# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 22_2 - 91 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 1.4e-21 70.2 12.6 1 1 2.6e-23 1.9e-21 69.8 12.6 1 36 1 35 1 35 0.99 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 5_4 - 91 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 5.1e-21 68.4 13.7 1 1 9.9e-23 7.5e-21 67.9 13.7 1 36 1 35 1 35 0.99 # 1731 # 2003 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 6_11 - 91 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 7.2e-20 64.7 9.8 1 1 1.4e-21 1e-19 64.2 9.8 1 36 1 35 1 35 0.99 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 14_5 - 63 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 8.3e-11 35.7 0.2 1 1 1.4e-12 1.1e-10 35.4 0.2 1 35 1 35 1 36 0.99 # 2605 # 2793 # 1 # ID=14_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 12_4 - 754 TruB_N PF01509.13 149 0.00081 14.0 0.0 1 1 5.3e-06 0.0016 13.1 0.0 20 103 10 99 7 114 0.81 # 2316 # 4577 # 1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 6_12 - 120 HTH_IclR PF09339.5 52 8.1e-07 23.1 0.1 1 1 1.5e-08 1.5e-06 22.2 0.1 15 40 14 39 13 40 0.95 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 19_2 - 90 HTH_IclR PF09339.5 52 3.5e-05 17.8 0.1 1 1 5e-07 5e-05 17.3 0.1 18 46 27 55 18 57 0.86 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 20_2 - 82 HTH_IclR PF09339.5 52 0.0016 12.5 0.0 1 1 2.7e-05 0.0027 11.8 0.0 10 42 2 34 1 36 0.88 # 240 # 485 # -1 # ID=20_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.451 8_3 - 260 ABC_tran PF00005.22 137 0.00043 15.1 0.3 1 1 2.4e-05 0.0036 12.1 0.0 8 30 99 121 93 136 0.86 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 20_4 - 107 ABC_tran PF00005.22 137 0.00068 14.4 0.0 1 1 7.5e-06 0.0011 13.7 0.0 8 29 60 81 54 87 0.86 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 1_47 - 149 HTH_22 PF13309.1 64 0.00011 16.4 0.0 1 2 0.04 12 0.3 0.0 27 38 37 48 26 58 0.82 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 1_47 - 149 HTH_22 PF13309.1 64 0.00011 16.4 0.0 2 2 4.2e-06 0.0013 13.0 0.0 48 63 127 142 125 143 0.92 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 6_12 - 120 HTH_35 PF13693.1 78 0.001 13.4 0.0 1 1 5.6e-06 0.0017 12.6 0.0 10 37 12 39 8 58 0.89 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 6_12 - 120 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00015 15.8 0.1 1 1 2.1e-06 0.00032 14.7 0.0 18 36 18 36 12 40 0.91 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 19_2 - 90 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00076 13.5 0.0 1 1 7.9e-06 0.0012 12.9 0.0 18 35 28 45 21 50 0.90 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 17_1 - 399 HHH_5 PF14520.1 60 0.00033 15.3 2.9 1 3 0.095 29 -0.5 0.3 27 51 126 149 107 151 0.61 # 357 # 1553 # 1 # ID=17_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 17_1 - 399 HHH_5 PF14520.1 60 0.00033 15.3 2.9 2 3 0.00011 0.032 8.9 0.1 16 58 182 227 174 229 0.84 # 357 # 1553 # 1 # ID=17_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 17_1 - 399 HHH_5 PF14520.1 60 0.00033 15.3 2.9 3 3 0.0028 0.85 4.4 0.0 7 22 278 293 255 317 0.76 # 357 # 1553 # 1 # ID=17_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 19_4 - 85 rve_3 PF13683.1 67 1.7e-19 63.6 0.0 1 1 8.5e-21 2.1e-19 63.3 0.0 5 67 2 64 1 64 0.97 # 2403 # 2657 # -1 # ID=19_4;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 50_2 - 85 rve_3 PF13683.1 67 1.7e-19 63.6 0.0 1 1 8.5e-21 2.1e-19 63.3 0.0 5 67 2 64 1 64 0.97 # 139 # 393 # -1 # ID=50_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 51_2 - 85 rve_3 PF13683.1 67 1.7e-19 63.6 0.0 1 1 8.5e-21 2.1e-19 63.3 0.0 5 67 2 64 1 64 0.97 # 139 # 393 # -1 # ID=51_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 11_7 - 94 rve_3 PF13683.1 67 2.2e-19 63.2 0.0 1 1 1.2e-20 3e-19 62.8 0.0 3 67 13 77 12 77 0.98 # 2294 # 2575 # -1 # ID=11_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.514 4_2 - 273 rve_3 PF13683.1 67 2.7e-19 63.0 0.2 1 1 2.5e-20 6.2e-19 61.8 0.2 2 67 194 260 193 260 0.98 # 323 # 1141 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 17_3 - 96 rve_3 PF13683.1 67 4.6e-19 62.2 0.0 1 1 2.4e-20 6e-19 61.9 0.0 4 67 23 84 20 84 0.94 # 2372 # 2659 # -1 # ID=17_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.503 6_10 - 195 rve_3 PF13683.1 67 1.1e-17 57.8 0.0 1 1 6.7e-19 1.7e-17 57.2 0.0 4 67 121 185 118 185 0.96 # 6770 # 7354 # 1 # ID=6_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 42_1 - 207 rve_3 PF13683.1 67 1.8e-13 44.3 0.0 1 1 1.1e-14 2.8e-13 43.7 0.0 6 67 127 188 122 188 0.93 # 43 # 663 # -1 # ID=42_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 26_3 - 89 rve_3 PF13683.1 67 1.1e-10 35.4 0.0 1 1 5.5e-12 1.4e-10 35.1 0.0 15 67 24 78 14 78 0.92 # 1039 # 1305 # -1 # ID=26_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.509 24_2 - 391 rve_3 PF13683.1 67 4.4e-07 23.8 0.1 1 1 4.7e-08 1.2e-06 22.5 0.1 9 52 219 263 215 268 0.93 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 38_2 - 258 rve_3 PF13683.1 67 3.1e-06 21.1 0.0 1 1 5.2e-07 1.3e-05 19.1 0.0 2 36 216 250 215 258 0.85 # 187 # 960 # 1 # ID=38_2;partial=01;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.562 8_2 - 248 rve_3 PF13683.1 67 0.00081 13.4 0.2 1 1 0.00011 0.0028 11.7 0.1 6 65 127 194 122 195 0.87 # 136 # 879 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.546 10_4 - 416 Sigma54_activat PF00158.21 168 1.4e-08 28.9 0.0 1 2 4.4e-08 3.3e-06 21.1 0.0 1 56 142 197 142 209 0.94 # 3452 # 4699 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 10_4 - 416 Sigma54_activat PF00158.21 168 1.4e-08 28.9 0.0 2 2 0.0046 0.34 4.8 0.1 89 153 211 264 203 279 0.61 # 3452 # 4699 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 8_3 - 260 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00035 14.5 0.1 1 1 2.9e-05 0.0022 11.9 0.1 18 55 98 135 82 205 0.71 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 24_3 - 266 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.001 13.0 0.1 1 1 0.00062 0.046 7.6 0.1 19 42 94 117 82 191 0.79 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 20_4 - 107 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.0014 12.6 0.0 1 1 3.1e-05 0.0023 11.9 0.0 18 42 59 83 42 97 0.77 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 1_17 - 107 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 4.7e-06 20.6 0.0 1 1 3.7e-08 5.6e-06 20.4 0.0 20 66 52 100 35 103 0.79 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_20 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3.1e-05 18.0 0.1 1 2 4.1e-06 0.00061 13.7 0.0 39 63 476 504 463 507 0.84 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_20 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3.1e-05 18.0 0.1 2 2 0.022 3.2 1.6 0.0 75 166 530 625 529 636 0.80 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 19_2 - 90 HTH_40 PF14493.1 91 7.7e-06 20.6 0.0 1 1 6.1e-08 9.1e-06 20.3 0.0 10 63 24 77 19 88 0.88 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 6_12 - 120 HTH_40 PF14493.1 91 7.7e-05 17.4 0.0 1 1 6.1e-07 9.1e-05 17.1 0.0 4 35 8 39 5 76 0.89 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 6_12 - 120 HTH_38 PF13936.1 44 6.3e-12 39.4 0.5 1 1 8.1e-13 3.5e-11 37.0 0.1 6 41 3 38 2 40 0.94 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 19_2 - 90 HTH_38 PF13936.1 44 1.5e-07 25.3 0.0 1 1 5.3e-09 2.3e-07 24.8 0.0 17 38 24 45 19 50 0.87 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 24_2 - 391 HTH_38 PF13936.1 44 1.3e-06 22.4 0.1 1 1 7.9e-08 3.4e-06 21.0 0.1 5 42 2 39 2 39 0.94 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 34_1 - 338 HTH_38 PF13936.1 44 0.00015 15.8 0.0 1 1 8.1e-06 0.00035 14.6 0.0 7 41 27 61 23 62 0.92 # 3 # 1016 # -1 # ID=34_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 36_3 - 96 HTH_38 PF13936.1 44 0.00092 13.2 0.0 1 1 3.3e-05 0.0014 12.7 0.0 11 39 36 65 31 66 0.88 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_47 - 149 HTH_38 PF13936.1 44 0.0013 12.8 0.0 1 1 0.0001 0.0044 11.1 0.0 13 41 114 142 102 142 0.85 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 1_9 - 230 HTH_38 PF13936.1 44 0.0019 12.3 0.0 1 1 0.00014 0.0058 10.7 0.0 15 36 164 185 157 185 0.90 # 5826 # 6515 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 19_2 - 90 SpoIIID PF12116.3 82 3.1e-05 18.3 0.0 1 1 1.7e-07 5.1e-05 17.7 0.0 17 38 25 46 19 60 0.90 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 1_20 - 876 MobB PF03205.9 140 0.00075 13.7 0.2 1 2 2.7e-05 0.0081 10.3 0.0 4 37 483 515 481 523 0.79 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_20 - 876 MobB PF03205.9 140 0.00075 13.7 0.2 2 2 0.034 10 0.3 0.0 25 64 695 732 690 744 0.86 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 7_1 - 950 UvrD-helicase PF00580.16 315 2.2e-10 34.7 0.6 1 2 3.6e-05 0.011 9.5 0.0 9 34 135 160 128 166 0.77 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 UvrD-helicase PF00580.16 315 2.2e-10 34.7 0.6 2 2 3.8e-09 1.1e-06 22.5 0.1 253 296 311 354 284 358 0.87 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 4_5 - 305 MarR PF01047.17 59 0.00032 14.9 0.0 1 1 4.5e-06 0.00068 13.8 0.0 25 42 27 44 25 45 0.94 # 2048 # 2962 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 36_3 - 96 MarR PF01047.17 59 0.00042 14.5 0.0 1 1 4.5e-06 0.00068 13.8 0.0 8 37 37 66 31 66 0.85 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 3_4 - 534 TBPIP PF07106.8 169 0.00042 14.4 3.4 1 1 3e-06 0.00091 13.2 3.4 74 142 16 84 4 98 0.86 # 2350 # 3951 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 10_4 - 416 HTH_8 PF02954.14 42 1.1e-11 38.6 0.7 1 1 1.1e-13 1.1e-11 38.6 0.7 2 42 366 406 365 406 0.97 # 3452 # 4699 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 28_2 - 117 HTH_8 PF02954.14 42 5e-05 17.3 0.5 1 1 9.5e-07 9.5e-05 16.4 0.5 12 39 61 87 57 88 0.83 # 331 # 681 # -1 # ID=28_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_47 - 149 HTH_8 PF02954.14 42 0.018 9.1 5.3 1 2 0.013 1.3 3.2 0.7 1 12 73 84 73 85 0.90 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 1_47 - 149 HTH_8 PF02954.14 42 0.018 9.1 5.3 2 2 0.0012 0.12 6.4 0.0 24 37 127 140 124 142 0.91 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 19_2 - 90 TetR_N PF00440.18 47 0.00015 15.9 0.0 1 1 3.4e-06 0.00025 15.1 0.0 15 37 26 48 25 49 0.91 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 20_2 - 82 TetR_N PF00440.18 47 0.00093 13.3 0.0 1 1 6.1e-05 0.0046 11.1 0.0 19 36 13 30 12 32 0.94 # 240 # 485 # -1 # ID=20_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.451 1_47 - 149 TetR_N PF00440.18 47 0.00096 13.3 0.0 1 1 4.3e-05 0.0033 11.6 0.0 20 36 125 141 123 147 0.91 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 6_12 - 120 TetR_N PF00440.18 47 0.0013 12.9 0.1 1 1 6.4e-05 0.0048 11.0 0.0 16 36 17 37 16 43 0.86 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 24_3 - 266 AAA_19 PF13245.1 76 2.4e-07 24.9 0.1 1 1 1.5e-08 8.7e-07 23.1 0.0 13 52 100 135 87 150 0.83 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_40 - 1756 AAA_19 PF13245.1 76 5e-07 23.9 2.0 1 1 2.8e-08 1.7e-06 22.2 0.5 7 76 980 1046 973 1046 0.74 # 31712 # 36979 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.599 7_1 - 950 AAA_19 PF13245.1 76 0.0012 13.0 0.0 1 1 6.5e-05 0.0039 11.4 0.0 9 35 137 164 132 188 0.77 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 8_3 - 260 AAA_19 PF13245.1 76 0.0013 13.0 0.0 1 1 5.3e-05 0.0032 11.7 0.0 10 37 103 129 96 154 0.81 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 20_4 - 107 AAA_19 PF13245.1 76 0.0017 12.6 0.0 1 1 5.1e-05 0.003 11.8 0.0 10 30 64 83 57 93 0.80 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 8_5 - 400 CbiA PF01656.18 195 8.3e-22 72.0 0.0 1 1 1.4e-23 1.4e-21 71.3 0.0 1 144 111 294 111 321 0.74 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 4_10 - 215 CbiA PF01656.18 195 3.7e-09 30.7 0.1 1 1 5.4e-11 5.4e-09 30.2 0.1 1 145 4 124 4 173 0.79 # 6602 # 7246 # 1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 24_3 - 266 CbiA PF01656.18 195 0.0002 15.2 0.0 1 1 2.8e-06 0.00028 14.8 0.0 9 63 107 171 100 249 0.67 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_3 - 266 KTI12 PF08433.5 270 0.0019 11.8 0.0 1 1 1.2e-05 0.0035 11.0 0.0 4 82 100 170 99 199 0.78 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 5_4 - 91 PAX PF00292.13 125 2.8e-05 18.3 0.0 1 1 2.4e-07 3.6e-05 17.9 0.0 22 54 51 83 33 89 0.86 # 1731 # 2003 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 22_2 - 91 PAX PF00292.13 125 0.00013 16.1 0.0 1 1 1.2e-06 0.00018 15.7 0.0 22 54 51 83 33 89 0.87 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 6_12 - 120 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.3e-07 25.4 0.0 1 1 7.7e-09 2.9e-07 24.4 0.0 25 48 16 39 12 40 0.94 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 19_2 - 90 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 6.4e-06 20.1 0.0 1 1 2.6e-07 9.9e-06 19.5 0.0 18 49 19 50 18 53 0.93 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 1_3 - 214 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00014 15.7 0.0 1 1 1.7e-05 0.00065 13.7 0.0 18 49 18 49 16 49 0.93 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 4_3 - 101 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00066 13.6 0.1 1 1 4.6e-05 0.0017 12.3 0.0 24 52 22 50 14 52 0.89 # 1177 # 1479 # -1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 45_1 - 101 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00072 13.5 0.0 1 1 4.3e-05 0.0016 12.4 0.0 25 52 23 50 15 52 0.93 # 59 # 361 # 1 # ID=45_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 24_2 - 391 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00075 13.4 0.0 1 1 3.9e-05 0.0015 12.5 0.0 31 47 22 38 13 39 0.92 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_9 - 230 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00082 13.3 0.0 1 1 4.3e-05 0.0016 12.4 0.0 26 48 169 191 159 194 0.84 # 5826 # 6515 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 8_6 - 327 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0061 10.5 2.2 1 1 0.00024 0.0089 10.0 0.1 24 50 159 185 153 186 0.88 # 3584 # 4564 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.423 6_10 - 195 rve PF00665.21 120 1.6e-31 103.4 0.0 1 1 9.9e-33 2.1e-31 103.0 0.0 3 119 32 146 30 147 0.96 # 6770 # 7354 # 1 # ID=6_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 42_1 - 207 rve PF00665.21 120 5e-28 92.1 0.0 1 1 5.4e-29 1.2e-27 90.9 0.0 2 119 36 150 35 151 0.97 # 43 # 663 # -1 # ID=42_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 4_2 - 273 rve PF00665.21 120 1.1e-26 87.8 0.0 1 1 8.4e-28 1.8e-26 87.1 0.0 2 119 106 221 105 222 0.97 # 323 # 1141 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 38_2 - 258 rve PF00665.21 120 1.1e-24 81.3 0.0 1 1 1.2e-25 2.5e-24 80.2 0.0 3 119 123 243 121 244 0.96 # 187 # 960 # 1 # ID=38_2;partial=01;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.562 8_2 - 248 rve PF00665.21 120 1.2e-21 71.5 0.0 1 1 9.2e-23 2e-21 70.8 0.0 3 118 25 149 24 151 0.96 # 136 # 879 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.546 24_2 - 391 rve PF00665.21 120 1.8e-19 64.5 0.0 1 1 1.6e-20 3.4e-19 63.6 0.0 3 120 113 240 112 240 0.94 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 17_3 - 96 rve PF00665.21 120 1.8e-15 51.6 0.0 1 1 1.3e-16 2.8e-15 51.0 0.0 73 120 2 49 1 49 0.97 # 2372 # 2659 # -1 # ID=17_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.503 34_1 - 338 rve PF00665.21 120 1.8e-10 35.4 0.0 1 1 2e-11 4.3e-10 34.2 0.0 8 119 194 306 187 307 0.87 # 3 # 1016 # -1 # ID=34_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 32_3 - 136 rve PF00665.21 120 4.5e-10 34.2 0.0 1 1 3e-11 6.5e-10 33.6 0.0 2 65 60 121 59 127 0.91 # 844 # 1251 # 1 # ID=32_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.490 11_7 - 94 rve PF00665.21 120 8e-06 20.4 0.0 1 1 7e-07 1.5e-05 19.6 0.0 93 119 13 39 10 40 0.93 # 2294 # 2575 # -1 # ID=11_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.514 19_4 - 85 rve PF00665.21 120 1.9e-05 19.2 0.0 1 1 1.7e-06 3.6e-05 18.4 0.0 95 119 2 26 1 27 0.93 # 2403 # 2657 # -1 # ID=19_4;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 50_2 - 85 rve PF00665.21 120 1.9e-05 19.2 0.0 1 1 1.7e-06 3.6e-05 18.4 0.0 95 119 2 26 1 27 0.93 # 139 # 393 # -1 # ID=50_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 51_2 - 85 rve PF00665.21 120 1.9e-05 19.2 0.0 1 1 1.7e-06 3.6e-05 18.4 0.0 95 119 2 26 1 27 0.93 # 139 # 393 # -1 # ID=51_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 9_3 - 40 rve PF00665.21 120 0.0015 13.1 0.0 1 1 6.8e-05 0.0015 13.1 0.0 97 117 17 37 5 39 0.88 # 1631 # 1750 # 1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 8_5 - 400 YhjQ PF06564.7 244 0.0015 12.3 0.7 1 3 0.076 23 -1.3 0.0 175 199 28 53 2 95 0.53 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 8_5 - 400 YhjQ PF06564.7 244 0.0015 12.3 0.7 2 3 0.038 11 -0.4 0.0 9 46 116 159 110 169 0.63 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 8_5 - 400 YhjQ PF06564.7 244 0.0015 12.3 0.7 3 3 3.7e-05 0.011 9.5 0.0 106 183 235 311 215 322 0.78 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 7_3 - 363 Glyco_trans_1_2 PF13524.1 92 7.2e-10 33.5 0.0 1 1 4.4e-12 1.3e-09 32.7 0.0 2 91 265 356 263 357 0.95 # 4806 # 5894 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 24_3 - 266 AFG1_ATPase PF03969.11 362 4.2e-06 20.2 0.0 1 1 3.8e-08 5.7e-06 19.8 0.0 63 227 98 258 53 263 0.80 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 8_3 - 260 AFG1_ATPase PF03969.11 362 0.00034 13.9 0.1 1 1 9.5e-06 0.0014 11.9 0.1 63 215 103 253 43 259 0.70 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 6_12 - 120 Terminase_5 PF06056.7 58 0.00035 14.6 0.0 1 1 1.1e-05 0.00083 13.4 0.0 9 36 13 40 9 44 0.85 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 15_1 - 219 Terminase_5 PF06056.7 58 0.00051 14.1 0.0 1 1 5.2e-05 0.0039 11.2 0.0 16 44 129 157 127 164 0.93 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 19_2 - 90 Terminase_5 PF06056.7 58 0.00061 13.8 0.0 1 1 1.3e-05 0.00096 13.2 0.0 14 36 28 50 24 59 0.87 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 6_2 - 102 Terminase_5 PF06056.7 58 0.0018 12.3 0.0 1 1 3.2e-05 0.0024 11.9 0.0 17 45 2 30 1 37 0.92 # 455 # 760 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 3_4 - 534 AAA_23 PF13476.1 202 0.076 7.8 8.2 1 1 0.0005 0.15 6.8 8.2 123 197 13 84 2 89 0.47 # 2350 # 3951 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 20_4 - 107 AAA_24 PF13479.1 213 0.0016 12.5 0.0 1 1 1.4e-05 0.0021 12.1 0.0 3 23 63 83 61 96 0.82 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 24_3 - 266 AAA_24 PF13479.1 213 0.0022 12.1 0.0 1 1 2.7e-05 0.004 11.2 0.0 5 23 99 117 95 151 0.86 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 7_1 - 950 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00057 13.5 0.1 1 1 3.8e-05 0.0029 11.2 0.0 12 46 134 168 125 175 0.74 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_37 - 751 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00065 13.3 0.0 1 1 0.00013 0.01 9.4 0.0 21 49 190 219 182 248 0.86 # 28741 # 30993 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 31_1 - 376 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00097 12.7 0.0 1 1 2.7e-05 0.002 11.7 0.0 98 135 317 354 303 356 0.93 # 131 # 1258 # 1 # ID=31_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_17 - 107 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0029 11.1 0.1 1 1 5.6e-05 0.0042 10.6 0.1 14 40 70 96 59 102 0.81 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_40 - 1756 AAA_30 PF13604.1 196 7.2e-44 144.2 14.2 1 2 2.8e-05 0.0028 11.7 3.8 7 147 419 551 415 561 0.84 # 31712 # 36979 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.599 1_40 - 1756 AAA_30 PF13604.1 196 7.2e-44 144.2 14.2 2 2 1.1e-43 1.1e-41 137.0 1.5 1 187 967 1156 967 1160 0.94 # 31712 # 36979 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.599 7_1 - 950 AAA_30 PF13604.1 196 0.00018 15.5 0.3 1 2 0.00096 0.096 6.7 0.0 7 35 133 156 127 189 0.72 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 AAA_30 PF13604.1 196 0.00018 15.5 0.3 2 2 0.0016 0.16 6.0 0.0 90 133 306 353 286 414 0.85 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_37 - 751 AAA_30 PF13604.1 196 0.0019 12.2 0.0 1 1 4e-05 0.004 11.2 0.0 21 57 188 224 180 230 0.85 # 28741 # 30993 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_3 - 214 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 8.9e-25 81.0 0.0 1 2 0.029 0.44 5.1 0.0 9 47 12 50 11 72 0.92 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_3 - 214 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 8.9e-25 81.0 0.0 2 2 1.1e-23 1.7e-22 73.7 0.0 2 68 92 162 91 169 0.90 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 5_1 - 88 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.3e-21 68.9 0.5 1 1 4.2e-22 6.3e-21 68.6 0.5 2 74 8 87 7 88 0.89 # 1 # 264 # -1 # ID=5_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 4_3 - 101 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.5e-17 57.8 0.2 1 1 1.2e-18 1.8e-17 57.5 0.2 2 75 3 75 2 76 0.95 # 1177 # 1479 # -1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 15_1 - 219 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.3e-16 54.8 0.0 1 1 1.8e-17 2.7e-16 53.8 0.0 2 68 109 175 108 177 0.84 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 45_1 - 101 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.4e-16 53.5 0.2 1 1 2.8e-17 4.2e-16 53.2 0.2 2 75 3 75 2 76 0.96 # 59 # 361 # 1 # ID=45_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 21_2 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.7e-13 44.9 1.1 1 1 4.4e-14 6.7e-13 42.9 1.1 1 74 1 87 1 88 0.86 # 271 # 597 # -1 # ID=21_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 41_2 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.5e-13 43.8 1.2 1 1 9.4e-14 1.4e-12 41.9 1.2 1 74 1 87 1 88 0.85 # 210 # 536 # 1 # ID=41_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 5_2 - 62 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.9e-12 40.5 0.0 1 1 3e-13 4.5e-12 40.3 0.0 5 45 21 61 18 61 0.93 # 463 # 648 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.446 18_2 - 64 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.6e-12 40.0 0.0 1 1 4.2e-13 6.3e-12 39.8 0.0 2 41 8 47 7 48 0.96 # 77 # 268 # -1 # ID=18_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 6_2 - 102 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.2e-11 38.9 0.0 1 1 1.1e-12 1.7e-11 38.5 0.0 27 69 2 48 1 58 0.83 # 455 # 760 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 20_3 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.8e-07 23.7 0.2 1 1 1.8e-06 2.6e-05 18.6 0.0 5 49 4 49 1 63 0.87 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 32_4 - 24 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.7e-06 20.5 0.0 1 1 4.5e-07 6.7e-06 20.5 0.0 1 22 1 22 1 24 0.92 # 1257 # 1328 # 1 # ID=32_4;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 46_2 - 24 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.7e-06 20.5 0.0 1 1 4.5e-07 6.7e-06 20.5 0.0 1 22 1 22 1 24 0.92 # 399 # 470 # 1 # ID=46_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 54_2 - 24 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.7e-06 20.5 0.0 1 1 4.5e-07 6.7e-06 20.5 0.0 1 22 1 22 1 24 0.92 # 203 # 274 # 1 # ID=54_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 35_1 - 23 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.9e-05 19.0 0.1 1 1 1.3e-06 1.9e-05 19.0 0.1 2 21 3 22 2 23 0.87 # 1 # 69 # -1 # ID=35_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.435 9_9 - 23 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.9e-05 19.0 0.1 1 1 1.3e-06 1.9e-05 19.0 0.1 2 21 3 22 2 23 0.87 # 7113 # 7181 # 1 # ID=9_9;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.435 57_1 - 54 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 2.7e-05 18.6 0.1 1 1 2.2e-06 3.3e-05 18.3 0.1 41 74 13 53 7 54 0.79 # 1 # 162 # -1 # ID=57_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 38_1 - 76 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6e-05 17.5 0.3 1 1 8.5e-06 0.00013 16.4 0.1 42 74 2 41 1 43 0.80 # 2 # 229 # 1 # ID=38_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 11_6 - 49 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 9e-05 16.9 0.1 1 1 8.6e-06 0.00013 16.4 0.1 2 21 3 22 2 25 0.87 # 1792 # 1938 # 1 # ID=11_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_47 - 149 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00026 15.4 0.0 1 1 3.6e-05 0.00055 14.4 0.0 19 43 117 141 107 146 0.85 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 2_10 - 409 TIGR02432 TIGR02432 189 9.6e-07 23.0 0.0 1 1 4.9e-09 1.5e-06 22.4 0.0 2 43 32 73 31 101 0.83 # 8577 # 9803 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 6_12 - 120 GerE PF00196.14 58 3.9e-06 20.6 0.0 1 1 6.1e-08 6.1e-06 20.0 0.0 17 39 16 38 7 40 0.88 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_9 - 230 GerE PF00196.14 58 4.1e-05 17.3 0.1 1 1 1.1e-06 0.00011 16.0 0.0 14 57 165 208 160 209 0.90 # 5826 # 6515 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 24_2 - 391 GerE PF00196.14 58 0.0015 12.4 0.0 1 1 3.4e-05 0.0034 11.2 0.0 18 40 17 39 10 40 0.82 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_37 - 751 TraG-D_C PF12696.2 128 2.4e-20 67.2 0.0 1 1 1.4e-22 4.3e-20 66.3 0.0 1 127 419 541 419 542 0.86 # 28741 # 30993 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 34_1 - 338 DDE_3 PF13358.1 146 6.4e-25 82.1 0.6 1 1 4.5e-27 1.3e-24 81.0 0.1 2 140 177 314 176 319 0.95 # 3 # 1016 # -1 # ID=34_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 24_3 - 266 Bac_DnaA PF00308.13 219 7.3e-12 39.8 0.0 1 1 1.2e-13 1.2e-11 39.1 0.0 36 139 99 199 71 212 0.87 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 8_3 - 260 Bac_DnaA PF00308.13 219 1.5e-09 32.2 0.0 1 1 2.2e-11 2.3e-09 31.7 0.0 37 136 105 202 75 207 0.85 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 20_4 - 107 Bac_DnaA PF00308.13 219 0.0005 14.2 0.0 1 1 6.2e-06 0.00062 13.9 0.0 37 64 66 93 36 99 0.86 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 20_4 - 107 TIGR03263 TIGR03263 180 0.0016 12.2 0.0 1 2 0.045 13 -0.6 0.0 138 175 19 55 5 59 0.67 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 20_4 - 107 TIGR03263 TIGR03263 180 0.0016 12.2 0.0 2 2 1.8e-05 0.0054 10.5 0.0 4 33 66 95 63 100 0.84 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 8_5 - 400 MipZ PF09140.6 261 4e-08 27.1 0.1 1 2 0.00079 0.12 5.8 0.0 2 48 110 161 109 186 0.76 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 8_5 - 400 MipZ PF09140.6 261 4e-08 27.1 0.1 2 2 7.5e-08 1.1e-05 19.0 0.0 88 135 234 281 216 288 0.87 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 4_10 - 215 MipZ PF09140.6 261 7.2e-08 26.2 2.3 1 2 0.0016 0.24 4.8 0.5 7 25 8 26 2 38 0.71 # 6602 # 7246 # 1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 4_10 - 215 MipZ PF09140.6 261 7.2e-08 26.2 2.3 2 2 1.8e-08 2.7e-06 21.1 0.1 70 133 45 108 25 125 0.84 # 6602 # 7246 # 1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 33_1 - 386 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 8.9e-29 95.0 0.0 1 1 2.4e-30 1.2e-28 94.6 0.0 4 213 70 295 67 295 0.85 # 1 # 1158 # 1 # ID=33_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.543 15_4 - 239 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.3e-25 84.6 0.0 1 1 3.1e-27 1.6e-25 84.4 0.0 41 213 3 216 1 216 0.95 # 1657 # 2373 # 1 # ID=15_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 15_5 - 380 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 5.5e-16 53.2 0.0 1 1 1.6e-17 8e-16 52.6 0.0 71 188 132 284 75 309 0.79 # 2576 # 3715 # -1 # ID=15_5;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.447 35_2 - 285 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.6e-12 41.9 0.0 1 1 3.9e-14 1.9e-12 41.6 0.0 2 153 107 284 106 285 0.90 # 212 # 1066 # 1 # ID=35_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 13_1 - 91 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2e-09 31.8 1.5 1 1 6e-11 3e-09 31.2 1.5 83 211 1 83 1 85 0.90 # 2 # 274 # 1 # ID=13_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 30_5 - 91 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 5.6e-09 30.3 0.8 1 1 1.7e-10 8.6e-09 29.7 0.8 83 211 1 83 1 85 0.91 # 1190 # 1462 # -1 # ID=30_5;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 7_3 - 363 Glyco_trans_4_2 PF13477.1 139 0.00039 14.7 0.1 1 1 2.6e-06 0.00077 13.8 0.1 16 102 22 106 13 134 0.81 # 4806 # 5894 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 1_15 - 476 DivIC PF04977.10 80 0.0046 10.9 4.2 1 1 3e-05 0.0089 10.0 4.2 17 66 76 124 72 125 0.92 # 9036 # 10463 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.576 9_5 - 107 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 1.1e-16 55.6 0.1 1 1 4.2e-19 1.3e-16 55.4 0.1 173 247 18 93 8 95 0.89 # 3118 # 3438 # 1 # ID=9_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 30_5 - 91 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 1e-25 84.3 1.4 1 1 1.8e-27 1.1e-25 84.1 1.4 5 86 1 84 1 86 0.97 # 1190 # 1462 # -1 # ID=30_5;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 13_1 - 91 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 1.8e-25 83.4 2.1 1 1 3.3e-27 2e-25 83.3 2.1 5 86 1 84 1 86 0.97 # 2 # 274 # 1 # ID=13_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 16_2 - 77 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 7.4e-12 39.8 0.7 1 1 1.3e-13 8.1e-12 39.7 0.7 51 86 35 70 5 72 0.92 # 677 # 907 # 1 # ID=16_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.498 53_1 - 38 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 5.9e-08 27.3 0.4 1 1 1e-09 6.2e-08 27.3 0.4 57 86 2 31 1 33 0.94 # 166 # 279 # -1 # ID=53_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.482 15_4 - 239 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.0019 12.9 0.1 1 1 9.3e-05 0.0056 11.4 0.0 39 83 168 212 156 217 0.85 # 1657 # 2373 # 1 # ID=15_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 8_6 - 327 Trp_repressor PF01371.14 88 0.00071 14.0 0.3 1 1 8.8e-06 0.0027 12.1 0.2 20 69 133 181 128 187 0.77 # 3584 # 4564 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.423 7_1 - 950 AAA_12 PF13087.1 200 0.00021 15.2 0.0 1 2 9.5e-05 0.029 8.2 0.1 3 90 365 451 364 466 0.77 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 AAA_12 PF13087.1 200 0.00021 15.2 0.0 2 2 0.0011 0.33 4.7 0.0 144 196 471 553 436 556 0.68 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 19_2 - 90 Sigma70_r4 PF04545.11 50 5.7e-07 23.3 0.0 1 1 1.5e-08 7.7e-07 22.9 0.0 12 41 19 48 17 54 0.89 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 6_12 - 120 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00062 13.6 0.2 1 1 6.9e-05 0.0035 11.2 0.1 19 39 16 36 6 39 0.89 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_3 - 214 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00075 13.3 0.1 1 1 2.9e-05 0.0014 12.4 0.1 11 41 17 47 15 52 0.88 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 15_1 - 219 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.001 12.9 0.0 1 1 3.7e-05 0.0018 12.0 0.0 13 39 29 55 27 61 0.93 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 36_3 - 96 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.0011 12.7 0.0 1 1 4.1e-05 0.0021 11.9 0.0 8 42 30 68 28 72 0.86 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 14_3 - 41 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.0022 11.8 0.0 1 1 5.1e-05 0.0026 11.6 0.0 11 38 9 36 8 37 0.93 # 593 # 715 # -1 # ID=14_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_19 - 74 zf-dskA_traR PF01258.12 36 8.6e-15 48.7 2.6 1 1 4.2e-17 1.3e-14 48.2 2.6 5 36 35 67 30 67 0.91 # 12237 # 12458 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 6_12 - 120 DUF2316 PF10078.4 89 0.00028 15.3 0.0 1 1 1.4e-06 0.00042 14.8 0.0 20 82 14 85 5 91 0.82 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 24_3 - 266 AAA PF00004.24 132 1.4e-08 29.5 0.0 1 1 3.9e-10 3.9e-08 28.1 0.0 1 74 100 174 100 202 0.73 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 8_3 - 260 AAA PF00004.24 132 5.9e-07 24.2 0.0 1 1 1e-08 1e-06 23.4 0.0 1 74 105 180 105 213 0.77 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 20_4 - 107 AAA PF00004.24 132 0.00058 14.5 0.0 1 1 1e-05 0.0011 13.7 0.0 1 30 66 95 66 103 0.78 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 8_6 - 327 KorB PF08535.5 93 0.00059 14.5 0.1 1 1 1.4e-05 0.0022 12.7 0.0 1 38 159 196 159 233 0.80 # 3584 # 4564 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.423 6_12 - 120 KorB PF08535.5 93 0.0011 13.6 0.0 1 1 1.8e-05 0.0027 12.3 0.0 2 28 16 42 15 48 0.88 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 36_3 - 96 HTH_37 PF13744.1 80 1.8e-09 31.8 0.0 1 1 8.1e-12 2.4e-09 31.4 0.0 19 79 34 93 21 94 0.91 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 20_4 - 107 TIGR00382 TIGR00382 414 0.0026 10.9 0.0 1 1 8.5e-06 0.0026 10.9 0.0 117 137 63 83 16 96 0.85 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 6_10 - 195 rve_2 PF13333.1 52 3e-21 69.8 0.1 1 1 8e-23 4.8e-21 69.1 0.1 1 52 137 193 137 193 0.98 # 6770 # 7354 # 1 # ID=6_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 26_3 - 89 rve_2 PF13333.1 52 1.5e-16 54.7 0.1 1 1 3.2e-18 1.9e-16 54.4 0.1 1 50 29 84 29 85 0.91 # 1039 # 1305 # -1 # ID=26_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.509 4_2 - 273 rve_2 PF13333.1 52 2.3e-14 47.7 0.7 1 1 8.2e-16 4.9e-14 46.7 0.7 1 51 212 267 212 267 0.93 # 323 # 1141 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 42_1 - 207 rve_2 PF13333.1 52 3.9e-08 27.8 0.0 1 1 1.2e-09 7e-08 26.9 0.0 1 44 141 187 141 194 0.88 # 43 # 663 # -1 # ID=42_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 17_3 - 96 rve_2 PF13333.1 52 0.00019 15.9 0.2 1 1 5e-06 0.0003 15.3 0.2 1 51 39 91 39 92 0.74 # 2372 # 2659 # -1 # ID=17_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.503 4_12 - 327 Hydantoinase_A PF01968.13 290 2e-08 28.1 0.2 1 2 3.4e-06 0.00051 13.6 0.1 66 98 154 185 141 192 0.79 # 8054 # 9034 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 4_12 - 327 Hydantoinase_A PF01968.13 290 2e-08 28.1 0.2 2 2 1.1e-05 0.0016 12.0 0.0 211 263 244 296 201 301 0.85 # 8054 # 9034 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 5_12 - 176 Hydantoinase_A PF01968.13 290 2.2e-08 27.9 0.3 1 2 2.9e-06 0.00044 13.9 0.0 68 97 11 38 5 46 0.81 # 4875 # 5402 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.354 5_12 - 176 Hydantoinase_A PF01968.13 290 2.2e-08 27.9 0.3 2 2 6.6e-06 0.00099 12.7 0.1 213 265 96 152 48 164 0.77 # 4875 # 5402 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.354 6_12 - 120 MerR_1 PF13411.1 69 0.0025 12.1 0.2 1 2 0.00038 0.11 6.8 0.1 44 65 5 26 3 27 0.86 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 6_12 - 120 MerR_1 PF13411.1 69 0.0025 12.1 0.2 2 2 0.00011 0.032 8.5 0.0 1 28 18 45 18 51 0.83 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 6_12 - 120 Crp PF00325.15 32 0.0022 12.0 1.6 1 1 8.7e-06 0.0026 11.7 0.1 3 23 18 38 17 39 0.90 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 36_3 - 96 HTH_25 PF13413.1 62 4.9e-05 17.4 0.0 1 1 2.8e-07 8.5e-05 16.6 0.0 1 33 37 69 37 75 0.94 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 7_1 - 950 AAA_16 PF13191.1 185 9.7e-06 20.1 0.0 1 1 1.2e-06 5.8e-05 17.6 0.0 23 173 138 338 118 347 0.56 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_37 - 751 AAA_16 PF13191.1 185 1.4e-05 19.6 0.0 1 1 1.2e-06 6.1e-05 17.5 0.0 21 60 182 222 177 262 0.81 # 28741 # 30993 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 24_3 - 266 AAA_16 PF13191.1 185 2.2e-05 19.0 1.5 1 2 0.08 4 1.8 0.0 127 173 25 88 3 93 0.61 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_3 - 266 AAA_16 PF13191.1 185 2.2e-05 19.0 1.5 2 2 1.4e-05 0.00068 14.1 0.7 23 51 96 124 88 195 0.82 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 20_4 - 107 AAA_16 PF13191.1 185 0.00016 16.1 0.0 1 1 5.3e-06 0.00027 15.4 0.0 12 41 54 80 41 84 0.75 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 8_3 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 0.00025 15.5 1.1 1 1 2.1e-05 0.001 13.5 0.1 16 41 97 119 85 135 0.77 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_17 - 107 AAA_16 PF13191.1 185 0.0012 13.3 0.1 1 1 6.6e-05 0.0033 11.9 0.1 22 51 70 99 64 104 0.90 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 24_3 - 266 AAA_22 PF13401.1 131 9.5e-07 23.5 0.3 1 2 0.00013 0.0077 10.8 0.0 5 21 98 114 94 134 0.85 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_3 - 266 AAA_22 PF13401.1 131 9.5e-07 23.5 0.3 2 2 0.00018 0.011 10.3 0.1 77 121 147 195 132 203 0.72 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 8_3 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 5.8e-06 20.9 0.2 1 2 0.0001 0.006 11.2 0.0 5 22 103 120 99 138 0.83 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 8_3 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 5.8e-06 20.9 0.2 2 2 0.002 0.12 7.0 0.0 88 102 154 180 124 203 0.67 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 7_1 - 950 AAA_22 PF13401.1 131 3.7e-05 18.3 0.0 1 2 0.00076 0.046 8.3 0.0 6 28 141 163 135 210 0.82 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 AAA_22 PF13401.1 131 3.7e-05 18.3 0.0 2 2 0.0027 0.16 6.5 0.0 74 124 301 349 266 355 0.73 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 20_4 - 107 AAA_22 PF13401.1 131 0.00065 14.3 0.1 1 1 2.6e-05 0.0016 13.1 0.0 5 21 64 80 60 99 0.83 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 1_17 - 107 AAA_22 PF13401.1 131 0.002 12.7 0.0 1 1 5.5e-05 0.0033 12.0 0.0 3 27 71 95 66 103 0.87 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 7_3 - 363 Glyco_trans_1_4 PF13692.1 135 1.2e-13 45.8 0.0 1 1 7e-16 2.1e-13 45.1 0.0 2 135 185 327 184 327 0.86 # 4806 # 5894 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 24_3 - 266 TIGR00362 TIGR00362 437 1.5e-13 44.7 0.0 1 1 1.7e-15 1.7e-13 44.6 0.0 138 242 98 199 8 207 0.85 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 8_3 - 260 TIGR00362 TIGR00362 437 1.3e-10 35.0 0.0 1 1 1.6e-12 1.6e-10 34.8 0.0 139 240 104 203 28 210 0.86 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 20_4 - 107 TIGR00362 TIGR00362 437 7.7e-05 16.0 0.0 1 1 7.6e-07 7.7e-05 16.0 0.0 139 163 65 89 6 97 0.78 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 20_5 - 262 HTH_AraC PF00165.18 42 1.8e-17 57.1 0.6 1 2 2.2e-06 0.00022 15.5 0.0 2 35 167 201 166 206 0.88 # 1366 # 2151 # -1 # ID=20_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.305 20_5 - 262 HTH_AraC PF00165.18 42 1.8e-17 57.1 0.6 2 2 8e-14 8e-12 39.2 0.1 7 41 220 255 217 256 0.92 # 1366 # 2151 # -1 # ID=20_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.305 2_12 - 295 HTH_AraC PF00165.18 42 9e-10 32.6 0.6 1 2 0.00021 0.021 9.2 0.1 4 34 203 233 202 234 0.91 # 10654 # 11538 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.334 2_12 - 295 HTH_AraC PF00165.18 42 9e-10 32.6 0.6 2 2 3.1e-08 3.1e-06 21.4 0.1 2 33 252 281 251 290 0.86 # 10654 # 11538 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.334 19_2 - 90 HTH_AraC PF00165.18 42 3.5e-05 18.1 0.1 1 1 5.5e-07 5.5e-05 17.4 0.1 5 31 24 50 20 52 0.90 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 7_1 - 950 TIGR01074 TIGR01074 668 2.1e-06 20.4 0.0 1 2 0.00048 0.14 4.4 0.0 10 37 135 162 127 172 0.78 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 TIGR01074 TIGR01074 668 2.1e-06 20.4 0.0 2 2 9.5e-07 0.00029 13.3 0.0 209 291 317 401 311 410 0.82 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 6_12 - 120 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0018 12.6 0.0 1 1 1e-05 0.0031 11.9 0.0 20 37 21 38 19 38 0.91 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 20_4 - 107 AAA_29 PF13555.1 62 0.002 12.1 0.0 1 1 2.3e-05 0.0034 11.4 0.0 18 39 58 79 50 84 0.77 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 8_3 - 260 AAA_29 PF13555.1 62 0.0022 12.0 0.0 1 1 2.9e-05 0.0043 11.1 0.0 19 59 98 139 89 141 0.72 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_5 - 305 HTH_1 PF00126.22 60 6.7e-18 58.7 0.0 1 1 4.3e-20 1.3e-17 57.8 0.0 3 59 9 65 7 66 0.96 # 2048 # 2962 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 19_2 - 90 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 0.00033 15.5 0.0 1 1 2.8e-06 0.00042 15.1 0.0 22 55 24 57 18 68 0.90 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 15_1 - 219 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 0.00033 15.4 0.0 1 2 0.002 0.31 5.9 0.0 22 55 33 66 22 77 0.88 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 15_1 - 219 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 0.00033 15.4 0.0 2 2 0.00079 0.12 7.3 0.0 26 54 127 155 120 179 0.83 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 24_2 - 391 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 0.00071 13.7 0.0 1 1 9.4e-06 0.0014 12.7 0.0 12 44 9 41 2 43 0.92 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 6_12 - 120 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 0.0019 12.3 0.0 1 1 2.2e-05 0.0033 11.5 0.0 13 43 10 40 7 48 0.83 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 24_3 - 266 AAA_28 PF13521.1 163 0.00015 16.2 1.0 1 2 1e-05 0.0016 12.9 0.1 2 47 100 150 99 162 0.68 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_3 - 266 AAA_28 PF13521.1 163 0.00015 16.2 1.0 2 2 0.0093 1.4 3.3 0.0 95 135 144 178 131 200 0.71 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 8_3 - 260 AAA_28 PF13521.1 163 0.0039 11.6 1.5 1 1 6.1e-05 0.0092 10.4 0.2 1 43 104 151 104 169 0.69 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 13_1 - 91 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 3.3e-06 21.4 0.1 1 1 2.5e-08 3.7e-06 21.2 0.1 89 149 1 63 1 69 0.87 # 2 # 274 # 1 # ID=13_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 30_5 - 91 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 1.4e-05 19.4 0.0 1 1 1e-07 1.5e-05 19.2 0.0 89 149 1 63 1 69 0.87 # 1190 # 1462 # -1 # ID=30_5;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 3_4 - 534 Mnd1 PF03962.10 188 0.0053 10.9 11.5 1 1 2e-06 0.00059 14.0 6.9 63 131 15 86 11 96 0.87 # 2350 # 3951 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 34_1 - 338 HTH_32 PF13565.1 77 3.3e-10 35.1 0.2 1 1 3.3e-12 3.3e-10 35.1 0.2 1 77 56 136 56 136 0.88 # 3 # 1016 # -1 # ID=34_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 20_3 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 1.4e-09 33.2 0.3 1 2 3.2e-06 0.00032 15.9 0.0 2 57 39 88 38 92 0.82 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 20_3 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 1.4e-09 33.2 0.3 2 2 5.1e-06 0.00051 15.3 0.3 1 44 96 140 96 166 0.73 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 1_47 - 149 HTH_32 PF13565.1 77 0.00032 16.0 0.3 1 1 8.2e-06 0.00082 14.6 0.1 6 77 83 142 80 142 0.76 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 4_12 - 327 TIGR02350 TIGR02350 596 0.00026 13.6 0.4 1 3 0.086 26 -2.9 0.0 361 381 79 99 67 129 0.60 # 8054 # 9034 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 4_12 - 327 TIGR02350 TIGR02350 596 0.00026 13.6 0.4 2 3 0.00011 0.032 6.7 0.0 175 200 159 181 142 198 0.82 # 8054 # 9034 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 4_12 - 327 TIGR02350 TIGR02350 596 0.00026 13.6 0.4 3 3 0.00049 0.15 4.5 0.0 271 348 220 295 205 308 0.85 # 8054 # 9034 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 7_1 - 950 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.7e-10 33.7 1.2 1 2 3.4e-07 0.0001 14.6 0.0 370 463 313 408 300 463 0.74 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.7e-10 33.7 1.2 2 2 3.5e-08 1.1e-05 17.8 0.3 735 875 478 611 473 632 0.60 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 19_2 - 90 GntR PF00392.16 64 0.00039 14.3 0.0 1 1 1.8e-06 0.00054 13.9 0.0 17 41 21 44 18 56 0.91 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 36_3 - 96 HTH_3 PF01381.17 55 1.5e-13 44.9 0.2 1 1 4.5e-15 2.7e-13 44.1 0.0 1 53 38 90 38 91 0.95 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 6_12 - 120 HTH_3 PF01381.17 55 1.7e-06 22.3 0.1 1 1 5e-08 3e-06 21.5 0.1 7 37 15 45 8 48 0.91 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_47 - 149 HTH_3 PF01381.17 55 8.6e-05 16.8 0.0 1 1 3.2e-05 0.0019 12.5 0.0 3 29 115 141 114 142 0.89 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 28_2 - 117 HTH_3 PF01381.17 55 0.00069 13.9 0.1 1 1 2e-05 0.0012 13.1 0.1 9 49 68 106 59 111 0.81 # 331 # 681 # -1 # ID=28_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 19_2 - 90 HTH_3 PF01381.17 55 0.0021 12.4 0.0 1 1 5.5e-05 0.0033 11.8 0.0 6 26 22 44 19 48 0.85 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 34_1 - 338 HTH_23 PF13384.1 50 7.7e-13 42.2 0.3 1 1 6.8e-13 1.3e-11 38.3 0.1 4 50 27 73 24 73 0.95 # 3 # 1016 # -1 # ID=34_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 20_3 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-12 41.5 0.6 1 2 5.1e-09 9.6e-08 26.0 0.0 5 49 9 54 6 55 0.89 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 20_3 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-12 41.5 0.6 2 2 7.5e-05 0.0014 12.8 0.4 3 50 64 113 62 113 0.90 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 1_3 - 214 HTH_23 PF13384.1 50 1.8e-10 34.7 0.0 1 2 0.00011 0.002 12.3 0.0 9 41 17 50 13 53 0.86 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_3 - 214 HTH_23 PF13384.1 50 1.8e-10 34.7 0.0 2 2 4.3e-07 8.1e-06 19.9 0.0 14 48 106 144 99 146 0.84 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 15_1 - 219 HTH_23 PF13384.1 50 1.5e-09 31.7 0.0 1 2 0.00043 0.008 10.4 0.0 16 46 34 65 26 66 0.81 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 15_1 - 219 HTH_23 PF13384.1 50 1.5e-09 31.7 0.0 2 2 8.1e-07 1.5e-05 19.0 0.0 16 46 124 155 117 159 0.88 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 6_12 - 120 HTH_23 PF13384.1 50 1.7e-08 28.4 0.3 1 1 2.5e-09 4.6e-08 27.0 0.0 9 40 9 40 2 43 0.90 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_47 - 149 HTH_23 PF13384.1 50 2.8e-08 27.7 0.1 1 1 1e-08 1.9e-07 25.0 0.0 10 38 114 142 112 145 0.93 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 19_2 - 90 HTH_23 PF13384.1 50 3e-08 27.6 0.0 1 1 2.3e-09 4.4e-08 27.1 0.0 11 46 20 56 18 60 0.87 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 5_1 - 88 HTH_23 PF13384.1 50 3.5e-07 24.2 0.1 1 1 3.3e-08 6.2e-07 23.4 0.1 3 48 14 60 12 62 0.90 # 1 # 264 # -1 # ID=5_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 24_2 - 391 HTH_23 PF13384.1 50 2.5e-06 21.5 0.1 1 1 3.1e-07 5.9e-06 20.3 0.1 10 39 10 39 8 40 0.92 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 21_2 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 2.7e-05 18.2 0.3 1 1 3.2e-06 5.9e-05 17.1 0.1 5 42 10 55 8 66 0.86 # 271 # 597 # -1 # ID=21_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 5_2 - 62 HTH_23 PF13384.1 50 8.5e-05 16.6 0.0 1 1 5.5e-06 0.0001 16.4 0.0 2 39 23 61 22 61 0.94 # 463 # 648 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.446 6_2 - 102 HTH_23 PF13384.1 50 8.7e-05 16.6 0.0 1 1 6.4e-06 0.00012 16.2 0.0 21 46 2 27 1 31 0.92 # 455 # 760 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 41_2 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 0.00021 15.4 0.9 1 1 7.1e-05 0.0013 12.8 0.2 5 42 10 55 8 66 0.83 # 210 # 536 # 1 # ID=41_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 14_3 - 41 HTH_23 PF13384.1 50 0.0016 12.6 0.0 1 1 0.0001 0.0019 12.3 0.0 10 35 10 36 6 37 0.87 # 593 # 715 # -1 # ID=14_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 9_1 - 95 HTH_23 PF13384.1 50 0.0018 12.5 0.0 1 1 0.00015 0.0029 11.8 0.0 10 46 10 47 8 48 0.81 # 20 # 304 # -1 # ID=9_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 8_6 - 327 HTH_23 PF13384.1 50 0.0023 12.1 1.2 1 1 0.0004 0.0075 10.5 0.1 9 40 153 184 152 186 0.87 # 3584 # 4564 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.423 1_47 - 149 HTH_7 PF02796.10 45 1.9e-13 44.6 0.0 1 2 0.032 1.4 3.4 0.0 12 25 38 51 28 60 0.81 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 1_47 - 149 HTH_7 PF02796.10 45 1.9e-13 44.6 0.0 2 2 3.3e-13 1.4e-11 38.5 0.0 1 44 101 144 101 145 0.97 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 6_12 - 120 HTH_7 PF02796.10 45 1.3e-10 35.5 1.2 1 1 4.1e-12 1.8e-10 35.1 0.2 13 44 9 40 5 41 0.93 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_9 - 230 HTH_7 PF02796.10 45 1.9e-05 19.0 0.1 1 1 1.1e-06 4.5e-05 17.7 0.1 11 37 159 185 128 188 0.87 # 5826 # 6515 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 24_2 - 391 HTH_7 PF02796.10 45 2.8e-05 18.4 0.3 1 1 1.3e-06 5.5e-05 17.5 0.3 7 42 3 38 1 40 0.91 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 28_2 - 117 HTH_7 PF02796.10 45 0.0024 12.2 0.1 1 1 0.00013 0.0055 11.1 0.0 24 43 69 88 60 90 0.88 # 331 # 681 # -1 # ID=28_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 19_2 - 90 HTH_7 PF02796.10 45 0.0025 12.2 0.0 1 1 9.6e-05 0.0041 11.5 0.0 14 38 20 44 13 45 0.86 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 8_6 - 327 HTH_7 PF02796.10 45 0.0039 11.5 0.6 1 1 0.00096 0.041 8.3 0.1 13 34 153 174 148 184 0.87 # 3584 # 4564 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.423 36_3 - 96 HTH_19 PF12844.2 64 1.8e-10 35.2 0.0 1 1 3.1e-12 4.7e-10 33.9 0.0 2 55 36 89 35 90 0.92 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 6_12 - 120 HTH_19 PF12844.2 64 3.5e-05 18.3 0.0 1 1 3.2e-07 4.9e-05 17.8 0.0 7 52 12 58 11 70 0.83 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 6_11 - 91 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.002 12.3 4.1 1 1 4.3e-05 0.0043 11.3 4.1 3 35 6 38 5 39 0.95 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 5_4 - 91 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.0026 11.9 3.3 1 2 0.0027 0.28 5.5 0.3 3 9 6 12 3 14 0.75 # 1731 # 2003 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 5_4 - 91 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.0026 11.9 3.3 2 2 0.0011 0.11 6.8 0.2 3 13 29 39 25 43 0.68 # 1731 # 2003 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 22_2 - 91 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.0026 11.9 3.2 1 2 0.0025 0.25 5.6 0.2 3 9 6 12 2 14 0.60 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 22_2 - 91 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.0026 11.9 3.2 2 2 0.0011 0.11 6.8 0.2 3 13 29 39 25 43 0.68 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 4_6 - 390 TIGR01246 TIGR01246 370 5.6e-08 26.3 0.0 1 1 2.7e-10 8.2e-08 25.7 0.0 101 306 110 315 101 336 0.83 # 3002 # 4171 # -1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.438 24_3 - 266 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.0016 12.1 0.0 1 1 1e-05 0.0031 11.1 0.0 23 42 98 117 84 124 0.89 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 34_1 - 338 HTH_29 PF13551.1 112 6e-16 53.1 0.1 1 1 3.2e-17 1.1e-15 52.3 0.1 1 109 30 137 30 140 0.94 # 3 # 1016 # -1 # ID=34_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 20_3 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 1.5e-12 42.1 0.3 1 2 2.5e-07 8.4e-06 20.4 0.0 16 75 26 80 11 86 0.82 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 20_3 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 1.5e-12 42.1 0.3 2 2 3.2e-08 1.1e-06 23.3 0.3 1 76 68 145 68 167 0.79 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 6_12 - 120 HTH_29 PF13551.1 112 2e-06 22.4 0.2 1 1 1e-07 3.3e-06 21.7 0.2 6 35 12 40 8 95 0.67 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_3 - 214 HTH_29 PF13551.1 112 4.2e-05 18.2 0.0 1 2 0.038 1.3 3.7 0.0 7 38 22 52 16 54 0.84 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_3 - 214 HTH_29 PF13551.1 112 4.2e-05 18.2 0.0 2 2 9.2e-05 0.0031 12.1 0.0 15 46 116 147 89 167 0.86 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_47 - 149 HTH_29 PF13551.1 112 6e-05 17.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.00048 14.7 0.0 6 33 116 142 113 147 0.92 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 19_2 - 90 HTH_29 PF13551.1 112 7.3e-05 17.4 0.0 1 1 2.3e-06 7.8e-05 17.3 0.0 7 45 22 60 18 86 0.85 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 5_1 - 88 HTH_29 PF13551.1 112 0.00011 16.8 0.1 1 1 4.9e-06 0.00016 16.3 0.1 11 47 29 64 18 87 0.74 # 1 # 264 # -1 # ID=5_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 15_1 - 219 HTH_29 PF13551.1 112 0.00082 14.0 0.0 1 1 0.00054 0.018 9.7 0.0 15 41 129 155 120 173 0.86 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 24_2 - 391 HTH_29 PF13551.1 112 0.003 12.2 0.9 1 1 0.00029 0.0096 10.6 0.0 8 34 14 39 8 43 0.82 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 7_3 - 363 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 4.1e-09 31.2 0.1 1 2 2.8e-09 8.4e-07 23.7 0.0 1 160 13 157 13 157 0.78 # 4806 # 5894 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 7_3 - 363 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 4.1e-09 31.2 0.1 2 2 0.008 2.4 2.7 0.1 83 108 172 196 165 273 0.75 # 4806 # 5894 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 12_4 - 754 Plug PF07715.10 108 3.9e-10 34.5 4.6 1 1 1.3e-12 3.9e-10 34.5 4.6 13 107 61 166 44 167 0.89 # 2316 # 4577 # 1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 19_1 - 498 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 4.2e-104 342.0 5.0 1 2 0.035 1.5 2.4 1.2 161 219 14 86 2 100 0.44 # 3 # 1496 # 1 # ID=19_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.566 19_1 - 498 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 4.2e-104 342.0 5.0 2 2 1.4e-105 6.1e-104 341.4 0.1 1 270 160 446 160 447 0.98 # 3 # 1496 # 1 # ID=19_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.566 3_4 - 534 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.4e-102 335.7 0.9 1 1 8e-104 3.4e-102 335.7 0.9 1 270 197 483 197 484 0.98 # 2350 # 3951 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 10_6 - 531 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.3e-97 319.3 1.8 1 1 1.5e-98 6.6e-97 318.4 0.0 1 271 189 480 189 480 0.98 # 5346 # 6938 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.547 6_4 - 411 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 4.6e-59 194.3 7.9 1 3 0.028 1.2 2.7 1.6 159 204 35 83 12 125 0.66 # 1127 # 2359 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.561 6_4 - 411 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 4.6e-59 194.3 7.9 2 3 5.5e-52 2.4e-50 165.7 0.0 1 140 186 339 186 340 0.97 # 1127 # 2359 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.561 6_4 - 411 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 4.6e-59 194.3 7.9 3 3 8.5e-11 3.7e-09 30.6 0.3 159 208 334 385 331 394 0.88 # 1127 # 2359 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.561 5_13 - 212 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1e-52 173.4 0.0 1 1 2.6e-54 1.1e-52 173.3 0.0 2 188 9 211 8 211 0.94 # 5509 # 6144 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.571 5_14 - 127 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.3e-24 81.3 0.0 1 1 4.1e-26 1.8e-24 80.8 0.0 197 270 2 75 1 76 0.96 # 6163 # 6543 # 1 # ID=5_14;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.577 8_9 - 44 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.5e-07 24.1 0.0 1 1 8.1e-09 3.5e-07 24.1 0.0 68 97 3 34 1 43 0.89 # 7289 # 7420 # -1 # ID=8_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.576 24_3 - 266 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.001 13.2 0.0 1 1 5e-05 0.005 11.0 0.0 18 120 95 192 81 196 0.61 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 20_4 - 107 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0015 12.7 0.0 1 1 2.1e-05 0.0021 12.2 0.0 7 37 50 80 47 102 0.80 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 8_3 - 260 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0026 11.9 0.1 1 1 0.00011 0.011 9.9 0.0 8 37 90 119 87 138 0.80 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 7_1 - 950 PhoH PF02562.11 205 1.9e-07 25.0 0.0 1 2 0.0044 0.33 4.6 0.0 22 37 142 157 131 166 0.83 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 PhoH PF02562.11 205 1.9e-07 25.0 0.0 2 2 4.9e-07 3.7e-05 17.5 0.0 122 173 317 369 309 394 0.83 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 20_4 - 107 PhoH PF02562.11 205 2.4e-07 24.6 0.0 1 1 6.1e-09 4.6e-07 23.7 0.0 11 51 55 96 44 100 0.77 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 8_3 - 260 PhoH PF02562.11 205 3.2e-07 24.2 0.1 1 1 1.5e-08 1.2e-06 22.4 0.0 11 48 94 131 83 146 0.81 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 24_3 - 266 PhoH PF02562.11 205 4.5e-06 20.5 0.0 1 1 1.4e-07 1e-05 19.3 0.0 15 47 93 125 80 149 0.87 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 8_3 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 0.00012 16.3 0.2 1 1 1e-05 0.001 13.3 0.2 1 74 104 173 104 185 0.74 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 24_3 - 266 AAA_5 PF07728.9 139 0.00025 15.3 2.4 1 1 6.8e-06 0.00068 13.8 0.7 1 19 99 117 99 192 0.84 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 20_4 - 107 AAA_5 PF07728.9 139 0.002 12.3 0.2 1 1 4.5e-05 0.0046 11.2 0.1 1 16 65 80 65 85 0.89 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 8_3 - 260 ResIII PF04851.10 184 0.0008 13.7 0.0 1 2 0.00012 0.018 9.3 0.0 8 51 89 128 49 137 0.78 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 8_3 - 260 ResIII PF04851.10 184 0.0008 13.7 0.0 2 2 0.01 1.5 3.0 0.0 112 164 131 187 125 204 0.72 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 20_4 - 107 ResIII PF04851.10 184 0.0017 12.6 0.0 1 1 1.3e-05 0.0019 12.5 0.0 7 51 49 89 12 102 0.78 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 2_10 - 409 PAPS_reduct PF01507.14 174 5.7e-20 66.3 0.2 1 2 5.6e-12 1.7e-09 32.2 0.0 3 52 33 87 31 115 0.90 # 8577 # 9803 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 2_10 - 409 PAPS_reduct PF01507.14 174 5.7e-20 66.3 0.2 2 2 5.9e-12 1.8e-09 32.1 0.1 99 160 162 234 122 249 0.88 # 8577 # 9803 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 1_37 - 751 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 9.5e-150 492.9 0.0 1 1 1.2e-151 1.2e-149 492.6 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 28741 # 30993 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_20 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.2e-06 21.8 0.1 1 2 7.2e-08 7.2e-06 19.2 0.0 15 53 479 517 470 547 0.80 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_20 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.2e-06 21.8 0.1 2 2 0.061 6.1 -0.3 0.0 261 317 713 769 684 772 0.92 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_17 - 107 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00035 13.7 0.0 1 2 0.049 4.9 0.0 0.0 294 331 24 61 16 68 0.71 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_17 - 107 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00035 13.7 0.0 2 2 9.8e-06 0.00098 12.2 0.0 5 42 62 99 58 103 0.88 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 8_5 - 400 TIGR01968 TIGR01968 261 1.3e-06 22.1 0.0 1 2 0.003 0.3 4.5 0.0 4 28 111 135 108 152 0.83 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 8_5 - 400 TIGR01968 TIGR01968 261 1.3e-06 22.1 0.0 2 2 1.5e-06 0.00015 15.3 0.0 102 137 235 270 224 280 0.85 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 4_10 - 215 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00023 14.7 2.1 1 2 1.2e-05 0.0012 12.3 0.8 3 50 3 44 1 49 0.80 # 6602 # 7246 # 1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 4_10 - 215 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00023 14.7 2.1 2 2 0.025 2.5 1.5 0.0 101 140 63 102 49 123 0.75 # 6602 # 7246 # 1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 4_12 - 327 TIGR01968 TIGR01968 261 0.0015 12.1 1.4 1 1 5.7e-05 0.0058 10.1 1.4 46 128 63 155 60 219 0.72 # 8054 # 9034 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 13_1 - 91 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 8.6e-07 23.1 0.1 1 1 6.1e-09 9.2e-07 23.0 0.1 91 154 20 80 3 84 0.81 # 2 # 274 # 1 # ID=13_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 30_5 - 91 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 1.4e-06 22.5 0.1 1 1 9.8e-09 1.5e-06 22.4 0.1 91 154 20 80 3 84 0.82 # 1190 # 1462 # -1 # ID=30_5;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 24_3 - 266 AAA_18 PF13238.1 129 0.0016 13.3 0.3 1 1 1.5e-05 0.0044 11.8 0.2 1 19 100 118 100 160 0.82 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 33_1 - 386 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 0.00027 15.4 0.0 1 1 1.7e-06 0.00051 14.5 0.0 72 124 245 298 218 299 0.84 # 1 # 1158 # 1 # ID=33_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.543 20_3 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.0013 12.8 0.2 1 2 0.018 5.5 1.1 0.0 23 31 29 37 28 37 0.87 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 20_3 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.0013 12.8 0.2 2 2 7e-05 0.021 8.9 0.1 10 26 73 89 72 89 0.85 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 5_4 - 91 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 3e-32 104.3 0.1 1 1 4e-34 4e-32 103.9 0.1 1 46 42 87 42 87 0.99 # 1731 # 2003 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 22_2 - 91 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 6.8e-32 103.2 0.5 1 1 9.1e-34 9.1e-32 102.8 0.5 1 46 42 87 42 87 0.99 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 6_11 - 91 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 6.5e-31 100.0 0.3 1 1 8.9e-33 8.9e-31 99.6 0.3 1 46 42 87 42 87 0.99 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 20_4 - 107 DUF258 PF03193.11 161 2.2e-05 18.2 0.0 1 1 1.8e-07 2.7e-05 17.9 0.0 21 53 49 81 30 99 0.73 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 8_3 - 260 DUF258 PF03193.11 161 4e-05 17.3 0.0 1 1 4e-07 6e-05 16.7 0.0 21 78 88 157 70 190 0.71 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 7_3 - 363 Glycos_transf_1 PF00534.15 172 1.5e-26 87.3 0.0 1 1 7.9e-29 2.4e-26 86.6 0.0 15 171 185 340 179 341 0.87 # 4806 # 5894 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 24_3 - 266 AAA_35 PF14516.1 331 0.0012 11.9 0.2 1 3 0.0049 1.5 1.8 0.1 237 272 10 42 5 59 0.79 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_3 - 266 AAA_35 PF14516.1 331 0.0012 11.9 0.2 2 3 0.0042 1.3 2.0 0.0 21 75 87 141 75 153 0.77 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_3 - 266 AAA_35 PF14516.1 331 0.0012 11.9 0.2 3 3 0.00079 0.24 4.4 0.1 122 161 153 192 144 199 0.90 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_3 - 266 AAA_3 PF07726.6 131 0.0025 11.9 0.0 1 1 1.4e-05 0.0043 11.1 0.0 2 75 100 171 99 222 0.74 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_20 - 876 DUF87 PF01935.12 229 8e-07 23.5 0.0 1 1 1.6e-08 2.4e-06 22.0 0.0 26 222 482 669 468 676 0.75 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_17 - 107 DUF87 PF01935.12 229 0.0004 14.7 0.0 1 1 4.1e-06 0.00061 14.1 0.0 25 50 74 99 72 103 0.91 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 20_3 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 1.3e-24 80.4 0.3 1 2 8.8e-13 1.8e-11 38.4 0.0 1 50 10 60 10 61 0.93 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 20_3 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 1.3e-24 80.4 0.3 2 2 3.1e-13 6.3e-12 39.8 0.2 2 47 68 115 67 121 0.93 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 5_1 - 88 HTH_28 PF13518.1 52 2.6e-08 28.3 0.5 1 1 2.6e-09 5.2e-08 27.3 0.0 1 43 17 60 17 64 0.93 # 1 # 264 # -1 # ID=5_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 34_1 - 338 HTH_28 PF13518.1 52 3e-08 28.0 0.9 1 1 6.9e-09 1.4e-07 25.9 0.1 1 50 29 79 29 84 0.89 # 3 # 1016 # -1 # ID=34_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 15_1 - 219 HTH_28 PF13518.1 52 3.6e-08 27.8 0.2 1 2 0.013 0.27 5.8 0.0 13 41 36 65 27 71 0.82 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 15_1 - 219 HTH_28 PF13518.1 52 3.6e-08 27.8 0.2 2 2 1.1e-06 2.3e-05 18.8 0.0 15 41 129 155 129 159 0.94 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 1_3 - 214 HTH_28 PF13518.1 52 7.8e-08 26.7 0.1 1 2 0.00089 0.018 9.6 0.0 4 38 17 52 15 52 0.84 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_3 - 214 HTH_28 PF13518.1 52 7.8e-08 26.7 0.1 2 2 2.4e-05 0.00048 14.6 0.0 15 41 116 142 116 145 0.93 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 6_12 - 120 HTH_28 PF13518.1 52 9.2e-08 26.5 0.1 1 1 9.8e-09 2e-07 25.4 0.1 7 34 12 39 8 40 0.89 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 19_2 - 90 HTH_28 PF13518.1 52 1.3e-07 26.0 0.0 1 1 9.4e-09 1.9e-07 25.5 0.0 6 43 20 58 18 64 0.83 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 6_2 - 102 HTH_28 PF13518.1 52 7.7e-06 20.3 0.0 1 1 5.5e-07 1.1e-05 19.8 0.0 16 41 2 27 1 31 0.94 # 455 # 760 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_47 - 149 HTH_28 PF13518.1 52 9.3e-06 20.1 0.0 1 1 1.4e-06 2.7e-05 18.6 0.0 8 33 116 142 110 146 0.80 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 4_3 - 101 HTH_28 PF13518.1 52 2.1e-05 19.0 0.0 1 1 2e-06 4e-05 18.0 0.0 1 38 12 50 12 55 0.92 # 1177 # 1479 # -1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 5_2 - 62 HTH_28 PF13518.1 52 7.7e-05 17.1 0.0 1 1 5.1e-06 0.0001 16.7 0.0 1 34 27 61 27 61 0.96 # 463 # 648 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.446 18_2 - 64 HTH_28 PF13518.1 52 0.001 13.5 0.3 1 1 0.00012 0.0024 12.4 0.0 1 29 17 46 17 47 0.93 # 77 # 268 # -1 # ID=18_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 45_1 - 101 HTH_28 PF13518.1 52 0.0011 13.5 0.0 1 1 9.6e-05 0.0019 12.7 0.0 1 40 12 51 12 55 0.88 # 59 # 361 # 1 # ID=45_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 28_2 - 117 HTH_28 PF13518.1 52 0.0011 13.5 0.3 1 1 8.3e-05 0.0017 12.9 0.3 5 33 58 87 56 88 0.87 # 331 # 681 # -1 # ID=28_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 8_6 - 327 HTH_28 PF13518.1 52 0.0014 13.1 0.5 1 1 0.00027 0.0055 11.2 0.1 4 34 153 183 152 185 0.87 # 3584 # 4564 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.423 6_12 - 120 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.0023 12.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.0035 12.2 0.0 10 54 24 70 22 72 0.92 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 6_12 - 120 HTH_24 PF13412.1 48 3.2e-07 24.2 0.1 1 1 1e-08 5.2e-07 23.5 0.1 10 40 11 40 10 43 0.89 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 19_2 - 90 HTH_24 PF13412.1 48 4.5e-07 23.7 0.0 1 1 1.4e-08 6.9e-07 23.1 0.0 16 46 26 56 22 56 0.91 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 8_6 - 327 HTH_24 PF13412.1 48 6e-06 20.1 0.1 1 1 4.3e-07 2.1e-05 18.3 0.1 14 39 158 183 154 185 0.92 # 3584 # 4564 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.423 36_3 - 96 HTH_24 PF13412.1 48 4.2e-05 17.4 0.0 1 1 1.4e-06 7e-05 16.7 0.0 8 36 37 65 35 66 0.92 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_3 - 214 HTH_24 PF13412.1 48 0.00017 15.5 0.0 1 1 8.5e-06 0.00043 14.1 0.0 8 40 15 49 10 52 0.93 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 4_5 - 305 HTH_24 PF13412.1 48 0.00021 15.1 0.1 1 1 1.3e-05 0.00064 13.6 0.0 24 43 26 45 25 46 0.94 # 2048 # 2962 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 10_4 - 416 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 1.2e-18 61.9 0.0 1 1 1.3e-20 2e-18 61.2 0.0 1 133 143 278 143 283 0.90 # 3452 # 4699 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 24_3 - 266 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00091 13.8 0.0 1 1 2.4e-05 0.0036 11.8 0.0 17 111 93 201 82 223 0.69 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 2_12 - 295 HTH_18 PF12833.2 81 2.1e-14 47.9 0.1 1 1 2.3e-16 3.4e-14 47.2 0.1 1 81 213 291 213 291 0.96 # 10654 # 11538 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.334 20_5 - 262 HTH_18 PF12833.2 81 7.1e-13 43.0 0.0 1 1 9.5e-15 1.4e-12 42.0 0.0 3 78 181 254 179 256 0.92 # 1366 # 2151 # -1 # ID=20_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.305 6_12 - 120 HTH_30 PF13556.1 59 0.0002 15.4 0.0 1 1 1e-06 0.00031 14.8 0.0 10 34 15 39 10 43 0.87 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 6_11 - 91 FUR PF01475.14 120 0.0046 11.4 1.8 1 2 0.00014 0.043 8.2 0.4 68 94 15 42 3 60 0.80 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 6_11 - 91 FUR PF01475.14 120 0.0046 11.4 1.8 2 2 0.0073 2.2 2.7 0.0 37 50 71 84 65 87 0.86 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 6_12 - 120 HTH_10 PF04967.7 53 0.001 13.1 0.0 1 1 1.2e-05 0.0019 12.3 0.0 24 45 18 39 15 43 0.89 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 19_2 - 90 HTH_10 PF04967.7 53 0.002 12.2 0.0 1 1 2.3e-05 0.0035 11.4 0.0 24 44 28 48 26 53 0.86 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 34_1 - 338 HTH_33 PF13592.1 60 2e-05 18.6 4.4 1 3 0.098 30 -1.2 0.0 11 31 16 36 11 40 0.74 # 3 # 1016 # -1 # ID=34_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 34_1 - 338 HTH_33 PF13592.1 60 2e-05 18.6 4.4 2 3 1.9e-07 5.6e-05 17.1 0.0 2 52 107 157 106 163 0.94 # 3 # 1016 # -1 # ID=34_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 34_1 - 338 HTH_33 PF13592.1 60 2e-05 18.6 4.4 3 3 0.025 7.6 0.7 0.0 30 42 242 254 239 257 0.88 # 3 # 1016 # -1 # ID=34_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.531 22_2 - 91 PhnA_Zn_Ribbon PF08274.7 30 0.0011 13.3 1.7 1 1 1.5e-05 0.0022 12.3 1.7 4 18 7 27 6 36 0.72 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 6_11 - 91 PhnA_Zn_Ribbon PF08274.7 30 0.0018 12.5 0.2 1 1 2e-05 0.0031 11.8 0.2 4 26 7 35 7 36 0.91 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 24_3 - 266 DEAD PF00270.24 169 0.0013 12.7 0.1 1 1 3.3e-05 0.01 9.8 0.1 13 64 96 144 83 203 0.68 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 36_3 - 96 HTH_31 PF13560.1 64 4.8e-12 40.4 0.0 1 1 9e-14 6.8e-12 39.9 0.0 6 57 38 88 34 93 0.94 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 6_12 - 120 HTH_31 PF13560.1 64 2.8e-05 18.8 0.0 1 1 6e-07 4.5e-05 18.1 0.0 12 54 15 60 13 61 0.85 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 19_2 - 90 HTH_31 PF13560.1 64 0.00017 16.3 0.0 1 1 3.1e-06 0.00023 15.8 0.0 8 36 21 49 18 75 0.84 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 8_6 - 327 HTH_31 PF13560.1 64 0.00043 14.9 2.0 1 1 6.1e-06 0.00046 14.9 0.4 5 52 153 211 149 218 0.78 # 3584 # 4564 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.423 7_1 - 950 DUF2075 PF09848.4 352 2.6e-07 24.3 2.0 1 3 0.00041 0.12 5.7 0.0 5 25 143 163 141 214 0.78 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 DUF2075 PF09848.4 352 2.6e-07 24.3 2.0 2 3 3.1e-05 0.0092 9.4 0.0 76 224 307 455 245 465 0.79 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 DUF2075 PF09848.4 352 2.6e-07 24.3 2.0 3 3 0.00021 0.062 6.7 0.0 316 349 521 553 510 556 0.77 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_40 - 1756 UvrD_C_2 PF13538.1 104 4e-07 24.6 0.7 1 2 0.037 5.5 1.7 0.0 6 44 1226 1264 1222 1293 0.76 # 31712 # 36979 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.599 1_40 - 1756 UvrD_C_2 PF13538.1 104 4e-07 24.6 0.7 2 2 7.8e-08 1.2e-05 19.9 0.2 3 102 1340 1443 1338 1445 0.77 # 31712 # 36979 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.599 7_1 - 950 UvrD_C_2 PF13538.1 104 4.6e-07 24.4 1.0 1 1 5.2e-08 7.8e-06 20.5 1.0 46 104 451 553 409 553 0.73 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 24_3 - 266 TIP49 PF06068.8 398 0.0013 11.9 0.1 1 2 0.00014 0.041 7.0 0.0 52 71 99 118 96 135 0.77 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_3 - 266 TIP49 PF06068.8 398 0.0013 11.9 0.1 2 2 0.0031 0.92 2.5 0.0 295 357 181 238 158 250 0.73 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_2 - 391 HTH_36 PF13730.1 55 0.0024 12.5 0.0 1 1 4.2e-05 0.0063 11.1 0.0 28 47 20 39 6 40 0.90 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 6_12 - 120 HTH_36 PF13730.1 55 0.0026 12.4 0.0 1 1 2.6e-05 0.0039 11.8 0.0 31 46 23 38 11 40 0.89 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_17 - 107 T2SE PF00437.15 272 0.0023 11.3 0.0 1 1 8.1e-06 0.0024 11.2 0.0 108 154 55 98 27 103 0.81 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 4_12 - 327 StbA PF06406.6 318 2.9e-155 510.4 1.0 1 1 2.2e-157 3.3e-155 510.2 1.0 1 318 1 319 1 319 1.00 # 8054 # 9034 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 5_12 - 176 StbA PF06406.6 318 1.9e-74 244.9 0.3 1 1 1.4e-76 2.1e-74 244.7 0.3 146 317 1 172 1 173 0.99 # 4875 # 5402 # -1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.354 24_3 - 266 NACHT PF05729.7 166 0.00041 14.5 0.4 1 1 6.1e-05 0.0092 10.1 0.4 3 21 100 118 98 218 0.88 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 7_1 - 950 NACHT PF05729.7 166 0.0013 12.9 0.2 1 1 5.3e-05 0.0079 10.3 0.0 3 27 142 166 140 200 0.81 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 24_3 - 266 AAA_17 PF13207.1 121 3.2e-05 19.2 0.0 1 1 1.7e-06 0.00017 16.9 0.0 2 64 100 156 99 200 0.57 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_37 - 751 AAA_17 PF13207.1 121 0.00097 14.4 0.0 1 1 2.2e-05 0.0022 13.3 0.0 3 28 189 218 187 353 0.73 # 28741 # 30993 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 20_4 - 107 AAA_17 PF13207.1 121 0.0028 13.0 0.0 1 1 5.1e-05 0.0051 12.1 0.0 2 17 66 81 65 101 0.86 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 1_19 - 74 DZR PF12773.2 50 0.0017 12.7 1.6 1 1 1.3e-05 0.004 11.5 1.6 14 41 36 67 33 72 0.70 # 12237 # 12458 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 39_3 - 56 Transposase_mut PF00872.13 381 0.0011 12.0 0.3 1 1 3.7e-06 0.0011 12.0 0.3 8 50 9 51 1 54 0.82 # 541 # 708 # 1 # ID=39_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 24_3 - 266 AAA_25 PF13481.1 194 2e-06 21.8 0.1 1 1 4.1e-08 4.1e-06 20.8 0.1 22 65 81 130 60 186 0.70 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 20_4 - 107 AAA_25 PF13481.1 194 5.5e-05 17.1 0.0 1 1 6.8e-07 6.8e-05 16.8 0.0 18 55 47 85 30 90 0.77 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 8_3 - 260 AAA_25 PF13481.1 194 7.6e-05 16.6 0.0 1 1 1.3e-06 0.00013 15.9 0.0 22 58 90 127 71 178 0.79 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 7_1 - 950 Viral_helicase1 PF01443.13 234 4.8e-12 40.3 1.9 1 3 0.0014 0.21 5.5 0.0 2 23 143 166 142 204 0.79 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 Viral_helicase1 PF01443.13 234 4.8e-12 40.3 1.9 2 3 1.3e-10 2e-08 28.5 0.2 35 202 288 490 270 498 0.82 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 Viral_helicase1 PF01443.13 234 4.8e-12 40.3 1.9 3 3 0.0042 0.63 3.9 0.1 212 232 532 552 524 554 0.75 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_40 - 1756 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0017 12.3 0.0 1 2 0.00054 0.081 6.8 0.0 1 23 987 1011 987 1190 0.74 # 31712 # 36979 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.599 1_40 - 1756 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0017 12.3 0.0 2 2 0.0097 1.5 2.7 0.0 166 234 1381 1446 1330 1446 0.61 # 31712 # 36979 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.599 1_17 - 107 Pox_A32 PF04665.7 241 0.00033 14.4 0.0 1 1 7.9e-06 0.00079 13.2 0.0 7 42 66 101 60 104 0.89 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 7_1 - 950 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0013 12.5 0.0 1 1 2.7e-05 0.0027 11.4 0.0 6 34 132 160 127 173 0.86 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 1_20 - 876 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0023 11.7 0.1 1 1 6.9e-05 0.0069 10.1 0.0 7 38 473 504 469 519 0.85 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 24_3 - 266 RuvB_N PF05496.7 234 3.2e-05 17.5 0.1 1 1 2.2e-07 6.5e-05 16.5 0.1 48 119 95 176 73 187 0.73 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_3 - 266 AAA_14 PF13173.1 128 9.4e-08 26.5 0.0 1 1 3.7e-09 3.7e-07 24.6 0.0 3 96 98 197 96 206 0.72 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 7_1 - 950 AAA_14 PF13173.1 128 5.5e-07 24.0 0.0 1 2 6.8e-05 0.0069 10.8 0.0 4 45 141 180 138 206 0.85 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 AAA_14 PF13173.1 128 5.5e-07 24.0 0.0 2 2 0.00016 0.016 9.6 0.0 30 101 278 353 263 360 0.66 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 8_3 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 3.1e-06 21.6 0.0 1 1 5.9e-08 5.9e-06 20.7 0.0 2 96 102 203 101 220 0.68 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 8_5 - 400 VirC1 PF07015.6 231 4.6e-05 17.0 0.0 1 2 0.012 1.8 2.0 0.0 6 28 113 135 110 163 0.81 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 8_5 - 400 VirC1 PF07015.6 231 4.6e-05 17.0 0.0 2 2 6.3e-06 0.00095 12.7 0.0 51 136 210 297 206 344 0.87 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 4_10 - 215 VirC1 PF07015.6 231 0.0012 12.4 0.0 1 2 0.0015 0.22 5.0 0.0 3 29 3 29 1 36 0.81 # 6602 # 7246 # 1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 4_10 - 215 VirC1 PF07015.6 231 0.0012 12.4 0.0 2 2 0.001 0.16 5.5 0.0 87 190 77 181 59 194 0.70 # 6602 # 7246 # 1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 31_1 - 376 Transposase_20 PF02371.11 87 2e-28 92.8 0.1 1 1 3.9e-30 3.9e-28 91.9 0.1 2 76 223 297 222 309 0.94 # 131 # 1258 # 1 # ID=31_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_3 - 340 Transposase_20 PF02371.11 87 9.6e-26 84.2 0.1 1 1 2e-27 2e-25 83.2 0.1 2 76 211 285 210 297 0.93 # 854 # 1873 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 17_1 - 399 Transposase_20 PF02371.11 87 8.3e-25 81.2 0.2 1 1 3.3e-26 3.3e-24 79.3 0.6 3 86 277 358 275 359 0.95 # 357 # 1553 # 1 # ID=17_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 19_2 - 90 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 1.1e-05 19.0 0.0 1 1 4.2e-07 1.8e-05 18.3 0.0 28 51 28 51 23 52 0.91 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 6_12 - 120 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 3.5e-05 17.4 0.0 1 1 1.8e-06 7.9e-05 16.3 0.0 20 49 10 39 2 40 0.82 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 5_1 - 88 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00027 14.6 0.2 1 1 2.5e-05 0.0011 12.6 0.1 7 42 8 44 8 46 0.93 # 1 # 264 # -1 # ID=5_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 18_2 - 64 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00038 14.1 0.1 1 1 1.1e-05 0.00049 13.8 0.1 7 42 8 44 8 46 0.93 # 77 # 268 # -1 # ID=18_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 45_1 - 101 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.0019 11.8 0.0 1 1 0.00023 0.01 9.5 0.0 7 50 3 47 2 49 0.91 # 59 # 361 # 1 # ID=45_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 24_2 - 391 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.0021 11.7 0.0 1 1 0.00014 0.0059 10.3 0.0 31 49 21 39 20 40 0.90 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_47 - 149 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.0024 11.5 0.0 1 1 0.00017 0.0073 10.0 0.0 32 48 126 142 114 142 0.90 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 20_3 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 1.9e-07 25.4 0.1 1 2 0.0023 0.23 5.9 0.0 58 81 31 54 20 57 0.87 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 20_3 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 1.9e-07 25.4 0.1 2 2 5.9e-07 5.9e-05 17.4 0.2 39 86 69 117 66 121 0.89 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 4_3 - 101 DUF1153 PF06627.6 90 0.00032 15.0 0.1 1 1 5.1e-06 0.00051 14.4 0.1 28 75 3 50 1 66 0.87 # 1177 # 1479 # -1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 45_1 - 101 DUF1153 PF06627.6 90 0.0012 13.2 0.1 1 1 2.4e-05 0.0024 12.2 0.0 28 75 3 50 1 59 0.91 # 59 # 361 # 1 # ID=45_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 24_3 - 266 AAA_33 PF13671.1 143 0.00095 13.5 0.0 1 1 7.6e-06 0.0023 12.3 0.0 2 40 100 143 100 169 0.64 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 5_1 - 88 CENP-B_N PF04218.8 53 4.7e-06 20.5 0.0 1 1 1.1e-07 8.4e-06 19.6 0.0 3 44 9 51 8 55 0.86 # 1 # 264 # -1 # ID=5_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 5_2 - 62 CENP-B_N PF04218.8 53 6.2e-06 20.1 0.0 1 1 9.9e-08 7.4e-06 19.8 0.0 8 44 24 61 19 61 0.88 # 463 # 648 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.446 18_2 - 64 CENP-B_N PF04218.8 53 1.1e-05 19.2 0.1 1 1 2.2e-07 1.7e-05 18.7 0.1 3 39 9 46 8 47 0.89 # 77 # 268 # -1 # ID=18_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 6_12 - 120 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00013 15.8 0.1 1 1 2.9e-06 0.00022 15.1 0.1 19 47 14 42 2 43 0.82 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 24_3 - 266 ArgK PF03308.11 267 0.00032 14.0 0.0 1 1 2.3e-06 0.00068 12.9 0.0 27 66 95 134 81 136 0.85 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_37 - 751 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 2e-09 31.0 0.0 1 1 4e-11 6e-09 29.4 0.0 264 361 382 476 198 500 0.82 # 28741 # 30993 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_20 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00017 14.7 0.0 1 2 0.00085 0.13 5.2 0.0 105 185 533 607 470 623 0.86 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_20 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00017 14.7 0.0 2 2 0.00022 0.033 7.2 0.0 319 378 711 769 663 771 0.90 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_17 - 107 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00036 15.2 0.0 1 1 2.6e-06 0.00079 14.1 0.0 1 29 75 103 75 106 0.91 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 8_3 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00057 14.1 0.1 1 2 0.0029 0.43 4.7 0.0 2 30 105 133 104 161 0.83 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 8_3 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00057 14.1 0.1 2 2 0.00039 0.059 7.5 0.0 88 113 157 182 143 204 0.72 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 24_3 - 266 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00091 13.4 0.0 1 2 0.0012 0.17 6.0 0.0 2 17 100 115 99 129 0.80 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 24_3 - 266 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00091 13.4 0.0 2 2 0.002 0.31 5.2 0.0 83 107 147 170 136 197 0.76 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 6_12 - 120 GcrA PF07750.6 162 0.00015 16.4 0.0 1 1 5.3e-07 0.00016 16.4 0.0 6 36 5 34 2 85 0.93 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 43_1 - 168 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.1e-79 257.9 0.8 1 1 2.4e-81 3.7e-79 257.7 0.8 1 131 37 167 37 167 0.99 # 16 # 519 # -1 # ID=43_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.550 25_2 - 87 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.2e-18 62.0 0.1 1 1 9.9e-21 1.5e-18 61.6 0.1 68 118 4 54 2 59 0.93 # 831 # 1091 # 1 # ID=25_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 2_10 - 409 ATP_bind_3 PF01171.15 182 5.2e-06 20.5 0.0 1 1 2.9e-08 8.6e-06 19.8 0.0 2 41 32 72 31 97 0.84 # 8577 # 9803 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 6_11 - 91 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0021 12.1 4.5 1 1 4.7e-05 0.0048 11.0 4.5 3 36 6 39 5 40 0.94 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 22_2 - 91 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0027 11.8 3.5 1 2 0.0024 0.24 5.5 0.2 3 9 6 12 2 14 0.60 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 22_2 - 91 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0027 11.8 3.5 2 2 0.00085 0.086 7.0 0.3 3 36 29 39 25 43 0.62 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 5_4 - 91 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0034 11.5 3.9 1 2 0.0026 0.26 5.4 0.3 3 9 6 12 3 14 0.75 # 1731 # 2003 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 5_4 - 91 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0034 11.5 3.9 2 2 0.00095 0.095 6.8 0.4 26 36 29 39 25 42 0.61 # 1731 # 2003 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 7_3 - 363 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 7.1e-07 23.6 0.0 1 1 1.3e-08 4e-06 21.1 0.0 4 172 5 159 2 163 0.62 # 4806 # 5894 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 20_4 - 107 Ras PF00071.17 162 0.0023 11.8 0.0 1 1 1.3e-05 0.004 11.0 0.0 2 28 66 92 65 104 0.85 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 6_10 - 195 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 7.3e-11 36.7 0.0 1 1 1.3e-12 1e-10 36.2 0.0 2 129 36 166 35 178 0.86 # 6770 # 7354 # 1 # ID=6_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 42_1 - 207 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 3.3e-08 28.1 0.0 1 1 5.8e-10 4.4e-08 27.7 0.0 2 137 41 178 40 180 0.92 # 43 # 663 # -1 # ID=42_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 4_2 - 273 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 9.1e-07 23.4 0.3 1 1 1.8e-08 1.4e-06 22.8 0.0 2 139 111 252 110 253 0.86 # 323 # 1141 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 32_3 - 136 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 3e-06 21.7 0.0 1 1 6.5e-08 4.9e-06 21.0 0.0 2 60 65 124 64 126 0.95 # 844 # 1251 # 1 # ID=32_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.490 36_3 - 96 HTH_26 PF13443.1 63 1.3e-07 26.3 0.0 1 1 1.3e-09 2e-07 25.7 0.0 5 55 41 90 37 91 0.90 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 6_12 - 120 HTH_26 PF13443.1 63 3.3e-06 21.7 0.0 1 1 3.1e-08 4.7e-06 21.2 0.0 4 41 11 48 10 58 0.90 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_47 - 149 HTH_17 PF12728.2 51 9.3e-05 17.1 0.0 1 1 2.3e-06 0.00024 15.8 0.0 5 22 125 142 122 146 0.92 # 40028 # 40474 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.503 10_4 - 416 HTH_17 PF12728.2 51 0.0011 13.7 0.0 1 1 2.8e-05 0.0028 12.4 0.0 4 21 385 403 384 412 0.86 # 3452 # 4699 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 6_12 - 120 HTH_17 PF12728.2 51 0.0012 13.5 0.2 1 1 2.8e-05 0.0028 12.4 0.2 6 27 22 44 18 89 0.88 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 5_4 - 91 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 2.1e-05 18.9 4.6 1 2 4.3e-05 0.0043 11.5 0.1 26 40 5 19 2 20 0.89 # 1731 # 2003 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 5_4 - 91 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 2.1e-05 18.9 4.6 2 2 0.00035 0.036 8.6 0.6 6 23 29 46 28 52 0.81 # 1731 # 2003 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 22_2 - 91 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 6.2e-05 17.4 5.1 1 2 6.3e-05 0.0063 11.0 0.1 26 40 5 19 2 20 0.89 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 22_2 - 91 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 6.2e-05 17.4 5.1 2 2 0.00062 0.063 7.8 0.9 6 21 29 44 28 50 0.82 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 6_11 - 91 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0013 13.2 5.6 1 2 0.00054 0.055 8.0 0.1 28 40 7 19 3 21 0.88 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 6_11 - 91 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0013 13.2 5.6 2 2 0.001 0.1 7.1 1.5 6 16 29 39 28 49 0.89 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 6_11 - 91 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 1.3e-05 19.4 5.6 1 1 2e-07 2e-05 18.8 5.6 19 45 6 36 3 37 0.94 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 22_2 - 91 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 3.9e-05 17.9 9.0 1 1 6e-07 6e-05 17.3 9.0 19 45 6 36 3 37 0.93 # 337 # 609 # 1 # ID=22_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 5_4 - 91 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 3.9e-05 17.9 9.9 1 1 6.1e-07 6.1e-05 17.3 9.9 19 45 6 36 3 37 0.93 # 1731 # 2003 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 6_12 - 120 HTH_11 PF08279.7 55 1.8e-06 22.0 0.1 1 1 6.5e-08 6.5e-06 20.2 0.1 7 37 11 39 5 40 0.80 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 24_2 - 391 HTH_11 PF08279.7 55 0.0002 15.5 0.0 1 1 4.3e-06 0.00043 14.4 0.0 18 37 20 39 5 40 0.81 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 19_2 - 90 HTH_11 PF08279.7 55 0.00036 14.6 0.1 1 1 6.1e-06 0.00061 13.9 0.0 13 33 25 45 18 56 0.84 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 6_11 - 91 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.0021 12.2 0.0 1 1 8.6e-06 0.0026 11.9 0.0 136 176 47 87 36 88 0.89 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 19_2 - 90 MarR_2 PF12802.2 62 3.3e-06 21.2 0.1 1 1 8.9e-08 5.3e-06 20.5 0.1 18 49 24 55 18 57 0.84 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 36_3 - 96 MarR_2 PF12802.2 62 7.9e-06 20.0 0.0 1 1 2e-07 1.2e-05 19.4 0.0 8 41 35 66 31 66 0.91 # 547 # 834 # 1 # ID=36_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 4_5 - 305 MarR_2 PF12802.2 62 0.00098 13.3 0.0 1 1 0.00023 0.014 9.6 0.0 28 46 26 44 10 45 0.83 # 2048 # 2962 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 6_12 - 120 MarR_2 PF12802.2 62 0.0015 12.6 0.1 1 1 7.1e-05 0.0043 11.2 0.0 15 42 13 38 7 40 0.85 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 15_1 - 219 MarR_2 PF12802.2 62 0.0023 12.1 0.0 1 1 0.00012 0.0073 10.5 0.0 3 50 18 65 16 65 0.80 # 195 # 851 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 6_11 - 91 Elf1 PF05129.8 81 0.00017 15.7 1.0 1 1 7.3e-07 0.00022 15.4 1.0 21 59 4 41 1 55 0.80 # 7694 # 7966 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 6_12 - 120 TrmB PF01978.14 68 0.00047 14.3 0.0 1 1 3.1e-06 0.00092 13.4 0.0 16 44 11 39 10 40 0.93 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 24_2 - 391 LacI PF00356.16 46 0.0009 13.3 0.0 1 1 2.4e-05 0.0072 10.4 0.0 2 34 20 52 19 61 0.91 # 102 # 1274 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_3 - 214 UPF0122 PF04297.9 101 0.0017 12.9 0.0 1 1 9.7e-06 0.0029 12.1 0.0 25 63 18 56 14 59 0.92 # 436 # 1077 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 19_2 - 90 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.0016 12.7 0.0 1 1 8.4e-06 0.0025 12.1 0.0 23 56 22 55 13 57 0.84 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 2_10 - 409 Asn_synthase PF00733.16 255 8.5e-05 16.6 0.0 1 1 5.3e-07 0.00016 15.7 0.0 19 58 31 70 13 329 0.88 # 8577 # 9803 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 21_2 - 109 Phage_terminase PF10668.4 60 0.0015 12.8 0.0 1 1 1.7e-05 0.0026 12.0 0.0 9 45 12 53 5 69 0.80 # 271 # 597 # -1 # ID=21_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 41_2 - 109 Phage_terminase PF10668.4 60 0.0015 12.8 0.0 1 1 1.8e-05 0.0028 11.9 0.0 9 45 12 53 5 69 0.80 # 210 # 536 # 1 # ID=41_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 6_12 - 120 DUF1670 PF07900.6 220 0.00096 12.9 0.0 1 1 4.9e-06 0.0015 12.2 0.0 189 219 9 39 4 40 0.92 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_20 - 876 AAA_10 PF12846.2 304 7.9e-49 161.1 0.0 1 1 2.7e-50 1.3e-48 160.4 0.0 1 294 479 768 479 774 0.89 # 12625 # 15252 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_37 - 751 AAA_10 PF12846.2 304 4.5e-10 33.9 0.0 1 1 1.4e-10 7.1e-09 29.9 0.0 3 296 187 494 186 500 0.70 # 28741 # 30993 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 8_3 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 2.5e-05 18.3 0.5 1 1 5.7e-06 0.00028 14.8 0.0 1 33 102 134 102 171 0.89 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_17 - 107 AAA_10 PF12846.2 304 2.8e-05 18.1 0.0 1 2 0.016 0.79 3.5 0.0 273 289 25 41 10 54 0.78 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_17 - 107 AAA_10 PF12846.2 304 2.8e-05 18.1 0.0 2 2 2.2e-05 0.0011 12.9 0.0 2 25 73 96 72 100 0.89 # 11024 # 11344 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 24_3 - 266 AAA_10 PF12846.2 304 0.00032 14.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.00062 13.7 0.0 2 35 98 131 97 173 0.88 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 20_4 - 107 AAA_10 PF12846.2 304 0.00052 13.9 0.1 1 1 5.6e-05 0.0028 11.5 0.0 1 24 63 86 63 94 0.86 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 20_2 - 82 HTH_20 PF12840.2 61 5.8e-05 17.4 0.0 1 1 7.9e-07 8e-05 16.9 0.0 27 50 13 36 1 44 0.80 # 240 # 485 # -1 # ID=20_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.451 6_12 - 120 HTH_20 PF12840.2 61 0.00043 14.6 0.0 1 1 8.2e-06 0.00082 13.7 0.0 19 46 13 39 10 40 0.89 # 8142 # 8501 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 19_2 - 90 HTH_20 PF12840.2 61 0.0017 12.6 0.1 1 1 6.9e-05 0.0069 10.7 0.0 19 42 22 45 15 56 0.89 # 1523 # 1792 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 7_1 - 950 UvrD_C PF13361.1 351 3.8e-07 24.3 0.0 1 2 0.0068 2 2.1 0.1 2 32 381 411 380 465 0.66 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 7_1 - 950 UvrD_C PF13361.1 351 3.8e-07 24.3 0.0 2 2 4.5e-08 1.4e-05 19.2 0.0 293 347 476 553 471 556 0.70 # 566 # 3415 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 8_5 - 400 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.0016 11.9 0.0 1 1 4.9e-05 0.0073 9.8 0.0 5 42 112 156 109 173 0.74 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 24_3 - 266 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.002 11.6 0.0 1 1 2.1e-05 0.0031 11.0 0.0 6 38 102 134 98 169 0.91 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 8_5 - 400 AAA_31 PF13614.1 157 1.5e-07 25.9 0.1 1 2 0.00019 0.059 7.8 0.0 3 44 111 158 109 210 0.86 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 8_5 - 400 AAA_31 PF13614.1 157 1.5e-07 25.9 0.1 2 2 7e-07 0.00021 15.7 0.0 108 148 235 274 233 279 0.87 # 2385 # 3584 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 24_3 - 266 IstB_IS21 PF01695.12 178 3.7e-77 252.2 0.7 1 1 1e-78 7.9e-77 251.1 0.0 1 177 51 227 51 228 0.99 # 1274 # 2071 # 1 # ID=24_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 8_3 - 260 IstB_IS21 PF01695.12 178 5.9e-71 232.0 0.1 1 1 1.7e-72 1.3e-70 230.9 0.1 1 178 56 235 56 235 0.98 # 879 # 1658 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 20_4 - 107 IstB_IS21 PF01695.12 178 8.8e-27 88.1 0.0 1 1 1.4e-28 1.1e-26 87.8 0.0 1 74 17 90 17 101 0.94 # 1104 # 1424 # 1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 5_5 - 78 IstB_IS21 PF01695.12 178 7.4e-13 42.7 0.0 1 1 1.2e-14 8.9e-13 42.5 0.0 1 56 11 66 11 69 0.96 # 2339 # 2572 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 1_19 - 74 GATA PF00320.22 36 0.00089 13.1 0.7 1 2 0.00038 0.11 6.4 0.2 22 27 36 41 28 43 0.85 # 12237 # 12458 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_19 - 74 GATA PF00320.22 36 0.00089 13.1 0.7 2 2 0.00074 0.22 5.4 0.0 21 35 56 70 52 71 0.87 # 12237 # 12458 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_40 - 1756 AAA_11 PF13086.1 236 0.00025 15.1 2.4 1 1 1.8e-06 0.00055 14.0 0.0 2 75 968 1038 967 1058 0.81 # 31712 # 36979 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.599 20_3 - 174 BrkDBD PF09607.5 58 0.0025 11.9 0.0 1 1 3.6e-05 0.011 9.8 0.0 11 47 11 44 2 51 0.80 # 482 # 1003 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.458 38_2 - 258 HTH_21 PF13276.1 60 2.6e-17 57.1 0.6 1 1 1.3e-18 6.3e-17 55.9 0.6 6 57 49 106 45 109 0.79 # 187 # 960 # 1 # ID=38_2;partial=01;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.562 20_2 - 82 HTH_21 PF13276.1 60 3.1e-13 44.1 3.0 1 1 9.8e-15 4.9e-13 43.4 3.0 6 44 43 80 38 80 0.91 # 240 # 485 # -1 # ID=20_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.451 4_2 - 273 HTH_21 PF13276.1 60 3.6e-11 37.4 5.4 1 1 1.9e-12 9.4e-11 36.1 5.4 3 59 27 82 23 83 0.89 # 323 # 1141 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.510 3_10 - 84 HTH_21 PF13276.1 60 1.5e-10 35.5 1.7 1 1 4e-12 2e-10 35.0 1.7 16 59 5 47 2 48 0.91 # 6303 # 6554 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 55_2 - 48 HTH_21 PF13276.1 60 2.4e-06 22.0 0.2 1 1 5e-08 2.5e-06 21.9 0.2 3 38 12 46 7 47 0.82 # 125 # 268 # -1 # ID=55_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.528 45_2 - 56 HTH_21 PF13276.1 60 8.8e-05 17.0 0.2 1 1 2.3e-06 0.00011 16.6 0.2 3 31 27 55 22 56 0.83 # 397 # 564 # 1 # ID=45_2;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/5636e782-2cef-4f46-ad4f-09b436d442be # Target file: checkm_output/bins/pm795/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm795/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/5636e782-2cef-4f46-ad4f-09b436d442be checkm_output/bins/pm795/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:14:47 2017 # [ok]