# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_4 - 492 ATP-synt_ab PF00006.20 215 5.9e-05 17.0 0.1 1 2 0.044 13 -0.4 0.0 17 34 32 49 28 55 0.88 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 ATP-synt_ab PF00006.20 215 5.9e-05 17.0 0.1 2 2 1.5e-06 0.00043 14.2 0.1 7 66 314 380 307 402 0.80 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_119 - 564 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0015 12.3 0.0 1 1 9.7e-06 0.0028 11.5 0.0 105 138 471 502 451 516 0.71 # 125948 # 127639 # 1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 2_28 - 695 KaiC PF06745.8 227 5.5e-05 16.7 0.0 1 2 7e-06 0.002 11.6 0.0 22 78 201 259 199 342 0.79 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_28 - 695 KaiC PF06745.8 227 5.5e-05 16.7 0.0 2 2 0.0039 1.1 2.6 0.0 48 105 357 414 348 425 0.85 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_25 - 437 TrkA_N PF02254.13 116 0.00015 16.2 0.1 1 2 2.1e-05 0.006 11.0 0.0 1 31 11 41 11 50 0.89 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 TrkA_N PF02254.13 116 0.00015 16.2 0.1 2 2 0.0096 2.8 2.4 0.0 1 35 164 203 164 233 0.76 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_40 - 156 MADF_DNA_bdg PF10545.4 85 0.00053 14.6 0.0 1 1 4.4e-06 0.0013 13.4 0.0 31 65 27 62 23 86 0.80 # 39922 # 40389 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 3_25 - 437 K_oxygenase PF13434.1 341 0.0032 10.8 0.4 1 3 0.00084 0.24 4.6 0.1 189 225 7 41 4 62 0.81 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 K_oxygenase PF13434.1 341 0.0032 10.8 0.4 2 3 0.0059 1.7 1.8 0.0 299 338 73 111 50 114 0.82 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 K_oxygenase PF13434.1 341 0.0032 10.8 0.4 3 3 0.014 4.1 0.5 0.0 186 209 157 180 135 195 0.73 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_4 - 492 ABC_tran PF00005.22 137 9.5e-31 101.3 8.0 1 3 1.7e-09 1.6e-07 26.1 0.1 5 37 24 56 20 66 0.85 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 ABC_tran PF00005.22 137 9.5e-31 101.3 8.0 2 3 3.1e-07 3e-05 18.7 0.0 101 137 94 128 73 128 0.79 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 ABC_tran PF00005.22 137 9.5e-31 101.3 8.0 3 3 9.5e-19 9.1e-17 56.0 0.1 2 136 313 436 312 437 0.81 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 ABC_tran PF00005.22 137 2.1e-17 58.1 0.0 1 3 2.8e-05 0.0027 12.4 0.0 1 28 29 56 29 66 0.91 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 ABC_tran PF00005.22 137 2.1e-17 58.1 0.0 2 3 0.00021 0.02 9.6 0.0 90 136 396 444 334 445 0.67 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 ABC_tran PF00005.22 137 2.1e-17 58.1 0.0 3 3 8.3e-11 7.9e-09 30.3 0.0 1 136 548 799 548 800 0.73 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_13 - 896 ABC_tran PF00005.22 137 8.6e-05 17.3 0.8 1 1 4.2e-06 0.0004 15.1 0.1 15 51 289 325 287 458 0.82 # 10485 # 13172 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_34 - 353 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0026 10.8 0.0 1 2 0.057 16 -1.7 0.0 262 305 125 172 112 198 0.69 # 33672 # 34730 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 1_34 - 353 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0026 10.8 0.0 2 2 2.7e-05 0.0078 9.2 0.0 78 104 276 302 269 329 0.84 # 33672 # 34730 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 1_17 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 3.3e-05 18.0 0.0 1 1 7.5e-07 0.00022 15.4 0.0 47 64 166 183 163 183 0.94 # 15635 # 16192 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.611 3_21 - 370 ADH_N PF08240.7 109 1.9e-29 96.0 1.9 1 1 1.3e-31 1.9e-29 96.0 1.9 2 108 28 154 27 155 0.93 # 19466 # 20575 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 10_2 - 299 ADH_N PF08240.7 109 8.8e-12 39.2 0.0 1 1 9.8e-14 1.4e-11 38.5 0.0 3 62 6 64 4 80 0.93 # 117 # 1013 # -1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.546 1_4 - 492 DUF815 PF05673.8 250 7.3e-05 16.2 0.2 1 2 0.00013 0.036 7.3 0.0 58 77 35 54 27 63 0.85 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 DUF815 PF05673.8 250 7.3e-05 16.2 0.2 2 2 0.00031 0.09 6.0 0.0 55 76 324 345 315 351 0.85 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_25 - 437 FAD_binding_3 PF01494.14 356 2.9e-07 24.2 0.1 1 2 6.8e-08 2e-05 18.2 0.0 3 36 10 43 8 48 0.91 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 FAD_binding_3 PF01494.14 356 2.9e-07 24.2 0.1 2 2 0.0016 0.47 3.8 0.0 5 21 165 181 161 202 0.86 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_130 - 254 N6_Mtase PF02384.11 311 1.2e-08 28.7 0.0 1 2 9e-06 0.0013 12.2 0.0 55 136 109 176 79 179 0.58 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_130 - 254 N6_Mtase PF02384.11 311 1.2e-08 28.7 0.0 2 2 4.1e-06 0.00059 13.3 0.0 161 200 179 219 176 247 0.76 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_119 - 564 N6_Mtase PF02384.11 311 7.2e-06 19.6 0.0 1 1 8.9e-08 1.3e-05 18.8 0.0 89 138 445 492 427 504 0.87 # 125948 # 127639 # 1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_89 - 457 ThiF PF00899.16 136 6.7e-25 81.9 0.6 1 1 5e-27 1.4e-24 80.8 0.6 3 125 186 310 184 317 0.93 # 92040 # 93410 # -1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 5_5 - 468 rve_3 PF13683.1 67 4.6e-05 17.3 0.4 1 1 4.4e-07 0.00013 15.9 0.1 11 56 247 295 237 295 0.86 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_69 - 353 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00035 14.4 0.0 1 1 7.9e-06 0.0023 11.8 0.0 20 120 94 189 78 223 0.65 # 66118 # 67176 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.407 2_28 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3.5e-07 24.2 0.0 1 2 5.4e-07 0.00015 15.6 0.0 22 80 181 236 170 243 0.86 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_28 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3.5e-07 24.2 0.0 2 2 0.00047 0.13 6.0 0.0 169 204 510 542 500 543 0.81 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_130 - 254 N6-adenineMlase PF10237.4 162 2.1e-05 18.6 0.0 1 1 1.1e-07 3.3e-05 18.0 0.0 84 133 163 214 133 225 0.77 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_19 - 659 Helicase_C PF00271.26 78 2.1e-18 60.4 0.0 1 1 1.8e-20 5.3e-18 59.1 0.0 2 77 466 546 465 547 0.98 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_118 - 388 HTH_38 PF13936.1 44 0.00017 15.5 0.1 1 1 1.3e-06 0.00037 14.4 0.1 17 42 178 204 171 204 0.86 # 124537 # 125700 # 1 # ID=1_118;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_4 - 492 MobB PF03205.9 140 0.00014 16.0 0.4 1 2 0.0046 0.44 4.7 0.0 2 20 32 50 31 61 0.86 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 MobB PF03205.9 140 0.00014 16.0 0.4 2 2 0.00023 0.022 8.9 0.1 3 23 325 345 323 353 0.87 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 MobB PF03205.9 140 0.00061 13.9 0.0 1 2 0.038 3.7 1.7 0.0 3 17 42 56 40 68 0.84 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 MobB PF03205.9 140 0.00061 13.9 0.0 2 2 0.00016 0.015 9.4 0.0 3 25 561 583 559 599 0.89 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_13 - 896 MobB PF03205.9 140 0.00099 13.2 0.0 1 1 2.1e-05 0.002 12.2 0.0 4 25 289 309 286 341 0.75 # 10485 # 13172 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_7 - 258 FmrO PF07091.6 251 1.2e-84 277.6 0.0 1 1 4.7e-87 1.3e-84 277.4 0.0 1 251 12 251 12 251 0.99 # 6576 # 7349 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_22 - 680 UvrD-helicase PF00580.16 315 3.4e-39 129.3 0.3 1 1 5.3e-40 3.8e-38 125.9 0.3 2 307 6 260 5 266 0.90 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_73 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.1e-30 101.4 2.9 1 2 2.1e-16 1.5e-14 48.4 0.0 2 105 5 91 4 95 0.92 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_73 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.1e-30 101.4 2.9 2 2 2.2e-17 1.6e-15 51.6 0.3 208 314 145 248 107 249 0.86 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_2 - 181 UvrD-helicase PF00580.16 315 0.00041 14.1 3.8 1 1 6.7e-06 0.00048 13.9 3.8 127 229 52 155 10 161 0.72 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 3_19 - 659 UvrD-helicase PF00580.16 315 0.021 8.5 5.0 1 2 0.0022 0.16 5.5 0.0 23 37 43 57 30 66 0.90 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 UvrD-helicase PF00580.16 315 0.021 8.5 5.0 2 2 0.021 1.5 2.4 2.2 34 74 436 486 432 655 0.58 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_91 - 183 MarR PF01047.17 59 0.0011 13.1 0.1 1 1 7.5e-06 0.0022 12.1 0.1 21 50 133 162 120 165 0.89 # 94627 # 95175 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_4 - 492 DUF3584 PF12128.3 1201 0.021 6.5 13.2 1 3 0.002 0.57 1.7 0.0 13 36 26 49 22 50 0.84 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 DUF3584 PF12128.3 1201 0.021 6.5 13.2 2 3 0.0047 1.3 0.5 7.1 629 703 191 268 173 301 0.38 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 DUF3584 PF12128.3 1201 0.021 6.5 13.2 3 3 8.7e-05 0.025 6.2 0.3 19 37 324 342 318 343 0.88 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_25 - 437 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 3.4e-12 41.2 0.0 1 3 6.5e-06 0.0019 12.7 0.0 1 31 12 41 12 47 0.94 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 3.4e-12 41.2 0.0 2 3 1e-07 3e-05 18.6 0.0 101 191 79 186 50 202 0.63 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 3.4e-12 41.2 0.0 3 3 0.00057 0.16 6.3 0.0 82 151 217 281 204 311 0.76 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 NAD_binding_7 PF13241.1 103 0.0019 12.8 0.1 1 2 7.5e-05 0.021 9.5 0.0 7 45 8 60 3 115 0.67 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 NAD_binding_7 PF13241.1 103 0.0019 12.8 0.1 2 2 0.038 11 0.8 0.0 6 20 160 174 156 188 0.81 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 2_28 - 695 DUF853 PF05872.7 504 8.2e-05 15.4 0.0 1 1 6.2e-07 0.00018 14.3 0.0 10 60 187 237 179 245 0.87 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_55 - 86 TetR_N PF00440.18 47 0.0016 12.5 0.0 1 1 2.1e-05 0.003 11.6 0.0 2 26 33 57 32 57 0.93 # 53588 # 53845 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_2 - 181 TetR_N PF00440.18 47 0.0024 12.0 0.1 1 1 3.8e-05 0.0054 10.8 0.1 15 36 2 23 1 23 0.94 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 1_22 - 680 AAA_19 PF13245.1 76 1.4e-10 35.2 0.1 1 1 5.1e-12 2.9e-10 34.2 0.1 14 75 21 86 11 87 0.88 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_73 - 595 AAA_19 PF13245.1 76 4.2e-09 30.5 0.0 1 1 1e-09 5.8e-08 26.8 0.0 3 75 12 86 10 87 0.84 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 3_19 - 659 AAA_19 PF13245.1 76 2.4e-05 18.5 1.3 1 2 1.3e-05 0.00076 13.6 0.2 15 54 38 70 20 80 0.79 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 AAA_19 PF13245.1 76 2.4e-05 18.5 1.3 2 2 0.082 4.7 1.5 0.0 25 62 534 569 532 619 0.83 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_4 - 492 AAA_19 PF13245.1 76 0.00048 14.3 0.1 1 1 3.7e-05 0.0021 12.2 0.0 10 48 323 360 317 370 0.75 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_100 - 418 AAA_19 PF13245.1 76 0.001 13.2 0.0 1 1 4.6e-05 0.0026 11.9 0.0 20 48 125 152 123 182 0.82 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_8 - 275 CbiA PF01656.18 195 3.9e-33 108.9 0.0 1 1 3.3e-35 4.7e-33 108.6 0.0 1 194 12 236 12 237 0.78 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_100 - 418 CbiA PF01656.18 195 2.2e-22 73.8 0.0 1 1 2.2e-24 3.1e-22 73.3 0.0 1 178 117 348 117 365 0.73 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_4 - 492 PRK PF00485.13 194 0.00083 13.3 0.2 1 2 0.0023 0.67 3.8 0.0 2 21 33 52 32 85 0.83 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 PRK PF00485.13 194 0.00083 13.3 0.2 2 2 0.00027 0.077 6.9 0.0 2 33 325 364 325 409 0.75 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_132 - 175 Pox_D5 PF03288.11 86 0.002 12.8 0.6 1 1 1e-05 0.003 12.3 0.1 34 67 38 79 35 99 0.87 # 142173 # 142697 # 1 # ID=1_132;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 1_117 - 271 MethyltransfD12 PF02086.10 260 1.9e-47 156.3 0.0 1 1 7.3e-50 2.1e-47 156.1 0.0 1 256 6 248 6 252 0.91 # 123355 # 124167 # -1 # ID=1_117;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.444 1_99 - 335 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00041 14.2 0.0 1 1 1.4e-05 0.00097 13.0 0.0 28 51 175 198 173 200 0.94 # 101802 # 102806 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_87 - 116 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00067 13.5 0.0 1 1 1.6e-05 0.0012 12.7 0.0 22 42 38 58 35 61 0.90 # 90669 # 91016 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 1_91 - 183 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0024 11.8 0.0 1 1 0.00021 0.015 9.2 0.0 25 49 128 152 123 153 0.92 # 94627 # 95175 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 5_5 - 468 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0043 11.0 1.5 1 2 0.00095 0.068 7.1 0.1 28 51 29 52 27 54 0.85 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 5_5 - 468 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0043 11.0 1.5 2 2 0.058 4.2 1.4 0.0 9 38 330 359 323 359 0.87 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_1 - 276 Rep_3 PF01051.16 222 2.1e-41 136.3 1.0 1 1 2.2e-43 2.1e-41 136.3 1.0 44 222 14 192 3 192 0.94 # 67 # 894 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.353 1_112 - 292 Rep_3 PF01051.16 222 7.8e-28 91.9 1.1 1 1 1.2e-29 1.2e-27 91.4 1.1 2 220 22 276 21 280 0.83 # 118921 # 119796 # -1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 1_125 - 363 Rep_3 PF01051.16 222 9.4e-16 52.4 1.8 1 1 1.6e-17 1.5e-15 51.7 1.8 6 219 32 285 27 288 0.82 # 133205 # 134293 # 1 # ID=1_125;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.449 14_1 - 235 rve PF00665.21 120 9.4e-13 42.8 0.1 1 2 0.045 4.3 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 52 # 756 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 14_1 - 235 rve PF00665.21 120 9.4e-13 42.8 0.1 2 2 1.8e-13 1.7e-11 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 52 # 756 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 5_5 - 468 rve PF00665.21 120 1.7e-10 35.4 0.0 1 1 3.9e-12 3.8e-10 34.4 0.0 4 119 142 265 139 266 0.87 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_9 - 246 rve PF00665.21 120 0.0018 12.8 0.0 1 1 2.6e-05 0.0025 12.3 0.0 4 96 53 153 50 166 0.76 # 7675 # 8412 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_91 - 183 Fe_dep_repress PF01325.14 60 0.0011 13.3 0.2 1 1 6.5e-06 0.0019 12.6 0.2 21 51 128 158 118 163 0.89 # 94627 # 95175 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 3_8 - 275 YhjQ PF06564.7 244 9.1e-06 19.5 0.0 1 2 0.0013 0.18 5.5 0.0 3 38 11 46 9 55 0.90 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 3_8 - 275 YhjQ PF06564.7 244 9.1e-06 19.5 0.0 2 2 2.9e-05 0.0042 10.8 0.0 76 149 95 166 87 265 0.71 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_100 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0022 11.8 0.2 1 2 0.0012 0.17 5.6 0.1 6 41 119 157 115 170 0.78 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_100 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0022 11.8 0.2 2 2 0.004 0.58 3.8 0.0 115 149 257 291 233 297 0.83 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_13 - 896 AAA_23 PF13476.1 202 4.5e-08 28.0 0.0 1 1 8.1e-10 7.7e-08 27.3 0.0 14 143 280 471 276 603 0.60 # 10485 # 13172 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_4 - 492 AAA_23 PF13476.1 202 1.4e-07 26.4 8.6 1 3 0.00011 0.011 10.4 0.0 24 38 35 49 25 57 0.91 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_23 PF13476.1 202 1.4e-07 26.4 8.6 2 3 0.0098 0.94 4.1 1.4 141 177 187 244 105 280 0.58 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_23 PF13476.1 202 1.4e-07 26.4 8.6 3 3 5.7e-06 0.00055 14.7 0.4 22 39 325 342 288 343 0.76 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 AAA_23 PF13476.1 202 0.0016 13.2 0.0 1 2 0.0048 0.46 5.1 0.0 17 35 36 55 20 56 0.77 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_23 PF13476.1 202 0.0016 13.2 0.0 2 2 0.0034 0.33 5.6 0.0 21 36 560 575 546 608 0.92 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_4 - 492 AAA_24 PF13479.1 213 0.00011 16.2 3.2 1 2 0.00068 0.19 5.6 0.0 8 38 35 64 30 111 0.76 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_24 PF13479.1 213 0.00011 16.2 3.2 2 2 2.2e-05 0.0062 10.5 0.1 4 23 323 342 321 356 0.86 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_130 - 254 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2.8e-13 44.4 0.1 1 1 8.2e-15 1.2e-12 42.3 0.0 1 115 101 201 101 207 0.81 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_119 - 564 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.3e-08 29.3 0.0 1 1 1.9e-10 2.7e-08 28.3 0.0 3 116 422 516 416 517 0.80 # 125948 # 127639 # 1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_4 - 492 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00015 15.3 1.5 1 2 0.00024 0.07 6.6 0.0 21 40 35 54 30 63 0.87 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00015 15.3 1.5 2 2 0.00017 0.05 7.0 0.0 20 40 326 346 309 353 0.83 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_7 - 258 TehB PF03848.9 192 0.0022 11.5 2.3 1 1 3.7e-06 0.0011 12.6 0.2 32 112 108 190 66 207 0.86 # 6576 # 7349 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_4 - 492 AAA_30 PF13604.1 196 9.1e-05 16.5 1.7 1 2 0.0087 0.63 4.0 0.0 18 39 31 51 25 61 0.81 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_30 PF13604.1 196 9.1e-05 16.5 1.7 2 2 9.5e-05 0.0068 10.4 0.0 21 133 325 467 321 469 0.59 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_73 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 9.3e-05 16.4 0.3 1 2 5.8e-05 0.0042 11.1 0.0 4 66 6 66 4 90 0.72 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_73 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 9.3e-05 16.4 0.3 2 2 0.035 2.5 2.0 0.0 91 132 187 227 162 261 0.83 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_22 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.0008 13.4 0.0 1 2 0.00032 0.023 8.6 0.0 7 43 10 43 4 85 0.71 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_22 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.0008 13.4 0.0 2 2 0.027 1.9 2.4 0.0 97 133 213 248 195 300 0.84 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_19 - 659 AAA_30 PF13604.1 196 0.0013 12.7 0.1 1 1 0.00014 0.0099 9.8 0.1 6 61 18 73 15 80 0.70 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_34 - 353 ATPgrasp_Ter PF15632.1 330 9.4e-130 426.5 0.0 1 1 3.7e-132 1.1e-129 426.3 0.0 1 329 4 344 4 345 0.98 # 33672 # 34730 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 5_6 - 106 RNA_POL_M_15KD PF02150.11 35 0.0014 12.7 1.3 1 2 0.00012 0.034 8.3 0.1 23 35 13 25 6 25 0.90 # 4539 # 4856 # 1 # ID=5_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 5_6 - 106 RNA_POL_M_15KD PF02150.11 35 0.0014 12.7 1.3 2 2 0.0049 1.4 3.1 0.1 22 30 38 46 30 50 0.75 # 4539 # 4856 # 1 # ID=5_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_4 - 492 SMC_N PF02463.14 220 6.3e-10 33.0 6.8 1 4 0.00055 0.053 7.1 0.0 29 43 35 49 25 65 0.86 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 SMC_N PF02463.14 220 6.3e-10 33.0 6.8 2 4 0.00053 0.051 7.2 0.0 116 203 79 160 70 173 0.81 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 SMC_N PF02463.14 220 6.3e-10 33.0 6.8 3 4 0.00033 0.032 7.8 0.1 27 44 325 342 311 344 0.80 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 SMC_N PF02463.14 220 6.3e-10 33.0 6.8 4 4 2.4e-05 0.0023 11.6 0.2 117 211 382 478 359 485 0.81 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_13 - 896 SMC_N PF02463.14 220 7.3e-10 32.8 0.0 1 1 1e-10 9.9e-09 29.1 0.0 19 216 280 854 275 857 0.91 # 10485 # 13172 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 3_26 - 884 SMC_N PF02463.14 220 5.3e-07 23.4 0.0 1 4 0.036 3.5 1.2 0.0 17 40 31 55 17 66 0.68 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 SMC_N PF02463.14 220 5.3e-07 23.4 0.0 2 4 0.0035 0.34 4.5 0.0 136 211 414 488 108 495 0.78 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 SMC_N PF02463.14 220 5.3e-07 23.4 0.0 3 4 0.0016 0.15 5.6 0.0 26 42 560 576 541 589 0.87 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 SMC_N PF02463.14 220 5.3e-07 23.4 0.0 4 4 0.00058 0.056 7.0 0.0 136 209 768 841 600 848 0.78 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 14_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.0007 14.0 0.3 1 1 5.4e-06 0.0015 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 52 # 756 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_28 - 695 TraG-D_C PF12696.2 128 2e-11 38.2 0.0 1 1 1.5e-13 4.2e-11 37.2 0.0 2 112 505 617 504 631 0.82 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 14_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.002 12.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.006 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 52 # 756 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_100 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.4e-11 38.4 0.1 1 2 2.8e-08 4e-06 20.4 0.1 2 39 116 156 115 170 0.78 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_100 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.4e-11 38.4 0.1 2 2 1.1e-06 0.00015 15.2 0.0 77 126 236 287 213 297 0.75 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_8 - 275 MipZ PF09140.6 261 4.5e-09 30.1 0.0 1 2 1.3e-07 1.8e-05 18.3 0.0 2 45 11 54 10 73 0.85 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 3_8 - 275 MipZ PF09140.6 261 4.5e-09 30.1 0.0 2 2 4.6e-05 0.0065 9.9 0.0 83 129 119 165 92 197 0.79 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_130 - 254 UPF0020 PF01170.13 180 0.00013 16.0 0.0 1 1 1.8e-06 0.00052 14.0 0.0 15 126 87 185 76 221 0.72 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 12_1 - 323 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 3.9e-35 115.7 0.1 1 1 8.8e-37 6.3e-35 115.0 0.1 5 212 134 308 131 309 0.90 # 3 # 971 # 1 # ID=12_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.557 1_9 - 246 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 4.1e-24 79.7 0.1 1 1 7.6e-26 5.4e-24 79.3 0.1 6 205 57 224 54 231 0.91 # 7675 # 8412 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 13_1 - 323 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 5e-24 79.4 0.7 1 1 9.8e-26 7e-24 78.9 0.7 4 205 130 301 127 308 0.88 # 36 # 1004 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.535 1_5 - 392 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 3e-15 50.7 0.2 1 1 6e-17 4.3e-15 50.2 0.2 63 211 142 315 91 317 0.78 # 4676 # 5851 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 4_7 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.085 6.8 32.9 1 5 0.063 18 -0.7 6.4 35 50 141 156 119 200 0.62 # 5178 # 6383 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 4_7 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.085 6.8 32.9 2 5 0.018 5.2 1.1 0.5 18 47 208 237 202 239 0.70 # 5178 # 6383 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 4_7 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.085 6.8 32.9 3 5 3e-05 0.0085 10.0 1.0 19 57 244 282 236 290 0.86 # 5178 # 6383 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 4_7 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.085 6.8 32.9 4 5 0.002 0.58 4.1 0.1 21 49 302 330 296 338 0.76 # 5178 # 6383 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 4_7 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.085 6.8 32.9 5 5 0.00036 0.1 6.5 1.0 23 49 339 365 333 374 0.89 # 5178 # 6383 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_9 - 246 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.00014 16.5 0.8 1 1 1.3e-06 0.00037 15.1 0.0 1 32 130 161 130 179 0.89 # 7675 # 8412 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_73 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.9e-08 28.3 0.1 1 3 0.00079 0.23 5.2 0.0 98 153 33 84 13 94 0.78 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_73 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.9e-08 28.3 0.1 2 3 0.0026 0.75 3.5 0.0 5 52 240 287 237 400 0.74 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_73 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.9e-08 28.3 0.1 3 3 5.1e-07 0.00015 15.6 0.0 136 196 497 563 409 567 0.81 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_4 - 492 AAA_21 PF13304.1 303 5.5e-18 60.3 5.1 1 4 1.2e-06 0.00011 16.6 0.6 3 21 34 52 33 85 0.87 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_21 PF13304.1 303 5.5e-18 60.3 5.1 2 4 0.00082 0.079 7.2 0.0 237 303 100 160 91 160 0.84 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_21 PF13304.1 303 5.5e-18 60.3 5.1 3 4 1.5e-06 0.00014 16.2 0.0 3 43 326 361 325 384 0.76 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_21 PF13304.1 303 5.5e-18 60.3 5.1 4 4 2e-07 2e-05 19.1 0.0 233 301 405 467 386 469 0.89 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 AAA_21 PF13304.1 303 8.8e-10 33.3 5.6 1 3 1.2e-06 0.00011 16.6 0.0 188 287 401 464 365 479 0.75 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_21 PF13304.1 303 8.8e-10 33.3 5.6 2 3 0.083 7.9 0.7 1.0 1 16 560 575 560 576 0.92 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_21 PF13304.1 303 8.8e-10 33.3 5.6 3 3 1.9e-06 0.00018 15.9 0.0 233 273 765 805 758 826 0.86 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_13 - 896 AAA_21 PF13304.1 303 8.4e-06 20.3 0.0 1 2 0.0002 0.02 9.2 0.0 2 35 288 319 287 354 0.70 # 10485 # 13172 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 3_13 - 896 AAA_21 PF13304.1 303 8.4e-06 20.3 0.0 2 2 0.00025 0.024 8.9 0.0 224 300 765 839 678 842 0.78 # 10485 # 13172 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_87 - 116 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00041 14.1 0.0 1 1 4.6e-06 0.00066 13.4 0.0 15 35 37 57 25 58 0.88 # 90669 # 91016 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 5_5 - 468 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00058 13.6 0.7 1 2 0.0011 0.16 5.8 0.4 12 43 19 50 15 53 0.88 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 5_5 - 468 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00058 13.6 0.7 2 2 0.0019 0.27 5.1 0.0 11 44 82 120 74 121 0.78 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_99 - 335 Phage_CI_repr PF07022.8 66 2e-06 22.2 0.0 1 1 1.4e-08 4.2e-06 21.2 0.0 7 50 168 244 164 256 0.92 # 101802 # 102806 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 3_25 - 437 Thi4 PF01946.12 230 0.00022 14.7 0.0 1 2 2.3e-05 0.0065 9.9 0.0 18 49 9 40 3 42 0.92 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 Thi4 PF01946.12 230 0.00022 14.7 0.0 2 2 0.0056 1.6 2.1 0.0 16 38 160 182 149 190 0.74 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_121 - 152 Ribosomal_L28 PF00830.14 61 0.0012 13.1 0.7 1 1 9.1e-06 0.0026 12.0 0.3 35 58 114 135 111 138 0.82 # 127861 # 128316 # 1 # ID=1_121;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.410 1_4 - 492 AAA PF00004.24 132 0.00012 16.7 0.1 1 2 0.011 1.6 3.3 0.0 3 22 35 54 33 124 0.77 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA PF00004.24 132 0.00012 16.7 0.1 2 2 6.4e-05 0.0092 10.6 0.0 3 23 327 347 325 437 0.75 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_69 - 353 AAA PF00004.24 132 0.00062 14.4 0.0 1 1 9.4e-06 0.0014 13.3 0.0 1 74 99 178 99 237 0.73 # 66118 # 67176 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.407 2_14 - 395 KorB PF08535.5 93 3.6e-05 18.3 0.3 1 1 8.3e-07 0.00024 15.7 0.1 5 48 170 213 166 252 0.76 # 9670 # 10854 # 1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_87 - 116 HTH_37 PF13744.1 80 4.1e-06 21.0 0.0 1 1 1.9e-08 5.5e-06 20.6 0.0 23 78 34 88 25 90 0.93 # 90669 # 91016 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 1_22 - 680 Herpes_ori_bp PF02399.10 824 0.00092 11.6 0.0 1 1 5.9e-06 0.0017 10.7 0.0 52 108 20 82 9 106 0.78 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 5_3 - 107 HTH_27 PF13463.1 68 0.00024 15.8 0.0 1 1 2.2e-06 0.00032 15.4 0.0 21 66 31 73 14 74 0.88 # 1800 # 2120 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_40 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.001 13.8 0.3 1 2 7.3e-05 0.011 10.6 0.0 1 44 3 48 3 49 0.87 # 39922 # 40389 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 1_40 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.001 13.8 0.3 2 2 0.074 11 0.9 0.1 17 42 112 138 106 149 0.81 # 39922 # 40389 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 1_94 - 346 Hydantoinase_A PF01968.13 290 6.5e-08 26.3 0.8 1 2 1.2e-06 0.00033 14.2 0.2 72 101 186 214 177 222 0.82 # 97659 # 98696 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 1_94 - 346 Hydantoinase_A PF01968.13 290 6.5e-08 26.3 0.8 2 2 1.4e-05 0.004 10.6 0.0 195 275 258 332 231 344 0.78 # 97659 # 98696 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 3_25 - 437 TIGR01087 TIGR01087 441 0.0037 10.4 0.0 1 2 7.1e-05 0.02 8.0 0.0 1 37 10 46 10 56 0.90 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 TIGR01087 TIGR01087 441 0.0037 10.4 0.0 2 2 0.022 6.2 -0.2 0.0 331 365 153 186 149 190 0.80 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_4 - 492 cobW PF02492.14 178 0.00076 13.3 1.3 1 2 0.0051 1.5 2.6 0.0 3 19 33 49 31 59 0.87 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 cobW PF02492.14 178 0.00076 13.3 1.3 2 2 6.1e-05 0.018 8.9 0.3 3 28 325 349 323 352 0.80 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 AAA_16 PF13191.1 185 6.3e-06 20.7 3.6 1 2 0.00053 0.051 7.9 0.0 26 41 41 56 26 88 0.83 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_16 PF13191.1 185 6.3e-06 20.7 3.6 2 2 9.8e-05 0.0094 10.3 0.1 26 49 560 583 546 629 0.84 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_4 - 492 AAA_16 PF13191.1 185 2.8e-05 18.6 0.1 1 2 0.0012 0.11 6.8 0.0 29 44 35 50 22 151 0.89 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_16 PF13191.1 185 2.8e-05 18.6 0.1 2 2 0.00021 0.021 9.2 0.0 27 49 325 347 320 410 0.84 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_13 - 896 AAA_16 PF13191.1 185 0.0043 11.4 0.0 1 1 4.5e-05 0.0043 11.4 0.0 29 56 290 318 284 328 0.84 # 10485 # 13172 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 2_25 - 394 Mt_ATP-synt_B PF05405.9 163 0.0014 12.5 0.0 1 1 9.5e-06 0.0027 11.5 0.0 105 146 248 289 234 299 0.84 # 17140 # 18321 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.476 1_34 - 353 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00037 14.8 0.0 1 2 0.03 8.7 0.6 0.0 109 146 75 115 31 120 0.74 # 33672 # 34730 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 1_34 - 353 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00037 14.8 0.0 2 2 9.6e-06 0.0028 11.9 0.0 2 87 115 232 114 244 0.84 # 33672 # 34730 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 1_4 - 492 AAA_22 PF13401.1 131 5e-08 27.6 0.8 1 2 0.013 0.72 4.4 0.0 9 25 35 51 30 144 0.78 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_22 PF13401.1 131 5e-08 27.6 0.8 2 2 1e-07 5.9e-06 20.9 0.0 7 125 325 464 322 471 0.86 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_19 - 659 AAA_22 PF13401.1 131 2.8e-05 18.7 0.2 1 2 0.00036 0.021 9.4 0.0 5 38 34 60 29 93 0.78 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 AAA_22 PF13401.1 131 2.8e-05 18.7 0.2 2 2 0.0099 0.57 4.7 0.0 36 91 383 451 368 462 0.72 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_22 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 4.5e-05 18.0 0.3 1 2 0.00019 0.011 10.3 0.1 4 66 17 76 13 107 0.80 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_22 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 4.5e-05 18.0 0.3 2 2 0.0068 0.39 5.3 0.0 42 108 154 232 112 246 0.60 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 3_26 - 884 AAA_22 PF13401.1 131 7.7e-05 17.3 0.5 1 2 0.012 0.67 4.5 0.0 6 21 41 56 37 72 0.89 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_22 PF13401.1 131 7.7e-05 17.3 0.5 2 2 0.0015 0.086 7.4 0.0 7 27 561 581 558 652 0.83 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 2_28 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00048 14.7 0.1 1 1 0.00019 0.011 10.3 0.1 5 24 199 218 198 295 0.71 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_6 - 232 HTH_AraC PF00165.18 42 0.00088 13.5 0.0 1 1 1e-05 0.0029 11.9 0.0 2 28 184 207 177 211 0.91 # 3644 # 4339 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_73 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 1.1e-54 179.8 1.3 1 2 2.2e-33 3.1e-31 102.3 0.4 5 404 7 377 4 381 0.83 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_73 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 1.1e-54 179.8 1.3 2 2 5.4e-25 7.7e-23 74.6 0.0 497 610 450 563 412 575 0.76 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_22 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 1.3e-51 169.7 0.0 1 2 9.1e-39 1.3e-36 120.1 0.0 2 304 5 308 4 405 0.82 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_22 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 1.3e-51 169.7 0.0 2 2 9.8e-17 1.4e-14 47.3 0.0 533 610 517 607 507 613 0.80 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_119 - 564 Methyltransf_27 PF13708.1 194 1.1e-56 185.8 0.1 1 1 1.5e-58 2.2e-56 184.9 0.0 2 194 93 296 92 296 0.95 # 125948 # 127639 # 1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 4_6 - 273 Methyltransf_27 PF13708.1 194 1.4e-46 152.8 0.0 1 1 1.2e-48 1.7e-46 152.6 0.0 3 194 72 266 70 266 0.95 # 4363 # 5181 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_40 - 180 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0011 13.2 0.0 1 1 6.7e-05 0.0096 10.2 0.0 18 30 22 34 21 37 0.89 # 38089 # 38628 # -1 # ID=2_40;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_17 - 186 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0038 11.5 0.0 1 1 5.1e-05 0.0074 10.6 0.0 20 37 165 182 164 182 0.90 # 15635 # 16192 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.611 3_26 - 884 AAA_29 PF13555.1 62 5.1e-08 26.8 0.0 1 2 6.8e-05 0.0065 10.4 0.0 16 39 33 55 11 70 0.82 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_29 PF13555.1 62 5.1e-08 26.8 0.0 2 2 7.7e-06 0.00073 13.5 0.0 23 40 558 575 539 583 0.81 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_4 - 492 AAA_29 PF13555.1 62 1.2e-07 25.5 0.5 1 2 2.9e-05 0.0027 11.6 0.0 25 40 32 47 20 52 0.78 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_29 PF13555.1 62 1.2e-07 25.5 0.5 2 2 3.3e-05 0.0031 11.4 0.1 14 40 314 339 310 343 0.77 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_13 - 896 AAA_29 PF13555.1 62 0.00011 16.1 0.0 1 1 2.5e-06 0.00024 15.0 0.0 26 48 288 310 277 328 0.80 # 10485 # 13172 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 3_25 - 437 Pyr_redox PF00070.22 80 1.7e-16 54.8 0.8 1 2 2.3e-07 6.6e-05 17.7 0.1 1 35 10 44 10 57 0.91 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 Pyr_redox PF00070.22 80 1.7e-16 54.8 0.8 2 2 2.2e-12 6.3e-10 33.8 0.1 2 67 164 244 163 251 0.89 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 5_5 - 468 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 1.6e-06 22.8 0.2 1 1 2.2e-08 6.2e-06 20.9 0.2 14 61 16 63 9 78 0.87 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_103 - 286 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.0031 11.6 0.0 1 1 2.4e-05 0.0068 10.5 0.0 65 106 26 67 20 71 0.84 # 111810 # 112667 # -1 # ID=1_103;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 1_91 - 183 B-block_TFIIIC PF04182.7 75 0.00027 15.2 0.0 1 1 4.1e-06 0.0012 13.1 0.0 16 57 127 166 123 172 0.89 # 94627 # 95175 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 3_8 - 275 SRP54 PF00448.17 196 0.00055 13.8 0.1 1 2 2.1e-05 0.006 10.4 0.1 10 39 19 48 10 61 0.88 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 3_8 - 275 SRP54 PF00448.17 196 0.00055 13.8 0.1 2 2 0.016 4.5 1.0 0.0 67 92 119 143 106 151 0.73 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_4 - 492 AAA_28 PF13521.1 163 0.00011 16.6 4.3 1 2 0.023 6.6 1.0 0.0 2 20 33 51 32 66 0.84 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_28 PF13521.1 163 0.00011 16.6 4.3 2 2 5.6e-07 0.00016 16.0 0.1 1 34 324 359 324 391 0.79 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 12_1 - 323 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 6e-10 33.5 0.0 1 1 3.7e-12 1e-09 32.7 0.0 5 151 133 288 130 292 0.72 # 3 # 971 # 1 # ID=12_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.557 3_25 - 437 HI0933_like PF03486.9 409 0.00013 14.9 0.1 1 4 5.7e-05 0.016 8.0 0.0 2 34 10 42 9 45 0.93 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 HI0933_like PF03486.9 409 0.00013 14.9 0.1 2 4 0.0058 1.7 1.4 0.0 130 164 81 112 69 120 0.75 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 HI0933_like PF03486.9 409 0.00013 14.9 0.1 3 4 0.012 3.3 0.4 0.0 3 21 164 182 162 190 0.75 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 HI0933_like PF03486.9 409 0.00013 14.9 0.1 4 4 0.073 21 -2.3 0.0 114 168 222 270 209 272 0.77 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 5_5 - 468 HTH_32 PF13565.1 77 1.1e-09 33.3 0.6 1 1 9.1e-11 1.3e-08 30.0 0.0 3 77 45 117 43 117 0.82 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 14_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 3.7e-06 22.1 0.2 1 1 1.1e-07 1.6e-05 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 52 # 756 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_73 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 5.5e-17 55.2 7.7 1 4 6.8e-07 9.8e-05 14.6 0.0 12 67 19 71 11 80 0.87 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_73 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 5.5e-17 55.2 7.7 2 4 4.7e-10 6.8e-08 25.1 0.0 376 457 194 275 190 285 0.83 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_73 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 5.5e-17 55.2 7.7 3 4 0.039 5.6 -1.2 0.2 241 287 419 468 405 484 0.72 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_73 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 5.5e-17 55.2 7.7 4 4 3.8e-07 5.4e-05 15.4 0.2 781 812 533 564 494 568 0.80 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_22 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 9.7e-17 54.3 0.0 1 3 0.0028 0.4 2.6 0.1 10 62 18 68 12 78 0.85 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_22 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 9.7e-17 54.3 0.0 2 3 4.8e-11 6.9e-09 28.3 0.0 341 419 185 255 96 258 0.80 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_22 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 9.7e-17 54.3 0.0 3 3 2.7e-08 3.9e-06 19.2 0.0 731 813 539 609 529 626 0.81 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_10 - 514 A2L_zn_ribbon PF08792.5 33 0.019 8.9 4.7 1 2 0.00018 0.053 7.5 0.6 5 29 76 101 74 102 0.90 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_10 - 514 A2L_zn_ribbon PF08792.5 33 0.019 8.9 4.7 2 2 0.0078 2.2 2.3 0.3 20 28 446 454 444 457 0.62 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_87 - 116 HTH_3 PF01381.17 55 1e-11 38.9 0.0 1 1 5.7e-14 1.6e-11 38.3 0.0 6 53 39 86 37 87 0.94 # 90669 # 91016 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 5_5 - 468 HTH_23 PF13384.1 50 8.5e-11 35.7 0.4 1 1 7.4e-12 3.5e-10 33.7 0.2 2 48 11 58 10 60 0.94 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 14_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 2.3e-05 18.4 0.5 1 2 0.095 4.5 1.6 0.0 7 27 11 35 7 36 0.69 # 52 # 756 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 14_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 2.3e-05 18.4 0.5 2 2 1.1e-05 0.00053 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 52 # 756 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_6 - 232 HTH_23 PF13384.1 50 9.9e-05 16.4 0.1 1 1 2.1e-05 0.001 13.2 0.0 10 40 179 210 176 225 0.82 # 3644 # 4339 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_87 - 116 HTH_23 PF13384.1 50 0.00083 13.4 0.0 1 1 3e-05 0.0014 12.7 0.0 16 35 39 60 26 64 0.83 # 90669 # 91016 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 1_17 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 0.0011 13.0 1.2 1 1 4.3e-05 0.002 12.2 0.0 10 39 154 183 149 184 0.80 # 15635 # 16192 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.611 1_118 - 388 HTH_23 PF13384.1 50 0.0013 12.8 0.4 1 1 8.3e-05 0.004 11.3 0.1 13 39 179 204 173 208 0.84 # 124537 # 125700 # 1 # ID=1_118;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 3_8 - 275 Fer4_NifH PF00142.13 273 4.9e-06 20.3 0.1 1 1 6.4e-08 9.1e-06 19.4 0.1 3 52 12 62 10 89 0.85 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_100 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00027 14.6 0.0 1 1 5.3e-06 0.00076 13.1 0.0 7 58 122 176 116 201 0.79 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_17 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 1.3e-13 45.1 0.1 1 1 9e-16 2.6e-13 44.1 0.1 1 44 141 184 141 185 0.98 # 15635 # 16192 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.611 1_10 - 514 Ribosomal_S27e PF01667.12 55 0.00025 15.0 0.8 1 1 8.6e-07 0.00025 15.0 0.8 5 33 72 100 69 105 0.90 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_87 - 116 HTH_19 PF12844.2 64 1.7e-07 25.6 0.0 1 1 1.9e-09 2.7e-07 25.0 0.0 8 55 38 85 36 86 0.92 # 90669 # 91016 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 3_6 - 232 HTH_19 PF12844.2 64 5.1e-06 20.9 0.2 1 1 8.5e-08 1.2e-05 19.7 0.2 2 39 177 215 176 222 0.86 # 3644 # 4339 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_10 - 514 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.016 9.3 4.0 1 2 0.00044 0.13 6.5 0.1 1 12 73 84 73 87 0.82 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_10 - 514 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.016 9.3 4.0 2 2 0.0063 1.8 2.8 0.0 5 14 96 105 95 113 0.81 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 3_25 - 437 NAD_binding_10 PF13460.1 183 0.0013 13.1 0.4 1 2 8.4e-05 0.024 9.0 0.1 1 35 11 44 11 57 0.91 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 NAD_binding_10 PF13460.1 183 0.0013 13.1 0.4 2 2 0.011 3.2 2.1 0.0 25 108 66 179 59 196 0.62 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_90 - 363 Multi_ubiq PF14452.1 72 3.1e-29 95.2 1.2 1 3 2.3e-13 6.7e-11 36.5 0.1 7 72 21 85 15 85 0.92 # 93407 # 94495 # -1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_90 - 363 Multi_ubiq PF14452.1 72 3.1e-29 95.2 1.2 2 3 2e-15 5.8e-13 43.1 0.0 1 71 86 154 86 155 0.95 # 93407 # 94495 # -1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_90 - 363 Multi_ubiq PF14452.1 72 3.1e-29 95.2 1.2 3 3 3e-06 0.00085 13.7 0.1 4 68 157 221 154 225 0.89 # 93407 # 94495 # -1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 5_5 - 468 HTH_29 PF13551.1 112 1.5e-16 54.9 0.6 1 1 2.5e-18 3.7e-16 53.7 0.6 1 110 16 119 16 121 0.89 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_2 - 181 HTH_29 PF13551.1 112 0.0016 13.0 0.0 1 1 2.9e-05 0.0042 11.7 0.0 12 47 4 39 1 91 0.86 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 3_25 - 437 NAD_binding_9 PF13454.1 156 8.4e-09 29.8 2.1 1 3 4.6e-05 0.013 9.6 0.1 1 35 12 41 12 52 0.86 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 NAD_binding_9 PF13454.1 156 8.4e-09 29.8 2.1 2 3 4e-06 0.0012 13.1 0.1 114 155 73 112 62 113 0.81 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 NAD_binding_9 PF13454.1 156 8.4e-09 29.8 2.1 3 3 0.0012 0.35 5.0 0.0 1 26 165 190 165 216 0.69 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 GIDA PF01134.17 392 0.00014 15.2 0.6 1 3 0.0018 0.53 3.4 0.1 2 30 11 39 10 52 0.82 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 GIDA PF01134.17 392 0.00014 15.2 0.6 2 3 0.00015 0.044 6.9 0.0 105 159 70 118 53 130 0.80 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 GIDA PF01134.17 392 0.00014 15.2 0.6 3 3 0.009 2.6 1.1 0.1 3 25 165 187 163 189 0.85 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_21 - 370 Met_10 PF02475.11 200 9.2e-05 16.5 0.0 1 1 6.9e-07 0.0002 15.4 0.0 98 141 183 227 178 230 0.87 # 19466 # 20575 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 1_4 - 492 ABC_tran_2 PF12848.2 85 1.8e-13 44.6 16.1 1 1 2e-14 5.6e-12 39.8 16.1 1 85 167 283 167 283 0.93 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_19 - 659 TIGR00595 TIGR00595 509 6.9e-14 45.3 0.8 1 3 5.8e-07 0.00017 14.3 0.0 2 54 38 87 37 93 0.84 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 TIGR00595 TIGR00595 509 6.9e-14 45.3 0.8 2 3 0.091 26 -2.8 0.0 117 155 375 413 373 417 0.78 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 TIGR00595 TIGR00595 509 6.9e-14 45.3 0.8 3 3 2.4e-11 6.8e-09 28.8 0.1 269 394 451 567 434 649 0.70 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_25 - 437 NAD_binding_8 PF13450.1 68 1.6e-06 22.5 0.2 1 2 6.2e-08 1.8e-05 19.1 0.0 1 30 13 42 13 44 0.97 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 NAD_binding_8 PF13450.1 68 1.6e-06 22.5 0.2 2 2 0.054 16 0.1 0.0 1 9 166 174 166 194 0.85 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 14_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 7.6e-12 39.3 0.6 1 1 3.7e-14 1.1e-11 38.9 0.4 5 131 10 143 6 158 0.86 # 52 # 756 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_2 - 181 IF2_N PF04760.10 54 0.00035 14.6 1.1 1 1 4.3e-06 0.0012 12.9 0.0 1 40 1 38 1 48 0.75 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 1_9 - 246 DDE_Tnp_1_7 PF13843.1 351 0.00072 13.0 0.0 1 1 3e-06 0.00086 12.8 0.0 148 262 78 186 52 226 0.77 # 7675 # 8412 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_130 - 254 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.0004 14.4 0.0 1 1 5.2e-06 0.00075 13.5 0.0 7 106 104 197 99 240 0.78 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_7 - 258 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.0009 13.2 0.2 1 1 1.7e-05 0.0024 11.9 0.0 5 83 108 182 104 231 0.78 # 6576 # 7349 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_4 - 492 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0003 14.9 3.0 1 3 0.039 5.6 0.9 0.0 25 40 35 50 24 85 0.87 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0003 14.9 3.0 2 3 0.017 2.4 2.1 0.7 53 104 181 237 166 267 0.65 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0003 14.9 3.0 3 3 6.5e-05 0.0093 10.0 0.0 24 68 326 374 323 473 0.69 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0035 11.4 0.0 1 2 0.018 2.5 2.1 0.0 4 36 25 55 24 82 0.86 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0035 11.4 0.0 2 2 0.00063 0.091 6.8 0.0 22 44 560 582 548 590 0.88 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_73 - 595 PhoH PF02562.11 205 8.8e-07 22.7 0.5 1 1 8.8e-08 2.5e-05 17.9 0.5 6 177 5 246 2 258 0.76 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_69 - 353 AAA_5 PF07728.9 139 7e-34 110.9 0.0 1 1 3.9e-36 1.1e-33 110.3 0.0 1 139 98 238 98 238 0.96 # 66118 # 67176 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.407 3_19 - 659 ResIII PF04851.10 184 3.2e-16 54.1 0.3 1 2 1.1e-15 1.5e-13 45.3 0.0 7 76 17 84 13 140 0.88 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 ResIII PF04851.10 184 3.2e-16 54.1 0.3 2 2 0.0024 0.34 5.1 0.0 47 107 241 302 232 397 0.73 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_22 - 680 ResIII PF04851.10 184 0.0036 11.5 0.3 1 1 6.1e-05 0.0088 10.3 0.3 24 60 16 58 4 218 0.85 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 2_28 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.4e-16 54.5 0.0 1 2 6.5e-07 0.00019 14.5 0.0 16 52 199 235 191 341 0.88 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_28 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.4e-16 54.5 0.0 2 2 8.1e-14 2.3e-11 37.2 0.0 164 345 412 604 391 646 0.77 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_8 - 275 TIGR01968 TIGR01968 261 5.6e-15 49.4 0.0 1 1 2.9e-16 4.2e-14 46.5 0.0 1 163 9 186 9 267 0.69 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_100 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 2.8e-06 20.9 0.1 1 2 7.8e-06 0.0011 12.4 0.1 2 39 115 155 114 185 0.85 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_100 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 2.8e-06 20.9 0.1 2 2 0.00049 0.07 6.5 0.0 103 143 251 291 226 382 0.85 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 12_1 - 323 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 7.8e-07 23.2 0.0 1 1 5.3e-09 1.5e-06 22.3 0.0 8 153 143 302 138 307 0.66 # 3 # 971 # 1 # ID=12_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.557 3_26 - 884 AAA_18 PF13238.1 129 0.0016 13.1 2.0 1 2 0.003 0.44 5.3 0.4 1 15 42 56 42 59 0.91 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_18 PF13238.1 129 0.0016 13.1 2.0 2 2 0.0014 0.2 6.3 0.0 2 18 562 578 562 609 0.73 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_4 - 492 AAA_18 PF13238.1 129 0.0028 12.4 8.3 1 2 0.0031 0.44 5.3 0.0 1 21 33 53 33 89 0.81 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_18 PF13238.1 129 0.0028 12.4 8.3 2 2 6.9e-05 0.0099 10.6 0.6 1 23 325 354 325 475 0.80 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 TIGR00611 TIGR00611 365 0.0019 11.4 2.8 1 3 0.0032 0.93 2.6 0.0 27 41 34 48 20 55 0.82 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 TIGR00611 TIGR00611 365 0.0019 11.4 2.8 2 3 0.01 3 0.9 0.2 81 124 230 273 204 274 0.81 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 TIGR00611 TIGR00611 365 0.0019 11.4 2.8 3 3 0.0004 0.11 5.6 0.0 27 43 326 342 318 348 0.86 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 5_5 - 468 B5 PF03484.10 70 0.0026 12.0 0.2 1 1 4.1e-05 0.012 9.9 0.0 6 51 95 139 93 141 0.91 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_46 - 418 IMS_HHH PF11798.3 32 4.5e-06 21.0 0.1 1 1 6.3e-08 1.8e-05 19.0 0.1 8 32 173 197 167 197 0.82 # 42031 # 43284 # -1 # ID=2_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.482 12_1 - 323 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 1.6e-08 29.0 0.2 1 1 1.4e-10 3.9e-08 27.8 0.2 59 123 249 310 240 312 0.81 # 3 # 971 # 1 # ID=12_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.557 1_7 - 258 Methyltransf_12 PF08242.7 99 1.6e-05 19.8 0.0 1 1 1.2e-07 3.3e-05 18.7 0.0 1 82 111 188 111 199 0.85 # 6576 # 7349 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_4 - 492 DUF258 PF03193.11 161 2.2e-08 27.8 0.1 1 2 4e-07 5.7e-05 16.7 0.0 39 95 34 126 15 136 0.87 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 DUF258 PF03193.11 161 2.2e-08 27.8 0.1 2 2 0.00013 0.018 8.6 0.0 38 67 325 352 302 391 0.77 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 DUF258 PF03193.11 161 3.8e-06 20.6 0.1 1 2 6.5e-05 0.0093 9.5 0.0 21 52 24 56 12 128 0.82 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 DUF258 PF03193.11 161 3.8e-06 20.6 0.1 2 2 0.00012 0.018 8.6 0.0 36 59 559 582 537 617 0.85 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_19 - 659 Flavi_DEAD PF07652.9 148 0.00012 16.3 0.1 1 3 0.02 5.8 1.1 0.0 13 50 42 75 32 94 0.60 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 Flavi_DEAD PF07652.9 148 0.00012 16.3 0.1 2 3 0.02 5.9 1.0 0.0 100 138 221 259 208 266 0.77 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 Flavi_DEAD PF07652.9 148 0.00012 16.3 0.1 3 3 0.00015 0.044 7.9 0.0 22 75 436 490 429 498 0.82 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_18 - 991 Glycos_transf_1 PF00534.15 172 0.00041 14.2 0.0 1 1 2.8e-06 0.00081 13.2 0.0 31 118 280 373 276 374 0.90 # 16195 # 19167 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 2_28 - 695 DUF87 PF01935.12 229 0.0005 14.3 0.0 1 1 1.2e-05 0.0012 13.1 0.0 25 68 200 242 189 278 0.89 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_19 - 659 DUF87 PF01935.12 229 0.0011 13.2 0.4 1 2 0.00024 0.023 8.9 0.0 25 48 35 58 30 69 0.83 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 DUF87 PF01935.12 229 0.0011 13.2 0.4 2 2 0.061 5.9 1.0 0.0 117 184 404 473 368 506 0.70 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_4 - 492 DUF87 PF01935.12 229 0.039 8.1 11.6 1 3 0.0038 0.37 4.9 0.0 25 48 32 55 20 62 0.86 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 DUF87 PF01935.12 229 0.039 8.1 11.6 2 3 0.003 0.28 5.3 0.3 25 46 324 345 321 357 0.88 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 DUF87 PF01935.12 229 0.039 8.1 11.6 3 3 0.027 2.5 2.2 0.1 40 196 415 472 368 486 0.56 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 5_5 - 468 HTH_28 PF13518.1 52 7.4e-13 42.7 0.8 1 1 7.4e-14 5.3e-12 40.0 0.8 2 51 16 66 15 67 0.96 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 14_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 0.00017 16.0 1.2 1 1 1e-05 0.00073 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 52 # 756 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_2 - 181 HTH_28 PF13518.1 52 0.00026 15.4 0.0 1 1 6.2e-06 0.00044 14.7 0.0 14 46 5 38 1 44 0.85 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 1_17 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.00061 14.2 0.1 1 1 2.6e-05 0.0018 12.7 0.0 16 34 165 183 150 184 0.81 # 15635 # 16192 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.611 3_25 - 437 Shikimate_DH PF01488.15 135 0.00016 16.2 0.0 1 1 3.8e-06 0.0011 13.5 0.0 13 49 9 44 4 63 0.87 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_91 - 183 HTH_24 PF13412.1 48 3.6e-07 23.9 0.1 1 1 1e-08 7.2e-07 23.0 0.1 13 47 125 159 116 160 0.85 # 94627 # 95175 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_87 - 116 HTH_24 PF13412.1 48 0.00022 15.0 0.0 1 1 6.5e-06 0.00046 14.0 0.0 16 35 41 60 32 61 0.83 # 90669 # 91016 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 5_5 - 468 HTH_24 PF13412.1 48 0.00056 13.7 0.1 1 1 2.6e-05 0.0019 12.0 0.1 9 45 17 55 17 55 0.93 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_99 - 335 HTH_24 PF13412.1 48 0.0014 12.4 0.7 1 1 0.00026 0.018 8.8 0.2 14 39 170 195 165 197 0.87 # 101802 # 102806 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_92 - 369 HTH_18 PF12833.2 81 0.0014 13.2 0.0 1 1 2.3e-05 0.0066 11.0 0.0 34 66 6 38 4 44 0.90 # 95214 # 96320 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_130 - 254 TIGR03533 TIGR03533 284 5.9e-06 19.9 0.0 1 1 2.8e-08 8.1e-06 19.4 0.0 119 208 98 184 69 192 0.81 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_130 - 254 TIGR03534 TIGR03534 253 1.4e-10 35.1 0.0 1 1 2.2e-12 2.1e-10 34.6 0.0 74 177 86 186 71 191 0.88 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_94 - 346 TIGR03534 TIGR03534 253 0.00099 12.7 0.0 1 1 1.9e-05 0.0018 11.8 0.0 80 128 290 337 280 341 0.85 # 97659 # 98696 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 1_119 - 564 TIGR03534 TIGR03534 253 0.0017 11.9 0.0 1 1 3e-05 0.0029 11.2 0.0 135 175 456 498 444 505 0.74 # 125948 # 127639 # 1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_17 - 186 HTH_10 PF04967.7 53 0.00044 14.2 0.1 1 2 0.061 18 -0.5 0.1 3 30 124 152 123 154 0.66 # 15635 # 16192 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.611 1_17 - 186 HTH_10 PF04967.7 53 0.00044 14.2 0.1 2 2 1.1e-05 0.0032 11.5 0.0 29 45 167 183 156 184 0.92 # 15635 # 16192 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.611 3_25 - 437 TIGR01292 TIGR01292 300 0.0025 10.7 0.6 1 3 0.025 7.3 -0.7 0.0 2 14 10 22 7 50 0.76 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 TIGR01292 TIGR01292 300 0.0025 10.7 0.6 2 3 0.00019 0.056 6.3 0.0 72 119 76 121 67 127 0.79 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 TIGR01292 TIGR01292 300 0.0025 10.7 0.6 3 3 0.015 4.2 0.1 0.5 4 13 165 174 162 284 0.69 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_4 - 492 MMR_HSR1 PF01926.18 116 5.3e-06 20.8 4.1 1 2 2.2e-05 0.0062 10.9 0.1 1 27 32 92 32 178 0.52 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 MMR_HSR1 PF01926.18 116 5.3e-06 20.8 4.1 2 2 4.9e-05 0.014 9.8 0.7 1 99 324 473 324 488 0.56 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_19 - 659 DEAD PF00270.24 169 3.8e-08 27.4 0.1 1 2 1.2e-08 1.7e-06 22.0 0.0 17 70 36 84 16 99 0.79 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 DEAD PF00270.24 169 3.8e-08 27.4 0.1 2 2 0.04 5.8 0.8 0.0 151 163 373 398 323 405 0.48 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_73 - 595 DEAD PF00270.24 169 8.5e-05 16.5 0.7 1 1 7.6e-06 0.0011 12.9 0.7 4 105 8 107 5 222 0.77 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_4 - 492 Miro PF08477.8 119 1.1e-08 30.0 1.0 1 2 1.1e-05 0.0016 13.3 0.0 1 21 32 52 32 82 0.89 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 Miro PF08477.8 119 1.1e-08 30.0 1.0 2 2 6.8e-06 0.00097 14.0 0.0 1 25 324 348 324 392 0.72 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 Miro PF08477.8 119 0.0014 13.5 0.0 1 2 0.03 4.3 2.3 0.0 2 25 42 65 41 104 0.82 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 Miro PF08477.8 119 0.0014 13.5 0.0 2 2 0.00045 0.065 8.2 0.0 3 20 562 579 561 608 0.90 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_87 - 116 HTH_31 PF13560.1 64 1.6e-06 22.7 0.0 1 1 1.6e-08 2.2e-06 22.2 0.0 10 58 38 85 24 90 0.90 # 90669 # 91016 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 3_6 - 232 HTH_31 PF13560.1 64 0.00084 13.9 0.1 1 1 1.4e-05 0.0019 12.8 0.1 9 36 182 209 168 218 0.85 # 3644 # 4339 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_73 - 595 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.4e-12 41.3 0.0 1 1 4e-14 5.7e-12 40.1 0.0 47 103 496 562 450 563 0.79 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_22 - 680 UvrD_C_2 PF13538.1 104 4.3e-11 37.3 0.0 1 1 1e-12 1.5e-10 35.6 0.0 22 104 504 607 488 607 0.86 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_100 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00072 13.3 0.0 1 2 0.00072 0.21 5.4 0.1 24 38 40 54 40 55 0.89 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_100 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00072 13.3 0.0 2 2 0.00036 0.1 6.4 0.0 17 37 53 73 52 76 0.85 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_100 - 418 HTH_36 PF13730.1 55 0.00081 13.9 0.1 1 1 1.8e-05 0.0026 12.3 0.0 28 54 52 78 31 79 0.91 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_125 - 363 HTH_36 PF13730.1 55 0.0087 10.6 2.0 1 1 0.00019 0.027 9.1 0.8 6 55 220 273 217 273 0.83 # 133205 # 134293 # 1 # ID=1_125;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.449 1_94 - 346 StbA PF06406.6 318 2.6e-132 434.9 0.7 1 1 1e-134 3e-132 434.7 0.7 1 317 22 340 22 341 0.98 # 97659 # 98696 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 1_4 - 492 NACHT PF05729.7 166 4.1e-06 20.9 0.1 1 2 0.00046 0.13 6.3 0.0 3 20 33 50 31 63 0.86 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 NACHT PF05729.7 166 4.1e-06 20.9 0.1 2 2 7.1e-06 0.002 12.2 0.0 3 24 325 346 323 394 0.84 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 UPF0079 PF02367.12 123 0.0012 12.9 0.1 1 2 0.0017 0.5 4.4 0.0 18 36 33 51 26 60 0.85 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 UPF0079 PF02367.12 123 0.0012 12.9 0.1 2 2 0.00063 0.18 5.8 0.0 14 39 321 346 312 357 0.83 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_17 PF13207.1 121 2.6e-06 22.7 3.7 1 2 0.0046 0.66 5.2 0.4 1 20 32 51 32 195 0.85 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_17 PF13207.1 121 2.6e-06 22.7 3.7 2 2 6e-07 8.6e-05 17.8 0.1 1 52 324 379 324 486 0.80 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 AAA_17 PF13207.1 121 0.00025 16.3 3.1 1 2 0.0011 0.16 7.2 0.2 2 16 42 56 41 57 0.91 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_17 PF13207.1 121 0.00025 16.3 3.1 2 2 0.00047 0.067 8.4 0.2 3 17 562 576 560 588 0.90 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_10 - 514 DZR PF12773.2 50 0.017 9.4 4.8 1 2 0.0017 0.48 4.8 3.4 1 20 77 101 64 109 0.61 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_10 - 514 DZR PF12773.2 50 0.017 9.4 4.8 2 2 0.0053 1.5 3.1 0.0 13 23 448 458 441 487 0.75 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_4 - 492 TIGR02211 TIGR02211 221 5.6e-30 98.6 2.1 1 4 6.3e-07 9e-05 16.1 0.0 18 53 17 52 4 67 0.83 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 TIGR02211 TIGR02211 221 5.6e-30 98.6 2.1 2 4 3.9e-14 5.6e-12 39.7 0.0 124 220 85 175 68 176 0.81 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 TIGR02211 TIGR02211 221 5.6e-30 98.6 2.1 3 4 2.2e-05 0.0031 11.1 0.0 19 52 310 343 305 358 0.90 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 TIGR02211 TIGR02211 221 5.6e-30 98.6 2.1 4 4 1.1e-10 1.6e-08 28.4 0.0 124 219 390 483 373 485 0.82 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 TIGR02211 TIGR02211 221 4.3e-20 66.2 0.5 1 4 0.00061 0.088 6.4 0.0 20 48 28 56 20 60 0.90 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 TIGR02211 TIGR02211 221 4.3e-20 66.2 0.5 2 4 7.6e-08 1.1e-05 19.1 0.0 126 211 398 485 382 491 0.81 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 TIGR02211 TIGR02211 221 4.3e-20 66.2 0.5 3 4 0.00049 0.07 6.7 0.1 18 48 545 575 538 589 0.86 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 TIGR02211 TIGR02211 221 4.3e-20 66.2 0.5 4 4 8.9e-11 1.3e-08 28.7 0.0 123 215 749 844 737 849 0.83 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_25 - 437 FAD_binding_2 PF00890.19 417 0.0016 11.6 3.2 1 2 5.8e-06 0.0017 11.6 0.1 2 32 11 41 10 46 0.91 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 FAD_binding_2 PF00890.19 417 0.0016 11.6 3.2 2 2 0.015 4.3 0.4 0.0 142 204 43 115 40 143 0.72 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_42 - 214 Bd3614-deam PF14439.1 136 0.00032 15.0 0.1 1 1 1.6e-06 0.00047 14.4 0.1 3 68 47 112 45 122 0.77 # 41513 # 42154 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 3_26 - 884 AAA_25 PF13481.1 194 2.6e-07 24.6 0.0 1 2 0.00018 0.017 8.9 0.0 30 60 36 66 24 80 0.85 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_25 PF13481.1 194 2.6e-07 24.6 0.0 2 2 2.4e-05 0.0023 11.7 0.0 28 53 553 578 541 599 0.87 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_4 - 492 AAA_25 PF13481.1 194 5.7e-05 17.0 0.0 1 2 0.022 2.1 2.1 0.0 37 54 34 51 30 72 0.81 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_25 PF13481.1 194 5.7e-05 17.0 0.0 2 2 4.2e-05 0.0041 10.9 0.0 29 54 318 343 294 423 0.76 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_73 - 595 AAA_25 PF13481.1 194 0.00098 12.9 0.0 1 1 5.3e-05 0.0051 10.6 0.0 17 63 3 46 1 62 0.78 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_22 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.1e-10 35.8 0.0 1 3 2.1e-06 0.0002 15.3 0.0 2 59 21 77 20 88 0.79 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_22 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.1e-10 35.8 0.0 2 3 0.00035 0.033 8.0 0.0 62 118 209 263 184 340 0.73 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_22 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1.1e-10 35.8 0.0 3 3 0.0016 0.15 5.9 0.0 213 232 572 606 527 608 0.62 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_73 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6.5e-08 26.7 0.1 1 3 0.0085 0.81 3.5 0.0 2 21 20 39 19 91 0.63 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_73 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6.5e-08 26.7 0.1 2 3 0.013 1.2 2.9 0.0 40 135 167 261 132 297 0.74 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_73 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6.5e-08 26.7 0.1 3 3 8.4e-07 8e-05 16.6 0.0 174 232 485 562 400 563 0.67 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 3_26 - 884 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0011 12.9 0.1 1 2 0.021 2 2.2 0.0 2 14 43 55 42 75 0.91 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0011 12.9 0.1 2 2 0.0003 0.028 8.3 0.0 2 24 562 583 561 614 0.75 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_4 - 492 AAA_15 PF13175.1 415 1.1e-09 32.2 1.2 1 3 0.00012 0.017 8.5 0.0 26 54 34 58 5 119 0.80 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_15 PF13175.1 415 1.1e-09 32.2 1.2 2 3 1.3e-05 0.0018 11.7 0.0 26 90 326 383 300 417 0.60 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_15 PF13175.1 415 1.1e-09 32.2 1.2 3 3 7.7e-05 0.011 9.1 0.1 352 414 415 467 393 476 0.75 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 AAA_15 PF13175.1 415 0.0016 11.9 0.0 1 3 0.00059 0.085 6.2 0.0 336 398 395 463 376 475 0.80 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_15 PF13175.1 415 0.0016 11.9 0.0 2 3 0.028 4 0.7 0.0 24 40 560 576 540 591 0.87 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_15 PF13175.1 415 0.0016 11.9 0.0 3 3 0.036 5.1 0.3 0.0 369 399 789 819 775 827 0.72 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_8 - 275 VirC1 PF07015.6 231 0.0015 12.0 0.0 1 1 1.3e-05 0.0038 10.7 0.0 3 46 11 54 9 80 0.84 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_19 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 3.2e-24 79.3 0.2 1 1 4.6e-26 6.7e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 19246 # 20250 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 2_2 - 413 Transposase_20 PF02371.11 87 2.5e-17 57.2 0.0 1 1 6.1e-19 8.7e-17 55.5 0.0 3 87 275 359 273 359 0.94 # 625 # 1863 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 3_26 - 884 AAA_33 PF13671.1 143 9.4e-06 20.0 0.0 1 2 0.00019 0.018 9.3 0.0 1 16 41 56 41 83 0.90 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_33 PF13671.1 143 9.4e-06 20.0 0.0 2 2 0.0006 0.057 7.7 0.0 2 23 561 582 560 658 0.77 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_4 - 492 AAA_33 PF13671.1 143 0.0019 12.5 0.1 1 2 0.026 2.5 2.4 0.0 4 19 35 50 33 121 0.83 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_33 PF13671.1 143 0.0019 12.5 0.1 2 2 0.00076 0.073 7.3 0.0 3 33 326 356 325 398 0.77 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_13 - 896 AAA_33 PF13671.1 143 0.0019 12.4 0.0 1 1 8.3e-05 0.0079 10.5 0.0 4 32 290 321 289 484 0.78 # 10485 # 13172 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 4_22 - 271 Usp PF00582.21 140 3.1e-37 122.3 0.1 1 3 3.8e-19 1.1e-16 55.7 0.1 1 140 1 152 1 152 0.93 # 15571 # 16383 # 1 # ID=4_22;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_22 - 271 Usp PF00582.21 140 3.1e-37 122.3 0.1 2 3 0.0012 0.34 5.5 0.0 4 22 160 178 158 197 0.76 # 15571 # 16383 # 1 # ID=4_22;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_22 - 271 Usp PF00582.21 140 3.1e-37 122.3 0.1 3 3 8.3e-20 2.4e-17 57.9 0.0 70 135 204 270 187 271 0.86 # 15571 # 16383 # 1 # ID=4_22;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_6 - 273 ThiS-like PF14453.1 57 0.0022 12.2 0.0 1 1 1.7e-05 0.0048 11.2 0.0 25 54 165 194 146 196 0.94 # 4363 # 5181 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_130 - 254 MTS PF05175.9 170 2.1e-08 28.1 0.0 1 1 3.5e-10 3.4e-08 27.4 0.0 35 144 104 205 89 224 0.72 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_119 - 564 MTS PF05175.9 170 9e-07 22.8 0.0 1 1 1.6e-08 1.6e-06 22.0 0.0 94 156 475 532 447 543 0.80 # 125948 # 127639 # 1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_7 - 258 MTS PF05175.9 170 1.1e-05 19.3 0.0 1 1 2.2e-07 2.1e-05 18.4 0.0 33 103 108 177 99 195 0.88 # 6576 # 7349 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 3_19 - 659 UvrB PF12344.3 44 2e-18 60.1 1.9 1 1 1.7e-20 4.9e-18 58.9 1.9 1 40 553 593 553 597 0.90 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_4 - 492 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0019 12.8 0.2 1 2 0.0033 0.95 4.1 0.0 3 22 35 54 33 65 0.83 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0019 12.8 0.2 2 2 0.00092 0.26 5.9 0.0 2 22 326 346 325 380 0.79 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_69 - 353 AAA_2 PF07724.9 171 1.4e-05 19.5 0.0 1 1 1.1e-07 3.2e-05 18.3 0.0 5 83 98 177 95 184 0.74 # 66118 # 67176 # -1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.407 1_7 - 258 Methyltransf_23 PF13489.1 161 2.4e-05 18.5 0.0 1 1 1.2e-07 3.3e-05 18.0 0.0 9 93 93 187 85 237 0.73 # 6576 # 7349 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 3_26 - 884 APS_kinase PF01583.15 157 0.00061 13.9 0.1 1 2 0.00041 0.12 6.4 0.0 3 20 40 57 38 68 0.87 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 APS_kinase PF01583.15 157 0.00061 13.9 0.1 2 2 0.0014 0.39 4.8 0.0 5 23 561 580 557 593 0.74 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_4 - 492 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00024 15.2 2.1 1 2 0.044 13 -0.1 0.0 1 19 32 50 32 62 0.83 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00024 15.2 2.1 2 2 1.7e-05 0.0049 11.0 1.0 1 26 324 349 324 490 0.62 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_21 - 370 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.0011 12.9 0.1 1 2 0.078 22 -1.1 0.0 34 58 5 29 3 33 0.88 # 19466 # 20575 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 3_21 - 370 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.0011 12.9 0.1 2 2 1.9e-05 0.0055 10.7 0.1 15 81 181 242 171 253 0.83 # 19466 # 20575 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 4_11 - 476 DNA_methylase PF00145.12 335 9.3e-76 249.4 0.0 1 1 4.2e-78 1.2e-75 249.0 0.0 1 333 92 455 92 457 0.87 # 8233 # 9660 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 7_8 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 4.4e-74 241.2 1.7 1 1 5.1e-76 4.8e-74 241.0 1.7 7 131 1 125 1 125 1.00 # 5066 # 5443 # 1 # ID=7_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 6_8 - 69 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.6e-37 122.9 0.9 1 1 1.8e-39 1.7e-37 122.8 0.9 64 131 1 68 1 68 0.99 # 6845 # 7051 # -1 # ID=6_8;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.512 7_1 - 69 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.6e-37 122.9 0.9 1 1 1.8e-39 1.7e-37 122.8 0.9 64 131 1 68 1 68 0.99 # 1 # 207 # 1 # ID=7_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.512 1_10 - 514 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.013 9.6 3.9 1 2 0.0004 0.11 6.5 0.1 1 12 73 84 73 87 0.82 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_10 - 514 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.013 9.6 3.9 2 2 0.0051 1.5 3.0 0.0 5 14 96 105 95 113 0.81 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 7_6 - 213 Trans_reg_C PF00486.23 77 1e-17 58.3 0.2 1 1 1.5e-19 4.4e-17 56.2 0.0 2 76 138 207 137 208 0.95 # 2818 # 3456 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 14_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 6.2e-53 172.9 0.1 1 1 6e-55 8.6e-53 172.5 0.1 4 139 75 212 73 213 0.99 # 52 # 756 # 1 # ID=14_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 7_8 - 126 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 0.0015 12.9 0.6 1 1 3.5e-05 0.005 11.2 0.6 10 112 7 96 1 124 0.74 # 5066 # 5443 # 1 # ID=7_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 1_4 - 492 PduV-EutP PF10662.4 143 7.3e-06 19.9 1.2 1 3 8e-05 0.023 8.6 0.0 3 31 32 60 30 100 0.90 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 PduV-EutP PF10662.4 143 7.3e-06 19.9 1.2 2 3 0.00051 0.15 6.0 0.1 3 23 324 344 322 352 0.89 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 PduV-EutP PF10662.4 143 7.3e-06 19.9 1.2 3 3 0.0082 2.3 2.1 0.0 40 72 431 463 420 484 0.69 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 3_26 - 884 TIGR00634 TIGR00634 563 0.051 6.5 4.5 1 4 0.09 26 -2.4 0.0 365 392 372 399 358 403 0.83 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 TIGR00634 TIGR00634 563 0.051 6.5 4.5 2 4 0.079 23 -2.2 0.0 442 501 416 474 407 478 0.75 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 TIGR00634 TIGR00634 563 0.051 6.5 4.5 3 4 0.091 26 -2.5 0.1 24 39 560 575 559 583 0.81 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 TIGR00634 TIGR00634 563 0.051 6.5 4.5 4 4 7.5e-05 0.022 7.7 0.1 442 510 770 838 762 844 0.83 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_112 - 292 TrfA PF07042.6 282 2.3e-06 21.0 0.0 1 1 9.4e-09 2.7e-06 20.8 0.0 84 173 77 170 34 231 0.79 # 118921 # 119796 # -1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 1_4 - 492 KAP_NTPase PF07693.9 325 0.0006 13.2 1.8 1 2 0.00056 0.16 5.3 0.0 23 47 33 57 26 143 0.77 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 KAP_NTPase PF07693.9 325 0.0006 13.2 1.8 2 2 0.00018 0.051 6.9 0.0 23 42 325 344 319 398 0.87 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_2 - 181 HTH_17 PF12728.2 51 4.7e-06 21.2 0.0 1 1 3.1e-08 8.9e-06 20.3 0.0 2 27 4 29 4 37 0.92 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 1_10 - 514 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.00079 13.8 7.4 1 2 0.00023 0.066 7.6 5.0 7 35 76 102 75 106 0.81 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_10 - 514 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.00079 13.8 7.4 2 2 0.00078 0.23 5.9 0.0 8 24 450 466 437 470 0.75 # 8748 # 10289 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_40 - 156 HTH_11 PF08279.7 55 8.8e-06 19.7 0.0 1 1 1.3e-07 1.9e-05 18.7 0.0 4 42 9 49 6 62 0.82 # 39922 # 40389 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 1_2 - 181 HTH_11 PF08279.7 55 0.00067 13.7 0.0 1 1 1.2e-05 0.0018 12.4 0.0 15 37 3 25 1 26 0.91 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 13_1 - 323 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 2.6e-48 157.2 0.0 1 2 2.7e-49 3.8e-47 153.5 0.0 1 112 34 145 34 145 0.96 # 36 # 1004 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.535 13_1 - 323 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 2.6e-48 157.2 0.0 2 2 0.067 9.7 0.8 0.0 42 67 278 305 249 312 0.82 # 36 # 1004 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.535 1_9 - 246 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 2.7e-25 83.1 0.0 1 1 1.3e-26 1.9e-24 80.4 0.0 43 112 1 70 1 70 0.93 # 7675 # 8412 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_91 - 183 MarR_2 PF12802.2 62 1.1e-06 22.7 0.0 1 1 1.3e-08 1.9e-06 21.9 0.0 11 55 121 163 118 169 0.86 # 94627 # 95175 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_40 - 156 MarR_2 PF12802.2 62 0.00069 13.7 0.1 1 1 1.3e-05 0.0019 12.3 0.1 11 47 13 48 5 49 0.84 # 39922 # 40389 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 5_3 - 107 HTH_5 PF01022.15 47 5e-20 65.4 0.2 1 1 2.5e-22 7.1e-20 64.9 0.2 1 46 13 59 13 60 0.98 # 1800 # 2120 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_91 - 183 TrmB PF01978.14 68 0.00022 15.3 0.1 1 1 1.6e-06 0.00046 14.3 0.1 18 58 124 165 115 176 0.82 # 94627 # 95175 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 3_25 - 437 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 4.5e-22 73.3 0.0 1 1 2.4e-24 6.9e-22 72.7 0.0 1 198 10 307 10 310 0.83 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_34 - 353 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.3e-26 87.9 0.0 1 2 0.063 18 -0.6 0.0 107 155 35 77 23 92 0.66 # 33672 # 34730 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 1_34 - 353 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.3e-26 87.9 0.0 2 2 2.3e-28 6.5e-26 85.6 0.0 2 182 114 293 113 296 0.93 # 33672 # 34730 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 1_2 - 181 UPF0122 PF04297.9 101 8.4e-07 23.4 1.3 1 3 2e-08 5.7e-06 20.7 0.0 33 89 3 64 1 76 0.78 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 1_2 - 181 UPF0122 PF04297.9 101 8.4e-07 23.4 1.3 2 3 0.088 25 -0.6 0.4 55 79 74 99 62 121 0.55 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 1_2 - 181 UPF0122 PF04297.9 101 8.4e-07 23.4 1.3 3 3 0.03 8.6 0.9 0.3 44 83 94 134 83 156 0.66 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 1_100 - 418 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00031 14.9 0.0 1 1 2.7e-06 0.00076 13.7 0.0 21 58 42 79 28 89 0.88 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_25 - 437 DAO PF01266.19 358 1.5e-09 31.5 10.0 1 4 8.2e-09 2.4e-06 21.0 0.4 1 31 10 40 10 56 0.95 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 DAO PF01266.19 358 1.5e-09 31.5 10.0 2 4 0.00054 0.16 5.2 0.0 167 207 81 118 49 141 0.78 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 DAO PF01266.19 358 1.5e-09 31.5 10.0 3 4 0.029 8.3 -0.5 0.7 2 12 164 174 163 211 0.71 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 DAO PF01266.19 358 1.5e-09 31.5 10.0 4 4 5.4e-05 0.015 8.5 0.0 151 205 221 270 212 318 0.80 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 1_92 - 369 z-alpha PF02295.12 66 8.6e-05 16.7 0.0 1 1 7.7e-07 0.00022 15.4 0.0 6 43 5 41 3 44 0.94 # 95214 # 96320 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_44 - 204 LptE PF04390.7 155 5.7e-06 20.5 0.0 1 1 3.5e-08 1e-05 19.7 0.0 2 80 8 88 7 126 0.80 # 40458 # 41069 # -1 # ID=2_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 1_49 - 392 SAC3_GANP PF03399.11 204 0.0018 12.3 1.0 1 1 1.2e-05 0.0034 11.3 0.1 43 104 191 252 183 254 0.85 # 49070 # 50245 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.457 1_101 - 894 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-65 215.0 0.0 1 1 7.4e-67 4.2e-65 214.5 0.0 1 303 456 812 456 813 0.93 # 108160 # 110841 # -1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 2_28 - 695 AAA_10 PF12846.2 304 9.4e-17 55.7 0.0 1 1 3.3e-18 1.9e-16 54.7 0.0 2 296 199 578 198 585 0.73 # 20090 # 22174 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_4 - 492 AAA_10 PF12846.2 304 0.00013 15.9 4.7 1 2 0.0034 0.2 5.4 0.0 6 22 35 51 33 67 0.80 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 AAA_10 PF12846.2 304 0.00013 15.9 4.7 2 2 8.5e-05 0.0049 10.7 0.5 4 118 325 478 322 489 0.76 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_73 - 595 AAA_10 PF12846.2 304 0.00074 13.4 0.2 1 1 5.8e-05 0.0034 11.2 0.0 1 25 16 40 16 49 0.80 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 3_26 - 884 AAA_10 PF12846.2 304 0.00086 13.2 0.5 1 2 0.0055 0.31 4.7 0.0 4 23 42 61 40 85 0.81 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 AAA_10 PF12846.2 304 0.00086 13.2 0.5 2 2 0.0021 0.12 6.1 0.2 4 20 561 577 558 587 0.85 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 5_3 - 107 HTH_20 PF12840.2 61 6.1e-11 36.4 0.3 1 1 8.9e-13 8.5e-11 36.0 0.3 2 61 6 65 5 65 0.97 # 1800 # 2120 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_91 - 183 HTH_20 PF12840.2 61 0.0001 16.5 0.0 1 1 1.9e-06 0.00018 15.7 0.0 21 56 126 161 117 165 0.87 # 94627 # 95175 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_40 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00017 15.8 0.4 1 2 6.5e-05 0.0062 10.8 0.0 19 50 17 48 7 49 0.91 # 39922 # 40389 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 1_40 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00017 15.8 0.4 2 2 0.027 2.6 2.4 0.1 7 20 108 121 103 142 0.72 # 39922 # 40389 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 1_4 - 492 Dynamin_N PF00350.18 168 0.03 8.5 17.3 1 2 0.0077 2.2 2.4 11.6 1 86 33 234 33 305 0.68 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_4 - 492 Dynamin_N PF00350.18 168 0.03 8.5 17.3 2 2 0.00049 0.14 6.3 0.3 1 111 325 437 325 487 0.51 # 2802 # 4277 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_130 - 254 Methyltransf_18 PF12847.2 112 5.4e-06 21.4 0.0 1 1 3.5e-08 1e-05 20.5 0.0 3 107 102 198 100 203 0.77 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_26 - 884 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 4.7e-08 27.4 0.6 1 3 0.0033 0.32 5.5 0.0 14 31 150 167 142 173 0.69 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 4.7e-08 27.4 0.6 2 3 0.055 5.2 1.7 0.0 18 24 290 296 279 307 0.64 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_26 - 884 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 4.7e-08 27.4 0.6 3 3 1.6e-06 0.00015 16.2 0.1 15 51 676 709 667 714 0.85 # 24926 # 27577 # 1 # ID=3_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_115 - 239 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 1.1e-05 19.9 1.7 1 1 1.8e-07 1.7e-05 19.2 1.7 36 64 27 54 17 56 0.85 # 121541 # 122257 # 1 # ID=1_115;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 9_3 - 103 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 1.6e-05 19.3 1.8 1 1 3.3e-05 0.0031 12.0 1.8 17 64 8 57 2 67 0.48 # 1570 # 1878 # 1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_73 - 595 UvrD_C PF13361.1 351 4.4e-42 139.1 0.0 1 1 5.7e-44 8.1e-42 138.2 0.0 2 348 254 564 253 567 0.86 # 69974 # 71758 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_22 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 3.6e-22 73.6 0.0 1 2 0.0086 1.2 2.8 0.0 74 118 332 377 289 388 0.79 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_22 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 3.6e-22 73.6 0.0 2 2 2e-22 2.8e-20 67.4 0.0 290 347 538 607 519 611 0.91 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_130 - 254 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00062 14.7 0.0 1 1 4.7e-06 0.0013 13.6 0.0 5 86 109 191 105 198 0.82 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_91 - 183 RPA_C PF08784.6 102 0.0015 13.4 0.0 1 1 1.1e-05 0.0033 12.3 0.0 61 95 125 159 108 162 0.91 # 94627 # 95175 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_100 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.7e-09 31.5 0.6 1 2 0.018 2.5 1.4 0.0 214 274 14 76 6 85 0.80 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_100 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.7e-09 31.5 0.6 2 2 4.9e-10 7e-08 26.2 0.1 8 136 122 269 115 274 0.80 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_8 - 275 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.6e-08 26.8 0.0 1 2 5.1e-08 7.4e-06 19.5 0.0 5 39 14 48 10 59 0.87 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 3_8 - 275 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.6e-08 26.8 0.0 2 2 0.0018 0.25 4.7 0.0 124 136 132 144 120 156 0.80 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 3_8 - 275 AAA_31 PF13614.1 157 3.6e-11 37.6 0.0 1 1 7e-13 1e-10 36.2 0.0 1 155 10 171 10 173 0.85 # 4799 # 5623 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_100 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 5.6e-08 27.2 0.4 1 2 1.9e-07 2.7e-05 18.5 0.0 9 128 123 270 121 292 0.83 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_100 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 5.6e-08 27.2 0.4 2 2 0.0018 0.25 5.6 0.1 14 89 299 381 284 410 0.72 # 102803 # 104056 # -1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_11 - 280 Pterin_bind PF00809.17 210 7.3e-58 189.7 0.0 1 1 3e-60 8.7e-58 189.5 0.0 1 210 7 216 7 216 0.98 # 10694 # 11533 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 3_21 - 370 ADH_zinc_N PF00107.21 130 4.1e-25 82.2 0.2 1 1 5.2e-27 7.5e-25 81.4 0.2 1 128 197 330 197 332 0.91 # 19466 # 20575 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 10_2 - 299 ADH_zinc_N PF00107.21 130 1.4e-09 32.0 0.0 1 1 1.8e-11 2.6e-09 31.1 0.0 2 110 135 239 134 255 0.88 # 117 # 1013 # -1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.546 1_91 - 183 FaeA PF04703.7 62 0.00036 15.1 0.0 1 1 2.2e-06 0.00062 14.3 0.0 13 50 127 164 116 171 0.91 # 94627 # 95175 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_22 - 680 AAA_11 PF13086.1 236 0.00034 14.6 0.1 1 1 5.9e-06 0.0017 12.3 0.0 17 75 17 70 4 165 0.77 # 22443 # 24482 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_71 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0015 12.8 0.1 1 2 3.3e-05 0.0096 10.2 0.1 2 83 8 87 7 94 0.74 # 68272 # 68649 # -1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.368 1_71 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0015 12.8 0.1 2 2 0.033 9.5 0.6 0.0 43 60 92 109 88 112 0.83 # 68272 # 68649 # -1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.368 3_19 - 659 Helicase_C_2 PF13307.1 167 0.00029 15.2 0.1 1 2 6.4e-05 0.018 9.3 0.0 5 83 443 519 440 523 0.90 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_19 - 659 Helicase_C_2 PF13307.1 167 0.00029 15.2 0.1 2 2 0.0088 2.5 2.4 0.1 126 144 535 553 531 566 0.82 # 16869 # 18845 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_21 - 370 ADH_zinc_N_2 PF13602.1 127 4.5e-06 22.0 0.0 1 1 7.9e-08 1.1e-05 20.7 0.0 2 121 231 362 230 363 0.64 # 19466 # 20575 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 10_2 - 299 ADH_zinc_N_2 PF13602.1 127 8.4e-05 17.9 0.0 1 1 1.2e-06 0.00017 16.9 0.0 18 105 190 283 167 297 0.66 # 117 # 1013 # -1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.546 1_130 - 254 MetW PF07021.7 193 0.0002 15.1 0.0 1 1 2.1e-06 0.0003 14.6 0.0 13 102 100 192 90 202 0.77 # 140244 # 141005 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_119 - 564 MetW PF07021.7 193 0.0019 12.0 0.0 1 1 2.3e-05 0.0033 11.2 0.0 18 83 424 487 410 499 0.85 # 125948 # 127639 # 1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 3_25 - 437 Lycopene_cycl PF05834.7 374 2.9e-06 20.8 0.1 1 3 6e-06 0.0017 11.7 0.0 2 38 11 45 10 50 0.93 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 Lycopene_cycl PF05834.7 374 2.9e-06 20.8 0.1 2 3 0.0017 0.5 3.5 0.0 99 142 73 114 53 131 0.83 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 3_25 - 437 Lycopene_cycl PF05834.7 374 2.9e-06 20.8 0.1 3 3 0.0065 1.9 1.6 0.0 3 31 165 196 163 214 0.68 # 23412 # 24722 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.537 5_5 - 468 HTH_21 PF13276.1 60 0.011 10.2 3.6 1 2 0.092 26 -0.6 0.8 24 48 26 49 26 64 0.80 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 5_5 - 468 HTH_21 PF13276.1 60 0.011 10.2 3.6 2 2 5.8e-05 0.017 9.6 0.0 34 59 104 129 81 130 0.84 # 2944 # 4347 # -1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_2 - 181 Phage_AlpA PF05930.7 51 0.0012 13.0 0.0 1 1 7.6e-06 0.0022 12.1 0.0 4 28 4 28 1 30 0.90 # 961 # 1503 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/27e727f7-0fc5-4fb3-bb56-8ab1d3cd05e5 # Target file: checkm_output/bins/pm66/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm66/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/27e727f7-0fc5-4fb3-bb56-8ab1d3cd05e5 checkm_output/bins/pm66/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:11:41 2017 # [ok]