# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 4_17 - 257 KR PF08659.5 181 3.3e-06 20.0 0.0 1 1 4.1e-08 4.9e-06 19.5 0.0 12 90 20 95 8 112 0.82 # 10466 # 11236 # -1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 2_1 - 140 AAA_19 PF13245.1 76 0.00022 14.2 0.0 1 1 2.8e-06 0.00033 13.6 0.0 11 33 118 138 108 140 0.72 # 3 # 422 # -1 # ID=2_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 3_12 - 209 DUF258 PF03193.11 161 1.5e-09 30.4 0.1 1 1 2.3e-11 2.7e-09 29.6 0.1 13 67 4 59 1 69 0.88 # 6643 # 7269 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.287 1_37 - 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116 HTH_5 PF01022.15 47 4.7e-17 54.6 1.6 1 1 2e-18 8.1e-17 53.9 1.6 1 45 41 86 41 88 0.95 # 459 # 806 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.256 1_38 - 81 HTH_5 PF01022.15 47 1.4e-05 17.9 0.0 1 1 5.5e-07 2.2e-05 17.3 0.0 12 36 51 75 44 77 0.86 # 35990 # 36232 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.329 3_18 - 193 HTH_5 PF01022.15 47 0.00044 13.1 0.0 1 1 2.1e-05 0.00086 12.2 0.0 5 42 150 187 147 188 0.86 # 11084 # 11662 # -1 # ID=3_18;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.328 1_36 - 365 HATPase_c_5 PF14501.1 100 7.1e-09 28.5 0.0 1 1 1.9e-10 2.3e-08 26.9 0.0 4 99 249 352 247 353 0.79 # 33949 # 35043 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.421 2_9 - 88 Terminase_5 PF06056.7 58 5.3e-05 15.9 0.0 1 1 1.9e-06 7.8e-05 15.4 0.0 15 43 27 55 22 59 0.92 # 4045 # 4308 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 1_30 - 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127 HTH_DeoR PF08220.7 57 0.00097 11.9 0.3 1 1 6.9e-05 0.0041 9.9 0.1 8 46 18 60 14 62 0.76 # 11926 # 12306 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.247 1_35 - 323 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 4.3e-58 188.5 0.0 1 1 9.9e-60 5.9e-58 188.1 0.0 1 178 112 294 112 294 0.94 # 32766 # 33734 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 4_17 - 257 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 0.001 11.4 0.1 1 1 5.1e-05 0.0031 9.8 0.0 33 78 3 51 1 67 0.79 # 10466 # 11236 # -1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 4_15 - 191 LacI PF00356.16 46 0.00014 14.7 0.0 1 1 2.7e-06 0.00032 13.5 0.0 3 23 163 183 161 188 0.87 # 7969 # 8541 # 1 # ID=4_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 3_18 - 193 Phage_antitermQ PF06530.7 126 0.00098 11.9 0.0 1 2 0.021 2.5 0.9 0.0 52 95 58 101 37 112 0.83 # 11084 # 11662 # -1 # ID=3_18;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.328 3_18 - 193 Phage_antitermQ PF06530.7 126 0.00098 11.9 0.0 2 2 8.1e-05 0.0097 8.7 0.0 62 101 144 183 141 189 0.90 # 11084 # 11662 # -1 # ID=3_18;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.328 4_15 - 191 Phage_AlpA PF05930.7 51 2.1e-05 17.4 0.0 1 1 8.4e-07 5e-05 16.2 0.0 2 26 158 182 157 184 0.87 # 7969 # 8541 # 1 # ID=4_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 2_9 - 88 Phage_AlpA PF05930.7 51 7.4e-05 15.7 0.0 1 1 1.9e-06 0.00011 15.1 0.0 8 25 30 47 27 54 0.88 # 4045 # 4308 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 1_14 - 666 Zot PF05707.7 193 0.00039 13.1 0.3 1 2 0.076 9.1 -1.2 0.1 5 26 263 284 261 292 0.68 # 12945 # 14942 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.343 1_14 - 666 Zot PF05707.7 193 0.00039 13.1 0.3 2 2 1.5e-05 0.0017 10.9 0.0 83 131 531 580 468 616 0.81 # 12945 # 14942 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.343 2_12 - 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