203 3 204 0.79 # 2827 # 3462 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 2_2 - 720 AAA_21 PF13304.1 303 4.4e-09 28.4 4.3 1 1 9.8e-11 4.4e-09 28.4 4.3 1 297 505 672 505 678 0.77 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_4 - 212 OMPdecase PF00215.19 226 5e-33 106.1 6.2 1 1 1.3e-34 5.9e-33 105.9 6.2 1 225 1 202 1 203 0.95 # 2827 # 3462 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_16 - 85 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00016 13.0 0.0 1 1 1.5e-05 0.00034 12.0 0.0 19 41 3 25 2 26 0.93 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 1_11 - 193 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00016 13.0 0.0 1 1 1.5e-05 0.00033 12.0 0.0 3 41 147 184 145 185 0.87 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 6_1 - 225 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 5.6e-44 141.3 1.3 1 1 3.9e-45 8.8e-44 140.7 1.3 3 138 72 202 70 204 0.94 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 7_1 - 209 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 9.2e-44 140.6 1.5 1 1 5.8e-45 1.3e-43 140.1 1.5 3 139 72 203 70 204 0.95 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 1_4 - 212 Pterin_bind PF00809.17 210 4.5e-06 17.9 1.0 1 2 0.031 1.4 -0.0 0.0 114 161 30 78 9 85 0.50 # 2827 # 3462 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_4 - 212 Pterin_bind PF00809.17 210 4.5e-06 17.9 1.0 2 2 3.7e-07 1.7e-05 16.1 0.1 78 166 89 173 83 174 0.78 # 2827 # 3462 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_11 - 193 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00012 13.4 0.0 1 1 6.7e-06 0.0003 12.2 0.0 7 43 151 185 150 188 0.85 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_16 - 85 HTH_10 PF04967.7 53 4.5e-05 14.8 0.0 1 1 1.6e-06 7.1e-05 14.2 0.0 25 46 3 24 1 31 0.87 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 1_12 - 204 HTH_7 PF02796.10 45 1.5e-23 74.3 1.0 1 1 9.1e-25 2e-23 73.8 0.2 1 45 147 199 147 199 0.96 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_11 - 193 HTH_7 PF02796.10 45 3.9e-20 63.3 0.2 1 1 3.4e-21 7.6e-20 62.4 0.2 1 44 140 183 140 184 0.98 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_7 - 140 DUF2250 PF10007.4 93 7.9e-05 14.4 0.1 1 1 3.2e-06 0.00014 13.5 0.1 7 58 32 83 26 130 0.83 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_16 - 85 HTH_DeoR PF08220.7 57 2.3e-05 15.7 0.2 1 1 5.8e-06 8.8e-05 13.9 0.0 16 35 3 22 2 34 0.85 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 1_11 - 193 HTH_DeoR PF08220.7 57 3.5e-05 15.1 0.0 1 1 5.3e-06 7.9e-05 14.0 0.0 16 41 162 187 149 189 0.83 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_10 - 127 HTH_DeoR PF08220.7 57 0.00036 11.9 0.3 1 1 0.0001 0.0015 9.9 0.1 8 46 18 60 14 62 0.76 # 9225 # 9605 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.257 2_2 - 720 AAA_14 PF13173.1 128 8.9e-06 17.4 1.7 1 2 4e-06 0.00018 13.2 0.3 4 70 505 584 502 605 0.70 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 AAA_14 PF13173.1 128 8.9e-06 17.4 1.7 2 2 0.0091 0.41 2.4 0.1 53 98 623 672 604 707 0.62 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 AAA PF00004.24 132 1.3e-06 20.5 0.9 1 1 8.9e-07 4e-05 15.6 0.9 2 114 507 676 506 682 0.69 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 AAA_10 PF12846.2 304 6e-08 24.2 0.6 1 3 4.5e-07 2e-05 15.9 0.1 4 31 506 533 504 538 0.81 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 AAA_10 PF12846.2 304 6e-08 24.2 0.6 2 3 0.0047 0.21 2.6 0.0 174 245 534 600 529 602 0.66 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 AAA_10 PF12846.2 304 6e-08 24.2 0.6 3 3 0.0052 0.24 2.5 0.0 220 271 632 682 620 705 0.85 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_13 - 741 DEAD PF00270.24 169 4.6e-11 34.2 0.0 1 1 2.2e-12 9.7e-11 33.2 0.0 15 163 26 175 5 183 0.70 # 11456 # 13678 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.275 2_2 - 720 AAA_16 PF13191.1 185 7e-06 17.9 0.0 1 1 4e-07 1.8e-05 16.6 0.0 25 52 504 532 489 669 0.72 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_6 - 324 Epimerase PF01370.16 236 0.00015 13.0 0.0 1 1 5e-06 0.00023 12.4 0.0 1 39 152 191 152 216 0.80 # 4511 # 5482 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_5 - 117 HxlR PF01638.12 91 1.1e-33 106.6 0.1 1 1 2.9e-35 1.3e-33 106.3 0.1 1 89 20 109 20 111 0.97 # 3565 # 3915 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.305 1_6 - 324 NmrA PF05368.8 233 5.6e-06 17.5 0.6 1 1 2.9e-07 1.3e-05 16.3 0.6 1 52 152 205 152 275 0.90 # 4511 # 5482 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_12 - 204 HTH_23 PF13384.1 50 2.9e-08 25.0 0.3 1 1 7.2e-09 6.4e-08 23.9 0.1 6 39 164 197 159 200 0.89 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_11 - 193 HTH_23 PF13384.1 50 3.4e-08 24.8 0.0 1 1 9e-09 8.1e-08 23.6 0.0 13 42 156 185 150 190 0.86 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_16 - 85 HTH_23 PF13384.1 50 1.8e-06 19.4 0.0 1 1 5.1e-07 4.6e-06 18.1 0.0 18 42 2 26 2 33 0.89 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 6_1 - 225 HTH_23 PF13384.1 50 1.2e-05 16.7 0.3 1 1 3.1e-05 0.00028 12.4 0.0 28 41 41 54 40 58 0.91 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 7_1 - 209 HTH_23 PF13384.1 50 9.6e-05 13.8 0.6 1 1 9e-05 0.00081 10.9 0.3 29 41 42 54 41 68 0.93 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 2_2 - 720 T2SE PF00437.15 272 2e-05 15.3 0.0 1 1 7.8e-07 3.5e-05 14.5 0.0 59 163 435 545 421 550 0.77 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_11 - 193 UPF0122 PF04297.9 101 0.00014 13.7 0.0 1 1 1.6e-05 0.00036 12.4 0.0 19 59 146 186 142 190 0.86 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_16 - 85 UPF0122 PF04297.9 101 0.00019 13.3 4.4 1 1 1.1e-05 0.00025 12.9 4.4 35 90 3 57 2 70 0.79 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 1_10 - 127 S-AdoMet_synt_M PF02772.11 120 0.00025 12.8 1.9 1 2 1.4e-05 0.00063 11.5 1.2 64 106 21 62 3 74 0.78 # 9225 # 9605 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.257 1_10 - 127 S-AdoMet_synt_M PF02772.11 120 0.00025 12.8 1.9 2 2 0.045 2 0.2 0.0 64 90 89 115 70 126 0.62 # 9225 # 9605 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.257 1_3 - 173 GATase PF00117.23 192 7.7e-07 20.5 0.0 1 1 2e-08 9.1e-07 20.2 0.0 36 86 43 112 13 154 0.72 # 2220 # 2738 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.329 1_2 - 257 TIGR02168 TIGR02168 1181 1.1e-07 21.4 33.5 1 1 5.6e-09 1.3e-07 21.2 33.5 253 431 48 226 13 247 0.82 # 1251 # 2021 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 2_2 - 720 TIGR02168 TIGR02168 1181 1.5e-05 14.3 0.0 1 1 1e-06 2.4e-05 13.6 0.0 1117 1164 636 684 628 686 0.95 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_6 - 324 DapB_N PF01113.15 124 4.3e-06 18.5 0.2 1 2 0.042 1.9 0.2 0.0 92 103 121 132 115 142 0.84 # 4511 # 5482 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_6 - 324 DapB_N PF01113.15 124 4.3e-06 18.5 0.2 2 2 1e-06 4.6e-05 15.1 0.2 3 97 152 242 150 250 0.78 # 4511 # 5482 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_3 - 173 DUF4066 PF13278.1 166 5.1e-16 50.1 0.0 1 1 1.4e-17 6.2e-16 49.9 0.0 2 151 9 153 8 154 0.91 # 2220 # 2738 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.329 1_4 - 212 Ribul_P_3_epim PF00834.14 201 1e-06 19.7 2.5 1 1 8.2e-08 3.7e-06 17.9 2.5 46 200 41 193 23 194 0.81 # 2827 # 3462 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_4 - 212 IGPS PF00218.16 254 5.2e-07 20.7 1.0 1 1 1.5e-08 7e-07 20.3 1.0 120 252 66 201 38 203 0.79 # 2827 # 3462 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_11 - 193 HTH_11 PF08279.7 55 5.1e-09 27.5 0.1 1 1 1e-09 1.2e-08 26.4 0.1 4 41 151 186 147 189 0.81 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_16 - 85 HTH_11 PF08279.7 55 5.6e-08 24.2 0.7 1 1 1.3e-08 1.4e-07 22.9 0.1 17 40 3 26 2 32 0.93 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 1_12 - 204 HTH_11 PF08279.7 55 8.4e-05 14.0 0.1 1 1 2.9e-05 0.00033 12.1 0.1 16 34 176 194 166 195 0.79 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_2 - 257 HTH_11 PF08279.7 55 0.00019 12.9 0.0 1 1 6.5e-05 0.00073 11.0 0.0 21 40 7 26 3 31 0.87 # 1251 # 2021 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 2_2 - 720 NACHT PF05729.7 166 6.4e-05 14.4 0.2 1 1 4e-06 0.00018 13.0 0.0 3 26 506 529 504 542 0.84 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 6_1 - 225 Arg_repressor PF01316.16 70 0.00021 12.7 0.0 1 1 1.3e-05 0.00059 11.2 0.0 24 49 30 55 24 77 0.75 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 1_3 - 173 GATase_3 PF07685.9 158 9.9e-05 13.7 0.0 1 1 3.2e-06 0.00014 13.2 0.0 2 59 59 115 58 161 0.80 # 2220 # 2738 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.329 1_12 - 204 HTH_28 PF13518.1 52 1.1e-08 26.8 0.0 1 1 2.9e-09 2.6e-08 25.6 0.0 4 34 167 197 166 200 0.94 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_11 - 193 HTH_28 PF13518.1 52 1.8e-05 16.5 0.0 1 1 4.8e-06 4.3e-05 15.3 0.0 8 38 156 186 152 189 0.93 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_16 - 85 HTH_28 PF13518.1 52 4.3e-05 15.3 0.1 1 1 1.4e-05 0.00012 13.9 0.0 14 37 3 26 1 31 0.91 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 6_1 - 225 HTH_28 PF13518.1 52 7e-05 14.6 0.2 1 1 4e-05 0.00036 12.4 0.2 15 36 31 54 22 55 0.85 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 7_1 - 209 HTH_28 PF13518.1 52 0.00017 13.4 3.0 1 1 2.5e-05 0.00023 13.0 0.7 14 36 30 54 17 55 0.85 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 1_2 - 257 HlyD PF00529.15 305 0.00082 10.5 13.7 1 1 2.5e-05 0.0011 10.0 13.7 43 136 106 198 94 233 0.87 # 1251 # 2021 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_6 - 324 ADH_zinc_N PF00107.21 130 4.5e-17 53.6 0.0 1 1 2.1e-18 9.7e-17 52.5 0.0 1 117 160 270 160 285 0.90 # 4511 # 5482 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 2_2 - 720 AAA_25 PF13481.1 194 1.5e-05 16.2 0.0 1 2 2.7e-06 0.00012 13.3 0.0 29 51 499 521 482 541 0.84 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 AAA_25 PF13481.1 194 1.5e-05 16.2 0.0 2 2 0.029 1.3 0.1 0.0 131 188 621 672 591 673 0.68 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_14 - 601 Methyltransf_26 PF13659.1 117 8.8e-06 17.6 0.0 1 2 0.00013 0.0059 8.4 0.0 65 113 122 185 100 188 0.77 # 13671 # 15473 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.272 1_14 - 601 Methyltransf_26 PF13659.1 117 8.8e-06 17.6 0.0 2 2 0.00043 0.019 6.8 0.0 4 22 437 459 434 502 0.80 # 13671 # 15473 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.272 1_11 - 193 HTH_Tnp_4 PF13613.1 53 0.00029 12.2 0.0 1 1 1.3e-05 0.00059 11.2 0.0 24 43 165 184 159 186 0.88 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 2_2 - 720 MMR_HSR1 PF01926.18 116 5.3e-05 15.0 0.3 1 1 5e-06 0.00023 13.0 0.1 2 37 506 541 505 585 0.80 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_1 - 332 HlyD_3 PF13437.1 105 4.7e-18 57.3 2.4 1 2 0.00018 0.008 8.4 0.1 2 44 67 111 66 119 0.84 # 88 # 1083 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.255 2_1 - 332 HlyD_3 PF13437.1 105 4.7e-18 57.3 2.4 2 2 5.7e-17 2.6e-15 48.5 0.4 6 97 203 298 200 306 0.82 # 88 # 1083 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.255 1_6 - 324 NAD_binding_10 PF13460.1 183 8e-06 17.7 0.1 1 1 2.5e-07 1.1e-05 17.2 0.1 1 38 152 192 152 241 0.87 # 4511 # 5482 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_12 - 204 CENP-B_N PF04218.8 53 1.9e-07 22.2 2.4 1 2 0.00042 0.019 6.3 0.3 13 35 117 139 115 142 0.85 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_12 - 204 CENP-B_N PF04218.8 53 1.9e-07 22.2 2.4 2 2 5.4e-07 2.4e-05 15.5 0.1 14 44 167 197 166 201 0.88 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 2_2 - 720 ABC_ATPase PF09818.4 448 6.2e-06 16.7 0.1 1 2 0.04 1.8 -1.3 0.0 242 263 500 522 496 533 0.79 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 ABC_ATPase PF09818.4 448 6.2e-06 16.7 0.1 2 2 4.8e-07 2.1e-05 14.9 0.0 298 365 589 657 582 682 0.85 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 NTPase_1 PF03266.10 168 5.7e-05 14.6 0.2 1 2 0.00046 0.021 6.3 0.0 2 27 506 531 505 535 0.84 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 NTPase_1 PF03266.10 168 5.7e-05 14.6 0.2 2 2 0.00092 0.042 5.3 0.1 85 154 624 693 613 704 0.78 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_16 - 85 GntR PF00392.16 64 0.00015 13.0 0.0 1 1 6.3e-06 0.00029 12.1 0.0 26 51 3 28 3 32 0.91 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 1_19 - 206 Virul_fac_BrkB PF03631.10 260 0.002 9.2 23.5 1 2 7.7e-06 0.00035 11.7 7.6 166 235 11 79 1 81 0.84 # 19275 # 19892 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.272 1_19 - 206 Virul_fac_BrkB PF03631.10 260 0.002 9.2 23.5 2 2 0.0021 0.096 3.7 8.0 115 180 135 191 107 193 0.63 # 19275 # 19892 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.272 1_14 - 601 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 2.1e-37 120.5 0.0 1 1 3.3e-38 1.5e-36 117.8 0.0 1 227 128 476 128 481 0.84 # 13671 # 15473 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.272 2_11 - 124 Thioredoxin PF00085.15 104 0.00027 12.5 0.0 1 1 1.8e-05 0.00083 10.9 0.0 28 93 38 114 13 122 0.70 # 7277 # 7648 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.261 1_7 - 140 Fe_dep_repress PF01325.14 60 0.00018 13.2 0.0 1 1 7.1e-06 0.00032 12.5 0.0 24 53 49 78 44 83 0.87 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_11 - 193 TetR_N PF00440.18 47 0.00019 12.9 0.1 1 1 3.4e-05 0.00076 11.0 0.0 16 36 160 180 158 180 0.92 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_12 - 204 TetR_N PF00440.18 47 0.00019 12.9 0.1 1 1 1.9e-05 0.00042 11.8 0.1 15 35 174 194 173 195 0.94 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_4 - 212 TMP-TENI PF02581.12 180 2.4e-06 18.5 1.9 1 1 4.3e-07 1.9e-05 15.6 1.9 100 169 111 179 3 206 0.82 # 2827 # 3462 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 6_1 - 225 rve PF00665.21 120 2.7e-18 58.0 0.7 1 1 6e-19 1.4e-17 55.8 0.4 4 117 68 174 65 176 0.92 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 7_1 - 209 rve PF00665.21 120 3.8e-17 54.3 0.8 1 1 4.3e-18 9.6e-17 53.0 0.3 4 117 68 174 65 176 0.87 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 1_4 - 212 PcrB PF01884.12 231 2.7e-05 15.2 0.5 1 2 0.0099 0.44 1.5 0.5 173 225 44 97 11 103 0.61 # 2827 # 3462 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_4 - 212 PcrB PF01884.12 231 2.7e-05 15.2 0.5 2 2 6e-07 2.7e-05 15.2 0.5 142 223 121 199 103 207 0.73 # 2827 # 3462 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_11 - 193 HTH_Mga PF08280.6 59 0.00037 12.1 1.8 1 1 9.4e-06 0.00042 11.9 0.5 2 44 144 185 143 187 0.91 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 2_9 - 67 HTH_25 PF13413.1 62 2e-06 19.2 0.1 1 1 6.3e-08 2.8e-06 18.7 0.1 3 36 5 38 3 41 0.94 # 6799 # 6999 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 6_1 - 225 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00024 12.9 0.4 1 1 3.7e-05 0.00084 11.1 0.1 31 47 38 54 5 67 0.70 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 7_1 - 209 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00035 12.3 0.3 1 1 3.3e-05 0.00073 11.3 0.3 24 47 29 54 5 73 0.79 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 2_2 - 720 MobB PF03205.9 140 1.6e-05 16.5 0.0 1 1 9.9e-07 4.4e-05 15.0 0.0 3 27 506 530 504 536 0.88 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_11 - 193 HTH_38 PF13936.1 44 3.3e-06 18.4 0.0 1 1 7.1e-07 8e-06 17.2 0.0 13 41 153 181 143 183 0.86 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_12 - 204 HTH_38 PF13936.1 44 1.3e-05 16.5 1.9 1 1 2.4e-06 2.8e-05 15.5 0.1 15 39 170 194 159 198 0.91 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_16 - 85 HTH_38 PF13936.1 44 9.9e-05 13.7 0.0 1 1 1.8e-05 0.0002 12.7 0.0 21 43 2 24 2 25 0.93 # 16220 # 16474 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 2_9 - 67 HTH_38 PF13936.1 44 0.00035 12.0 0.0 1 1 4e-05 0.00045 11.6 0.0 12 37 3 29 1 30 0.84 # 6799 # 6999 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 1_12 - 204 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00013 13.1 0.2 1 1 6e-06 0.00027 12.1 0.2 9 42 160 197 157 198 0.91 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 2_12 - 97 TIGR02225 TIGR02225 290 2e-08 25.3 0.2 1 1 5e-10 2.2e-08 25.2 0.2 204 285 9 89 2 93 0.90 # 7769 # 8059 # -1 # ID=2_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.326 1_7 - 140 HTH_27 PF13463.1 68 2.6e-10 32.4 0.0 1 1 1.5e-11 3.5e-10 31.9 0.0 1 67 31 96 31 97 0.90 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_10 - 127 HTH_27 PF13463.1 68 0.00028 13.0 0.0 1 1 8e-05 0.0018 10.4 0.0 4 54 11 64 8 70 0.92 # 9225 # 9605 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.257 1_9 - 586 SprT-like PF10263.4 157 5e-05 14.8 0.0 1 1 2.8e-06 0.00013 13.5 0.0 7 71 145 206 140 209 0.85 # 7478 # 9235 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.263 3_4 - 73 PHO4 PF01384.15 326 7.7e-05 13.2 0.0 1 1 1.7e-06 7.7e-05 13.2 0.0 111 145 18 51 6 67 0.80 # 1963 # 2181 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.256 1_11 - 193 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 7.1e-05 14.3 0.0 1 1 6e-06 0.00013 13.4 0.0 17 48 159 190 134 192 0.86 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_12 - 204 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00014 13.4 0.1 1 1 1.7e-05 0.00038 12.0 0.1 9 38 166 195 163 202 0.90 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 2_1 - 332 HlyD_2 PF12700.2 328 2.4e-11 35.0 26.0 1 1 8.1e-13 3.6e-11 34.5 26.0 8 261 49 306 47 320 0.71 # 88 # 1083 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.255 1_19 - 206 Cad PF03596.8 191 2.6e-85 276.7 16.4 1 1 6.7e-87 3e-85 276.5 16.4 1 191 12 203 12 203 0.99 # 19275 # 19892 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.272 1_11 - 193 HTH_40 PF14493.1 91 3.2e-05 15.9 0.0 1 1 2.9e-06 6.5e-05 15.0 0.0 8 42 155 189 153 191 0.90 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_12 - 204 HTH_40 PF14493.1 91 0.00017 13.6 0.1 1 1 2.1e-05 0.00047 12.2 0.1 7 31 169 193 165 195 0.92 # 10574 # 11185 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 2_9 - 67 HTH_3 PF01381.17 55 5.6e-19 59.6 0.1 1 1 1.4e-20 6.1e-19 59.5 0.1 1 53 4 56 4 58 0.96 # 6799 # 6999 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 6_1 - 225 DDE_3 PF13358.1 146 5.2e-08 24.5 0.2 1 1 3.9e-09 8.9e-08 23.8 0.2 30 95 78 143 59 208 0.76 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 7_1 - 209 DDE_3 PF13358.1 146 6.4e-07 21.0 0.1 1 1 4.9e-08 1.1e-06 20.2 0.1 17 95 67 144 59 185 0.77 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 6_1 - 225 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 2.8e-09 28.3 3.4 1 2 3.4e-10 7.6e-09 26.9 0.9 6 98 11 101 7 137 0.72 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 6_1 - 225 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 2.8e-09 28.3 3.4 2 2 0.015 0.35 1.8 0.1 243 263 163 183 150 190 0.83 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 7_1 - 209 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 7.2e-09 27.0 1.5 1 2 2.1e-09 4.8e-08 24.3 0.4 15 104 20 103 7 135 0.75 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 7_1 - 209 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 7.2e-09 27.0 1.5 2 2 0.015 0.34 1.8 0.0 243 261 163 180 156 189 0.78 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 1_7 - 140 TrmB PF01978.14 68 4.2e-07 21.4 0.0 1 1 5e-08 1.1e-06 20.1 0.0 1 58 26 83 26 99 0.92 # 5606 # 6025 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 1_11 - 193 TrmB PF01978.14 68 2.6e-06 18.9 0.0 1 1 2.6e-07 5.8e-06 17.8 0.0 8 48 147 186 144 188 0.77 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 2_2 - 720 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00014 13.8 0.0 1 1 7.5e-06 0.00034 12.5 0.0 18 49 500 531 490 562 0.76 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_9 - 67 HTH_26 PF13443.1 63 5.5e-09 28.0 0.3 1 1 1.3e-10 6.1e-09 27.8 0.3 1 58 3 59 3 64 0.94 # 6799 # 6999 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 2_11 - 124 Thioredoxin_8 PF13905.1 95 5.9e-06 18.2 0.4 1 2 1.9e-06 8.4e-05 14.5 0.1 1 31 28 58 28 76 0.84 # 7277 # 7648 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.261 2_11 - 124 Thioredoxin_8 PF13905.1 95 5.9e-06 18.2 0.4 2 2 0.013 0.6 2.1 0.1 67 93 76 104 61 106 0.69 # 7277 # 7648 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.261 2_2 - 720 ABC_tran PF00005.22 137 6.1e-35 112.3 0.1 1 1 2.5e-36 1.1e-34 111.4 0.1 1 137 493 643 493 643 0.96 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_9 - 586 Peptidase_M48 PF01435.13 226 0.00021 12.6 0.0 1 1 1e-05 0.00046 11.5 0.0 64 124 173 230 113 268 0.76 # 7478 # 9235 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.263 2_2 - 720 SMC_N PF02463.14 220 1.1e-11 36.2 2.0 1 1 1.4e-11 6.1e-10 30.4 2.0 24 212 503 687 492 693 0.59 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_11 - 124 TraF PF13728.1 215 2.1e-05 15.8 0.0 1 1 5.4e-07 2.4e-05 15.6 0.0 130 194 38 104 17 116 0.84 # 7277 # 7648 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.261 1_11 - 193 Trp_repressor PF01371.14 88 1.3e-05 16.9 0.5 1 2 0.057 2.5 -0.1 0.1 3 33 87 117 85 124 0.83 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 1_11 - 193 Trp_repressor PF01371.14 88 1.3e-05 16.9 0.5 2 2 2e-06 8.9e-05 14.2 0.0 39 79 150 190 146 192 0.89 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 2_2 - 720 AAA_29 PF13555.1 62 7.2e-06 17.3 0.0 1 1 3.7e-07 1.7e-05 16.1 0.0 19 39 500 519 490 539 0.85 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_13 - 741 Herpes_ori_bp PF02399.10 824 3.5e-06 16.9 0.0 1 2 6.3e-07 2.8e-05 13.9 0.0 50 84 26 60 7 62 0.78 # 11456 # 13678 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.275 1_13 - 741 Herpes_ori_bp PF02399.10 824 3.5e-06 16.9 0.0 2 2 0.0091 0.41 0.2 0.0 612 672 207 266 89 304 0.80 # 11456 # 13678 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.275 1_17 - 328 RepA_N PF06970.6 76 6.1e-36 113.9 3.5 1 1 1e-36 1.6e-35 112.6 3.5 1 76 14 89 14 89 0.98 # 16772 # 17755 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.280 1_1 - 268 RepA_N PF06970.6 76 1.1e-33 106.8 4.7 1 1 1.8e-34 2.8e-33 105.4 4.7 1 76 15 90 15 90 0.99 # 3 # 806 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 5_2 - 79 RepA_N PF06970.6 76 3.2e-13 41.2 3.4 1 1 2.5e-14 3.8e-13 40.9 3.4 1 64 5 68 5 77 0.87 # 955 # 1191 # 1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.236 2_2 - 720 AAA_5 PF07728.9 139 9.1e-06 17.2 0.0 1 2 1.6e-05 0.00073 11.1 0.0 3 26 507 530 506 542 0.82 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 2_2 - 720 AAA_5 PF07728.9 139 9.1e-06 17.2 0.0 2 2 0.0036 0.16 3.5 0.0 60 83 621 650 597 704 0.70 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 1_19 - 206 Sdh_cyt PF01127.17 121 0.0012 10.4 15.6 1 2 0.00031 0.014 7.0 1.9 35 120 13 117 2 118 0.59 # 19275 # 19892 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.272 1_19 - 206 Sdh_cyt PF01127.17 121 0.0012 10.4 15.6 2 2 0.001 0.045 5.4 6.2 33 78 144 189 129 192 0.52 # 19275 # 19892 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.272 6_1 - 225 HTH_32 PF13565.1 77 1.2e-06 21.1 0.6 1 1 9.3e-07 1.4e-05 17.7 0.0 48 76 25 50 7 51 0.84 # 60 # 734 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 7_1 - 209 HTH_32 PF13565.1 77 1.5e-06 20.7 0.2 1 2 2.3e-06 3.4e-05 16.4 0.1 48 76 25 50 8 51 0.86 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 7_1 - 209 HTH_32 PF13565.1 77 1.5e-06 20.7 0.2 2 2 0.07 1.1 2.0 0.0 33 73 140 183 112 185 0.75 # 59 # 685 # 1 # ID=7_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 1_11 - 193 HTH_32 PF13565.1 77 8.1e-06 18.4 0.3 1 1 1e-06 1.5e-05 17.5 0.3 19 77 131 181 118 181 0.80 # 9869 # 10447 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 2_2 - 720 RNA_helicase PF00910.17 107 1.3e-05 17.2 0.2 1 1 1.3e-06 5.7e-05 15.1 0.1 2 53 507 561 506 565 0.77 # 1085 # 3244 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.284 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/59682887-0bea-4308-a3bd-da3ffef171b3 # Target file: checkm_output/bins/pGCA_001558795.1.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_001558795.1.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/59682887-0bea-4308-a3bd-da3ffef171b3 checkm_output/bins/pGCA_001558795.1.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/Staphylococcus/training_20210111 # Date: Mon Jan 11 14:53:41 2021 # [ok]