# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_33 - 156 MADF_DNA_bdg PF10545.4 85 0.00047 14.6 0.0 1 1 4.4e-06 0.0011 13.4 0.0 31 65 27 62 23 86 0.80 # 25462 # 25929 # 1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 5_13 - 426 K_oxygenase PF13434.1 341 7.8e-118 387.5 0.0 1 1 3.6e-120 9.4e-118 387.2 0.0 2 340 4 333 3 334 0.96 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 3_2 - 108 HTH_IclR PF09339.5 52 7.8e-09 29.3 0.1 1 1 3.3e-10 2.8e-08 27.5 0.1 13 51 27 65 23 66 0.93 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 HTH_IclR PF09339.5 52 1.2e-08 28.8 0.1 1 1 3.3e-10 2.8e-08 27.5 0.1 13 51 27 65 23 66 0.93 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 7_10 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 3.2e-05 17.7 0.2 1 1 1.4e-06 0.00012 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 5_3 - 275 ABC_tran PF00005.22 137 9.7e-30 97.9 0.0 1 1 2.2e-31 1.4e-29 97.4 0.0 1 136 22 169 22 170 0.89 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_10 - 487 ABC_tran PF00005.22 137 3.3e-11 37.9 0.3 1 1 1.6e-11 1e-09 33.1 0.3 8 134 33 235 29 237 0.53 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_13 - 713 ABC_tran PF00005.22 137 8e-07 23.7 0.5 1 2 0.0014 0.088 7.3 1.2 19 37 29 47 16 175 0.65 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_13 - 713 ABC_tran PF00005.22 137 8e-07 23.7 0.5 2 2 6.2e-05 0.004 11.7 0.0 87 136 398 452 283 453 0.74 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_18 - 742 ABC_tran PF00005.22 137 5.1e-05 17.8 0.0 1 1 3e-06 0.00019 16.0 0.0 5 36 40 71 37 88 0.89 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 3_27 - 353 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0024 10.7 0.0 1 2 0.072 19 -2.1 0.0 262 305 125 172 113 198 0.68 # 19212 # 20270 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.509 3_27 - 353 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0024 10.7 0.0 2 2 2.5e-05 0.0064 9.3 0.0 78 106 276 304 269 342 0.83 # 19212 # 20270 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.509 7_2 - 85 HTH_22 PF13309.1 64 1.5e-05 18.9 0.1 1 2 0.075 6.5 0.9 0.0 18 42 16 40 1 54 0.75 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 7_2 - 85 HTH_22 PF13309.1 64 1.5e-05 18.9 0.1 2 2 1.2e-06 0.0001 16.3 0.0 47 64 64 81 61 81 0.93 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 7_10 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 0.00073 13.6 1.5 1 1 3.5e-05 0.0031 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_2 - 119 HTH_22 PF13309.1 64 0.0017 12.4 0.0 1 1 6.1e-05 0.0053 10.8 0.0 28 64 8 39 1 39 0.80 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 6_13 - 296 rve_3 PF13683.1 67 1.9e-13 44.0 0.1 1 1 3.5e-15 4.6e-13 42.8 0.0 6 67 216 277 211 277 0.93 # 10133 # 11020 # 1 # ID=6_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 13_1 - 308 rve_3 PF13683.1 67 0.00055 13.7 0.8 1 1 1.1e-05 0.0015 12.4 0.2 2 67 233 295 232 295 0.76 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 1_31 - 353 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00032 14.4 0.0 1 1 7.9e-06 0.002 11.8 0.0 20 120 94 189 78 223 0.65 # 37711 # 38769 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 6_2 - 119 HTH_DeoR PF08220.7 57 0.0013 12.6 0.0 1 1 7.8e-06 0.002 11.9 0.0 5 36 9 39 7 50 0.80 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 2_29 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.1e-05 19.3 0.2 1 2 4.1e-06 0.00052 13.7 0.0 39 63 476 504 463 507 0.84 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_29 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.1e-05 19.3 0.2 2 2 0.0077 0.99 3.0 0.1 75 167 530 626 529 632 0.85 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 4_10 - 487 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00062 13.5 0.0 1 1 9.4e-06 0.0012 12.5 0.0 36 58 34 56 15 63 0.82 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 7_10 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.0017 12.8 0.6 1 1 4.3e-05 0.0055 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 13_1 - 308 HTH_40 PF14493.1 91 0.013 10.0 4.0 1 2 0.0003 0.039 8.5 0.7 8 44 2 38 1 99 0.71 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 13_1 - 308 HTH_40 PF14493.1 91 0.013 10.0 4.0 2 2 0.096 12 0.5 0.0 37 72 177 213 174 227 0.75 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 2_56 - 86 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.00039 14.6 0.3 1 1 1.8e-06 0.00046 14.4 0.3 112 155 40 83 30 85 0.85 # 45325 # 45582 # 1 # ID=2_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 13_1 - 308 HTH_38 PF13936.1 44 9.1e-14 45.1 4.0 1 2 6.1e-15 5.3e-13 42.6 0.7 15 44 2 31 1 31 0.95 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 13_1 - 308 HTH_38 PF13936.1 44 9.1e-14 45.1 4.0 2 2 0.032 2.7 1.9 0.1 29 39 91 101 69 103 0.84 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 6_2 - 119 HTH_38 PF13936.1 44 6.6e-08 26.3 0.1 1 1 1.9e-09 1.6e-07 25.1 0.1 5 42 2 39 2 39 0.94 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 7_10 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 8e-06 19.6 1.4 1 1 1.8e-07 1.5e-05 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 2_29 - 876 MobB PF03205.9 140 0.00065 13.7 0.2 1 2 5.4e-05 0.0069 10.3 0.0 4 37 483 515 481 523 0.79 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_29 - 876 MobB PF03205.9 140 0.00065 13.7 0.2 2 2 0.069 8.9 0.3 0.0 25 64 695 732 690 744 0.86 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_47 - 718 MobB PF03205.9 140 0.0024 11.8 0.0 1 1 5.1e-05 0.0066 10.4 0.0 7 34 192 219 188 225 0.89 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 1_27 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.5e-31 101.4 2.9 1 3 5.3e-17 1.4e-14 48.4 0.0 2 105 5 91 4 95 0.92 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.5e-31 101.4 2.9 2 3 5.5e-18 1.4e-15 51.6 0.3 208 314 145 248 107 249 0.86 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.5e-31 101.4 2.9 3 3 0.028 7.2 -0.0 0.0 92 128 413 455 374 528 0.75 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 3_2 - 108 HTH_34 PF13601.1 80 0.00065 14.0 0.0 1 1 8.3e-06 0.0011 13.3 0.0 2 47 18 65 17 72 0.89 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 HTH_34 PF13601.1 80 0.00066 14.0 0.0 1 1 8.3e-06 0.0011 13.3 0.0 2 47 18 65 17 72 0.89 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 3_2 - 108 MarR PF01047.17 59 0.0005 14.0 0.0 1 1 9.4e-06 0.0012 12.8 0.0 16 48 31 63 24 70 0.91 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 MarR PF01047.17 59 0.00051 14.0 0.0 1 1 9.4e-06 0.0012 12.8 0.0 16 48 31 63 24 70 0.91 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 6_13 - 296 Sigma54_DBD PF04552.8 160 0.0018 12.1 0.1 1 1 1.1e-05 0.0029 11.4 0.1 100 153 45 96 28 103 0.78 # 10133 # 11020 # 1 # ID=6_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 5_13 - 426 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 5.7e-18 59.9 0.0 1 2 2e-16 5.1e-14 47.0 0.0 78 200 93 218 64 221 0.87 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 426 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 5.7e-18 59.9 0.0 2 2 2.2e-05 0.0057 10.9 0.0 48 172 234 375 225 381 0.65 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 7_2 - 85 HTH_8 PF02954.14 42 4.4e-05 17.3 0.2 1 2 0.0079 2 2.3 0.1 2 12 12 22 11 23 0.86 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 7_2 - 85 HTH_8 PF02954.14 42 4.4e-05 17.3 0.2 2 2 4.5e-06 0.0011 12.7 0.0 19 37 60 78 56 81 0.86 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 9_3 - 226 TetR_N PF00440.18 47 9.1e-20 64.4 0.1 1 2 1.4e-20 1.8e-18 60.2 0.0 2 47 19 64 18 64 0.97 # 631 # 1308 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 9_3 - 226 TetR_N PF00440.18 47 9.1e-20 64.4 0.1 2 2 0.025 3.2 1.8 0.1 1 16 179 194 179 196 0.91 # 631 # 1308 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_45 - 86 TetR_N PF00440.18 47 0.0014 12.5 0.0 1 1 2.1e-05 0.0027 11.6 0.0 2 26 33 57 32 57 0.93 # 51053 # 51310 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_27 - 595 AAA_19 PF13245.1 76 3.8e-09 30.5 0.0 1 1 1e-09 5.2e-08 26.8 0.0 3 75 12 86 10 87 0.84 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 2_50 - 1757 AAA_19 PF13245.1 76 6.4e-07 23.4 3.1 1 1 2.2e-08 1.2e-06 22.5 0.3 7 76 981 1047 974 1047 0.74 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 4_10 - 487 AAA_19 PF13245.1 76 3e-05 18.0 0.0 1 1 1.3e-06 6.7e-05 16.9 0.0 9 37 35 62 30 74 0.84 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_9 - 418 AAA_19 PF13245.1 76 0.00093 13.2 0.0 1 1 4.6e-05 0.0024 11.9 0.0 20 48 125 152 123 182 0.82 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 4_18 - 742 AAA_19 PF13245.1 76 0.0015 12.6 0.0 1 1 7.1e-05 0.0037 11.3 0.0 10 50 46 85 38 86 0.82 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 2_2 - 389 CbiA PF01656.18 195 2.6e-36 119.1 0.0 1 1 2.7e-38 3.4e-36 118.7 0.0 2 194 110 339 109 340 0.80 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_9 - 418 CbiA PF01656.18 195 1.9e-22 73.8 0.0 1 1 2.2e-24 2.8e-22 73.3 0.0 1 178 117 348 117 365 0.73 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 13_1 - 308 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 9.5e-06 19.3 1.6 1 1 1.7e-06 0.00011 15.9 0.1 24 49 5 30 1 30 0.91 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 6_2 - 119 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 9.7e-05 16.1 0.0 1 1 2.5e-06 0.00016 15.4 0.0 31 47 22 38 9 39 0.92 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_10 - 335 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00037 14.2 0.0 1 1 1.4e-05 0.00087 13.0 0.0 28 51 175 198 173 200 0.94 # 13298 # 14302 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 2_16 - 230 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0007 13.3 0.0 1 1 2.2e-05 0.0014 12.4 0.0 26 48 169 191 159 194 0.84 # 10649 # 11338 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 10_4 - 229 Rep_3 PF01051.16 222 8.3e-41 134.2 0.1 1 1 7.3e-43 9.4e-41 134.0 0.1 8 213 3 216 1 222 0.93 # 3002 # 3688 # -1 # ID=10_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.451 6_4 - 326 Rep_3 PF01051.16 222 4.1e-33 109.0 0.1 1 1 4.3e-35 5.6e-33 108.6 0.1 3 214 10 265 8 271 0.90 # 2041 # 3018 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 6_13 - 296 rve PF00665.21 120 2e-26 86.7 0.1 1 1 7.9e-28 6.8e-26 85.0 0.0 2 119 125 239 124 240 0.97 # 10133 # 11020 # 1 # ID=6_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 13_1 - 308 rve PF00665.21 120 7.4e-17 55.9 0.0 1 1 1.3e-18 1.1e-16 55.2 0.0 4 120 155 261 152 261 0.93 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 14_1 - 181 rve PF00665.21 120 8.8e-13 42.7 0.1 1 2 0.029 2.5 2.5 0.0 78 102 27 49 5 54 0.83 # 3 # 545 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 14_1 - 181 rve PF00665.21 120 8.8e-13 42.7 0.1 2 2 2.4e-13 2.1e-11 38.3 0.0 9 118 75 181 70 181 0.89 # 3 # 545 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_9 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0019 11.8 0.2 1 2 0.00059 0.15 5.6 0.1 6 41 119 157 115 170 0.78 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0019 11.8 0.2 2 2 0.002 0.52 3.8 0.0 115 149 257 291 233 297 0.83 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 4_10 - 487 AAA_23 PF13476.1 202 5.7e-12 40.6 0.2 1 1 6.6e-14 5.7e-12 40.6 0.2 1 190 16 252 16 280 0.59 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_13 - 713 AAA_23 PF13476.1 202 6.5e-08 27.3 0.5 1 1 2.5e-09 2.1e-07 25.7 0.5 2 177 3 268 2 385 0.68 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 5_3 - 275 AAA_23 PF13476.1 202 2.8e-05 18.7 0.2 1 1 5.7e-07 4.9e-05 18.0 0.2 21 40 34 53 21 63 0.86 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_47 - 718 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0017 11.7 0.0 1 1 3.4e-05 0.0088 9.4 0.0 21 49 190 219 182 236 0.85 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 2_50 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 7.7e-44 143.8 14.3 1 2 3.3e-05 0.0017 12.2 4.1 7 147 420 552 416 562 0.82 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_50 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 7.7e-44 143.8 14.3 2 2 5.1e-43 2.7e-41 135.6 1.1 1 186 968 1156 968 1162 0.94 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_27 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 8.7e-05 16.4 0.3 1 2 7.3e-05 0.0038 11.1 0.0 4 66 6 66 4 90 0.72 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 8.7e-05 16.4 0.3 2 2 0.044 2.3 2.0 0.0 91 132 187 227 162 261 0.83 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 4_10 - 487 AAA_30 PF13604.1 196 0.0011 12.8 0.0 1 1 5.5e-05 0.0028 11.5 0.0 12 44 30 62 26 76 0.85 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 2_47 - 718 AAA_30 PF13604.1 196 0.0015 12.4 0.0 1 1 6.3e-05 0.0033 11.3 0.0 21 57 188 224 180 230 0.85 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 5_3 - 275 AAA_30 PF13604.1 196 0.0016 12.3 0.3 1 1 7.3e-05 0.0038 11.1 0.1 15 53 29 67 20 82 0.74 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 3_27 - 353 ATPgrasp_Ter PF15632.1 330 7.3e-130 426.7 0.0 1 1 3.2e-132 8.2e-130 426.5 0.0 1 329 4 344 4 345 0.98 # 19212 # 20270 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.509 4_10 - 487 SMC_N PF02463.14 220 6.3e-15 49.2 4.4 1 2 9.8e-10 8.4e-08 25.9 0.2 2 45 14 57 13 61 0.92 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 SMC_N PF02463.14 220 6.3e-15 49.2 4.4 2 2 3e-09 2.6e-07 24.3 0.2 135 208 176 279 123 289 0.69 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 SMC_N PF02463.14 220 5.7e-08 26.4 0.2 1 1 1.7e-09 1.4e-07 25.1 0.2 25 198 33 200 21 217 0.75 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_13 - 713 SMC_N PF02463.14 220 0.00057 13.4 0.0 1 2 0.0015 0.13 5.7 0.0 5 45 3 42 1 50 0.78 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_13 - 713 SMC_N PF02463.14 220 0.00057 13.4 0.0 2 2 0.0015 0.13 5.6 0.0 135 186 243 470 100 500 0.73 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 6_12 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 8.3e-13 42.4 1.0 1 1 3.9e-14 3.4e-12 40.5 1.0 1 74 1 87 1 88 0.85 # 9807 # 10133 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 7_2 - 85 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00015 16.0 0.1 1 1 2.8e-06 0.00024 15.3 0.1 15 44 52 80 38 84 0.78 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 14_1 - 181 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00042 14.5 0.5 1 1 1.1e-05 0.00093 13.4 0.5 4 51 6 58 4 64 0.79 # 3 # 545 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 13_1 - 308 GerE PF00196.14 58 7e-06 19.6 0.6 1 1 3.2e-07 2.8e-05 17.7 0.1 14 39 3 28 1 32 0.89 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 2_16 - 230 GerE PF00196.14 58 3.5e-05 17.3 0.1 1 1 1.1e-06 9.1e-05 16.0 0.0 14 57 165 208 160 209 0.90 # 10649 # 11338 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 6_2 - 119 GerE PF00196.14 58 0.00026 14.6 0.0 1 1 5.3e-06 0.00045 13.8 0.0 17 40 16 39 9 40 0.83 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 2_47 - 718 TraG-D_C PF12696.2 128 1.9e-20 67.3 0.0 1 1 1.3e-22 3.5e-20 66.4 0.0 1 127 419 541 419 542 0.86 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 14_1 - 181 DDE_3 PF13358.1 146 0.00097 13.1 0.0 1 2 0.076 19 -0.8 0.0 44 79 25 61 16 81 0.72 # 3 # 545 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 14_1 - 181 DDE_3 PF13358.1 146 0.00097 13.1 0.0 2 2 1.1e-05 0.0029 11.6 0.0 32 90 82 141 57 148 0.87 # 3 # 545 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_9 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.2e-11 38.4 0.1 1 2 2.8e-08 3.6e-06 20.4 0.1 2 39 116 156 115 170 0.78 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.2e-11 38.4 0.1 2 2 1.1e-06 0.00014 15.2 0.0 77 126 236 287 213 297 0.75 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_2 - 389 MipZ PF09140.6 261 1.1e-05 18.8 0.4 1 2 7e-06 0.00091 12.6 0.0 2 47 108 153 107 157 0.87 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_2 - 389 MipZ PF09140.6 261 1.1e-05 18.8 0.4 2 2 0.0023 0.29 4.4 0.0 88 134 224 270 197 292 0.84 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 4_8 - 421 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2.1e-34 113.2 0.2 1 1 1.7e-36 4.4e-34 112.1 0.0 6 213 128 362 123 362 0.96 # 3803 # 5065 # -1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 2_22 - 476 DivIC PF04977.10 80 0.0023 11.7 4.6 1 1 1.8e-05 0.0047 10.7 4.6 17 66 76 124 72 125 0.92 # 13859 # 15286 # 1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.570 13_1 - 308 Trp_repressor PF01371.14 88 0.0017 12.5 1.0 1 1 2.2e-05 0.0057 10.9 0.1 45 68 3 26 1 43 0.90 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 1_27 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.8e-08 28.2 0.0 1 3 0.00079 0.2 5.2 0.0 98 153 33 84 13 94 0.78 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.8e-08 28.2 0.0 2 3 0.0028 0.72 3.4 0.0 5 51 240 286 237 391 0.75 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.8e-08 28.2 0.0 3 3 5.2e-07 0.00013 15.6 0.0 136 196 497 563 412 567 0.81 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 4_10 - 487 AAA_21 PF13304.1 303 6.8e-24 79.5 10.4 1 1 1.6e-24 1.4e-22 75.2 7.0 1 297 38 268 38 272 0.66 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_21 PF13304.1 303 1.9e-17 58.4 0.0 1 2 3.8e-09 3.3e-07 24.7 0.0 1 25 34 62 34 99 0.77 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 5_3 - 275 AAA_21 PF13304.1 303 1.9e-17 58.4 0.0 2 2 2.5e-11 2.2e-09 31.9 0.0 232 298 137 200 106 202 0.84 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_13 - 713 AAA_21 PF13304.1 303 4.4e-08 27.6 0.2 1 2 2.1e-05 0.0018 12.5 0.0 7 69 29 104 27 211 0.64 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_13 - 713 AAA_21 PF13304.1 303 4.4e-08 27.6 0.2 2 2 2e-05 0.0017 12.6 0.1 219 298 386 487 302 489 0.75 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 3_14 - 99 Sigma70_r4 PF04545.11 50 8.6e-05 16.1 0.0 1 1 9.9e-07 0.00013 15.5 0.0 3 42 9 48 8 49 0.84 # 9489 # 9785 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 13_1 - 308 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.03 7.9 4.6 1 1 0.00011 0.014 9.0 0.1 20 43 7 30 4 34 0.84 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 2_27 - 74 zf-dskA_traR PF01258.12 36 4.4e-15 49.4 3.4 1 1 2.5e-17 6.5e-15 48.9 3.4 5 36 35 67 30 67 0.91 # 16960 # 17181 # 1 # ID=2_27;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_10 - 335 Phage_CI_repr PF07022.8 66 1.8e-06 22.2 0.0 1 1 1.4e-08 3.7e-06 21.2 0.0 7 50 168 244 164 256 0.92 # 13298 # 14302 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 4_10 - 487 AAA PF00004.24 132 2.2e-07 25.4 0.1 1 2 0.00025 0.032 8.7 0.0 3 21 41 59 39 105 0.80 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA PF00004.24 132 2.2e-07 25.4 0.1 2 2 6.5e-06 0.00084 13.8 0.2 39 114 208 274 173 288 0.80 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_31 - 353 AAA PF00004.24 132 0.00056 14.4 0.0 1 1 9.4e-06 0.0012 13.3 0.0 1 74 99 178 99 237 0.73 # 37711 # 38769 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 13_1 - 308 KorB PF08535.5 93 1.9e-06 22.3 0.3 1 1 1.9e-08 4.8e-06 20.9 0.1 1 26 5 30 5 44 0.87 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 2_18 - 122 CTP_transf_2 PF01467.21 157 0.002 12.4 0.0 1 1 8.5e-06 0.0022 12.3 0.0 32 67 7 41 2 98 0.65 # 11865 # 12230 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 3_14 - 99 HTH_37 PF13744.1 80 3.8e-08 27.3 0.0 1 1 2.1e-10 5.3e-08 26.9 0.0 23 76 18 70 10 73 0.92 # 9489 # 9785 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 3_2 - 108 Rrf2 PF02082.15 83 0.00096 13.5 0.0 1 1 3.7e-05 0.0048 11.3 0.0 17 58 25 65 18 67 0.87 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 Rrf2 PF02082.15 83 0.001 13.4 0.0 1 1 3.7e-05 0.0048 11.3 0.0 17 58 25 65 18 67 0.87 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 13_1 - 308 HTH_27 PF13463.1 68 0.00059 14.4 0.1 1 1 8.2e-05 0.011 10.4 0.0 18 41 7 30 3 33 0.90 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 3_33 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.0009 13.8 0.3 1 2 7.3e-05 0.0095 10.6 0.0 1 44 3 48 3 49 0.87 # 25462 # 25929 # 1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 3_33 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.0009 13.8 0.3 2 2 0.074 9.5 0.9 0.1 17 42 112 138 106 149 0.81 # 25462 # 25929 # 1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 3_10 - 272 TIGR01394 TIGR01394 594 0.0031 9.6 0.0 1 1 1.6e-05 0.0042 9.2 0.0 366 424 108 166 103 180 0.79 # 6552 # 7367 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 6_13 - 296 rve_2 PF13333.1 52 5.3e-08 27.1 0.0 1 1 4.2e-10 1.1e-07 26.1 0.0 1 44 230 276 230 283 0.88 # 10133 # 11020 # 1 # ID=6_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_15 - 346 Hydantoinase_A PF01968.13 290 5.9e-08 26.3 0.8 1 2 1.2e-06 0.0003 14.2 0.2 72 101 186 214 177 222 0.82 # 17408 # 18445 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 1_15 - 346 Hydantoinase_A PF01968.13 290 5.9e-08 26.3 0.8 2 2 1.4e-05 0.0036 10.6 0.0 195 275 258 332 231 344 0.78 # 17408 # 18445 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 2_2 - 389 MerR_1 PF13411.1 69 0.00092 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.0027 11.7 0.0 2 44 41 88 40 105 0.75 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 4_18 - 742 cobW PF02492.14 178 0.0012 12.6 0.1 1 1 7.7e-06 0.002 11.8 0.1 2 23 48 71 47 82 0.78 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 2_47 - 718 AAA_16 PF13191.1 185 1.2e-05 19.6 0.0 1 1 7.8e-07 5e-05 17.6 0.0 21 60 182 222 179 263 0.81 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 4_18 - 742 AAA_16 PF13191.1 185 5.1e-05 17.5 3.0 1 1 5.9e-06 0.00038 14.7 1.1 24 175 46 225 36 233 0.49 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 4_10 - 487 AAA_16 PF13191.1 185 0.00056 14.2 0.0 1 2 0.00015 0.0095 10.2 0.0 27 46 39 58 34 67 0.87 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_16 PF13191.1 185 0.00056 14.2 0.0 2 2 0.069 4.4 1.5 0.0 138 166 215 243 186 276 0.74 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_16 PF13191.1 185 0.00056 14.2 0.2 1 1 2.1e-05 0.0014 12.9 0.0 12 63 22 73 15 91 0.72 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 3_27 - 353 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00017 15.7 0.0 1 2 0.044 11 0.0 0.0 110 144 76 112 40 118 0.76 # 19212 # 20270 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.509 3_27 - 353 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00017 15.7 0.0 2 2 5.8e-06 0.0015 12.7 0.0 2 86 115 231 114 239 0.84 # 19212 # 20270 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.509 4_10 - 487 AAA_22 PF13401.1 131 1.1e-06 23.1 0.0 1 2 7.9e-05 0.02 9.3 0.0 6 27 38 59 34 90 0.84 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_22 PF13401.1 131 1.1e-06 23.1 0.0 2 2 2.1e-05 0.0054 11.1 0.1 69 121 209 265 163 274 0.75 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 2_2 - 389 HTH_AraC PF00165.18 42 0.0023 12.1 0.0 1 1 1.8e-05 0.0046 11.1 0.0 4 26 35 57 33 62 0.81 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_27 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 9.9e-55 179.8 1.3 1 2 1.1e-33 2.8e-31 102.4 0.4 5 404 7 377 4 382 0.83 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 9.9e-55 179.8 1.3 2 2 2.7e-25 6.9e-23 74.6 0.0 497 610 450 563 412 575 0.76 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 7_2 - 85 NUMOD1 PF07453.8 37 0.00056 14.0 0.0 1 1 3.3e-06 0.00084 13.5 0.0 19 37 62 80 62 80 0.94 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 4_10 - 487 AAA_29 PF13555.1 62 3.1e-10 33.7 0.1 1 2 1.3e-10 1.6e-08 28.2 0.0 15 51 29 64 14 67 0.82 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_29 PF13555.1 62 3.1e-10 33.7 0.1 2 2 0.012 1.6 2.7 0.1 25 41 356 372 343 375 0.83 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_29 PF13555.1 62 1.9e-06 21.6 0.2 1 1 3.4e-08 4.4e-06 20.4 0.2 18 44 28 53 13 62 0.83 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_44 - 941 Orn_Arg_deC_N PF02784.11 251 0.0063 9.9 2.8 1 1 1.3e-05 0.0035 10.8 0.1 171 211 610 649 599 679 0.80 # 29025 # 31847 # 1 # ID=2_44;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 6_2 - 119 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 0.00056 13.8 0.0 1 1 3.6e-06 0.00093 13.1 0.0 12 44 9 41 2 43 0.92 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 4_10 - 487 MutS_V PF00488.16 235 3.3e-05 17.6 1.1 1 2 2.9e-05 0.0075 9.9 0.1 37 67 32 60 6 63 0.78 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 MutS_V PF00488.16 235 3.3e-05 17.6 1.1 2 2 0.00063 0.16 5.5 0.1 117 177 222 281 209 301 0.73 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 7_2 - 85 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 2.5e-05 18.2 0.1 1 1 4.4e-07 3.8e-05 17.6 0.0 9 42 54 83 48 84 0.86 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 7_10 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00024 15.0 0.0 1 1 5.8e-06 0.0005 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_6 - 286 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.0027 11.6 0.0 1 1 7.1e-05 0.0061 10.5 0.0 65 106 26 67 20 71 0.84 # 3704 # 4561 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 6_8 - 370 adh_short PF00106.20 167 0.0018 12.5 0.1 1 1 2.4e-05 0.0063 10.7 0.1 3 49 4 48 2 175 0.83 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 13_1 - 308 HTH_32 PF13565.1 77 1.3e-08 29.8 0.2 1 1 1.5e-10 1.3e-08 29.8 0.2 1 75 23 101 23 103 0.83 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 14_1 - 181 HTH_32 PF13565.1 77 1.9e-06 22.9 0.2 1 1 1.1e-07 9.3e-06 20.7 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 3 # 545 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 7_2 - 85 HTH_32 PF13565.1 77 0.00033 15.7 4.0 1 1 1.5e-05 0.0013 13.8 4.0 7 77 22 80 17 80 0.68 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_27 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.7e-17 55.2 7.6 1 4 3.4e-07 8.8e-05 14.6 0.0 12 67 19 71 11 80 0.87 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.7e-17 55.2 7.6 2 4 2.4e-10 6.1e-08 25.1 0.0 376 457 194 275 190 285 0.83 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.7e-17 55.2 7.6 3 4 0.016 4.1 -0.9 0.2 240 287 418 468 386 487 0.75 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.7e-17 55.2 7.6 4 4 1.8e-07 4.7e-05 15.5 0.2 781 812 533 564 493 568 0.80 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 3_2 - 108 GntR PF00392.16 64 0.0012 12.6 0.2 1 1 1.9e-05 0.0024 11.6 0.0 22 62 31 70 21 72 0.88 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 GntR PF00392.16 64 0.0012 12.6 0.2 1 1 1.9e-05 0.0024 11.6 0.0 22 62 31 70 21 72 0.88 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 3_14 - 99 HTH_3 PF01381.17 55 1.8e-16 54.0 0.0 1 1 2.3e-18 3e-16 53.3 0.0 5 53 22 70 21 71 0.97 # 9489 # 9785 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 7_2 - 85 HTH_3 PF01381.17 55 0.00052 14.1 1.0 1 1 7.3e-06 0.00094 13.3 1.0 2 31 50 81 40 82 0.89 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 4_8 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 8.3e-27 87.6 3.5 1 2 0.0052 1.3 1.2 0.0 11 42 5 36 3 62 0.72 # 3803 # 5065 # -1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 4_8 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 8.3e-27 87.6 3.5 2 2 1.5e-28 3.8e-26 85.4 2.2 137 438 122 418 41 420 0.82 # 3803 # 5065 # -1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 6_8 - 370 Epimerase PF01370.16 236 4.6e-12 40.1 0.0 1 1 2.7e-14 7e-12 39.5 0.0 2 174 5 195 4 255 0.70 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 13_1 - 308 HTH_23 PF13384.1 50 7.8e-11 35.6 0.5 1 2 1.5e-09 3.6e-08 27.2 0.1 13 42 3 32 1 39 0.86 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 13_1 - 308 HTH_23 PF13384.1 50 7.8e-11 35.6 0.5 2 2 0.085 2 2.5 0.0 14 28 72 86 66 90 0.82 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 6_2 - 119 HTH_23 PF13384.1 50 1.6e-07 25.1 0.1 1 1 1.3e-08 3e-07 24.2 0.1 9 39 9 39 8 40 0.92 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 14_1 - 181 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-05 19.0 0.8 1 1 1.4e-05 0.00034 14.5 0.1 28 42 41 55 40 63 0.87 # 3 # 545 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 7_2 - 85 HTH_23 PF13384.1 50 1.7e-05 18.7 0.1 1 1 7.1e-07 1.7e-05 18.7 0.1 10 39 49 81 45 82 0.82 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 15_2 - 55 HTH_23 PF13384.1 50 3.2e-05 17.8 0.0 1 1 1.7e-06 4e-05 17.5 0.0 7 40 16 49 14 53 0.93 # 241 # 405 # -1 # ID=15_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 7_10 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 0.00011 16.0 0.3 1 1 4.9e-06 0.00011 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_12 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 0.00012 16.0 1.1 1 1 2.8e-05 0.00067 13.6 0.3 5 42 10 55 8 66 0.84 # 9807 # 10133 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 3_14 - 99 HTH_23 PF13384.1 50 0.00018 15.4 0.0 1 1 1.1e-05 0.00026 14.9 0.0 15 37 24 46 17 58 0.87 # 9489 # 9785 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 4_23 - 264 HTH_23 PF13384.1 50 0.00074 13.4 0.1 1 1 7.7e-05 0.0018 12.2 0.1 24 43 161 180 161 188 0.79 # 18700 # 19491 # 1 # ID=4_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 9_3 - 226 HTH_23 PF13384.1 50 0.0023 11.9 0.2 1 1 0.00053 0.012 9.5 0.0 10 35 22 51 14 64 0.75 # 631 # 1308 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 3_2 - 108 HTH_23 PF13384.1 50 0.0023 11.9 0.0 1 1 0.00093 0.022 8.8 0.0 11 40 26 55 16 61 0.80 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 1_9 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00024 14.6 0.0 1 2 2.7e-06 0.00068 13.1 0.0 7 58 122 176 116 201 0.79 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00024 14.6 0.0 2 2 0.1 26 -1.9 0.0 30 65 324 358 321 391 0.61 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 7_2 - 85 HTH_7 PF02796.10 45 1e-16 54.8 1.2 1 1 1.8e-18 1.1e-16 54.7 0.3 1 44 39 82 39 83 0.98 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 7_10 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 6e-13 42.7 1.1 1 1 2.1e-14 1.3e-12 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_2 - 119 HTH_7 PF02796.10 45 4e-06 20.9 0.2 1 1 1.2e-07 7.9e-06 20.0 0.2 7 42 3 38 1 40 0.91 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 2_16 - 230 HTH_7 PF02796.10 45 1.6e-05 19.0 0.1 1 1 6e-07 3.9e-05 17.7 0.1 11 37 159 185 128 188 0.87 # 10649 # 11338 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 3_14 - 99 HTH_19 PF12844.2 64 1.9e-11 38.1 0.0 1 1 1.1e-13 2.8e-11 37.6 0.0 7 55 21 69 20 71 0.95 # 9489 # 9785 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 4_18 - 742 NB-ARC PF00931.17 287 0.0034 10.4 0.9 1 1 6.6e-05 0.017 8.2 0.9 17 110 44 205 30 219 0.72 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 6_8 - 370 NAD_binding_10 PF13460.1 183 3.6e-06 21.3 0.0 1 1 1.6e-06 0.00042 14.6 0.0 2 148 5 193 4 204 0.70 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 13_1 - 308 HTH_29 PF13551.1 112 6.8e-08 26.9 2.5 1 1 2.2e-09 1.4e-07 25.9 0.3 6 106 2 101 1 105 0.79 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 7_2 - 85 HTH_29 PF13551.1 112 0.00021 15.7 1.6 1 2 0.003 0.2 6.1 1.0 33 70 20 56 14 59 0.64 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 7_2 - 85 HTH_29 PF13551.1 112 0.00021 15.7 1.6 2 2 0.00023 0.015 9.8 0.0 7 34 55 81 50 82 0.87 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 6_2 - 119 HTH_29 PF13551.1 112 0.00026 15.4 0.0 1 1 6.9e-06 0.00045 14.6 0.0 8 34 14 39 8 51 0.84 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 7_10 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00027 15.3 0.6 1 2 0.098 6.3 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 7_10 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00027 15.3 0.6 2 2 4.1e-05 0.0026 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 5_13 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 9e-09 29.5 0.0 1 3 5.8e-08 1.5e-05 19.1 0.0 3 155 10 151 7 152 0.68 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 9e-09 29.5 0.0 2 3 0.02 5.2 1.1 0.0 2 31 186 214 185 229 0.79 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 9e-09 29.5 0.0 3 3 0.00086 0.22 5.5 0.0 116 155 287 332 254 333 0.73 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 4_10 - 487 G-alpha PF00503.15 389 0.00069 12.6 0.1 1 2 3.4e-05 0.0087 8.9 0.0 63 86 41 64 33 86 0.89 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 G-alpha PF00503.15 389 0.00069 12.6 0.1 2 2 0.0077 2 1.2 0.3 98 191 163 296 135 326 0.53 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_14 - 734 Plug PF07715.10 108 1.2e-19 65.0 2.2 1 1 4.8e-22 1.2e-19 64.9 0.6 3 107 45 146 43 147 0.94 # 13144 # 15345 # 1 # ID=5_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.546 14_1 - 181 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.1e-12 40.5 0.3 1 1 1.4e-14 3.6e-12 40.3 0.3 5 132 10 144 6 173 0.87 # 3 # 545 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 4_10 - 487 Arch_ATPase PF01637.13 234 2.7e-07 24.7 0.7 1 2 2.1e-05 0.0028 11.6 0.0 7 41 24 57 19 71 0.87 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 Arch_ATPase PF01637.13 234 2.7e-07 24.7 0.7 2 2 4e-05 0.0051 10.7 0.4 103 163 212 267 143 287 0.87 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_18 - 742 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0014 12.6 0.1 1 1 0.00012 0.015 9.2 0.1 20 51 46 80 38 235 0.75 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_27 - 595 PhoH PF02562.11 205 8e-07 22.7 0.5 1 1 8.8e-08 2.3e-05 17.9 0.5 6 177 5 246 2 258 0.76 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_31 - 353 AAA_5 PF07728.9 139 6.3e-34 110.9 0.0 1 1 3.9e-36 1e-33 110.3 0.0 1 139 98 238 98 238 0.96 # 37711 # 38769 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 2_47 - 718 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 5.5e-150 493.5 0.0 1 1 5.2e-152 6.7e-150 493.2 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 2_29 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1e-06 21.8 0.1 1 2 4.8e-08 6.2e-06 19.2 0.0 15 53 479 517 470 547 0.80 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_29 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1e-06 21.8 0.1 2 2 0.041 5.2 -0.3 0.0 261 317 713 769 684 772 0.92 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_2 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 1.1e-07 25.3 0.1 1 2 5.2e-06 0.00067 13.0 0.0 3 37 108 142 106 145 0.93 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_2 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 1.1e-07 25.3 0.1 2 2 3.1e-05 0.004 10.4 0.0 104 145 227 268 215 340 0.81 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_9 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 2.5e-06 20.9 0.1 1 2 7.8e-06 0.001 12.4 0.1 2 39 115 155 114 185 0.85 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 2.5e-06 20.9 0.1 2 2 0.00049 0.063 6.5 0.0 103 143 251 291 226 382 0.85 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 4_10 - 487 TIGR00611 TIGR00611 365 0.0018 11.4 1.0 1 1 1.1e-05 0.0027 10.8 0.0 21 45 33 58 13 63 0.73 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 7_2 - 85 HTH_psq PF05225.11 45 9.3e-05 16.2 0.0 1 1 7.5e-07 0.00019 15.2 0.0 21 39 64 82 63 84 0.91 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 15_2 - 55 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 4.3e-32 103.6 0.3 1 1 1.9e-34 4.8e-32 103.4 0.3 1 46 6 51 6 51 0.99 # 241 # 405 # -1 # ID=15_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 5_3 - 275 DUF258 PF03193.11 161 0.00065 13.1 0.1 1 1 4.8e-06 0.0012 12.3 0.1 26 67 22 64 3 70 0.79 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_29 - 876 DUF87 PF01935.12 229 2.9e-07 24.7 0.0 1 1 3.3e-09 8.4e-07 23.2 0.0 26 222 482 669 468 676 0.77 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 13_1 - 308 HTH_28 PF13518.1 52 6.8e-06 20.3 0.6 1 2 8.3e-06 0.00036 14.8 0.1 8 35 3 30 1 38 0.91 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 13_1 - 308 HTH_28 PF13518.1 52 6.8e-06 20.3 0.6 2 2 0.054 2.3 2.6 0.0 21 31 91 101 90 111 0.91 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 7_2 - 85 HTH_28 PF13518.1 52 2.4e-05 18.6 2.4 1 1 7.7e-07 3.3e-05 18.1 0.1 9 34 56 81 48 82 0.83 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 15_2 - 55 HTH_28 PF13518.1 52 5.6e-05 17.4 0.0 1 1 1.6e-06 6.9e-05 17.1 0.0 4 35 18 49 16 53 0.91 # 241 # 405 # -1 # ID=15_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.497 14_1 - 181 HTH_28 PF13518.1 52 0.0001 16.6 1.2 1 1 1e-05 0.00044 14.5 1.2 22 36 40 54 12 55 0.75 # 3 # 545 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 7_10 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.00035 14.8 0.0 1 1 2.5e-05 0.0011 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_2 - 119 HTH_28 PF13518.1 52 0.0011 13.3 0.1 1 1 5.5e-05 0.0024 12.2 0.1 14 34 19 39 8 40 0.74 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 7_2 - 85 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.00037 14.6 0.1 1 1 3.6e-06 0.00046 14.2 0.1 28 56 55 81 29 84 0.75 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 9_3 - 226 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.002 12.1 0.0 1 1 2.3e-05 0.003 11.6 0.0 22 77 24 73 5 79 0.76 # 631 # 1308 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 3_2 - 108 HTH_24 PF13412.1 48 5.7e-06 19.9 0.0 1 2 2.8e-06 0.00012 15.7 0.0 16 48 31 63 21 63 0.89 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 3_2 - 108 HTH_24 PF13412.1 48 5.7e-06 19.9 0.0 2 2 0.048 2.1 2.1 0.0 5 28 80 104 76 107 0.76 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 HTH_24 PF13412.1 48 2.4e-05 17.9 0.0 1 1 2.8e-06 0.00012 15.7 0.0 16 48 31 63 21 63 0.89 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 3_14 - 99 HTH_24 PF13412.1 48 3.5e-05 17.4 0.0 1 1 1.4e-06 5.9e-05 16.7 0.0 14 36 23 45 17 46 0.86 # 9489 # 9785 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 13_1 - 308 HTH_24 PF13412.1 48 0.00057 13.5 0.2 1 1 3.8e-05 0.0016 12.1 0.2 19 40 9 30 2 30 0.92 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 1_10 - 335 HTH_24 PF13412.1 48 0.0012 12.4 0.7 1 1 0.00039 0.017 8.8 0.2 14 39 170 195 165 197 0.87 # 13298 # 14302 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 6_2 - 119 HTH_24 PF13412.1 48 0.0022 11.7 0.0 1 1 0.00011 0.0046 10.6 0.0 21 39 21 39 20 40 0.94 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 7_2 - 85 HTH_30 PF13556.1 59 0.00094 13.0 0.0 1 1 5.5e-06 0.0014 12.5 0.0 5 34 52 81 49 82 0.91 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_15 - 346 TIGR03534 TIGR03534 253 0.0009 12.7 0.0 1 1 6.2e-06 0.0016 11.8 0.0 80 128 290 337 280 341 0.85 # 17408 # 18445 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 7_2 - 85 HTH_10 PF04967.7 53 4.9e-06 20.3 0.2 1 2 0.015 3.9 1.4 0.1 3 18 22 37 21 52 0.70 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 7_2 - 85 HTH_10 PF04967.7 53 4.9e-06 20.3 0.2 2 2 2.5e-07 6.5e-05 16.7 0.0 27 45 63 81 60 83 0.93 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 5_13 - 426 TIGR01292 TIGR01292 300 0.0022 10.7 0.0 1 2 0.0001 0.027 7.2 0.0 57 111 97 152 91 157 0.80 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 426 TIGR01292 TIGR01292 300 0.0022 10.7 0.0 2 2 0.013 3.3 0.3 0.0 141 178 181 222 178 232 0.65 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_3 - 275 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00095 13.4 0.5 1 1 6.3e-06 0.0016 12.6 0.5 2 21 35 54 34 199 0.75 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_27 - 595 DEAD PF00270.24 169 7.8e-05 16.5 0.7 1 1 3.8e-06 0.00098 12.9 0.7 4 105 8 107 5 222 0.77 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 3_14 - 99 HTH_31 PF13560.1 64 1.1e-08 29.4 0.0 1 1 1.6e-10 1.4e-08 29.2 0.0 5 56 17 67 13 81 0.86 # 9489 # 9785 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 2_2 - 389 HTH_31 PF13560.1 64 0.00033 15.1 0.4 1 1 1.1e-05 0.00098 13.6 0.2 12 45 37 69 31 73 0.87 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 13_1 - 308 HTH_31 PF13560.1 64 0.0017 12.8 0.2 1 1 7.7e-05 0.0066 10.9 0.2 13 33 6 26 4 32 0.92 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 1_27 - 595 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.2e-12 41.3 0.0 1 1 4e-14 5.2e-12 40.1 0.0 47 103 496 562 450 563 0.79 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 2_50 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.7e-07 25.6 0.6 1 2 0.026 3.3 2.2 0.0 6 44 1227 1265 1223 1295 0.74 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_50 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.7e-07 25.6 0.6 2 2 4.7e-08 6e-06 20.6 0.1 3 102 1341 1444 1339 1446 0.82 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_9 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00065 13.3 0.0 1 2 0.00072 0.19 5.4 0.1 24 38 40 54 40 55 0.89 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00065 13.3 0.0 2 2 0.00036 0.092 6.4 0.0 17 37 53 73 52 76 0.85 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 6_2 - 119 HTH_36 PF13730.1 55 0.00083 13.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.0015 12.9 0.0 28 47 20 39 3 40 0.88 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_9 - 418 HTH_36 PF13730.1 55 0.002 12.5 0.1 1 1 5.1e-05 0.0066 10.9 0.0 28 52 52 76 31 79 0.91 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_15 - 346 StbA PF06406.6 318 2.3e-132 434.9 0.7 1 1 1e-134 2.7e-132 434.7 0.7 1 317 22 340 22 341 0.98 # 17408 # 18445 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 4_10 - 487 NACHT PF05729.7 166 7e-06 20.0 0.0 1 2 9.8e-06 0.0013 12.7 0.0 3 40 39 77 37 91 0.77 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 NACHT PF05729.7 166 7e-06 20.0 0.0 2 2 0.0022 0.29 5.0 0.0 73 112 219 251 176 293 0.74 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_18 - 742 NACHT PF05729.7 166 2.2e-05 18.4 1.3 1 2 2.4e-05 0.003 11.4 0.0 2 32 48 78 47 86 0.84 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 4_18 - 742 NACHT PF05729.7 166 2.2e-05 18.4 1.3 2 2 0.0041 0.53 4.2 0.0 48 99 478 541 461 582 0.81 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 4_18 - 742 UPF0079 PF02367.12 123 0.00089 13.1 0.0 1 1 7.9e-06 0.002 12.0 0.0 10 42 41 73 31 81 0.84 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 2_47 - 718 AAA_17 PF13207.1 121 0.00076 14.6 0.0 1 1 2.9e-05 0.0025 12.9 0.0 3 27 189 217 187 284 0.70 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 4_10 - 487 AAA_17 PF13207.1 121 0.001 14.1 0.0 1 1 4.9e-05 0.0042 12.2 0.0 3 26 40 67 39 154 0.85 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_18 - 742 AAA_17 PF13207.1 121 0.0027 12.8 0.1 1 1 0.0001 0.0087 11.1 0.1 1 43 48 94 48 284 0.87 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 5_3 - 275 TIGR02211 TIGR02211 221 1.1e-24 81.1 0.0 1 1 1.7e-26 1.5e-24 80.7 0.0 19 212 20 211 6 220 0.84 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_10 - 487 TIGR02211 TIGR02211 221 5e-07 23.4 1.1 1 2 1.1e-06 9.2e-05 16.0 0.0 21 60 25 65 12 74 0.79 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 TIGR02211 TIGR02211 221 5e-07 23.4 1.1 2 2 0.0029 0.25 4.7 0.1 141 213 207 280 186 287 0.80 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_13 - 713 TIGR02211 TIGR02211 221 2.2e-05 18.0 0.0 1 1 5.8e-07 5e-05 16.8 0.0 127 203 406 489 393 507 0.77 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 3_36 - 214 Bd3614-deam PF14439.1 136 0.00029 15.0 0.1 1 1 1.6e-06 0.00042 14.4 0.1 3 68 47 112 45 122 0.77 # 27053 # 27694 # 1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 4_10 - 487 AAA_25 PF13481.1 194 0.00057 13.6 0.0 1 1 1.5e-05 0.0013 12.4 0.0 30 58 33 61 22 85 0.81 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_27 - 595 AAA_25 PF13481.1 194 0.00089 12.9 0.0 1 1 5.3e-05 0.0046 10.6 0.0 17 63 3 46 1 62 0.78 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 5_3 - 275 AAA_25 PF13481.1 194 0.0023 11.6 0.5 1 1 6.5e-05 0.0056 10.3 0.1 30 57 29 56 22 86 0.85 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_27 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-08 26.7 0.1 1 3 0.0057 0.73 3.5 0.0 2 21 20 39 19 91 0.63 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-08 26.7 0.1 2 3 0.0086 1.1 2.9 0.0 40 135 167 261 132 297 0.74 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-08 26.7 0.1 3 3 5.6e-07 7.2e-05 16.6 0.0 174 232 485 562 400 563 0.67 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 2_50 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0019 11.9 0.0 1 2 0.00067 0.086 6.5 0.0 1 23 988 1011 988 1188 0.79 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_50 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0019 11.9 0.0 2 2 0.012 1.6 2.4 0.0 167 234 1380 1447 1334 1447 0.64 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 4_10 - 487 AAA_15 PF13175.1 415 7.2e-15 49.1 18.2 1 2 1e-09 1.3e-07 25.2 0.1 2 47 15 61 14 118 0.81 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_15 PF13175.1 415 7.2e-15 49.1 18.2 2 2 9e-11 1.2e-08 28.7 10.1 286 411 149 269 137 273 0.72 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_15 PF13175.1 415 5.1e-07 23.2 0.0 1 2 2.9e-05 0.0038 10.5 0.0 23 42 33 52 18 86 0.82 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 5_3 - 275 AAA_15 PF13175.1 415 5.1e-07 23.2 0.0 2 2 2.4e-05 0.0031 10.8 0.0 370 410 159 199 150 201 0.91 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_29 - 876 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0022 11.5 0.0 1 1 2.3e-05 0.0059 10.1 0.0 7 38 473 504 469 519 0.85 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 4_10 - 487 AAA_14 PF13173.1 128 1.5e-05 19.2 0.0 1 2 0.00016 0.04 8.1 0.0 5 27 39 61 36 79 0.84 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_14 PF13173.1 128 1.5e-05 19.2 0.0 2 2 0.00014 0.035 8.2 0.1 50 102 218 273 172 298 0.67 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 2_2 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00017 14.9 0.1 1 2 0.00028 0.072 6.3 0.0 4 42 109 147 107 154 0.91 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_2 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00017 14.9 0.1 2 2 0.0003 0.077 6.2 0.1 84 139 235 290 222 312 0.77 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 7_4 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 2.8e-24 79.3 0.2 1 1 4.6e-26 6e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 3491 # 4495 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 10_3 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 2.8e-24 79.3 0.2 1 1 4.6e-26 6e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 1425 # 2429 # 1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 6_8 - 370 3Beta_HSD PF01073.14 280 1.4e-08 27.9 0.0 1 1 8.7e-11 2.2e-08 27.3 0.0 1 158 5 175 5 196 0.75 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 6_2 - 119 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00032 14.1 0.0 1 1 3.1e-06 0.0008 12.9 0.0 31 49 21 39 20 40 0.90 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 2_2 - 389 MerR PF00376.18 38 9.8e-07 22.6 0.0 1 1 1.8e-08 2.3e-06 21.4 0.0 1 28 41 68 41 74 0.95 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 6_2 - 119 MerR PF00376.18 38 0.0023 11.8 3.0 1 2 0.00027 0.035 8.0 0.1 4 21 22 39 19 49 0.84 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 6_2 - 119 MerR PF00376.18 38 0.0023 11.8 3.0 2 2 0.0054 0.7 3.8 0.7 14 22 90 98 89 110 0.69 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 5_3 - 275 AAA_33 PF13671.1 143 2e-05 18.7 0.1 1 1 3.3e-07 8.6e-05 16.7 0.1 3 33 36 81 34 202 0.61 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 7_2 - 85 CENP-B_N PF04218.8 53 2.1e-06 21.3 0.1 1 1 1.3e-08 3.3e-06 20.7 0.1 17 43 54 80 48 84 0.92 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 4_11 - 197 PaaX PF07848.7 70 0.00091 13.5 0.0 1 1 6.7e-06 0.0017 12.6 0.0 15 68 23 80 13 82 0.77 # 8091 # 8681 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.648 5_3 - 275 SbcCD_C PF13558.1 90 1.7e-06 22.1 0.0 1 1 4.7e-08 1.2e-05 19.4 0.0 26 89 135 185 118 186 0.79 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_47 - 718 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.8e-09 30.9 0.0 1 1 3.9e-11 5e-09 29.4 0.0 264 361 382 476 198 500 0.83 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 2_29 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00053 12.8 0.0 1 2 0.0031 0.4 3.3 0.0 105 184 533 606 470 625 0.82 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_29 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00053 12.8 0.0 2 2 0.00021 0.028 7.2 0.0 319 378 711 769 662 771 0.90 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_31 - 353 AAA_2 PF07724.9 171 1.2e-05 19.5 0.0 1 1 1.1e-07 2.9e-05 18.3 0.0 5 83 98 177 95 184 0.74 # 37711 # 38769 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 4_10 - 487 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00011 16.2 0.2 1 2 0.00039 0.1 6.5 0.0 4 22 41 59 39 72 0.83 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00011 16.2 0.2 2 2 0.00029 0.074 7.0 0.3 86 147 219 282 203 295 0.77 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 6_16 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 8.7e-76 246.5 1.5 1 1 1.1e-77 9.6e-76 246.4 1.5 7 131 1 125 1 125 1.00 # 11813 # 12190 # 1 # ID=6_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 15_1 - 65 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.4e-38 126.2 0.5 1 1 1.7e-40 1.5e-38 126.1 0.5 7 71 1 65 1 65 0.99 # 2 # 196 # -1 # ID=15_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 2_1 - 64 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3e-33 108.9 3.2 1 1 3.8e-35 3.3e-33 108.8 3.2 69 131 1 63 1 63 0.99 # 3 # 194 # 1 # ID=2_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.495 4_2 - 108 RP-C PF03428.8 177 7.1e-05 16.6 0.0 1 1 1.4e-06 0.00018 15.2 0.0 76 103 38 64 36 71 0.87 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 3_2 - 108 RP-C PF03428.8 177 7.2e-05 16.5 0.0 1 1 1.4e-06 0.00018 15.2 0.0 76 103 38 64 36 71 0.87 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 14_1 - 181 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 3.5e-42 138.0 0.0 1 1 5.8e-44 5e-42 137.4 0.0 4 108 75 181 73 181 0.98 # 3 # 545 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 11_1 - 120 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 3.1e-20 66.8 0.0 1 1 4.3e-22 3.7e-20 66.6 0.0 58 139 12 97 5 98 0.89 # 55 # 414 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.511 6_13 - 296 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.4e-08 29.0 0.0 1 1 2.6e-10 2.3e-08 28.4 0.0 2 137 130 267 129 269 0.92 # 10133 # 11020 # 1 # ID=6_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 3_14 - 99 HTH_26 PF13443.1 63 6.6e-06 20.6 0.0 1 1 4.4e-08 1.1e-05 19.8 0.0 7 55 23 70 20 70 0.92 # 9489 # 9785 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 4_10 - 487 TIGR00634 TIGR00634 563 0.00085 12.2 0.2 1 2 0.00025 0.065 6.0 0.0 1 43 13 57 13 60 0.88 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 TIGR00634 TIGR00634 563 0.00085 12.2 0.2 2 2 0.00093 0.24 4.1 0.0 444 511 211 278 198 311 0.80 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_18 - 742 KAP_NTPase PF07693.9 325 3.6e-72 237.3 0.0 1 1 2.1e-74 5.3e-72 236.7 0.0 1 325 27 334 27 334 0.96 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 6_2 - 119 HTH_17 PF12728.2 51 0.00069 14.1 1.4 1 2 1.5e-05 0.004 11.7 0.0 6 41 22 56 20 65 0.77 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 6_2 - 119 HTH_17 PF12728.2 51 0.00069 14.1 1.4 2 2 0.028 7.3 1.2 0.4 14 34 88 109 82 116 0.81 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 6_8 - 370 NAD_binding_4 PF07993.7 249 2.4e-53 174.8 0.0 1 1 1.1e-55 3e-53 174.5 0.0 1 248 6 237 6 238 0.94 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 3_33 - 156 HTH_11 PF08279.7 55 7.9e-06 19.7 0.0 1 1 3.9e-07 1.7e-05 18.7 0.0 4 42 9 49 6 62 0.82 # 25462 # 25929 # 1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 6_2 - 119 HTH_11 PF08279.7 55 4.5e-05 17.3 0.0 1 1 2.1e-06 9e-05 16.4 0.0 18 37 20 39 5 40 0.80 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 7_2 - 85 HTH_11 PF08279.7 55 0.00017 15.5 0.1 1 1 2.3e-05 0.00097 13.0 0.0 20 37 64 81 60 82 0.91 # 189 # 443 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 13_1 - 308 HTH_11 PF08279.7 55 0.00038 14.4 0.5 1 2 0.00021 0.0088 10.0 0.1 18 37 10 29 1 30 0.82 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 13_1 - 308 HTH_11 PF08279.7 55 0.00038 14.4 0.5 2 2 0.078 3.4 1.7 0.0 24 36 91 103 89 104 0.88 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 3_2 - 108 HTH_11 PF08279.7 55 0.0009 13.2 0.1 1 1 7.3e-05 0.0031 11.4 0.0 3 43 19 60 17 65 0.88 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 HTH_11 PF08279.7 55 0.0009 13.2 0.1 1 1 7.3e-05 0.0031 11.4 0.0 3 43 19 60 17 65 0.88 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 6_2 - 119 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.00062 13.7 0.0 1 1 3.8e-06 0.00098 13.1 0.0 143 174 9 40 2 52 0.86 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 3_2 - 108 MarR_2 PF12802.2 62 3.6e-07 24.1 0.0 1 1 1.2e-08 6.2e-07 23.3 0.0 7 55 18 66 9 71 0.85 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 MarR_2 PF12802.2 62 3.8e-07 24.0 0.0 1 1 1.2e-08 6.2e-07 23.3 0.0 7 55 18 66 9 71 0.85 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 13_1 - 308 MarR_2 PF12802.2 62 8e-05 16.6 0.1 1 2 3.8e-05 0.002 12.1 0.1 23 44 9 30 1 31 0.85 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 13_1 - 308 MarR_2 PF12802.2 62 8e-05 16.6 0.1 2 2 0.063 3.3 1.8 0.0 23 39 77 93 60 95 0.87 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 3_14 - 99 MarR_2 PF12802.2 62 9.6e-05 16.3 0.0 1 1 2.8e-06 0.00014 15.7 0.0 15 41 22 46 7 46 0.83 # 9489 # 9785 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 3_33 - 156 MarR_2 PF12802.2 62 0.00062 13.7 0.1 1 1 3.3e-05 0.0017 12.3 0.1 11 47 13 48 5 49 0.84 # 25462 # 25929 # 1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 3_2 - 108 HTH_5 PF01022.15 47 5.1e-10 33.2 1.4 1 2 2.7e-11 3.5e-09 30.5 0.0 1 46 15 63 15 64 0.94 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 3_2 - 108 HTH_5 PF01022.15 47 5.1e-10 33.2 1.4 2 2 0.04 5.1 1.2 0.4 6 19 78 94 73 106 0.73 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 HTH_5 PF01022.15 47 8.9e-10 32.4 1.5 1 2 2.7e-11 3.5e-09 30.5 0.0 1 46 15 63 15 64 0.94 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 4_2 - 108 HTH_5 PF01022.15 47 8.9e-10 32.4 1.5 2 2 0.075 9.7 0.3 0.4 6 18 78 93 73 95 0.77 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 3_2 - 108 TrmB PF01978.14 68 1.7e-06 21.9 0.0 1 1 3.6e-08 3.1e-06 21.1 0.0 14 65 22 75 20 80 0.82 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 TrmB PF01978.14 68 1.8e-06 21.9 0.0 1 1 3.6e-08 3.1e-06 21.1 0.0 14 65 22 75 20 80 0.82 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 7_10 - 186 TrmB PF01978.14 68 0.00014 15.8 0.0 1 1 3.4e-06 0.00029 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 6_2 - 119 LacI PF00356.16 46 0.00069 13.5 0.0 1 1 5.9e-06 0.0015 12.4 0.0 2 34 20 52 19 62 0.91 # 939 # 1295 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 3_27 - 353 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.7e-26 87.3 0.0 1 2 0.065 17 -0.7 0.0 101 154 40 76 21 95 0.57 # 19212 # 20270 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.509 3_27 - 353 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.7e-26 87.3 0.0 2 2 3.2e-28 8.2e-26 85.1 0.0 2 182 114 293 113 296 0.93 # 19212 # 20270 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.509 1_9 - 418 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00042 14.4 0.0 1 1 8.1e-06 0.001 13.1 0.0 21 57 42 78 28 88 0.88 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 3_14 - 99 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00073 13.6 0.0 1 1 1e-05 0.0013 12.8 0.0 28 48 26 46 20 47 0.93 # 9489 # 9785 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 13_1 - 308 Phage_terminase PF10668.4 60 0.0015 12.6 1.4 1 2 0.00018 0.046 7.8 0.0 23 40 8 25 3 53 0.89 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 13_1 - 308 Phage_terminase PF10668.4 60 0.0015 12.6 1.4 2 2 0.0074 1.9 2.6 0.1 24 44 274 294 268 296 0.86 # 138 # 1061 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 1_8 - 894 AAA_10 PF12846.2 304 2.2e-65 215.3 0.0 1 1 7.4e-67 3.2e-65 214.7 0.0 1 303 456 812 456 813 0.93 # 5530 # 8211 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 2_29 - 876 AAA_10 PF12846.2 304 1e-48 160.6 0.0 1 1 4e-50 1.7e-48 159.8 0.0 1 294 479 768 479 774 0.88 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_47 - 718 AAA_10 PF12846.2 304 3.3e-10 34.1 0.0 1 1 1.4e-10 6.2e-09 29.9 0.0 3 296 187 494 186 499 0.69 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 4_10 - 487 AAA_10 PF12846.2 304 0.00023 14.9 0.1 1 2 0.00011 0.0046 10.6 0.0 3 22 38 57 36 66 0.87 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_10 PF12846.2 304 0.00023 14.9 0.1 2 2 0.049 2.1 1.9 0.0 212 262 222 269 204 277 0.83 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_10 PF12846.2 304 0.00047 13.9 1.4 1 1 6e-05 0.0026 11.4 1.0 4 34 35 65 32 158 0.89 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_27 - 595 AAA_10 PF12846.2 304 0.00068 13.3 0.2 1 1 7e-05 0.003 11.2 0.0 1 25 16 40 16 49 0.80 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 3_2 - 108 HTH_20 PF12840.2 61 2.1e-18 60.2 0.0 1 1 7.3e-20 3.1e-18 59.6 0.0 3 61 6 69 4 69 0.93 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 4_2 - 108 HTH_20 PF12840.2 61 2.1e-18 60.2 0.0 1 1 7.3e-20 3.1e-18 59.6 0.0 3 61 6 69 4 69 0.93 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 7_10 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 5.2e-06 20.5 0.2 1 2 0.022 0.96 3.6 0.0 33 52 8 27 4 28 0.91 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 7_10 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 5.2e-06 20.5 0.2 2 2 5.5e-05 0.0023 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 8972 # 9529 # -1 # ID=7_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 3_33 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00015 15.8 0.4 1 2 0.00013 0.0056 10.8 0.0 19 50 17 48 7 49 0.91 # 25462 # 25929 # 1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 3_33 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00015 15.8 0.4 2 2 0.055 2.3 2.4 0.1 7 20 108 121 103 142 0.72 # 25462 # 25929 # 1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.496 6_4 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.0002 15.4 0.0 1 2 0.0044 0.19 5.9 0.0 24 47 102 125 97 125 0.89 # 2041 # 3018 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 6_4 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.0002 15.4 0.0 2 2 0.0021 0.089 6.9 0.1 19 58 213 259 185 262 0.77 # 2041 # 3018 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 9_3 - 226 HTH_20 PF12840.2 61 0.00062 13.8 0.1 1 1 0.00011 0.0046 11.0 0.0 21 46 30 55 18 63 0.85 # 631 # 1308 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 3_8 - 103 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 1.7e-05 19.1 2.3 1 2 2.6e-05 0.0066 10.8 0.4 15 37 6 27 2 35 0.65 # 5016 # 5324 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 3_8 - 103 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 1.7e-05 19.1 2.3 2 2 0.00017 0.043 8.2 0.1 36 53 44 61 34 68 0.71 # 5016 # 5324 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_27 - 595 UvrD_C PF13361.1 351 4.4e-42 139.0 0.0 1 1 3.1e-44 8.1e-42 138.1 0.0 2 348 254 564 253 567 0.86 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 4_13 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 2.3e-26 86.7 0.0 1 3 2.5e-11 3.2e-09 30.0 0.0 15 125 20 147 10 163 0.76 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_13 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 2.3e-26 86.7 0.0 2 3 7.5e-06 0.00097 11.9 0.0 240 390 195 383 187 387 0.60 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_13 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 2.3e-26 86.7 0.0 3 3 4.9e-15 6.3e-13 42.2 0.0 461 572 376 489 309 509 0.77 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 5_3 - 275 AAA_13 PF13166.1 712 0.0031 10.2 0.1 1 2 0.0015 0.2 4.2 0.2 23 36 39 52 28 65 0.83 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 5_3 - 275 AAA_13 PF13166.1 712 0.0031 10.2 0.1 2 2 0.0021 0.27 3.8 0.0 529 572 161 202 151 209 0.90 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_2 - 108 RPA_C PF08784.6 102 0.00026 15.6 0.0 1 1 4.9e-06 0.00064 14.4 0.0 60 95 27 62 18 65 0.90 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 3_2 - 108 RPA_C PF08784.6 102 0.00027 15.6 0.1 1 1 4.9e-06 0.00064 14.4 0.0 60 95 27 62 18 65 0.90 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 1_9 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.6e-09 31.4 0.8 1 2 0.015 2 1.6 0.0 214 274 14 76 6 87 0.78 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.6e-09 31.4 0.8 2 2 4.9e-10 6.3e-08 26.2 0.1 8 136 122 269 115 274 0.80 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_2 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.5e-06 20.1 0.4 1 2 3.3e-06 0.00043 13.6 0.1 9 36 115 142 109 151 0.89 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_2 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.5e-06 20.1 0.4 2 2 0.0022 0.29 4.3 0.0 123 136 231 244 221 251 0.84 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_2 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 2.5e-09 31.5 0.0 1 2 2.7e-08 3.5e-06 21.3 0.0 2 49 108 155 107 195 0.91 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_2 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 2.5e-09 31.5 0.0 2 2 0.00036 0.046 7.9 0.1 110 152 227 268 223 272 0.84 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_9 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 4.6e-08 27.4 0.2 1 2 1.9e-07 2.4e-05 18.5 0.0 9 128 123 270 121 292 0.83 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 4.6e-08 27.4 0.2 2 2 0.0018 0.23 5.6 0.1 14 89 299 381 284 410 0.72 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 7_6 - 272 Pterin_bind PF00809.17 210 1.9e-59 194.7 0.0 1 1 9.1e-62 2.3e-59 194.5 0.0 1 209 10 216 10 217 0.98 # 5183 # 5998 # 1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 5_13 - 426 FMO-like PF00743.14 532 7.1e-06 18.6 0.0 1 2 3.9e-06 0.001 11.5 0.0 142 200 143 198 95 219 0.87 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 426 FMO-like PF00743.14 532 7.1e-06 18.6 0.0 2 2 0.00035 0.09 5.1 0.0 317 342 319 344 311 377 0.81 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 6_8 - 370 KR PF08659.5 181 0.0018 12.2 0.0 1 1 1.3e-05 0.0034 11.3 0.0 4 49 5 51 3 101 0.75 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 4_2 - 108 RNA_pol_Rpc34 PF05158.7 327 0.0019 11.6 0.0 1 1 2e-05 0.0026 11.2 0.0 72 132 3 64 1 70 0.91 # 608 # 931 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 3_2 - 108 RNA_pol_Rpc34 PF05158.7 327 0.0019 11.6 0.0 1 1 2e-05 0.0026 11.2 0.0 72 132 3 64 1 70 0.91 # 607 # 930 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.438 2_50 - 1757 AAA_11 PF13086.1 236 0.00024 15.0 1.5 1 1 3.2e-06 0.00084 13.2 0.0 2 72 969 1036 968 1063 0.82 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 3_5 - 166 Ribosomal_L20 PF00453.13 108 0.00047 14.3 0.1 1 1 3.1e-06 0.00079 13.6 0.1 45 98 67 121 47 128 0.87 # 3362 # 3859 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 2_5 - 180 SSB PF00436.20 104 7.2e-41 132.6 0.4 1 1 7e-43 9.1e-41 132.2 0.4 1 101 6 109 6 112 0.96 # 4002 # 4541 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_29 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0013 12.8 0.1 1 2 6.7e-05 0.0086 10.2 0.1 2 83 8 87 7 94 0.74 # 36238 # 36615 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 1_29 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0013 12.8 0.1 2 2 0.066 8.5 0.6 0.0 43 60 92 109 88 112 0.83 # 36238 # 36615 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 5_13 - 426 Lycopene_cycl PF05834.7 374 7.1e-05 16.0 0.0 1 1 4.5e-07 0.00012 15.3 0.0 1 144 6 157 6 182 0.73 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 6_13 - 296 HTH_21 PF13276.1 60 1.8e-18 60.6 3.5 1 1 1.6e-20 4.1e-18 59.5 3.5 2 60 46 103 44 103 0.94 # 10133 # 11020 # 1 # ID=6_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/ac50f6e4-f1db-4480-af1c-030bf6d9ff6c # Target file: checkm_output/bins/pm839/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm839/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/ac50f6e4-f1db-4480-af1c-030bf6d9ff6c checkm_output/bins/pm839/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:16:07 2017 # [ok]