# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_12 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1e-05 17.8 0.0 1 2 0.0003 0.028 6.6 0.0 112 146 18 54 1 82 0.62 # 9220 # 9903 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_12 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1e-05 17.8 0.0 2 2 4e-05 0.0037 9.4 0.0 41 62 162 183 145 218 0.78 # 9220 # 9903 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_3 - 91 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 9e-21 66.0 9.0 1 1 1.5e-22 1.4e-20 65.4 9.0 1 36 1 35 1 35 0.99 # 4633 # 4905 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_8 - 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228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00011 14.3 0.0 2 2 0.00024 0.023 6.8 0.0 53 86 164 199 155 218 0.77 # 9220 # 9903 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_22 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00023 13.1 0.0 1 2 1.6e-05 0.0015 10.4 0.0 28 64 32 68 21 83 0.87 # 15581 # 16144 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 1_22 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00023 13.1 0.0 2 2 0.037 3.4 -0.6 0.0 127 137 114 124 104 133 0.81 # 15581 # 16144 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 1_50 - 245 rve_3 PF13683.1 67 9.1e-20 62.9 0.2 1 1 6.8e-21 1.6e-19 62.1 0.2 2 67 166 232 165 232 0.98 # 45414 # 46148 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 2_27 - 218 rve_3 PF13683.1 67 8.4e-16 50.2 0.1 1 1 6e-17 1.4e-15 49.4 0.1 2 67 133 199 132 199 0.96 # 29602 # 30255 # 1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 1_5 - 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389 CbiA PF01656.18 195 9.3e-37 119.1 0.0 1 1 1.3e-38 1.2e-36 118.7 0.0 2 194 110 339 109 340 0.80 # 5100 # 6266 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_10 - 707 PRK PF00485.13 194 0.00065 12.1 0.0 1 1 1.3e-05 0.0012 11.2 0.0 1 22 497 518 497 560 0.88 # 7261 # 9381 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.373 1_12 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00033 12.9 0.0 1 2 0.013 1.2 1.3 0.0 176 188 19 31 7 87 0.85 # 9220 # 9903 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_12 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00033 12.9 0.0 2 2 4e-05 0.0037 9.5 0.0 20 46 163 189 148 197 0.78 # 9220 # 9903 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_33 - 129 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 6.2e-05 15.3 0.0 1 1 1.2e-06 0.00011 14.5 0.0 31 47 14 30 6 31 0.92 # 25195 # 25581 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 1_7 - 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