# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 7_3 - 370 TrkA_N PF02254.13 116 7.6e-05 15.7 0.0 1 1 2.6e-06 0.00014 14.9 0.0 1 45 190 236 190 246 0.83 # 597 # 1706 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 2_9 - 590 TrkA_N PF02254.13 116 0.00034 13.6 0.1 1 1 3.1e-05 0.0016 11.4 0.1 2 35 315 349 314 434 0.80 # 7001 # 8770 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 1_16 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.5e-06 19.0 0.2 1 3 0.0041 0.43 2.3 0.2 187 223 95 129 86 132 0.74 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.5e-06 19.0 0.2 2 3 2.9e-06 0.0003 12.7 0.0 130 231 217 309 200 339 0.79 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.5e-06 19.0 0.2 3 3 0.022 2.3 -0.0 0.0 139 160 345 366 314 376 0.63 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_3 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 1.3e-05 17.7 0.2 1 1 4.6e-07 4.8e-05 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 2_13 - 610 ABC_tran PF00005.22 137 0.0001 15.6 0.0 1 1 3.1e-06 0.00033 13.9 0.0 6 42 97 133 93 209 0.74 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 3_6 - 190 HTH_22 PF13309.1 64 5.3e-06 19.2 0.1 1 1 4.4e-07 1.5e-05 17.7 0.1 45 62 168 185 166 187 0.92 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_12 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 2.7e-05 16.9 0.4 1 1 4e-06 0.00014 14.6 0.0 47 64 166 183 164 183 0.93 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_3 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 0.0003 13.6 1.5 1 1 3.5e-05 0.0012 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_3 - 370 ADH_N PF08240.7 109 3.7e-30 96.9 2.6 1 1 3.5e-32 3.7e-30 96.9 2.6 2 108 28 154 27 155 0.92 # 597 # 1706 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_28 - 424 Cdd1 PF11731.3 93 0.00044 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.0012 11.8 0.0 10 47 177 214 143 227 0.86 # 23341 # 24612 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_9 - 590 ThiF PF00899.16 136 4.1e-22 71.4 0.0 1 1 8.3e-24 8.7e-22 70.4 0.0 3 129 312 445 310 451 0.86 # 7001 # 8770 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 1_13 - 71 DUF2116 PF09889.4 59 0.0017 11.1 5.7 1 1 0.00073 0.077 5.9 5.7 6 35 14 54 12 60 0.75 # 13597 # 13809 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 11_2 - 277 rve_3 PF13683.1 67 1.3e-34 110.6 0.3 1 1 6.1e-36 3.2e-34 109.3 0.3 1 67 189 255 189 255 0.99 # 362 # 1192 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 2_11 - 77 rve_3 PF13683.1 67 1.6e-28 91.1 0.2 1 1 4e-30 2.1e-28 90.7 0.2 6 67 2 63 1 63 0.98 # 9286 # 9516 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_3 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.00069 12.8 0.6 1 1 2.1e-05 0.0022 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_3 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 3.2e-06 19.6 1.4 1 1 1.8e-07 6.2e-06 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 3_6 - 190 HTH_38 PF13936.1 44 1.2e-05 17.8 0.0 1 1 1.1e-06 3.8e-05 16.2 0.0 4 39 148 184 145 185 0.93 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 2_3 - 129 HTH_38 PF13936.1 44 0.00031 13.3 0.0 1 1 1.2e-05 0.00043 12.9 0.0 5 31 12 41 8 45 0.83 # 1037 # 1423 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 3_6 - 190 SpoIIID PF12116.3 82 6.3e-05 15.9 0.1 1 2 0.038 4 0.5 0.0 33 55 8 30 4 37 0.84 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 3_6 - 190 SpoIIID PF12116.3 82 6.3e-05 15.9 0.1 2 2 5.8e-06 0.00061 12.7 0.0 11 42 157 188 149 189 0.82 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 2_9 - 590 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 0.00014 14.0 0.0 1 1 4.8e-06 0.00025 13.2 0.0 29 61 304 336 293 360 0.82 # 7001 # 8770 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 7_3 - 370 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 0.00052 12.2 0.1 1 1 1.9e-05 0.001 11.2 0.1 34 76 185 228 173 240 0.82 # 597 # 1706 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 6_2 - 303 TIGR01830 TIGR01830 239 7.9e-46 149.3 0.0 1 1 8.9e-48 9.3e-46 149.1 0.0 1 237 60 298 60 300 0.93 # 2514 # 3422 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_16 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 6.2e-07 21.7 3.8 1 2 5.9e-09 6.2e-07 21.7 3.8 1 41 100 139 100 159 0.83 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 6.2e-07 21.7 3.8 2 2 0.01 1.1 1.2 0.0 84 120 305 341 261 364 0.71 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_5 - 209 MobB PF03205.9 140 6.4e-05 15.7 0.1 1 1 1.6e-06 0.00017 14.3 0.0 10 42 11 41 1 46 0.79 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_16 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.5e-18 60.5 0.1 1 3 1.5e-06 0.00016 14.8 0.0 164 199 95 130 48 134 0.85 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.5e-18 60.5 0.1 2 3 5.8e-09 6.1e-07 22.6 0.0 115 201 219 304 174 306 0.81 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.5e-18 60.5 0.1 3 3 5.6e-08 5.9e-06 19.4 0.0 89 147 317 372 309 431 0.82 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_6 - 190 NanE PF04131.9 192 0.00022 13.2 0.0 1 2 0.00013 0.013 7.4 0.0 47 79 9 41 1 69 0.76 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 3_6 - 190 NanE PF04131.9 192 0.00022 13.2 0.0 2 2 0.0018 0.19 3.6 0.0 58 141 83 161 75 177 0.70 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_16 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 4.1e-06 20.0 1.2 1 2 3.7e-05 0.0019 11.4 0.2 9 38 100 129 96 164 0.90 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 4.1e-06 20.0 1.2 2 2 0.00098 0.051 6.9 0.1 8 45 271 314 264 382 0.66 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_9 - 590 NAD_binding_7 PF13241.1 103 0.00024 14.3 0.0 1 1 4.2e-05 0.0022 11.2 0.0 5 88 309 435 307 437 0.65 # 7001 # 8770 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 6_4 - 75 HTH_8 PF02954.14 42 1e-09 30.8 0.3 1 1 2.5e-11 1.3e-09 30.5 0.3 9 41 39 71 37 72 0.93 # 4253 # 4477 # -1 # ID=6_4;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.418 1_12 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00013 14.4 0.2 1 2 0.047 2.5 0.8 0.1 2 12 114 124 113 124 0.85 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_12 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00013 14.4 0.2 2 2 3.2e-05 0.0017 10.9 0.0 20 37 163 180 159 183 0.86 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 7_5 - 219 TetR_N PF00440.18 47 3.1e-18 58.2 0.0 1 1 1e-19 5.2e-18 57.5 0.0 2 47 10 55 9 55 0.97 # 3081 # 3737 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_6 - 190 TetR_N PF00440.18 47 0.00026 13.6 0.0 1 1 9.9e-06 0.00052 12.7 0.0 17 36 166 185 164 185 0.94 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 4_5 - 209 AAA_19 PF13245.1 76 0.00064 12.5 0.1 1 2 9.6e-05 0.01 8.6 0.0 20 48 11 35 9 44 0.84 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 4_5 - 209 AAA_19 PF13245.1 76 0.00064 12.5 0.1 2 2 0.025 2.6 0.9 0.0 42 62 135 155 118 180 0.76 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 4_5 - 209 CbiA PF01656.18 195 2.5e-22 72.2 0.0 1 1 9.4e-24 4.9e-22 71.2 0.0 1 154 3 137 3 176 0.78 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_30 - 402 CbiA PF01656.18 195 1.6e-18 59.8 0.0 1 1 5.6e-20 3e-18 58.9 0.0 1 142 111 292 111 327 0.76 # 25668 # 26873 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 11_2 - 277 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0002 13.8 0.0 1 1 9.5e-06 0.0005 12.5 0.0 20 49 2 31 1 31 0.95 # 362 # 1192 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_29 - 325 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00054 12.4 0.1 1 1 2.7e-05 0.0014 11.1 0.1 23 50 157 184 152 185 0.88 # 24694 # 25668 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 2_6 - 252 Rep_3 PF01051.16 222 6.1e-50 162.8 0.0 1 1 1.3e-51 6.9e-50 162.6 0.0 3 222 16 242 14 242 0.91 # 2635 # 3390 # 1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_32 - 289 Rep_3 PF01051.16 222 7.5e-49 159.2 0.0 1 1 1.8e-50 9.2e-49 158.9 0.0 3 213 65 278 63 283 0.95 # 27914 # 28780 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.442 11_2 - 277 rve PF00665.21 120 2.7e-24 78.6 0.0 1 1 2.8e-25 5.8e-24 77.5 0.0 2 120 103 218 102 218 0.93 # 362 # 1192 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 5_2 - 265 rve PF00665.21 120 1.3e-13 44.2 0.0 1 1 9.2e-14 1.9e-12 40.3 0.0 8 117 83 189 79 192 0.90 # 1208 # 2002 # 1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.610 12_1 - 182 rve PF00665.21 120 4.5e-13 42.4 0.1 1 2 0.049 1 2.5 0.0 78 102 27 49 5 54 0.83 # 2 # 547 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 12_1 - 182 rve PF00665.21 120 4.5e-13 42.4 0.1 2 2 5e-13 1e-11 38.0 0.0 9 118 75 181 70 182 0.90 # 2 # 547 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_12 - 72 rve PF00665.21 120 2.1e-10 33.7 0.0 1 1 1.1e-11 2.3e-10 33.6 0.0 26 84 12 69 4 71 0.85 # 9538 # 9753 # -1 # ID=2_12;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 2_11 - 77 rve PF00665.21 120 0.00018 14.6 0.0 1 1 2.2e-05 0.00046 13.3 0.0 96 120 2 26 1 26 0.94 # 9286 # 9516 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 6_1 - 514 zf-ribbon_3 PF13248.1 26 0.059 5.7 9.1 1 2 9.1e-05 0.0095 8.2 0.9 18 24 95 101 93 108 0.74 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 6_1 - 514 zf-ribbon_3 PF13248.1 26 0.059 5.7 9.1 2 2 0.0085 0.9 1.9 0.1 18 23 449 454 446 457 0.83 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 4_5 - 209 YhjQ PF06564.7 244 2.4e-05 16.8 0.3 1 2 1.8e-06 0.00019 13.8 0.3 4 38 3 37 1 50 0.89 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 4_5 - 209 YhjQ PF06564.7 244 2.4e-05 16.8 0.3 2 2 0.029 3.1 0.0 0.0 108 144 69 103 44 113 0.78 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 2_9 - 590 F420_oxidored PF03807.12 96 3.3e-05 17.3 0.0 1 1 9.1e-07 9.5e-05 15.8 0.0 1 23 313 335 313 372 0.90 # 7001 # 8770 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 1_29 - 325 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.00031 13.5 0.5 1 1 7.2e-06 0.00075 12.3 0.2 48 97 133 185 124 190 0.84 # 24694 # 25668 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 11_1 - 88 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.2e-21 69.4 0.1 1 1 5.5e-23 1.4e-21 69.2 0.1 4 76 2 71 1 71 0.97 # 72 # 335 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 4_3 - 101 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 2e-13 43.2 0.6 1 1 9.2e-15 2.4e-13 42.9 0.6 1 76 1 76 1 76 0.94 # 2338 # 2640 # -1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 12_1 - 182 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00018 14.5 0.5 1 1 1.5e-05 0.00038 13.4 0.5 4 51 6 58 4 64 0.79 # 2 # 547 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_12 - 187 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00022 14.2 0.1 1 1 1.8e-05 0.00047 13.1 0.1 15 44 154 182 140 186 0.79 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 12_1 - 182 DDE_3 PF13358.1 146 0.00011 14.9 0.0 1 2 0.076 8 -0.8 0.0 44 79 25 61 16 81 0.72 # 2 # 547 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 12_1 - 182 DDE_3 PF13358.1 146 0.00011 14.9 0.0 2 2 3.3e-06 0.00035 13.3 0.0 32 90 82 141 59 148 0.87 # 2 # 547 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 4_5 - 209 MipZ PF09140.6 261 2e-21 69.2 0.5 1 2 2.4e-12 1.2e-10 33.8 0.0 2 53 2 52 1 60 0.89 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 4_5 - 209 MipZ PF09140.6 261 2e-21 69.2 0.5 2 2 3.2e-12 1.7e-10 33.4 0.0 87 140 65 118 58 128 0.92 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_30 - 402 MipZ PF09140.6 261 2e-06 20.0 0.0 1 2 0.0053 0.28 3.1 0.0 3 50 111 163 109 193 0.73 # 25668 # 26873 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_30 - 402 MipZ PF09140.6 261 2e-06 20.0 0.0 2 2 1.7e-06 9.1e-05 14.6 0.0 87 136 233 282 220 296 0.87 # 25668 # 26873 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_38 - 207 DivIC PF04977.10 80 0.032 6.8 9.0 1 3 0.003 0.31 3.6 0.9 17 52 95 130 91 145 0.64 # 33557 # 34177 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.688 1_38 - 207 DivIC PF04977.10 80 0.032 6.8 9.0 2 3 0.016 1.7 1.3 0.1 33 53 128 148 116 159 0.70 # 33557 # 34177 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.688 1_38 - 207 DivIC PF04977.10 80 0.032 6.8 9.0 3 3 0.00035 0.037 6.6 1.3 22 50 166 194 155 199 0.84 # 33557 # 34177 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.688 3_6 - 190 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00019 13.7 0.0 1 2 0.028 2.9 0.3 0.0 31 40 148 157 144 160 0.85 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 3_6 - 190 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00019 13.7 0.0 2 2 1.5e-05 0.0016 10.8 0.0 18 37 163 182 148 188 0.88 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_16 - 562 Thi4 PF01946.12 230 0.00028 13.0 0.4 1 1 6.3e-06 0.00067 11.7 0.4 19 70 100 150 95 158 0.88 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_13 - 610 AAA PF00004.24 132 0.00023 14.4 2.2 1 1 6.2e-06 0.00065 12.9 0.1 4 112 108 215 106 225 0.65 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 1_29 - 325 HTH_37 PF13744.1 80 0.00033 13.4 1.0 1 1 3e-05 0.0032 10.3 0.2 27 53 156 182 134 185 0.87 # 24694 # 25668 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 4_5 - 209 TIGR00064 TIGR00064 279 0.00026 12.9 0.5 1 2 0.00073 0.077 4.8 0.1 89 116 11 38 1 45 0.88 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 4_5 - 209 TIGR00064 TIGR00064 279 0.00026 12.9 0.5 2 2 0.00024 0.026 6.4 0.0 153 175 68 90 60 99 0.82 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 2_11 - 77 rve_2 PF13333.1 52 1.8e-08 27.4 0.0 1 1 4.2e-10 2.2e-08 27.1 0.0 1 47 16 66 16 69 0.95 # 9286 # 9516 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 11_2 - 277 rve_2 PF13333.1 52 1.5e-05 18.0 0.0 1 1 7.9e-07 4.2e-05 16.6 0.0 1 47 208 258 208 261 0.96 # 362 # 1192 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 3_6 - 190 MRP-L20 PF12824.2 164 3.4e-06 20.1 0.0 1 1 4.5e-08 4.7e-06 19.6 0.0 70 123 133 184 116 189 0.78 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_20 - 152 MerR_1 PF13411.1 69 3.6e-20 64.5 0.0 1 1 1.9e-21 6.6e-20 63.7 0.0 2 67 9 75 8 77 0.96 # 17396 # 17851 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_15 - 122 MerR_1 PF13411.1 69 5.4e-13 41.6 0.0 1 1 2.2e-14 7.8e-13 41.1 0.0 1 68 4 72 4 73 0.97 # 14108 # 14473 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 3_6 - 190 MerR_1 PF13411.1 69 0.00015 14.5 0.4 1 2 0.022 0.76 2.7 0.0 45 66 78 99 76 102 0.82 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 3_6 - 190 MerR_1 PF13411.1 69 0.00015 14.5 0.4 2 2 0.00019 0.0068 9.2 0.1 1 23 166 188 166 189 0.94 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 2_13 - 610 AAA_16 PF13191.1 185 0.0014 11.6 0.3 1 2 0.0012 0.12 5.3 0.1 29 81 107 157 101 174 0.66 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 2_13 - 610 AAA_16 PF13191.1 185 0.0014 11.6 0.3 2 2 0.0015 0.15 5.0 0.1 142 175 160 200 137 210 0.68 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 2_13 - 610 AAA_22 PF13401.1 131 1.3e-05 18.4 0.1 1 1 3.5e-07 3.7e-05 16.9 0.1 3 125 101 215 99 218 0.81 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 1_12 - 187 NUMOD1 PF07453.8 37 0.00058 12.7 0.0 1 1 1.1e-05 0.0011 11.8 0.0 19 37 164 182 164 182 0.94 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_16 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 1e-19 63.8 5.4 1 2 1.2e-06 0.00013 15.4 1.5 2 31 101 130 100 132 0.95 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 1e-19 63.8 5.4 2 2 3.2e-17 3.3e-15 49.3 0.1 1 72 272 342 272 351 0.91 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_3 - 101 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 6.6e-06 19.4 0.1 1 1 1e-07 1.1e-05 18.8 0.1 20 52 17 49 14 73 0.88 # 2338 # 2640 # -1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 6_2 - 303 adh_short_C2 PF13561.1 241 5.2e-29 94.6 0.0 1 1 5.8e-31 6.1e-29 94.4 0.0 5 239 66 298 63 300 0.95 # 2514 # 3422 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_12 - 187 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 3e-05 16.7 0.0 1 1 1.3e-06 6.7e-05 15.6 0.0 10 42 157 185 151 186 0.86 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_3 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 9.9e-05 15.0 0.0 1 1 3.9e-06 0.0002 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 4_5 - 209 SRP54 PF00448.17 196 2.7e-07 23.2 0.1 1 1 1.5e-08 1.6e-06 20.7 0.1 4 98 2 91 1 134 0.80 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_16 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 4.6e-09 28.1 5.0 1 2 4.3e-07 4.5e-05 15.0 2.8 2 33 100 131 99 139 0.91 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 4.6e-09 28.1 5.0 2 2 1.7e-06 0.00018 13.0 0.0 83 163 286 362 281 379 0.85 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_38 - 207 Mnd1 PF03962.10 188 0.0012 11.5 2.4 1 1 2.3e-05 0.0025 10.5 2.3 71 149 97 179 80 194 0.74 # 33557 # 34177 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.688 6_2 - 303 adh_short PF00106.20 167 2e-34 111.9 0.1 1 1 2.4e-36 2.5e-34 111.6 0.1 3 166 60 225 58 226 0.98 # 2514 # 3422 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 12_1 - 182 HTH_32 PF13565.1 77 7.7e-07 22.9 0.2 1 1 1.8e-07 3.8e-06 20.7 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 2 # 547 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_6 - 190 HTH_32 PF13565.1 77 1.1e-06 22.3 0.5 1 1 5.2e-07 1.1e-05 19.2 0.2 7 76 127 185 121 186 0.71 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 5_2 - 265 HTH_32 PF13565.1 77 0.00021 15.1 0.2 1 1 3.3e-05 0.0007 13.4 0.2 37 76 25 60 15 61 0.83 # 1208 # 2002 # 1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.610 11_2 - 277 HTH_32 PF13565.1 77 0.00032 14.5 1.5 1 2 1.5e-05 0.00032 14.5 1.5 24 76 27 76 9 77 0.73 # 362 # 1192 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 11_2 - 277 HTH_32 PF13565.1 77 0.00032 14.5 1.5 2 2 0.069 1.5 2.8 0.3 8 60 75 121 72 131 0.57 # 362 # 1192 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_12 - 187 HTH_32 PF13565.1 77 0.0012 12.6 6.7 1 1 0.00013 0.0028 11.5 3.5 7 77 124 182 119 182 0.68 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 4_7 - 205 TIGR00609 TIGR00609 1175 0.00081 10.1 0.0 1 1 8.1e-06 0.00085 10.0 0.0 606 658 26 79 14 130 0.82 # 6003 # 6617 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.553 6_1 - 514 A2L_zn_ribbon PF08792.5 33 0.007 8.9 4.7 1 2 0.00018 0.019 7.5 0.6 5 29 76 101 74 102 0.90 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 6_1 - 514 A2L_zn_ribbon PF08792.5 33 0.007 8.9 4.7 2 2 0.0078 0.82 2.3 0.3 20 28 446 454 444 457 0.62 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_12 - 187 HTH_3 PF01381.17 55 0.00027 13.8 0.7 1 1 1.1e-05 0.0012 11.7 0.4 2 31 152 183 151 184 0.86 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 6_2 - 303 Epimerase PF01370.16 236 4.2e-05 16.0 0.0 1 1 5.3e-07 5.6e-05 15.6 0.0 1 157 60 224 60 239 0.80 # 2514 # 3422 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 11_1 - 88 HTH_23 PF13384.1 50 1.4e-07 24.1 0.2 1 1 3.6e-08 3.8e-07 22.7 0.0 9 45 12 46 6 51 0.87 # 72 # 335 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 4_3 - 101 HTH_23 PF13384.1 50 1.5e-06 20.8 0.0 1 1 6.7e-07 7e-06 18.6 0.0 7 43 12 48 7 56 0.82 # 2338 # 2640 # -1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 12_1 - 182 HTH_23 PF13384.1 50 5.3e-06 19.0 0.8 1 1 1.3e-05 0.00014 14.5 0.1 28 42 41 55 40 63 0.87 # 2 # 547 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_6 - 190 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-05 17.7 0.0 1 1 4.1e-06 4.3e-05 16.1 0.0 12 37 160 185 151 188 0.84 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_12 - 187 HTH_23 PF13384.1 50 2e-05 17.2 1.3 1 1 2.9e-06 3.1e-05 16.6 0.1 10 39 151 183 148 184 0.82 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_3 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 4.6e-05 16.0 0.3 1 1 4.4e-06 4.6e-05 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 6_4 - 75 HTH_23 PF13384.1 50 0.00027 13.6 0.0 1 1 3.9e-05 0.00041 13.0 0.0 14 40 44 71 39 73 0.84 # 4253 # 4477 # -1 # ID=6_4;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.418 7_5 - 219 HTH_23 PF13384.1 50 0.00029 13.5 0.1 1 1 8.9e-05 0.00093 11.9 0.0 10 39 13 47 5 56 0.81 # 3081 # 3737 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_29 - 325 HTH_23 PF13384.1 50 0.00034 13.3 0.1 1 1 0.00025 0.0026 10.5 0.0 9 40 152 183 151 188 0.88 # 24694 # 25668 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 11_2 - 277 HTH_23 PF13384.1 50 0.00059 12.5 4.5 1 1 9.2e-05 0.00096 11.8 0.0 12 37 2 28 1 38 0.86 # 362 # 1192 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 4_5 - 209 Fer4_NifH PF00142.13 273 7.5e-05 14.9 0.0 1 1 2.3e-06 0.00024 13.3 0.0 8 38 9 39 2 46 0.89 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 3_6 - 190 HTH_7 PF02796.10 45 1.1e-17 56.6 0.1 1 1 1.6e-18 5.7e-17 54.4 0.1 1 44 144 188 144 189 0.98 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_12 - 187 HTH_7 PF02796.10 45 1.1e-16 53.5 0.3 1 1 7.1e-18 2.5e-16 52.3 0.3 1 44 141 184 141 185 0.98 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_3 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 2.4e-13 42.7 1.1 1 1 1.5e-14 5.4e-13 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 6_1 - 514 Ribosomal_S27e PF01667.12 55 9e-05 15.0 0.8 1 1 1.7e-06 9e-05 15.0 0.8 5 33 72 100 69 105 0.90 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_5 - 180 Ribosomal_S27e PF01667.12 55 0.0002 13.9 1.1 1 1 6.9e-06 0.00036 13.1 1.1 5 33 71 99 68 104 0.90 # 5140 # 5679 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 6_2 - 303 DUF1776 PF08643.5 299 0.00011 14.4 0.0 1 1 1.5e-06 0.00016 13.8 0.0 107 196 152 235 146 239 0.85 # 2514 # 3422 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_5 - 180 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.00011 14.9 0.2 1 2 0.0003 0.016 8.0 0.1 2 14 73 85 73 87 0.84 # 5140 # 5679 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_5 - 180 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.00011 14.9 0.2 2 2 0.0034 0.18 4.6 0.0 5 15 95 105 94 114 0.81 # 5140 # 5679 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 6_1 - 514 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.006 9.3 4.0 1 2 0.00087 0.046 6.5 0.1 1 12 73 84 73 87 0.82 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 6_1 - 514 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.006 9.3 4.0 2 2 0.013 0.66 2.8 0.0 5 14 96 105 95 113 0.81 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 2_13 - 610 NB-ARC PF00931.17 287 2.9e-07 22.5 0.6 1 1 1e-08 1.1e-06 20.7 0.6 17 183 100 259 85 268 0.69 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 2_3 - 129 Ribosomal_S20p PF01649.13 84 0.00029 14.2 0.1 1 1 4.9e-06 0.00052 13.4 0.1 6 47 56 97 53 115 0.77 # 1037 # 1423 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 11_1 - 88 HTH_29 PF13551.1 112 3e-06 20.4 0.1 1 1 1.4e-07 3.7e-06 20.1 0.1 4 37 13 45 11 85 0.82 # 72 # 335 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 4_3 - 101 HTH_29 PF13551.1 112 0.0001 15.4 0.1 1 1 5.7e-06 0.00015 14.9 0.1 6 46 17 56 12 86 0.75 # 2338 # 2640 # -1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_3 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00011 15.3 0.6 1 2 0.098 2.6 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_3 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00011 15.3 0.6 2 2 4.1e-05 0.0011 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 3_6 - 190 HTH_29 PF13551.1 112 0.00053 13.1 3.1 1 2 0.0044 0.11 5.6 0.3 37 71 129 162 122 166 0.75 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 3_6 - 190 HTH_29 PF13551.1 112 0.00053 13.1 3.1 2 2 0.00055 0.015 8.5 0.0 6 32 159 185 154 188 0.80 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_16 - 562 GIDA PF01134.17 392 2.7e-06 19.4 5.3 1 2 2.6e-08 2.7e-06 19.4 5.3 1 53 100 154 100 290 0.87 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 GIDA PF01134.17 392 2.7e-06 19.4 5.3 2 2 0.01 1.1 1.0 0.3 349 385 390 426 376 430 0.79 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_3 - 370 Met_10 PF02475.11 200 8.5e-05 15.2 0.0 1 1 1.4e-06 0.00015 14.4 0.0 98 143 183 229 178 305 0.81 # 597 # 1706 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 2_9 - 590 ApbA PF02558.11 151 8.7e-05 15.0 0.1 1 1 1.5e-06 0.00015 14.2 0.1 1 46 314 361 314 397 0.81 # 7001 # 8770 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 3_5 - 490 MutS_I PF01624.15 113 0.00018 14.6 0.0 1 1 5.5e-06 0.00058 12.9 0.0 54 94 262 302 244 315 0.83 # 4051 # 5520 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 1_16 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.00087 12.6 1.0 1 2 0.08 8.4 -0.3 0.1 1 29 101 129 101 163 0.86 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.00087 12.6 1.0 2 2 6.9e-05 0.0072 9.6 0.1 1 66 273 351 273 371 0.64 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 NAD_binding_8 PF13450.1 68 7.2e-05 15.8 1.2 1 1 6.9e-07 7.2e-05 15.8 1.2 1 35 103 136 103 155 0.91 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 12_1 - 182 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.5e-13 43.5 0.3 1 1 3.2e-15 1.7e-13 43.3 0.3 5 132 10 144 6 173 0.88 # 2 # 547 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 5_2 - 265 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.3e-09 30.6 0.4 1 1 3.8e-11 2e-09 30.0 0.4 11 132 26 153 18 191 0.85 # 1208 # 2002 # 1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.610 2_13 - 610 Arch_ATPase PF01637.13 234 2.2e-05 17.2 1.3 1 2 2.1e-07 2.2e-05 17.2 1.3 19 83 101 175 97 278 0.75 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 2_13 - 610 Arch_ATPase PF01637.13 234 2.2e-05 17.2 1.3 2 2 0.032 3.3 0.2 0.3 39 75 410 448 387 495 0.60 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 1_16 - 562 Trp_halogenase PF04820.9 454 0.0047 8.5 3.3 1 1 8.1e-05 0.0085 7.6 3.3 1 47 100 143 100 151 0.76 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_5 - 209 TIGR01968 TIGR01968 261 2e-11 36.4 1.0 1 2 1.3e-10 6.7e-09 28.1 0.5 3 39 2 38 1 42 0.97 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 4_5 - 209 TIGR01968 TIGR01968 261 2e-11 36.4 1.0 2 2 0.00034 0.018 7.0 0.0 100 135 65 100 60 158 0.83 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_30 - 402 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00089 11.3 0.0 1 2 0.018 0.96 1.3 0.0 4 28 111 135 108 169 0.76 # 25668 # 26873 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_30 - 402 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00089 11.3 0.0 2 2 0.00031 0.016 7.1 0.0 102 138 235 271 226 288 0.87 # 25668 # 26873 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_28 - 424 IMS_HHH PF11798.3 32 2.7e-08 26.6 0.1 1 1 6.4e-10 6.7e-08 25.3 0.1 2 32 170 200 169 200 0.91 # 23341 # 24612 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 7_5 - 219 HTH_psq PF05225.11 45 3.9e-05 16.2 0.0 1 2 2.7e-05 0.0014 11.2 0.0 5 39 10 47 6 52 0.84 # 3081 # 3737 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 7_5 - 219 HTH_psq PF05225.11 45 3.9e-05 16.2 0.0 2 2 0.015 0.77 2.4 0.0 12 22 79 89 77 93 0.87 # 3081 # 3737 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_12 - 187 HTH_psq PF05225.11 45 0.00012 14.6 0.0 1 1 5e-06 0.00026 13.5 0.0 21 39 166 184 165 186 0.91 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 11_1 - 88 HTH_28 PF13518.1 52 1.5e-08 27.6 0.0 1 1 1.2e-09 2.1e-08 27.1 0.0 5 37 13 45 9 57 0.92 # 72 # 335 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 4_3 - 101 HTH_28 PF13518.1 52 1.9e-06 20.9 0.0 1 1 1.7e-07 2.9e-06 20.2 0.0 1 38 10 48 10 58 0.88 # 2338 # 2640 # -1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 12_1 - 182 HTH_28 PF13518.1 52 4e-05 16.6 1.2 1 1 1e-05 0.00018 14.5 1.2 22 36 40 54 12 55 0.75 # 2 # 547 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_12 - 187 HTH_28 PF13518.1 52 5.1e-05 16.3 0.1 1 1 2.9e-06 5.1e-05 16.3 0.1 9 34 158 183 147 184 0.84 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 3_6 - 190 HTH_28 PF13518.1 52 5.9e-05 16.1 0.0 1 1 1.5e-05 0.00025 14.0 0.0 13 32 166 185 159 188 0.87 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_3 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.00014 14.8 0.0 1 1 2.5e-05 0.00045 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_5 - 219 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.00021 14.1 0.0 1 1 3.4e-06 0.00036 13.3 0.0 24 77 13 64 2 68 0.78 # 3081 # 3737 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 2_9 - 590 Shikimate_DH PF01488.15 135 0.00032 13.8 0.1 1 1 6.9e-06 0.00073 12.6 0.1 6 43 305 342 301 420 0.83 # 7001 # 8770 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 1_20 - 152 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 3.5e-21 68.4 1.4 1 1 1.2e-22 6.4e-21 67.6 1.1 1 65 51 113 51 113 0.95 # 17396 # 17851 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_15 - 122 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.0002 14.8 6.6 1 1 6.7e-06 0.00035 14.0 6.6 1 64 47 108 47 109 0.80 # 14108 # 14473 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 3_6 - 190 HTH_24 PF13412.1 48 2.3e-05 16.7 0.0 1 1 7.9e-06 0.00021 13.7 0.0 9 38 157 186 157 188 0.92 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 7_5 - 219 HTH_24 PF13412.1 48 6.3e-05 15.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.00029 13.2 0.0 15 40 23 47 13 50 0.84 # 3081 # 3737 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_29 - 325 HTH_24 PF13412.1 48 6.4e-05 15.3 1.1 1 1 4.5e-06 0.00012 14.5 0.1 15 39 158 182 151 184 0.84 # 24694 # 25668 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 11_2 - 277 HTH_24 PF13412.1 48 0.00066 12.1 0.2 1 1 6.8e-05 0.0018 10.7 0.0 17 36 7 27 1 28 0.86 # 362 # 1192 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_12 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 1.4e-05 17.6 0.2 1 2 0.055 5.8 -0.3 0.1 3 18 124 139 123 154 0.71 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_12 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 1.4e-05 17.6 0.2 2 2 8.6e-07 9e-05 15.0 0.0 27 45 165 183 162 185 0.93 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_16 - 562 TIGR01292 TIGR01292 300 1.4e-19 62.7 3.5 1 2 4.9e-06 0.00052 11.5 1.2 2 39 100 137 99 143 0.91 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 TIGR01292 TIGR01292 300 1.4e-19 62.7 3.5 2 2 3.9e-18 4.1e-16 51.2 0.0 143 296 272 425 214 427 0.82 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_3 - 370 MinC_C PF03775.11 105 0.00058 12.5 0.8 1 2 5e-05 0.0053 9.4 0.1 23 95 175 249 167 253 0.88 # 597 # 1706 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 7_3 - 370 MinC_C PF03775.11 105 0.00058 12.5 0.8 2 2 0.018 1.9 1.2 0.0 15 78 277 343 267 365 0.69 # 597 # 1706 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 2_9 - 590 NAD_binding_2 PF03446.10 163 3.6e-07 23.1 0.0 1 1 6.8e-09 7.1e-07 22.2 0.0 3 77 313 388 311 433 0.82 # 7001 # 8770 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 2_13 - 610 NACHT PF05729.7 166 2.1e-15 49.7 0.1 1 1 4.3e-17 4.5e-15 48.7 0.1 5 161 107 244 103 249 0.83 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 4_5 - 209 AAA_17 PF13207.1 121 2.3e-05 18.2 0.0 1 1 4.3e-07 4.5e-05 17.3 0.0 9 77 11 84 9 205 0.77 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 6_1 - 514 DZR PF12773.2 50 0.0062 9.4 4.8 1 2 0.0017 0.17 4.8 3.4 1 20 77 101 64 109 0.61 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 6_1 - 514 DZR PF12773.2 50 0.0062 9.4 4.8 2 2 0.0053 0.56 3.1 0.0 13 23 448 458 441 487 0.75 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_16 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1e-06 20.8 5.3 1 3 9.5e-09 1e-06 20.8 5.3 2 32 101 131 100 138 0.91 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1e-06 20.8 5.3 2 3 0.034 3.6 -0.8 0.2 142 204 311 366 286 382 0.67 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1e-06 20.8 5.3 3 3 0.0019 0.19 3.4 0.1 373 402 374 405 368 419 0.86 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_5 - 209 AAA_25 PF13481.1 194 0.00014 14.3 0.1 1 1 3.1e-06 0.00032 13.1 0.0 42 87 10 44 3 90 0.78 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 2_13 - 610 AAA_14 PF13173.1 128 1.5e-05 17.9 3.7 1 2 1.6e-07 1.7e-05 17.8 0.4 1 95 101 212 101 217 0.72 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 2_13 - 610 AAA_14 PF13173.1 128 1.5e-05 17.9 3.7 2 2 0.047 4.9 0.1 0.2 47 74 420 452 347 473 0.64 # 10125 # 11954 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.313 4_5 - 209 VirC1 PF07015.6 231 3.2e-09 29.1 0.0 1 1 6.4e-11 6.8e-09 28.1 0.0 3 172 2 164 1 206 0.75 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_10 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 1.1e-24 79.3 0.2 1 1 4.6e-26 2.4e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 8854 # 9858 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 8_3 - 359 Transposase_20 PF02371.11 87 3.9e-14 45.6 0.1 1 1 1.6e-15 8.2e-14 44.5 0.1 9 86 238 315 232 316 0.93 # 752 # 1828 # 1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_20 - 152 MerR PF00376.18 38 1e-14 46.8 0.1 1 1 4e-16 2.1e-14 45.9 0.1 1 38 9 46 9 46 0.99 # 17396 # 17851 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_15 - 122 MerR PF00376.18 38 3.8e-07 22.6 0.1 1 1 1.1e-08 5.9e-07 22.0 0.1 2 38 6 42 5 42 0.89 # 14108 # 14473 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 1_12 - 187 CENP-B_N PF04218.8 53 2.9e-06 19.6 0.0 1 1 1.1e-07 5.6e-06 18.7 0.0 17 43 156 182 152 186 0.92 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 7_5 - 219 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00052 12.4 0.0 1 1 2.3e-05 0.0012 11.3 0.0 26 51 28 53 23 55 0.91 # 3081 # 3737 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 6_2 - 303 Eno-Rase_NADH_b PF12242.3 78 6.1e-06 19.0 0.1 1 1 1.1e-07 1.2e-05 18.1 0.1 33 66 52 83 46 93 0.80 # 2514 # 3422 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_16 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 8.9e-07 21.6 2.3 1 2 3.9e-06 0.00041 12.9 0.3 16 50 94 128 80 131 0.87 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 8.9e-07 21.6 2.3 2 2 0.00012 0.012 8.1 0.1 19 60 269 310 260 341 0.84 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 5_4 - 492 DNA_methylase PF00145.12 335 2.4e-79 259.8 0.0 1 1 4.9e-81 5.1e-79 258.7 0.0 1 331 110 471 110 474 0.86 # 3511 # 4986 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.479 2_5 - 60 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.4e-22 71.9 1.2 1 2 2.1e-19 2.2e-17 56.4 0.0 35 79 1 45 1 45 0.98 # 1634 # 1813 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 2_5 - 60 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.4e-22 71.9 1.2 2 2 5.7e-08 6e-06 19.4 0.3 115 131 43 59 41 59 0.95 # 1634 # 1813 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 2_9 - 590 3HCDH_N PF02737.13 180 1.5e-05 17.7 0.0 1 1 4.7e-07 2.5e-05 17.0 0.0 2 31 314 343 313 397 0.69 # 7001 # 8770 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.446 1_16 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.017 7.7 6.6 1 2 0.017 0.91 2.1 2.8 1 30 100 129 100 133 0.93 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.017 7.7 6.6 2 2 0.0006 0.031 6.9 0.1 2 36 273 307 272 359 0.75 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_5 - 180 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 5.2e-05 15.8 0.1 1 2 0.00019 0.0099 8.5 0.0 2 14 73 85 72 87 0.84 # 5140 # 5679 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_5 - 180 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 5.2e-05 15.8 0.1 2 2 0.0026 0.14 4.8 0.0 5 15 95 105 94 115 0.81 # 5140 # 5679 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 6_1 - 514 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0046 9.6 3.9 1 2 0.0008 0.042 6.5 0.1 1 12 73 84 73 87 0.82 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 6_1 - 514 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0046 9.6 3.9 2 2 0.01 0.54 3.0 0.0 5 14 96 105 95 113 0.81 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_16 - 562 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 0.00016 14.4 0.5 1 1 2.7e-06 0.00028 13.6 0.1 13 39 277 303 274 335 0.84 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 5_2 - 265 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.2e-53 173.8 0.0 1 1 5.8e-55 1.5e-53 173.5 0.0 3 139 83 221 81 222 0.98 # 1208 # 2002 # 1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.610 12_1 - 182 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.4e-41 134.7 0.0 1 1 7.6e-43 2e-41 134.2 0.0 4 108 75 181 73 182 0.98 # 2 # 547 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_1 - 95 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 4.4e-20 65.1 0.0 1 1 1.9e-21 5e-20 64.9 0.0 68 139 1 72 1 73 0.98 # 1 # 285 # 1 # ID=2_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 11_2 - 277 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 0.00043 13.3 0.0 1 1 2.4e-05 0.00063 12.7 0.0 59 139 166 247 152 248 0.76 # 362 # 1192 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 11_1 - 88 HTH_26 PF13443.1 63 0.00031 13.9 0.2 1 2 8.7e-05 0.0045 10.2 0.0 7 33 17 43 16 59 0.84 # 72 # 335 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 11_1 - 88 HTH_26 PF13443.1 63 0.00031 13.9 0.2 2 2 0.044 2.3 1.5 0.4 1 20 64 83 64 86 0.85 # 72 # 335 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 7_5 - 219 HTH_26 PF13443.1 63 0.00066 12.9 0.0 1 1 2.5e-05 0.0013 11.9 0.0 5 40 16 52 14 61 0.81 # 3081 # 3737 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_6 - 190 HTH_17 PF12728.2 51 0.00024 14.3 0.1 1 1 4.8e-06 0.00051 13.3 0.1 2 22 166 186 165 188 0.93 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 6_1 - 514 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.00029 13.8 7.4 1 2 0.00046 0.024 7.6 5.0 7 35 76 102 75 106 0.81 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 6_1 - 514 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.00029 13.8 7.4 2 2 0.0016 0.082 5.9 0.0 8 24 450 466 437 470 0.75 # 508 # 2049 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_5 - 180 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0037 10.2 4.7 1 1 0.00017 0.0088 9.0 4.7 7 35 75 101 74 105 0.90 # 5140 # 5679 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 3_6 - 190 HTH_11 PF08279.7 55 1.6e-06 20.7 0.1 1 1 9.3e-08 4.9e-06 19.2 0.0 6 35 157 185 154 187 0.84 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_12 - 187 HTH_11 PF08279.7 55 0.00015 14.4 0.2 1 1 2.5e-05 0.0013 11.4 0.0 20 37 166 183 162 184 0.91 # 12906 # 13466 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 3_6 - 190 TrmB PF01978.14 68 4.4e-05 16.2 0.0 1 1 1.7e-06 8.8e-05 15.2 0.0 6 42 149 185 146 188 0.92 # 6277 # 6846 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_3 - 186 TrmB PF01978.14 68 5.8e-05 15.8 0.0 1 1 2.3e-06 0.00012 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_16 - 562 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 7.4e-43 139.7 0.0 1 1 1.6e-44 1.7e-42 138.6 0.0 1 199 100 407 100 409 0.96 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 DAO PF01266.19 358 7e-12 37.8 7.5 1 2 1.9e-08 2e-06 19.9 1.5 2 35 101 134 100 161 0.85 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_16 - 562 DAO PF01266.19 358 7e-12 37.8 7.5 2 2 7.7e-09 8.1e-07 21.1 0.5 151 239 314 400 274 529 0.80 # 14491 # 16176 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_38 - 207 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.0011 12.0 4.0 1 2 0.0079 0.83 2.7 0.1 50 98 95 140 83 144 0.72 # 33557 # 34177 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.688 1_38 - 207 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.0011 12.0 4.0 2 2 1.8e-05 0.0019 11.3 1.4 31 101 128 195 121 197 0.88 # 33557 # 34177 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.688 4_5 - 209 AAA_10 PF12846.2 304 0.00016 14.1 0.0 1 1 2.5e-06 0.00026 13.4 0.0 11 39 11 39 3 67 0.90 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_3 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 2.1e-06 20.5 0.2 1 2 0.0037 0.39 3.6 0.0 33 52 8 27 4 28 0.91 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_3 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 2.1e-06 20.5 0.2 2 2 9.1e-06 0.00096 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 3330 # 3887 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 4_5 - 209 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.2e-08 25.9 0.4 1 2 1.2e-09 1.2e-07 24.0 0.1 3 48 3 48 1 69 0.85 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 4_5 - 209 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.2e-08 25.9 0.4 2 2 0.053 5.6 -1.2 0.0 121 135 69 85 47 86 0.75 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 4_5 - 209 AAA_31 PF13614.1 157 4.5e-06 19.6 0.0 1 1 5e-07 2.6e-05 17.1 0.0 2 42 2 42 1 55 0.88 # 3457 # 4083 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.451 1_30 - 402 AAA_31 PF13614.1 157 9.9e-05 15.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.00057 12.8 0.0 108 147 235 273 230 279 0.86 # 25668 # 26873 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_8 - 272 Pterin_bind PF00809.17 210 3e-60 196.1 0.0 1 1 6.8e-62 3.6e-60 195.9 0.0 1 209 10 216 10 217 0.98 # 7351 # 8166 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.609 10_2 - 280 Pterin_bind PF00809.17 210 2.7e-58 189.7 0.0 1 1 6.1e-60 3.2e-58 189.5 0.0 1 210 7 216 7 216 0.98 # 380 # 1219 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 1_5 - 180 NOB1_Zn_bind PF08772.6 73 0.00043 13.1 0.4 1 1 7.8e-06 0.00081 12.2 0.4 10 36 74 104 71 125 0.75 # 5140 # 5679 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 7_3 - 370 ADH_zinc_N PF00107.21 130 1.4e-23 75.9 0.2 1 1 2e-25 2.1e-23 75.3 0.2 1 128 197 330 197 332 0.90 # 597 # 1706 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 6_2 - 303 KR PF08659.5 181 3.5e-13 42.6 0.0 1 1 4.5e-15 4.8e-13 42.1 0.0 3 174 60 236 59 242 0.81 # 2514 # 3422 # 1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_28 - 424 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 5.5e-05 15.7 0.1 1 1 4.5e-06 0.00047 12.7 0.0 5 29 182 206 178 217 0.87 # 23341 # 24612 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 7_3 - 370 ADH_zinc_N_2 PF13602.1 127 9.5e-06 19.5 0.0 1 1 2.1e-07 2.2e-05 18.4 0.0 2 121 231 362 230 363 0.63 # 597 # 1706 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 11_2 - 277 HTH_21 PF13276.1 60 2.3e-16 52.6 8.6 1 1 4.2e-18 4.4e-16 51.7 8.6 2 60 34 90 33 91 0.87 # 362 # 1192 # 1 # ID=11_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/c12b18a6-cb12-4b0b-9ac7-c586e1025b09 # Target file: checkm_output/bins/pm674/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm674/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/c12b18a6-cb12-4b0b-9ac7-c586e1025b09 checkm_output/bins/pm674/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:12:01 2017 # [ok]