# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_6 - 111 HTH_12 PF08461.5 66 3.3e-05 15.0 0.2 1 1 2.4e-06 7.9e-05 13.8 0.2 22 54 41 73 38 102 0.85 # 5941 # 6273 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 2_2 - 248 GerE PF00196.14 58 3.6e-06 17.6 1.1 1 2 0.00016 0.0054 7.5 0.1 19 42 2 25 2 27 0.90 # 435 # 1178 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 2_2 - 248 GerE PF00196.14 58 3.6e-06 17.6 1.1 2 2 6.9e-05 0.0023 8.7 0.1 21 45 97 121 93 133 0.87 # 435 # 1178 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_16 - 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198 Mga PF05043.8 87 1.1e-06 20.2 0.5 2 2 1.5e-06 5e-05 14.9 0.0 17 55 148 185 144 187 0.92 # 13281 # 13874 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.335 1_14 - 198 HTH_30 PF13556.1 59 9.9e-05 13.3 0.0 1 1 6.2e-06 0.0002 12.3 0.0 3 38 151 186 150 187 0.94 # 13281 # 13874 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.335 1_14 - 198 HTH_22 PF13309.1 64 5.1e-08 24.0 0.3 1 2 0.026 0.43 1.8 0.0 23 38 70 85 64 86 0.87 # 13281 # 13874 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.335 1_14 - 198 HTH_22 PF13309.1 64 5.1e-08 24.0 0.3 2 2 1.6e-07 2.7e-06 18.5 0.1 17 64 141 182 129 182 0.76 # 13281 # 13874 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.335 2_2 - 248 HTH_22 PF13309.1 64 4.3e-05 14.6 1.1 1 1 1e-05 0.00017 12.7 0.0 43 64 2 23 1 23 0.92 # 435 # 1178 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 4_1 - 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