# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_18 - 577 AAA_19 PF13245.1 76 1.4e-06 20.5 0.7 1 2 0.00011 0.0082 8.4 0.0 14 50 25 56 18 66 0.87 # 16885 # 18615 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_18 - 577 AAA_19 PF13245.1 76 1.4e-06 20.5 0.7 2 2 4.6e-05 0.0033 9.7 0.3 17 50 339 368 333 379 0.88 # 16885 # 18615 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_18 - 577 DUF258 PF03193.11 161 1.8e-06 19.6 1.1 1 2 0.00012 0.0089 7.7 0.1 35 61 20 46 3 61 0.77 # 16885 # 18615 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_18 - 577 DUF258 PF03193.11 161 1.8e-06 19.6 1.1 2 2 3.3e-05 0.0024 9.5 0.1 22 62 316 359 308 385 0.77 # 16885 # 18615 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 3_9 - 229 GerE PF00196.14 58 9.3e-05 14.2 0.6 1 1 2.5e-06 0.00018 13.3 0.6 19 45 2 28 2 34 0.85 # 6911 # 7597 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.293 1_18 - 577 DUF1611 PF07755.6 301 6.7e-05 14.0 1.4 1 2 0.0022 0.16 3.0 0.0 124 156 31 63 22 68 0.92 # 16885 # 18615 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_18 - 577 DUF1611 PF07755.6 301 6.7e-05 14.0 1.4 2 2 3.1e-05 0.0023 9.0 0.1 101 152 321 371 311 385 0.86 # 16885 # 18615 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_28 - 208 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 4.1e-05 15.9 2.3 1 1 1.1e-06 7.7e-05 15.0 2.3 20 44 160 184 156 186 0.90 # 24264 # 24887 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.308 1_18 - 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577 KaiC PF06745.8 227 8.1e-09 27.3 1.3 2 2 1.5e-06 0.00011 13.8 1.3 25 162 338 504 321 517 0.77 # 16885 # 18615 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 3_3 - 67 CSD PF00313.17 66 3e-32 102.7 2.8 1 1 4.5e-34 3.2e-32 102.6 2.8 2 65 3 65 2 66 0.97 # 2102 # 2302 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.348 1_17 - 555 TIGR01292 TIGR01292 300 9.9e-17 52.7 2.8 1 1 5.1e-18 1.8e-16 51.9 2.8 2 276 3 286 2 292 0.76 # 15224 # 16888 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 4_4 - 373 TIGR01292 TIGR01292 300 0.001 10.0 1.2 1 2 0.00039 0.014 6.3 0.3 1 35 4 38 4 54 0.85 # 2661 # 3779 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 4_4 - 373 TIGR01292 TIGR01292 300 0.001 10.0 1.2 2 2 0.0054 0.19 2.5 0.0 47 111 146 210 118 217 0.74 # 2661 # 3779 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_18 - 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