# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_4 - 1220 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.0013 11.8 0.2 1 3 0.00033 0.054 6.5 0.0 10 37 363 390 358 440 0.87 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.0013 11.8 0.2 2 3 0.06 9.9 -0.9 0.0 99 140 527 567 498 576 0.50 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.0013 11.8 0.2 3 3 0.016 2.6 1.0 0.1 10 35 985 1010 980 1026 0.87 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 KaiC PF06745.8 227 0.00056 12.7 0.1 1 2 0.0024 0.4 3.3 0.0 17 35 366 384 359 389 0.88 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 KaiC PF06745.8 227 0.00056 12.7 0.1 2 2 0.00032 0.052 6.2 0.0 15 35 986 1006 960 1011 0.85 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 4_3 - 284 RepC PF06504.6 283 7.3e-159 520.6 0.0 1 1 5e-161 8.1e-159 520.5 0.0 2 282 2 282 1 283 0.99 # 831 # 1682 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.661 3_3 - 426 K_oxygenase PF13434.1 341 4.9e-118 387.5 0.0 1 1 7.3e-120 6e-118 387.2 0.0 2 340 4 333 3 334 0.96 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 6_10 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 9.3e-06 18.3 0.0 1 2 0.0079 0.65 2.4 0.0 187 220 94 125 59 130 0.79 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 9.3e-06 18.3 0.0 2 2 6.7e-06 0.00055 12.5 0.0 132 231 218 308 202 332 0.82 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_33 - 108 HTH_IclR PF09339.5 52 7.3e-09 28.8 0.1 1 1 3.3e-10 1.8e-08 27.5 0.1 13 51 27 65 23 66 0.93 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 4_15 - 505 HTH_IclR PF09339.5 52 2.9e-07 23.6 0.2 1 2 1.2e-07 6.7e-06 19.3 0.0 17 41 14 38 1 38 0.81 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 4_15 - 505 HTH_IclR PF09339.5 52 2.9e-07 23.6 0.2 2 2 0.06 3.3 1.1 0.0 6 31 427 454 426 455 0.88 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 8_1 - 113 HTH_IclR PF09339.5 52 8.5e-06 19.0 0.4 1 1 6.1e-07 3.4e-05 17.0 0.0 15 40 82 107 78 108 0.85 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 1_4 - 1220 ABC_tran PF00005.22 137 4.2e-65 211.8 0.0 1 2 1.2e-35 3.8e-34 111.5 0.0 1 137 358 511 358 511 0.86 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 ABC_tran PF00005.22 137 4.2e-65 211.8 0.0 2 2 2e-31 6.4e-30 97.9 0.0 1 137 980 1129 980 1129 0.88 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_13 - 276 ABC_tran PF00005.22 137 6.2e-30 97.9 0.0 1 1 2.8e-31 9.1e-30 97.4 0.0 1 136 23 170 23 171 0.89 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_30 - 519 ABC_tran PF00005.22 137 2.5e-11 37.6 0.3 1 1 2.3e-11 7.4e-10 32.9 0.3 8 134 33 235 29 237 0.52 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_27 - 713 ABC_tran PF00005.22 137 5.1e-07 23.7 0.5 1 2 0.0017 0.056 7.3 1.2 19 37 29 47 16 175 0.65 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_27 - 713 ABC_tran PF00005.22 137 5.1e-07 23.7 0.5 2 2 7.7e-05 0.0025 11.7 0.0 87 136 398 452 283 453 0.74 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_22 - 742 ABC_tran PF00005.22 137 3.2e-05 17.8 0.0 1 1 3.8e-06 0.00012 16.0 0.0 5 36 40 71 37 88 0.89 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 8_1 - 113 HTH_22 PF13309.1 64 0.00014 15.2 0.5 1 1 1e-05 0.00085 12.7 0.2 32 63 80 106 70 107 0.76 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 5_13 - 119 HTH_22 PF13309.1 64 0.0011 12.4 0.0 1 1 4.1e-05 0.0033 10.8 0.0 28 64 8 39 1 39 0.80 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 4_14 - 262 DUF815 PF05673.8 250 0.00037 13.1 0.0 1 1 3.6e-06 0.0006 12.4 0.0 23 76 65 122 46 139 0.79 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_3 - 372 Glyco_tran_28_C PF04101.11 167 0.0001 15.6 0.0 1 1 1e-06 0.00017 14.9 0.0 52 137 254 333 242 362 0.78 # 2311 # 3426 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 4_15 - 505 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00096 12.3 0.0 1 1 1.6e-05 0.0026 10.9 0.0 18 35 16 33 13 36 0.94 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 7_6 - 302 rve_3 PF13683.1 67 2e-19 62.5 0.1 1 1 1.7e-20 7e-19 60.8 0.0 2 67 216 281 215 281 0.98 # 4714 # 5619 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.550 1_2 - 187 rve_3 PF13683.1 67 5.1e-16 51.6 0.0 1 1 2e-17 8.2e-16 51.0 0.0 2 67 77 145 76 145 0.97 # 514 # 1074 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 5_3 - 296 rve_3 PF13683.1 67 1.2e-13 44.0 0.1 1 1 7.1e-15 2.9e-13 42.8 0.0 6 67 216 277 211 277 0.93 # 545 # 1432 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 7_4 - 104 rve_3 PF13683.1 67 6.9e-06 19.2 0.0 1 1 2.4e-07 9.9e-06 18.7 0.0 2 34 29 61 28 96 0.90 # 1848 # 2159 # -1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.449 5_13 - 119 HTH_DeoR PF08220.7 57 0.00082 12.6 0.0 1 1 7.8e-06 0.0013 11.9 0.0 5 36 9 39 7 50 0.80 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_4 - 1220 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 7.9e-07 22.3 0.2 1 2 6.6e-06 0.00054 13.1 0.0 27 58 357 388 344 390 0.84 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 7.9e-07 22.3 0.2 2 2 0.00091 0.075 6.1 0.0 29 56 981 1008 962 1020 0.78 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_30 - 519 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00038 13.6 0.0 1 1 1e-05 0.00084 12.4 0.0 36 58 34 56 15 63 0.82 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 4_15 - 505 HTH_40 PF14493.1 91 9.8e-05 16.2 0.0 1 1 8.5e-06 0.00069 13.5 0.0 10 36 12 38 6 51 0.90 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 8_1 - 113 HTH_40 PF14493.1 91 0.00034 14.5 0.6 1 2 0.099 8.1 0.4 0.0 49 74 40 66 30 77 0.69 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 8_1 - 113 HTH_40 PF14493.1 91 0.00034 14.5 0.6 2 2 1.8e-05 0.0015 12.4 0.1 7 33 79 105 73 110 0.89 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 1_3 - 372 DUF1205 PF06722.7 97 1.4e-31 102.2 0.1 1 1 2.3e-33 3.9e-31 100.8 0.1 1 97 165 260 165 260 0.96 # 2311 # 3426 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_7 - 86 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.00025 14.6 0.3 1 1 1.8e-06 0.00029 14.4 0.3 112 155 40 83 30 85 0.85 # 4345 # 4602 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 5_13 - 119 HTH_38 PF13936.1 44 4.2e-08 26.3 0.1 1 1 1.9e-09 1e-07 25.1 0.1 5 42 2 39 2 39 0.94 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 8_1 - 113 HTH_38 PF13936.1 44 1.8e-06 21.0 1.4 1 1 7.3e-08 4e-06 20.0 0.0 9 41 74 106 72 109 0.93 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 4_15 - 505 HTH_38 PF13936.1 44 2.9e-05 17.2 0.2 1 1 1.2e-06 6.4e-05 16.1 0.2 13 41 7 36 5 38 0.87 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 6_10 - 565 FAD_oxidored PF12831.2 428 4.8e-06 19.4 3.6 1 1 2.9e-08 4.8e-06 19.4 3.6 2 41 100 138 99 167 0.83 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_4 - 1220 MobB PF03205.9 140 5.9e-08 26.1 0.3 1 2 3.4e-05 0.0019 11.5 0.0 2 22 370 390 369 396 0.90 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 MobB PF03205.9 140 5.9e-08 26.1 0.3 2 2 2.3e-05 0.0012 12.1 0.1 1 21 991 1011 991 1015 0.91 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 7_5 - 398 MobB PF03205.9 140 3.1e-05 17.3 0.0 1 1 8.6e-07 4.7e-05 16.7 0.0 2 49 6 50 5 127 0.79 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_17 - 718 MobB PF03205.9 140 0.0015 11.8 0.0 1 1 7.7e-05 0.0042 10.4 0.0 7 34 192 219 188 225 0.89 # 14398 # 16551 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_33 - 108 HTH_34 PF13601.1 80 0.00042 14.0 0.0 1 1 4.1e-06 0.00068 13.3 0.0 2 47 18 65 17 72 0.89 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_33 - 108 MarR PF01047.17 59 0.00032 14.0 0.0 1 1 4.7e-06 0.00077 12.8 0.0 16 48 31 63 24 70 0.91 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 5_3 - 296 Sigma54_DBD PF04552.8 160 0.0011 12.1 0.1 1 1 1.1e-05 0.0018 11.4 0.1 100 153 45 96 28 103 0.78 # 545 # 1432 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_3 - 426 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 3.6e-18 59.9 0.0 1 2 4e-16 3.2e-14 47.0 0.0 78 200 93 218 64 221 0.87 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_3 - 426 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 3.6e-18 59.9 0.0 2 2 4.4e-05 0.0036 10.9 0.0 48 172 234 375 225 381 0.65 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 6_10 - 565 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 2.1e-17 57.4 0.1 1 2 8.9e-14 7.3e-12 39.3 0.1 1 201 101 303 101 305 0.75 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 2.1e-17 57.4 0.1 2 2 1.8e-06 0.00015 15.5 0.0 93 147 320 375 309 430 0.76 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 NAD_binding_7 PF13241.1 103 5.6e-07 23.4 1.2 1 2 5.4e-05 0.0089 9.9 0.2 9 38 99 128 96 184 0.89 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 NAD_binding_7 PF13241.1 103 5.6e-07 23.4 1.2 2 2 1.4e-05 0.0023 11.8 0.1 8 41 270 306 264 380 0.74 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_37 - 226 TetR_N PF00440.18 47 5.8e-20 64.4 0.1 1 2 2.1e-20 1.1e-18 60.2 0.0 2 47 19 64 18 64 0.97 # 39224 # 39901 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_37 - 226 TetR_N PF00440.18 47 5.8e-20 64.4 0.1 2 2 0.038 2.1 1.8 0.1 1 16 179 194 179 196 0.91 # 39224 # 39901 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 4_20 - 57 TetR_N PF00440.18 47 8.8e-11 35.0 0.0 1 1 2e-12 1.1e-10 34.6 0.0 1 34 22 55 22 57 0.97 # 14655 # 14825 # 1 # ID=4_20;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.298 4_15 - 505 TetR_N PF00440.18 47 0.0003 14.1 0.0 1 1 1.2e-05 0.00064 13.0 0.0 15 40 14 39 14 40 0.91 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_14 - 1757 AAA_19 PF13245.1 76 1.8e-07 24.5 1.4 1 1 2.7e-08 7.3e-07 22.5 0.3 7 76 981 1047 974 1047 0.74 # 8412 # 13682 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 4_14 - 262 AAA_19 PF13245.1 76 6.1e-07 22.8 0.0 1 1 5.8e-08 1.6e-06 21.4 0.0 11 37 101 126 95 147 0.81 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_30 - 519 AAA_19 PF13245.1 76 2.1e-05 17.9 0.0 1 1 1.7e-06 4.6e-05 16.8 0.0 9 37 35 62 30 74 0.85 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_4 - 1220 AAA_19 PF13245.1 76 0.00025 14.4 12.1 1 2 0.00085 0.023 8.1 0.0 10 41 369 396 363 427 0.73 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_19 PF13245.1 76 0.00025 14.4 12.1 2 2 0.00019 0.0052 10.2 0.1 12 36 992 1017 982 1048 0.77 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_22 - 742 AAA_19 PF13245.1 76 0.00094 12.6 0.0 1 1 8.6e-05 0.0023 11.3 0.0 10 50 46 85 38 86 0.82 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 7_5 - 398 AAA_19 PF13245.1 76 0.0015 12.0 0.0 1 1 0.00011 0.0031 10.9 0.0 11 36 5 30 2 56 0.81 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_42 - 389 CbiA PF01656.18 195 1.6e-36 119.1 0.0 1 1 2.7e-38 2.2e-36 118.7 0.0 2 194 110 339 109 340 0.80 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 7_5 - 398 CbiA PF01656.18 195 0.00025 14.1 0.1 1 1 4.6e-06 0.00038 13.5 0.1 2 109 7 109 6 172 0.78 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 4_14 - 262 KTI12 PF08433.5 270 0.00029 13.7 0.4 1 2 6.4e-05 0.01 8.6 0.0 4 81 102 172 101 174 0.68 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 4_14 - 262 KTI12 PF08433.5 270 0.00029 13.7 0.4 2 2 0.0037 0.6 2.8 0.1 34 59 232 257 212 261 0.77 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 4_15 - 505 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 9e-06 18.8 0.1 1 1 5.2e-07 2.8e-05 17.2 0.0 23 48 12 37 9 38 0.91 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 5_13 - 119 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 6.1e-05 16.1 0.0 1 1 1.9e-06 0.0001 15.4 0.0 31 47 22 38 9 39 0.92 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_27 - 230 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00044 13.3 0.0 1 1 1.6e-05 0.00088 12.4 0.0 26 48 169 191 159 194 0.84 # 24730 # 25419 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 5_11 - 326 Rep_3 PF01051.16 222 2.6e-33 109.0 0.1 1 1 2.2e-35 3.6e-33 108.6 0.1 3 214 10 265 8 271 0.90 # 8547 # 9524 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 5_3 - 296 rve PF00665.21 120 1.3e-26 86.7 0.1 1 1 2.1e-27 4.3e-26 85.0 0.0 2 119 125 239 124 240 0.97 # 545 # 1432 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 6_6 - 560 rve PF00665.21 120 2.9e-26 85.6 0.0 1 1 2.6e-27 5.4e-26 84.7 0.0 2 120 173 313 172 313 0.95 # 4454 # 6133 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 7_6 - 302 rve PF00665.21 120 1.7e-25 83.1 0.1 1 1 1.8e-26 3.8e-25 82.0 0.0 3 119 123 243 121 244 0.97 # 4714 # 5619 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.550 1_2 - 187 rve PF00665.21 120 9e-21 67.8 0.0 1 1 5.8e-22 1.2e-20 67.5 0.0 11 120 1 105 1 105 0.89 # 514 # 1074 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 4_15 - 505 rve PF00665.21 120 2.7e-15 50.2 0.2 1 1 2.5e-16 5.2e-15 49.2 0.2 4 119 127 253 125 254 0.95 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 10_1 - 235 rve PF00665.21 120 5.4e-13 42.7 0.1 1 1 4.9e-13 9.9e-12 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_3 - 289 rve PF00665.21 120 1.6e-12 41.2 0.0 1 1 1.2e-13 2.5e-12 40.6 0.0 3 119 141 265 139 266 0.87 # 795 # 1661 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 7_4 - 104 rve PF00665.21 120 3.3e-08 27.3 0.0 1 1 2.3e-09 4.8e-08 26.8 0.0 77 119 14 56 9 57 0.92 # 1848 # 2159 # -1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.449 4_16 - 243 zf-ribbon_3 PF13248.1 26 0.069 6.1 8.1 1 1 0.00045 0.073 6.0 5.6 3 25 69 96 67 97 0.74 # 11654 # 12382 # -1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 4_14 - 262 MCM PF00493.18 331 0.00033 13.1 0.0 1 2 7.5e-06 0.0012 11.2 0.0 56 120 98 162 82 172 0.81 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 4_14 - 262 MCM PF00493.18 331 0.00033 13.1 0.0 2 2 0.034 5.6 -0.8 0.0 161 211 190 237 186 259 0.71 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_30 - 519 AAA_23 PF13476.1 202 2.3e-12 41.2 1.7 1 1 2e-13 8.3e-12 39.4 1.6 1 190 16 252 16 402 0.71 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_27 - 713 AAA_23 PF13476.1 202 4.1e-08 27.3 0.5 1 1 3.3e-09 1.4e-07 25.7 0.5 2 177 3 268 2 385 0.68 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_4 - 1220 AAA_23 PF13476.1 202 9.6e-06 19.6 0.0 1 2 0.0018 0.073 6.9 0.0 20 36 369 385 347 389 0.79 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_23 PF13476.1 202 9.6e-06 19.6 0.0 2 2 0.00018 0.0072 10.2 0.0 21 65 992 1049 977 1081 0.72 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_13 - 276 AAA_23 PF13476.1 202 1.8e-05 18.7 0.2 1 1 7.6e-07 3.1e-05 17.9 0.2 21 40 35 54 22 64 0.86 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_4 - 1220 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00023 13.9 0.8 1 2 0.007 0.38 3.4 0.1 18 39 370 391 355 414 0.78 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00023 13.9 0.8 2 2 0.0003 0.016 7.8 0.1 18 41 992 1015 986 1026 0.81 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_17 - 718 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0011 11.7 0.0 1 1 0.0001 0.0056 9.4 0.0 21 49 190 219 182 236 0.85 # 14398 # 16551 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 7_5 - 398 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0021 10.7 0.0 1 1 7.2e-05 0.0039 9.9 0.0 17 42 5 32 2 45 0.74 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_14 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 2.2e-44 145.0 14.9 1 2 3.9e-05 0.0011 12.2 4.1 7 147 420 552 416 562 0.82 # 8412 # 13682 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 2_14 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 2.2e-44 145.0 14.9 2 2 2.3e-43 6.2e-42 137.0 1.5 1 186 968 1156 968 1160 0.93 # 8412 # 13682 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_4 - 1220 AAA_30 PF13604.1 196 1.4e-07 24.8 1.0 1 3 0.00034 0.0094 9.1 0.0 18 57 369 407 361 424 0.82 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_30 PF13604.1 196 1.4e-07 24.8 1.0 2 3 0.093 2.5 1.2 0.1 91 131 546 584 454 588 0.71 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_30 PF13604.1 196 1.4e-07 24.8 1.0 3 3 0.00025 0.0069 9.5 0.0 16 42 988 1014 982 1049 0.86 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 4_14 - 262 AAA_30 PF13604.1 196 0.00077 12.7 0.2 1 1 8.3e-05 0.0023 11.1 0.1 16 49 97 131 87 162 0.73 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_30 - 519 AAA_30 PF13604.1 196 0.00077 12.7 0.0 1 1 7.1e-05 0.002 11.3 0.0 12 44 30 62 26 76 0.85 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 2_17 - 718 AAA_30 PF13604.1 196 0.00095 12.4 0.0 1 1 7.6e-05 0.0021 11.3 0.0 21 57 188 224 180 230 0.85 # 14398 # 16551 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 3_13 - 276 AAA_30 PF13604.1 196 0.001 12.3 0.3 1 1 8.8e-05 0.0024 11.0 0.1 15 53 30 68 21 83 0.74 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_4 - 1220 GBP PF02263.14 260 0.0011 11.6 0.0 1 2 0.0013 0.21 4.2 0.0 13 50 360 400 352 437 0.76 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 GBP PF02263.14 260 0.0011 11.6 0.0 2 2 0.00069 0.11 5.0 0.0 9 43 978 1012 974 1038 0.84 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 6_10 - 565 F420_oxidored PF03807.12 96 0.012 9.7 4.1 1 2 0.0023 0.38 4.9 1.2 2 31 100 126 99 131 0.87 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 F420_oxidored PF03807.12 96 0.012 9.7 4.1 2 2 0.0075 1.2 3.3 0.1 1 34 271 300 271 323 0.87 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_30 - 519 SMC_N PF02463.14 220 5.2e-15 48.8 4.4 1 2 1.8e-09 5.8e-08 25.8 0.2 2 45 14 57 13 61 0.92 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 SMC_N PF02463.14 220 5.2e-15 48.8 4.4 2 2 5.8e-09 1.9e-07 24.1 0.2 135 208 176 279 126 289 0.69 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 3_13 - 276 SMC_N PF02463.14 220 3.7e-08 26.4 0.2 1 1 2.8e-09 9.2e-08 25.1 0.2 25 198 34 201 22 218 0.75 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_4 - 1220 SMC_N PF02463.14 220 1e-07 25.0 2.5 1 4 0.0093 0.3 3.8 0.1 26 41 370 385 359 392 0.85 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 SMC_N PF02463.14 220 1e-07 25.0 2.5 2 4 0.00071 0.023 7.5 0.0 136 211 482 554 407 561 0.81 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 SMC_N PF02463.14 220 1e-07 25.0 2.5 3 4 0.014 0.47 3.2 0.0 26 43 992 1009 980 1020 0.84 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 SMC_N PF02463.14 220 1e-07 25.0 2.5 4 4 0.001 0.034 6.9 0.0 137 207 1101 1169 1037 1176 0.81 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_10 - 47 SMC_N PF02463.14 220 0.00032 13.6 0.3 1 1 1e-05 0.00034 13.5 0.3 164 211 1 46 1 46 0.93 # 14705 # 14845 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 1_27 - 713 SMC_N PF02463.14 220 0.00036 13.4 0.0 1 2 0.0024 0.08 5.7 0.0 5 45 3 42 1 50 0.78 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_27 - 713 SMC_N PF02463.14 220 0.00036 13.4 0.0 2 2 0.0026 0.084 5.6 0.0 135 186 243 470 100 500 0.73 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 7_7 - 113 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 9e-20 64.1 0.3 1 1 2.3e-21 1.2e-19 63.6 0.3 2 74 8 87 7 89 0.89 # 5612 # 5950 # -1 # ID=7_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 5_4 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.3e-13 42.4 1.0 1 1 3.9e-14 2.1e-12 40.5 1.0 1 74 1 87 1 88 0.85 # 1432 # 1758 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 10_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00041 13.9 0.3 1 1 1.6e-05 0.00088 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_27 - 230 GerE PF00196.14 58 2.2e-05 17.3 0.1 1 1 1.1e-06 5.8e-05 16.0 0.0 14 57 165 208 160 209 0.90 # 24730 # 25419 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 5_13 - 119 GerE PF00196.14 58 0.00016 14.6 0.0 1 1 5.3e-06 0.00029 13.8 0.0 17 40 16 39 9 40 0.83 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 8_1 - 113 GerE PF00196.14 58 0.00068 12.6 0.1 1 1 2.4e-05 0.0013 11.7 0.1 11 35 78 102 76 105 0.93 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 2_17 - 718 TraG-D_C PF12696.2 128 1.2e-20 67.3 0.0 1 1 1.3e-22 2.2e-20 66.4 0.0 1 127 419 541 419 542 0.86 # 14398 # 16551 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 10_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.0011 12.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.0034 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 4_14 - 262 Bac_DnaA PF00308.13 219 2.1e-10 34.2 0.0 1 1 2.1e-12 3.4e-10 33.5 0.0 36 136 101 199 80 221 0.87 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 7_5 - 398 TIGR03263 TIGR03263 180 7e-05 15.8 0.0 1 1 1.2e-06 0.0001 15.3 0.0 2 47 5 50 4 106 0.88 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_4 - 1220 TIGR03263 TIGR03263 180 0.0011 11.9 0.5 1 2 0.0028 0.23 4.3 0.0 4 23 371 390 368 412 0.76 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 TIGR03263 TIGR03263 180 0.0011 11.9 0.5 2 2 0.0018 0.15 5.0 0.1 2 21 991 1010 990 1019 0.86 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_42 - 389 MipZ PF09140.6 261 7.1e-06 18.8 0.4 1 2 3.5e-06 0.00058 12.6 0.0 2 47 108 153 107 157 0.87 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_42 - 389 MipZ PF09140.6 261 7.1e-06 18.8 0.4 2 2 0.0011 0.18 4.4 0.0 88 134 224 270 197 292 0.84 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_9 - 323 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 4.9e-23 75.4 0.7 1 1 4.6e-25 7.5e-23 74.7 0.7 4 207 130 303 127 308 0.86 # 13609 # 14577 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 2_21 - 437 DivIC PF04977.10 80 0.0099 9.0 8.4 1 1 1.6e-05 0.0027 10.9 4.6 17 66 76 124 72 125 0.92 # 20899 # 22209 # -1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_30 - 519 AAA_21 PF13304.1 303 6e-24 79.0 10.5 1 1 3e-24 1.2e-22 74.7 7.3 1 297 38 268 38 272 0.66 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 3_13 - 276 AAA_21 PF13304.1 303 1.2e-17 58.4 0.0 1 2 5.1e-09 2.1e-07 24.7 0.0 1 25 35 63 35 100 0.77 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 3_13 - 276 AAA_21 PF13304.1 303 1.2e-17 58.4 0.0 2 2 3.4e-11 1.4e-09 31.9 0.0 232 298 138 201 107 203 0.84 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_4 - 1220 AAA_21 PF13304.1 303 6.2e-12 39.6 0.1 1 3 6.3e-06 0.00026 14.6 0.1 3 41 372 410 370 508 0.72 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_21 PF13304.1 303 6.2e-12 39.6 0.1 2 3 2.4e-06 0.0001 16.0 0.0 3 25 994 1022 992 1076 0.77 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_21 PF13304.1 303 6.2e-12 39.6 0.1 3 3 0.095 3.9 0.9 0.0 236 282 1100 1143 1091 1158 0.82 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_27 - 713 AAA_21 PF13304.1 303 2.8e-08 27.6 0.2 1 2 2.8e-05 0.0012 12.5 0.0 7 69 29 104 27 211 0.64 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_27 - 713 AAA_21 PF13304.1 303 2.8e-08 27.6 0.2 2 2 2.6e-05 0.0011 12.6 0.1 219 298 386 487 302 489 0.75 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 4_14 - 262 AAA PF00004.24 132 1.7e-07 25.1 0.0 1 1 5.3e-09 2.9e-07 24.4 0.0 1 111 102 202 102 230 0.70 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_30 - 519 AAA PF00004.24 132 1.8e-07 25.0 0.2 1 2 0.0004 0.022 8.6 0.0 3 21 41 59 39 104 0.80 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 AAA PF00004.24 132 1.8e-07 25.0 0.2 2 2 1.1e-05 0.00062 13.6 0.2 39 114 208 274 174 288 0.80 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_4 - 1220 AAA PF00004.24 132 9e-05 16.3 0.2 1 2 0.096 5.2 0.9 0.0 2 20 372 390 371 431 0.83 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA PF00004.24 132 9e-05 16.3 0.2 2 2 0.00032 0.018 8.9 0.2 3 98 995 1152 993 1173 0.65 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_25 - 122 CTP_transf_2 PF01467.21 157 0.0013 12.4 0.0 1 1 8.5e-06 0.0014 12.3 0.0 32 67 7 41 2 98 0.65 # 23838 # 24203 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_33 - 108 Rrf2 PF02082.15 83 0.00065 13.4 0.0 1 1 1.9e-05 0.0031 11.3 0.0 17 58 25 65 18 67 0.87 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_36 - 400 TIGR01394 TIGR01394 594 0.0025 9.3 0.0 1 1 2.2e-05 0.0036 8.8 0.0 408 486 267 343 261 354 0.84 # 37946 # 39145 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 5_3 - 296 rve_2 PF13333.1 52 3.4e-08 27.1 0.0 1 1 8.4e-10 6.9e-08 26.1 0.0 1 44 230 276 230 283 0.88 # 545 # 1432 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_2 - 187 rve_2 PF13333.1 52 4.8e-07 23.4 0.1 1 1 9.3e-09 7.6e-07 22.8 0.1 17 47 114 148 95 152 0.84 # 514 # 1074 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 6_14 - 145 MerR_1 PF13411.1 69 1.5e-19 63.2 0.0 1 1 7.5e-21 2.4e-19 62.5 0.0 2 67 9 75 8 77 0.96 # 10440 # 10874 # 1 # ID=6_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.595 6_9 - 121 MerR_1 PF13411.1 69 8.9e-14 44.7 0.0 1 1 4.4e-15 1.4e-13 44.0 0.0 1 68 4 72 4 73 0.97 # 7145 # 7507 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_1 - 97 MerR_1 PF13411.1 69 0.00012 15.4 0.3 1 2 0.014 0.47 3.9 0.0 7 24 2 19 1 20 0.86 # 42 # 332 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_1 - 97 MerR_1 PF13411.1 69 0.00012 15.4 0.3 2 2 0.00025 0.0082 9.6 0.2 3 23 20 40 18 79 0.77 # 42 # 332 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 4_15 - 505 MerR_1 PF13411.1 69 0.00017 15.0 0.0 1 1 1.4e-05 0.00045 13.6 0.0 2 30 17 45 16 51 0.90 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_42 - 389 MerR_1 PF13411.1 69 0.00059 13.2 0.0 1 1 5.3e-05 0.0017 11.7 0.0 2 44 41 88 40 105 0.75 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 7_5 - 398 cobW PF02492.14 178 2.2e-26 85.9 0.1 1 1 5.7e-28 3.1e-26 85.5 0.1 2 177 6 204 5 205 0.88 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_22 - 742 cobW PF02492.14 178 0.00075 12.6 0.1 1 1 2.3e-05 0.0013 11.8 0.1 2 23 48 71 47 82 0.78 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_4 - 1220 cobW PF02492.14 178 0.0016 11.5 0.9 1 2 0.0036 0.2 4.7 0.0 3 20 371 388 369 398 0.85 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 cobW PF02492.14 178 0.0016 11.5 0.9 2 2 0.0036 0.2 4.7 0.1 2 20 992 1010 991 1028 0.85 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_16 PF13191.1 185 4.4e-09 30.2 8.8 1 2 1.1e-07 2.5e-06 21.2 0.2 19 160 363 510 355 553 0.53 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_16 PF13191.1 185 4.4e-09 30.2 8.8 2 2 7e-05 0.0016 12.0 0.9 20 179 986 1152 977 1158 0.51 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_17 - 718 AAA_16 PF13191.1 185 7.8e-06 19.6 0.0 1 1 1.4e-06 3.2e-05 17.6 0.0 21 60 182 222 179 263 0.81 # 14398 # 16551 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_22 - 742 AAA_16 PF13191.1 185 3.3e-05 17.5 3.0 1 1 1e-05 0.00024 14.7 1.1 24 175 46 225 36 233 0.49 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 4_14 - 262 AAA_16 PF13191.1 185 0.00023 14.7 0.1 1 1 2.4e-05 0.00056 13.5 0.1 23 51 98 126 84 166 0.79 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 6_5 - 556 AAA_16 PF13191.1 185 0.00025 14.7 0.1 1 1 5.5e-05 0.0013 12.3 0.0 8 104 45 146 43 206 0.74 # 2784 # 4451 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 3_13 - 276 AAA_16 PF13191.1 185 0.00036 14.1 0.2 1 1 3.7e-05 0.00087 12.9 0.0 12 63 23 74 16 92 0.72 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_30 - 519 AAA_16 PF13191.1 185 0.0004 14.0 0.0 1 1 0.00028 0.0065 10.0 0.0 27 46 39 58 34 67 0.87 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 6_5 - 556 AAA_22 PF13401.1 131 5.1e-10 33.2 0.0 1 1 1.6e-10 4.3e-09 30.2 0.0 7 96 64 154 59 156 0.96 # 2784 # 4451 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 1_4 - 1220 AAA_22 PF13401.1 131 1.8e-09 31.5 0.8 1 2 2.2e-05 0.00059 13.6 0.0 7 62 371 422 365 509 0.82 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_22 PF13401.1 131 1.8e-09 31.5 0.8 2 2 2.1e-05 0.00058 13.6 0.2 6 109 992 1144 986 1163 0.65 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_30 - 519 AAA_22 PF13401.1 131 7.8e-07 22.9 0.0 1 2 0.00051 0.014 9.2 0.0 6 27 38 59 34 90 0.84 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 AAA_22 PF13401.1 131 7.8e-07 22.9 0.0 2 2 0.00014 0.0038 11.0 0.1 69 121 209 265 164 274 0.75 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 4_14 - 262 AAA_22 PF13401.1 131 4.5e-06 20.5 0.1 1 2 1.7e-05 0.00045 14.0 0.2 2 28 97 123 96 159 0.74 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 4_14 - 262 AAA_22 PF13401.1 131 4.5e-06 20.5 0.1 2 2 0.012 0.34 4.7 0.0 87 117 151 196 132 204 0.62 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 4_16 - 243 AAA_22 PF13401.1 131 1.3e-05 18.9 0.0 1 1 8.5e-07 2.3e-05 18.2 0.0 88 127 99 147 84 151 0.83 # 11654 # 12382 # -1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 7_5 - 398 AAA_22 PF13401.1 131 0.00013 15.7 0.0 1 1 1e-05 0.00028 14.7 0.0 3 52 3 77 1 160 0.74 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 6_9 - 121 DUF977 PF06163.6 127 0.00049 13.5 0.1 1 1 5.9e-06 0.00096 12.5 0.0 27 70 4 47 2 65 0.90 # 7145 # 7507 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 4_14 - 262 TIGR00362 TIGR00362 437 7.4e-13 41.5 0.0 1 1 7.2e-15 1.2e-12 40.9 0.0 138 240 100 200 77 220 0.90 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 2_42 - 389 HTH_AraC PF00165.18 42 0.0015 12.1 0.0 1 1 1.8e-05 0.0029 11.1 0.0 4 26 35 57 33 62 0.81 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_4 - 1220 AAA_29 PF13555.1 62 5.7e-11 35.5 1.0 1 2 8.5e-07 3.5e-05 16.9 0.2 18 40 364 385 356 389 0.83 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_29 PF13555.1 62 5.7e-11 35.5 1.0 2 2 1.4e-06 5.6e-05 16.3 0.1 17 50 985 1017 979 1023 0.76 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_30 - 519 AAA_29 PF13555.1 62 2.3e-10 33.6 0.1 1 2 2.7e-10 1.1e-08 28.1 0.0 15 51 29 64 14 67 0.82 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 AAA_29 PF13555.1 62 2.3e-10 33.6 0.1 2 2 0.026 1.1 2.5 0.1 25 41 356 372 343 375 0.83 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 3_13 - 276 AAA_29 PF13555.1 62 1.2e-06 21.6 0.2 1 1 6.9e-08 2.8e-06 20.4 0.2 18 44 29 54 14 63 0.83 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_14 - 262 AAA_29 PF13555.1 62 2.2e-05 17.5 0.0 1 1 1.1e-06 4.6e-05 16.5 0.0 5 47 80 125 78 136 0.83 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 6_10 - 565 Pyr_redox PF00070.22 80 5.9e-20 65.1 6.0 1 2 1.4e-06 0.00023 15.2 1.5 1 31 99 129 99 131 0.96 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 Pyr_redox PF00070.22 80 5.9e-20 65.1 6.0 2 2 6.2e-18 1e-15 51.6 0.2 1 74 271 345 271 354 0.90 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_3 - 289 HTH_1 PF00126.22 60 0.0012 12.2 0.0 1 1 2e-05 0.0032 10.9 0.0 2 38 15 52 14 55 0.85 # 795 # 1661 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_1 - 97 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 0.00069 13.6 0.1 1 1 5e-06 0.00082 13.4 0.1 24 66 16 58 10 78 0.82 # 42 # 332 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 2_20 - 941 Orn_Arg_deC_N PF02784.11 251 0.004 9.9 2.8 1 1 1.3e-05 0.0022 10.8 0.1 171 211 610 649 599 679 0.80 # 18080 # 20902 # -1 # ID=2_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 5_13 - 119 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 0.00036 13.8 0.0 1 1 7.2e-06 0.00059 13.1 0.0 12 44 9 41 2 43 0.92 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 4_15 - 505 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 0.001 12.3 0.1 1 1 3.3e-05 0.0027 11.0 0.1 20 42 15 37 11 41 0.91 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_30 - 519 MutS_V PF00488.16 235 2.6e-05 17.3 1.1 1 2 3.2e-05 0.0052 9.8 0.1 37 67 32 60 6 63 0.78 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 MutS_V PF00488.16 235 2.6e-05 17.3 1.1 2 2 0.00069 0.11 5.4 0.1 117 177 222 281 209 301 0.73 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 8_1 - 113 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 7.3e-05 16.1 0.0 1 1 1.5e-06 0.00012 15.3 0.0 8 44 75 111 70 112 0.91 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 1_1 - 97 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00017 14.9 0.0 1 1 2.2e-06 0.00018 14.8 0.0 5 39 5 38 1 71 0.89 # 42 # 332 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 7_5 - 398 SRP54 PF00448.17 196 0.00022 14.3 0.1 1 1 3.8e-06 0.00063 12.8 0.1 2 40 5 43 4 130 0.78 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_4 - 1220 AAA_28 PF13521.1 163 1.2e-05 19.0 0.0 1 2 0.00011 0.0088 9.6 0.0 2 21 371 390 370 413 0.88 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_28 PF13521.1 163 1.2e-05 19.0 0.0 2 2 0.001 0.085 6.4 0.0 2 35 993 1028 992 1066 0.78 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 4_14 - 262 AAA_28 PF13521.1 163 1.5e-05 18.6 1.1 1 1 9.1e-07 7.5e-05 16.3 0.8 1 24 101 124 101 239 0.90 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 6_10 - 565 HI0933_like PF03486.9 409 3.6e-08 25.8 3.7 1 2 1.2e-06 0.0002 13.5 2.5 2 33 99 130 98 138 0.91 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 HI0933_like PF03486.9 409 3.6e-08 25.8 3.7 2 2 7.2e-06 0.0012 10.9 0.0 82 164 284 366 276 385 0.83 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_21 - 437 Mnd1 PF03962.10 188 0.035 7.3 6.1 1 2 9.1e-05 0.015 8.5 1.8 67 122 67 123 59 130 0.59 # 20899 # 22209 # -1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 2_21 - 437 Mnd1 PF03962.10 188 0.035 7.3 6.1 2 2 0.029 4.8 0.4 0.1 118 160 356 398 348 422 0.65 # 20899 # 22209 # -1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 5_7 - 370 adh_short PF00106.20 167 0.0011 12.5 0.1 1 1 2.4e-05 0.004 10.7 0.1 3 49 4 48 2 175 0.83 # 4759 # 5868 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 7_3 - 289 HTH_32 PF13565.1 77 1.5e-08 29.0 0.1 1 1 8.7e-10 4.8e-08 27.4 0.1 3 77 45 117 43 117 0.83 # 795 # 1661 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 10_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 2.1e-06 22.1 0.2 1 1 1.7e-07 9.2e-06 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_1 - 97 HTH_32 PF13565.1 77 0.00011 16.6 1.3 1 1 3.1e-06 0.00017 16.0 1.2 2 58 34 91 33 93 0.73 # 42 # 332 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_33 - 108 GntR PF00392.16 64 0.00074 12.6 0.2 1 1 9.5e-06 0.0016 11.6 0.0 22 62 31 70 21 72 0.88 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 5_7 - 370 Epimerase PF01370.16 236 2.9e-12 40.1 0.0 1 1 2.7e-14 4.5e-12 39.5 0.0 2 174 5 195 4 255 0.70 # 4759 # 5868 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 7_3 - 289 HTH_23 PF13384.1 50 3.3e-11 36.2 0.0 1 1 6.2e-12 9.2e-11 34.8 0.0 3 47 12 57 10 59 0.94 # 795 # 1661 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_1 - 97 HTH_23 PF13384.1 50 1.7e-09 30.7 0.0 1 1 2.1e-10 3.1e-09 29.9 0.0 5 50 6 50 3 50 0.93 # 42 # 332 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 5_13 - 119 HTH_23 PF13384.1 50 1e-07 25.1 0.1 1 1 1.3e-08 1.9e-07 24.2 0.1 9 39 9 39 8 40 0.92 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 4_15 - 505 HTH_23 PF13384.1 50 6.2e-07 22.6 0.5 1 1 1.3e-07 2e-06 21.0 0.5 14 39 12 37 2 39 0.87 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 6_6 - 560 HTH_23 PF13384.1 50 6.6e-07 22.5 0.9 1 1 1.7e-07 2.6e-06 20.6 0.9 3 45 23 71 21 76 0.87 # 4454 # 6133 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 7_7 - 113 HTH_23 PF13384.1 50 3.2e-06 20.3 0.0 1 1 4e-07 5.9e-06 19.5 0.0 3 48 14 60 12 62 0.90 # 5612 # 5950 # -1 # ID=7_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 10_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 9.9e-06 18.8 0.7 1 1 2e-05 0.00031 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 8_1 - 113 HTH_23 PF13384.1 50 1.5e-05 18.2 2.0 1 1 1.7e-06 2.6e-05 17.4 0.2 5 39 73 107 69 111 0.87 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 5_4 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 7.4e-05 16.0 1.1 1 1 2.8e-05 0.00042 13.6 0.3 5 42 10 55 8 66 0.84 # 1432 # 1758 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_18 - 264 HTH_23 PF13384.1 50 0.00047 13.4 0.1 1 1 7.7e-05 0.0012 12.2 0.1 24 43 161 180 161 188 0.79 # 18810 # 19601 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_37 - 226 HTH_23 PF13384.1 50 0.0015 11.9 0.2 1 1 0.00053 0.0079 9.5 0.0 10 35 22 51 14 64 0.75 # 39224 # 39901 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 8_1 - 113 HTH_7 PF02796.10 45 1.3e-13 44.2 0.6 1 1 7.9e-15 3.2e-13 43.0 0.1 1 44 68 108 68 109 0.97 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 5_13 - 119 HTH_7 PF02796.10 45 2.6e-06 20.9 0.2 1 1 1.2e-07 5e-06 20.0 0.2 7 42 3 38 1 40 0.91 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 4_15 - 505 HTH_7 PF02796.10 45 7.9e-06 19.3 0.1 1 1 4.6e-07 1.9e-05 18.1 0.1 20 43 14 37 12 39 0.92 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_27 - 230 HTH_7 PF02796.10 45 1e-05 19.0 0.1 1 1 6e-07 2.5e-05 17.7 0.1 11 37 159 185 128 188 0.87 # 24730 # 25419 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 4_16 - 243 Ribosomal_S27e PF01667.12 55 0.00018 14.7 2.3 1 1 1.9e-06 0.00031 13.9 2.3 5 33 66 94 63 100 0.90 # 11654 # 12382 # -1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 1_4 - 1220 NB-ARC PF00931.17 287 1.2e-05 17.8 0.2 1 2 0.0025 0.2 4.0 0.0 21 36 370 385 358 408 0.91 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 NB-ARC PF00931.17 287 1.2e-05 17.8 0.2 2 2 1.6e-05 0.0013 11.2 0.1 8 39 979 1010 974 1012 0.86 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_22 - 742 NB-ARC PF00931.17 287 0.0022 10.4 0.9 1 1 0.00013 0.011 8.2 0.9 17 110 44 205 30 219 0.72 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 4_14 - 262 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00083 12.1 0.0 1 1 1.1e-05 0.0018 11.1 0.0 23 43 100 120 96 153 0.86 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 5_7 - 370 NAD_binding_10 PF13460.1 183 2.3e-06 21.3 0.0 1 1 1.6e-06 0.00027 14.6 0.0 2 148 5 193 4 204 0.70 # 4759 # 5868 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 7_3 - 289 HTH_29 PF13551.1 112 1.9e-14 47.4 0.4 1 1 1.3e-15 3.1e-14 46.7 0.4 1 112 16 121 16 121 0.87 # 795 # 1661 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_1 - 97 HTH_29 PF13551.1 112 2.4e-06 21.3 0.0 1 1 1.2e-07 2.9e-06 21.1 0.0 10 78 16 84 8 91 0.83 # 42 # 332 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 6_6 - 560 HTH_29 PF13551.1 112 5.6e-06 20.1 0.3 1 1 2.4e-07 5.6e-06 20.1 0.3 13 77 39 109 27 132 0.79 # 4454 # 6133 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 8_1 - 113 HTH_29 PF13551.1 112 6e-05 16.8 0.9 1 2 0.071 1.7 2.5 0.3 23 54 40 70 16 80 0.67 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 8_1 - 113 HTH_29 PF13551.1 112 6e-05 16.8 0.9 2 2 3e-05 0.0007 13.4 0.0 4 35 78 108 75 111 0.90 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 7_7 - 113 HTH_29 PF13551.1 112 0.00011 15.9 0.1 1 1 7e-06 0.00017 15.4 0.1 11 69 29 86 18 107 0.72 # 5612 # 5950 # -1 # ID=7_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 5_13 - 119 HTH_29 PF13551.1 112 0.00017 15.4 0.0 1 1 1.2e-05 0.00028 14.6 0.0 8 34 14 39 8 51 0.84 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 4_15 - 505 HTH_29 PF13551.1 112 0.00054 13.7 0.0 1 1 6.4e-05 0.0015 12.3 0.0 9 34 13 37 9 66 0.92 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_3 - 372 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 4.9e-05 17.1 0.1 1 1 1.4e-06 0.00011 15.9 0.1 7 119 17 147 16 209 0.66 # 2311 # 3426 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 6_10 - 565 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 0.00032 14.5 1.7 1 1 8.5e-06 0.00069 13.4 0.1 2 26 276 306 276 340 0.70 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_3 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 5.7e-09 29.5 0.0 1 3 1.2e-07 9.5e-06 19.1 0.0 3 155 10 151 7 152 0.68 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_3 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 5.7e-09 29.5 0.0 2 3 0.04 3.3 1.1 0.0 2 31 186 214 185 229 0.79 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_3 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 5.7e-09 29.5 0.0 3 3 0.0017 0.14 5.5 0.0 116 155 287 332 254 333 0.73 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 6_10 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 4.7e-05 16.8 2.8 1 3 0.016 1.3 2.3 0.1 1 41 101 135 101 162 0.81 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 4.7e-05 16.8 2.8 2 3 0.067 5.5 0.3 0.0 134 155 218 241 202 242 0.72 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 4.7e-05 16.8 2.8 3 3 1.3e-05 0.0011 12.4 0.1 112 155 321 366 311 367 0.85 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 GIDA PF01134.17 392 4.2e-08 26.0 6.6 1 3 3.5e-10 5.7e-08 25.5 3.3 2 187 100 279 99 302 0.72 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 GIDA PF01134.17 392 4.2e-08 26.0 6.6 2 3 0.038 6.2 -0.9 0.0 3 31 273 301 271 315 0.84 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 GIDA PF01134.17 392 4.2e-08 26.0 6.6 3 3 0.018 3 0.1 0.1 349 385 393 429 387 433 0.77 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_3 - 372 UDPGT PF00201.13 500 6.5e-09 28.4 0.0 1 1 6.1e-11 1e-08 27.7 0.0 279 396 209 328 196 343 0.78 # 2311 # 3426 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 6_10 - 565 NAD_binding_8 PF13450.1 68 5.7e-05 16.7 1.2 1 2 3.5e-07 5.7e-05 16.7 1.2 1 35 102 135 102 155 0.90 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 NAD_binding_8 PF13450.1 68 5.7e-05 16.7 1.2 2 2 0.041 6.7 0.5 0.2 1 25 274 298 274 303 0.81 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_7 - 726 Plug PF07715.10 108 1.4e-32 105.9 0.9 1 1 6.5e-34 5.3e-32 104.0 0.9 8 108 50 164 44 164 0.96 # 9644 # 11821 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 3_2 - 733 Plug PF07715.10 108 7.3e-20 65.0 2.2 1 1 9.6e-22 7.9e-20 64.9 0.6 3 107 44 145 42 146 0.94 # 557 # 2755 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 10_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.8e-12 39.5 0.3 1 1 3e-14 4.9e-12 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_30 - 519 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.9e-07 24.6 0.5 1 2 4.7e-05 0.0019 11.5 0.0 7 41 24 57 19 71 0.87 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.9e-07 24.6 0.5 2 2 8.3e-05 0.0034 10.7 0.3 103 163 212 267 144 284 0.87 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_22 - 742 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00089 12.6 0.1 1 1 0.00024 0.0097 9.2 0.1 20 51 46 80 38 235 0.75 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_4 - 1220 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.001 12.4 0.0 1 2 0.032 1.3 2.2 0.0 22 40 370 388 358 435 0.75 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.001 12.4 0.0 2 2 0.0021 0.085 6.1 0.0 7 41 979 1011 977 1080 0.85 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 7_5 - 398 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0011 12.2 0.0 1 1 4.2e-05 0.0017 11.6 0.0 18 109 2 89 1 96 0.69 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 4_14 - 262 PhoH PF02562.11 205 2.1e-08 27.2 0.1 1 1 2.9e-10 4.8e-08 26.0 0.1 3 61 83 142 81 179 0.77 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_4 - 1220 AAA_5 PF07728.9 139 1.2e-05 18.7 0.0 1 2 0.0001 0.0086 9.4 0.0 3 25 372 395 370 421 0.83 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_5 PF07728.9 139 1.2e-05 18.7 0.0 2 2 0.0031 0.25 4.7 0.0 4 23 995 1014 992 1062 0.85 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 4_14 - 262 AAA_5 PF07728.9 139 0.00031 14.1 0.2 1 1 8.6e-06 0.00071 12.9 0.2 1 19 101 119 101 243 0.78 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 2_17 - 718 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 3.5e-150 493.5 0.0 1 1 5.2e-152 4.3e-150 493.2 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 14398 # 16551 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 7_5 - 398 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.0016 10.7 0.1 1 1 3.3e-05 0.0027 9.9 0.1 16 49 5 40 1 44 0.77 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_42 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 7.2e-08 25.3 0.1 1 2 2.6e-06 0.00043 13.0 0.0 3 37 108 142 106 145 0.93 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_42 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 7.2e-08 25.3 0.1 2 2 1.5e-05 0.0025 10.4 0.0 104 145 227 268 215 340 0.81 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_4 - 1220 AAA_18 PF13238.1 129 2.5e-06 21.4 0.0 1 2 5.8e-05 0.0047 10.8 0.0 1 20 371 390 371 446 0.83 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_18 PF13238.1 129 2.5e-06 21.4 0.0 2 2 0.00041 0.034 8.1 0.0 1 20 993 1012 993 1059 0.80 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 7_5 - 398 AAA_18 PF13238.1 129 1.4e-05 19.0 0.0 1 1 3.3e-07 2.7e-05 18.1 0.0 1 63 7 65 7 141 0.66 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_30 - 519 TIGR00611 TIGR00611 365 0.0013 11.2 1.0 1 1 1.1e-05 0.0019 10.6 0.0 21 45 33 58 13 63 0.73 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 6_5 - 556 AAA_32 PF13654.1 509 0.0016 10.7 0.0 1 1 1.9e-05 0.0031 9.7 0.0 8 81 34 112 26 126 0.86 # 2784 # 4451 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 1_4 - 1220 DUF258 PF03193.11 161 2.2e-11 36.8 0.0 1 2 5.2e-08 4.3e-06 19.6 0.0 22 85 354 418 331 426 0.80 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 DUF258 PF03193.11 161 2.2e-11 36.8 0.0 2 2 1.7e-06 0.00014 14.7 0.0 25 57 979 1012 964 1041 0.81 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_13 - 276 DUF258 PF03193.11 161 0.00039 13.2 0.1 1 1 8.7e-06 0.00071 12.4 0.1 25 67 22 65 2 71 0.79 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 6_5 - 556 TniB PF05621.6 302 2.1e-100 328.9 3.2 1 1 4.2e-102 3.5e-100 328.2 3.2 1 154 1 154 1 163 0.99 # 2784 # 4451 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 4_16 - 243 TniB PF05621.6 302 3.9e-94 308.3 1.6 1 1 7e-96 5.7e-94 307.8 1.6 142 285 97 241 92 242 0.96 # 11654 # 12382 # -1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 4_14 - 262 AAA_3 PF07726.6 131 0.00084 12.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.002 11.4 0.0 2 72 102 171 101 201 0.70 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_4 - 1220 DUF87 PF01935.12 229 2e-05 18.1 3.2 1 2 8.3e-05 0.014 8.8 0.2 26 44 371 389 359 392 0.88 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 DUF87 PF01935.12 229 2e-05 18.1 3.2 2 2 5.3e-05 0.0087 9.4 0.3 26 43 993 1010 990 1023 0.90 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 7_3 - 289 HTH_28 PF13518.1 52 3.1e-12 40.0 0.4 1 1 4.1e-13 8.5e-12 38.5 0.1 2 51 16 66 15 67 0.94 # 795 # 1661 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_1 - 97 HTH_28 PF13518.1 52 3.5e-10 33.4 0.1 1 1 2.5e-11 5.2e-10 32.8 0.1 9 51 14 56 8 62 0.91 # 42 # 332 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 6_6 - 560 HTH_28 PF13518.1 52 1.4e-08 28.3 0.1 1 1 2.8e-09 5.6e-08 26.3 0.1 1 46 26 78 26 87 0.76 # 4454 # 6133 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 7_7 - 113 HTH_28 PF13518.1 52 2.7e-08 27.4 0.3 1 1 2.9e-09 6e-08 26.2 0.0 1 43 17 60 17 63 0.93 # 5612 # 5950 # -1 # ID=7_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_15 - 505 HTH_28 PF13518.1 52 1e-05 19.1 0.4 1 1 1.6e-06 3.2e-05 17.5 0.4 5 34 6 37 3 38 0.82 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 8_1 - 113 HTH_28 PF13518.1 52 8.5e-05 16.2 0.0 1 1 1.5e-05 0.0003 14.4 0.0 8 33 81 106 75 111 0.82 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 10_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 9.5e-05 16.0 1.2 1 1 2e-05 0.00042 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 5_13 - 119 HTH_28 PF13518.1 52 0.00069 13.3 0.1 1 1 7.3e-05 0.0015 12.2 0.1 14 34 19 39 8 40 0.74 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 4_14 - 262 DnaB_C PF03796.10 259 0.00025 13.6 0.0 1 1 2.4e-06 0.0004 12.9 0.0 16 55 96 135 85 158 0.90 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_37 - 226 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.0013 12.1 0.0 1 1 1.2e-05 0.0019 11.6 0.0 22 77 24 73 5 79 0.76 # 39224 # 39901 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 6_14 - 145 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 3.4e-21 69.1 0.6 1 1 9.7e-23 7.9e-21 67.9 0.5 1 65 51 113 51 113 0.95 # 10440 # 10874 # 1 # ID=6_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.595 6_9 - 121 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.0013 12.8 7.4 1 1 2.5e-05 0.0021 12.1 7.4 1 64 47 108 47 109 0.85 # 7145 # 7507 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 4_15 - 505 HTH_24 PF13412.1 48 5.3e-07 22.6 0.1 1 1 4.1e-08 1.7e-06 21.0 0.1 7 39 2 37 1 39 0.90 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_33 - 108 HTH_24 PF13412.1 48 1.5e-05 17.9 0.0 1 1 1.9e-06 7.8e-05 15.7 0.0 16 48 31 63 21 63 0.89 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 7_3 - 289 HTH_24 PF13412.1 48 0.00024 14.1 0.1 1 1 1.3e-05 0.00054 13.0 0.1 9 42 17 52 14 55 0.87 # 795 # 1661 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 5_13 - 119 HTH_24 PF13412.1 48 0.0014 11.7 0.0 1 1 7.1e-05 0.0029 10.6 0.0 21 39 21 39 20 40 0.94 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 4_14 - 262 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00049 13.8 0.1 1 1 7.7e-06 0.0013 12.4 0.0 3 44 79 122 77 151 0.81 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 7_5 - 398 Guanylate_kin PF00625.16 183 0.0019 11.2 0.0 1 1 1.9e-05 0.0032 10.5 0.0 4 48 6 49 3 52 0.84 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 4_15 - 505 HTH_30 PF13556.1 59 0.00027 14.1 0.3 1 1 5.2e-06 0.00085 12.6 0.1 7 34 10 37 8 38 0.90 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_8 - 279 DAHP_synth_1 PF00793.15 272 7.7e-62 202.0 0.0 1 1 5.7e-64 9.4e-62 201.7 0.0 46 271 17 271 5 272 0.92 # 12676 # 13512 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 6_10 - 565 TIGR01292 TIGR01292 300 2.7e-19 62.3 2.9 1 2 7.7e-05 0.0063 8.6 1.1 3 39 100 136 98 142 0.89 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 TIGR01292 TIGR01292 300 2.7e-19 62.3 2.9 2 2 2.1e-18 1.8e-16 53.1 0.0 142 296 270 428 213 430 0.81 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_3 - 426 TIGR01292 TIGR01292 300 0.0014 10.7 0.0 1 2 0.00021 0.017 7.2 0.0 57 111 97 152 91 157 0.80 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_3 - 426 TIGR01292 TIGR01292 300 0.0014 10.7 0.0 2 2 0.026 2.1 0.3 0.0 141 178 181 222 178 232 0.65 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_4 - 1220 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.2e-07 24.0 0.6 1 2 0.00028 0.023 8.3 0.0 2 20 371 389 370 409 0.89 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.2e-07 24.0 0.6 2 2 1.3e-05 0.001 12.6 0.1 2 20 993 1011 992 1158 0.79 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_13 - 276 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00061 13.4 0.5 1 1 1.3e-05 0.0011 12.6 0.5 2 21 36 55 35 200 0.75 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_4 - 1220 Miro PF08477.8 119 1e-07 26.1 0.0 1 2 0.00012 0.02 9.0 0.0 2 21 371 390 370 417 0.84 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 Miro PF08477.8 119 1e-07 26.1 0.0 2 2 8.4e-06 0.0014 12.8 0.0 2 26 993 1020 992 1067 0.75 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_42 - 389 HTH_31 PF13560.1 64 0.00021 15.1 0.4 1 1 7.6e-06 0.00062 13.6 0.2 12 45 37 69 31 73 0.87 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 4_15 - 505 HTH_31 PF13560.1 64 0.00072 13.4 0.2 1 1 2.2e-05 0.0018 12.1 0.2 12 43 13 44 4 54 0.82 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_14 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 5e-07 23.5 0.7 1 2 0.013 2.1 2.2 0.0 6 44 1227 1265 1223 1294 0.75 # 8412 # 13682 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 2_14 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 5e-07 23.5 0.7 2 2 1.1e-07 1.8e-05 18.5 0.1 3 102 1341 1444 1339 1446 0.77 # 8412 # 13682 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 4_15 - 505 HTH_36 PF13730.1 55 1.9e-05 18.4 0.0 1 1 5.8e-07 4.8e-05 17.1 0.0 26 47 16 37 2 38 0.88 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 5_13 - 119 HTH_36 PF13730.1 55 0.00053 13.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.00094 12.9 0.0 28 47 20 39 3 40 0.88 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 7_5 - 398 T2SE PF00437.15 272 0.00027 13.5 0.2 1 1 2.4e-06 0.0004 12.9 0.2 129 173 5 50 1 69 0.80 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 6_6 - 560 HTH_Tnp_Mu_2 PF09039.6 108 1.7e-05 18.2 0.0 1 1 2.8e-07 4.6e-05 16.8 0.0 37 101 100 163 83 166 0.91 # 4454 # 6133 # -1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 1_30 - 519 NACHT PF05729.7 166 5.2e-06 19.8 0.0 1 2 2.7e-05 0.00087 12.6 0.0 3 40 39 77 37 91 0.77 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 NACHT PF05729.7 166 5.2e-06 19.8 0.0 2 2 0.0061 0.2 4.9 0.0 73 112 219 251 177 293 0.74 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_4 - 1220 NACHT PF05729.7 166 5.5e-06 19.7 1.8 1 2 9e-05 0.003 10.8 0.1 2 21 370 389 369 391 0.90 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 NACHT PF05729.7 166 5.5e-06 19.7 1.8 2 2 0.001 0.034 7.4 0.2 2 21 992 1011 991 1014 0.90 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_22 - 742 NACHT PF05729.7 166 1.4e-05 18.4 1.3 1 2 5.9e-05 0.0019 11.4 0.0 2 32 48 78 47 86 0.84 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_22 - 742 NACHT PF05729.7 166 1.4e-05 18.4 1.3 2 2 0.01 0.34 4.2 0.0 48 99 478 541 461 582 0.81 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 7_5 - 398 NACHT PF05729.7 166 4.2e-05 16.8 0.1 1 2 2.4e-05 0.00078 12.7 0.0 2 29 6 33 5 46 0.89 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 7_5 - 398 NACHT PF05729.7 166 4.2e-05 16.8 0.1 2 2 0.074 2.4 1.4 0.0 103 142 154 193 139 207 0.77 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 4_14 - 262 NACHT PF05729.7 166 0.002 11.4 2.1 1 2 0.00029 0.0097 9.2 0.3 3 23 102 122 100 148 0.84 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 4_14 - 262 NACHT PF05729.7 166 0.002 11.4 2.1 2 2 0.058 1.9 1.7 0.1 80 127 156 200 139 221 0.76 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 7_5 - 398 UPF0079 PF02367.12 123 2.4e-06 20.8 0.1 1 1 1.3e-07 7.2e-06 19.3 0.1 13 40 2 29 1 39 0.81 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_4 - 1220 UPF0079 PF02367.12 123 0.00046 13.4 0.2 1 2 0.016 0.9 2.8 0.0 9 36 362 389 356 397 0.84 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 UPF0079 PF02367.12 123 0.00046 13.4 0.2 2 2 0.0004 0.022 8.0 0.1 8 36 983 1011 980 1022 0.85 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_22 - 742 UPF0079 PF02367.12 123 0.00057 13.1 0.0 1 1 2.4e-05 0.0013 12.0 0.0 10 42 41 73 31 81 0.84 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_4 - 1220 AAA_17 PF13207.1 121 1.1e-11 39.2 0.0 1 2 7.5e-07 2.1e-05 19.0 0.0 2 24 371 393 370 469 0.77 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_17 PF13207.1 121 1.1e-11 39.2 0.0 2 2 2e-06 5.4e-05 17.6 0.0 1 25 992 1025 992 1135 0.81 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 4_14 - 262 AAA_17 PF13207.1 121 0.00018 15.9 0.0 1 1 9.4e-06 0.00026 15.4 0.0 2 38 102 133 101 232 0.74 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 2_17 - 718 AAA_17 PF13207.1 121 0.00049 14.6 0.0 1 1 5.8e-05 0.0016 12.9 0.0 3 27 189 217 187 284 0.70 # 14398 # 16551 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_30 - 519 AAA_17 PF13207.1 121 0.0007 14.0 0.0 1 1 0.00011 0.0031 12.0 0.0 3 25 40 66 39 136 0.84 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 7_5 - 398 AAA_17 PF13207.1 121 0.001 13.5 0.3 1 1 0.00012 0.0032 11.9 0.1 1 51 6 62 6 136 0.76 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_22 - 742 AAA_17 PF13207.1 121 0.0017 12.8 0.1 1 1 0.0002 0.0055 11.1 0.1 1 43 48 94 48 284 0.87 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_4 - 1220 TIGR02211 TIGR02211 221 1.2e-56 185.0 0.1 1 3 2.5e-32 1e-30 100.2 0.0 6 219 345 559 341 561 0.83 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 TIGR02211 TIGR02211 221 1.2e-56 185.0 0.1 2 3 0.034 1.4 1.6 0.0 42 89 823 872 819 907 0.79 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 TIGR02211 TIGR02211 221 1.2e-56 185.0 0.1 3 3 6.3e-26 2.6e-24 79.2 0.0 17 220 976 1179 963 1180 0.83 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_13 - 276 TIGR02211 TIGR02211 221 6.8e-25 81.1 0.0 1 1 2.3e-26 9.6e-25 80.6 0.0 19 212 21 212 7 221 0.84 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_30 - 519 TIGR02211 TIGR02211 221 3.8e-07 23.1 1.1 1 2 1.5e-06 6.3e-05 15.8 0.0 21 60 25 65 12 74 0.79 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 TIGR02211 TIGR02211 221 3.8e-07 23.1 1.1 2 2 0.0043 0.17 4.6 0.1 141 213 207 280 186 287 0.80 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_27 - 713 TIGR02211 TIGR02211 221 1.4e-05 18.0 0.0 1 1 7.8e-07 3.2e-05 16.8 0.0 127 203 406 489 393 507 0.77 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 6_10 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 7e-06 18.6 4.7 1 3 4.3e-08 7e-06 18.6 4.7 2 32 100 130 99 137 0.90 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 7e-06 18.6 4.7 2 3 0.034 5.6 -0.8 0.1 143 204 311 369 297 388 0.72 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 7e-06 18.6 4.7 3 3 0.074 12 -1.9 0.0 376 402 388 408 377 424 0.82 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_2 - 236 AAA_25 PF13481.1 194 8.6e-25 80.8 0.0 1 1 3.6e-26 1.2e-24 80.4 0.0 48 193 1 140 1 141 0.86 # 137 # 844 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.679 1_4 - 1220 AAA_25 PF13481.1 194 7.3e-08 25.6 2.8 1 2 1.2e-05 0.00039 13.5 0.9 30 65 365 402 354 535 0.74 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_25 PF13481.1 194 7.3e-08 25.6 2.8 2 2 0.00017 0.0054 9.7 0.0 30 54 987 1011 973 1021 0.89 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 4_14 - 262 AAA_25 PF13481.1 194 0.00018 14.6 0.0 1 1 9e-06 0.00029 13.8 0.0 29 57 95 123 76 170 0.86 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_30 - 519 AAA_25 PF13481.1 194 0.00039 13.4 0.0 1 1 2.7e-05 0.00089 12.3 0.0 30 58 33 61 22 85 0.81 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 3_13 - 276 AAA_25 PF13481.1 194 0.0011 12.0 0.1 1 1 0.00011 0.0036 10.3 0.1 30 57 30 57 23 87 0.85 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_14 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0013 11.9 0.1 1 2 0.00065 0.054 6.6 0.0 1 23 988 1011 988 1158 0.77 # 8412 # 13682 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 2_14 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0013 11.9 0.1 2 2 0.014 1.1 2.2 0.0 172 234 1388 1447 1342 1447 0.63 # 8412 # 13682 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 7_5 - 398 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0015 11.6 0.0 1 1 3.2e-05 0.0026 10.9 0.0 1 23 7 31 7 60 0.80 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_30 - 519 AAA_15 PF13175.1 415 9.2e-15 48.1 18.8 1 2 1.3e-09 1e-07 24.9 0.2 2 47 15 61 14 109 0.84 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 AAA_15 PF13175.1 415 9.2e-15 48.1 18.8 2 2 1e-10 8.3e-09 28.5 10.2 286 411 149 269 136 273 0.72 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 3_13 - 276 AAA_15 PF13175.1 415 3.3e-07 23.2 0.0 1 2 3e-05 0.0024 10.5 0.0 23 42 34 53 19 86 0.82 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 3_13 - 276 AAA_15 PF13175.1 415 3.3e-07 23.2 0.0 2 2 2.4e-05 0.002 10.8 0.0 370 410 160 200 151 202 0.91 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_14 - 262 RuvB_N PF05496.7 234 0.00086 12.0 0.0 1 1 7.1e-06 0.0012 11.5 0.0 48 75 97 124 45 170 0.84 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_30 - 519 AAA_14 PF13173.1 128 8.3e-06 19.3 0.0 1 2 0.00051 0.028 8.0 0.0 5 27 39 61 36 78 0.84 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 AAA_14 PF13173.1 128 8.3e-06 19.3 0.0 2 2 0.00046 0.025 8.1 0.1 50 102 218 273 172 298 0.68 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_4 - 1220 AAA_14 PF13173.1 128 5.6e-05 16.7 0.0 1 2 0.00067 0.037 7.6 0.0 3 36 369 402 367 431 0.73 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_14 PF13173.1 128 5.6e-05 16.7 0.0 2 2 0.0035 0.19 5.2 0.0 2 28 990 1016 989 1055 0.73 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 7_5 - 398 AAA_14 PF13173.1 128 8.1e-05 16.1 0.0 1 1 4e-06 0.00022 14.8 0.0 3 96 5 103 3 122 0.63 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_42 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00011 14.9 0.1 1 2 0.00028 0.046 6.3 0.0 4 42 109 147 107 154 0.91 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_42 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00011 14.9 0.1 2 2 0.0003 0.049 6.2 0.1 84 139 235 290 222 312 0.77 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 7_5 - 398 Mito_fiss_Elm1 PF06258.6 311 0.0012 11.4 0.0 1 1 1.1e-05 0.0018 10.8 0.0 62 151 13 100 9 123 0.89 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 5_7 - 370 3Beta_HSD PF01073.14 280 9.1e-09 27.9 0.0 1 1 8.7e-11 1.4e-08 27.3 0.0 1 158 5 175 5 196 0.75 # 4759 # 5868 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 5_13 - 119 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00021 14.1 0.0 1 1 6.2e-06 0.00051 12.9 0.0 31 49 21 39 20 40 0.90 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 7_7 - 113 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00026 13.8 0.2 1 1 1.2e-05 0.001 11.9 0.1 7 42 8 44 8 46 0.93 # 5612 # 5950 # -1 # ID=7_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 6_14 - 145 MerR PF00376.18 38 1.3e-13 43.9 0.2 1 1 8.9e-15 2.4e-13 43.1 0.2 1 38 9 46 9 46 0.99 # 10440 # 10874 # 1 # ID=6_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.595 2_42 - 389 MerR PF00376.18 38 6.2e-07 22.6 0.0 1 1 5.3e-08 1.4e-06 21.4 0.0 1 28 41 68 41 74 0.95 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 6_9 - 121 MerR PF00376.18 38 2e-06 20.9 0.0 1 1 1.2e-07 3.2e-06 20.3 0.0 1 38 5 42 5 42 0.95 # 7145 # 7507 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 4_15 - 505 MerR PF00376.18 38 0.0002 14.5 0.1 1 1 1.7e-05 0.00048 13.3 0.1 1 28 17 43 17 48 0.85 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_1 - 97 MerR PF00376.18 38 0.00036 13.7 0.1 1 2 0.032 0.87 2.9 0.0 14 23 10 19 2 21 0.88 # 42 # 332 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_1 - 97 MerR PF00376.18 38 0.00036 13.7 0.1 2 2 0.00075 0.02 8.1 0.0 2 19 20 37 19 43 0.89 # 42 # 332 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 5_13 - 119 MerR PF00376.18 38 0.0015 11.8 3.0 1 2 0.00082 0.022 8.0 0.1 4 21 22 39 19 49 0.84 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 5_13 - 119 MerR PF00376.18 38 0.0015 11.8 3.0 2 2 0.016 0.44 3.8 0.7 14 22 90 98 89 110 0.69 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_13 - 276 AAA_33 PF13671.1 143 1.3e-05 18.7 0.1 1 1 1.3e-06 5.5e-05 16.7 0.1 3 33 37 82 35 203 0.61 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_4 - 1220 AAA_33 PF13671.1 143 1.5e-05 18.5 7.1 1 2 0.00011 0.0045 10.5 0.2 2 20 371 389 370 497 0.87 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_33 PF13671.1 143 1.5e-05 18.5 7.1 2 2 9.3e-05 0.0038 10.7 0.1 1 27 992 1015 992 1139 0.78 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 4_14 - 262 AAA_33 PF13671.1 143 0.0006 13.3 0.2 1 1 3.6e-05 0.0015 12.1 0.2 2 36 102 142 102 255 0.67 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 7_5 - 398 AAA_33 PF13671.1 143 0.00081 12.9 0.0 1 1 3.6e-05 0.0015 12.1 0.0 1 26 6 31 6 65 0.80 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 7_7 - 113 CENP-B_N PF04218.8 53 3.3e-07 23.3 0.0 1 1 8e-09 6.6e-07 22.3 0.0 3 45 9 52 8 55 0.89 # 5612 # 5950 # -1 # ID=7_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 8_1 - 113 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00057 12.9 0.1 1 1 5.1e-05 0.0042 10.2 0.1 26 47 89 110 74 111 0.86 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 1_4 - 1220 ABC_ATPase PF09818.4 448 7.7e-08 24.8 2.0 1 4 0.0069 1.1 1.2 0.0 243 265 366 389 360 395 0.81 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 ABC_ATPase PF09818.4 448 7.7e-08 24.8 2.0 2 4 7.2e-06 0.0012 11.1 0.2 290 354 448 514 443 532 0.86 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 ABC_ATPase PF09818.4 448 7.7e-08 24.8 2.0 3 4 3.1e-05 0.005 9.0 0.0 239 265 984 1011 962 1050 0.83 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 ABC_ATPase PF09818.4 448 7.7e-08 24.8 2.0 4 4 0.09 15 -2.4 0.0 331 353 1109 1131 1079 1146 0.73 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 7_5 - 398 ArgK PF03308.11 267 2.2e-06 20.2 0.0 1 1 4.6e-08 3.7e-06 19.4 0.0 30 132 5 105 2 108 0.83 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_4 - 1220 ArgK PF03308.11 267 0.00017 14.0 0.0 1 2 0.0021 0.17 4.1 0.0 16 49 355 388 346 394 0.82 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 ArgK PF03308.11 267 0.00017 14.0 0.0 2 2 0.00024 0.019 7.3 0.0 19 65 980 1028 965 1040 0.71 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_29 - 197 PaaX PF07848.7 70 0.00058 13.5 0.0 1 1 6.7e-06 0.0011 12.6 0.0 15 68 23 80 13 82 0.77 # 29619 # 30209 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_13 - 276 SbcCD_C PF13558.1 90 1.1e-06 22.1 0.0 1 1 9.5e-08 7.8e-06 19.4 0.0 26 89 136 186 119 187 0.79 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_4 - 1220 SbcCD_C PF13558.1 90 0.00081 12.9 1.4 1 2 0.055 4.5 0.9 0.2 27 50 477 493 468 525 0.62 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 SbcCD_C PF13558.1 90 0.00081 12.9 1.4 2 2 0.00013 0.011 9.3 0.1 60 89 1115 1144 1101 1145 0.78 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_17 - 718 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.1e-09 30.9 0.0 1 1 1.9e-11 3.2e-09 29.4 0.0 264 361 382 476 198 500 0.83 # 14398 # 16551 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_4 - 1220 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00034 14.4 0.0 1 2 0.0011 0.19 5.6 0.0 2 20 372 390 371 403 0.89 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00034 14.4 0.0 2 2 0.00083 0.14 6.0 0.0 2 19 994 1011 993 1057 0.75 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_30 - 519 NTPase_1 PF03266.10 168 8.5e-05 15.9 0.3 1 2 0.00084 0.069 6.4 0.0 4 22 41 59 39 72 0.83 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 NTPase_1 PF03266.10 168 8.5e-05 15.9 0.3 2 2 0.00068 0.056 6.7 0.4 86 147 219 282 204 295 0.77 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 7_5 - 398 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00062 13.1 0.0 1 2 0.00014 0.011 9.0 0.0 2 31 7 36 6 64 0.88 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 7_5 - 398 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00062 13.1 0.0 2 2 0.025 2 1.7 0.0 112 151 80 122 77 131 0.82 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 6_10 - 565 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 3.9e-05 16.9 3.1 1 2 0.00051 0.084 6.0 0.8 15 50 92 127 89 130 0.90 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 3.9e-05 16.9 3.1 2 2 2.1e-05 0.0035 10.5 0.1 16 58 265 307 257 339 0.84 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 11_1 - 145 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 4.3e-65 211.3 0.5 1 1 1.9e-66 5.2e-65 211.1 0.5 1 109 37 145 37 145 0.99 # 250 # 684 # 1 # ID=11_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.572 2_43 - 64 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.9e-33 108.9 3.2 1 1 7.6e-35 2.1e-33 108.8 3.2 69 131 1 63 1 63 0.99 # 35833 # 36024 # -1 # ID=2_43;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 5_15 - 64 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.9e-33 108.9 3.2 1 1 7.6e-35 2.1e-33 108.8 3.2 69 131 1 63 1 63 0.99 # 11453 # 11644 # -1 # ID=5_15;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.505 6_15 - 64 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.9e-33 108.9 3.2 1 1 7.6e-35 2.1e-33 108.8 3.2 69 131 1 63 1 63 0.99 # 10981 # 11172 # -1 # ID=6_15;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.505 7_1 - 64 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.9e-33 108.9 3.2 1 1 7.6e-35 2.1e-33 108.8 3.2 69 131 1 63 1 63 0.99 # 3 # 194 # 1 # ID=7_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.490 9_2 - 64 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.9e-33 108.9 3.2 1 1 7.6e-35 2.1e-33 108.8 3.2 69 131 1 63 1 63 0.99 # 788 # 979 # -1 # ID=9_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.505 1_4 - 1220 TIGR03594 TIGR03594 432 0.00011 14.5 0.0 1 2 0.0028 0.46 2.6 0.0 2 17 370 385 349 391 0.75 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 TIGR03594 TIGR03594 432 0.00011 14.5 0.0 2 2 2.5e-05 0.0041 9.4 0.0 173 195 988 1010 935 1013 0.75 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_3 - 372 Glyco_transf_28 PF03033.15 139 9e-08 25.6 0.0 1 1 1.3e-09 2.1e-07 24.4 0.0 12 128 14 129 11 142 0.85 # 2311 # 3426 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_4 - 1220 TIGR03598 TIGR03598 186 4.7e-05 16.4 0.5 1 2 0.003 0.49 3.3 0.1 18 38 368 388 360 392 0.85 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 TIGR03598 TIGR03598 186 4.7e-05 16.4 0.5 2 2 3.1e-05 0.0051 9.8 0.0 16 38 988 1010 978 1013 0.82 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 6_10 - 565 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0052 10.0 6.4 1 2 0.0047 0.78 2.9 2.4 1 30 99 128 99 134 0.93 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0052 10.0 6.4 2 2 9e-05 0.015 8.6 0.1 2 39 272 309 271 348 0.73 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 1e-05 19.0 0.1 1 1 1.3e-07 2.2e-05 17.8 0.1 13 40 276 303 272 356 0.82 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_33 - 108 RP-C PF03428.8 177 4.5e-05 16.6 0.0 1 2 7.1e-07 0.00012 15.2 0.0 76 103 38 64 36 71 0.87 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_33 - 108 RP-C PF03428.8 177 4.5e-05 16.6 0.0 2 2 0.096 16 -1.5 0.0 45 59 76 90 64 99 0.72 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_4 - 1220 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.0014 11.8 2.2 1 3 0.022 3.6 0.6 0.0 212 236 301 325 285 327 0.79 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.0014 11.8 2.2 2 3 0.00096 0.16 5.1 0.1 1 20 373 392 373 399 0.85 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.0014 11.8 2.2 3 3 0.0037 0.61 3.1 0.0 1 17 995 1011 995 1032 0.87 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_3 - 372 Glyco_trans_1_3 PF13528.1 318 0.00034 13.4 0.0 1 2 0.00095 0.16 4.7 0.0 19 118 18 126 15 134 0.68 # 2311 # 3426 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_3 - 372 Glyco_trans_1_3 PF13528.1 318 0.00034 13.4 0.0 2 2 0.00023 0.037 6.7 0.0 248 301 271 322 202 338 0.85 # 2311 # 3426 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 10_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.2e-52 171.2 0.0 1 1 3.2e-54 1.7e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 5_3 - 296 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 9.2e-09 29.0 0.0 1 1 2.6e-10 1.4e-08 28.4 0.0 2 137 130 267 129 269 0.92 # 545 # 1432 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_2 - 187 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 5.8e-05 16.7 0.0 1 1 1.3e-06 7e-05 16.4 0.0 12 139 7 137 1 138 0.85 # 514 # 1074 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 8_1 - 113 HTH_26 PF13443.1 63 0.0012 12.7 0.0 1 1 1.2e-05 0.002 12.0 0.0 6 34 81 109 77 112 0.90 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 1_30 - 519 TIGR00634 TIGR00634 563 0.00064 12.0 0.2 1 2 0.00027 0.045 5.9 0.0 1 43 13 57 13 60 0.88 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 TIGR00634 TIGR00634 563 0.00064 12.0 0.2 2 2 0.001 0.17 4.0 0.0 444 511 211 278 198 311 0.80 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_22 - 742 KAP_NTPase PF07693.9 325 2.3e-72 237.3 0.0 1 1 4.1e-74 3.4e-72 236.7 0.0 1 325 27 334 27 334 0.96 # 22315 # 24540 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 7_5 - 398 KAP_NTPase PF07693.9 325 0.00077 12.1 0.0 1 1 1.3e-05 0.001 11.6 0.0 18 64 2 49 1 91 0.83 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 5_13 - 119 HTH_17 PF12728.2 51 0.00044 14.1 1.4 1 1 6.2e-05 0.0025 11.7 0.0 6 41 22 56 20 65 0.77 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 7_3 - 289 HTH_17 PF12728.2 51 0.00055 13.8 0.2 1 1 0.00017 0.007 10.3 0.0 4 24 30 50 27 70 0.87 # 795 # 1661 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 4_15 - 505 HTH_17 PF12728.2 51 0.00071 13.5 0.0 1 1 7.3e-05 0.003 11.5 0.0 3 25 17 39 17 53 0.90 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 8_1 - 113 HTH_17 PF12728.2 51 0.0015 12.4 1.0 1 2 0.061 2.5 2.1 0.1 25 43 60 78 46 81 0.80 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 8_1 - 113 HTH_17 PF12728.2 51 0.0015 12.4 1.0 2 2 0.00048 0.02 8.8 0.1 6 23 90 107 88 110 0.87 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 5_7 - 370 NAD_binding_4 PF07993.7 249 1.5e-53 174.8 0.0 1 1 1.1e-55 1.9e-53 174.5 0.0 1 248 6 237 6 238 0.94 # 4759 # 5868 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 5_13 - 119 HTH_11 PF08279.7 55 2.8e-05 17.3 0.0 1 1 1e-06 5.7e-05 16.4 0.0 18 37 20 39 5 40 0.80 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_33 - 108 HTH_11 PF08279.7 55 0.00057 13.2 0.1 1 1 3.7e-05 0.002 11.4 0.0 3 43 19 60 17 65 0.88 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 4_15 - 505 HTH_11 PF08279.7 55 0.00078 12.7 0.2 1 1 3.9e-05 0.0022 11.3 0.1 16 37 16 37 11 38 0.89 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_9 - 323 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 2e-47 153.6 0.3 1 1 5.1e-49 8.4e-47 151.6 0.0 1 112 34 145 34 145 0.96 # 13609 # 14577 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 5_13 - 119 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.00039 13.7 0.0 1 1 3.8e-06 0.00062 13.1 0.0 143 174 9 40 2 52 0.86 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_33 - 108 MarR_2 PF12802.2 62 2.4e-07 24.0 0.0 1 1 2.4e-09 4e-07 23.3 0.0 7 55 18 66 9 71 0.85 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_33 - 108 HTH_5 PF01022.15 47 5.7e-10 32.4 1.5 1 2 1.4e-11 2.2e-09 30.5 0.0 1 46 15 63 15 64 0.94 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_33 - 108 HTH_5 PF01022.15 47 5.7e-10 32.4 1.5 2 2 0.038 6.2 0.3 0.4 6 18 78 93 73 95 0.77 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_33 - 108 TrmB PF01978.14 68 1.1e-06 21.9 0.0 1 1 3.6e-08 2e-06 21.1 0.0 14 65 22 75 20 80 0.82 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 8_1 - 113 TrmB PF01978.14 68 4.6e-05 16.7 0.0 1 1 1.4e-06 7.9e-05 16.0 0.0 19 44 82 107 76 108 0.89 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 4_15 - 505 TrmB PF01978.14 68 0.00034 14.0 0.0 1 1 2.4e-05 0.0013 12.1 0.1 22 45 15 38 13 38 0.92 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 4_15 - 505 LacI PF00356.16 46 0.00033 13.9 0.0 1 1 8.2e-06 0.00067 12.9 0.0 1 23 17 39 17 44 0.91 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 5_13 - 119 LacI PF00356.16 46 0.00044 13.5 0.0 1 1 1.2e-05 0.00096 12.4 0.0 2 34 20 52 19 62 0.91 # 10270 # 10626 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 6_10 - 565 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.3e-43 142.8 0.0 1 1 3.2e-45 5.3e-43 140.8 0.0 2 199 100 410 99 412 0.96 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 DFP PF04127.10 185 0.0013 12.0 2.4 1 2 0.00039 0.065 6.4 0.4 28 51 105 128 99 156 0.83 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 DFP PF04127.10 185 0.0013 12.0 2.4 2 2 0.0014 0.23 4.7 0.1 32 53 281 302 276 336 0.77 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_3 - 289 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00084 12.8 0.1 1 1 1.5e-05 0.0025 11.3 0.0 26 55 25 54 9 67 0.80 # 795 # 1661 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 6_10 - 565 DAO PF01266.19 358 6.9e-09 28.6 11.7 1 3 1.4e-08 2.2e-06 20.3 0.7 1 38 99 134 99 190 0.84 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 DAO PF01266.19 358 6.9e-09 28.6 11.7 2 3 0.032 5.2 -0.6 0.1 3 31 273 301 271 307 0.75 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_10 - 565 DAO PF01266.19 358 6.9e-09 28.6 11.7 3 3 9.4e-07 0.00015 14.3 0.5 152 208 314 372 307 433 0.74 # 7525 # 9219 # -1 # ID=6_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_17 - 718 AAA_10 PF12846.2 304 2.1e-10 34.1 0.0 1 1 9.6e-11 3.9e-09 29.9 0.0 3 296 187 494 186 499 0.69 # 14398 # 16551 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_4 - 1220 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-08 27.1 0.4 1 2 5.5e-05 0.0023 11.0 0.1 4 23 371 390 368 398 0.89 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-08 27.1 0.4 2 2 1.1e-05 0.00046 13.3 0.0 4 34 993 1023 991 1068 0.77 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_30 - 519 AAA_10 PF12846.2 304 0.00015 14.9 0.1 1 2 7.7e-05 0.0032 10.5 0.0 3 22 38 57 36 66 0.87 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_30 - 519 AAA_10 PF12846.2 304 0.00015 14.9 0.1 2 2 0.036 1.5 1.7 0.0 212 262 222 269 204 277 0.83 # 30472 # 32028 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 3_13 - 276 AAA_10 PF12846.2 304 0.0003 13.9 1.4 1 2 4e-05 0.0016 11.4 1.0 4 34 36 66 33 159 0.89 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 3_13 - 276 AAA_10 PF12846.2 304 0.0003 13.9 1.4 2 2 0.081 3.3 0.6 0.0 242 266 181 205 170 210 0.87 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_33 - 108 HTH_20 PF12840.2 61 1.3e-18 60.2 0.0 1 1 6.1e-20 2e-18 59.6 0.0 3 61 6 69 4 69 0.93 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 8_1 - 113 HTH_20 PF12840.2 61 3.5e-05 17.2 0.1 1 1 1.4e-05 0.00045 13.6 0.1 2 43 36 104 35 107 0.93 # 1 # 339 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 5_11 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.00013 15.4 0.0 1 2 0.0036 0.12 5.9 0.0 24 47 102 125 97 125 0.89 # 8547 # 9524 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 5_11 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.00013 15.4 0.0 2 2 0.0017 0.056 6.9 0.1 19 58 213 259 185 262 0.77 # 8547 # 9524 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 4_15 - 505 HTH_20 PF12840.2 61 0.00032 14.1 0.2 1 1 2.8e-05 0.0009 12.7 0.0 13 45 1 36 1 38 0.94 # 10029 # 11543 # -1 # ID=4_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_37 - 226 HTH_20 PF12840.2 61 0.00039 13.8 0.1 1 1 9e-05 0.0029 11.0 0.0 21 46 30 55 18 63 0.85 # 39224 # 39901 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_4 - 1220 Dynamin_N PF00350.18 168 9.3e-06 19.1 0.5 1 2 0.00035 0.057 6.8 0.1 1 19 371 389 371 397 0.89 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 Dynamin_N PF00350.18 168 9.3e-06 19.1 0.5 2 2 3.3e-05 0.0054 10.1 0.1 1 25 993 1016 993 1023 0.84 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_27 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 1.4e-26 86.7 0.0 1 3 2.5e-11 2e-09 30.0 0.0 15 125 20 147 10 163 0.76 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_27 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 1.4e-26 86.7 0.0 2 3 7.5e-06 0.00061 11.9 0.0 240 390 195 383 187 387 0.60 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_27 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 1.4e-26 86.7 0.0 3 3 4.9e-15 4e-13 42.2 0.0 461 572 376 489 309 509 0.77 # 26870 # 29008 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 3_13 - 276 AAA_13 PF13166.1 712 0.002 10.2 0.1 1 2 0.0015 0.12 4.2 0.2 23 36 40 53 29 66 0.83 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 3_13 - 276 AAA_13 PF13166.1 712 0.002 10.2 0.1 2 2 0.0021 0.17 3.8 0.0 529 572 162 203 152 210 0.90 # 13568 # 14395 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_4 - 1220 TIGR00436 TIGR00436 270 0.0003 13.5 1.0 1 2 0.002 0.33 3.5 0.1 2 18 370 386 369 391 0.88 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 TIGR00436 TIGR00436 270 0.0003 13.5 1.0 2 2 6.2e-05 0.01 8.5 0.1 2 21 992 1011 991 1014 0.88 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_33 - 108 RPA_C PF08784.6 102 0.00017 15.6 0.0 1 1 2.5e-06 0.0004 14.4 0.0 60 95 27 62 18 65 0.90 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_42 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.9e-06 20.1 0.4 1 2 1.7e-06 0.00027 13.6 0.1 9 36 115 142 109 151 0.89 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_42 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.9e-06 20.1 0.4 2 2 0.0011 0.18 4.3 0.0 123 136 231 244 221 251 0.84 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_4 - 1220 Septin PF00735.13 281 0.00079 12.1 0.1 1 2 0.0011 0.19 4.3 0.0 6 24 370 388 367 414 0.88 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 1220 Septin PF00735.13 281 0.00079 12.1 0.1 2 2 0.00052 0.086 5.4 0.1 6 23 992 1009 989 1020 0.87 # 3566 # 7225 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_42 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 1.6e-09 31.5 0.0 1 2 1.4e-08 2.3e-06 21.3 0.0 2 49 108 155 107 195 0.91 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_42 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 1.6e-09 31.5 0.0 2 2 0.00018 0.029 7.9 0.1 110 152 227 268 223 272 0.84 # 34367 # 35533 # -1 # ID=2_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 4_4 - 272 Pterin_bind PF00809.17 210 1.9e-60 197.4 0.0 1 1 2.7e-62 2.2e-60 197.2 0.0 1 209 10 216 10 217 0.98 # 1990 # 2805 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 4_11 - 280 Pterin_bind PF00809.17 210 4.2e-58 189.7 0.0 1 1 6.1e-60 5e-58 189.5 0.0 1 210 7 216 7 216 0.98 # 7614 # 8453 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 3_3 - 426 FMO-like PF00743.14 532 4.5e-06 18.6 0.0 1 2 3.9e-06 0.00064 11.5 0.0 142 200 143 198 95 219 0.87 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_3 - 426 FMO-like PF00743.14 532 4.5e-06 18.6 0.0 2 2 0.00035 0.057 5.1 0.0 317 342 319 344 311 377 0.81 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 4_14 - 262 IstB_IS21 PF01695.12 178 5.1e-69 224.8 0.1 1 1 4.1e-71 6.7e-69 224.4 0.1 2 177 55 230 54 231 0.98 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 5_7 - 370 KR PF08659.5 181 0.0011 12.2 0.0 1 1 1.3e-05 0.0022 11.3 0.0 4 49 5 51 3 101 0.75 # 4759 # 5868 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 1_33 - 108 RNA_pol_Rpc34 PF05158.7 327 0.0012 11.6 0.0 1 1 1e-05 0.0017 11.2 0.0 72 132 3 64 1 70 0.91 # 34367 # 34690 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_14 - 1757 AAA_11 PF13086.1 236 0.0002 14.6 1.5 1 1 5.4e-06 0.00044 13.4 0.0 2 75 969 1039 968 1060 0.80 # 8412 # 13682 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 4_14 - 262 AAA_11 PF13086.1 236 0.00074 12.7 0.3 1 1 1.7e-05 0.0014 11.8 0.3 6 44 89 142 82 260 0.72 # 9257 # 10042 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 2_38 - 180 SSB PF00436.20 104 4.6e-41 132.6 0.4 1 1 3.5e-43 5.8e-41 132.2 0.4 1 101 6 109 6 112 0.96 # 31529 # 32068 # -1 # ID=2_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 3_3 - 426 Lycopene_cycl PF05834.7 374 4.5e-05 16.0 0.0 1 1 4.5e-07 7.4e-05 15.3 0.0 1 144 6 157 6 182 0.73 # 2840 # 4117 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 7_6 - 302 HTH_21 PF13276.1 60 1e-18 60.8 2.0 1 2 8.2e-19 4.5e-17 55.5 0.6 6 57 49 106 45 109 0.79 # 4714 # 5619 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.550 7_6 - 302 HTH_21 PF13276.1 60 1e-18 60.8 2.0 2 2 0.0095 0.52 4.0 0.0 11 33 264 288 255 301 0.77 # 4714 # 5619 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.550 5_3 - 296 HTH_21 PF13276.1 60 1.1e-18 60.6 3.5 1 1 4.7e-20 2.6e-18 59.5 3.5 2 60 46 103 44 103 0.94 # 545 # 1432 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 7_3 - 289 HTH_21 PF13276.1 60 0.00052 13.7 2.7 1 1 1e-05 0.00055 13.6 0.5 12 59 82 129 73 130 0.78 # 795 # 1661 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 7_5 - 398 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.0014 11.6 0.1 1 1 1.5e-05 0.0024 10.9 0.1 7 79 8 104 2 108 0.66 # 2298 # 3491 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/1787a49f-976f-468b-86e1-9dbdbb7809fe # Target file: checkm_output/bins/pm92/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm92/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/1787a49f-976f-468b-86e1-9dbdbb7809fe checkm_output/bins/pm92/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:18:12 2017 # [ok]