# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_7 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.2e-05 16.5 0.0 1 2 0.00059 0.047 5.6 0.0 112 127 18 33 9 81 0.68 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_7 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.2e-05 16.5 0.0 2 2 5.6e-05 0.0045 9.0 0.0 42 63 163 184 145 221 0.76 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_1 - 153 HTH_IclR PF09339.5 52 7.5e-06 18.1 0.0 1 1 2.7e-07 1.1e-05 17.6 0.0 5 50 74 120 72 122 0.91 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 2_6 - 468 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00055 12.2 0.0 1 1 4.2e-05 0.0017 10.6 0.0 12 37 303 328 301 329 0.90 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 2_3 - 707 ABC_tran PF00005.22 137 2.5e-37 120.9 0.1 1 1 6.8e-39 5.5e-37 119.7 0.1 1 137 485 634 485 634 0.89 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 3_7 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00025 13.0 0.0 1 2 0.0016 0.13 4.1 0.0 123 138 19 34 8 78 0.76 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_7 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00025 13.0 0.0 2 2 0.00023 0.019 6.9 0.0 53 87 164 200 155 221 0.77 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 12_1 - 127 rve_3 PF13683.1 67 1.1e-20 65.5 0.1 1 1 1.5e-21 3.1e-20 64.1 0.0 2 67 41 106 40 106 0.98 # 233 # 613 # 1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 11_1 - 273 rve_3 PF13683.1 67 7.3e-20 63.0 0.2 1 1 8.2e-21 1.7e-19 61.8 0.2 2 67 194 260 193 260 0.98 # 44 # 862 # -1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.504 10_2 - 289 rve_3 PF13683.1 67 1e-17 56.1 0.0 1 1 1e-18 2e-17 55.1 0.0 4 67 215 279 212 279 0.96 # 273 # 1139 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 9_1 - 296 rve_3 PF13683.1 67 6e-14 44.0 0.1 1 1 7.1e-15 1.4e-13 42.8 0.0 6 67 216 277 211 277 0.93 # 43 # 930 # -1 # ID=9_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_6 - 468 HTH_38 PF13936.1 44 1.4e-06 20.4 0.2 1 1 5.5e-08 4.5e-06 18.8 0.2 12 40 301 329 285 331 0.85 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 2_3 - 707 MobB PF03205.9 140 0.00065 12.0 0.4 1 1 4.5e-05 0.0018 10.6 0.1 2 21 497 516 496 524 0.87 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 1_4 - 610 MobB PF03205.9 140 0.00075 11.8 0.0 1 1 4.2e-05 0.0017 10.7 0.0 7 34 72 99 68 105 0.89 # 1553 # 3382 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 2_1 - 153 HTH_34 PF13601.1 80 2.8e-05 16.8 0.1 1 1 5.6e-07 4.5e-05 16.1 0.1 3 66 75 139 73 148 0.83 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 2_1 - 153 MarR PF01047.17 59 6.2e-16 50.5 0.3 1 1 1.6e-17 1.3e-15 49.6 0.3 1 59 70 130 70 130 0.94 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 9_1 - 296 Sigma54_DBD PF04552.8 160 0.00055 12.1 0.1 1 1 1.1e-05 0.00091 11.4 0.1 100 153 45 96 28 103 0.78 # 43 # 930 # -1 # ID=9_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_6 - 1110 AAA_19 PF13245.1 76 3.9e-07 22.4 1.3 1 1 1.4e-08 1.1e-06 21.0 0.3 7 76 666 732 659 732 0.75 # 4305 # 7634 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_3 - 707 PRK PF00485.13 194 0.0006 12.0 0.0 1 1 1.4e-05 0.0012 11.0 0.0 1 22 497 518 497 537 0.84 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 3_7 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00037 12.6 0.0 1 2 0.027 2.2 0.2 0.1 175 188 18 31 8 38 0.80 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_7 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00037 12.6 0.0 2 2 3.3e-05 0.0027 9.8 0.0 20 46 163 189 148 198 0.78 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_6 - 468 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 9.2e-05 14.5 0.0 1 1 8.5e-06 0.00023 13.3 0.0 24 45 307 328 300 331 0.85 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 14_3 - 63 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00011 14.3 0.0 1 1 5.8e-06 0.00016 13.8 0.0 24 52 22 50 14 52 0.89 # 377 # 565 # 1 # ID=14_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 11_2 - 80 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00022 13.3 0.0 1 1 2.3e-05 0.00062 11.9 0.0 25 52 2 29 1 31 0.94 # 898 # 1137 # -1 # ID=11_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.467 7_4 - 326 Rep_3 PF01051.16 222 4.4e-33 107.3 0.1 1 1 7.4e-35 6e-33 106.9 0.1 3 214 10 265 8 271 0.90 # 2368 # 3345 # -1 # ID=7_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.521 10_2 - 289 rve PF00665.21 120 5.3e-32 103.1 0.0 1 1 5.5e-33 1.1e-31 102.1 0.0 3 119 126 240 124 241 0.96 # 273 # 1139 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 9_1 - 296 rve PF00665.21 120 1.6e-27 88.6 0.1 1 1 2.8e-28 5.7e-27 86.8 0.0 2 119 125 239 124 240 0.97 # 43 # 930 # -1 # ID=9_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 11_1 - 273 rve PF00665.21 120 3e-27 87.8 0.0 1 1 2.4e-28 4.9e-27 87.1 0.0 2 119 106 221 105 222 0.97 # 44 # 862 # -1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.504 12_1 - 127 rve PF00665.21 120 4.8e-17 54.8 0.0 1 1 3.6e-18 7.2e-17 54.3 0.0 59 119 4 68 1 69 0.94 # 233 # 613 # 1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 6_4 - 369 Glyco_trans_1_2 PF13524.1 92 1.8e-11 36.8 0.0 1 1 4.2e-13 3.4e-11 36.0 0.0 1 89 264 354 264 357 0.94 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 3_7 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.8e-11 36.7 0.1 1 2 6.7e-07 5.4e-05 15.8 0.0 57 114 7 71 2 74 0.68 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_7 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.8e-11 36.7 0.1 2 2 8.3e-08 6.7e-06 18.8 0.0 4 45 167 207 164 224 0.81 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 610 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00047 11.9 0.0 1 1 2.8e-05 0.0023 9.6 0.0 21 49 70 99 62 116 0.85 # 1553 # 3382 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 1_6 - 1110 AAA_30 PF13604.1 196 3.5e-44 143.3 10.2 1 2 6e-06 0.00024 13.3 2.4 7 132 105 224 101 244 0.86 # 4305 # 7634 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_6 - 1110 AAA_30 PF13604.1 196 3.5e-44 143.3 10.2 2 2 5.9e-43 2.4e-41 134.1 1.0 1 186 653 841 653 855 0.94 # 4305 # 7634 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_4 - 610 AAA_30 PF13604.1 196 0.00044 12.5 0.0 1 1 2.1e-05 0.00084 11.5 0.0 21 57 68 104 60 110 0.85 # 1553 # 3382 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 7_2 - 122 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.00041 12.7 0.2 1 2 0.0027 0.22 3.9 0.0 5 31 11 37 8 49 0.85 # 538 # 903 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 7_2 - 122 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.00041 12.7 0.2 2 2 0.00031 0.025 7.0 0.1 42 80 76 112 73 117 0.89 # 538 # 903 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 2_3 - 707 SMC_N PF02463.14 220 4.1e-09 28.5 1.5 1 2 0.0011 0.089 4.6 0.3 26 42 497 513 485 526 0.83 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 SMC_N PF02463.14 220 4.1e-09 28.5 1.5 2 2 3.1e-09 2.5e-07 22.7 0.0 136 210 605 675 516 682 0.74 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 7_2 - 122 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3e-21 67.8 1.1 1 1 4.8e-22 3.9e-21 67.5 0.6 2 74 8 87 7 89 0.89 # 538 # 903 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 14_3 - 63 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1e-15 50.1 0.1 1 1 1.3e-16 1.1e-15 50.0 0.1 2 57 3 58 2 63 0.91 # 377 # 565 # 1 # ID=14_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 9_2 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 9.4e-14 43.8 1.2 1 1 4.7e-14 3.8e-13 41.9 1.2 1 74 1 87 1 88 0.85 # 930 # 1256 # -1 # ID=9_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 10_1 - 92 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.5e-11 35.6 2.9 1 1 5.3e-12 4.3e-11 35.3 2.9 3 76 3 71 1 71 0.90 # 1 # 276 # 1 # ID=10_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.514 11_2 - 80 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.1e-08 27.6 0.1 1 1 1.7e-09 1.4e-08 27.3 0.1 21 75 1 54 1 55 0.92 # 898 # 1137 # -1 # ID=11_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.467 6_1 - 37 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 2e-07 23.6 0.0 1 1 2.8e-08 2.2e-07 23.4 0.0 1 30 1 29 1 32 0.93 # 34 # 144 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 4_1 - 50 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.5e-07 22.8 0.1 1 1 5e-08 4e-07 22.6 0.1 2 44 10 50 9 50 0.94 # 2 # 151 # -1 # ID=4_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 14_1 - 24 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.8e-06 20.5 0.0 1 1 2.2e-07 1.8e-06 20.5 0.0 1 22 1 22 1 24 0.92 # 2 # 73 # -1 # ID=14_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 3_1 - 24 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.8e-06 20.5 0.0 1 1 2.2e-07 1.8e-06 20.5 0.0 1 22 1 22 1 24 0.92 # 2 # 73 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 3_13 - 80 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.7e-06 18.9 0.0 1 1 1e-06 8.1e-06 18.4 0.0 32 74 10 58 8 59 0.83 # 6448 # 6687 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.567 1_4 - 610 TraG-D_C PF12696.2 128 4.6e-21 67.7 0.0 1 1 1e-22 8.4e-21 66.8 0.0 1 127 299 421 299 422 0.86 # 1553 # 3382 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 3_7 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 1.3e-05 17.4 0.0 1 2 0.0005 0.04 6.1 0.0 103 117 17 31 4 71 0.83 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_7 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 1.3e-05 17.4 0.0 2 2 4.7e-05 0.0038 9.4 0.0 28 54 163 189 158 223 0.65 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 6_4 - 369 Glyco_trans_4_2 PF13477.1 139 1.6e-11 36.8 0.0 1 1 3.9e-13 3.2e-11 35.9 0.0 15 106 22 110 3 133 0.77 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 2_6 - 468 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 1.8e-22 72.7 0.0 1 2 1e-22 8.3e-21 67.2 0.0 1 139 160 294 160 320 0.80 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 2_6 - 468 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 1.8e-22 72.7 0.0 2 2 0.0034 0.28 3.3 0.1 123 173 415 464 400 467 0.69 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 2_3 - 707 AAA_21 PF13304.1 303 1e-09 31.3 0.1 1 1 6.9e-09 5.6e-07 22.3 0.1 2 297 498 662 497 667 0.87 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_1 - 153 Rrf2 PF02082.15 83 4.5e-06 19.4 0.0 1 1 1e-07 8.4e-06 18.5 0.0 13 56 76 119 69 124 0.78 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 2_1 - 153 HTH_27 PF13463.1 68 8.5e-07 21.9 0.0 1 1 2.2e-08 1.8e-06 20.9 0.0 21 68 91 138 81 138 0.94 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 3_7 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 3.7e-35 114.0 0.0 1 2 2.8e-13 2.3e-11 36.2 0.0 1 113 21 123 21 129 0.84 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_7 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 3.7e-35 114.0 0.0 2 2 1.9e-25 1.5e-23 76.0 0.0 169 228 141 200 125 203 0.90 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 10_2 - 289 rve_2 PF13333.1 52 7.6e-23 73.0 1.5 1 2 0.016 0.43 3.4 0.0 41 52 101 112 88 112 0.75 # 273 # 1139 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 10_2 - 289 rve_2 PF13333.1 52 7.6e-23 73.0 1.5 2 2 8.8e-23 2.4e-21 68.3 0.1 1 52 231 287 231 287 0.98 # 273 # 1139 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 11_1 - 273 rve_2 PF13333.1 52 6e-15 47.8 0.7 1 1 4.9e-16 1.3e-14 46.7 0.7 1 51 212 267 212 267 0.93 # 44 # 862 # -1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.504 9_1 - 296 rve_2 PF13333.1 52 1.7e-08 27.1 0.0 1 1 1.3e-09 3.4e-08 26.1 0.0 1 44 230 276 230 283 0.88 # 43 # 930 # -1 # ID=9_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 3_9 - 320 Hydantoinase_A PF01968.13 290 0.00012 13.9 0.3 1 2 0.043 3.5 -0.8 0.0 82 106 6 30 4 37 0.86 # 4572 # 5531 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.398 3_9 - 320 Hydantoinase_A PF01968.13 290 0.00012 13.9 0.3 2 2 0.00014 0.011 7.4 0.0 73 100 163 189 150 210 0.83 # 4572 # 5531 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.398 2_6 - 468 Crp PF00325.15 32 0.00098 11.3 1.1 1 1 2.3e-05 0.0019 10.4 0.1 7 21 314 328 311 329 0.91 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 1_4 - 610 AAA_16 PF13191.1 185 3.2e-06 19.8 0.0 1 1 3.1e-07 1.3e-05 17.9 0.0 21 61 62 103 59 145 0.80 # 1553 # 3382 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 2_3 - 707 AAA_16 PF13191.1 185 0.00019 14.0 0.0 1 1 1e-05 0.00042 12.9 0.0 24 106 495 587 489 660 0.57 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 AAA_22 PF13401.1 131 2.8e-05 16.9 0.3 1 1 2.3e-06 0.00018 14.2 0.3 7 106 498 642 492 667 0.66 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 6_4 - 369 Glyco_trans_1_4 PF13692.1 135 7.6e-16 51.1 0.0 1 2 0.071 5.7 -0.3 0.0 3 21 83 101 81 106 0.90 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 6_4 - 369 Glyco_trans_1_4 PF13692.1 135 7.6e-16 51.1 0.0 2 2 7.9e-17 6.4e-15 48.1 0.0 2 133 185 325 184 327 0.83 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 2_3 - 707 AAA_29 PF13555.1 62 3.8e-05 15.8 0.4 1 1 1.5e-06 0.00012 14.2 0.1 22 40 494 512 486 525 0.83 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_1 - 153 GntR PF00392.16 64 0.00012 14.2 0.0 1 1 2.7e-06 0.00022 13.3 0.0 26 56 90 120 88 124 0.88 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 7_2 - 122 HTH_23 PF13384.1 50 1.9e-07 23.3 0.1 1 1 3.2e-08 3.7e-07 22.3 0.1 3 48 14 60 12 62 0.90 # 538 # 903 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 2_6 - 468 HTH_23 PF13384.1 50 5.9e-07 21.7 0.3 1 1 5.1e-08 5.9e-07 21.7 0.3 2 37 294 329 293 332 0.95 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 10_1 - 92 HTH_23 PF13384.1 50 8.1e-06 18.1 0.0 1 1 1.4e-06 1.7e-05 17.1 0.0 7 40 12 44 6 52 0.86 # 1 # 276 # 1 # ID=10_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.514 4_1 - 50 HTH_23 PF13384.1 50 5.2e-05 15.5 0.0 1 1 5.2e-06 6e-05 15.3 0.0 6 38 19 50 14 50 0.88 # 2 # 151 # -1 # ID=4_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 9_2 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 5.6e-05 15.4 0.9 1 1 3.1e-05 0.00036 12.8 0.2 5 42 10 55 8 66 0.83 # 930 # 1256 # -1 # ID=9_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 7_1 - 152 HTH_23 PF13384.1 50 0.00026 13.3 2.3 1 1 2.9e-05 0.00034 12.9 0.5 13 40 7 34 3 40 0.90 # 125 # 580 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.555 3_12 - 83 HTH_23 PF13384.1 50 0.00039 12.7 0.0 1 1 0.00036 0.0041 9.5 0.0 12 39 3 31 3 42 0.85 # 6200 # 6448 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 2_6 - 468 HTH_7 PF02796.10 45 6.1e-07 21.9 0.0 1 1 3.6e-08 2.9e-06 19.7 0.0 4 38 293 326 283 329 0.87 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 2_6 - 468 HTH_29 PF13551.1 112 9.6e-06 18.4 0.6 1 1 1.6e-06 6.6e-05 15.7 0.1 2 34 300 331 300 397 0.93 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 7_2 - 122 HTH_29 PF13551.1 112 1.8e-05 17.5 0.2 1 1 6.8e-07 2.8e-05 16.9 0.2 11 71 29 88 18 109 0.67 # 538 # 903 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 6_4 - 369 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 2.1e-14 46.6 0.9 1 3 3.2e-14 2.6e-12 39.8 0.0 1 160 14 157 14 157 0.84 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 6_4 - 369 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 2.1e-14 46.6 0.9 2 3 0.021 1.7 1.3 0.1 89 104 177 217 162 283 0.50 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 6_4 - 369 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 2.1e-14 46.6 0.9 3 3 0.03 2.4 0.9 0.0 95 104 284 293 226 340 0.52 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 1_4 - 610 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 3.1e-149 489.3 0.0 1 1 4.6e-151 3.7e-149 489.0 0.0 2 386 52 441 51 441 0.99 # 1553 # 3382 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 2_3 - 707 AAA_18 PF13238.1 129 4.8e-06 19.5 1.9 1 3 9.2e-07 7.4e-05 15.7 0.5 1 20 498 517 498 534 0.77 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 AAA_18 PF13238.1 129 4.8e-06 19.5 1.9 2 3 0.094 7.6 -0.5 0.0 73 100 523 549 519 580 0.79 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 AAA_18 PF13238.1 129 4.8e-06 19.5 1.9 3 3 0.046 3.7 0.5 0.0 47 91 632 672 614 682 0.79 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 3_7 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.00054 12.1 0.0 1 2 0.042 3.4 -0.2 0.0 53 79 4 29 2 33 0.90 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_7 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.00054 12.1 0.0 2 2 3.7e-05 0.003 9.7 0.0 2 31 165 194 164 208 0.86 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_3 - 707 DUF258 PF03193.11 161 1.9e-05 16.5 0.7 1 2 2.2e-06 0.00018 13.3 0.0 26 66 485 526 467 531 0.79 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 DUF258 PF03193.11 161 1.9e-05 16.5 0.7 2 2 0.019 1.6 0.5 0.0 23 49 581 607 561 608 0.81 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 6_4 - 369 Glycos_transf_1 PF00534.15 172 6.9e-33 106.1 0.0 1 1 1.3e-34 1.1e-32 105.4 0.0 13 171 183 340 176 341 0.95 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 2_3 - 707 DUF87 PF01935.12 229 0.00021 13.8 0.1 1 1 2.6e-06 0.00021 13.8 0.1 26 61 498 531 481 532 0.80 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 7_2 - 122 HTH_28 PF13518.1 52 1.5e-08 27.2 0.5 1 1 2e-09 3.2e-08 26.2 0.0 1 43 17 60 17 63 0.93 # 538 # 903 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 14_3 - 63 HTH_28 PF13518.1 52 2.3e-06 20.2 0.0 1 1 1.9e-07 3.1e-06 19.8 0.0 1 38 12 50 12 56 0.92 # 377 # 565 # 1 # ID=14_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 10_1 - 92 HTH_28 PF13518.1 52 5.2e-05 15.9 0.6 1 1 6e-06 9.8e-05 15.0 0.1 14 34 23 43 14 45 0.85 # 1 # 276 # 1 # ID=10_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.514 4_1 - 50 HTH_28 PF13518.1 52 5.2e-05 15.9 0.1 1 1 4.8e-06 7.9e-05 15.3 0.1 14 33 31 50 21 50 0.85 # 2 # 151 # -1 # ID=4_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 2_6 - 468 HTH_28 PF13518.1 52 0.0003 13.4 0.1 1 1 1.9e-05 0.0003 13.4 0.1 5 32 302 329 300 332 0.85 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 2_1 - 153 HTH_24 PF13412.1 48 6.2e-08 24.6 0.2 1 1 3.2e-09 1.3e-07 23.6 0.0 2 48 71 119 70 119 0.92 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 2_6 - 468 HTH_24 PF13412.1 48 0.00057 11.9 0.0 1 1 3.1e-05 0.0012 10.8 0.0 14 36 306 328 303 328 0.88 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 1_6 - 1110 UvrD_C_2 PF13538.1 104 4.4e-05 16.2 0.3 1 2 0.0075 0.61 2.9 0.0 6 44 912 950 908 980 0.74 # 4305 # 7634 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_6 - 1110 UvrD_C_2 PF13538.1 104 4.4e-05 16.2 0.3 2 2 3.9e-05 0.0031 10.3 0.1 3 67 1026 1093 1024 1095 0.71 # 4305 # 7634 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_1 - 153 HTH_6 PF01418.12 77 3.8e-05 16.0 0.0 1 1 7.6e-07 6.1e-05 15.4 0.0 24 63 79 117 53 127 0.81 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 3_9 - 320 StbA PF06406.6 318 3.5e-148 485.3 0.2 1 1 4.9e-150 4e-148 485.1 0.2 1 317 2 318 2 319 0.99 # 4572 # 5531 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.398 2_3 - 707 AAA_17 PF13207.1 121 4.5e-08 26.6 0.0 1 1 2.8e-09 1.1e-07 25.3 0.0 1 53 497 552 497 601 0.70 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 1_4 - 610 AAA_17 PF13207.1 121 0.00021 14.8 0.0 1 1 1.7e-05 0.0007 13.1 0.0 3 27 69 97 67 148 0.68 # 1553 # 3382 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 2_3 - 707 TIGR02211 TIGR02211 221 3.7e-36 117.0 0.2 1 1 8.8e-38 7.1e-36 116.0 0.2 8 219 474 681 468 683 0.81 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 AAA_25 PF13481.1 194 0.00018 13.5 0.0 1 2 2.3e-05 0.0019 10.2 0.0 29 50 491 512 482 532 0.88 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 AAA_25 PF13481.1 194 0.00018 13.5 0.0 2 2 0.031 2.5 0.0 0.0 134 188 617 662 586 663 0.76 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 7_2 - 122 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00028 12.7 1.6 1 1 1.4e-05 0.00058 11.7 0.1 7 42 8 44 8 46 0.92 # 538 # 903 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 14_3 - 63 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00029 12.6 0.0 1 1 9.6e-06 0.00039 12.2 0.0 7 50 3 47 2 49 0.90 # 377 # 565 # 1 # ID=14_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 14_3 - 63 DUF1153 PF06627.6 90 3.5e-05 16.3 0.0 1 1 4.7e-07 3.8e-05 16.2 0.0 28 75 3 50 1 61 0.88 # 377 # 565 # 1 # ID=14_3;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 7_2 - 122 CENP-B_N PF04218.8 53 2.5e-06 19.5 0.0 1 1 6e-08 4.8e-06 18.6 0.0 3 44 9 51 8 55 0.86 # 538 # 903 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 2_3 - 707 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00016 12.9 0.2 1 2 0.00092 0.075 4.1 0.0 241 265 491 516 477 523 0.90 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00016 12.9 0.2 2 2 0.00018 0.014 6.5 0.0 304 366 586 652 574 681 0.71 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 ArgK PF03308.11 267 0.00019 12.8 0.0 1 1 4.4e-06 0.00036 11.9 0.0 15 52 481 518 473 528 0.84 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 SbcCD_C PF13558.1 90 0.00044 12.8 0.1 1 1 5.2e-05 0.0042 9.7 0.1 61 86 621 646 592 650 0.81 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 1_4 - 610 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.8e-10 32.5 0.0 1 1 5.3e-12 4.3e-10 31.3 0.0 250 361 242 356 78 380 0.77 # 1553 # 3382 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 2_3 - 707 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00097 12.0 0.8 1 2 0.00027 0.022 7.6 0.0 3 19 500 516 498 530 0.86 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00097 12.0 0.8 2 2 0.018 1.5 1.7 0.1 48 104 622 676 618 678 0.77 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 13_1 - 98 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 5.5e-53 171.2 0.5 1 1 7.4e-55 6e-53 171.0 0.5 35 131 1 97 1 97 0.99 # 18 # 311 # -1 # ID=13_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 6_4 - 369 Glyco_transf_28 PF03033.15 139 0.0008 11.8 1.8 1 2 0.00043 0.035 6.5 0.0 15 54 20 61 18 100 0.64 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 6_4 - 369 Glyco_transf_28 PF03033.15 139 0.0008 11.8 1.8 2 2 0.011 0.88 2.0 0.0 99 128 273 302 245 308 0.85 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 6_4 - 369 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 4.3e-14 45.2 0.0 1 1 1e-15 8.3e-14 44.3 0.0 4 172 6 159 3 160 0.72 # 3391 # 4497 # -1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.507 10_2 - 289 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.2e-12 39.8 0.0 1 1 1.9e-13 3.8e-12 39.0 0.0 2 129 130 260 129 272 0.88 # 273 # 1139 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 9_1 - 296 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.9e-08 26.4 0.0 1 1 2.2e-09 4.5e-08 25.8 0.0 2 137 130 267 129 269 0.92 # 43 # 930 # -1 # ID=9_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 11_1 - 273 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.5e-07 23.4 0.0 1 1 1.8e-08 3.7e-07 22.8 0.0 2 139 111 252 110 253 0.86 # 44 # 862 # -1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.504 12_1 - 127 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 0.00068 12.2 0.0 1 1 4.3e-05 0.00088 11.9 0.0 53 133 11 93 4 99 0.81 # 233 # 613 # 1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 2_5 - 172 HHH_4 PF14490.1 94 0.00012 14.5 0.1 1 1 5.5e-06 0.00045 12.6 0.0 9 42 127 159 119 160 0.82 # 7368 # 7883 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.347 2_6 - 468 HTH_26 PF13443.1 63 0.00013 14.8 0.0 1 1 4.8e-06 0.00039 13.3 0.0 5 36 304 336 300 342 0.78 # 8739 # 10142 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.513 2_1 - 153 HTH_11 PF08279.7 55 1.8e-09 29.8 0.0 1 1 4.6e-11 3.7e-09 28.8 0.0 5 44 77 117 73 126 0.91 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 2_1 - 153 MarR_2 PF12802.2 62 3.1e-11 35.5 0.0 1 1 6e-13 4.9e-11 34.8 0.0 2 62 69 129 68 129 0.92 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 2_1 - 153 TrmB PF01978.14 68 1.5e-06 20.5 0.0 1 1 3.2e-08 2.6e-06 19.7 0.0 24 62 90 133 75 138 0.84 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 2_1 - 153 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 6e-05 15.4 0.1 1 1 2.1e-06 0.00017 14.0 0.0 26 60 86 120 73 140 0.77 # 232 # 690 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=8bp;gc_cont=0.331 9_2 - 109 Phage_terminase PF10668.4 60 0.00041 12.8 0.0 1 1 9.2e-06 0.00075 11.9 0.0 9 45 12 53 5 69 0.80 # 930 # 1256 # -1 # ID=9_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 1_4 - 610 AAA_10 PF12846.2 304 7.9e-11 34.5 0.0 1 1 6e-11 2.4e-09 29.6 0.0 3 296 67 374 66 380 0.67 # 1553 # 3382 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 2_3 - 707 AAA_10 PF12846.2 304 0.00015 13.8 0.1 1 2 2.7e-05 0.0011 11.0 0.0 6 25 500 519 497 532 0.79 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_3 - 707 AAA_10 PF12846.2 304 0.00015 13.8 0.1 2 2 0.06 2.4 0.0 0.0 217 257 620 659 594 674 0.70 # 2200 # 4320 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 3_7 - 228 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00043 13.4 0.0 1 2 0.0055 0.45 3.7 0.0 79 93 54 68 46 70 0.83 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_7 - 228 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00043 13.4 0.0 2 2 0.00048 0.039 7.1 0.0 5 58 172 224 168 227 0.86 # 2330 # 3013 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_6 - 1110 AAA_11 PF13086.1 236 0.00014 14.1 0.0 1 1 5.6e-06 0.00045 12.4 0.0 2 75 654 724 653 746 0.80 # 4305 # 7634 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 9_1 - 296 HTH_21 PF13276.1 60 5.5e-19 60.6 3.5 1 1 7.9e-20 1.3e-18 59.5 3.5 2 60 46 103 44 103 0.94 # 43 # 930 # -1 # ID=9_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 7_1 - 152 HTH_21 PF13276.1 60 5.2e-18 57.5 0.4 1 1 3.2e-19 5.2e-18 57.5 0.4 6 57 49 106 44 109 0.80 # 125 # 580 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.555 10_2 - 289 HTH_21 PF13276.1 60 1.3e-12 40.3 0.1 1 1 3.4e-13 5.6e-12 38.2 0.0 4 59 47 101 44 102 0.90 # 273 # 1139 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.552 11_1 - 273 HTH_21 PF13276.1 60 3.7e-11 35.5 3.8 1 1 6.1e-12 9.9e-11 34.2 3.8 3 58 27 81 23 83 0.88 # 44 # 862 # -1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.504 3_11 - 75 HTH_21 PF13276.1 60 0.00046 12.9 0.4 1 1 2.8e-05 0.00046 12.9 0.4 38 60 1 23 1 23 0.92 # 5991 # 6215 # -1 # ID=3_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/3fd99c2b-4190-4d09-b4d7-f1dc97c19ed0 # Target file: checkm_output/bins/pm541/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm541/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/3fd99c2b-4190-4d09-b4d7-f1dc97c19ed0 checkm_output/bins/pm541/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:08:40 2017 # [ok]