# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_21 - 270 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.8e-05 17.0 0.0 1 2 0.0007 0.066 5.4 0.0 112 128 18 34 9 82 0.67 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_21 - 270 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.8e-05 17.0 0.0 2 2 3.4e-05 0.0033 9.7 0.0 41 64 162 185 145 234 0.71 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 2_13 - 255 DnaB_bind PF10410.4 59 0.00095 12.0 0.2 1 2 0.0022 0.21 4.5 0.1 24 38 138 152 135 153 0.88 # 9177 # 9941 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 2_13 - 255 DnaB_bind PF10410.4 59 0.00095 12.0 0.2 2 2 0.0016 0.15 5.0 0.0 20 37 171 188 169 194 0.90 # 9177 # 9941 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 9_2 - 77 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 1.5e-11 36.5 6.0 1 1 2.4e-13 2.3e-11 35.9 6.0 17 36 2 21 1 21 0.96 # 407 # 637 # -1 # ID=9_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 2_11 - 886 Peptidase_M66 PF10462.4 305 4.2e-131 429.1 0.6 1 1 4.4e-133 4.2e-131 429.1 0.6 1 305 236 537 236 537 0.99 # 5561 # 8218 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 4_2 - 210 ABC_tran PF00005.22 137 3.5e-27 88.2 0.0 1 1 1.7e-28 5.5e-27 87.6 0.0 1 137 17 163 17 163 0.93 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 1_34 - 244 ABC_tran PF00005.22 137 5e-24 78.0 0.0 1 1 2.3e-25 7.2e-24 77.5 0.0 2 136 24 162 23 163 0.93 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 2_15 - 301 ABC_tran PF00005.22 137 0.00019 14.6 0.0 1 1 9.7e-06 0.00031 13.9 0.0 13 51 62 100 56 183 0.65 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_27 - 151 TIGR01173 TIGR01173 452 1.2e-12 39.9 5.9 1 2 1.5e-07 1.4e-05 16.6 0.1 293 343 6 56 4 74 0.50 # 21442 # 21894 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.470 1_27 - 151 TIGR01173 TIGR01173 452 1.2e-12 39.9 5.9 2 2 4.2e-12 3.9e-10 31.6 2.0 332 433 27 138 26 146 0.83 # 21442 # 21894 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.470 1_21 - 270 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00056 12.1 0.0 1 2 0.0016 0.15 4.2 0.0 123 138 19 34 8 79 0.71 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_21 - 270 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00056 12.1 0.0 2 2 0.00048 0.046 5.9 0.0 53 72 164 183 155 216 0.81 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 2_4 - 115 rve_3 PF13683.1 67 3.4e-14 45.0 0.0 1 1 1.4e-15 4.6e-14 44.6 0.0 5 67 34 96 30 96 0.92 # 2512 # 2856 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_37 - 200 rve_3 PF13683.1 67 8.4e-14 43.8 0.0 1 1 4e-15 1.3e-13 43.2 0.0 6 67 120 181 115 181 0.93 # 28610 # 29209 # -1 # ID=1_37;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 3_8 - 214 rve_3 PF13683.1 67 6.9e-07 21.6 0.1 1 1 4.1e-08 1.3e-06 20.7 0.1 9 52 42 86 40 91 0.94 # 6180 # 6821 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.540 7_1 - 186 HTH_DeoR PF08220.7 57 0.00038 12.9 0.9 1 1 1.1e-05 0.001 11.5 0.2 15 35 98 118 85 124 0.77 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 2_22 - 400 T2SL PF05134.8 230 4e-69 225.1 1.6 1 1 6.4e-71 6.1e-69 224.5 1.6 1 230 13 238 13 238 0.98 # 16800 # 17999 # 1 # ID=2_22;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.494 2_15 - 301 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00066 12.0 0.0 1 1 1.2e-05 0.0011 11.2 0.0 36 57 58 79 30 88 0.81 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_6 - 129 HTH_38 PF13936.1 44 0.00061 12.2 0.1 1 1 1.2e-05 0.0011 11.4 0.1 10 43 30 63 26 63 0.82 # 5658 # 6044 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 2_15 - 301 MobB PF03205.9 140 0.00015 14.3 0.0 1 1 2.7e-06 0.00026 13.6 0.0 2 34 62 94 61 99 0.87 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 10_1 - 138 Sigma54_DBD PF04552.8 160 0.00033 13.0 0.0 1 1 5.2e-06 0.00049 12.5 0.0 100 154 45 97 27 103 0.76 # 2 # 415 # -1 # ID=10_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_6 - 513 DUF3584 PF12128.3 1201 0.0038 7.4 5.7 1 2 6.3e-06 0.0006 10.0 2.1 304 377 12 86 5 100 0.88 # 3289 # 4827 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.594 1_6 - 513 DUF3584 PF12128.3 1201 0.0038 7.4 5.7 2 2 0.068 6.5 -3.4 0.1 281 977 378 399 346 419 0.42 # 3289 # 4827 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.594 1_3 - 127 TetR_N PF00440.18 47 0.0001 14.8 0.0 1 1 1.8e-06 0.00017 14.1 0.0 1 26 69 94 69 95 0.93 # 1249 # 1629 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 2_15 - 301 AAA_19 PF13245.1 76 7.1e-07 21.8 0.0 1 1 5.3e-08 2.5e-06 20.1 0.0 6 36 55 86 52 99 0.83 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_7 - 114 AAA_19 PF13245.1 76 0.00023 13.7 0.0 1 2 0.086 4.1 0.2 0.0 51 75 47 72 24 73 0.83 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 3_7 - 114 AAA_19 PF13245.1 76 0.00023 13.7 0.0 2 2 2.6e-05 0.0012 11.4 0.0 12 25 99 112 87 113 0.77 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_21 - 270 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00073 11.8 0.1 1 2 0.035 3.3 -0.2 0.1 175 188 18 31 9 38 0.80 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_21 - 270 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00073 11.8 0.1 2 2 5.1e-05 0.0049 9.1 0.0 20 46 163 189 148 197 0.78 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_37 - 200 rve PF00665.21 120 1.4e-28 92.3 0.0 1 1 1.1e-29 3.3e-28 91.1 0.0 2 119 29 143 28 144 0.97 # 28610 # 29209 # -1 # ID=1_37;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 2_4 - 115 rve PF00665.21 120 1.4e-11 37.4 0.0 1 1 8.4e-13 2.7e-11 36.5 0.0 69 119 8 58 2 59 0.93 # 2512 # 2856 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 3_8 - 214 rve PF00665.21 120 2.5e-08 26.9 0.0 1 1 1.4e-09 4.3e-08 26.2 0.0 70 120 3 63 1 63 0.84 # 6180 # 6821 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.540 1_16 - 139 zf-ribbon_3 PF13248.1 26 2.2e-05 16.5 0.3 1 1 4.8e-07 4.5e-05 15.5 0.3 2 21 102 130 101 130 0.85 # 13223 # 13639 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.513 4_6 - 129 Terminase_5 PF06056.7 58 2.1e-06 20.1 0.0 1 1 3.4e-08 3.2e-06 19.5 0.0 3 48 30 75 28 85 0.89 # 5658 # 6044 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_34 - 244 AAA_23 PF13476.1 202 8.8e-08 25.5 1.9 1 1 4.4e-09 1.4e-07 24.9 1.9 12 114 25 143 18 238 0.62 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 2_15 - 301 AAA_23 PF13476.1 202 4.8e-06 19.8 0.0 1 1 2.3e-07 7.3e-06 19.2 0.0 19 38 60 79 46 90 0.88 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_2 - 210 AAA_23 PF13476.1 202 1.3e-05 18.4 6.4 1 1 7.3e-07 2.3e-05 17.6 6.5 10 100 17 99 11 183 0.52 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 1_21 - 270 Methyltransf_26 PF13659.1 117 7.6e-11 35.0 0.1 1 2 1.5e-06 0.00014 14.7 0.0 57 114 7 71 2 74 0.71 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_21 - 270 Methyltransf_26 PF13659.1 117 7.6e-11 35.0 0.1 2 2 1.2e-07 1.1e-05 18.3 0.0 4 43 167 205 164 253 0.71 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 2_15 - 301 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00046 12.1 0.0 1 1 7.9e-06 0.00075 11.4 0.0 18 46 62 92 48 100 0.79 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_15 - 301 AAA_30 PF13604.1 196 0.00024 13.5 0.0 1 1 5e-06 0.00047 12.6 0.0 10 44 52 86 44 95 0.81 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_2 - 210 SMC_N PF02463.14 220 7.3e-10 31.2 3.1 1 2 9.3e-06 0.00044 12.3 0.2 15 44 18 47 7 55 0.82 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 4_2 - 210 SMC_N PF02463.14 220 7.3e-10 31.2 3.1 2 2 4.9e-08 2.4e-06 19.8 0.3 118 206 111 201 57 208 0.68 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 1_34 - 244 SMC_N PF02463.14 220 6.7e-06 18.3 0.4 1 3 0.0011 0.053 5.5 0.1 26 44 35 53 23 75 0.84 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_34 - 244 SMC_N PF02463.14 220 6.7e-06 18.3 0.4 2 3 0.00015 0.0069 8.4 0.0 137 188 133 182 86 199 0.87 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_34 - 244 SMC_N PF02463.14 220 6.7e-06 18.3 0.4 3 3 0.028 1.3 1.0 0.0 46 82 204 238 198 243 0.75 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 3_1 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.4e-14 44.6 1.3 1 1 8e-15 2.5e-13 42.7 1.3 1 74 1 87 1 88 0.86 # 32 # 358 # -1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 6_1 - 72 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.2e-07 22.5 1.8 1 1 8.1e-08 2.6e-06 20.2 1.8 1 49 1 59 1 70 0.80 # 139 # 354 # -1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 4_6 - 129 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00013 14.7 0.2 1 1 2.4e-05 0.00075 12.3 0.1 20 57 37 78 29 97 0.81 # 5658 # 6044 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 4_2 - 210 TIGR03263 TIGR03263 180 0.0004 12.6 0.5 1 2 9.3e-06 0.00089 11.4 0.2 3 20 29 46 27 55 0.85 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 4_2 - 210 TIGR03263 TIGR03263 180 0.0004 12.6 0.5 2 2 0.088 8.3 -1.5 0.0 82 112 88 118 48 123 0.63 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 1_21 - 270 UPF0020 PF01170.13 180 2.7e-05 16.6 0.0 1 2 0.0007 0.067 5.6 0.0 103 117 17 31 4 77 0.85 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_21 - 270 UPF0020 PF01170.13 180 2.7e-05 16.6 0.0 2 2 5.8e-05 0.0055 9.1 0.0 28 54 163 188 158 252 0.72 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 5_2 - 220 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 5.4e-17 54.8 0.1 1 1 1.1e-18 1.1e-16 53.9 0.1 5 71 138 213 135 219 0.94 # 455 # 1114 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_6 - 513 DivIC PF04977.10 80 0.0027 10.1 6.6 1 2 0.0007 0.066 5.6 1.8 19 51 16 48 8 52 0.65 # 3289 # 4827 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.594 1_6 - 513 DivIC PF04977.10 80 0.0027 10.1 6.6 2 2 0.0005 0.047 6.1 0.0 21 47 58 84 54 87 0.83 # 3289 # 4827 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.594 2_8 - 85 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 4e-17 55.4 0.2 1 1 9.9e-19 4.7e-17 55.2 0.2 185 247 11 71 8 73 0.95 # 4138 # 4392 # -1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_9 - 107 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 7.6e-09 28.3 0.5 1 1 9.7e-09 4.6e-07 22.4 0.5 27 115 22 90 5 99 0.65 # 4515 # 4835 # -1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.548 4_2 - 210 AAA_21 PF13304.1 303 1.1e-18 61.0 6.1 1 1 4.9e-18 2.3e-16 53.3 6.1 1 303 29 198 29 198 0.77 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 1_34 - 244 AAA_21 PF13304.1 303 6.4e-15 48.6 4.0 1 2 4.9e-06 0.00023 14.0 1.9 2 24 36 58 35 126 0.76 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_34 - 244 AAA_21 PF13304.1 303 6.4e-15 48.6 4.0 2 2 2.3e-12 1.1e-10 34.7 0.0 189 297 120 192 85 197 0.79 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_27 - 151 TIGR00965 TIGR00965 271 0.0017 10.3 3.5 1 3 1.3e-05 0.0012 10.8 0.3 166 209 20 63 12 69 0.86 # 21442 # 21894 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.470 1_27 - 151 TIGR00965 TIGR00965 271 0.0017 10.3 3.5 2 3 0.077 7.3 -1.6 0.0 175 185 65 75 62 84 0.73 # 21442 # 21894 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.470 1_27 - 151 TIGR00965 TIGR00965 271 0.0017 10.3 3.5 3 3 0.031 2.9 -0.3 0.2 119 138 110 129 71 140 0.68 # 21442 # 21894 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.470 2_15 - 301 AAA PF00004.24 132 0.00051 13.1 0.0 1 1 2e-05 0.00096 12.2 0.0 1 32 63 94 63 163 0.65 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_7 - 114 AAA PF00004.24 132 0.00053 13.1 0.6 1 2 0.097 4.6 0.3 0.0 23 54 31 62 10 69 0.71 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 3_7 - 114 AAA PF00004.24 132 0.00053 13.1 0.6 2 2 5.3e-05 0.0025 10.9 0.3 1 12 100 111 100 113 0.90 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_21 - 270 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 2.1e-35 115.1 0.0 1 1 4.9e-35 4.7e-33 107.4 0.0 1 227 21 199 21 203 0.92 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 2_4 - 115 rve_2 PF13333.1 52 3.7e-09 29.4 0.0 1 1 1.3e-10 6e-09 28.8 0.0 1 44 49 95 49 103 0.87 # 2512 # 2856 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_37 - 200 rve_2 PF13333.1 52 1.7e-08 27.3 0.0 1 1 6.4e-10 3.1e-08 26.5 0.0 1 44 134 180 134 187 0.88 # 28610 # 29209 # -1 # ID=1_37;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 1_25 - 140 Hydantoinase_A PF01968.13 290 0.00027 12.9 0.0 1 1 3e-06 0.00028 12.8 0.0 213 264 60 115 15 127 0.76 # 20267 # 20686 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.350 2_15 - 301 AAA_16 PF13191.1 185 2.8e-08 26.8 0.0 1 1 1.3e-09 4e-08 26.3 0.0 24 121 60 166 49 209 0.72 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_2 - 210 AAA_16 PF13191.1 185 1.4e-05 18.0 0.2 1 1 1e-06 3.3e-05 16.8 0.2 21 44 24 46 14 207 0.76 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 3_7 - 114 AAA_16 PF13191.1 185 1.7e-05 17.7 0.1 1 2 0.0053 0.17 4.7 0.0 123 173 21 88 3 95 0.62 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 3_7 - 114 AAA_16 PF13191.1 185 1.7e-05 17.7 0.1 2 2 3.2e-05 0.001 11.9 0.1 23 38 96 111 85 113 0.86 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 4_2 - 210 AAA_22 PF13401.1 131 2.1e-06 20.7 0.3 1 1 2.4e-07 7.7e-06 18.9 0.3 3 124 26 192 22 198 0.77 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 2_15 - 301 AAA_22 PF13401.1 131 4.2e-06 19.8 0.0 1 1 2.6e-07 8.2e-06 18.8 0.0 4 37 60 104 57 158 0.71 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_3 - 524 AAA_22 PF13401.1 131 0.0016 11.4 1.9 1 2 0.029 0.91 2.5 0.6 36 88 26 79 10 97 0.77 # 1215 # 2786 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.567 3_3 - 524 AAA_22 PF13401.1 131 0.0016 11.4 1.9 2 2 0.0012 0.039 6.9 0.0 12 44 266 298 264 414 0.70 # 1215 # 2786 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.567 1_34 - 244 FeoB_N PF02421.13 156 0.00057 12.0 0.1 1 1 1.1e-05 0.001 11.2 0.1 3 33 36 63 34 95 0.86 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 7_1 - 186 HTH_AraC PF00165.18 42 1.2e-14 46.6 2.3 1 2 3.3e-06 0.00032 13.4 0.1 1 29 90 119 90 128 0.90 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 7_1 - 186 HTH_AraC PF00165.18 42 1.2e-14 46.6 2.3 2 2 5e-12 4.8e-10 31.9 0.1 11 40 148 178 141 180 0.90 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 1_10 - 283 Methyltransf_27 PF13708.1 194 2.2e-67 219.1 0.0 1 1 3.1e-69 3e-67 218.7 0.0 2 194 85 278 84 278 0.96 # 8746 # 9594 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 4_2 - 210 AAA_29 PF13555.1 62 6.7e-07 21.7 0.0 1 1 5.2e-08 1.7e-06 20.4 0.0 13 40 18 44 12 50 0.85 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 2_15 - 301 AAA_29 PF13555.1 62 1.2e-06 20.8 0.0 1 1 8.8e-08 2.8e-06 19.7 0.0 21 43 59 80 50 89 0.82 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_34 - 244 AAA_29 PF13555.1 62 0.00017 14.0 0.0 1 1 1.2e-05 0.00038 12.8 0.0 15 40 26 50 22 53 0.78 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_6 - 129 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 3.7e-06 20.1 0.3 1 1 6e-08 5.7e-06 19.5 0.3 15 59 30 74 17 94 0.82 # 5658 # 6044 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 2_15 - 301 TK PF00265.13 176 0.00046 12.6 0.0 1 1 7.1e-06 0.00068 12.1 0.0 3 85 62 138 60 153 0.79 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_2 - 210 MutS_V PF00488.16 235 0.00018 13.7 0.0 1 1 3.2e-06 0.00031 13.0 0.0 29 66 13 50 2 58 0.80 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 5_2 - 220 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 2.6e-06 20.1 0.2 1 1 5.7e-08 5.4e-06 19.1 0.0 5 79 137 211 134 217 0.76 # 455 # 1114 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_6 - 513 Mnd1 PF03962.10 188 0.03 6.8 7.7 1 2 7.2e-05 0.0068 8.9 3.5 62 135 14 88 10 100 0.78 # 3289 # 4827 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.594 1_6 - 513 Mnd1 PF03962.10 188 0.03 6.8 7.7 2 2 0.066 6.3 -0.8 0.1 110 154 374 418 347 444 0.62 # 3289 # 4827 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.594 4_6 - 129 HTH_32 PF13565.1 77 2.1e-08 27.8 0.1 1 1 5e-10 4.8e-08 26.6 0.0 1 60 56 121 56 128 0.83 # 5658 # 6044 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_11 - 84 HTH_3 PF01381.17 55 2.7e-05 16.9 0.0 1 2 1e-06 9.7e-05 15.1 0.0 1 34 6 39 6 45 0.90 # 10174 # 10425 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_11 - 84 HTH_3 PF01381.17 55 2.7e-05 16.9 0.0 2 2 0.083 7.9 -0.7 0.0 39 52 67 80 65 83 0.66 # 10174 # 10425 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 2_15 - 301 Rad17 PF03215.10 519 5.2e-05 14.8 0.0 1 1 7e-07 6.7e-05 14.5 0.0 38 69 53 84 47 128 0.78 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_6 - 129 HTH_23 PF13384.1 50 2e-10 32.9 0.0 1 1 1.8e-11 4.3e-10 31.9 0.0 4 50 27 73 24 73 0.93 # 5658 # 6044 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_1 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 7.3e-06 18.4 0.0 1 2 1.8e-05 0.00042 12.8 0.1 5 37 85 117 83 125 0.84 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 7_1 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 7.3e-06 18.4 0.0 2 2 0.019 0.46 3.2 0.0 12 35 140 163 134 177 0.73 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 3_1 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 1e-05 18.0 0.5 1 1 8.3e-07 2e-05 17.1 0.1 5 42 10 55 8 65 0.86 # 32 # 358 # -1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_11 - 84 HTH_23 PF13384.1 50 3.4e-05 16.3 0.3 1 2 1.4e-05 0.00033 13.2 0.1 17 33 14 30 6 38 0.86 # 10174 # 10425 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_11 - 84 HTH_23 PF13384.1 50 3.4e-05 16.3 0.3 2 2 0.096 2.3 1.0 0.0 5 22 63 82 59 83 0.75 # 10174 # 10425 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_11 - 84 HTH_19 PF12844.2 64 7.5e-05 15.6 0.0 1 1 1.2e-06 0.00011 15.1 0.0 7 53 9 56 5 67 0.87 # 10174 # 10425 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_11 - 84 DUF1870 PF08965.5 118 0.00028 13.4 1.2 1 1 3.7e-06 0.00036 13.1 1.2 1 75 1 78 1 81 0.69 # 10174 # 10425 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 4_6 - 129 HTH_29 PF13551.1 112 4.9e-14 45.3 0.1 1 1 6.9e-16 6.6e-14 44.9 0.1 1 90 30 119 30 128 0.88 # 5658 # 6044 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_12 - 78 UBA PF00627.26 37 0.00034 13.3 0.1 1 2 0.034 3.2 0.7 0.0 4 16 23 35 20 41 0.78 # 10456 # 10689 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 1_12 - 78 UBA PF00627.26 37 0.00034 13.3 0.1 2 2 2.6e-05 0.0025 10.6 0.0 6 22 45 61 42 61 0.86 # 10456 # 10689 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 3_4 - 350 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.7e-103 338.3 0.0 1 1 1e-104 2e-103 338.1 0.0 1 271 12 299 12 299 0.98 # 3267 # 4316 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.586 3_3 - 524 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.9e-103 338.2 0.1 1 2 0.061 1.2 1.1 2.1 162 207 41 86 18 125 0.48 # 1215 # 2786 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.567 3_3 - 524 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.9e-103 338.2 0.1 2 2 9.8e-105 1.9e-103 338.2 0.1 1 270 186 472 186 473 0.98 # 1215 # 2786 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.567 1_6 - 513 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 2e-103 338.1 0.0 1 1 1.1e-104 2e-103 338.1 0.0 1 271 175 462 175 462 0.98 # 3289 # 4827 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.594 1_4 - 305 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.7e-88 288.0 0.1 1 1 2.3e-89 4.4e-88 287.8 0.1 36 270 2 253 1 254 0.98 # 1709 # 2623 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.576 9_1 - 126 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.1e-05 17.5 0.1 1 1 8.3e-07 1.6e-05 17.1 0.0 83 134 16 73 4 88 0.77 # 3 # 380 # -1 # ID=9_1;partial=10;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.511 1_35 - 188 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.0021 10.5 2.3 1 2 4.8e-05 0.0045 9.4 1.0 39 88 29 78 24 99 0.83 # 27004 # 27567 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 1_35 - 188 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.0021 10.5 2.3 2 2 0.04 3.8 -0.1 0.0 52 67 133 148 124 172 0.79 # 27004 # 27567 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 2_15 - 301 Arch_ATPase PF01637.13 234 6.5e-05 15.5 0.0 1 1 1.8e-06 8.6e-05 15.1 0.0 11 56 52 96 50 153 0.70 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_2 - 210 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00019 14.0 0.6 1 1 5.9e-06 0.00028 13.4 0.6 18 63 25 71 19 187 0.66 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 2_15 - 301 AAA_5 PF07728.9 139 6.1e-05 15.6 0.0 1 1 2.1e-06 0.0001 14.9 0.0 2 95 63 159 62 190 0.72 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_7 - 114 AAA_5 PF07728.9 139 0.00017 14.1 0.6 1 2 0.053 2.5 0.6 0.0 91 126 13 49 3 62 0.53 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 3_7 - 114 AAA_5 PF07728.9 139 0.00017 14.1 0.6 2 2 1.9e-05 0.00088 11.9 0.1 1 14 99 112 99 113 0.91 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_15 - 301 ResIII PF04851.10 184 0.0012 11.6 0.0 1 1 1.7e-05 0.0017 11.1 0.0 21 51 58 86 25 99 0.80 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_2 - 210 AAA_18 PF13238.1 129 4e-06 20.0 0.2 1 1 1.3e-06 6.1e-05 16.2 0.2 2 71 31 114 31 206 0.69 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 2_15 - 301 AAA_18 PF13238.1 129 4.1e-06 20.0 0.0 1 1 1.4e-07 6.4e-06 19.3 0.0 1 69 63 140 63 198 0.63 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_21 - 270 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.00029 13.3 0.0 1 2 0.04 3.8 -0.2 0.0 53 80 4 30 2 64 0.88 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_21 - 270 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.00029 13.3 0.0 2 2 1.7e-05 0.0016 10.9 0.0 3 63 166 224 164 240 0.72 # 17092 # 17901 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 9_2 - 77 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 7e-31 98.3 0.3 1 1 1e-32 9.5e-31 97.9 0.3 1 45 28 72 28 73 0.99 # 407 # 637 # -1 # ID=9_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 4_2 - 210 DUF258 PF03193.11 161 2.7e-07 22.8 0.0 1 1 1.5e-08 4.8e-07 21.9 0.0 34 59 25 51 4 70 0.80 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 1_34 - 244 DUF258 PF03193.11 161 0.00012 14.1 0.1 1 1 6.1e-06 0.00019 13.5 0.1 23 67 20 65 4 83 0.78 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 2_15 - 301 DUF258 PF03193.11 161 0.00064 11.8 0.0 1 1 3.3e-05 0.0011 11.0 0.0 18 67 44 92 29 97 0.73 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_6 - 129 HTH_28 PF13518.1 52 1.3e-08 27.6 0.1 1 1 2e-10 1.9e-08 27.1 0.1 1 50 29 79 29 84 0.89 # 5658 # 6044 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_1 - 186 DUF2089 PF09862.4 113 4.5e-05 16.1 0.5 1 2 0.00015 0.014 8.1 0.1 29 79 77 127 53 141 0.74 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 7_1 - 186 DUF2089 PF09862.4 113 4.5e-05 16.1 0.5 2 2 0.00037 0.035 6.8 0.0 18 48 138 170 127 174 0.82 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 7_1 - 186 HTH_18 PF12833.2 81 3e-13 42.6 0.0 1 1 5.5e-15 5.2e-13 41.8 0.0 3 78 105 178 103 179 0.94 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 7_1 - 186 HTH_10 PF04967.7 53 0.00029 13.3 0.0 1 2 2.9e-05 0.0028 10.1 0.0 19 46 93 120 93 125 0.89 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 7_1 - 186 HTH_10 PF04967.7 53 0.00029 13.3 0.0 2 2 0.065 6.2 -0.6 0.0 25 40 147 162 145 163 0.82 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 4_2 - 210 MMR_HSR1 PF01926.18 116 5.7e-05 15.9 1.0 1 1 3e-06 0.00014 14.7 1.0 3 41 31 71 30 206 0.73 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 1_34 - 244 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00015 14.5 0.8 1 1 6e-06 0.00029 13.7 0.8 2 38 36 68 35 238 0.87 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_11 - 84 HTH_31 PF13560.1 64 6e-07 22.5 2.0 1 2 1e-08 9.5e-07 21.9 1.2 3 43 3 43 2 57 0.86 # 10174 # 10425 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_11 - 84 HTH_31 PF13560.1 64 6e-07 22.5 2.0 2 2 0.1 9.5 -0.6 0.0 17 34 65 72 44 82 0.58 # 10174 # 10425 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 2_15 - 301 T2SE PF00437.15 272 5e-70 228.2 0.8 1 1 6.9e-72 6.6e-70 227.9 0.8 74 271 7 198 3 199 0.98 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_24 - 176 StbA PF06406.6 318 6.5e-91 297.3 0.1 1 1 1.6e-92 7.7e-91 297.1 0.1 1 172 1 172 1 174 0.99 # 19725 # 20252 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 1_25 - 140 StbA PF06406.6 318 5.9e-55 179.2 0.4 1 1 1.4e-56 6.5e-55 179.0 0.4 182 317 1 136 1 137 0.99 # 20267 # 20686 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.350 1_34 - 244 UPF0079 PF02367.12 123 0.00019 13.9 0.2 1 1 4.5e-06 0.00043 12.8 0.2 9 37 27 55 22 65 0.81 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_25 - 140 YbaB_DNA_bd PF02575.11 93 0.00038 13.2 0.0 1 2 0.0087 0.82 2.5 0.0 63 78 20 35 13 42 0.84 # 20267 # 20686 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.350 1_25 - 140 YbaB_DNA_bd PF02575.11 93 0.00038 13.2 0.0 2 2 0.00011 0.011 8.6 0.0 63 88 66 91 51 96 0.84 # 20267 # 20686 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.350 2_15 - 301 AAA_17 PF13207.1 121 2.5e-06 21.2 0.0 1 1 1.4e-07 4.4e-06 20.4 0.0 1 64 62 129 62 174 0.68 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_2 - 210 AAA_17 PF13207.1 121 0.0003 14.5 0.4 1 1 2.4e-05 0.00076 13.2 0.4 3 18 31 46 31 54 0.90 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 3_7 - 114 AAA_17 PF13207.1 121 0.00078 13.1 0.1 1 2 0.061 1.9 2.2 0.0 22 53 10 46 5 94 0.60 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 3_7 - 114 AAA_17 PF13207.1 121 0.00078 13.1 0.1 2 2 0.00037 0.012 9.3 0.0 2 15 100 113 99 113 0.84 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_6 - 513 DZR PF12773.2 50 0.0001 14.9 0.7 1 1 2.1e-06 0.0002 14.0 0.7 10 41 115 166 110 170 0.88 # 3289 # 4827 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.594 4_2 - 210 TIGR02211 TIGR02211 221 1.5e-42 138.0 1.6 1 1 3.8e-44 1.8e-42 137.8 1.6 11 214 7 206 3 209 0.90 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 1_34 - 244 TIGR02211 TIGR02211 221 2.2e-14 46.0 0.0 1 2 2.6e-11 1.2e-09 30.5 0.1 18 94 20 101 5 112 0.80 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_34 - 244 TIGR02211 TIGR02211 221 2.2e-14 46.0 0.0 2 2 3.5e-06 0.00017 13.7 0.0 136 196 127 189 116 211 0.81 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_2 - 210 AAA_25 PF13481.1 194 0.00012 14.3 0.0 1 1 9e-06 0.00028 13.1 0.0 30 50 24 44 4 68 0.81 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 2_15 - 301 AAA_25 PF13481.1 194 0.00041 12.6 0.1 1 1 3.9e-05 0.0012 11.1 0.1 27 53 53 80 36 86 0.79 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_7 - 114 AAA_25 PF13481.1 194 0.00087 11.5 0.0 1 1 3.8e-05 0.0012 11.1 0.0 18 49 77 113 59 113 0.73 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_11 - 886 Reprolysin_2 PF13574.1 174 0.00028 13.8 4.1 1 1 7.9e-06 0.00075 12.4 4.1 42 132 346 454 330 491 0.72 # 5561 # 8218 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 4_2 - 210 AAA_15 PF13175.1 415 1.4e-08 26.9 8.8 1 2 1.4e-06 6.5e-05 14.9 7.7 8 81 13 88 6 135 0.67 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 4_2 - 210 AAA_15 PF13175.1 415 1.4e-08 26.9 8.8 2 2 1.8e-05 0.00087 11.2 0.0 368 414 154 196 142 197 0.85 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 1_34 - 244 AAA_15 PF13175.1 415 1.5e-05 17.0 8.6 1 2 0.0001 0.0048 8.7 2.1 12 53 23 65 7 144 0.62 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_34 - 244 AAA_15 PF13175.1 415 1.5e-05 17.0 8.6 2 2 6.4e-06 0.0003 12.7 0.2 342 411 133 193 98 194 0.76 # 26269 # 27000 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 2_15 - 301 AAA_14 PF13173.1 128 2.3e-05 17.2 0.0 1 1 3.9e-07 3.7e-05 16.5 0.0 3 86 61 154 59 177 0.60 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_15 - 301 AAA_33 PF13671.1 143 0.00019 14.2 0.0 1 1 4.2e-06 0.00039 13.1 0.0 2 77 63 136 62 152 0.75 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 4_2 - 210 SbcCD_C PF13558.1 90 0.00021 14.1 0.0 1 1 1.4e-05 0.0013 11.5 0.0 27 89 129 178 122 179 0.84 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 2_15 - 301 NTPase_1 PF03266.10 168 4.9e-05 15.9 0.2 1 2 6.4e-06 0.00061 12.3 0.0 2 33 63 91 62 97 0.81 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 2_15 - 301 NTPase_1 PF03266.10 168 4.9e-05 15.9 0.2 2 2 0.016 1.5 1.3 0.0 74 117 108 147 98 177 0.59 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 3_5 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.2e-76 246.5 1.5 1 1 1.5e-77 3.5e-76 246.4 1.5 7 131 1 125 1 125 1.00 # 4421 # 4798 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 9_1 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 2.1e-72 234.2 0.1 1 1 1e-73 2.4e-72 234.0 0.1 1 126 2 126 2 126 0.99 # 3 # 380 # -1 # ID=9_1;partial=10;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.511 5_1 - 47 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 5e-24 77.7 0.9 1 1 2.2e-25 5.2e-24 77.7 0.9 86 129 1 44 1 46 0.97 # 3 # 143 # 1 # ID=5_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.475 3_10 - 112 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 2.2e-22 72.4 0.2 1 1 1.7e-23 4.1e-22 71.5 0.2 86 127 1 42 1 45 0.96 # 8741 # 9076 # -1 # ID=3_10;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.494 1_37 - 200 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 5.9e-09 28.9 0.0 1 1 1.6e-10 7.8e-09 28.5 0.0 2 137 34 171 33 173 0.92 # 28610 # 29209 # -1 # ID=1_37;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 2_4 - 115 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 0.00027 13.7 0.0 1 1 7e-06 0.00033 13.5 0.0 71 137 20 86 9 88 0.86 # 2512 # 2856 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 4_2 - 210 TIGR00634 TIGR00634 563 0.00054 11.4 1.0 1 1 6.6e-06 0.00063 11.2 0.1 7 45 11 50 6 57 0.91 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 9_2 - 77 Sigma70_ECF PF07638.6 185 4.7e-05 15.9 0.0 1 1 5.7e-07 5.4e-05 15.7 0.0 135 173 32 70 21 73 0.90 # 407 # 637 # -1 # ID=9_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 1_16 - 139 zinc_ribbon_2 PF13240.1 23 0.00017 14.0 0.5 1 2 1.7e-05 0.0016 10.8 0.2 9 21 98 110 97 111 0.82 # 13223 # 13639 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.513 1_16 - 139 zinc_ribbon_2 PF13240.1 23 0.00017 14.0 0.5 2 2 0.025 2.4 0.7 0.0 9 18 121 130 120 130 0.78 # 13223 # 13639 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.513 7_1 - 186 HTH_5 PF01022.15 47 0.00015 14.3 0.1 1 2 0.068 6.5 -0.6 0.0 19 33 101 115 99 120 0.79 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 7_1 - 186 HTH_5 PF01022.15 47 0.00015 14.3 0.1 2 2 1e-05 0.00098 11.7 0.1 8 30 138 160 131 161 0.88 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 2_15 - 301 AAA_8 PF12780.2 268 0.00086 11.1 0.0 1 1 1.1e-05 0.0011 10.8 0.0 10 52 39 86 31 143 0.81 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 7_1 - 186 UPF0122 PF04297.9 101 0.00013 14.8 1.9 1 2 0.0003 0.028 7.3 0.1 6 56 70 120 64 128 0.84 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 7_1 - 186 UPF0122 PF04297.9 101 0.00013 14.8 1.9 2 2 0.00021 0.02 7.8 0.1 12 52 124 164 114 172 0.85 # 582 # 1139 # 1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 4_2 - 210 AAA_10 PF12846.2 304 3.6e-06 19.4 2.6 1 2 4.4e-05 0.0021 10.3 0.8 5 22 31 48 28 88 0.91 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 4_2 - 210 AAA_10 PF12846.2 304 3.6e-06 19.4 2.6 2 2 0.0001 0.0049 9.1 0.1 162 278 79 206 57 209 0.78 # 1695 # 2324 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 2_15 - 301 AAA_10 PF12846.2 304 0.00036 12.8 0.0 1 1 1.2e-05 0.00055 12.2 0.0 3 36 62 96 60 109 0.77 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_6 - 513 AAA_13 PF13166.1 712 0.00029 12.1 0.1 1 2 3.1e-06 0.00029 12.1 0.1 362 438 6 82 1 102 0.91 # 3289 # 4827 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.594 1_6 - 513 AAA_13 PF13166.1 712 0.00029 12.1 0.1 2 2 0.096 9.2 -2.7 0.1 428 464 376 411 348 418 0.51 # 3289 # 4827 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.594 2_21 - 326 T2SK PF03934.8 280 5.2e-85 277.8 2.2 1 1 6.3e-87 5.9e-85 277.6 2.2 3 277 32 310 30 313 0.94 # 15826 # 16803 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 3_7 - 114 IstB_IS21 PF01695.12 178 6.3e-25 80.4 0.3 1 2 0.019 1.8 0.7 0.2 83 111 4 32 2 33 0.87 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 3_7 - 114 IstB_IS21 PF01695.12 178 6.3e-25 80.4 0.3 2 2 4.6e-26 4.4e-24 77.7 0.0 1 63 51 113 51 113 0.98 # 5839 # 6180 # -1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_15 - 301 AAA_11 PF13086.1 236 2.9e-05 16.5 0.0 1 1 4.2e-07 4e-05 16.1 0.0 10 111 52 152 44 195 0.76 # 11713 # 12615 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 10_1 - 138 HTH_21 PF13276.1 60 2.6e-19 61.9 2.9 1 1 6.5e-21 6.2e-19 60.7 2.9 3 60 47 103 44 103 0.93 # 2 # 415 # -1 # ID=10_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/f8ffda2d-0e2b-4323-b0bd-0f05ff023c29 # Target file: checkm_output/bins/pm531/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm531/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/f8ffda2d-0e2b-4323-b0bd-0f05ff023c29 checkm_output/bins/pm531/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:08:28 2017 # [ok]