# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_69 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 9.7e-06 18.7 0.0 1 2 0.00026 0.045 6.8 0.0 112 146 18 54 5 82 0.66 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_69 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 9.7e-06 18.7 0.0 2 2 2.6e-05 0.0044 10.1 0.0 41 62 162 183 145 216 0.85 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 5_12 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 2.1e-05 17.7 0.2 1 1 9.2e-07 7.8e-05 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_14 - 355 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00063 13.0 0.0 1 1 1.8e-05 0.0015 11.8 0.0 12 37 303 328 301 332 0.88 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 1_82 - 742 ABC_tran PF00005.22 137 4e-05 17.6 0.0 1 1 4.3e-06 0.00015 15.8 0.0 5 36 40 71 37 85 0.89 # 58496 # 60721 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_11 - 319 ABC_tran PF00005.22 137 7.8e-05 16.7 0.0 1 1 3.9e-06 0.00013 15.9 0.0 9 48 112 151 104 222 0.84 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 1_88 - 658 ABC_tran PF00005.22 137 0.0002 15.3 0.0 1 1 6.6e-05 0.0023 11.9 0.0 87 136 343 397 214 398 0.75 # 64388 # 66361 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 3_9 - 535 ABC_tran PF00005.22 137 0.00025 15.0 0.0 1 1 1.9e-05 0.00064 13.7 0.0 16 37 258 279 254 343 0.80 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_28 - 877 ABC_tran PF00005.22 137 0.0017 12.4 0.0 1 1 0.00015 0.005 10.8 0.0 13 102 482 611 477 620 0.60 # 21178 # 23808 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 5_12 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 0.00041 13.8 1.2 1 1 1.2e-05 0.002 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_69 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00032 13.7 0.0 1 2 0.00052 0.09 5.7 0.0 122 138 18 34 3 79 0.71 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_69 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00032 13.7 0.0 2 2 0.00043 0.073 6.0 0.0 53 72 164 183 155 214 0.82 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_14 - 355 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.0089 9.3 0.0 1 1 5.2e-05 0.0089 9.3 0.0 19 36 311 328 307 329 0.94 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 1_73 - 415 HHH_5 PF14520.1 60 0.00054 13.8 0.0 1 1 8.4e-06 0.0014 12.5 0.0 9 37 184 212 172 225 0.92 # 51362 # 52606 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_58 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00039 13.2 0.0 1 2 2.7e-05 0.0045 9.7 0.0 28 64 32 68 21 84 0.88 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_58 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00039 13.2 0.0 2 2 0.014 2.4 0.7 0.0 127 137 114 124 103 134 0.82 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 3_21 - 124 rve_3 PF13683.1 67 2.2e-20 65.7 0.3 1 1 9e-22 3.1e-20 65.2 0.3 2 67 29 93 28 93 0.98 # 16815 # 17186 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.457 2_6 - 273 rve_3 PF13683.1 67 9.2e-20 63.7 0.3 1 1 6.2e-21 2.1e-19 62.5 0.3 2 67 194 260 193 260 0.98 # 12217 # 13035 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.512 5_4 - 289 rve_3 PF13683.1 67 2.2e-17 56.1 0.0 1 1 1.3e-18 4.3e-17 55.1 0.0 4 67 215 279 212 279 0.96 # 2646 # 3512 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.551 9_1 - 231 rve_3 PF13683.1 67 3.5e-16 52.2 0.1 1 1 1.8e-17 6.1e-16 51.4 0.1 2 67 146 212 145 212 0.97 # 9 # 701 # -1 # ID=9_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 2_7 - 297 rve_3 PF13683.1 67 3.7e-13 42.5 0.1 1 1 2.4e-14 8.2e-13 41.4 0.0 6 67 217 278 212 278 0.93 # 13193 # 14083 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.538 3_9 - 535 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 5.6e-05 15.5 0.0 1 1 5.1e-07 8.7e-05 14.9 0.0 48 114 210 280 171 291 0.72 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_35 - 107 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.7e-06 20.6 0.0 1 1 7.6e-08 3.3e-06 20.4 0.0 13 66 45 100 35 103 0.81 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 1_28 - 877 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3e-05 17.2 0.2 1 2 8.1e-06 0.00035 13.7 0.0 39 63 477 505 464 508 0.84 # 21178 # 23808 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 1_28 - 877 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3e-05 17.2 0.2 2 2 0.072 3.1 0.9 0.0 75 166 531 626 530 635 0.75 # 21178 # 23808 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 3_11 - 319 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 5.3e-05 16.4 0.1 1 1 2.2e-06 9.4e-05 15.6 0.1 37 63 113 139 96 144 0.80 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 3_9 - 535 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00089 12.4 0.0 1 1 3.4e-05 0.0015 11.7 0.0 42 74 257 288 223 329 0.73 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 5_12 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.0011 12.9 0.6 1 1 2.1e-05 0.0037 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_14 - 355 HTH_38 PF13936.1 44 1.1e-06 21.8 0.2 1 1 7.2e-08 3.1e-06 20.4 0.0 11 41 300 330 293 331 0.92 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 5_12 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 1e-05 18.7 0.0 1 1 2.4e-07 1e-05 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_32 - 151 HTH_38 PF13936.1 44 0.00031 14.0 0.0 1 1 2.1e-05 0.0009 12.5 0.0 11 29 105 123 102 125 0.90 # 22259 # 22711 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_45 - 230 HTH_38 PF13936.1 44 0.001 12.3 0.0 1 1 7.7e-05 0.0033 10.7 0.0 15 36 164 185 157 185 0.90 # 31806 # 32495 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 3_9 - 535 MobB PF03205.9 140 0.00044 13.6 0.0 1 1 2.8e-05 0.0016 11.8 0.0 3 35 256 288 254 330 0.78 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_28 - 877 MobB PF03205.9 140 0.001 12.4 0.1 1 1 8.1e-05 0.0046 10.3 0.0 4 37 484 516 482 524 0.79 # 21178 # 23808 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 1_3 - 730 MobB PF03205.9 140 0.0018 11.6 0.0 1 1 7.8e-05 0.0045 10.4 0.0 7 34 192 219 188 225 0.89 # 2318 # 4507 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 4_13 - 1045 AAA_19 PF13245.1 76 6.9e-07 22.7 0.4 1 1 6.6e-08 2.8e-06 20.7 0.4 7 71 269 330 262 336 0.71 # 8073 # 11207 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 3_11 - 319 AAA_19 PF13245.1 76 0.0001 15.7 0.4 1 1 6.9e-06 0.0003 14.2 0.0 9 36 113 140 106 152 0.84 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 3_9 - 535 AAA_19 PF13245.1 76 0.00033 14.1 0.0 1 1 2e-05 0.00087 12.7 0.0 14 39 257 282 250 290 0.81 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_82 - 742 AAA_19 PF13245.1 76 0.00087 12.7 0.0 1 1 5.1e-05 0.0022 11.5 0.0 10 50 46 85 38 86 0.82 # 58496 # 60721 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_77 - 215 CbiA PF01656.18 195 2.1e-09 30.7 0.1 1 1 1.8e-11 3.1e-09 30.2 0.1 1 145 4 124 4 173 0.79 # 54836 # 55480 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_69 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00037 13.7 0.0 1 2 0.0079 1.4 2.0 0.0 175 189 18 32 9 94 0.79 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_69 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00037 13.7 0.0 2 2 3.3e-05 0.0056 9.8 0.0 20 46 163 189 148 213 0.81 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 2_14 - 355 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 9.5e-05 15.5 0.0 1 1 4.3e-06 0.00024 14.2 0.0 25 46 308 329 301 331 0.87 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 2_15 - 104 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00026 14.1 1.3 1 1 4.8e-06 0.00028 14.0 0.0 23 52 22 51 19 52 0.88 # 27433 # 27744 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 1_45 - 230 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00047 13.3 0.0 1 1 1.6e-05 0.00092 12.4 0.0 26 48 169 191 159 194 0.84 # 31806 # 32495 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 3_1 - 326 Rep_3 PF01051.16 222 6.2e-33 107.9 0.1 1 1 4.9e-35 8.4e-33 107.4 0.1 3 214 10 265 8 271 0.90 # 264 # 1241 # 1 # ID=3_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 5_4 - 289 rve PF00665.21 120 1.1e-31 103.1 0.0 1 1 8.2e-33 2.3e-31 102.1 0.0 3 119 126 240 124 241 0.96 # 2646 # 3512 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.551 9_1 - 231 rve PF00665.21 120 3.2e-30 98.4 0.0 1 1 1.7e-31 4.9e-30 97.8 0.0 2 120 58 174 57 174 0.98 # 9 # 701 # -1 # ID=9_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 2_7 - 297 rve PF00665.21 120 2.8e-27 88.9 0.1 1 1 3.3e-28 9.3e-27 87.2 0.0 2 119 126 240 125 241 0.97 # 13193 # 14083 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.538 2_6 - 273 rve PF00665.21 120 6e-27 87.8 0.0 1 1 3.6e-28 1e-26 87.1 0.0 2 119 106 221 105 222 0.97 # 12217 # 13035 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.512 8_1 - 235 rve PF00665.21 120 5.6e-13 42.7 0.1 1 2 0.089 2.5 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 64 # 768 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 8_1 - 235 rve PF00665.21 120 5.6e-13 42.7 0.1 2 2 3.6e-13 1e-11 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 64 # 768 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 3_21 - 124 rve PF00665.21 120 2.9e-12 40.5 0.0 1 1 1.6e-13 4.4e-12 39.8 0.0 68 118 5 55 1 57 0.92 # 16815 # 17186 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.457 4_2 - 138 zf-ribbon_3 PF13248.1 26 4e-05 16.5 0.8 1 1 4.7e-07 8e-05 15.5 0.8 2 21 102 129 101 129 0.80 # 264 # 677 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 3_9 - 535 AAA_23 PF13476.1 202 4e-07 24.2 0.0 1 1 9.5e-09 8.1e-07 23.2 0.0 20 50 254 284 235 432 0.78 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 3_11 - 319 AAA_23 PF13476.1 202 8.8e-05 16.5 0.2 1 1 2.6e-06 0.00022 15.2 0.1 18 39 113 134 99 144 0.86 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 1_58 - 188 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.5e-13 43.0 0.0 1 1 9.5e-15 8.1e-13 42.1 0.0 2 114 52 147 51 150 0.91 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_69 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2.6e-12 40.5 0.1 1 2 2.2e-08 1.9e-06 21.6 0.0 54 114 4 71 2 74 0.75 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_69 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2.6e-12 40.5 0.1 2 2 6.3e-07 5.4e-05 16.9 0.0 4 34 167 196 164 221 0.79 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_3 - 730 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0013 11.5 0.0 1 1 3.5e-05 0.006 9.3 0.0 21 49 190 219 182 235 0.85 # 2318 # 4507 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 4_13 - 1045 AAA_30 PF13604.1 196 9.7e-41 133.1 2.3 1 1 1.1e-42 9.7e-41 133.1 2.3 1 186 256 444 256 448 0.94 # 8073 # 11207 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 1_3 - 730 AAA_30 PF13604.1 196 0.001 12.3 0.0 1 1 2.6e-05 0.0022 11.2 0.0 21 57 188 224 180 230 0.85 # 2318 # 4507 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 3_23 - 149 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.2e-22 73.4 0.0 1 1 7.4e-24 2.1e-22 72.6 0.0 3 68 28 97 26 104 0.90 # 17451 # 17897 # 1 # ID=3_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 2_8 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 9.5e-14 44.9 1.1 1 1 1.3e-14 3.8e-13 42.9 1.1 1 74 1 87 1 88 0.86 # 14080 # 14406 # -1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 2_15 - 104 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 4.6e-11 36.3 0.7 1 1 2e-12 5.8e-11 35.9 0.7 2 76 4 79 3 85 0.83 # 27433 # 27744 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 2_11 - 100 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 9.4e-11 35.3 2.9 1 1 4.2e-12 1.2e-10 34.9 2.9 3 76 11 79 9 79 0.90 # 24664 # 24963 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 5_3 - 100 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 9.4e-11 35.3 2.9 1 1 4.2e-12 1.2e-10 34.9 2.9 3 76 11 79 9 79 0.90 # 2350 # 2649 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 8_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00042 13.9 0.3 1 1 3.2e-05 0.00092 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 64 # 768 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_45 - 230 GerE PF00196.14 58 2.3e-05 17.3 0.1 1 1 7e-07 6e-05 16.0 0.0 14 57 165 208 160 209 0.90 # 31806 # 32495 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 3_32 - 151 GerE PF00196.14 58 0.00068 12.7 0.1 1 1 3.2e-05 0.0028 10.7 0.0 10 27 106 123 98 125 0.89 # 22259 # 22711 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_3 - 730 TraG-D_C PF12696.2 128 1.3e-20 67.2 0.0 1 1 1.4e-22 2.4e-20 66.4 0.0 1 127 419 541 419 542 0.86 # 2318 # 4507 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 2_3 - 86 DDE_3 PF13358.1 146 3.1e-05 17.4 0.0 1 1 4.1e-07 3.5e-05 17.2 0.0 2 53 17 67 16 80 0.91 # 10931 # 11188 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 8_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.0012 12.3 0.0 1 1 4.2e-05 0.0036 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 3_9 - 535 TIGR03263 TIGR03263 180 0.0012 11.8 0.0 1 1 1.6e-05 0.0028 10.7 0.0 4 23 256 275 254 301 0.85 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_77 - 215 MipZ PF09140.6 261 4.1e-08 26.2 2.3 1 2 0.0008 0.14 4.8 0.5 7 25 8 26 2 38 0.71 # 54836 # 55480 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_77 - 215 MipZ PF09140.6 261 4.1e-08 26.2 2.3 2 2 9e-09 1.5e-06 21.1 0.1 70 133 45 108 25 125 0.84 # 54836 # 55480 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_69 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 3.4e-07 23.6 0.0 1 2 1.6e-05 0.0027 10.9 0.0 102 143 16 57 5 90 0.74 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_69 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 3.4e-07 23.6 0.0 2 2 1.7e-05 0.0029 10.8 0.0 28 54 163 189 158 221 0.66 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_83 - 403 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2.6e-27 89.4 0.0 1 1 4.7e-29 4e-27 88.8 0.0 4 210 91 328 88 331 0.93 # 60758 # 61966 # -1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.451 3_20 - 429 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.5e-15 51.0 0.0 1 1 2.4e-17 2.1e-15 50.5 0.0 3 213 130 356 128 356 0.76 # 15081 # 16367 # 1 # ID=3_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_15 - 104 DivIC PF04977.10 80 0.00022 14.4 0.1 1 1 3.4e-06 0.00029 14.0 0.1 23 66 53 94 37 98 0.72 # 27433 # 27744 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 1_37 - 476 DivIC PF04977.10 80 0.0016 11.6 4.6 1 1 3.6e-05 0.0031 10.7 4.6 17 66 76 124 72 125 0.92 # 27081 # 28508 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_14 - 355 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 1.3e-21 70.9 0.0 1 1 2.2e-23 1.9e-21 70.4 0.0 1 139 160 294 160 319 0.80 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 2_13 - 161 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 2.8e-12 40.4 0.0 1 1 3.7e-14 3.2e-12 40.2 0.0 122 239 42 152 14 156 0.86 # 25238 # 25720 # -1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.497 1_88 - 658 AAA_21 PF13304.1 303 0.00031 14.4 0.3 1 1 5.8e-06 0.00099 12.7 0.1 219 298 331 432 248 434 0.75 # 64388 # 66361 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_32 - 74 zf-dskA_traR PF01258.12 36 2.8e-15 49.5 3.4 1 1 2.5e-17 4.3e-15 48.9 3.4 5 36 35 67 30 67 0.91 # 25085 # 25306 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_54 - 685 KorB PF08535.5 93 3.5e-05 17.6 0.0 1 1 6.3e-07 0.00011 16.0 0.0 2 43 182 223 181 234 0.93 # 38309 # 40363 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_69 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 2.8e-35 115.5 0.0 1 2 5.6e-15 9.6e-13 41.8 0.0 1 114 21 124 21 140 0.87 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_69 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 2.8e-35 115.5 0.0 2 2 2.3e-24 4e-22 72.5 0.0 169 226 141 198 123 203 0.90 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 5_4 - 289 rve_2 PF13333.1 52 1.6e-22 73.0 1.5 1 2 0.021 0.91 3.4 0.0 41 52 101 112 88 112 0.75 # 2646 # 3512 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.551 5_4 - 289 rve_2 PF13333.1 52 1.6e-22 73.0 1.5 2 2 1.2e-22 5e-21 68.3 0.1 1 52 231 287 231 287 0.98 # 2646 # 3512 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.551 2_6 - 273 rve_2 PF13333.1 52 1.6e-15 50.7 1.4 1 1 7.9e-17 3.4e-15 49.6 1.4 1 51 212 267 212 267 0.93 # 12217 # 13035 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.512 9_1 - 231 rve_2 PF13333.1 52 2.7e-10 33.9 0.1 1 1 1.2e-11 5.1e-10 33.0 0.1 1 50 164 218 164 219 0.90 # 9 # 701 # -1 # ID=9_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 2_7 - 297 rve_2 PF13333.1 52 3.5e-08 27.1 0.0 1 1 1.7e-09 7.2e-08 26.1 0.0 1 44 231 277 231 284 0.88 # 13193 # 14083 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.538 1_75 - 327 Hydantoinase_A PF01968.13 290 1.2e-08 28.0 0.3 1 2 1.7e-06 0.0003 13.6 0.1 66 98 154 185 143 192 0.79 # 53047 # 54027 # -1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 1_75 - 327 Hydantoinase_A PF01968.13 290 1.2e-08 28.0 0.3 2 2 5.5e-06 0.00094 11.9 0.0 211 263 244 296 201 301 0.86 # 53047 # 54027 # -1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 2_14 - 355 Crp PF00325.15 32 0.00054 13.1 0.1 1 1 6e-06 0.001 12.2 0.1 7 24 314 331 311 332 0.88 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 3_9 - 535 cobW PF02492.14 178 0.00011 15.3 0.1 1 1 9e-06 0.00077 12.6 0.0 3 33 256 288 254 310 0.77 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_82 - 742 cobW PF02492.14 178 0.00072 12.7 0.0 1 1 1.4e-05 0.0012 11.9 0.0 2 23 48 71 47 82 0.77 # 58496 # 60721 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_3 - 730 AAA_16 PF13191.1 185 6.3e-06 19.9 0.0 1 1 1.2e-06 3.3e-05 17.6 0.0 21 61 182 223 179 264 0.80 # 2318 # 4507 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 3_11 - 319 AAA_16 PF13191.1 185 3.4e-05 17.5 0.1 1 1 1.9e-06 5.3e-05 16.9 0.1 19 57 109 148 103 265 0.85 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 3_9 - 535 AAA_16 PF13191.1 185 0.00025 14.7 0.1 1 1 2.1e-05 0.00061 13.5 0.1 16 48 245 277 239 404 0.88 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_82 - 742 AAA_16 PF13191.1 185 0.00032 14.4 0.8 1 1 8.8e-05 0.0025 11.5 0.2 24 58 46 83 35 229 0.82 # 58496 # 60721 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_35 - 107 AAA_16 PF13191.1 185 0.00083 13.0 0.0 1 1 4.3e-05 0.0012 12.5 0.0 22 51 70 99 61 104 0.90 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 4_13 - 1045 AAA_16 PF13191.1 185 0.031 7.9 7.2 1 2 0.0038 0.11 6.1 0.0 23 46 272 295 255 303 0.82 # 8073 # 11207 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 4_13 - 1045 AAA_16 PF13191.1 185 0.031 7.9 7.2 2 2 0.029 0.82 3.2 0.1 52 120 379 461 363 520 0.59 # 8073 # 11207 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 3_9 - 535 AAA_22 PF13401.1 131 4.6e-07 23.7 0.0 1 1 1.4e-08 1.2e-06 22.3 0.0 5 85 254 329 249 376 0.77 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 3_11 - 319 AAA_22 PF13401.1 131 0.00022 15.1 0.0 1 1 4.1e-06 0.00035 14.4 0.0 3 31 113 141 110 218 0.83 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 3_27 - 275 HTH_AraC PF00165.18 42 3.1e-19 62.0 0.2 1 2 3.3e-09 5.6e-07 23.0 0.0 1 40 174 212 174 214 0.93 # 20111 # 20935 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.282 3_27 - 275 HTH_AraC PF00165.18 42 3.1e-19 62.0 0.2 2 2 1.4e-13 2.4e-11 36.9 0.1 1 40 225 262 225 262 0.96 # 20111 # 20935 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.282 3_9 - 535 AAA_29 PF13555.1 62 1.8e-06 21.1 0.0 1 1 4.3e-08 3.6e-06 20.1 0.0 25 58 255 288 237 292 0.81 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 3_11 - 319 AAA_29 PF13555.1 62 7.8e-06 19.1 0.2 1 1 2e-07 1.7e-05 18.0 0.2 23 45 115 136 105 142 0.83 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 2_15 - 104 HTH_1 PF00126.22 60 0.0011 12.5 1.1 1 2 0.00011 0.019 8.5 0.0 4 40 15 52 14 55 0.90 # 27433 # 27744 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 2_15 - 104 HTH_1 PF00126.22 60 0.0011 12.5 1.1 2 2 0.0079 1.4 2.5 0.5 33 41 69 77 53 84 0.72 # 27433 # 27744 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 5_12 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00016 15.0 0.0 1 1 1.9e-06 0.00033 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_9 - 535 SRP54 PF00448.17 196 0.0017 11.5 0.0 1 1 1.7e-05 0.0029 10.7 0.0 5 37 257 290 254 330 0.75 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 8_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 2.2e-06 22.1 0.2 1 1 5.6e-08 9.6e-06 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 64 # 768 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_75 - 327 TIGR02350 TIGR02350 596 0.00015 13.6 0.8 1 3 0.032 5.4 -1.5 0.1 360 382 78 100 63 130 0.70 # 53047 # 54027 # -1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 1_75 - 327 TIGR02350 TIGR02350 596 0.00015 13.6 0.8 2 3 0.00012 0.02 6.5 0.0 175 200 159 181 146 198 0.82 # 53047 # 54027 # -1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 1_75 - 327 TIGR02350 TIGR02350 596 0.00015 13.6 0.8 3 3 0.00048 0.082 4.5 0.0 271 348 220 295 205 308 0.85 # 53047 # 54027 # -1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 3_9 - 535 Rad17 PF03215.10 519 9.7e-06 18.1 0.1 1 1 2.3e-07 2e-05 17.1 0.0 47 91 255 299 241 316 0.83 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 3_11 - 319 Rad17 PF03215.10 519 0.00027 13.3 0.0 1 1 5e-06 0.00043 12.7 0.0 35 74 104 143 100 162 0.85 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 2_15 - 104 HTH_23 PF13384.1 50 4.1e-08 26.4 0.0 1 1 1.7e-08 2.9e-07 23.7 0.0 7 47 14 57 10 60 0.82 # 27433 # 27744 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 2_14 - 355 HTH_23 PF13384.1 50 4.9e-07 23.0 3.0 1 1 1.2e-07 2e-06 21.0 0.2 2 38 294 330 293 331 0.92 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 1_54 - 685 HTH_23 PF13384.1 50 7.8e-07 22.3 0.0 1 1 7.6e-07 1.3e-05 18.4 0.0 13 40 179 206 173 210 0.91 # 38309 # 40363 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 3_23 - 149 HTH_23 PF13384.1 50 1.7e-06 21.3 0.0 1 1 1.6e-07 2.7e-06 20.6 0.0 14 48 41 79 34 81 0.84 # 17451 # 17897 # 1 # ID=3_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 8_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 1e-05 18.8 0.7 1 1 1.9e-05 0.00032 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_8 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 1.5e-05 18.2 0.3 1 1 2e-06 3.4e-05 17.1 0.1 5 42 10 55 8 66 0.86 # 14080 # 14406 # -1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 2_11 - 100 HTH_23 PF13384.1 50 2.1e-05 17.8 0.0 1 1 2.5e-06 4.2e-05 16.8 0.0 7 40 20 52 14 60 0.86 # 24664 # 24963 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 5_3 - 100 HTH_23 PF13384.1 50 2.1e-05 17.8 0.0 1 1 2.5e-06 4.2e-05 16.8 0.0 7 40 20 52 14 60 0.86 # 2350 # 2649 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 5_12 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 7.5e-05 16.0 0.3 1 1 4.4e-06 7.5e-05 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_32 - 151 HTH_23 PF13384.1 50 0.00042 13.6 0.0 1 1 8.8e-05 0.0015 11.9 0.0 9 27 106 124 105 125 0.93 # 22259 # 22711 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_14 - 182 Cro PF09048.5 59 0.0049 10.2 1.9 1 2 0.013 2.3 1.7 0.1 25 34 32 41 29 45 0.87 # 11913 # 12458 # 1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 3_14 - 182 Cro PF09048.5 59 0.0049 10.2 1.9 2 2 0.0002 0.035 7.5 0.2 27 50 80 103 75 105 0.85 # 11913 # 12458 # 1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 5_12 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 3.1e-13 43.1 0.5 1 1 1.5e-14 8.8e-13 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_14 - 355 HTH_7 PF02796.10 45 5.6e-06 19.9 0.0 1 1 3.6e-07 2e-05 18.1 0.0 5 38 294 326 283 329 0.86 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 1_45 - 230 HTH_7 PF02796.10 45 9.7e-06 19.1 0.1 1 1 4.5e-07 2.6e-05 17.7 0.1 11 37 159 185 128 188 0.87 # 31806 # 32495 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 2_14 - 355 HTH_29 PF13551.1 112 2.8e-05 17.9 0.7 1 1 3.1e-06 0.00013 15.8 0.0 3 33 301 330 298 332 0.93 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 5_12 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00018 15.3 0.6 1 2 0.098 4.2 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 5_12 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00018 15.3 0.6 2 2 4.1e-05 0.0017 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_54 - 685 HTH_29 PF13551.1 112 0.00049 13.9 0.0 1 1 4.3e-05 0.0018 12.1 0.0 4 37 175 208 172 264 0.85 # 38309 # 40363 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 3_23 - 149 HTH_29 PF13551.1 112 0.0005 13.9 0.0 1 1 2e-05 0.00085 13.2 0.0 15 48 51 83 38 105 0.83 # 17451 # 17897 # 1 # ID=3_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 2_5 - 108 OrfB_Zn_ribbon PF07282.6 69 0.0007 13.0 0.0 1 1 8.4e-06 0.0014 11.9 0.0 1 26 80 105 80 106 0.94 # 11497 # 11820 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.466 3_26 - 173 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 5.9e-39 127.5 0.1 1 1 1.2e-40 7e-39 127.3 0.1 158 270 6 121 1 122 0.95 # 19318 # 19836 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.545 3_25 - 370 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.1e-34 113.5 1.2 1 2 0.019 1.1 2.0 1.8 162 206 41 85 15 125 0.49 # 18264 # 19373 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.584 3_25 - 370 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.1e-34 113.5 1.2 2 2 4.9e-35 2.8e-33 108.9 0.0 1 97 186 284 186 307 0.93 # 18264 # 19373 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.584 8_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 4e-12 39.5 0.3 1 1 8.9e-14 5.1e-12 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_58 - 188 Methyltransf_31 PF13847.1 152 2.7e-06 20.7 0.0 1 1 1.9e-08 3.3e-06 20.4 0.0 5 118 52 156 48 182 0.85 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 3_9 - 535 Arch_ATPase PF01637.13 234 6.8e-05 16.3 0.0 1 1 7.5e-07 0.00013 15.4 0.0 22 73 255 314 246 374 0.82 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 4_13 - 1045 PhoH PF02562.11 205 0.00011 15.1 0.2 1 1 2.2e-06 0.00037 13.4 0.1 3 61 255 317 253 336 0.85 # 8073 # 11207 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 3_9 - 535 AAA_5 PF07728.9 139 0.00056 13.3 0.0 1 2 2.5e-05 0.0043 10.5 0.0 3 40 257 297 256 352 0.71 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 3_9 - 535 AAA_5 PF07728.9 139 0.00056 13.3 0.0 2 2 0.045 7.7 -0.1 0.0 64 78 496 514 469 527 0.78 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_3 - 730 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.2e-149 491.8 0.0 1 1 3.4e-151 1.4e-149 491.5 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 2318 # 4507 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_28 - 877 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.4e-06 20.7 0.3 1 1 9.5e-08 4.1e-06 19.2 0.0 15 53 480 518 471 548 0.80 # 21178 # 23808 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 1_35 - 107 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00025 13.3 0.0 1 2 0.026 1.1 1.4 0.0 294 335 24 65 16 73 0.83 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 1_35 - 107 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00025 13.3 0.0 2 2 2.3e-05 0.00099 11.4 0.0 6 42 63 99 58 103 0.87 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 3_11 - 319 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00034 12.9 0.0 1 1 1.2e-05 0.00052 12.3 0.0 18 47 117 147 110 153 0.80 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 1_77 - 215 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00013 14.7 2.1 1 2 8.1e-06 0.00069 12.3 0.8 3 50 3 44 1 49 0.80 # 54836 # 55480 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_77 - 215 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00013 14.7 2.1 2 2 0.017 1.4 1.5 0.0 101 140 63 102 49 123 0.75 # 54836 # 55480 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_75 - 327 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00037 13.2 1.6 1 2 1.1e-05 0.00096 11.9 0.6 46 128 63 155 60 184 0.71 # 53047 # 54027 # -1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 1_75 - 327 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00037 13.2 1.6 2 2 0.079 6.8 -0.8 0.0 6 32 181 207 177 217 0.83 # 53047 # 54027 # -1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 3_9 - 535 AAA_18 PF13238.1 129 1.1e-07 25.9 0.0 1 1 2.2e-09 3.7e-07 24.2 0.0 2 116 257 381 257 390 0.81 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_73 - 415 IMS_HHH PF11798.3 32 8.1e-09 28.9 0.3 1 1 1.3e-10 2.2e-08 27.5 0.3 3 32 172 201 170 201 0.93 # 51362 # 52606 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_69 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 4.5e-05 16.7 0.1 1 2 0.0074 1.3 2.2 0.0 53 80 4 30 2 38 0.92 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_69 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 4.5e-05 16.7 0.1 2 2 6.3e-06 0.0011 12.2 0.0 3 38 166 202 164 212 0.82 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_58 - 188 Methyltransf_12 PF08242.7 99 8.7e-05 16.7 0.0 1 1 7.6e-07 0.00013 16.1 0.0 1 99 55 144 55 144 0.84 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_58 - 188 Methyltrans_SAM PF10672.4 286 0.0015 11.0 0.0 1 1 1.3e-05 0.0022 10.5 0.0 196 261 113 173 99 179 0.78 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_28 - 877 DUF87 PF01935.12 229 4e-07 23.7 0.0 1 1 2.7e-08 1.1e-06 22.2 0.0 26 221 483 669 469 677 0.75 # 21178 # 23808 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 3_9 - 535 DUF87 PF01935.12 229 1.5e-05 18.6 0.2 1 1 1.2e-06 5.1e-05 16.8 0.0 28 56 258 288 256 297 0.83 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 3_11 - 319 DUF87 PF01935.12 229 0.0011 12.4 0.3 1 1 4.5e-05 0.0019 11.6 0.3 27 48 118 139 116 149 0.82 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 1_35 - 107 DUF87 PF01935.12 229 0.0016 11.9 0.0 1 1 5.6e-05 0.0024 11.3 0.0 25 50 74 99 68 103 0.91 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 2_15 - 104 HTH_28 PF13518.1 52 2.9e-09 30.5 0.1 1 1 2.1e-10 5.2e-09 29.7 0.1 1 40 13 53 13 61 0.88 # 27433 # 27744 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 2_14 - 355 HTH_28 PF13518.1 52 1.5e-05 18.7 3.6 1 1 8.2e-06 0.0002 15.0 0.0 8 33 305 330 301 333 0.85 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 3_23 - 149 HTH_28 PF13518.1 52 8.2e-05 16.3 0.0 1 1 6.1e-06 0.00015 15.4 0.0 15 41 51 77 51 80 0.93 # 17451 # 17897 # 1 # ID=3_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 2_11 - 100 HTH_28 PF13518.1 52 9.5e-05 16.1 0.1 1 1 9.9e-06 0.00024 14.8 0.1 14 34 31 51 22 53 0.85 # 24664 # 24963 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 5_3 - 100 HTH_28 PF13518.1 52 9.5e-05 16.1 0.1 1 1 9.9e-06 0.00024 14.8 0.1 14 34 31 51 22 53 0.85 # 2350 # 2649 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 8_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 9.9e-05 16.0 1.2 1 1 1.8e-05 0.00043 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 64 # 768 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 5_12 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.00023 14.9 0.0 1 1 3e-05 0.00073 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_25 - 370 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.071 7.3 10.9 1 2 0.0025 0.43 4.8 3.6 20 64 12 56 10 57 0.94 # 18264 # 19373 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.584 3_25 - 370 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.071 7.3 10.9 2 2 0.00064 0.11 6.7 0.7 33 57 62 86 58 93 0.85 # 18264 # 19373 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.584 2_14 - 355 HTH_24 PF13412.1 48 0.00088 12.4 0.0 1 1 1.1e-05 0.0019 11.3 0.0 14 36 306 328 303 328 0.88 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 3_27 - 275 HTH_18 PF12833.2 81 7.1e-13 42.2 0.0 1 1 6.6e-15 1.1e-12 41.6 0.0 4 78 190 262 187 264 0.93 # 20111 # 20935 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.282 1_58 - 188 TIGR03533 TIGR03533 284 0.0016 11.2 0.0 1 1 1.5e-05 0.0025 10.5 0.0 118 210 47 133 37 141 0.86 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_58 - 188 TIGR03534 TIGR03534 253 5.7e-07 22.5 0.0 1 1 4e-09 6.8e-07 22.3 0.0 80 175 44 131 12 148 0.86 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 4_13 - 1045 UvrD_C_2 PF13538.1 104 6.9e-08 26.3 0.8 1 2 0.0068 1.2 3.1 0.0 6 45 515 554 511 583 0.74 # 8073 # 11207 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 4_13 - 1045 UvrD_C_2 PF13538.1 104 6.9e-08 26.3 0.8 2 2 2.1e-08 3.6e-06 20.8 0.2 3 102 629 732 627 734 0.77 # 8073 # 11207 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 1_58 - 188 TIGR00755 TIGR00755 256 1.2e-08 27.9 0.0 1 1 9.1e-11 1.6e-08 27.5 0.0 8 105 29 123 25 134 0.91 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 3_9 - 535 T2SE PF00437.15 272 1.8e-39 128.9 0.0 1 1 4.8e-41 4.1e-39 127.7 0.0 11 271 120 401 112 402 0.80 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 3_11 - 319 T2SE PF00437.15 272 2.3e-30 99.0 0.0 1 1 3.6e-32 3.1e-30 98.6 0.0 94 259 84 253 41 266 0.77 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 1_75 - 327 StbA PF06406.6 318 1.1e-155 511.0 1.7 1 1 7e-158 1.2e-155 510.9 1.7 1 318 1 319 1 319 1.00 # 53047 # 54027 # -1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 1_82 - 742 NACHT PF05729.7 166 1.3e-05 18.5 0.1 1 2 9e-06 0.0015 11.8 0.0 2 32 48 78 47 86 0.85 # 58496 # 60721 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_82 - 742 NACHT PF05729.7 166 1.3e-05 18.5 0.1 2 2 0.002 0.35 4.2 0.0 48 99 478 541 461 582 0.81 # 58496 # 60721 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_82 - 742 UPF0079 PF02367.12 123 0.00072 12.9 0.0 1 1 9.6e-06 0.0016 11.7 0.0 10 41 41 72 31 81 0.85 # 58496 # 60721 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 3_9 - 535 AAA_17 PF13207.1 121 5.2e-07 24.2 0.1 1 1 3.6e-08 2e-06 22.3 0.0 3 77 257 337 255 432 0.70 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 3_11 - 319 AAA_17 PF13207.1 121 0.00038 15.0 0.1 1 1 1.5e-05 0.00085 13.8 0.1 2 33 117 153 116 267 0.74 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 1_3 - 730 AAA_17 PF13207.1 121 0.00052 14.5 0.0 1 1 2.6e-05 0.0015 13.0 0.0 3 28 189 218 187 298 0.70 # 2318 # 4507 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 3_32 - 151 Transposase_mut PF00872.13 381 3.7e-34 111.5 0.1 1 1 4.5e-36 3.9e-34 111.4 0.1 5 149 5 148 1 150 0.84 # 22259 # 22711 # -1 # ID=3_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 3_31 - 79 Transposase_mut PF00872.13 381 1.1e-14 47.4 0.0 1 1 1.5e-16 1.3e-14 47.2 0.0 187 233 3 49 1 55 0.93 # 21929 # 22165 # -1 # ID=3_31;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_88 - 658 TIGR02211 TIGR02211 221 1.5e-05 18.0 0.0 1 1 1.7e-07 3e-05 17.0 0.0 127 203 351 434 338 452 0.77 # 64388 # 66361 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 4_13 - 1045 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.00043 13.5 0.0 1 2 0.00016 0.027 7.6 0.0 1 23 276 300 276 478 0.78 # 8073 # 11207 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 4_13 - 1045 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.00043 13.5 0.0 2 2 0.0026 0.45 3.6 0.0 173 234 674 735 622 735 0.63 # 8073 # 11207 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 1_35 - 107 Pox_A32 PF04665.7 241 7.8e-05 15.7 0.0 1 2 0.023 2 1.3 0.1 2 30 41 68 40 71 0.77 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 1_35 - 107 Pox_A32 PF04665.7 241 7.8e-05 15.7 0.0 2 2 4.2e-06 0.00036 13.5 0.0 7 42 66 101 60 104 0.89 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 1_28 - 877 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0011 11.9 0.0 1 1 3.7e-05 0.0031 10.4 0.0 6 38 473 505 470 520 0.85 # 21178 # 23808 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 3_11 - 319 AAA_14 PF13173.1 128 8.5e-07 22.6 0.0 1 1 1.9e-08 1.6e-06 21.7 0.0 2 86 114 216 113 240 0.71 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 3_9 - 535 AAA_14 PF13173.1 128 5.1e-06 20.1 0.1 1 1 2.3e-07 2e-05 18.2 0.0 4 46 255 299 253 338 0.80 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_77 - 215 VirC1 PF07015.6 231 0.0007 12.4 0.0 1 2 0.00073 0.12 5.0 0.0 3 29 3 29 1 36 0.81 # 54836 # 55480 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_77 - 215 VirC1 PF07015.6 231 0.0007 12.4 0.0 2 2 0.00052 0.088 5.5 0.0 87 190 77 181 59 194 0.70 # 54836 # 55480 # -1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 3_9 - 535 AAA_33 PF13671.1 143 0.00022 14.8 0.0 1 2 0.023 3.9 1.0 0.0 70 103 46 79 42 96 0.85 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 3_9 - 535 AAA_33 PF13671.1 143 0.00022 14.8 0.0 2 2 1.9e-05 0.0033 11.0 0.0 3 22 257 276 255 333 0.90 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 3_9 - 535 ArgK PF03308.11 267 0.0012 11.3 0.0 1 1 1.4e-05 0.0024 10.3 0.0 34 67 258 293 249 304 0.81 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_3 - 730 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.2e-09 30.9 0.0 1 1 4e-11 3.4e-09 29.4 0.0 264 361 382 476 198 500 0.83 # 2318 # 4507 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_28 - 877 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 5.9e-06 18.7 0.0 1 2 0.00023 0.02 7.1 0.0 105 186 534 609 476 624 0.88 # 21178 # 23808 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 1_28 - 877 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 5.9e-06 18.7 0.0 2 2 4.7e-05 0.004 9.4 0.0 319 378 712 770 664 772 0.90 # 21178 # 23808 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 1_58 - 188 MTS PF05175.9 170 4.5e-09 29.5 0.0 1 1 3.7e-11 6.3e-09 29.1 0.0 24 141 45 149 41 166 0.84 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 2_5 - 108 Ribosom_S12_S23 PF00164.20 122 0.00025 14.2 0.0 1 1 1.6e-06 0.00028 14.0 0.0 41 85 11 61 4 95 0.78 # 11497 # 11820 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.466 1_35 - 107 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00014 15.7 0.0 1 1 1.6e-06 0.00028 14.8 0.0 1 29 75 103 75 106 0.91 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 1_43 - 89 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.1e-49 161.5 0.3 1 1 7.2e-52 1.2e-49 161.4 0.3 44 131 1 88 1 88 0.99 # 31033 # 31299 # 1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 1_35 - 107 TIGR01039 TIGR01039 462 0.0011 11.1 0.0 1 1 6.5e-06 0.0011 11.1 0.0 123 172 50 100 18 103 0.73 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 8_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.3e-52 171.2 0.0 1 1 5.3e-54 1.8e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 64 # 768 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 9_1 - 231 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.9e-14 46.9 0.0 1 1 1.2e-15 4.1e-14 46.4 0.0 2 139 63 204 62 205 0.91 # 9 # 701 # -1 # ID=9_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 5_4 - 289 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 4.6e-12 39.8 0.0 1 1 2.3e-13 8e-12 39.0 0.0 2 129 130 260 129 272 0.88 # 2646 # 3512 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.551 2_7 - 297 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 3.7e-08 27.1 0.0 1 1 1.8e-09 6e-08 26.4 0.0 2 137 131 268 130 270 0.92 # 13193 # 14083 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.538 2_6 - 273 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.7e-07 25.0 0.4 1 1 7.2e-09 2.5e-07 24.4 0.0 2 139 111 252 110 253 0.86 # 12217 # 13035 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.512 2_14 - 355 HTH_26 PF13443.1 63 0.00018 15.4 0.0 1 1 2.4e-06 0.0004 14.3 0.0 5 33 304 333 300 341 0.78 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 1_82 - 742 KAP_NTPase PF07693.9 325 5.4e-70 229.5 0.0 1 1 4.7e-72 8e-70 229.0 0.0 1 325 27 334 27 334 0.96 # 58496 # 60721 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 2_14 - 355 HTH_17 PF12728.2 51 0.00044 14.2 0.0 1 1 6.7e-06 0.0011 12.9 0.0 3 30 311 338 310 348 0.84 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 4_2 - 138 zinc_ribbon_2 PF13240.1 23 0.0002 14.5 0.7 1 2 1.4e-05 0.0024 11.1 0.1 9 21 98 110 96 111 0.84 # 264 # 677 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 4_2 - 138 zinc_ribbon_2 PF13240.1 23 0.0002 14.5 0.7 2 2 0.015 2.6 1.4 0.0 13 22 124 135 121 136 0.72 # 264 # 677 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 5_12 - 186 TrmB PF01978.14 68 9.8e-05 15.7 0.0 1 1 1.1e-06 0.00019 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_8 - 109 Phage_terminase PF10668.4 60 0.00082 12.8 0.0 1 1 8.7e-06 0.0015 12.0 0.0 9 45 12 53 5 69 0.80 # 14080 # 14406 # -1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 2_14 - 355 DUF1670 PF07900.6 220 0.0025 10.7 0.0 1 1 2.4e-05 0.004 10.0 0.0 177 216 289 328 274 331 0.85 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 1_28 - 877 AAA_10 PF12846.2 304 9.5e-50 163.3 0.1 1 1 4.8e-51 1.7e-49 162.5 0.1 1 299 480 774 480 777 0.90 # 21178 # 23808 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 1_3 - 730 AAA_10 PF12846.2 304 2.4e-10 33.9 0.0 1 1 1.4e-10 4.9e-09 29.6 0.0 3 296 187 494 186 499 0.69 # 2318 # 4507 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 3_9 - 535 AAA_10 PF12846.2 304 2.6e-05 17.4 0.0 1 1 1.3e-06 4.4e-05 16.7 0.0 5 40 257 295 254 335 0.74 # 7061 # 8665 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 1_35 - 107 AAA_10 PF12846.2 304 0.00039 13.6 0.0 1 2 0.017 0.59 3.1 0.0 273 289 25 41 11 54 0.80 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 1_35 - 107 AAA_10 PF12846.2 304 0.00039 13.6 0.0 2 2 0.00035 0.012 8.7 0.0 2 24 73 95 72 100 0.87 # 26197 # 26517 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 3_11 - 319 AAA_10 PF12846.2 304 0.0004 13.5 0.0 1 1 1.5e-05 0.0005 13.2 0.0 3 37 116 152 114 230 0.80 # 9752 # 10708 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.413 5_12 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 7.3e-06 19.4 0.1 1 2 0.016 1.4 2.5 0.0 33 52 8 27 6 28 0.90 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 5_12 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 7.3e-06 19.4 0.1 2 2 1.8e-05 0.0016 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 7518 # 8075 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_1 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 2.5e-05 17.7 0.0 1 2 0.0015 0.12 5.9 0.0 24 47 102 125 97 125 0.89 # 264 # 1241 # 1 # ID=3_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 3_1 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 2.5e-05 17.7 0.0 2 2 0.00013 0.011 9.2 0.1 19 58 210 259 185 262 0.79 # 264 # 1241 # 1 # ID=3_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 1_83 - 403 Dimerisation PF08100.6 51 0.00076 13.0 0.2 1 1 2.9e-05 0.005 10.4 0.0 16 47 29 65 27 66 0.80 # 60758 # 61966 # -1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.451 1_58 - 188 RrnaAD PF00398.15 262 1e-08 28.2 0.0 1 1 7.6e-11 1.3e-08 27.8 0.0 9 113 29 128 24 148 0.89 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_58 - 188 Methyltransf_18 PF12847.2 112 7.5e-10 33.1 0.0 1 1 9.4e-12 1.6e-09 32.0 0.0 4 109 53 146 50 148 0.89 # 42054 # 42617 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_69 - 228 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.0019 12.4 0.3 1 2 0.0014 0.24 5.7 0.1 77 93 52 68 2 70 0.76 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_69 - 228 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.0019 12.4 0.3 2 2 0.0085 1.5 3.1 0.0 5 53 172 219 168 226 0.74 # 48293 # 48976 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 1_88 - 658 AAA_13 PF13166.1 712 1.1e-18 60.6 0.9 1 3 0.00096 0.16 3.9 0.3 61 129 24 96 6 108 0.75 # 64388 # 66361 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_88 - 658 AAA_13 PF13166.1 712 1.1e-18 60.6 0.9 2 3 1e-06 0.00017 13.7 0.6 158 390 60 328 53 331 0.59 # 64388 # 66361 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_88 - 658 AAA_13 PF13166.1 712 1.1e-18 60.6 0.9 3 3 2.2e-15 3.7e-13 42.4 0.0 460 572 320 434 254 454 0.77 # 64388 # 66361 # -1 # ID=1_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 4_13 - 1045 AAA_11 PF13086.1 236 8.5e-05 15.8 4.7 1 1 1.1e-06 0.00019 14.7 0.0 2 75 257 327 256 346 0.82 # 8073 # 11207 # -1 # ID=4_13;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.607 1_56 - 176 SSB PF00436.20 104 1.3e-40 131.1 0.3 1 1 9.9e-43 1.7e-40 130.8 0.3 1 101 6 109 6 112 0.95 # 40621 # 41148 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.576 2_7 - 297 HTH_21 PF13276.1 60 6.5e-18 58.2 4.7 1 1 4.2e-19 1.4e-17 57.1 4.7 2 60 47 104 45 104 0.94 # 13193 # 14083 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.538 5_4 - 289 HTH_21 PF13276.1 60 2.7e-12 40.3 0.1 1 1 3.4e-13 1.2e-11 38.2 0.0 4 59 47 101 44 102 0.90 # 2646 # 3512 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.551 2_6 - 273 HTH_21 PF13276.1 60 2.1e-11 37.4 5.4 1 1 1.6e-12 5.3e-11 36.1 5.4 3 59 27 82 23 83 0.89 # 12217 # 13035 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.512 2_12 - 96 HTH_21 PF13276.1 60 1.8e-05 18.4 0.0 1 1 8.8e-07 3e-05 17.7 0.0 4 42 47 84 44 84 0.84 # 24960 # 25247 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 9_1 - 231 HTH_21 PF13276.1 60 0.00022 14.9 0.0 1 1 1.5e-05 0.00053 13.7 0.0 26 57 3 33 1 38 0.78 # 9 # 701 # -1 # ID=9_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 2_14 - 355 Phage_AlpA PF05930.7 51 0.00057 13.3 0.0 1 1 7.7e-06 0.0013 12.1 0.0 5 31 311 337 309 342 0.93 # 25771 # 26835 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.517 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/54c6430f-c06e-4e21-82ee-bc276163ba70 # Target file: checkm_output/bins/pm843/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm843/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/54c6430f-c06e-4e21-82ee-bc276163ba70 checkm_output/bins/pm843/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:16:09 2017 # [ok]