# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_79 - 357 KaiC PF06745.8 227 0.00013 15.1 0.0 1 1 9.9e-07 0.00021 14.4 0.0 12 52 150 189 127 196 0.78 # 61291 # 62361 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 1_35 - 91 HTH_IclR PF09339.5 52 6e-06 19.8 0.0 1 1 1.6e-07 1.1e-05 18.9 0.0 4 43 9 47 8 49 0.92 # 21112 # 21384 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 2_5 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 2.6e-05 17.7 0.2 1 1 1.4e-06 9.6e-05 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 3210 # 3767 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 10_1 - 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372 TIGR00420 TIGR00420 351 0.0021 10.5 0.0 2 2 0.0073 1.5 1.1 0.0 192 223 274 305 245 313 0.89 # 2553 # 3668 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 11_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.6e-52 171.2 0.0 1 1 1.1e-54 2.2e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 64 # 768 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_25 - 183 HTH_26 PF13443.1 63 0.00019 15.6 0.1 1 2 0.0022 0.46 4.7 0.0 9 48 53 91 45 92 0.86 # 14394 # 14942 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_25 - 183 HTH_26 PF13443.1 63 0.00019 15.6 0.1 2 2 0.00018 0.037 8.2 0.0 39 56 163 180 155 182 0.92 # 14394 # 14942 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_54 - 95 HTH_17 PF12728.2 51 9.9e-12 38.9 0.0 1 1 1.2e-13 1.2e-11 38.6 0.0 1 50 22 72 22 73 0.94 # 37481 # 37765 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.698 1_93 - 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