# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_66 - 447 KaiC PF06745.8 227 6.9e-11 34.8 0.4 1 3 0.0089 1.1 1.5 0.0 120 163 74 120 14 184 0.61 # 54799 # 56139 # -1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_66 - 447 KaiC PF06745.8 227 6.9e-11 34.8 0.4 2 3 1.7e-11 2.2e-09 30.0 0.0 2 168 191 376 190 393 0.64 # 54799 # 56139 # -1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_66 - 447 KaiC PF06745.8 227 6.9e-11 34.8 0.4 3 3 0.01 1.2 1.3 0.1 65 133 342 408 336 417 0.59 # 54799 # 56139 # -1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_45 - 780 RecA PF00154.16 323 1.2e-40 132.7 0.0 1 2 1.7e-08 2.1e-06 20.2 0.0 22 70 16 68 7 84 0.78 # 33216 # 35555 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_45 - 780 RecA PF00154.16 323 1.2e-40 132.7 0.0 2 2 7.5e-36 9.2e-34 110.1 0.0 64 281 484 728 480 759 0.81 # 33216 # 35555 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_50 - 502 HHH_3 PF12836.2 65 0.00013 15.1 0.0 1 2 0.0037 0.46 3.8 0.0 19 41 122 144 119 147 0.90 # 38532 # 40037 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.485 1_50 - 502 HHH_3 PF12836.2 65 0.00013 15.1 0.0 2 2 0.0002 0.025 7.8 0.0 19 48 229 259 224 261 0.81 # 38532 # 40037 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.485 1_103 - 222 ABC_tran PF00005.22 137 2e-14 47.3 0.1 1 1 1.5e-13 6e-12 39.2 0.1 1 134 39 152 39 155 0.83 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_33 - 639 ABC_tran PF00005.22 137 1.7e-06 21.6 6.3 1 1 0.00031 0.013 9.0 6.3 79 125 482 564 40 568 0.86 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_24 - 215 ABC_tran PF00005.22 137 0.00011 15.7 0.0 1 1 5.7e-06 0.00023 14.7 0.0 13 35 4 26 2 33 0.90 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_70 - 223 CmcI PF04989.7 206 0.0005 12.6 0.0 1 1 6.4e-06 0.00078 12.0 0.0 57 115 26 87 4 97 0.84 # 58385 # 59053 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_103 - 222 DUF815 PF05673.8 250 1.6e-05 17.1 0.0 1 1 2e-07 2.5e-05 16.5 0.0 32 103 30 99 9 106 0.83 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_22 - 265 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00058 12.6 0.2 1 2 0.00092 0.11 5.3 0.0 19 40 169 190 163 190 0.88 # 13055 # 13849 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_22 - 265 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00058 12.6 0.2 2 2 0.0014 0.17 4.7 0.2 22 40 225 243 220 243 0.86 # 13055 # 13849 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_9 - 562 N6_Mtase PF02384.11 311 7.7e-05 15.0 0.0 1 2 0.00079 0.097 4.8 0.0 27 66 400 440 394 449 0.87 # 4193 # 5878 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.498 1_9 - 562 N6_Mtase PF02384.11 311 7.7e-05 15.0 0.0 2 2 0.00015 0.019 7.2 0.0 122 143 479 500 459 509 0.79 # 4193 # 5878 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.498 1_103 - 222 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00022 13.9 0.1 1 2 1.2e-05 0.0015 11.2 0.0 16 49 43 76 30 92 0.79 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00022 13.9 0.1 2 2 0.026 3.2 0.4 0.1 131 150 174 194 155 209 0.67 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00028 13.6 0.0 1 2 7.5e-06 0.00093 11.9 0.0 18 58 28 69 16 73 0.81 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00028 13.6 0.0 2 2 0.065 8 -1.0 0.0 175 200 159 184 95 197 0.72 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_106 - 520 Helicase_C PF00271.26 78 2.8e-14 46.0 0.0 1 1 6.9e-16 8.5e-14 44.5 0.0 2 78 387 463 386 463 0.97 # 90664 # 92223 # 1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_24 - 215 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 2.1e-05 17.7 0.6 1 1 4.3e-07 5.3e-05 16.4 0.6 2 30 5 33 4 206 0.97 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_55 - 129 HTH_38 PF13936.1 44 0.001 11.9 0.1 1 1 2.5e-05 0.0031 10.3 0.1 14 32 18 37 9 40 0.75 # 46232 # 46618 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 1_43 - 277 TIGR01932 TIGR01932 318 1.3e-09 30.2 2.7 1 1 1.4e-11 1.7e-09 29.7 2.7 144 268 115 240 84 244 0.84 # 32089 # 32919 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_43 - 277 TIGR01933 TIGR01933 261 6.2e-06 18.7 1.8 1 1 6.6e-08 8.1e-06 18.3 1.8 84 201 115 234 80 252 0.78 # 32089 # 32919 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_103 - 222 MobB PF03205.9 140 4e-06 19.8 0.0 1 1 1.5e-07 9.5e-06 18.6 0.0 2 37 51 86 50 102 0.88 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_24 - 215 MobB PF03205.9 140 0.00072 12.5 0.0 1 1 2.2e-05 0.0013 11.6 0.0 2 20 4 22 3 35 0.90 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_77 - 235 TBPIP PF07106.8 169 0.00054 12.7 1.5 1 2 6.1e-05 0.0075 9.0 0.2 70 110 21 64 3 71 0.49 # 62099 # 62803 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 1_77 - 235 TBPIP PF07106.8 169 0.00054 12.7 1.5 2 2 0.0055 0.67 2.7 0.1 114 136 205 227 197 233 0.75 # 62099 # 62803 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 1_99 - 92 AAA_19 PF13245.1 76 0.00051 13.0 0.0 1 1 1e-05 0.00062 12.7 0.0 22 58 36 70 19 88 0.81 # 86304 # 86579 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_24 - 215 AAA_19 PF13245.1 76 0.00062 12.8 0.1 1 1 2.3e-05 0.0014 11.6 0.1 15 35 7 26 4 51 0.79 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_70 - 223 CbiA PF01656.18 195 3.2e-15 49.2 0.2 1 1 8.3e-17 5.1e-15 48.6 0.2 2 158 6 147 5 185 0.75 # 58385 # 59053 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_103 - 222 CbiA PF01656.18 195 0.00054 12.6 0.2 1 1 1.4e-05 0.00083 12.0 0.2 2 48 52 101 51 201 0.72 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 PRK PF00485.13 194 4e-05 16.4 0.1 1 1 1.3e-06 8.2e-05 15.4 0.0 1 39 51 88 51 107 0.78 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_24 - 215 PRK PF00485.13 194 6.3e-05 15.8 0.0 1 1 1.5e-06 9.3e-05 15.2 0.0 2 33 5 47 4 86 0.77 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_103 - 222 KTI12 PF08433.5 270 6.9e-07 21.9 0.1 1 2 1.6e-07 1.9e-05 17.1 0.0 4 40 52 88 50 102 0.90 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 KTI12 PF08433.5 270 6.9e-07 21.9 0.1 2 2 0.0036 0.44 2.8 0.0 187 224 149 185 136 218 0.65 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_38 - 352 Rep_3 PF01051.16 222 2.1e-38 125.3 0.0 1 1 3.2e-40 3.9e-38 124.4 0.0 3 220 27 283 25 286 0.92 # 28934 # 29989 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 1_33 - 639 AAA_23 PF13476.1 202 3.6e-20 66.3 10.3 1 1 4.6e-20 5.6e-18 59.1 7.8 1 201 5 266 5 510 0.78 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_21 - 183 TIGR00573 TIGR00573 217 2.9e-18 59.0 0.0 1 1 3.1e-20 3.8e-18 58.6 0.0 11 173 5 168 2 173 0.87 # 12510 # 13058 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_24 - 215 AAA_24 PF13479.1 213 0.00086 12.1 0.0 1 1 1e-05 0.0012 11.6 0.0 5 25 4 24 2 66 0.86 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_9 - 562 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2.7e-09 30.3 0.0 1 1 4.2e-11 5.1e-09 29.4 0.0 2 116 422 519 421 520 0.89 # 4193 # 5878 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.498 1_103 - 222 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.2e-05 17.7 0.1 1 2 2.9e-07 3.6e-05 16.1 0.0 14 52 47 85 37 101 0.81 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.2e-05 17.7 0.1 2 2 0.064 7.9 -1.3 0.0 174 185 159 170 126 207 0.61 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 AAA_30 PF13604.1 196 3.3e-05 16.7 0.1 1 2 2.2e-06 0.00027 13.7 0.0 17 50 48 81 42 112 0.91 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 AAA_30 PF13604.1 196 3.3e-05 16.7 0.1 2 2 0.017 2.1 1.0 0.0 36 52 167 183 120 217 0.64 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_33 - 639 SMC_N PF02463.14 220 5.7e-16 51.6 0.5 1 1 1.6e-17 1e-15 50.8 0.5 32 199 41 617 4 632 0.91 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_103 - 222 SMC_N PF02463.14 220 4.7e-05 15.9 0.6 1 2 0.00086 0.053 5.9 0.1 25 41 50 66 37 73 0.81 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 SMC_N PF02463.14 220 4.7e-05 15.9 0.6 2 2 0.00012 0.0073 8.7 0.0 135 204 117 192 67 208 0.65 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_70 - 223 MipZ PF09140.6 261 4.7e-17 55.1 0.3 1 1 2.8e-17 3.4e-15 48.9 0.3 2 150 4 133 3 145 0.84 # 58385 # 59053 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_6 - 184 DivIC PF04977.10 80 0.00013 14.7 0.0 1 1 3.6e-06 0.00022 13.9 0.0 5 51 50 96 49 104 0.89 # 2358 # 2909 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_77 - 235 DivIC PF04977.10 80 0.00067 12.4 0.6 1 2 0.032 2 1.3 0.1 20 42 19 41 9 68 0.58 # 62099 # 62803 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 1_77 - 235 DivIC PF04977.10 80 0.00067 12.4 0.6 2 2 0.00011 0.0066 9.2 0.0 30 51 206 227 199 233 0.86 # 62099 # 62803 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 1_33 - 639 AAA_21 PF13304.1 303 1.1e-07 25.2 0.1 1 2 0.00022 0.014 8.5 0.0 8 23 42 57 41 117 0.80 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_33 - 639 AAA_21 PF13304.1 303 1.1e-07 25.2 0.1 2 2 3.5e-06 0.00021 14.5 0.1 219 297 500 615 375 616 0.67 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_24 - 215 AAA_21 PF13304.1 303 0.00074 12.7 0.0 1 1 1.6e-05 0.00097 12.3 0.0 3 22 6 25 5 79 0.86 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_24 - 215 AAA PF00004.24 132 0.00013 15.4 0.1 1 1 2.1e-06 0.00026 14.4 0.0 3 38 7 45 5 74 0.81 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_55 - 129 HTH_37 PF13744.1 80 0.00019 14.4 0.0 1 1 2.8e-06 0.00034 13.6 0.0 17 56 11 51 2 70 0.80 # 46232 # 46618 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 1_101 - 89 LexA_DNA_bind PF01726.11 65 0.00037 13.3 0.3 1 1 1.4e-05 0.0017 11.2 0.3 4 64 3 63 1 64 0.84 # 87408 # 87674 # -1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_123 - 40 tRNA_bind PF01588.15 95 7.7e-07 22.1 0.0 1 1 6.6e-09 8.1e-07 22.1 0.0 58 94 1 36 1 37 0.94 # 101799 # 101918 # -1 # ID=1_123;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 1_101 - 89 HTH_27 PF13463.1 68 0.00051 13.6 0.2 1 2 0.042 5.2 0.8 0.0 19 43 5 30 2 32 0.73 # 87408 # 87674 # -1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_101 - 89 HTH_27 PF13463.1 68 0.00051 13.6 0.2 2 2 2.8e-05 0.0034 10.9 0.0 29 58 36 63 34 79 0.75 # 87408 # 87674 # -1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_22 - 265 MerR_1 PF13411.1 69 0.00015 14.7 0.2 1 2 0.00013 0.016 8.3 0.0 2 28 169 196 168 217 0.76 # 13055 # 13849 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_22 - 265 MerR_1 PF13411.1 69 0.00015 14.7 0.2 2 2 0.0026 0.31 4.1 0.0 2 31 222 258 222 263 0.81 # 13055 # 13849 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_103 - 222 cobW PF02492.14 178 0.00069 12.3 0.0 1 1 9.8e-06 0.0012 11.5 0.0 2 33 51 83 50 112 0.78 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 AAA_16 PF13191.1 185 1.8e-08 27.7 0.0 1 1 2.1e-10 2.6e-08 27.3 0.0 13 87 39 107 30 182 0.77 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 AAA_22 PF13401.1 131 3.5e-07 23.7 0.0 1 1 2.5e-08 1e-06 22.1 0.0 3 86 48 176 45 194 0.73 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_66 - 447 AAA_22 PF13401.1 131 0.00075 12.9 0.1 1 1 9.9e-05 0.0041 10.5 0.1 3 118 208 361 203 371 0.65 # 54799 # 56139 # -1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_24 - 215 AAA_22 PF13401.1 131 0.00082 12.7 0.2 1 1 2.7e-05 0.0011 12.3 0.2 9 28 7 26 3 153 0.93 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_57 - 82 TIGR00365 TIGR00365 99 5e-05 16.3 0.0 1 1 4.7e-07 5.8e-05 16.1 0.0 26 81 10 71 2 79 0.80 # 47927 # 48172 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_9 - 562 Methyltransf_27 PF13708.1 194 3.6e-45 147.0 1.2 1 2 1.3e-46 1.6e-44 144.9 1.3 3 194 87 300 85 300 0.91 # 4193 # 5878 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.498 1_9 - 562 Methyltransf_27 PF13708.1 194 3.6e-45 147.0 1.2 2 2 0.072 8.9 -1.0 0.0 108 135 348 375 333 385 0.78 # 4193 # 5878 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.498 1_103 - 222 AAA_29 PF13555.1 62 1.1e-07 24.6 0.0 1 1 4.6e-09 2.8e-07 23.2 0.0 8 40 35 66 32 70 0.91 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_33 - 639 AAA_29 PF13555.1 62 7.8e-05 15.4 0.0 1 1 3.7e-06 0.00023 13.9 0.0 31 51 41 61 4 65 0.82 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_24 - 215 AAA_28 PF13521.1 163 4.4e-11 36.2 0.0 1 1 5.5e-13 6.8e-11 35.6 0.0 1 101 4 102 4 158 0.81 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_21 - 183 RNase_H_2 PF13482.1 164 1.2e-07 24.9 0.0 1 1 1.1e-08 1.4e-06 21.4 0.0 43 121 67 151 5 157 0.73 # 12510 # 13058 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_55 - 129 HTH_3 PF01381.17 55 0.00044 13.3 0.0 1 1 6.2e-06 0.00076 12.6 0.0 10 53 26 70 23 72 0.96 # 46232 # 46618 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 1_70 - 223 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00092 11.6 2.2 1 2 1.3e-05 0.0016 10.8 0.4 8 45 11 49 3 97 0.73 # 58385 # 59053 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_70 - 223 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00092 11.6 2.2 2 2 0.015 1.8 0.8 0.1 155 228 100 177 77 196 0.69 # 58385 # 59053 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_55 - 129 HTH_19 PF12844.2 64 6.9e-07 22.5 0.0 1 1 8.3e-09 1e-06 22.0 0.0 9 62 22 76 14 78 0.89 # 46232 # 46618 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 1_24 - 215 NB-ARC PF00931.17 287 0.00098 11.2 0.1 1 1 1.3e-05 0.0016 10.5 0.1 22 42 5 25 3 30 0.89 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_47 - 315 TIGR00593 TIGR00593 890 2.8e-37 121.3 0.0 1 1 5.4e-39 3.3e-37 121.1 0.0 3 278 5 287 3 307 0.81 # 35824 # 36768 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_79 - 779 TIGR00593 TIGR00593 890 0.0065 7.6 15.4 1 1 0.00014 0.0087 7.2 15.4 258 461 123 345 25 366 0.40 # 63091 # 65427 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_106 - 520 TIGR00595 TIGR00595 509 0.00051 11.5 0.1 1 1 9.8e-06 0.0012 10.3 0.0 300 339 403 442 375 452 0.83 # 90664 # 92223 # 1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_103 - 222 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00028 13.8 0.0 1 1 2.8e-06 0.00035 13.5 0.0 18 68 47 97 41 177 0.84 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_98 - 328 PhoH PF02562.11 205 0.00045 12.7 0.0 1 2 0.00022 0.027 6.8 0.0 112 137 21 44 16 55 0.85 # 85324 # 86307 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_98 - 328 PhoH PF02562.11 205 0.00045 12.7 0.0 2 2 0.0022 0.27 3.6 0.0 62 106 257 301 229 306 0.87 # 85324 # 86307 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_52 - 412 AAA_5 PF07728.9 139 9.2e-18 57.5 0.0 1 1 1.3e-19 1.6e-17 56.7 0.0 4 126 173 293 172 308 0.93 # 42230 # 43465 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_106 - 520 ResIII PF04851.10 184 8.2e-18 58.0 0.0 1 1 1.4e-19 1.8e-17 57.0 0.0 26 183 112 268 96 269 0.82 # 90664 # 92223 # 1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_106 - 520 SNF2_N PF00176.18 299 3e-05 16.1 0.0 1 1 4e-07 5e-05 15.4 0.0 106 182 186 277 155 285 0.84 # 90664 # 92223 # 1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_70 - 223 TIGR01968 TIGR01968 261 4e-09 29.0 7.5 1 2 5.2e-07 6.4e-05 15.2 1.8 2 40 3 42 2 46 0.87 # 58385 # 59053 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_70 - 223 TIGR01968 TIGR01968 261 4e-09 29.0 7.5 2 2 1.1e-07 1.3e-05 17.5 0.4 99 199 69 173 52 213 0.84 # 58385 # 59053 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_24 - 215 AAA_18 PF13238.1 129 6.4e-07 22.9 0.1 1 1 1.7e-08 1e-06 22.3 0.1 1 25 5 29 5 102 0.84 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_103 - 222 AAA_18 PF13238.1 129 2e-06 21.3 0.0 1 1 6.4e-08 3.9e-06 20.4 0.0 1 40 52 91 52 106 0.82 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 DUF258 PF03193.11 161 1.9e-05 17.1 0.0 1 1 2.7e-07 3.3e-05 16.3 0.0 25 84 38 110 14 119 0.75 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_21 - 183 TIGR01406 TIGR01406 231 1.5e-23 76.5 0.0 1 1 1.5e-25 1.9e-23 76.1 0.0 5 166 6 166 4 175 0.92 # 12510 # 13058 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_66 - 447 DnaB_C PF03796.10 259 4.3e-12 38.6 0.2 1 1 5.2e-14 6.4e-12 38.0 0.2 2 237 190 420 189 441 0.75 # 54799 # 56139 # -1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_103 - 222 DUF2791 PF10923.3 417 0.00023 13.0 0.1 1 1 3.4e-06 0.00042 12.1 0.0 26 84 27 84 23 105 0.85 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 3.1e-05 17.3 0.0 1 1 4.3e-07 5.2e-05 16.5 0.0 10 95 38 143 34 192 0.70 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_21 - 183 TIGR01298 TIGR01298 200 9.8e-07 21.6 0.2 1 2 6.3e-05 0.0078 8.9 0.0 13 75 6 64 2 107 0.83 # 12510 # 13058 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_21 - 183 TIGR01298 TIGR01298 200 9.8e-07 21.6 0.2 2 2 1.7e-05 0.0021 10.7 0.0 163 192 143 172 134 176 0.86 # 12510 # 13058 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_24 - 215 HTH_33 PF13592.1 60 0.00024 13.9 0.0 1 1 3.9e-06 0.00048 12.9 0.0 10 36 18 44 16 47 0.94 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_106 - 520 DEAD PF00270.24 169 6.7e-14 44.9 0.1 1 2 1.6e-13 2e-11 36.9 0.0 2 163 99 268 98 275 0.66 # 90664 # 92223 # 1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_106 - 520 DEAD PF00270.24 169 6.7e-14 44.9 0.1 2 2 0.0015 0.19 4.4 0.0 64 102 384 425 371 428 0.78 # 90664 # 92223 # 1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_55 - 129 HTH_31 PF13560.1 64 7.2e-05 16.2 0.0 1 1 8.7e-07 0.00011 15.6 0.0 10 59 21 70 12 81 0.85 # 46232 # 46618 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 1_103 - 222 DUF2075 PF09848.4 352 8.3e-05 14.8 0.1 1 2 1.8e-06 0.00023 13.4 0.0 3 28 51 76 49 105 0.82 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 DUF2075 PF09848.4 352 8.3e-05 14.8 0.1 2 2 0.053 6.5 -1.3 0.0 207 245 166 203 147 213 0.70 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_9 - 562 TIGR00755 TIGR00755 256 1.4e-05 17.3 0.0 1 1 2.4e-07 2.9e-05 16.3 0.0 15 106 406 494 393 502 0.84 # 4193 # 5878 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.498 1_98 - 328 Terminase_6 PF03237.10 384 1.1e-16 53.8 0.0 1 1 9.9e-19 1.2e-16 53.6 0.0 71 382 3 312 1 314 0.89 # 85324 # 86307 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_103 - 222 T2SE PF00437.15 272 0.00022 13.4 0.1 1 1 3.2e-06 0.00039 12.5 0.1 117 164 38 85 5 109 0.79 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 NACHT PF05729.7 166 4.7e-05 16.3 0.0 1 1 1.8e-06 0.00011 15.1 0.0 2 30 51 79 50 106 0.84 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_24 - 215 NACHT PF05729.7 166 0.00095 12.0 0.1 1 1 2.8e-05 0.0017 11.2 0.1 4 20 6 22 3 27 0.87 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_103 - 222 UPF0079 PF02367.12 123 4.6e-06 19.5 0.0 1 1 8e-08 9.9e-06 18.4 0.0 9 47 43 82 36 93 0.87 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_81 - 198 Lambda_tail_I PF06805.7 82 0.00015 14.8 0.0 1 1 3.4e-06 0.00042 13.4 0.0 5 81 7 95 4 96 0.75 # 69700 # 70293 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_24 - 215 AAA_17 PF13207.1 121 1.8e-13 44.6 0.1 1 1 4.8e-15 2.9e-13 43.9 0.1 1 94 4 102 4 155 0.71 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_103 - 222 AAA_17 PF13207.1 121 5.6e-07 23.6 0.0 1 1 1.7e-08 1e-06 22.8 0.0 1 33 51 86 51 178 0.81 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 TIGR02211 TIGR02211 221 4.4e-16 51.9 0.2 1 2 2.7e-09 1.7e-07 23.9 0.0 15 51 33 69 22 81 0.90 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 TIGR02211 TIGR02211 221 4.4e-16 51.9 0.2 2 2 4.7e-10 2.9e-08 26.3 0.0 119 215 102 200 83 204 0.86 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_33 - 639 TIGR02211 TIGR02211 221 3.2e-05 16.4 0.2 1 2 0.045 2.8 0.2 0.1 39 51 41 53 31 70 0.84 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_33 - 639 TIGR02211 TIGR02211 221 3.2e-05 16.4 0.2 2 2 5.2e-06 0.00032 13.1 0.0 137 218 543 634 520 636 0.79 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_66 - 447 AAA_25 PF13481.1 194 2.4e-13 43.1 0.1 1 2 0.045 2.8 0.5 0.0 120 176 44 103 12 114 0.63 # 54799 # 56139 # -1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_66 - 447 AAA_25 PF13481.1 194 2.4e-13 43.1 0.1 2 2 3.3e-14 2e-12 40.1 0.0 14 193 189 372 175 373 0.75 # 54799 # 56139 # -1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_103 - 222 AAA_25 PF13481.1 194 0.00028 13.5 0.1 1 2 5.7e-05 0.0035 9.9 0.0 19 50 31 66 15 88 0.76 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 AAA_25 PF13481.1 194 0.00028 13.5 0.1 2 2 0.025 1.5 1.3 0.1 165 185 162 182 144 186 0.80 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 AAA_15 PF13175.1 415 0.00012 14.3 0.0 1 1 1.2e-06 0.00015 14.1 0.0 14 54 41 95 6 142 0.77 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_24 - 215 AAA_14 PF13173.1 128 0.0002 14.4 0.1 1 1 1.1e-05 0.00068 12.8 0.1 5 35 5 31 2 41 0.80 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_103 - 222 AAA_14 PF13173.1 128 0.0004 13.5 0.0 1 1 1.9e-05 0.0012 12.0 0.0 2 44 49 90 48 122 0.72 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_70 - 223 VirC1 PF07015.6 231 9.6e-08 24.5 0.0 1 1 1.1e-09 1.4e-07 24.0 0.0 6 189 7 189 2 203 0.81 # 58385 # 59053 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_21 - 183 DNA_pol_B_exo1 PF03104.14 325 3.3e-05 16.0 0.0 1 1 4.4e-07 5.4e-05 15.3 0.0 237 271 84 118 5 136 0.72 # 12510 # 13058 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_74 - 231 MerR PF00376.18 38 8.6e-05 15.3 0.1 1 1 2.6e-06 0.00031 13.5 0.0 2 26 87 111 86 124 0.85 # 60593 # 61285 # -1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_24 - 215 AAA_33 PF13671.1 143 0.00034 13.7 0.0 1 1 9.5e-06 0.00059 12.9 0.0 5 78 8 81 5 120 0.64 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_103 - 222 AAA_33 PF13671.1 143 0.00039 13.5 0.1 1 1 1.1e-05 0.00069 12.7 0.1 1 33 51 94 51 213 0.69 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 ArgK PF03308.11 267 1.8e-05 16.8 0.0 1 1 2.7e-07 3.3e-05 15.9 0.0 25 63 45 83 5 86 0.88 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_33 - 639 SbcCD_C PF13558.1 90 3.9e-08 26.4 0.1 1 1 7.6e-10 9.3e-08 25.2 0.1 7 89 529 601 520 602 0.84 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_50 - 502 HHH_6 PF14579.1 90 1.3e-16 53.7 0.0 1 1 2.7e-18 3.3e-16 52.4 0.0 1 84 195 285 195 287 0.93 # 38532 # 40037 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.485 1_103 - 222 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00011 15.5 0.1 1 1 5.5e-06 0.00067 13.1 0.1 1 26 52 77 52 109 0.80 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_61 - 72 HTH_45 PF14947.1 77 0.00061 12.8 0.0 1 1 8.1e-06 0.00099 12.2 0.0 43 71 33 66 29 71 0.74 # 50609 # 50824 # -1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 1_103 - 222 APS_kinase PF01583.15 157 4.2e-07 22.9 0.0 1 1 6.6e-09 8.1e-07 22.0 0.0 1 38 48 85 48 105 0.86 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 NTPase_1 PF03266.10 168 3.5e-05 16.7 0.0 1 2 5.6e-06 0.00035 13.5 0.0 2 31 52 81 51 85 0.94 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 NTPase_1 PF03266.10 168 3.5e-05 16.7 0.0 2 2 0.055 3.4 0.5 0.0 94 140 143 193 124 216 0.57 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_24 - 215 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00043 13.2 0.1 1 1 1.3e-05 0.00078 12.4 0.1 1 19 4 22 4 27 0.88 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_17 - 197 RNase_H PF00075.19 132 1.1e-34 112.8 0.0 1 1 1.3e-36 1.6e-34 112.3 0.0 3 131 40 178 38 179 0.90 # 9172 # 9762 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_100 - 211 HTH_26 PF13443.1 63 0.0007 13.0 0.0 1 2 4e-05 0.0049 10.3 0.0 11 34 29 52 25 55 0.90 # 86579 # 87211 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_100 - 211 HTH_26 PF13443.1 63 0.0007 13.0 0.0 2 2 0.081 10 -0.3 0.0 22 44 164 188 161 190 0.74 # 86579 # 87211 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_103 - 222 KAP_NTPase PF07693.9 325 3.6e-07 22.6 0.0 1 1 3.5e-09 4.3e-07 22.4 0.0 17 115 46 142 37 203 0.69 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_43 - 277 ATP-synt_B PF00430.13 132 0.0007 12.6 7.0 1 1 1.1e-05 0.0014 11.7 7.0 45 93 187 233 179 265 0.81 # 32089 # 32919 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_27 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 1.8e-66 217.2 0.6 1 4 6.4e-22 7.9e-20 64.0 0.0 2 84 18 101 17 103 0.95 # 15872 # 16975 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_27 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 1.8e-66 217.2 0.6 2 4 1.7e-08 2.1e-06 19.9 0.2 116 136 100 120 100 135 0.84 # 15872 # 16975 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_27 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 1.8e-66 217.2 0.6 3 4 4.1e-16 5.1e-14 45.0 0.0 139 188 157 206 149 221 0.90 # 15872 # 16975 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_27 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 1.8e-66 217.2 0.6 4 4 2e-28 2.5e-26 85.4 0.0 191 296 260 367 255 367 0.93 # 15872 # 16975 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_101 - 89 MarR_2 PF12802.2 62 0.00038 13.4 0.1 1 1 5.9e-06 0.00072 12.5 0.1 34 54 38 58 36 72 0.75 # 87408 # 87674 # -1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_103 - 222 PIF1 PF05970.9 364 5.1e-05 15.5 0.0 1 1 6.8e-07 8.3e-05 14.8 0.0 18 55 45 82 31 85 0.86 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_24 - 215 CoaE PF01121.15 180 1.7e-06 20.8 0.2 1 1 2.8e-08 3.4e-06 19.8 0.2 2 31 4 34 3 48 0.93 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_21 - 183 RNase_T PF00929.19 164 1.5e-22 73.8 0.0 1 1 1.3e-24 1.7e-22 73.7 0.0 3 164 6 165 4 165 0.93 # 12510 # 13058 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_33 - 639 AAA_10 PF12846.2 304 3.2e-06 19.9 2.9 1 2 0.0002 0.012 8.1 0.1 10 29 42 64 39 100 0.70 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_33 - 639 AAA_10 PF12846.2 304 3.2e-06 19.9 2.9 2 2 1.8e-05 0.0011 11.6 0.3 62 262 434 617 356 628 0.86 # 23037 # 24953 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_103 - 222 AAA_10 PF12846.2 304 3.4e-06 19.8 0.4 1 2 2.4e-06 0.00015 14.5 0.0 6 42 54 92 51 107 0.81 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_103 - 222 AAA_10 PF12846.2 304 3.4e-06 19.8 0.4 2 2 0.0042 0.26 3.8 0.1 216 260 140 184 94 191 0.78 # 88571 # 89236 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_100 - 211 HTH_20 PF12840.2 61 0.00049 13.1 0.0 1 1 2.1e-05 0.0026 10.8 0.0 21 47 25 51 11 58 0.89 # 86579 # 87211 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_24 - 215 CPT PF07931.7 174 0.00051 12.9 0.0 1 2 1.7e-05 0.0021 10.9 0.0 7 47 8 48 5 87 0.79 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_24 - 215 CPT PF07931.7 174 0.00051 12.9 0.0 2 2 0.08 9.8 -1.1 0.0 62 86 171 195 144 206 0.58 # 14340 # 14984 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_9 - 562 RrnaAD PF00398.15 262 0.00016 14.0 0.0 1 1 2.4e-06 0.00029 13.1 0.0 11 108 401 493 394 500 0.81 # 4193 # 5878 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.498 1_43 - 277 TIGR01144 TIGR01144 147 0.035 6.9 9.5 1 2 0.031 3.8 0.3 0.0 109 145 117 153 110 155 0.77 # 32089 # 32919 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_43 - 277 TIGR01144 TIGR01144 147 0.035 6.9 9.5 2 2 0.00028 0.034 6.9 6.6 41 89 187 235 179 252 0.84 # 32089 # 32919 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_70 - 223 AAA_31 PF13614.1 157 5e-07 23.0 0.0 1 2 6.5e-06 0.0008 12.6 0.0 1 41 3 44 3 66 0.84 # 58385 # 59053 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_70 - 223 AAA_31 PF13614.1 157 5e-07 23.0 0.0 2 2 0.00012 0.015 8.4 0.0 109 151 70 114 51 120 0.74 # 58385 # 59053 # -1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_45 - 780 TIGR02012 TIGR02012 321 1.3e-40 132.5 0.0 1 2 2.1e-07 2.5e-05 16.6 0.0 35 72 28 68 11 82 0.74 # 33216 # 35555 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_45 - 780 TIGR02012 TIGR02012 321 1.3e-40 132.5 0.0 2 2 6.3e-37 7.7e-35 113.5 0.0 66 285 484 730 479 758 0.78 # 33216 # 35555 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_98 - 328 Terminase_3 PF04466.8 387 0.00046 12.5 0.0 1 2 1.8e-05 0.0022 10.3 0.0 72 123 1 52 1 69 0.89 # 85324 # 86307 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_98 - 328 Terminase_3 PF04466.8 387 0.00046 12.5 0.0 2 2 0.027 3.4 -0.2 0.0 342 385 266 311 227 313 0.70 # 85324 # 86307 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/ce790596-4c3e-4717-8bec-23258168e69d # Target file: checkm_output/bins/pm956/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm956/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/ce790596-4c3e-4717-8bec-23258168e69d checkm_output/bins/pm956/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:19:06 2017 # [ok]