# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_29 - 301 TrkA_N PF02254.13 116 2.1e-05 16.8 0.0 1 1 8e-07 5e-05 15.6 0.0 1 42 7 48 7 79 0.86 # 19148 # 20050 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_43 - 421 ABC_tran PF00005.22 137 0.00023 13.7 0.0 1 1 1e-05 0.00063 12.3 0.0 12 37 202 227 189 258 0.88 # 31772 # 33034 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_29 - 301 NAD_binding_11 PF14833.1 122 2.9e-38 122.9 0.3 1 2 0.029 1.8 0.9 1.1 8 53 96 141 92 153 0.85 # 19148 # 20050 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_29 - 301 NAD_binding_11 PF14833.1 122 2.9e-38 122.9 0.3 2 2 4.7e-40 2.9e-38 122.9 0.3 1 121 170 289 170 290 0.98 # 19148 # 20050 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_28 - 254 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00031 12.6 0.3 1 1 1.4e-05 0.00089 11.1 0.3 7 42 9 44 8 44 0.94 # 18125 # 18886 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_43 - 421 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00047 11.9 0.0 1 1 1.9e-05 0.0012 10.6 0.0 23 47 202 226 180 246 0.80 # 31772 # 33034 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_28 - 254 HTH_DeoR PF08220.7 57 1.7e-20 64.6 1.0 1 1 7.1e-22 4.4e-20 63.3 1.0 1 55 6 60 6 61 0.97 # 18125 # 18886 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 1_23 - 221 HTH_38 PF13936.1 44 0.00014 13.7 0.2 1 1 2.3e-06 0.00014 13.7 0.2 12 43 174 206 166 207 0.89 # 15022 # 15684 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.520 1_29 - 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