# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_36 - 584 KaiC PF06745.8 227 0.0011 12.0 0.3 1 2 0.00052 0.11 5.5 0.0 25 58 14 46 10 97 0.91 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 KaiC PF06745.8 227 0.0011 12.0 0.3 2 2 0.0015 0.3 4.0 0.2 21 48 329 355 320 489 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_52 - 92 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 2.3e-21 69.0 8.1 1 1 2.2e-23 4.5e-21 68.0 8.1 1 36 1 36 1 36 0.99 # 39161 # 39436 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_45 - 109 HTH_IclR PF09339.5 52 7.5e-07 22.6 0.6 1 1 1.1e-08 7.5e-07 22.6 0.6 13 51 27 65 24 66 0.93 # 33508 # 33834 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_6 - 290 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00031 14.3 0.1 1 1 1.7e-05 0.0012 12.4 0.1 20 45 18 43 14 46 0.88 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 1_49 - 265 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00071 13.1 0.0 1 1 2.2e-05 0.0015 12.1 0.0 16 40 32 56 29 57 0.88 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 1_18 - 251 Peptidase_M56 PF05569.6 299 0.0012 11.7 0.0 1 1 8.6e-06 0.0017 11.2 0.0 180 217 56 93 43 102 0.87 # 14686 # 15438 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.664 7_7 - 152 HHH_3 PF12836.2 65 0.00039 14.3 0.0 1 1 7e-06 0.0014 12.5 0.0 16 55 39 78 36 88 0.86 # 4555 # 5010 # -1 # ID=7_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_2 - 276 ABC_tran PF00005.22 137 2.9e-30 99.3 0.0 1 1 7.7e-32 3.9e-30 98.8 0.0 1 137 27 180 27 180 0.90 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_14 - 932 ABC_tran PF00005.22 137 3.9e-05 17.9 0.0 1 2 0.0076 0.39 4.9 0.0 15 42 307 332 298 382 0.77 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 ABC_tran PF00005.22 137 3.9e-05 17.9 0.0 2 2 0.00029 0.015 9.5 0.0 13 39 645 671 638 695 0.81 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 ABC_tran PF00005.22 137 0.00016 15.9 0.0 1 2 0.054 2.7 2.2 0.0 15 79 12 76 9 118 0.63 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 ABC_tran PF00005.22 137 0.00016 15.9 0.0 2 2 0.00015 0.0076 10.5 0.0 13 45 329 361 322 443 0.78 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 ABC_tran PF00005.22 137 0.00064 13.9 0.0 1 2 0.031 1.6 3.0 0.0 15 32 14 31 11 214 0.84 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 ABC_tran PF00005.22 137 0.00064 13.9 0.0 2 2 0.00071 0.036 8.3 0.0 14 60 331 384 324 415 0.76 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 6_2 - 337 ADH_N PF08240.7 109 8.1e-12 38.8 0.0 1 1 6.4e-14 1.3e-11 38.2 0.0 3 62 31 89 29 103 0.93 # 463 # 1473 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 1_14 - 932 DUF815 PF05673.8 250 1.2e-05 18.2 1.9 1 3 2e-05 0.004 9.9 0.0 41 114 291 382 284 385 0.69 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 DUF815 PF05673.8 250 1.2e-05 18.2 1.9 2 3 0.075 15 -1.8 0.4 199 248 533 586 526 588 0.71 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 DUF815 PF05673.8 250 1.2e-05 18.2 1.9 3 3 0.00032 0.064 6.0 0.0 51 92 641 682 599 696 0.70 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 3_12 - 424 Cdd1 PF11731.3 93 0.00036 14.4 0.0 1 2 0.074 15 -0.4 0.0 53 66 94 107 74 118 0.76 # 10852 # 12123 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 3_12 - 424 Cdd1 PF11731.3 93 0.00036 14.4 0.0 2 2 1.4e-05 0.0028 11.5 0.0 10 47 178 215 144 227 0.86 # 10852 # 12123 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 7_7 - 152 HHH_5 PF14520.1 60 0.00041 14.5 0.0 1 1 3.9e-06 0.00079 13.5 0.0 40 58 39 57 3 64 0.62 # 4555 # 5010 # -1 # ID=7_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 3_24 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00077 12.5 0.0 1 2 2.6e-05 0.0054 9.7 0.0 28 71 32 75 21 93 0.82 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 3_24 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00077 12.5 0.0 2 2 0.031 6.4 -0.4 0.0 124 137 111 124 97 132 0.81 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_5 - 337 ThiF PF00899.16 136 0.0052 10.5 5.4 1 3 0.017 3.4 1.4 0.1 78 117 8 47 5 61 0.77 # 3462 # 4472 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 1_5 - 337 ThiF PF00899.16 136 0.0052 10.5 5.4 2 3 0.00014 0.028 8.2 1.6 2 26 145 169 144 172 0.92 # 3462 # 4472 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 1_5 - 337 ThiF PF00899.16 136 0.0052 10.5 5.4 3 3 0.047 9.6 -0.1 0.0 84 111 192 220 172 229 0.78 # 3462 # 4472 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 5_7 - 274 rve_3 PF13683.1 67 1.4e-18 60.2 0.0 1 1 6.5e-20 2.6e-18 59.3 0.0 4 67 199 262 196 262 0.95 # 7064 # 7885 # -1 # ID=5_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.560 3_33 - 360 rve_3 PF13683.1 67 4.7e-18 58.5 0.2 1 1 2.2e-19 8.9e-18 57.6 0.2 2 67 260 328 259 328 0.98 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_20 - 240 rve_3 PF13683.1 67 2e-11 37.2 0.0 1 1 2.7e-12 1.1e-10 34.8 0.0 6 67 165 228 160 228 0.94 # 16061 # 16780 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.515 1_22 - 453 rve_3 PF13683.1 67 4.4e-09 29.7 0.1 1 1 5.5e-10 2.3e-08 27.4 0.0 7 56 238 290 233 294 0.92 # 17281 # 18639 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_24 - 468 rve_3 PF13683.1 67 0.00028 14.3 0.0 1 1 1.6e-05 0.00067 13.1 0.0 16 56 252 295 237 295 0.88 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_14 - 932 Sigma54_activat PF00158.21 168 9.7e-13 41.8 0.1 1 2 0.00029 0.03 7.7 0.1 2 61 285 349 284 393 0.59 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 Sigma54_activat PF00158.21 168 9.7e-13 41.8 0.1 2 2 2.6e-11 2.7e-09 30.6 0.0 22 153 643 773 615 777 0.84 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.0015 11.9 0.0 1 2 0.0074 0.75 3.1 0.0 25 59 11 47 2 56 0.77 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.0015 11.9 0.0 2 2 0.00098 0.1 6.0 0.0 23 42 328 347 310 371 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 10_3 - 57 HTH_Tnp_Tc3_2 PF01498.13 72 0.00045 14.2 0.0 1 1 2.4e-06 0.00049 14.1 0.0 14 39 26 51 11 55 0.89 # 1394 # 1564 # 1 # ID=10_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 2_22 - 660 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00015 15.2 0.0 1 1 5.8e-06 0.00039 13.8 0.0 39 63 260 286 246 288 0.85 # 23417 # 25396 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 1_41 - 447 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.0002 14.8 0.0 1 1 6.3e-06 0.00042 13.7 0.0 40 111 330 399 300 419 0.82 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_14 - 932 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00022 14.7 0.0 1 2 0.00077 0.052 6.9 0.0 19 69 284 334 269 337 0.80 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00022 14.7 0.0 2 2 0.0033 0.22 4.8 0.0 40 86 645 688 625 694 0.85 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 4_5 - 732 Helicase_C PF00271.26 78 3.6e-13 43.1 0.0 1 1 5.3e-15 1.1e-12 41.6 0.0 10 76 295 362 293 364 0.96 # 4610 # 6805 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.475 1_49 - 265 HTH_38 PF13936.1 44 3.6e-05 17.2 0.2 1 1 1.5e-06 0.0001 15.7 0.2 15 41 29 55 19 57 0.89 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 8_5 - 93 HTH_38 PF13936.1 44 4.1e-05 17.0 0.4 1 1 1.5e-06 9.9e-05 15.8 0.2 10 39 33 63 29 66 0.91 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 10_3 - 57 HTH_38 PF13936.1 44 0.0005 13.5 0.0 1 1 2.3e-05 0.0016 11.9 0.0 30 43 40 53 38 54 0.90 # 1394 # 1564 # 1 # ID=10_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_5 - 337 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 2e-49 161.0 0.0 1 1 1.3e-51 2.7e-49 160.6 0.0 1 178 109 294 109 294 0.93 # 3462 # 4472 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 1_41 - 447 MobB PF03205.9 140 1.7e-08 28.2 0.3 1 2 9.4e-06 0.00064 13.4 0.0 2 38 12 47 11 104 0.87 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 MobB PF03205.9 140 1.7e-08 28.2 0.3 2 2 1.5e-05 0.001 12.7 0.3 3 32 331 360 329 368 0.90 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 MobB PF03205.9 140 1e-06 22.4 0.0 1 2 5.9e-05 0.004 10.8 0.0 3 38 11 45 9 84 0.85 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 MobB PF03205.9 140 1e-06 22.4 0.0 2 2 0.00016 0.011 9.4 0.0 3 49 330 376 328 413 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 MobB PF03205.9 140 0.0009 12.9 0.0 1 2 0.019 1.3 2.7 0.0 5 26 308 329 307 339 0.86 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 MobB PF03205.9 140 0.0009 12.9 0.0 2 2 0.00074 0.05 7.2 0.0 3 28 646 671 644 686 0.83 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_45 - 109 NinF PF05810.7 58 0.00034 14.3 0.2 1 1 2.4e-06 0.00049 13.8 0.2 13 41 65 94 60 104 0.86 # 33508 # 33834 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_41 - 447 SecA_DEAD PF07517.9 266 0.0017 11.6 0.6 1 1 2.5e-05 0.0051 10.0 0.1 92 127 329 365 316 382 0.85 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 6_3 - 374 Sigma54_DBD PF04552.8 160 0.00081 12.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.0023 11.3 0.0 46 72 13 39 7 49 0.89 # 1895 # 3016 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 1_5 - 337 IlvN PF07991.7 165 3.4e-05 17.2 0.0 1 2 0.037 7.4 -0.2 0.0 50 77 35 62 19 69 0.76 # 3462 # 4472 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 1_5 - 337 IlvN PF07991.7 165 3.4e-05 17.2 0.0 2 2 9.6e-07 0.00019 14.7 0.0 2 90 143 231 142 238 0.82 # 3462 # 4472 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 1_36 - 584 AAA_19 PF13245.1 76 8e-10 32.3 2.1 1 2 2.9e-06 0.00015 15.4 0.0 14 50 13 44 4 49 0.89 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_19 PF13245.1 76 8e-10 32.3 2.1 2 2 7.6e-06 0.00039 14.1 0.0 4 36 320 353 318 413 0.84 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 AAA_19 PF13245.1 76 1.6e-07 24.9 6.2 1 2 1.5e-05 0.00074 13.2 0.1 16 50 16 46 10 60 0.89 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_19 PF13245.1 76 1.6e-07 24.9 6.2 2 2 2.5e-05 0.0012 12.5 1.6 9 53 327 367 319 369 0.77 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 2_3 - 1754 AAA_19 PF13245.1 76 4.6e-06 20.3 0.5 1 1 9e-08 4.6e-06 20.3 0.5 8 74 984 1047 976 1050 0.71 # 1577 # 6838 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 1_14 - 932 AAA_19 PF13245.1 76 8.1e-06 19.5 0.1 1 2 7e-05 0.0035 11.0 0.0 9 37 304 329 296 368 0.80 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_19 PF13245.1 76 8.1e-06 19.5 0.1 2 2 0.0038 0.19 5.4 0.0 15 35 648 668 623 692 0.82 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 3_6 - 389 CbiA PF01656.18 195 1.6e-36 119.4 0.0 1 1 4.1e-38 2.1e-36 119.0 0.0 2 194 110 339 109 340 0.80 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_36 - 584 CbiA PF01656.18 195 1.7e-28 93.2 0.0 1 2 4.8e-16 2.4e-14 47.0 0.0 4 163 13 242 10 270 0.71 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 CbiA PF01656.18 195 1.7e-28 93.2 0.0 2 2 4e-15 2e-13 44.0 0.0 4 157 332 528 329 557 0.74 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 CbiA PF01656.18 195 1.5e-26 86.9 0.1 1 2 1.6e-17 8.3e-16 51.8 0.0 2 174 13 260 12 278 0.71 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 CbiA PF01656.18 195 1.5e-26 86.9 0.1 2 2 9.7e-12 4.9e-10 33.0 0.1 2 43 331 372 330 406 0.88 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_40 - 158 CbiA PF01656.18 195 0.0017 11.6 0.0 1 1 5.6e-05 0.0029 10.9 0.0 89 124 7 56 1 129 0.71 # 30031 # 30504 # -1 # ID=1_40;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 1_36 - 584 KTI12 PF08433.5 270 0.00031 13.9 0.1 1 2 0.0045 0.46 3.5 0.0 4 38 11 45 9 54 0.90 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 KTI12 PF08433.5 270 0.00031 13.9 0.1 2 2 0.0002 0.02 7.9 0.0 3 38 329 364 328 387 0.88 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 KTI12 PF08433.5 270 0.00093 12.3 0.0 1 2 0.0057 0.58 3.2 0.0 2 38 11 47 11 61 0.89 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 KTI12 PF08433.5 270 0.00093 12.3 0.0 2 2 0.00045 0.046 6.8 0.0 3 38 330 365 329 389 0.90 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_14 - 932 TIGR00390 TIGR00390 441 1.8e-08 27.3 0.6 1 3 0.007 1.4 1.2 0.1 48 70 304 326 290 333 0.85 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIGR00390 TIGR00390 441 1.8e-08 27.3 0.6 2 3 0.06 12 -1.8 0.0 240 264 366 392 357 403 0.69 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIGR00390 TIGR00390 441 1.8e-08 27.3 0.6 3 3 2.6e-09 5.2e-07 22.4 0.0 8 87 609 686 605 694 0.76 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_43 - 182 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.1e-10 34.8 0.1 1 1 4.2e-12 2.1e-10 33.9 0.1 3 54 105 156 103 156 0.97 # 32244 # 32789 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.586 2_38 - 232 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 2.5e-05 17.6 0.0 1 1 9.2e-07 4.7e-05 16.8 0.0 25 54 163 192 143 199 0.92 # 33803 # 34498 # -1 # ID=2_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 1_49 - 265 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 4.6e-05 16.8 0.0 1 1 2.2e-06 0.00011 15.5 0.0 26 48 34 56 32 57 0.93 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 8_5 - 93 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00073 12.9 0.0 1 1 3.3e-05 0.0017 11.8 0.0 22 44 40 62 38 68 0.88 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_5 - 337 Rep_3 PF01051.16 222 1.1e-32 107.3 1.9 1 1 8.2e-35 1.7e-32 106.7 1.9 4 214 25 275 22 281 0.85 # 4001 # 5011 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 5_7 - 274 rve PF00665.21 120 1.8e-22 73.6 0.0 1 1 8e-24 2.7e-22 73.1 0.0 7 119 108 224 102 225 0.95 # 7064 # 7885 # -1 # ID=5_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.560 3_33 - 360 rve PF00665.21 120 3.3e-22 72.8 0.0 1 1 1.7e-23 5.6e-22 72.0 0.0 3 120 176 288 174 288 0.92 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_20 - 240 rve PF00665.21 120 8.2e-21 68.3 0.0 1 1 1.6e-21 5.3e-20 65.7 0.0 4 119 75 188 72 189 0.96 # 16061 # 16780 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.515 1_22 - 453 rve PF00665.21 120 1.3e-13 45.0 0.0 1 1 1.3e-14 4.5e-13 43.3 0.0 4 119 138 260 135 261 0.88 # 17281 # 18639 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 13_1 - 220 rve PF00665.21 120 6.4e-13 42.8 0.1 1 1 3.1e-13 1e-11 38.9 0.0 9 119 60 167 55 168 0.89 # 54 # 713 # -1 # ID=13_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_24 - 468 rve PF00665.21 120 1.7e-09 31.7 0.0 1 1 9e-11 3.1e-09 30.9 0.0 3 119 141 265 139 266 0.82 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_41 - 447 CTP_synth_N PF06418.9 276 0.0026 10.7 0.3 1 3 0.024 5 -0.0 0.0 3 45 12 52 11 62 0.88 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 CTP_synth_N PF06418.9 276 0.0026 10.7 0.3 2 3 0.033 6.6 -0.4 0.0 174 208 200 234 183 242 0.72 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 CTP_synth_N PF06418.9 276 0.0026 10.7 0.3 3 3 0.00026 0.054 6.4 0.0 12 41 337 366 329 375 0.90 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 8_5 - 93 Fe_dep_repress PF01325.14 60 2.2e-05 18.3 0.0 1 1 2.8e-07 2.9e-05 17.9 0.0 24 56 46 81 26 85 0.80 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_6 - 290 Fe_dep_repress PF01325.14 60 0.00072 13.4 0.0 1 1 1.5e-05 0.0015 12.4 0.0 29 49 23 43 15 51 0.91 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 1_36 - 584 YhjQ PF06564.7 244 1.9e-08 27.8 0.1 1 2 7.8e-07 7.9e-05 16.0 0.0 10 52 16 58 11 150 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 YhjQ PF06564.7 244 1.9e-08 27.8 0.1 2 2 9.7e-05 0.0098 9.1 0.0 10 49 335 374 328 400 0.84 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 YhjQ PF06564.7 244 7.7e-08 25.8 0.2 1 2 5.9e-06 0.0006 13.1 0.0 10 125 18 145 13 158 0.61 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 YhjQ PF06564.7 244 7.7e-08 25.8 0.2 2 2 4e-05 0.0041 10.4 0.2 10 35 336 361 328 369 0.85 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_14 - 932 AAA_23 PF13476.1 202 5.1e-06 20.8 1.1 1 2 0.0042 0.21 5.7 1.0 23 201 307 565 287 613 0.47 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_23 PF13476.1 202 5.1e-06 20.8 1.1 2 2 9.2e-05 0.0047 11.2 0.0 22 59 646 683 640 820 0.66 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_2 - 276 AAA_23 PF13476.1 202 6e-05 17.3 0.0 1 1 1.7e-06 8.5e-05 16.8 0.0 10 40 27 58 23 99 0.85 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_36 - 584 AAA_23 PF13476.1 202 0.0022 12.2 0.1 1 1 0.0005 0.025 8.7 0.0 18 40 326 348 308 428 0.85 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_69 - 462 AAA_23 PF13476.1 202 0.014 9.6 4.6 1 2 0.0014 0.069 7.3 1.3 106 198 122 233 62 244 0.68 # 55029 # 56414 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_69 - 462 AAA_23 PF13476.1 202 0.014 9.6 4.6 2 2 0.022 1.1 3.4 0.1 144 191 349 403 303 437 0.61 # 55029 # 56414 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_14 - 932 DNA_pol3_delta2 PF13177.1 162 4.3e-05 17.1 0.0 1 1 1.2e-06 0.00024 14.7 0.0 21 125 645 738 636 742 0.82 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 AAA_24 PF13479.1 213 5e-05 16.8 3.3 1 2 5.8e-05 0.0039 10.7 0.1 9 77 16 146 12 154 0.78 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_24 PF13479.1 213 5e-05 16.8 3.3 2 2 0.005 0.34 4.3 0.9 7 22 332 347 328 352 0.84 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_14 - 932 AAA_24 PF13479.1 213 0.00048 13.6 0.0 1 2 0.0074 0.5 3.8 0.0 5 23 305 323 301 329 0.78 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_24 PF13479.1 213 0.00048 13.6 0.0 2 2 0.0006 0.04 7.3 0.0 6 26 646 666 642 737 0.68 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 AAA_24 PF13479.1 213 0.012 9.0 3.4 1 2 0.022 1.5 2.2 0.3 10 33 15 46 11 146 0.68 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_24 PF13479.1 213 0.012 9.0 3.4 2 2 0.001 0.071 6.5 0.2 6 22 330 346 327 352 0.87 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_43 - 182 Sigma70_r2 PF04542.9 71 7.1e-15 48.3 2.9 1 1 7.4e-17 1.5e-14 47.3 2.9 1 69 14 80 14 82 0.96 # 32244 # 32789 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.586 3_24 - 188 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.4e-13 44.8 0.1 1 1 1.1e-15 2.2e-13 44.2 0.1 2 111 52 144 51 148 0.90 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_41 - 447 TIGR00416 TIGR00416 454 0.00026 13.4 0.2 1 2 0.00034 0.035 6.4 0.0 97 189 13 105 11 130 0.78 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 TIGR00416 TIGR00416 454 0.00026 13.4 0.2 2 2 0.0014 0.14 4.3 0.2 95 129 329 363 324 372 0.85 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 TIGR00416 TIGR00416 454 0.0012 11.1 0.0 1 2 0.00025 0.025 6.8 0.0 99 187 13 101 9 119 0.80 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 TIGR00416 TIGR00416 454 0.0012 11.1 0.0 2 2 0.0078 0.79 1.9 0.0 95 121 328 354 322 368 0.86 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.7e-07 24.4 0.6 1 3 0.00095 0.19 4.6 0.0 16 41 303 328 289 338 0.81 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.7e-07 24.4 0.6 2 3 0.064 13 -1.3 0.4 107 153 494 548 491 579 0.69 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.7e-07 24.4 0.6 3 3 3.3e-07 6.8e-05 15.9 0.0 12 99 638 736 628 742 0.83 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 2_3 - 1754 AAA_30 PF13604.1 196 3.4e-45 147.9 7.6 1 2 2.5e-06 0.00013 15.5 1.4 10 126 425 536 422 560 0.85 # 1577 # 6838 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 2_3 - 1754 AAA_30 PF13604.1 196 3.4e-45 147.9 7.6 2 2 1.2e-42 6e-41 134.1 0.5 2 186 971 1158 970 1162 0.94 # 1577 # 6838 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 1_36 - 584 AAA_30 PF13604.1 196 1e-06 22.3 0.6 1 2 0.0014 0.069 6.6 0.0 21 54 11 44 2 54 0.88 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_30 PF13604.1 196 1e-06 22.3 0.6 2 2 1.3e-05 0.00065 13.2 0.1 10 54 319 363 316 380 0.88 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_2 - 276 AAA_30 PF13604.1 196 0.00011 15.8 0.0 1 1 5.8e-06 0.00029 14.3 0.0 16 49 35 68 28 70 0.86 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_41 - 447 AAA_30 PF13604.1 196 0.00046 13.7 7.4 1 2 0.01 0.52 3.7 0.0 21 67 13 61 6 89 0.72 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_30 PF13604.1 196 0.00046 13.7 7.4 2 2 1.3e-05 0.00068 13.1 1.2 9 54 319 364 315 372 0.87 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_5 - 337 F420_oxidored PF03807.12 96 2.7e-05 18.5 0.0 1 1 2.7e-07 5.5e-05 17.5 0.0 1 73 147 212 147 236 0.81 # 3462 # 4472 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 14_1 - 132 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.0001 16.0 0.1 1 2 5e-05 0.01 9.5 0.0 6 45 22 61 17 78 0.86 # 65 # 460 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 14_1 - 132 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.0001 16.0 0.1 2 2 0.0014 0.29 4.8 0.0 42 81 86 123 81 129 0.84 # 65 # 460 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_2 - 276 SMC_N PF02463.14 220 8.5e-05 15.7 0.0 1 1 2.6e-05 0.0054 9.9 0.0 24 185 37 196 24 231 0.47 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 14_1 - 132 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.5e-19 62.5 1.3 1 1 1.2e-20 4.7e-19 62.1 0.3 3 74 19 97 17 99 0.90 # 65 # 460 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 7_6 - 49 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.4e-10 34.9 0.0 1 1 4e-12 1.6e-10 34.7 0.0 4 41 2 38 1 39 0.95 # 4216 # 4362 # 1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 1_19 - 169 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.8e-10 32.7 0.6 1 1 3.1e-11 1.2e-09 31.9 0.6 3 73 15 93 13 96 0.81 # 15552 # 16058 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 10_3 - 57 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 4.8e-05 17.2 0.8 1 1 2.3e-06 9.5e-05 16.3 0.8 4 47 6 54 4 57 0.81 # 1394 # 1564 # 1 # ID=10_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 3_33 - 360 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.0006 13.7 0.1 1 1 3.5e-05 0.0014 12.5 0.1 26 57 45 77 30 106 0.77 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_14 - 932 Ribosomal_S7 PF00177.16 148 0.00085 12.8 0.1 1 1 9e-06 0.0018 11.7 0.1 42 143 291 387 270 392 0.89 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 8_5 - 93 GerE PF00196.14 58 0.00036 13.8 0.0 1 1 5.4e-06 0.00055 13.2 0.0 17 42 43 68 36 80 0.90 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_38 - 232 GerE PF00196.14 58 0.00083 12.6 0.0 1 1 1.8e-05 0.0018 11.5 0.0 4 51 150 197 149 203 0.85 # 33803 # 34498 # -1 # ID=2_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 2_4 - 771 TraG-D_C PF12696.2 128 1.4e-19 64.1 0.0 1 1 1.6e-21 3.2e-19 63.0 0.0 1 127 419 541 419 542 0.88 # 6838 # 9150 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 13_1 - 220 DDE_3 PF13358.1 146 0.0013 12.4 0.0 1 1 1.6e-05 0.0033 11.1 0.0 32 90 67 126 44 138 0.88 # 54 # 713 # -1 # ID=13_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_41 - 447 MipZ PF09140.6 261 1e-09 31.7 1.0 1 3 0.00064 0.043 6.7 0.0 5 38 14 47 11 68 0.87 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 MipZ PF09140.6 261 1e-09 31.7 1.0 2 3 0.023 1.6 1.6 0.0 70 110 107 150 88 157 0.67 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 MipZ PF09140.6 261 1e-09 31.7 1.0 3 3 4.5e-08 3.1e-06 20.3 0.0 3 54 330 381 328 408 0.83 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 MipZ PF09140.6 261 1.1e-07 25.0 2.3 1 2 7.2e-05 0.0049 9.8 0.0 8 39 15 46 10 54 0.90 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 MipZ PF09140.6 261 1.1e-07 25.0 2.3 2 2 2.1e-05 0.0014 11.6 0.4 6 39 332 365 327 464 0.62 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 3_6 - 389 MipZ PF09140.6 261 9.5e-06 18.7 0.4 1 2 1.1e-05 0.00071 12.6 0.0 2 47 108 153 107 157 0.87 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_6 - 389 MipZ PF09140.6 261 9.5e-06 18.7 0.4 2 2 0.0035 0.24 4.3 0.1 88 134 224 270 197 290 0.84 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_24 - 188 UPF0020 PF01170.13 180 2.8e-05 17.7 0.0 1 2 9.5e-07 0.00019 14.9 0.0 19 54 41 78 39 110 0.68 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 3_24 - 188 UPF0020 PF01170.13 180 2.8e-05 17.7 0.0 2 2 0.012 2.4 1.6 0.0 91 116 98 122 87 138 0.82 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_8 - 327 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2.6e-35 115.7 0.1 1 1 9.2e-37 4.7e-35 114.9 0.1 5 212 138 312 135 313 0.90 # 6544 # 7524 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 12_1 - 252 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1e-19 64.8 0.1 1 1 3e-21 1.5e-19 64.2 0.1 4 116 130 242 127 250 0.91 # 33 # 788 # 1 # ID=12_1;partial=01;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 4_1 - 113 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.1e-07 25.5 0.1 1 1 2.5e-09 1.3e-07 25.3 0.1 85 205 1 91 1 98 0.83 # 1 # 339 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 9_2 - 113 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.5e-07 25.1 0.1 1 1 3.4e-09 1.7e-07 24.9 0.1 85 205 1 91 1 98 0.83 # 1552 # 1890 # -1 # ID=9_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 1_73 - 135 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 3.6e-26 86.1 0.0 1 1 6.1e-28 4.1e-26 85.9 0.0 154 248 2 94 1 95 0.96 # 59717 # 60121 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.511 1_48 - 272 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 2e-18 60.7 0.0 1 1 4.3e-20 2.9e-18 60.2 0.0 1 104 160 254 160 267 0.94 # 35284 # 36099 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.538 1_49 - 265 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 5.1e-16 52.9 0.1 1 1 1.4e-17 9.2e-16 52.0 0.1 121 249 138 259 104 259 0.83 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 1_2 - 276 AAA_21 PF13304.1 303 1.1e-10 35.8 0.1 1 2 2.5e-06 0.00051 13.9 0.3 1 22 39 60 39 80 0.89 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_2 - 276 AAA_21 PF13304.1 303 1.1e-10 35.8 0.1 2 2 4.6e-08 9.4e-06 19.6 0.0 235 298 150 211 137 214 0.87 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_43 - 182 Sigma70_r4 PF04545.11 50 8e-07 22.3 0.6 1 1 1.3e-08 1.4e-06 21.5 0.6 2 50 110 158 109 158 0.98 # 32244 # 32789 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.586 8_5 - 93 Sigma70_r4 PF04545.11 50 1.6e-05 18.1 0.1 1 1 3.4e-07 3.5e-05 17.0 0.0 15 44 39 68 33 71 0.92 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_14 - 932 AAA PF00004.24 132 4.8e-30 98.4 0.0 1 2 3.1e-19 2.1e-17 57.5 0.0 2 115 307 428 306 444 0.81 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA PF00004.24 132 4.8e-30 98.4 0.0 2 2 3.1e-13 2.1e-11 38.1 0.0 2 120 647 775 646 786 0.83 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 AAA PF00004.24 132 7.5e-06 20.1 0.9 1 2 0.0012 0.084 7.0 0.0 2 20 14 32 13 86 0.79 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA PF00004.24 132 7.5e-06 20.1 0.9 2 2 6e-05 0.0041 11.3 0.1 2 24 332 354 331 393 0.83 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 AAA PF00004.24 132 1.5e-05 19.2 0.1 1 2 0.012 0.81 3.8 0.0 2 22 12 32 11 60 0.80 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA PF00004.24 132 1.5e-05 19.2 0.1 2 2 1.7e-05 0.0012 13.0 0.0 1 22 330 351 330 480 0.87 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 8_5 - 93 HTH_37 PF13744.1 80 5.5e-14 45.7 0.1 1 1 3.3e-16 6.8e-14 45.4 0.1 4 77 16 89 13 91 0.88 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_32 - 192 HTH_27 PF13463.1 68 0.00085 13.6 0.1 1 2 0.00042 0.043 8.1 0.0 4 68 13 85 11 85 0.69 # 23844 # 24419 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 1_32 - 192 HTH_27 PF13463.1 68 0.00085 13.6 0.1 2 2 0.02 2 2.8 0.0 57 68 144 155 140 155 0.90 # 23844 # 24419 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 1_34 - 117 HTH_27 PF13463.1 68 0.0016 12.7 0.0 1 1 2.7e-05 0.0028 11.9 0.0 25 66 36 74 34 75 0.83 # 25034 # 25384 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.550 1_14 - 932 TIGR00382 TIGR00382 414 1.9e-08 27.3 0.9 1 3 2.9e-05 0.0059 9.2 0.1 116 194 302 387 283 393 0.66 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIGR00382 TIGR00382 414 1.9e-08 27.3 0.9 2 3 3.3e-06 0.00068 12.3 0.0 70 140 605 666 575 669 0.78 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIGR00382 TIGR00382 414 1.9e-08 27.3 0.9 3 3 0.0033 0.68 2.4 0.0 295 380 792 873 761 881 0.79 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 TIGR00064 TIGR00064 279 4.9e-07 22.8 0.4 1 2 0.00012 0.012 8.4 0.0 79 117 10 48 5 91 0.79 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 TIGR00064 TIGR00064 279 4.9e-07 22.8 0.4 2 2 7.3e-06 0.00074 12.4 0.1 81 116 330 365 307 394 0.82 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 TIGR00064 TIGR00064 279 5.7e-07 22.6 0.1 1 2 0.00018 0.018 7.8 0.0 82 116 11 45 2 55 0.88 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 TIGR00064 TIGR00064 279 5.7e-07 22.6 0.1 2 2 7.8e-06 0.00079 12.3 0.0 78 116 326 364 305 389 0.89 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_20 - 240 rve_2 PF13333.1 52 1.6e-15 50.8 0.1 1 1 1.6e-17 1.6e-15 50.8 0.1 1 50 179 234 179 235 0.91 # 16061 # 16780 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.515 3_33 - 360 rve_2 PF13333.1 52 2.5e-05 18.2 0.1 1 1 5.3e-07 5.4e-05 17.2 0.1 16 47 296 331 278 334 0.85 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_14 - 932 Torsin PF06309.6 127 0.00017 15.4 0.0 1 1 3.3e-06 0.00068 13.5 0.0 15 80 603 670 594 677 0.85 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_19 - 169 P22_Cro PF14549.1 60 0.00034 14.2 0.1 1 1 4.1e-06 0.00083 13.0 0.0 10 40 36 66 30 70 0.88 # 15552 # 16058 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 3_6 - 389 MerR_1 PF13411.1 69 0.00022 14.9 0.0 1 1 6.6e-06 0.00067 13.4 0.0 2 35 41 75 40 104 0.79 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_49 - 265 MerR_1 PF13411.1 69 0.00088 13.0 0.0 1 1 4.9e-05 0.005 10.6 0.0 3 24 37 58 35 67 0.88 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 8_5 - 93 HTH_25 PF13413.1 62 1.4e-05 18.6 0.0 1 1 1.8e-07 3.6e-05 17.3 0.0 2 34 36 68 35 88 0.87 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_2 - 276 cobW PF02492.14 178 0.0041 10.5 1.4 1 2 5.4e-05 0.011 9.1 0.7 3 21 40 58 38 80 0.88 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_2 - 276 cobW PF02492.14 178 0.0041 10.5 1.4 2 2 0.046 9.3 -0.5 0.0 93 132 179 215 145 249 0.67 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_14 - 932 AAA_16 PF13191.1 185 8.3e-16 52.4 4.8 1 3 2e-06 6.8e-05 16.8 0.0 2 47 284 326 283 337 0.88 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_16 PF13191.1 185 8.3e-16 52.4 4.8 2 3 0.00069 0.023 8.5 0.0 125 160 350 385 330 393 0.91 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_16 PF13191.1 185 8.3e-16 52.4 4.8 3 3 9e-09 3.1e-07 24.5 0.1 1 65 614 684 614 730 0.82 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 AAA_16 PF13191.1 185 2.3e-09 31.4 0.3 1 2 0.00014 0.0048 10.8 0.0 23 81 9 62 5 156 0.67 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_16 PF13191.1 185 2.3e-09 31.4 0.3 2 2 1.3e-06 4.5e-05 17.4 0.1 11 80 315 386 311 403 0.83 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 AAA_16 PF13191.1 185 5.9e-08 26.8 1.6 1 2 7.2e-05 0.0025 11.7 0.4 23 135 7 90 3 264 0.84 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_16 PF13191.1 185 5.9e-08 26.8 1.6 2 2 4.7e-05 0.0016 12.3 0.0 16 81 319 383 314 461 0.61 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 4_4 - 439 AAA_16 PF13191.1 185 6.1e-08 26.7 0.1 1 1 3.7e-09 1.3e-07 25.7 0.1 3 86 33 118 32 342 0.88 # 3297 # 4613 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_4 - 771 AAA_16 PF13191.1 185 5.9e-06 20.3 0.0 1 1 8.4e-07 2.8e-05 18.0 0.0 20 56 181 218 179 254 0.78 # 6838 # 9150 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_2 - 276 AAA_16 PF13191.1 185 0.00015 15.6 6.7 1 1 1.4e-05 0.00048 14.0 6.7 23 131 36 188 25 247 0.51 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_32 - 192 NodS PF05401.6 201 0.0018 11.6 0.0 1 2 0.05 10 -0.7 0.0 42 154 35 60 20 69 0.62 # 23844 # 24419 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 1_32 - 192 NodS PF05401.6 201 0.0018 11.6 0.0 2 2 3.3e-05 0.0067 9.7 0.0 25 70 100 145 93 173 0.84 # 23844 # 24419 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 1_14 - 932 AAA_22 PF13401.1 131 8e-11 36.1 0.3 1 2 1.1e-05 0.00038 14.5 0.1 7 98 306 386 300 400 0.76 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_22 PF13401.1 131 8e-11 36.1 0.3 2 2 2.7e-06 9.2e-05 16.5 0.0 8 113 647 740 644 760 0.79 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 4_4 - 439 AAA_22 PF13401.1 131 2.5e-07 24.8 0.1 1 1 2.2e-06 7.4e-05 16.8 0.1 4 127 54 288 50 290 0.78 # 3297 # 4613 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_2 - 276 AAA_22 PF13401.1 131 5.1e-06 20.6 0.4 1 1 3e-06 0.0001 16.4 0.4 4 127 37 214 34 218 0.76 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_41 - 447 AAA_22 PF13401.1 131 1.7e-05 18.8 1.3 1 2 0.0012 0.041 8.0 0.1 6 49 12 50 10 137 0.82 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_22 PF13401.1 131 1.7e-05 18.8 1.3 2 2 0.00057 0.019 9.0 0.1 3 31 327 355 324 404 0.72 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 AAA_22 PF13401.1 131 0.00021 15.3 0.1 1 1 0.00028 0.0096 10.0 0.1 3 29 326 352 323 451 0.61 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 2_3 - 1754 AAA_22 PF13401.1 131 0.00053 14.0 0.0 1 2 0.034 1.2 3.2 0.0 89 121 505 536 468 538 0.72 # 1577 # 6838 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 2_3 - 1754 AAA_22 PF13401.1 131 0.00053 14.0 0.0 2 2 0.0024 0.081 7.0 0.0 3 28 986 1011 983 1064 0.79 # 1577 # 6838 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 1_41 - 447 Thymidylate_kin PF02223.12 186 5.3e-06 19.8 0.0 1 2 0.00024 0.024 7.9 0.0 3 46 17 60 15 78 0.81 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 Thymidylate_kin PF02223.12 186 5.3e-06 19.8 0.0 2 2 7e-05 0.0071 9.6 0.0 5 31 337 363 335 402 0.86 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 Thymidylate_kin PF02223.12 186 5.8e-06 19.7 0.2 1 2 0.00081 0.083 6.1 0.0 3 43 15 55 13 67 0.84 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 Thymidylate_kin PF02223.12 186 5.8e-06 19.7 0.2 2 2 4.6e-05 0.0047 10.2 0.0 5 54 336 384 333 401 0.84 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 TIGR00362 TIGR00362 437 0.00029 13.6 0.7 1 3 0.0026 0.52 2.8 0.0 129 162 297 328 284 335 0.76 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIGR00362 TIGR00362 437 0.00029 13.6 0.7 2 3 0.011 2.2 0.7 0.1 332 373 559 603 517 616 0.78 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIGR00362 TIGR00362 437 0.00029 13.6 0.7 3 3 0.00035 0.071 5.7 0.0 135 164 641 670 618 677 0.78 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 3_6 - 389 HTH_AraC PF00165.18 42 0.0018 12.1 0.0 1 1 1.8e-05 0.0036 11.1 0.0 4 26 35 57 33 62 0.81 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_45 - 109 HTH_9 PF08221.6 62 0.00087 13.1 0.2 1 1 7.8e-06 0.0016 12.3 0.2 18 57 21 62 5 63 0.88 # 33508 # 33834 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_2 - 276 AAA_29 PF13555.1 62 4e-07 23.5 0.4 1 1 1.9e-08 9.8e-07 22.2 0.4 16 51 31 65 22 70 0.85 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_14 - 932 AAA_29 PF13555.1 62 6.1e-05 16.5 0.0 1 2 0.00061 0.031 7.8 0.0 20 48 300 328 292 334 0.80 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_29 PF13555.1 62 6.1e-05 16.5 0.0 2 2 0.0025 0.13 5.8 0.0 25 50 645 670 637 675 0.81 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 AAA_29 PF13555.1 62 7.3e-05 16.2 0.6 1 2 0.01 0.51 3.9 0.0 27 42 12 27 6 40 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_29 PF13555.1 62 7.3e-05 16.2 0.6 2 2 0.00014 0.0069 9.9 0.2 23 45 328 349 317 355 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 AAA_29 PF13555.1 62 9.6e-05 15.8 0.7 1 2 0.0025 0.13 5.8 0.0 26 45 13 32 5 45 0.81 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_29 PF13555.1 62 9.6e-05 15.8 0.7 2 2 0.0007 0.035 7.6 0.2 22 48 326 353 319 365 0.74 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_6 - 290 HTH_1 PF00126.22 60 1.2e-21 70.2 0.8 1 1 1.3e-23 2.6e-21 69.1 0.8 3 59 6 62 5 63 0.95 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 1_24 - 468 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 2.7e-06 21.6 0.1 1 1 1.5e-07 7.8e-06 20.1 0.1 13 61 15 63 4 78 0.89 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_22 - 453 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 1.5e-05 19.2 4.2 1 1 4.3e-07 2.2e-05 18.7 0.7 13 64 11 63 8 73 0.88 # 17281 # 18639 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_19 - 169 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 8.2e-05 16.9 0.2 1 1 2.8e-06 0.00014 16.1 0.2 14 67 24 78 13 96 0.84 # 15552 # 16058 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 3_33 - 360 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 0.0045 11.3 3.0 1 1 8.5e-05 0.0043 11.3 0.4 24 65 41 82 35 102 0.84 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_36 - 584 adh_short_C2 PF13561.1 241 5.5e-05 16.9 0.0 1 2 3.2e-05 0.0066 10.1 0.0 1 41 18 57 17 128 0.74 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 adh_short_C2 PF13561.1 241 5.5e-05 16.9 0.0 2 2 0.0015 0.3 4.7 0.0 5 45 340 381 336 476 0.75 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 3_33 - 360 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00056 13.5 0.0 1 1 5.6e-06 0.0011 12.5 0.0 6 40 31 64 26 80 0.86 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_41 - 447 SRP54 PF00448.17 196 2.8e-10 33.9 1.8 1 3 6.2e-06 0.00063 13.1 0.0 3 39 12 48 10 91 0.88 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 SRP54 PF00448.17 196 2.8e-10 33.9 1.8 2 3 0.048 4.9 0.4 0.0 77 92 131 146 114 155 0.82 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 SRP54 PF00448.17 196 2.8e-10 33.9 1.8 3 3 2.5e-07 2.5e-05 17.7 0.3 3 38 330 365 328 385 0.94 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 SRP54 PF00448.17 196 5.9e-10 32.8 1.6 1 2 9.9e-06 0.001 12.4 0.0 3 38 10 45 8 58 0.92 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 SRP54 PF00448.17 196 5.9e-10 32.8 1.6 2 2 2.1e-07 2.1e-05 17.9 0.0 3 38 329 364 327 401 0.92 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 AAA_28 PF13521.1 163 7.1e-07 23.2 0.0 1 2 4e-05 0.0041 11.0 0.0 3 34 307 339 305 383 0.71 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_28 PF13521.1 163 7.1e-07 23.2 0.0 2 2 0.00019 0.019 8.8 0.0 2 22 646 666 645 687 0.85 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_2 - 276 AAA_28 PF13521.1 163 0.00014 15.7 0.1 1 1 2.7e-06 0.00027 14.8 0.1 3 75 41 112 39 117 0.78 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_8 - 327 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 3.3e-10 33.8 0.3 1 1 3e-12 6.1e-10 33.0 0.1 5 151 137 292 134 296 0.72 # 6544 # 7524 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_22 - 453 HTH_32 PF13565.1 77 2.3e-12 41.5 0.2 1 1 5.7e-14 2.3e-12 41.5 0.2 3 77 41 113 39 113 0.87 # 17281 # 18639 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 10_3 - 57 HTH_32 PF13565.1 77 1.2e-07 26.4 0.0 1 1 3.6e-09 1.5e-07 26.1 0.0 26 76 5 50 2 51 0.86 # 1394 # 1564 # 1 # ID=10_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_24 - 468 HTH_32 PF13565.1 77 4.6e-07 24.5 0.1 1 1 1.1e-08 4.6e-07 24.5 0.1 3 77 45 117 43 117 0.74 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_33 - 360 HTH_32 PF13565.1 77 1.3e-06 23.1 1.9 1 1 3.2e-08 1.3e-06 23.1 1.9 3 77 60 137 58 137 0.81 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 13_1 - 220 HTH_32 PF13565.1 77 3.1e-05 18.7 0.7 1 1 2.3e-06 9.5e-05 17.1 0.1 46 76 9 35 1 36 0.81 # 54 # 713 # -1 # ID=13_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 3_11 - 286 A2L_zn_ribbon PF08792.5 33 0.022 8.2 6.0 1 1 0.00021 0.044 7.3 6.0 5 31 216 243 214 244 0.93 # 9678 # 10535 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.521 8_5 - 93 HTH_3 PF01381.17 55 4.1e-14 46.1 0.0 1 1 9e-16 6.1e-14 45.6 0.0 2 52 37 87 36 89 0.95 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 8_6 - 138 HTH_3 PF01381.17 55 8.4e-09 29.1 0.0 1 1 2.9e-10 2e-08 28.0 0.0 2 52 83 132 82 135 0.93 # 1698 # 2111 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 6_3 - 374 HTH_3 PF01381.17 55 2.5e-05 18.0 0.1 1 1 3.2e-06 0.00021 15.0 0.0 11 40 18 47 17 56 0.84 # 1895 # 3016 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 1_24 - 468 HTH_23 PF13384.1 50 2.5e-11 36.9 0.9 1 1 5e-12 8.5e-11 35.2 0.9 2 48 11 58 10 60 0.94 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_33 - 360 HTH_23 PF13384.1 50 1e-08 28.5 0.2 1 1 1.5e-09 2.5e-08 27.3 0.2 5 49 31 74 28 75 0.91 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_22 - 453 HTH_23 PF13384.1 50 2.5e-07 24.1 2.6 1 1 2.2e-08 3.8e-07 23.6 0.5 3 49 8 55 6 56 0.94 # 17281 # 18639 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_49 - 265 HTH_23 PF13384.1 50 2.6e-07 24.1 1.1 1 1 1.5e-08 2.6e-07 24.1 1.1 2 39 19 56 18 59 0.90 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 14_1 - 132 HTH_23 PF13384.1 50 3.1e-07 23.9 0.0 1 1 4.6e-08 7.9e-07 22.6 0.0 2 48 23 70 22 72 0.91 # 65 # 460 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 10_3 - 57 HTH_23 PF13384.1 50 1.9e-06 21.4 1.0 1 2 0.034 0.58 3.9 0.1 10 27 17 35 10 36 0.70 # 1394 # 1564 # 1 # ID=10_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 10_3 - 57 HTH_23 PF13384.1 50 1.9e-06 21.4 1.0 2 2 3.6e-06 6.1e-05 16.6 0.1 28 42 41 55 40 57 0.89 # 1394 # 1564 # 1 # ID=10_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_19 - 169 HTH_23 PF13384.1 50 2.8e-06 20.8 0.4 1 1 2.2e-06 3.6e-05 17.3 0.0 5 40 22 58 20 67 0.91 # 15552 # 16058 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 13_1 - 220 HTH_23 PF13384.1 50 2.4e-05 17.8 0.6 1 1 2.1e-05 0.00035 14.2 0.1 28 42 26 40 25 48 0.87 # 54 # 713 # -1 # ID=13_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_52 - 92 HTH_23 PF13384.1 50 0.00012 15.6 0.0 1 1 1.1e-05 0.00019 15.0 0.0 7 40 53 86 51 90 0.92 # 39161 # 39436 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 3_28 - 679 HTH_23 PF13384.1 50 0.00043 13.9 0.2 1 1 0.00021 0.0036 10.9 0.0 13 40 150 177 147 186 0.86 # 21725 # 23761 # 1 # ID=3_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 8_5 - 93 HTH_23 PF13384.1 50 0.00078 13.0 0.2 1 1 0.00012 0.002 11.8 0.2 13 37 39 64 27 85 0.82 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 6_3 - 374 HTH_23 PF13384.1 50 0.0015 12.1 0.0 1 1 0.00028 0.0048 10.5 0.0 20 40 19 39 14 47 0.89 # 1895 # 3016 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 1_36 - 584 Fer4_NifH PF00142.13 273 5e-13 42.7 0.3 1 2 6.2e-09 6.3e-07 22.7 0.0 5 42 13 50 10 72 0.89 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 Fer4_NifH PF00142.13 273 5e-13 42.7 0.3 2 2 3e-07 3.1e-05 17.2 0.0 3 62 330 388 329 406 0.77 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 Fer4_NifH PF00142.13 273 4.6e-11 36.2 0.1 1 2 5.2e-07 5.3e-05 16.4 0.0 4 44 14 54 12 81 0.85 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 Fer4_NifH PF00142.13 273 4.6e-11 36.2 0.1 2 2 2.6e-07 2.7e-05 17.4 0.0 5 41 333 369 330 391 0.89 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_49 - 265 HTH_7 PF02796.10 45 3.3e-06 20.8 0.3 1 1 4.4e-08 9e-06 19.4 0.3 2 40 8 53 8 57 0.86 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 8_6 - 138 HTH_19 PF12844.2 64 5.7e-11 36.3 0.0 1 1 2.3e-12 2.4e-10 34.3 0.0 4 59 82 136 79 137 0.93 # 1698 # 2111 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 8_5 - 93 HTH_19 PF12844.2 64 3.7e-10 33.7 0.0 1 1 5.7e-12 5.8e-10 33.1 0.0 2 55 34 87 34 88 0.95 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_52 - 92 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.0043 10.7 5.3 1 1 6.9e-05 0.014 9.1 5.3 5 35 8 39 5 40 0.83 # 39161 # 39436 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_41 - 447 NB-ARC PF00931.17 287 8.7e-07 21.9 0.9 1 2 0.00037 0.037 6.7 0.0 21 36 12 27 7 34 0.88 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 NB-ARC PF00931.17 287 8.7e-07 21.9 0.9 2 2 3.5e-06 0.00036 13.3 0.2 7 40 318 349 314 358 0.82 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 NB-ARC PF00931.17 287 1.1e-06 21.6 0.1 1 2 0.0027 0.27 3.9 0.0 22 36 11 25 2 37 0.83 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 NB-ARC PF00931.17 287 1.1e-06 21.6 0.1 2 2 8.6e-07 8.7e-05 15.3 0.0 17 51 325 358 315 401 0.79 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 Mg_chelatase PF01078.16 207 1.5e-05 18.2 0.0 1 3 0.00079 0.053 6.5 0.0 12 48 292 329 280 365 0.65 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 Mg_chelatase PF01078.16 207 1.5e-05 18.2 0.0 2 3 0.00056 0.038 7.0 0.0 24 44 645 665 614 690 0.86 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 Mg_chelatase PF01078.16 207 1.5e-05 18.2 0.0 3 3 0.077 5.2 0.0 0.0 108 136 717 745 702 776 0.79 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00054 13.1 0.1 1 2 0.0085 0.58 3.2 0.0 25 65 13 53 12 65 0.80 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00054 13.1 0.1 2 2 0.00045 0.031 7.3 0.1 16 55 322 361 308 380 0.82 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00098 12.2 0.6 1 1 8e-05 0.0054 9.8 0.1 22 59 326 364 319 393 0.75 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_24 - 468 HTH_29 PF13551.1 112 1.7e-15 51.1 1.2 1 1 1.4e-16 4.2e-15 49.8 1.2 1 112 16 121 16 121 0.89 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_22 - 453 HTH_29 PF13551.1 112 3e-15 50.3 2.0 1 1 1e-16 3e-15 50.3 2.0 1 111 12 116 12 117 0.87 # 17281 # 18639 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 3_33 - 360 HTH_29 PF13551.1 112 3.5e-07 24.3 1.0 1 1 2.1e-08 6.1e-07 23.5 0.2 10 84 41 115 33 141 0.75 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_49 - 265 HTH_29 PF13551.1 112 2.6e-06 21.5 1.7 1 1 3e-07 8.7e-06 19.8 0.3 6 35 29 57 25 118 0.84 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 14_1 - 132 HTH_29 PF13551.1 112 6.7e-06 20.2 0.0 1 1 3.5e-07 1e-05 19.6 0.0 8 66 36 93 28 120 0.75 # 65 # 460 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_19 - 169 HTH_29 PF13551.1 112 0.0001 16.3 1.5 1 1 6.3e-06 0.00018 15.5 0.6 1 97 24 117 24 121 0.66 # 15552 # 16058 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 1_6 - 290 HTH_29 PF13551.1 112 0.0002 15.4 0.2 1 2 0.00034 0.0098 10.0 0.0 14 55 18 59 8 65 0.79 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 1_6 - 290 HTH_29 PF13551.1 112 0.0002 15.4 0.2 2 2 0.069 2 2.5 0.0 28 84 104 159 100 166 0.84 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 1_41 - 447 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 0.0031 11.6 0.1 1 1 1.5e-05 0.0031 11.6 0.1 2 44 340 382 337 417 0.71 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 3_11 - 286 OrfB_Zn_ribbon PF07282.6 69 1.7e-26 85.6 0.7 1 1 1.8e-28 3.6e-26 84.6 0.7 1 67 187 254 187 256 0.98 # 9678 # 10535 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.521 1_2 - 276 G-alpha PF00503.15 389 0.0022 10.6 0.0 1 1 1.1e-05 0.0022 10.6 0.0 62 91 41 85 35 216 0.86 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_36 - 584 CobA_CobO_BtuR PF02572.10 172 0.0095 9.5 3.8 1 3 0.036 7.2 0.1 0.0 9 37 13 42 8 43 0.85 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 CobA_CobO_BtuR PF02572.10 172 0.0095 9.5 3.8 2 3 0.024 5 0.6 0.0 125 156 194 225 184 231 0.86 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 CobA_CobO_BtuR PF02572.10 172 0.0095 9.5 3.8 3 3 0.00032 0.064 6.8 0.6 2 36 326 360 325 362 0.90 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 13_1 - 220 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.9e-11 37.6 0.5 1 1 2.4e-13 2.4e-11 37.2 0.5 15 132 5 129 1 160 0.87 # 54 # 713 # -1 # ID=13_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 10_3 - 57 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 2.4e-06 20.8 0.0 1 1 2.3e-08 2.4e-06 20.8 0.0 4 50 9 55 6 57 0.92 # 1394 # 1564 # 1 # ID=10_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_14 - 932 Arch_ATPase PF01637.13 234 7.5e-08 26.2 1.6 1 3 0.00018 0.019 8.5 0.1 3 43 286 326 284 334 0.85 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 Arch_ATPase PF01637.13 234 7.5e-08 26.2 1.6 2 3 0.00045 0.045 7.3 0.0 97 132 354 390 325 417 0.82 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 Arch_ATPase PF01637.13 234 7.5e-08 26.2 1.6 3 3 0.00062 0.063 6.8 0.0 24 64 647 686 637 743 0.80 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0027 11.3 0.0 1 2 0.052 5.3 0.5 0.0 23 65 11 53 3 146 0.63 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0027 11.3 0.0 2 2 0.00026 0.026 8.1 0.0 15 55 322 362 314 470 0.59 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 PhoH PF02562.11 205 1.1e-08 28.4 3.7 1 2 7e-07 7.2e-05 16.0 0.1 21 64 12 55 5 111 0.88 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 PhoH PF02562.11 205 1.1e-08 28.4 3.7 2 2 8.6e-06 0.00088 12.4 0.4 18 52 327 361 316 372 0.80 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 PhoH PF02562.11 205 1.9e-08 27.7 0.4 1 2 5.6e-06 0.00057 13.1 0.1 21 63 10 52 1 110 0.89 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 PhoH PF02562.11 205 1.9e-08 27.7 0.4 2 2 1.3e-05 0.0014 11.8 0.0 15 45 321 353 309 375 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 AAA_5 PF07728.9 139 1.9e-19 63.7 0.1 1 2 2.2e-07 2.3e-05 18.1 0.1 3 76 307 386 305 390 0.74 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_5 PF07728.9 139 1.9e-19 63.7 0.1 2 2 9.1e-15 9.2e-13 42.0 0.0 2 125 646 767 645 777 0.82 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 AAA_5 PF07728.9 139 0.00071 13.2 0.0 1 2 0.041 4.2 1.0 0.0 2 23 11 32 10 55 0.75 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_5 PF07728.9 139 0.00071 13.2 0.0 2 2 0.00011 0.011 9.4 0.0 2 41 330 369 329 430 0.77 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_18 - 251 SprT-like PF10263.4 157 4.4e-05 17.1 0.0 1 1 3.2e-07 6.5e-05 16.5 0.0 38 73 51 85 19 88 0.86 # 14686 # 15438 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.664 1_14 - 932 TIGR00763 TIGR00763 795 8.3e-08 24.6 0.4 1 2 0.004 0.27 3.1 0.0 357 375 307 325 291 329 0.80 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIGR00763 TIGR00763 795 8.3e-08 24.6 0.4 2 2 4.4e-08 3e-06 19.5 0.1 252 450 541 741 477 777 0.73 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 TIGR00763 TIGR00763 795 0.00077 11.5 0.5 1 2 0.003 0.2 3.5 0.0 355 374 12 31 7 41 0.85 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 TIGR00763 TIGR00763 795 0.00077 11.5 0.5 2 2 0.00057 0.039 5.9 0.1 350 380 326 355 316 362 0.77 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 TIGR00763 TIGR00763 795 0.002 10.2 0.1 1 2 0.0068 0.46 2.3 0.0 356 375 11 30 4 40 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 TIGR00763 TIGR00763 795 0.002 10.2 0.1 2 2 0.00075 0.051 5.5 0.0 355 377 329 351 318 360 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 ResIII PF04851.10 184 0.00032 14.5 0.0 1 3 0.023 2.3 1.9 0.0 10 45 289 323 285 336 0.79 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 ResIII PF04851.10 184 0.00032 14.5 0.0 2 3 0.058 5.9 0.6 0.0 143 160 372 389 335 430 0.70 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 ResIII PF04851.10 184 0.00032 14.5 0.0 3 3 0.00066 0.067 6.9 0.0 8 47 618 665 612 678 0.80 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 ResIII PF04851.10 184 0.0018 12.0 0.0 1 2 0.008 0.81 3.4 0.0 31 56 14 42 4 47 0.78 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 ResIII PF04851.10 184 0.0018 12.0 0.0 2 2 0.0012 0.13 6.0 0.0 24 50 326 352 254 364 0.81 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_39 - 179 Trp_halogenase PF04820.9 454 0.0011 11.5 0.0 1 1 6e-06 0.0012 11.3 0.0 254 283 47 76 27 124 0.83 # 29373 # 29909 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 2_4 - 771 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2e-148 488.0 0.0 1 1 2.5e-150 2.5e-148 487.6 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 6838 # 9150 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 2_22 - 660 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.7e-05 17.4 0.2 1 1 5.5e-07 5.6e-05 15.8 0.0 16 91 262 333 254 349 0.72 # 23417 # 25396 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 1_41 - 447 TIGR01968 TIGR01968 261 2.7e-14 46.7 5.7 1 2 6.6e-07 4.5e-05 16.5 0.1 8 39 16 47 12 53 0.93 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 TIGR01968 TIGR01968 261 2.7e-14 46.7 5.7 2 2 2.8e-11 1.9e-09 30.8 1.8 4 39 330 365 327 371 0.91 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 TIGR01968 TIGR01968 261 1.6e-13 44.2 2.0 1 2 1.1e-08 7.7e-07 22.3 0.1 8 39 14 45 11 66 0.90 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 TIGR01968 TIGR01968 261 1.6e-13 44.2 2.0 2 2 5.5e-08 3.7e-06 20.0 0.2 5 37 330 362 326 368 0.87 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 3_6 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 9.2e-08 25.3 0.1 1 2 7.8e-06 0.00053 13.0 0.0 3 37 108 142 106 145 0.93 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_6 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 9.2e-08 25.3 0.1 2 2 4.8e-05 0.0033 10.4 0.0 104 145 227 268 215 340 0.82 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_8 - 327 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 5e-07 23.3 0.1 1 1 5.2e-09 1.1e-06 22.3 0.1 6 153 147 306 142 311 0.65 # 6544 # 7524 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_14 - 932 AAA_18 PF13238.1 129 2.6e-09 31.4 4.0 1 2 2.2e-06 0.00011 16.4 0.0 3 75 308 377 307 389 0.80 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_18 PF13238.1 129 2.6e-09 31.4 4.0 2 2 4.7e-06 0.00024 15.3 0.1 3 23 648 676 647 786 0.74 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 AAA_18 PF13238.1 129 0.00044 14.5 1.5 1 2 0.023 1.2 3.4 0.1 2 18 12 28 11 68 0.80 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_18 PF13238.1 129 0.00044 14.5 1.5 2 2 0.0003 0.015 9.5 0.1 1 24 330 358 330 453 0.77 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_2 - 276 AAA_18 PF13238.1 129 0.00097 13.4 0.0 1 1 7.9e-05 0.004 11.4 0.0 3 33 42 75 41 119 0.75 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_41 - 447 AAA_18 PF13238.1 129 0.02 9.2 5.1 1 2 0.0085 0.43 4.8 1.0 1 15 13 27 13 32 0.93 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_18 PF13238.1 129 0.02 9.2 5.1 2 2 0.0066 0.33 5.2 0.2 5 19 335 349 331 367 0.77 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 3_12 - 424 IMS_HHH PF11798.3 32 3.9e-08 27.0 0.0 1 1 5.5e-10 1.1e-07 25.5 0.0 5 32 174 201 170 201 0.91 # 10852 # 12123 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_8 - 327 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 1.1e-08 29.1 0.2 1 1 1.4e-10 2.8e-08 27.7 0.2 59 123 253 314 244 316 0.81 # 6544 # 7524 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 3_24 - 188 Methyltransf_2 PF00891.13 242 0.0021 11.1 0.0 1 1 1.5e-05 0.0031 10.6 0.0 111 159 60 110 40 126 0.84 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_52 - 92 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 1.2e-30 98.6 0.2 1 1 1e-32 2.1e-30 97.9 0.2 1 46 43 88 43 88 0.99 # 39161 # 39436 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_14 - 932 DUF258 PF03193.11 161 2.6e-06 20.6 0.0 1 2 0.0001 0.0053 9.9 0.0 18 59 286 327 270 374 0.74 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 DUF258 PF03193.11 161 2.6e-06 20.6 0.0 2 2 0.00038 0.019 8.0 0.0 36 58 644 666 628 702 0.84 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_2 - 276 DUF258 PF03193.11 161 1.1e-05 18.5 0.1 1 1 3.4e-07 1.7e-05 17.9 0.1 34 67 36 69 16 95 0.81 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_36 - 584 DUF258 PF03193.11 161 0.00016 14.8 0.0 1 2 0.0081 0.41 3.7 0.0 38 52 11 25 2 123 0.88 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 DUF258 PF03193.11 161 0.00016 14.8 0.0 2 2 0.00024 0.012 8.7 0.0 35 58 327 350 305 396 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 DUF258 PF03193.11 161 0.00023 14.3 0.1 1 2 0.0028 0.14 5.2 0.0 38 52 13 27 4 47 0.88 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 DUF258 PF03193.11 161 0.00023 14.3 0.1 2 2 0.001 0.052 6.6 0.0 36 64 329 357 306 370 0.76 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_14 - 932 AAA_3 PF07726.6 131 2.7e-06 20.9 0.0 1 3 0.0014 0.28 4.7 0.0 4 23 308 327 306 332 0.87 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_3 PF07726.6 131 2.7e-06 20.9 0.0 2 3 0.0046 0.94 3.0 0.0 5 25 649 669 645 683 0.81 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_3 PF07726.6 131 2.7e-06 20.9 0.0 3 3 6.6e-05 0.013 9.0 0.0 64 111 717 764 696 768 0.89 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 2_22 - 660 DUF87 PF01935.12 229 4.3e-06 20.6 0.0 1 1 2.6e-07 2.6e-05 18.0 0.0 26 222 264 454 259 461 0.82 # 23417 # 25396 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 1_14 - 932 DUF87 PF01935.12 229 0.00051 13.8 0.2 1 1 8.1e-05 0.0082 9.8 0.0 29 66 649 684 645 719 0.84 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_24 - 468 HTH_28 PF13518.1 52 5.3e-12 39.5 2.6 1 1 4.4e-13 8.9e-12 38.8 1.6 2 48 16 63 15 70 0.93 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_33 - 360 HTH_28 PF13518.1 52 7.7e-11 35.8 0.1 1 1 1.4e-11 2.8e-10 34.0 0.1 11 51 41 81 32 82 0.89 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_22 - 453 HTH_28 PF13518.1 52 7.5e-09 29.4 4.2 1 1 4.6e-10 9.4e-09 29.1 0.9 2 51 12 63 11 64 0.92 # 17281 # 18639 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 14_1 - 132 HTH_28 PF13518.1 52 5.4e-08 26.7 0.1 1 1 1.1e-08 2.3e-07 24.7 0.0 1 43 27 70 27 73 0.92 # 65 # 460 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_19 - 169 HTH_28 PF13518.1 52 8e-06 19.7 0.2 1 1 8.1e-07 1.6e-05 18.7 0.2 4 50 26 74 23 76 0.78 # 15552 # 16058 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 10_3 - 57 HTH_28 PF13518.1 52 1.5e-05 18.9 2.6 1 1 3.7e-06 7.6e-05 16.6 2.6 12 36 25 54 10 55 0.69 # 1394 # 1564 # 1 # ID=10_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_49 - 265 HTH_28 PF13518.1 52 3.2e-05 17.8 0.2 1 1 1.6e-06 3.2e-05 17.8 0.2 9 34 31 56 27 57 0.90 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 13_1 - 220 HTH_28 PF13518.1 52 0.00011 16.1 1.1 1 1 2.3e-05 0.00047 14.1 1.1 22 36 25 39 2 40 0.76 # 54 # 713 # -1 # ID=13_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_52 - 92 HTH_28 PF13518.1 52 0.00018 15.4 0.0 1 1 1.4e-05 0.00028 14.8 0.0 4 34 55 85 53 89 0.91 # 39161 # 39436 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 7_6 - 49 HTH_28 PF13518.1 52 0.00032 14.6 0.0 1 1 1.9e-05 0.00038 14.4 0.0 4 30 12 38 9 38 0.91 # 4216 # 4362 # 1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 1_36 - 584 TIGR00041 TIGR00041 196 5e-05 16.7 0.0 1 2 0.0046 0.31 4.3 0.0 6 48 10 52 8 66 0.86 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 TIGR00041 TIGR00041 196 5e-05 16.7 0.0 2 2 0.0001 0.0068 9.7 0.0 6 56 329 379 325 398 0.80 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 TIGR00041 TIGR00041 196 9.5e-05 15.7 0.0 1 2 0.00046 0.031 7.6 0.0 6 51 12 57 9 73 0.88 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 TIGR00041 TIGR00041 196 9.5e-05 15.7 0.0 2 2 0.0016 0.11 5.8 0.0 11 43 335 368 328 392 0.82 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_2 - 276 TIGR00041 TIGR00041 196 0.00069 12.9 0.0 1 1 1.5e-05 0.001 12.4 0.0 3 53 36 84 34 104 0.78 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 4_4 - 439 DUF2791 PF10923.3 417 3.7e-172 566.5 0.0 1 1 2.1e-174 4.2e-172 566.3 0.0 1 416 6 413 6 414 0.99 # 3297 # 4613 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_6 - 290 HTH_24 PF13412.1 48 8.6e-05 15.8 0.0 1 1 3.2e-06 0.00016 15.0 0.0 22 44 21 43 18 43 0.88 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 1_24 - 468 HTH_24 PF13412.1 48 0.00054 13.3 0.2 1 1 6.6e-05 0.0033 10.7 0.1 15 43 25 53 17 55 0.82 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_43 - 182 HTH_24 PF13412.1 48 0.00079 12.7 0.1 1 1 3.5e-05 0.0018 11.6 0.1 17 40 128 151 124 154 0.89 # 32244 # 32789 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.586 8_5 - 93 HTH_24 PF13412.1 48 0.0009 12.6 0.0 1 1 3.1e-05 0.0016 11.8 0.0 7 36 34 63 29 64 0.86 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_36 - 584 AAA_26 PF13500.1 199 0.0075 9.8 2.6 1 4 0.016 3.3 1.1 0.1 11 32 18 39 10 42 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_26 PF13500.1 199 0.0075 9.8 2.6 2 4 0.00097 0.2 5.1 0.0 131 179 200 250 192 270 0.78 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_26 PF13500.1 199 0.0075 9.8 2.6 3 4 0.086 18 -1.2 0.1 11 25 337 351 330 360 0.77 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_26 PF13500.1 199 0.0075 9.8 2.6 4 4 0.036 7.3 0.0 0.0 130 184 491 566 468 576 0.59 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00019 15.4 0.0 1 2 0.00013 0.027 8.4 0.0 7 44 288 326 286 384 0.83 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00019 15.4 0.0 2 2 0.0034 0.7 3.9 0.0 25 44 647 666 634 743 0.89 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_6 - 290 HTH_30 PF13556.1 59 1.8e-06 21.4 0.0 1 1 2e-08 4e-06 20.3 0.0 12 44 16 48 7 54 0.87 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 3_24 - 188 TIGR03533 TIGR03533 284 2e-05 17.6 0.0 1 1 1.6e-07 3.2e-05 16.9 0.0 115 208 44 131 39 146 0.84 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 3_24 - 188 TIGR03534 TIGR03534 253 4.2e-09 29.8 0.0 1 1 3.9e-11 8e-09 28.9 0.0 68 189 34 145 4 162 0.84 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 3_11 - 286 TIGR00344 TIGR00344 847 4.9e-06 18.6 0.8 1 1 3.2e-08 6.4e-06 18.2 0.8 679 778 63 159 26 174 0.79 # 9678 # 10535 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.521 1_6 - 290 HTH_10 PF04967.7 53 0.00064 13.2 0.1 1 1 8.9e-06 0.0018 11.8 0.0 29 51 22 44 17 45 0.88 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 1_36 - 584 LpxK PF02606.9 326 0.0011 11.9 1.4 1 2 0.0014 0.14 4.9 0.1 46 72 17 43 15 50 0.96 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 LpxK PF02606.9 326 0.0011 11.9 1.4 2 2 0.00084 0.086 5.6 0.1 46 69 336 359 333 362 0.92 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 LpxK PF02606.9 326 0.0044 9.8 3.2 1 2 0.0017 0.17 4.6 0.1 46 72 19 45 17 55 0.95 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 LpxK PF02606.9 326 0.0044 9.8 3.2 2 2 0.0012 0.12 5.1 0.6 46 69 337 360 332 363 0.92 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_14 - 932 MMR_HSR1 PF01926.18 116 4.3e-05 17.4 0.0 1 2 0.00014 0.015 9.2 0.0 3 44 307 344 305 403 0.67 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 MMR_HSR1 PF01926.18 116 4.3e-05 17.4 0.0 2 2 0.0022 0.23 5.4 0.0 2 32 646 673 645 762 0.63 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_2 - 276 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0017 12.2 0.0 1 1 3.6e-05 0.0037 11.2 0.0 3 20 41 58 39 96 0.86 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 4_5 - 732 DEAD PF00270.24 169 1.9e-30 99.5 0.0 1 1 1.8e-32 3.6e-30 98.6 0.0 2 167 26 200 25 202 0.88 # 4610 # 6805 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.475 1_5 - 337 NAD_binding_2 PF03446.10 163 1.9e-08 28.2 0.0 1 1 1.6e-10 3.2e-08 27.5 0.0 2 98 146 240 145 256 0.82 # 3462 # 4472 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 1_14 - 932 Miro PF08477.8 119 0.00098 13.6 0.0 1 1 4.3e-05 0.0087 10.5 0.0 3 43 307 346 306 382 0.72 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 8_5 - 93 HTH_31 PF13560.1 64 1.3e-14 48.1 0.2 1 1 2.7e-16 1.8e-14 47.6 0.2 2 56 32 85 31 88 0.96 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_6 - 389 HTH_31 PF13560.1 64 0.00019 15.6 0.6 1 1 7.3e-06 0.00049 14.2 0.3 12 45 37 69 32 90 0.82 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 16_1 - 54 HTH_31 PF13560.1 64 0.00046 14.3 0.0 1 1 7.5e-06 0.00051 14.2 0.0 14 55 2 43 1 48 0.96 # 3 # 164 # 1 # ID=16_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 2_3 - 1754 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.5e-07 25.4 0.2 1 1 5.1e-09 1e-06 22.8 0.1 3 102 1340 1443 1336 1445 0.76 # 1577 # 6838 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 3_24 - 188 TIGR00755 TIGR00755 256 2e-07 24.1 0.0 1 1 1.3e-09 2.7e-07 23.7 0.0 8 105 29 123 26 128 0.89 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_14 - 932 TIP49 PF06068.8 398 1.3e-05 17.9 1.0 1 3 0.004 0.41 3.1 0.0 54 75 307 328 278 337 0.77 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIP49 PF06068.8 398 1.3e-05 17.9 1.0 2 3 0.027 2.8 0.4 0.1 257 289 354 386 343 388 0.79 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIP49 PF06068.8 398 1.3e-05 17.9 1.0 3 3 2.4e-05 0.0024 10.4 0.0 21 75 610 668 584 682 0.77 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 TIP49 PF06068.8 398 8e-05 15.3 0.2 1 2 0.021 2.1 0.8 0.0 53 75 13 35 10 65 0.84 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 TIP49 PF06068.8 398 8e-05 15.3 0.2 2 2 7.2e-06 0.00073 12.2 0.1 41 111 318 389 315 397 0.85 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 3_10 - 95 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 9.3e-10 31.7 0.6 1 1 7.2e-12 1.5e-09 31.0 0.6 19 46 1 28 1 28 0.95 # 9397 # 9681 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 3_5 - 337 HTH_36 PF13730.1 55 0.00017 15.6 0.0 1 1 3.7e-06 0.00074 13.6 0.0 6 55 212 265 210 265 0.90 # 4001 # 5011 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_41 - 447 T2SE PF00437.15 272 0.00019 14.2 0.0 1 2 0.0058 0.59 2.8 0.0 131 162 13 44 5 57 0.83 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 T2SE PF00437.15 272 0.00019 14.2 0.0 2 2 8e-05 0.0081 8.9 0.0 34 156 188 356 176 373 0.72 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 T2SE PF00437.15 272 0.0004 13.2 0.0 1 2 0.016 1.6 1.4 0.0 132 162 12 42 5 50 0.79 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 T2SE PF00437.15 272 0.0004 13.2 0.0 2 2 6.5e-05 0.0066 9.2 0.0 124 154 325 353 195 372 0.85 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 NACHT PF05729.7 166 4.6e-07 23.5 0.0 1 2 8.8e-05 0.006 10.1 0.0 4 31 307 334 305 342 0.89 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 NACHT PF05729.7 166 4.6e-07 23.5 0.0 2 2 0.00076 0.052 7.1 0.0 3 24 646 667 644 678 0.86 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 NACHT PF05729.7 166 6.9e-05 16.5 3.8 1 2 0.0006 0.04 7.4 0.1 3 26 13 36 12 44 0.84 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 NACHT PF05729.7 166 6.9e-05 16.5 3.8 2 2 0.00022 0.015 8.9 0.6 3 28 331 356 329 363 0.88 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 NACHT PF05729.7 166 0.0015 12.1 5.1 1 2 0.034 2.3 1.7 0.1 3 26 11 34 10 42 0.79 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 NACHT PF05729.7 166 0.0015 12.1 5.1 2 2 4.5e-05 0.003 11.1 0.6 2 27 329 354 328 460 0.92 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 UPF0079 PF02367.12 123 0.00021 14.8 0.1 1 2 0.00078 0.16 5.5 0.0 19 39 307 327 296 334 0.87 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 UPF0079 PF02367.12 123 0.00021 14.8 0.1 2 2 0.00038 0.078 6.5 0.0 18 41 646 670 635 675 0.81 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_17 PF13207.1 121 7.9e-08 27.1 6.0 1 2 0.00049 0.033 8.9 0.0 4 52 308 372 307 446 0.61 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_17 PF13207.1 121 7.9e-08 27.1 6.0 2 2 8.1e-07 5.5e-05 17.9 0.3 6 34 650 682 646 881 0.79 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 AAA_17 PF13207.1 121 4.7e-06 21.3 0.0 1 2 0.015 1 4.2 0.0 3 23 12 32 11 154 0.67 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_17 PF13207.1 121 4.7e-06 21.3 0.0 2 2 1.1e-05 0.00077 14.2 0.0 2 35 330 363 329 449 0.56 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 AAA_17 PF13207.1 121 0.00019 16.2 2.1 1 2 0.0078 0.53 5.1 0.9 2 17 13 28 12 32 0.89 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_17 PF13207.1 121 0.00019 16.2 2.1 2 2 0.00043 0.029 9.1 0.0 6 26 335 358 330 411 0.77 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_2 - 276 TIGR02211 TIGR02211 221 5.4e-36 117.7 0.0 1 1 3.2e-38 6.6e-36 117.4 0.0 18 219 24 230 10 232 0.86 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_14 - 932 TIGR03346 TIGR03346 853 4.3e-299 988.2 15.8 1 2 1.3e-155 2.6e-153 505.9 9.8 3 463 114 571 112 574 0.94 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIGR03346 TIGR03346 853 4.3e-299 988.2 15.8 2 2 1.1e-149 2.2e-147 486.3 0.3 526 847 574 900 572 908 0.96 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 AAA_25 PF13481.1 194 2.6e-11 37.2 1.5 1 2 9.8e-06 0.0005 13.4 0.0 37 79 12 44 7 55 0.80 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_25 PF13481.1 194 2.6e-11 37.2 1.5 2 2 3.3e-08 1.7e-06 21.5 0.2 25 151 318 449 294 471 0.57 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 AAA_25 PF13481.1 194 1e-10 35.2 4.9 1 2 1.2e-06 6.3e-05 16.3 0.4 35 110 12 80 10 148 0.60 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_25 PF13481.1 194 1e-10 35.2 4.9 2 2 1.4e-07 7.1e-06 19.4 0.5 15 63 308 359 295 373 0.78 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_14 - 932 AAA_25 PF13481.1 194 1.9e-06 21.3 0.0 1 2 7.4e-05 0.0038 10.5 0.0 37 111 307 384 300 417 0.78 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_25 PF13481.1 194 1.9e-06 21.3 0.0 2 2 0.00049 0.025 7.9 0.0 34 58 644 668 611 741 0.87 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_2 - 276 AAA_25 PF13481.1 194 3.8e-05 17.0 0.1 1 1 4.6e-06 0.00023 14.5 0.1 31 65 35 70 21 148 0.70 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_2 - 276 AAA_15 PF13175.1 415 1.7e-05 17.9 0.0 1 2 0.00018 0.036 6.9 0.0 18 47 32 62 24 82 0.82 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_2 - 276 AAA_15 PF13175.1 415 1.7e-05 17.9 0.0 2 2 4.5e-05 0.0091 8.9 0.0 370 410 168 210 156 212 0.89 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_22 - 660 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0001 15.5 0.0 1 1 1.1e-06 0.00022 14.5 0.0 6 40 254 288 250 303 0.82 # 23417 # 25396 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 1_14 - 932 RuvB_N PF05496.7 234 6e-08 25.9 1.3 1 4 0.00053 0.036 7.0 0.0 16 75 274 328 261 337 0.67 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 RuvB_N PF05496.7 234 6e-08 25.9 1.3 2 4 0.023 1.6 1.6 0.0 96 113 370 387 343 390 0.77 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 RuvB_N PF05496.7 234 6e-08 25.9 1.3 3 4 1.9e-05 0.0013 11.7 0.0 17 74 606 667 593 673 0.68 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 RuvB_N PF05496.7 234 6e-08 25.9 1.3 4 4 0.059 4 0.3 0.0 101 130 715 744 706 754 0.88 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 RuvB_N PF05496.7 234 1.6e-07 24.5 0.3 1 2 0.051 3.4 0.5 0.0 53 75 11 33 5 49 0.81 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 RuvB_N PF05496.7 234 1.6e-07 24.5 0.3 2 2 3.1e-08 2.1e-06 20.8 0.0 53 119 330 400 320 407 0.87 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 RuvB_N PF05496.7 234 0.0018 11.2 0.2 1 2 0.0089 0.6 3.0 0.0 53 74 13 34 7 59 0.83 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 RuvB_N PF05496.7 234 0.0018 11.2 0.2 2 2 0.0012 0.084 5.8 0.1 53 76 331 354 324 370 0.77 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_14 - 932 AAA_14 PF13173.1 128 6.1e-09 29.8 0.0 1 2 4.7e-06 0.00096 13.0 0.0 6 73 307 387 302 440 0.76 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_14 PF13173.1 128 6.1e-09 29.8 0.0 2 2 2.3e-06 0.00046 14.0 0.0 7 87 648 742 644 767 0.70 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 VirC1 PF07015.6 231 1.5e-06 21.3 0.7 1 2 0.00044 0.03 7.3 0.0 9 40 17 48 12 89 0.86 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 VirC1 PF07015.6 231 1.5e-06 21.3 0.7 2 2 1.5e-05 0.001 12.1 0.1 9 48 335 375 329 387 0.83 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 3_6 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00014 14.9 0.0 1 2 0.00084 0.057 6.3 0.0 4 42 109 147 107 154 0.91 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_6 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00014 14.9 0.0 2 2 0.00093 0.063 6.2 0.0 84 139 235 290 222 316 0.77 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_36 - 584 VirC1 PF07015.6 231 0.00038 13.5 0.7 1 2 0.00049 0.033 7.1 0.0 9 40 15 46 10 61 0.88 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 VirC1 PF07015.6 231 0.00038 13.5 0.7 2 2 0.0033 0.22 4.4 0.1 10 43 335 368 329 379 0.87 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 11_1 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 2.2e-24 79.3 0.2 1 1 4.6e-26 4.7e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 69 # 1073 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 7_7 - 152 Transposase_20 PF02371.11 87 3.9e-20 65.7 0.4 1 1 3.6e-21 3.7e-19 62.6 0.4 1 65 36 100 36 112 0.89 # 4555 # 5010 # -1 # ID=7_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_24 - 468 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 7e-05 15.9 0.7 1 2 8.9e-06 0.0018 11.4 0.3 19 51 18 51 13 52 0.93 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_24 - 468 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 7e-05 15.9 0.7 2 2 0.0081 1.6 1.9 0.0 40 51 109 120 106 121 0.83 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_6 - 389 MerR PF00376.18 38 5.6e-07 23.0 0.0 1 1 1.3e-08 1.3e-06 21.8 0.0 1 29 41 69 41 75 0.91 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_49 - 265 MerR PF00376.18 38 0.00046 13.7 0.7 1 1 1.1e-05 0.0012 12.4 0.1 2 21 37 56 36 66 0.92 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 1_14 - 932 AAA_33 PF13671.1 143 1.4e-06 22.2 0.2 1 3 0.0093 0.47 4.2 0.0 3 22 307 326 307 377 0.82 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_33 PF13671.1 143 1.4e-06 22.2 0.2 2 3 0.00027 0.014 9.2 0.0 3 79 647 756 646 762 0.55 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_33 PF13671.1 143 1.4e-06 22.2 0.2 3 3 0.052 2.7 1.8 0.1 55 81 825 851 765 859 0.60 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 AAA_33 PF13671.1 143 0.00017 15.4 0.1 1 2 0.028 1.4 2.7 0.0 2 19 13 30 12 111 0.80 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_33 PF13671.1 143 0.00017 15.4 0.1 2 2 0.00013 0.0064 10.3 0.0 1 31 330 364 330 412 0.74 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_2 - 276 AAA_33 PF13671.1 143 0.0002 15.2 0.4 1 1 9.5e-06 0.00048 13.9 0.4 2 20 40 61 39 121 0.67 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_36 - 584 AAA_33 PF13671.1 143 0.0011 12.7 1.0 1 1 9.2e-05 0.0047 10.7 0.2 1 41 329 377 329 474 0.69 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 14_1 - 132 CENP-B_N PF04218.8 53 3.5e-06 20.3 0.1 1 1 5.2e-08 1.1e-05 18.8 0.0 8 45 24 62 18 65 0.87 # 65 # 460 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 7_7 - 152 HHH PF00633.18 30 5.5e-05 16.7 0.8 1 1 5.5e-07 0.00011 15.7 0.8 13 29 39 55 39 56 0.88 # 4555 # 5010 # -1 # ID=7_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_18 - 251 DUF2201_N PF13203.1 292 0.0016 11.5 0.0 1 1 1.5e-05 0.003 10.6 0.0 45 73 57 85 23 92 0.84 # 14686 # 15438 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.664 1_41 - 447 ArgK PF03308.11 267 3.8e-08 26.3 2.8 1 2 4.8e-05 0.0048 9.5 0.1 34 71 15 52 11 76 0.92 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 ArgK PF03308.11 267 3.8e-08 26.3 2.8 2 2 3.2e-07 3.3e-05 16.7 0.5 18 70 319 369 306 372 0.81 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 ArgK PF03308.11 267 2.5e-07 23.6 0.4 1 2 3e-06 0.00031 13.5 0.0 34 71 13 50 9 58 0.94 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 ArgK PF03308.11 267 2.5e-07 23.6 0.4 2 2 0.00016 0.017 7.8 0.1 32 71 330 369 315 389 0.88 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_32 - 192 PaaX PF07848.7 70 0.00058 13.8 0.0 1 1 8.5e-06 0.0017 12.3 0.0 37 60 51 74 17 85 0.69 # 23844 # 24419 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 1_2 - 276 SbcCD_C PF13558.1 90 0.00063 13.6 0.1 1 1 2.6e-05 0.0053 10.6 0.1 27 89 146 195 130 196 0.79 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_4 - 771 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 2.8e-08 26.6 0.0 1 2 0.08 16 -2.3 0.0 130 199 262 330 253 360 0.69 # 6838 # 9150 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 2_4 - 771 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 2.8e-08 26.6 0.0 2 2 3.3e-10 6.8e-08 25.3 0.0 274 393 392 507 361 559 0.74 # 6838 # 9150 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 3_24 - 188 MTS PF05175.9 170 9.7e-11 35.2 0.0 1 1 6.6e-13 1.3e-10 34.8 0.0 24 142 43 150 38 170 0.84 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 10_3 - 57 Arg_repressor PF01316.16 70 0.00063 13.2 0.0 1 1 4.4e-06 0.00089 12.7 0.0 23 46 29 52 26 54 0.92 # 1394 # 1564 # 1 # ID=10_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_14 - 932 RNA_helicase PF00910.17 107 2.2e-06 21.7 0.0 1 2 0.00093 0.063 7.4 0.0 3 23 308 328 307 346 0.86 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 RNA_helicase PF00910.17 107 2.2e-06 21.7 0.0 2 2 0.00014 0.0093 10.1 0.0 2 23 647 668 646 686 0.87 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00066 13.8 0.1 1 2 0.037 2.5 2.3 0.0 2 23 12 33 11 49 0.79 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00066 13.8 0.1 2 2 0.0003 0.02 9.0 0.0 1 25 330 354 330 376 0.86 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0024 12.0 0.1 1 2 0.011 0.72 4.0 0.0 1 17 13 29 13 56 0.82 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0024 12.0 0.1 2 2 0.0033 0.22 5.6 0.0 2 25 332 355 331 373 0.80 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 Gtr1_RagA PF04670.7 232 0.0009 12.3 0.4 1 2 0.016 3.3 0.6 0.0 2 16 11 25 10 31 0.88 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 Gtr1_RagA PF04670.7 232 0.0009 12.3 0.4 2 2 6.5e-05 0.013 8.5 0.1 2 19 330 347 329 363 0.91 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 AAA_2 PF07724.9 171 6.4e-58 189.3 0.2 1 2 1.5e-05 0.003 11.4 0.1 3 109 303 415 301 434 0.68 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_2 PF07724.9 171 6.4e-58 189.3 0.2 2 2 8.4e-56 1.7e-53 174.9 0.0 1 171 641 810 641 810 0.97 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_41 - 447 APS_kinase PF01583.15 157 5.3e-08 26.6 0.1 1 2 2.8e-06 0.00028 14.4 0.0 4 67 12 74 10 84 0.77 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 APS_kinase PF01583.15 157 5.3e-08 26.6 0.1 2 2 7.9e-05 0.0081 9.7 0.0 6 37 332 363 328 384 0.85 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 APS_kinase PF01583.15 157 3.7e-07 23.8 0.1 1 2 1.4e-05 0.0015 12.1 0.0 5 37 11 43 8 50 0.90 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 APS_kinase PF01583.15 157 3.7e-07 23.8 0.1 2 2 0.00013 0.013 9.0 0.0 5 37 330 362 327 387 0.85 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 NTPase_1 PF03266.10 168 2e-05 18.2 1.8 1 2 0.0026 0.17 5.4 0.1 2 30 11 39 10 52 0.85 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 NTPase_1 PF03266.10 168 2e-05 18.2 1.8 2 2 0.0001 0.0069 10.0 0.1 2 30 330 358 329 362 0.92 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00018 15.2 2.5 1 2 0.0015 0.1 6.2 0.1 2 27 13 38 12 74 0.87 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00018 15.2 2.5 2 2 0.00036 0.024 8.2 0.4 5 30 334 359 330 363 0.89 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_14 - 932 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00026 14.6 0.3 1 2 0.0015 0.099 6.2 0.0 4 25 308 329 306 339 0.85 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00026 14.6 0.3 2 2 0.0099 0.67 3.5 0.0 6 23 650 667 645 674 0.85 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_9 - 168 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 4.1e-75 244.0 1.3 1 1 9.7e-77 4.9e-75 243.8 1.3 1 131 37 167 37 167 0.99 # 7783 # 8286 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 5_6 - 168 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 5.7e-75 243.6 1.8 1 1 1.3e-76 6.8e-75 243.3 1.8 1 131 37 167 37 167 0.99 # 6176 # 6679 # -1 # ID=5_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.538 1_53 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 2.3e-72 235.1 2.5 1 1 5e-74 2.6e-72 235.0 2.5 7 131 1 125 1 125 1.00 # 39481 # 39858 # 1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_74 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 2.2e-71 231.9 2.3 1 1 4.9e-73 2.5e-71 231.8 2.3 7 131 1 125 1 125 1.00 # 60275 # 60652 # -1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.534 1_52 - 92 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0055 10.2 6.1 1 1 0.00011 0.021 8.4 6.1 5 36 8 40 5 41 0.83 # 39161 # 39436 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_70 - 227 Trans_reg_C PF00486.23 77 7.5e-27 87.1 0.0 1 1 1.6e-28 1.6e-26 86.0 0.0 1 77 146 221 146 221 0.95 # 56604 # 57284 # 1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_55 - 227 Trans_reg_C PF00486.23 77 3.2e-26 85.0 0.4 1 1 8.1e-28 8.2e-26 83.7 0.0 1 77 146 221 146 221 0.97 # 40201 # 40881 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_5 - 337 Rossmann-like PF10727.4 127 0.00024 14.7 0.0 1 1 2.5e-06 0.0005 13.7 0.0 12 102 147 234 136 255 0.80 # 3462 # 4472 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 1_41 - 447 ATP_bind_1 PF03029.12 238 3e-06 20.8 3.3 1 2 9.6e-05 0.0097 9.3 0.1 2 37 16 51 15 55 0.94 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 ATP_bind_1 PF03029.12 238 3e-06 20.8 3.3 2 2 3.5e-05 0.0036 10.7 0.1 2 38 334 370 333 379 0.92 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 ATP_bind_1 PF03029.12 238 9.9e-06 19.1 2.5 1 2 0.00012 0.012 9.0 0.1 2 37 14 49 13 55 0.94 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 ATP_bind_1 PF03029.12 238 9.9e-06 19.1 2.5 2 2 0.0001 0.01 9.3 0.1 2 37 333 368 332 371 0.94 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 13_1 - 220 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.3e-52 171.4 0.0 1 1 1.7e-54 1.8e-52 171.0 0.0 4 139 60 197 58 198 0.99 # 54 # 713 # -1 # ID=13_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 3_33 - 360 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 4.9e-05 17.2 0.0 1 1 8.3e-07 8.5e-05 16.5 0.0 16 140 194 321 183 321 0.84 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 8_5 - 93 HTH_26 PF13443.1 63 2.6e-08 27.9 0.0 1 1 6.6e-10 6.7e-08 26.6 0.0 7 53 41 86 31 88 0.90 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 8_6 - 138 HTH_26 PF13443.1 63 1.5e-05 19.1 0.0 1 1 2.6e-07 2.7e-05 18.3 0.0 2 55 82 133 81 136 0.94 # 1698 # 2111 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_2 - 276 Arf PF00025.16 175 0.0023 11.1 0.0 1 1 1.9e-05 0.0038 10.4 0.0 18 36 41 59 28 73 0.82 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_12 - 94 HTH_17 PF12728.2 51 9e-20 64.7 0.0 1 1 2.3e-21 1.2e-19 64.3 0.0 2 50 9 57 8 58 0.96 # 9511 # 9792 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.574 1_49 - 265 HTH_17 PF12728.2 51 1.2e-05 19.4 0.7 1 1 7.1e-07 3.6e-05 17.9 0.0 4 30 37 63 36 71 0.87 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 8_5 - 93 HTH_17 PF12728.2 51 0.0019 12.4 0.4 1 2 0.074 3.8 1.8 0.1 5 20 26 41 24 43 0.85 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 8_5 - 93 HTH_17 PF12728.2 51 0.0019 12.4 0.4 2 2 0.00065 0.033 8.4 0.0 2 21 45 64 44 82 0.91 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_33 - 360 HTH_17 PF12728.2 51 0.0023 12.1 1.3 1 1 0.00028 0.014 9.6 0.1 7 26 48 70 45 90 0.72 # 25915 # 26994 # -1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_52 - 92 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 0.00034 14.3 4.8 1 1 3e-06 0.00061 13.5 4.8 19 46 6 38 3 38 0.79 # 39161 # 39436 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 7_6 - 49 HTH_11 PF08279.7 55 0.0011 12.6 0.0 1 1 6.8e-06 0.0014 12.2 0.0 3 31 8 36 7 39 0.93 # 4216 # 4362 # 1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 12_1 - 252 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 1.1e-46 151.5 0.0 1 1 1.4e-48 2.8e-46 150.2 0.0 1 112 34 145 34 145 0.96 # 33 # 788 # 1 # ID=12_1;partial=01;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 1_45 - 109 MarR_2 PF12802.2 62 7.4e-05 16.3 0.2 1 1 2.4e-06 0.00012 15.6 0.2 17 55 30 66 6 70 0.83 # 33508 # 33834 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_6 - 290 MarR_2 PF12802.2 62 0.00013 15.6 0.4 1 1 1.2e-05 0.00062 13.4 0.1 27 48 22 43 2 54 0.86 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 1_32 - 192 MarR_2 PF12802.2 62 0.00037 14.1 0.2 1 2 0.0049 0.25 5.0 0.1 5 31 12 41 10 43 0.78 # 23844 # 24419 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 1_32 - 192 MarR_2 PF12802.2 62 0.00037 14.1 0.2 2 2 0.0017 0.088 6.5 0.0 41 57 57 73 51 76 0.84 # 23844 # 24419 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 8_5 - 93 MarR_2 PF12802.2 62 0.0005 13.7 0.1 1 1 1.5e-05 0.00077 13.1 0.1 15 41 40 64 33 82 0.84 # 1419 # 1697 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_41 - 447 PIF1 PF05970.9 364 1.9e-05 17.6 0.1 1 2 0.00032 0.032 7.0 0.0 19 56 7 44 3 51 0.81 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 PIF1 PF05970.9 364 1.9e-05 17.6 0.1 2 2 0.00011 0.011 8.5 0.0 18 87 324 394 315 420 0.77 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 PIF1 PF05970.9 364 7.6e-05 15.6 0.1 1 2 0.00029 0.029 7.1 0.0 19 57 5 43 2 63 0.89 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 PIF1 PF05970.9 364 7.6e-05 15.6 0.1 2 2 0.00096 0.097 5.4 0.0 14 56 319 361 313 377 0.82 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_34 - 117 HTH_5 PF01022.15 47 1e-18 60.7 0.6 1 1 2.2e-20 1.5e-18 60.2 0.6 1 45 14 59 14 61 0.98 # 25034 # 25384 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.550 1_45 - 109 HTH_5 PF01022.15 47 1.7e-07 24.7 0.3 1 1 4.2e-09 2.9e-07 24.0 0.3 3 42 17 59 15 64 0.87 # 33508 # 33834 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_6 - 290 HTH_5 PF01022.15 47 1.1e-06 22.2 0.0 1 1 3.3e-08 2.2e-06 21.2 0.0 22 42 23 43 18 43 0.93 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 1_45 - 109 TrmB PF01978.14 68 2.6e-06 21.0 0.0 1 1 3.6e-08 3.7e-06 20.5 0.0 12 63 20 73 15 78 0.88 # 33508 # 33834 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 6_3 - 374 TrmB PF01978.14 68 0.0017 12.0 0.0 1 1 3.3e-05 0.0034 11.0 0.0 18 44 12 38 9 42 0.90 # 1895 # 3016 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 1_36 - 584 Helicase_RecD PF05127.9 177 0.00087 12.9 0.1 1 2 0.0039 0.4 4.2 0.0 3 47 14 58 12 88 0.86 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 Helicase_RecD PF05127.9 177 0.00087 12.9 0.1 2 2 0.001 0.1 6.1 0.0 2 70 332 400 331 457 0.74 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 Helicase_RecD PF05127.9 177 0.0016 12.0 0.4 1 2 0.00086 0.087 6.3 0.0 3 46 16 59 14 149 0.84 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 Helicase_RecD PF05127.9 177 0.0016 12.0 0.4 2 2 0.01 1 2.9 0.0 5 46 336 378 332 419 0.66 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 6_3 - 374 LacI PF00356.16 46 2.6e-24 78.6 3.2 1 1 4.1e-26 8.3e-24 76.9 2.0 1 46 18 63 18 63 0.99 # 1895 # 3016 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 6_3 - 374 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00011 15.8 0.3 1 1 3.1e-06 0.00062 13.5 0.0 28 51 16 39 8 42 0.91 # 1895 # 3016 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 1_18 - 251 Peptidase_M48 PF01435.13 226 2.4e-32 106.2 0.0 1 1 1.6e-34 3.2e-32 105.8 0.0 27 225 11 211 2 212 0.86 # 14686 # 15438 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.664 3_18 - 85 Exonuc_V_gamma PF04257.9 805 0.00046 12.1 0.7 1 1 2.5e-06 0.0005 12.0 0.7 152 212 12 74 1 75 0.85 # 16085 # 16339 # 1 # ID=3_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 2_22 - 660 AAA_10 PF12846.2 304 1.1e-45 150.2 0.0 1 1 4.9e-47 1.7e-45 149.6 0.0 1 294 261 553 261 559 0.85 # 23417 # 25396 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.547 2_4 - 771 AAA_10 PF12846.2 304 4.3e-09 30.1 0.0 1 1 3.7e-08 1.3e-06 22.0 0.0 3 296 187 494 186 499 0.63 # 6838 # 9150 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_36 - 584 AAA_10 PF12846.2 304 1.8e-06 21.5 0.4 1 2 9.5e-05 0.0032 10.8 0.0 2 70 9 78 8 106 0.81 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_10 PF12846.2 304 1.8e-06 21.5 0.4 2 2 0.00071 0.024 7.9 0.1 3 43 329 371 327 418 0.80 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 AAA_10 PF12846.2 304 4.5e-06 20.2 0.4 1 2 1.1e-05 0.00037 13.9 0.0 2 48 11 62 10 316 0.87 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_10 PF12846.2 304 4.5e-06 20.2 0.4 2 2 0.0071 0.24 4.6 0.1 3 36 330 365 328 376 0.85 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_14 - 932 AAA_10 PF12846.2 304 0.00038 13.8 0.2 1 2 0.09 3 1.0 0.0 4 25 306 327 303 333 0.80 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 AAA_10 PF12846.2 304 0.00038 13.8 0.2 2 2 0.00081 0.027 7.7 0.0 3 48 645 703 644 908 0.71 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_2 - 276 AAA_10 PF12846.2 304 0.0014 11.9 0.9 1 1 0.00011 0.0036 10.6 0.4 4 25 40 61 37 70 0.81 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_14 - 932 CobU PF02283.11 167 0.0063 9.8 3.2 1 3 0.0025 0.51 3.6 0.0 87 125 347 385 335 394 0.83 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 CobU PF02283.11 167 0.0063 9.8 3.2 2 3 0.017 3.5 0.9 2.5 20 121 526 626 516 634 0.72 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 CobU PF02283.11 167 0.0063 9.8 3.2 3 3 0.013 2.7 1.3 0.0 2 80 647 723 646 775 0.72 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_45 - 109 HTH_20 PF12840.2 61 1e-14 48.1 0.4 1 1 2.2e-16 1.5e-14 47.5 0.4 2 61 8 69 7 69 0.97 # 33508 # 33834 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_34 - 117 HTH_20 PF12840.2 61 2e-11 37.5 0.2 1 1 5e-13 3.4e-11 36.8 0.2 2 61 7 66 6 66 0.96 # 25034 # 25384 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.550 1_6 - 290 HTH_20 PF12840.2 61 9.8e-07 22.5 0.2 1 1 7e-08 4.8e-06 20.3 0.1 27 59 19 52 15 54 0.86 # 4466 # 5335 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 3_24 - 188 RrnaAD PF00398.15 262 5.7e-07 22.7 0.0 1 1 3.8e-09 7.7e-07 22.2 0.0 9 113 29 128 26 140 0.90 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 3_24 - 188 Methyltransf_18 PF12847.2 112 1.2e-07 26.2 0.0 1 1 9.9e-10 2e-07 25.5 0.0 2 107 51 144 50 146 0.90 # 19477 # 20040 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_2 - 276 AAA_13 PF13166.1 712 0.00068 12.0 0.0 1 2 0.0045 0.92 1.7 0.0 17 39 38 60 27 84 0.87 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_2 - 276 AAA_13 PF13166.1 712 0.00068 12.0 0.0 2 2 4.9e-05 0.01 8.2 0.0 527 579 169 220 162 230 0.85 # 930 # 1757 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_36 - 584 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.9e-133 438.1 0.0 1 3 2.1e-91 1e-89 294.4 0.0 2 300 9 292 8 296 0.97 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.9e-133 438.1 0.0 2 3 1.8e-35 9.2e-34 110.7 0.1 3 162 329 476 327 484 0.93 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.9e-133 438.1 0.0 3 3 1.1e-10 5.7e-09 29.3 0.0 200 300 483 582 475 583 0.93 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.5e-89 292.7 0.1 1 2 3.5e-77 1.8e-75 247.7 0.0 2 299 11 293 10 298 0.94 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.5e-89 292.7 0.1 2 2 5.5e-14 2.8e-12 40.1 0.3 4 41 331 368 328 392 0.93 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_40 - 158 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.6e-19 64.0 0.0 1 2 1.3e-10 6.7e-09 29.0 0.1 115 168 2 57 1 58 0.79 # 30031 # 30504 # -1 # ID=1_40;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 1_40 - 158 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.6e-19 64.0 0.0 2 2 2.1e-13 1.1e-11 38.2 0.0 176 300 33 156 31 157 0.93 # 30031 # 30504 # -1 # ID=1_40;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 3_6 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.5e-06 20.1 0.4 1 2 6.6e-06 0.00034 13.6 0.1 9 36 115 142 109 151 0.89 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_6 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.5e-06 20.1 0.4 2 2 0.0045 0.23 4.3 0.0 123 136 231 244 221 250 0.83 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_41 - 447 AAA_31 PF13614.1 157 2.4e-13 44.2 0.2 1 2 2.4e-08 1.6e-06 22.0 0.0 5 128 14 148 12 157 0.67 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 AAA_31 PF13614.1 157 2.4e-13 44.2 0.2 2 2 8.1e-07 5.5e-05 17.1 0.1 9 36 336 363 334 371 0.87 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 AAA_31 PF13614.1 157 1.3e-10 35.4 0.1 1 3 2.5e-07 1.7e-05 18.7 0.0 5 45 12 52 10 61 0.88 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_31 PF13614.1 157 1.3e-10 35.4 0.1 2 3 0.015 1 3.2 0.0 100 128 116 146 103 155 0.84 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 AAA_31 PF13614.1 157 1.3e-10 35.4 0.1 3 3 0.00018 0.012 9.4 0.0 3 38 330 364 328 409 0.74 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 3_6 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 2e-09 31.5 0.0 1 2 4.2e-08 2.8e-06 21.2 0.0 2 49 108 155 107 195 0.92 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_6 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 2e-09 31.5 0.0 2 2 0.00054 0.036 7.9 0.1 110 152 227 268 223 272 0.84 # 5763 # 6929 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_14 - 932 TIGR02397 TIGR02397 355 4e-07 23.1 0.0 1 2 0.016 1.1 1.9 0.0 7 58 275 325 269 335 0.73 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 TIGR02397 TIGR02397 355 4e-07 23.1 0.0 2 2 2.1e-07 1.4e-05 18.0 0.0 14 60 613 667 608 673 0.79 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_36 - 584 TIGR02397 TIGR02397 355 0.00046 13.0 0.5 1 2 0.0013 0.091 5.5 0.1 38 53 10 25 3 37 0.78 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 TIGR02397 TIGR02397 355 0.00046 13.0 0.5 2 2 0.0015 0.1 5.3 0.1 40 59 331 350 321 354 0.83 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_41 - 447 TIGR02397 TIGR02397 355 0.0019 11.0 3.2 1 2 0.00076 0.052 6.3 0.0 36 55 10 29 6 40 0.81 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 TIGR02397 TIGR02397 355 0.0019 11.0 3.2 2 2 0.002 0.13 5.0 0.2 42 63 334 355 324 384 0.79 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 6_2 - 337 ADH_zinc_N PF00107.21 130 1.1e-09 31.8 0.0 1 1 1.2e-11 2.4e-09 30.8 0.0 2 110 160 264 159 280 0.88 # 463 # 1473 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 1_41 - 447 IstB_IS21 PF01695.12 178 6.9e-11 35.8 0.4 1 2 1.3e-06 8.7e-05 15.9 0.0 50 84 13 47 4 54 0.91 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_41 - 447 IstB_IS21 PF01695.12 178 6.9e-11 35.8 0.4 2 2 4.8e-07 3.2e-05 17.3 0.1 50 90 331 371 315 396 0.81 # 30447 # 31787 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_36 - 584 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.1e-10 35.2 0.3 1 2 1.9e-06 0.00013 15.3 0.0 50 84 11 45 9 49 0.92 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_36 - 584 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.1e-10 35.2 0.3 2 2 6.3e-07 4.3e-05 16.9 0.0 49 83 329 363 320 383 0.85 # 25814 # 27565 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.535 1_14 - 932 IstB_IS21 PF01695.12 178 2.1e-09 30.9 0.2 1 2 1.5e-05 0.001 12.4 0.0 45 73 301 329 287 371 0.82 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_14 - 932 IstB_IS21 PF01695.12 178 2.1e-09 30.9 0.2 2 2 2e-06 0.00013 15.3 0.0 49 79 645 675 641 693 0.80 # 10511 # 13306 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_24 - 468 FaeA PF04703.7 62 0.00043 14.4 0.1 1 1 4.4e-06 0.00089 13.4 0.1 13 56 25 68 11 72 0.82 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_12 - 424 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 0.00011 15.6 0.0 1 1 1.8e-06 0.00036 14.0 0.0 5 28 183 206 179 215 0.87 # 10852 # 12123 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 7_1 - 173 tRNA_anti-like PF12869.2 144 3.6e-10 33.4 0.0 1 1 2.2e-12 4.4e-10 33.1 0.0 42 142 41 142 14 144 0.87 # 2 # 520 # 1 # ID=7_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.364 2_3 - 1754 AAA_11 PF13086.1 236 5.3e-05 16.8 2.4 1 2 9.3e-07 0.00019 15.0 0.0 2 72 971 1038 970 1065 0.82 # 1577 # 6838 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 2_3 - 1754 AAA_11 PF13086.1 236 5.3e-05 16.8 2.4 2 2 0.033 6.7 0.1 0.0 3 34 1182 1212 1180 1335 0.70 # 1577 # 6838 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 3_26 - 181 SSB PF00436.20 104 1.3e-40 131.4 0.2 1 1 8.1e-43 1.7e-40 131.1 0.2 1 99 6 105 6 113 0.97 # 20816 # 21358 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 6_2 - 337 ADH_zinc_N_2 PF13602.1 127 1.3e-09 32.9 0.0 1 1 1.2e-11 2.4e-09 32.1 0.0 18 126 215 332 174 333 0.75 # 463 # 1473 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 5_7 - 274 HTH_21 PF13276.1 60 1.4e-15 51.0 0.1 1 1 7e-17 3.6e-15 49.7 0.1 2 55 30 86 27 95 0.85 # 7064 # 7885 # -1 # ID=5_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.560 1_20 - 240 HTH_21 PF13276.1 60 1.8e-12 41.0 5.8 1 1 6.6e-14 3.4e-12 40.2 5.8 12 60 3 50 1 52 0.88 # 16061 # 16780 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.515 1_24 - 468 HTH_21 PF13276.1 60 0.00045 14.1 0.0 1 1 8.9e-06 0.00045 14.1 0.0 29 59 99 129 76 130 0.80 # 19518 # 20921 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_22 - 453 HTH_21 PF13276.1 60 0.0019 12.1 1.9 1 1 0.00012 0.0061 10.5 0.0 9 60 75 126 67 128 0.81 # 17281 # 18639 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_12 - 94 Phage_AlpA PF05930.7 51 1.9e-05 18.2 0.0 1 1 3.1e-07 3.1e-05 17.6 0.0 5 51 10 54 6 54 0.90 # 9511 # 9792 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.574 1_49 - 265 Phage_AlpA PF05930.7 51 0.00013 15.6 0.0 1 1 3.3e-06 0.00034 14.3 0.0 6 31 37 62 35 63 0.94 # 36110 # 36904 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/87668a05-e28f-4445-b78a-fdb67d7cb611 # Target file: checkm_output/bins/pn21/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pn21/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/87668a05-e28f-4445-b78a-fdb67d7cb611 checkm_output/bins/pn21/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:22:43 2017 # [ok]