# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_17 - 301 TrkA_N PF02254.13 116 3.6e-05 16.8 0.0 1 1 8e-07 8.6e-05 15.6 0.0 1 42 7 48 7 79 0.86 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 1_46 - 92 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 1.2e-21 69.0 8.1 1 1 2.2e-23 2.4e-21 68.0 8.1 1 36 1 36 1 36 0.99 # 37404 # 37679 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_21 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.6e-06 19.0 0.2 1 3 0.0041 0.44 2.3 0.2 187 223 95 129 86 132 0.74 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.6e-06 19.0 0.2 2 3 2.9e-06 0.00031 12.7 0.0 130 231 217 309 200 339 0.79 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.6e-06 19.0 0.2 3 3 0.022 2.3 -0.0 0.0 139 160 345 366 314 376 0.63 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_8 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 1.3e-05 17.7 0.2 1 1 9.2e-07 4.9e-05 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_2 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 1.3e-05 17.7 0.2 1 1 9.2e-07 4.9e-05 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_45 - 237 ABC_tran PF00005.22 137 9.8e-05 15.7 0.0 1 1 1.4e-06 0.00015 15.1 0.0 15 113 28 155 18 173 0.74 # 36660 # 37370 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 3_8 - 190 HTH_22 PF13309.1 64 5.4e-06 19.2 0.1 1 1 5.8e-07 1.6e-05 17.7 0.1 45 62 168 185 166 187 0.92 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_17 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 2.8e-05 16.9 0.4 1 1 5.4e-06 0.00014 14.6 0.0 47 64 166 183 164 183 0.93 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 7_2 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 0.00025 13.8 1.2 1 1 4.7e-05 0.0013 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_8 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 0.0003 13.6 1.5 1 1 4.7e-05 0.0013 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 6_3 - 183 TIGR01173 TIGR01173 452 1.9e-08 26.2 0.2 1 1 2.5e-10 2.7e-08 25.7 0.2 390 430 109 149 100 158 0.89 # 1292 # 1840 # 1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 2_2 - 202 DUF463 PF04317.7 443 2.1e-73 240.3 0.0 1 1 2.2e-75 2.4e-73 240.1 0.0 1 180 20 198 20 201 0.98 # 111 # 716 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.561 2_17 - 301 NAD_binding_11 PF14833.1 122 5.1e-38 122.9 0.3 1 2 0.029 3.1 0.9 1.1 8 53 96 141 92 153 0.85 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 2_17 - 301 NAD_binding_11 PF14833.1 122 5.1e-38 122.9 0.3 2 2 4.7e-40 5.1e-38 122.9 0.3 1 121 170 289 170 290 0.98 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 2_18 - 254 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00053 12.6 0.3 1 1 1.4e-05 0.0015 11.1 0.3 7 42 9 44 8 44 0.94 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_33 - 424 Cdd1 PF11731.3 93 0.00044 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.0012 11.8 0.0 10 47 177 214 143 227 0.86 # 25733 # 27004 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_18 - 71 DUF2116 PF09889.4 59 0.0018 11.1 5.7 1 1 0.00073 0.078 5.9 5.7 6 35 14 54 12 60 0.75 # 15989 # 16201 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 5_2 - 283 rve_3 PF13683.1 67 4.6e-17 54.4 0.2 1 1 8.4e-19 9e-17 53.5 0.2 2 59 190 247 189 251 0.97 # 145 # 993 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 2_8 - 325 Sigma54_activat PF00158.21 168 4.2e-64 208.0 0.0 1 1 5.5e-66 5.9e-64 207.6 0.0 2 163 9 170 8 175 0.98 # 3339 # 4313 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 2_18 - 254 HTH_DeoR PF08220.7 57 2.9e-20 64.6 1.0 1 1 7.1e-22 7.6e-20 63.3 1.0 1 55 6 60 6 61 0.97 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 7_2 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.00069 12.9 0.6 1 1 4.3e-05 0.0023 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_8 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.0007 12.8 0.6 1 1 4.3e-05 0.0023 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 5_4 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.0011 11.9 0.0 1 2 9.1e-05 0.0098 8.8 0.0 1 22 2 23 2 44 0.81 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 5_4 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.0011 11.9 0.0 2 2 0.026 2.8 0.8 0.0 110 135 96 122 94 136 0.74 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_8 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 3.3e-06 19.6 1.4 1 1 2.4e-07 6.3e-06 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_2 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 6.3e-06 18.7 0.0 1 1 2.4e-07 6.3e-06 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 3_8 - 190 HTH_38 PF13936.1 44 1.2e-05 17.8 0.0 1 1 1.5e-06 3.9e-05 16.2 0.0 4 39 148 184 145 185 0.93 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 4_3 - 129 HTH_38 PF13936.1 44 0.00032 13.3 0.0 1 1 1.6e-05 0.00043 12.9 0.0 5 31 12 41 8 45 0.83 # 951 # 1337 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 3_8 - 190 SpoIIID PF12116.3 82 6.4e-05 15.9 0.1 1 2 0.038 4.1 0.5 0.0 33 55 8 30 4 37 0.84 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 3_8 - 190 SpoIIID PF12116.3 82 6.4e-05 15.9 0.1 2 2 5.8e-06 0.00062 12.7 0.0 11 42 157 188 149 189 0.82 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 2_17 - 301 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 1.1e-06 20.9 0.1 1 1 1.9e-08 2e-06 20.0 0.1 36 146 4 118 2 124 0.86 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 1_21 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 6.4e-07 21.7 3.8 1 2 5.9e-09 6.4e-07 21.7 3.8 1 41 100 139 100 159 0.83 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 6.4e-07 21.7 3.8 2 2 0.01 1.1 1.2 0.0 84 120 305 341 261 364 0.71 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_2 - 202 MobB PF03205.9 140 0.00042 13.1 0.0 1 1 5.8e-06 0.00062 12.5 0.0 2 26 21 45 20 52 0.91 # 111 # 716 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.561 2_18 - 254 MarR PF01047.17 59 3.9e-07 22.8 0.1 1 1 1e-08 1.1e-06 21.4 0.1 7 47 9 49 5 52 0.95 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_17 - 301 TIGR00873 TIGR00873 467 6.8e-09 27.6 0.4 1 1 8.2e-11 8.8e-09 27.3 0.4 2 213 7 209 6 229 0.80 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 2_17 - 301 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 7.7e-06 18.4 0.2 1 2 2e-06 0.00021 13.7 0.1 2 39 6 43 5 50 0.92 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 2_17 - 301 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 7.7e-06 18.4 0.2 2 2 0.0061 0.65 2.3 0.0 107 139 86 117 82 126 0.77 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 1_21 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.5e-18 60.5 0.1 1 3 1.5e-06 0.00016 14.8 0.0 164 199 95 130 48 134 0.85 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.5e-18 60.5 0.1 2 3 5.8e-09 6.2e-07 22.6 0.0 115 201 219 304 174 306 0.81 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.5e-18 60.5 0.1 3 3 5.6e-08 6e-06 19.4 0.0 89 147 317 372 309 431 0.82 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_8 - 190 NanE PF04131.9 192 0.00023 13.2 0.0 1 2 0.00013 0.014 7.4 0.0 47 79 9 41 1 69 0.76 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 3_8 - 190 NanE PF04131.9 192 0.00023 13.2 0.0 2 2 0.0018 0.19 3.6 0.0 58 141 83 161 75 177 0.70 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_21 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 4.1e-06 20.0 1.2 1 2 1.9e-05 0.002 11.4 0.2 9 38 100 129 96 164 0.90 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 4.1e-06 20.0 1.2 2 2 0.00049 0.052 6.9 0.1 8 45 271 314 264 382 0.66 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_8 - 325 HTH_8 PF02954.14 42 2.3e-09 29.7 0.1 1 1 8.7e-11 4.7e-09 28.7 0.1 6 41 286 321 282 322 0.92 # 3339 # 4313 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_17 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00014 14.4 0.2 1 2 0.047 2.5 0.8 0.1 2 12 114 124 113 124 0.85 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_17 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00014 14.4 0.2 2 2 3.2e-05 0.0017 10.9 0.0 20 37 163 180 159 183 0.86 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 4_7 - 94 HTH_39 PF14090.1 70 0.00028 13.4 0.0 1 1 4.1e-06 0.00044 12.7 0.0 5 36 7 38 5 52 0.89 # 5230 # 5511 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 3_8 - 190 TetR_N PF00440.18 47 0.00026 13.6 0.0 1 1 4.9e-06 0.00053 12.7 0.0 17 36 166 185 164 185 0.94 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 5_4 - 181 AAA_19 PF13245.1 76 0.00046 13.0 0.0 1 1 1.8e-05 0.0019 11.0 0.0 15 33 5 22 2 36 0.85 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_35 - 402 CbiA PF01656.18 195 1.6e-18 59.8 0.0 1 1 2.8e-20 3e-18 58.9 0.0 1 142 111 292 111 327 0.76 # 28060 # 29265 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_34 - 325 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00056 12.4 0.1 1 1 1.4e-05 0.0015 11.1 0.1 23 50 157 184 152 185 0.88 # 27086 # 28060 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 4_6 - 252 Rep_3 PF01051.16 222 6.2e-50 162.8 0.0 1 1 1.3e-51 7.1e-50 162.6 0.0 3 222 16 242 14 242 0.91 # 2549 # 3304 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_37 - 289 Rep_3 PF01051.16 222 1.3e-48 158.5 0.0 1 1 2.9e-50 1.6e-48 158.2 0.0 3 213 65 278 63 283 0.95 # 30306 # 31172 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.441 5_2 - 283 rve PF00665.21 120 3.7e-25 81.4 0.1 1 1 2e-26 1.1e-24 79.9 0.0 2 118 104 216 103 218 0.95 # 145 # 993 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 8_1 - 211 rve PF00665.21 120 2.4e-13 43.3 0.1 1 2 0.025 1.4 2.1 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 64 # 696 # 1 # ID=8_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 8_1 - 211 rve PF00665.21 120 2.4e-13 43.3 0.1 2 2 9.2e-14 4.9e-12 39.0 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 64 # 696 # 1 # ID=8_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_18 - 254 Fe_dep_repress PF01325.14 60 1.7e-06 21.0 0.2 1 1 4.1e-08 4.4e-06 19.6 0.1 13 53 10 50 8 55 0.93 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_45 - 237 AAA_23 PF13476.1 202 1.7e-11 37.8 0.0 1 1 1.6e-13 1.7e-11 37.8 0.0 1 53 6 58 6 202 0.88 # 36660 # 37370 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 5_4 - 181 AAA_24 PF13479.1 213 0.00011 14.9 0.0 1 1 1.2e-06 0.00013 14.5 0.0 6 33 3 34 1 99 0.87 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_17 - 301 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.0026 10.8 6.3 1 1 4.6e-05 0.0049 9.9 6.3 13 105 14 155 6 246 0.76 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 5_4 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 8.6e-05 14.7 0.0 1 2 2.1e-05 0.0022 10.1 0.0 19 50 3 32 1 39 0.78 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 5_4 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 8.6e-05 14.7 0.0 2 2 0.0045 0.48 2.4 0.0 94 123 73 102 57 160 0.77 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_17 - 301 F420_oxidored PF03807.12 96 2.3e-06 21.0 0.6 1 1 6.5e-08 7e-06 19.5 0.2 2 78 7 79 6 98 0.82 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 1_34 - 325 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.00029 13.6 0.2 1 1 7.2e-06 0.00077 12.3 0.2 48 97 133 185 124 190 0.84 # 27086 # 28060 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_45 - 237 SMC_N PF02463.14 220 2.9e-10 32.7 0.0 1 1 3.9e-12 4.1e-10 32.2 0.0 2 71 4 69 3 79 0.85 # 36660 # 37370 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 2_11 - 135 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.9e-18 59.3 0.0 1 1 9.2e-20 2.4e-18 58.9 0.0 2 58 9 72 8 101 0.83 # 5722 # 6126 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 5_3 - 104 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.1e-09 29.7 0.0 1 1 1.3e-10 3.5e-09 29.6 0.0 2 57 4 59 3 85 0.86 # 990 # 1301 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_17 - 187 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00022 14.2 0.1 1 1 1.8e-05 0.00047 13.1 0.1 15 44 154 182 140 186 0.79 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 8_1 - 211 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00023 14.1 0.4 1 1 1.9e-05 0.0005 13.1 0.4 4 51 6 58 4 64 0.79 # 64 # 696 # 1 # ID=8_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 8_1 - 211 DDE_3 PF13358.1 146 0.00055 12.7 0.0 1 1 1.7e-05 0.0018 11.0 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 64 # 696 # 1 # ID=8_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_35 - 402 MipZ PF09140.6 261 2e-06 20.0 0.0 1 2 0.0027 0.29 3.1 0.0 3 50 111 163 109 193 0.73 # 28060 # 29265 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_35 - 402 MipZ PF09140.6 261 2e-06 20.0 0.0 2 2 8.7e-07 9.3e-05 14.6 0.0 87 136 233 282 220 296 0.87 # 28060 # 29265 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_6 - 421 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 8.5e-35 113.2 0.2 1 1 1.7e-36 1.8e-34 112.1 0.0 6 213 128 362 123 362 0.96 # 3896 # 5158 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 2_13 - 513 DivIC PF04977.10 80 0.0012 11.4 4.9 1 2 0.0013 0.14 4.8 0.6 18 38 29 49 24 52 0.86 # 6519 # 8057 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.591 2_13 - 513 DivIC PF04977.10 80 0.0012 11.4 4.9 2 2 0.00024 0.026 7.1 0.1 21 49 58 86 54 88 0.86 # 6519 # 8057 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.591 1_45 - 237 AAA_21 PF13304.1 303 1.4e-05 18.2 0.0 1 1 2.3e-07 2.5e-05 17.3 0.0 2 24 27 49 27 83 0.83 # 36660 # 37370 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 3_8 - 190 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00019 13.7 0.0 1 2 0.056 3 0.3 0.0 31 40 148 157 144 160 0.85 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 3_8 - 190 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00019 13.7 0.0 2 2 3.1e-05 0.0016 10.8 0.0 18 37 163 182 148 188 0.88 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 2_18 - 254 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.0045 9.4 4.2 1 1 2.6e-05 0.0014 11.0 0.4 7 39 5 38 5 43 0.90 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_21 - 562 Thi4 PF01946.12 230 0.00029 13.0 0.4 1 1 6.3e-06 0.00068 11.7 0.4 19 70 100 150 95 158 0.88 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_8 - 325 AAA PF00004.24 132 1.7e-05 18.1 0.0 1 1 3.4e-07 3.6e-05 17.0 0.0 1 125 32 167 32 171 0.73 # 3339 # 4313 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_34 - 325 HTH_37 PF13744.1 80 0.00095 12.0 2.6 1 1 3e-05 0.0032 10.3 0.2 27 53 156 182 134 185 0.87 # 27086 # 28060 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_18 - 254 Rrf2 PF02082.15 83 2e-06 20.9 0.3 1 1 4.9e-08 5.2e-06 19.6 0.2 17 60 11 54 9 70 0.84 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_18 - 254 HTH_27 PF13463.1 68 7.7e-05 16.0 0.1 1 1 1.5e-06 0.00016 15.0 0.1 5 49 7 50 5 70 0.88 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 5_2 - 283 rve_2 PF13333.1 52 1.9e-09 30.6 0.2 1 1 3.2e-11 3.4e-09 29.7 0.2 1 40 208 247 208 254 0.93 # 145 # 993 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 3_8 - 190 MRP-L20 PF12824.2 164 3.4e-06 20.1 0.0 1 1 4.5e-08 4.8e-06 19.6 0.0 70 123 133 184 116 189 0.78 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_25 - 152 MerR_1 PF13411.1 69 3.7e-20 64.5 0.0 1 1 1.9e-21 6.7e-20 63.7 0.0 2 67 9 75 8 77 0.96 # 19788 # 20243 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_20 - 122 MerR_1 PF13411.1 69 5.5e-13 41.6 0.0 1 1 2.2e-14 8e-13 41.1 0.0 1 68 4 72 4 73 0.97 # 16500 # 16865 # -1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 3_8 - 190 MerR_1 PF13411.1 69 0.00016 14.5 0.4 1 2 0.022 0.77 2.7 0.0 45 66 78 99 76 102 0.82 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 3_8 - 190 MerR_1 PF13411.1 69 0.00016 14.5 0.4 2 2 0.00019 0.007 9.2 0.1 1 23 166 188 166 189 0.94 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 5_4 - 181 cobW PF02492.14 178 0.0008 11.9 0.0 1 1 1.3e-05 0.0014 11.1 0.0 2 21 2 21 1 29 0.81 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_8 - 325 AAA_16 PF13191.1 185 0.0004 13.4 0.0 1 1 7.1e-06 0.00076 12.5 0.0 18 64 21 69 10 125 0.78 # 3339 # 4313 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 5_4 - 181 AAA_22 PF13401.1 131 1.7e-05 18.0 0.0 1 1 4.7e-07 5e-05 16.5 0.0 6 50 2 50 1 105 0.72 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_18 - 254 DUF977 PF06163.6 127 0.00019 14.2 0.3 1 1 4.9e-06 0.00053 12.8 0.3 15 57 8 50 4 65 0.87 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_17 - 187 NUMOD1 PF07453.8 37 0.00059 12.7 0.0 1 1 1.1e-05 0.0011 11.8 0.0 19 37 164 182 164 182 0.94 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_45 - 237 AAA_29 PF13555.1 62 5.8e-08 25.2 0.0 1 1 9.2e-10 9.8e-08 24.5 0.0 2 49 5 50 4 57 0.82 # 36660 # 37370 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_21 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 1e-19 63.8 5.4 1 2 1.2e-06 0.00013 15.4 1.5 2 31 101 130 100 132 0.95 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 1e-19 63.8 5.4 2 2 3.2e-17 3.4e-15 49.3 0.1 1 72 272 342 272 351 0.91 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_17 - 187 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 3e-05 16.7 0.0 1 1 1.9e-06 6.8e-05 15.6 0.0 10 42 157 185 151 186 0.86 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 7_2 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 9.9e-05 15.0 0.0 1 1 5.8e-06 0.00021 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_8 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.0001 15.0 0.0 1 1 5.8e-06 0.00021 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 5_4 - 181 AAA_28 PF13521.1 163 0.00017 14.6 0.0 1 1 4.7e-06 0.0005 13.0 0.0 2 29 3 33 2 58 0.77 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_21 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 4.6e-09 28.1 5.0 1 2 4.3e-07 4.6e-05 15.0 2.8 2 33 100 131 99 139 0.91 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 4.6e-09 28.1 5.0 2 2 1.7e-06 0.00018 13.0 0.0 83 163 286 362 281 379 0.85 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 8_1 - 211 HTH_32 PF13565.1 77 1.1e-06 22.4 0.2 1 1 1.4e-07 5e-06 20.3 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 64 # 696 # 1 # ID=8_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_8 - 190 HTH_32 PF13565.1 77 1.2e-06 22.3 0.5 1 1 3.1e-07 1.1e-05 19.2 0.2 7 76 127 185 121 186 0.71 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_17 - 187 HTH_32 PF13565.1 77 0.0012 12.6 6.7 1 1 7.9e-05 0.0028 11.5 3.5 7 77 124 182 119 182 0.68 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 2_18 - 254 GntR PF00392.16 64 3.7e-07 22.6 0.5 1 1 8.1e-09 8.7e-07 21.4 0.5 26 59 21 54 9 59 0.92 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_17 - 187 HTH_3 PF01381.17 55 0.00028 13.8 0.7 1 1 1.1e-05 0.0012 11.7 0.4 2 31 152 183 151 184 0.86 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_6 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 3.4e-27 87.6 3.5 1 2 0.0052 0.55 1.2 0.0 11 42 5 36 3 62 0.72 # 3896 # 5158 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 1_6 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 3.4e-27 87.6 3.5 2 2 1.5e-28 1.6e-26 85.4 2.2 137 438 122 418 41 420 0.82 # 3896 # 5158 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 8_1 - 211 HTH_23 PF13384.1 50 6.4e-06 18.8 1.1 1 1 1.8e-05 0.00017 14.2 0.1 28 42 41 55 40 63 0.87 # 64 # 696 # 1 # ID=8_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_8 - 190 HTH_23 PF13384.1 50 1.4e-05 17.7 0.0 1 1 4.5e-06 4.4e-05 16.1 0.0 12 37 160 185 151 188 0.84 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_17 - 187 HTH_23 PF13384.1 50 2.1e-05 17.2 1.3 1 1 3.2e-06 3.1e-05 16.6 0.1 10 39 151 183 148 184 0.82 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 2_18 - 254 HTH_23 PF13384.1 50 2.6e-05 16.8 0.1 1 1 6.9e-06 6.7e-05 15.5 0.1 4 45 4 47 1 50 0.86 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_8 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 4.7e-05 16.0 0.3 1 1 4.9e-06 4.7e-05 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_2 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 4.7e-05 16.0 0.3 1 1 4.9e-06 4.7e-05 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_46 - 92 HTH_23 PF13384.1 50 6.3e-05 15.6 0.0 1 1 1e-05 0.0001 15.0 0.0 7 40 53 86 51 90 0.92 # 37404 # 37679 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 2_11 - 135 HTH_23 PF13384.1 50 0.00029 13.5 0.0 1 1 4.7e-05 0.00046 12.9 0.0 7 44 19 57 14 62 0.85 # 5722 # 6126 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 5_3 - 104 HTH_23 PF13384.1 50 0.00039 13.1 0.0 1 1 5.3e-05 0.00052 12.7 0.0 7 48 14 55 8 57 0.82 # 990 # 1301 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_34 - 325 HTH_23 PF13384.1 50 0.00041 13.0 0.1 1 1 0.00027 0.0027 10.5 0.0 9 40 152 183 151 188 0.88 # 27086 # 28060 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_8 - 325 HTH_23 PF13384.1 50 0.00084 12.1 0.0 1 1 0.00022 0.0022 10.7 0.0 16 40 296 321 288 323 0.86 # 3339 # 4313 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 3_8 - 190 HTH_7 PF02796.10 45 1.2e-17 56.6 0.1 1 1 2.2e-18 5.8e-17 54.4 0.1 1 44 144 188 144 189 0.98 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_17 - 187 HTH_7 PF02796.10 45 1.1e-16 53.5 0.3 1 1 9.5e-18 2.5e-16 52.3 0.3 1 44 141 184 141 185 0.98 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 7_2 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 2e-13 43.1 0.5 1 1 2.1e-14 5.5e-13 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_8 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 2.5e-13 42.7 1.1 1 1 2.1e-14 5.5e-13 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_10 - 180 Ribosomal_S27e PF01667.12 55 0.0002 13.9 1.1 1 1 3.5e-06 0.00037 13.1 1.1 5 33 71 99 68 104 0.90 # 7532 # 8071 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_10 - 180 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.00011 14.9 0.2 1 2 0.0003 0.016 8.0 0.1 2 14 73 85 73 87 0.84 # 7532 # 8071 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_10 - 180 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.00011 14.9 0.2 2 2 0.0034 0.18 4.6 0.0 5 15 95 105 94 114 0.81 # 7532 # 8071 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_46 - 92 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.0023 10.7 5.3 1 1 0.00014 0.0074 9.1 5.3 5 35 8 39 5 40 0.83 # 37404 # 37679 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 4_3 - 129 Ribosomal_S20p PF01649.13 84 0.0003 14.2 0.1 1 1 4.9e-06 0.00053 13.4 0.1 6 47 56 97 53 115 0.77 # 951 # 1337 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 2_8 - 325 Mg_chelatase PF01078.16 207 1e-08 27.6 0.0 1 2 0.00012 0.013 7.6 0.0 25 45 32 52 26 60 0.89 # 3339 # 4313 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 2_8 - 325 Mg_chelatase PF01078.16 207 1e-08 27.6 0.0 2 2 1e-07 1.1e-05 17.7 0.0 92 157 86 149 79 158 0.89 # 3339 # 4313 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_8 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00011 15.3 0.6 1 2 0.074 2.6 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_8 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00011 15.3 0.6 2 2 3.1e-05 0.0011 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_2 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00011 15.3 0.6 1 2 0.074 2.6 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_2 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00011 15.3 0.6 2 2 3.1e-05 0.0011 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 3_8 - 190 HTH_29 PF13551.1 112 0.00054 13.1 3.1 1 2 0.0033 0.12 5.6 0.3 37 71 129 162 122 166 0.75 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 3_8 - 190 HTH_29 PF13551.1 112 0.00054 13.1 3.1 2 2 0.00042 0.015 8.5 0.0 6 32 159 185 154 188 0.80 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_21 - 562 GIDA PF01134.17 392 2.8e-06 19.4 5.3 1 2 5.2e-08 2.8e-06 19.4 5.3 1 53 100 154 100 290 0.87 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 GIDA PF01134.17 392 2.8e-06 19.4 5.3 2 2 0.02 1.1 1.0 0.3 349 385 390 426 376 430 0.79 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_17 - 301 GIDA PF01134.17 392 0.0054 8.6 3.4 1 1 0.00014 0.0075 8.1 3.4 2 72 7 78 6 90 0.89 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 3_9 - 490 MutS_I PF01624.15 113 0.00018 14.6 0.0 1 1 5.5e-06 0.00059 12.9 0.0 54 94 262 302 244 315 0.83 # 8891 # 10360 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 1_21 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.00089 12.6 1.0 1 2 0.08 8.6 -0.3 0.1 1 29 101 129 101 163 0.86 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.00089 12.6 1.0 2 2 6.9e-05 0.0074 9.6 0.1 1 66 273 351 273 371 0.64 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 NAD_binding_8 PF13450.1 68 7.4e-05 15.8 1.2 1 1 6.9e-07 7.4e-05 15.8 1.2 1 35 103 136 103 155 0.91 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_13 - 513 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.8e-101 331.8 0.0 1 1 3.5e-103 1.8e-101 331.8 0.0 1 271 175 462 175 462 0.98 # 6519 # 8057 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.591 8_1 - 211 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 1.9e-12 39.9 0.3 1 1 4.3e-14 2.3e-12 39.6 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 64 # 696 # 1 # ID=8_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_2 - 202 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0009 11.9 0.0 1 1 1.2e-05 0.0012 11.5 0.0 10 49 7 48 5 75 0.71 # 111 # 716 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.561 2_8 - 325 AAA_5 PF07728.9 139 2.7e-09 29.9 0.0 1 1 3.8e-11 4.1e-09 29.3 0.0 1 123 31 150 31 169 0.81 # 3339 # 4313 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_21 - 562 Trp_halogenase PF04820.9 454 0.0048 8.5 3.3 1 1 8.1e-05 0.0087 7.6 3.3 1 47 100 143 100 151 0.76 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_35 - 402 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00091 11.3 0.0 1 2 0.0091 0.97 1.3 0.0 4 28 111 135 108 169 0.76 # 28060 # 29265 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_35 - 402 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00091 11.3 0.0 2 2 0.00016 0.017 7.1 0.0 102 138 235 271 226 288 0.87 # 28060 # 29265 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 5_4 - 181 AAA_18 PF13238.1 129 2.1e-09 30.8 0.0 1 1 3.9e-11 4.2e-09 29.8 0.0 1 126 3 134 3 137 0.76 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_45 - 237 TIGR00611 TIGR00611 365 2.2e-08 26.2 0.0 1 1 3e-10 3.2e-08 25.7 0.0 3 56 4 57 2 81 0.92 # 36660 # 37370 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_33 - 424 IMS_HHH PF11798.3 32 2.7e-08 26.6 0.1 1 1 6.4e-10 6.8e-08 25.3 0.1 2 32 170 200 169 200 0.91 # 25733 # 27004 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_17 - 187 HTH_psq PF05225.11 45 0.00013 14.6 0.0 1 1 2.5e-06 0.00027 13.5 0.0 21 39 166 184 165 186 0.91 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_46 - 92 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 6.5e-31 98.6 0.2 1 1 1e-32 1.1e-30 97.9 0.2 1 46 43 88 43 88 0.99 # 37404 # 37679 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 5_3 - 104 HTH_28 PF13518.1 52 9.7e-08 25.0 0.0 1 1 1.4e-08 1.6e-07 24.2 0.0 1 41 13 53 13 58 0.93 # 990 # 1301 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 2_11 - 135 HTH_28 PF13518.1 52 3.5e-06 20.0 0.0 1 1 4.6e-07 5.5e-06 19.4 0.0 1 39 18 57 18 63 0.91 # 5722 # 6126 # 1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 2_18 - 254 HTH_28 PF13518.1 52 4.3e-05 16.5 0.0 1 1 8.5e-06 0.0001 15.3 0.0 4 41 9 48 6 53 0.89 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_17 - 187 HTH_28 PF13518.1 52 5.2e-05 16.3 0.1 1 1 4.3e-06 5.2e-05 16.3 0.1 9 34 158 183 147 184 0.84 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 8_1 - 211 HTH_28 PF13518.1 52 5.5e-05 16.2 1.3 1 1 2e-05 0.00023 14.2 1.3 22 36 40 54 12 55 0.76 # 64 # 696 # 1 # ID=8_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_8 - 190 HTH_28 PF13518.1 52 6e-05 16.1 0.0 1 1 2.2e-05 0.00026 14.0 0.0 13 32 166 185 159 188 0.87 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_46 - 92 HTH_28 PF13518.1 52 9.3e-05 15.4 0.0 1 1 1.3e-05 0.00015 14.8 0.0 4 34 55 85 53 89 0.91 # 37404 # 37679 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 7_2 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.00014 14.9 0.0 1 1 3.8e-05 0.00045 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_8 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.00014 14.8 0.0 1 1 3.8e-05 0.00045 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_25 - 152 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 3.6e-21 68.4 1.4 1 1 1.2e-22 6.5e-21 67.6 1.1 1 65 51 113 51 113 0.95 # 19788 # 20243 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_20 - 122 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.0002 14.8 6.6 1 1 6.7e-06 0.00036 14.0 6.6 1 64 47 108 47 109 0.80 # 16500 # 16865 # -1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 2_18 - 254 HTH_24 PF13412.1 48 3.8e-07 22.5 0.4 1 1 2.8e-08 1e-06 21.1 0.2 5 47 7 49 5 50 0.95 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 3_8 - 190 HTH_24 PF13412.1 48 2.3e-05 16.7 0.0 1 1 5.9e-06 0.00021 13.7 0.0 9 38 157 186 157 188 0.92 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_34 - 325 HTH_24 PF13412.1 48 6.5e-05 15.3 1.1 1 1 3.4e-06 0.00012 14.5 0.1 15 39 158 182 151 184 0.84 # 27086 # 28060 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_8 - 325 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 7.9e-25 80.5 0.0 1 1 2.6e-26 2.8e-24 78.8 0.0 1 138 9 179 9 179 0.90 # 3339 # 4313 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_17 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 1.4e-05 17.6 0.2 1 2 0.055 5.9 -0.3 0.1 3 18 124 139 123 154 0.71 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_17 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 1.4e-05 17.6 0.2 2 2 8.6e-07 9.2e-05 15.0 0.0 27 45 165 183 162 185 0.93 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 1_21 - 562 TIGR01292 TIGR01292 300 1.4e-19 62.7 3.5 1 2 4.9e-06 0.00053 11.5 1.2 2 39 100 137 99 143 0.91 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 TIGR01292 TIGR01292 300 1.4e-19 62.7 3.5 2 2 3.9e-18 4.2e-16 51.2 0.0 143 296 272 425 214 427 0.82 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_17 - 301 NAD_binding_2 PF03446.10 163 4.7e-41 133.3 3.7 1 1 6.4e-43 6.9e-41 132.8 3.7 2 162 5 166 4 167 0.96 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 2_2 - 202 T2SE PF00437.15 272 0.00067 11.6 0.0 1 1 8.8e-06 0.00094 11.1 0.0 113 152 4 43 1 52 0.90 # 111 # 716 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.561 5_4 - 181 NACHT PF05729.7 166 8.8e-05 15.2 0.1 1 1 2.1e-06 0.00022 13.9 0.0 2 21 2 21 1 29 0.91 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 5_4 - 181 AAA_17 PF13207.1 121 2.5e-06 21.3 0.0 1 1 4.8e-08 5.1e-06 20.3 0.0 1 32 2 34 2 175 0.59 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_13 - 513 DZR PF12773.2 50 0.00013 14.8 0.7 1 1 2.3e-06 0.00024 13.9 0.7 10 41 115 166 110 170 0.88 # 6519 # 8057 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.591 1_21 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1e-06 20.8 5.3 1 3 9.5e-09 1e-06 20.8 5.3 2 32 101 131 100 138 0.91 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1e-06 20.8 5.3 2 3 0.034 3.6 -0.8 0.2 142 204 311 366 286 382 0.67 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1e-06 20.8 5.3 3 3 0.0019 0.2 3.4 0.1 373 402 374 405 368 419 0.86 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_45 - 237 AAA_15 PF13175.1 415 5.8e-09 28.4 0.0 1 1 7.2e-11 7.8e-09 28.0 0.0 2 46 5 48 4 67 0.90 # 36660 # 37370 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_15 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 1.2e-24 79.3 0.2 1 1 2.3e-26 2.5e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 11246 # 12250 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 5_3 - 104 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 9.3e-05 14.6 0.0 1 1 1.8e-06 0.00019 13.6 0.0 7 44 4 42 4 45 0.93 # 990 # 1301 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_25 - 152 MerR PF00376.18 38 1.1e-14 46.8 0.1 1 1 5.9e-16 2.1e-14 45.9 0.1 1 38 9 46 9 46 0.99 # 19788 # 20243 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_20 - 122 MerR PF00376.18 38 3.9e-07 22.6 0.1 1 1 1.7e-08 6e-07 22.0 0.1 2 38 6 42 5 42 0.89 # 16500 # 16865 # -1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 2_18 - 254 MerR PF00376.18 38 0.00085 11.9 0.3 1 1 0.00019 0.0067 9.1 0.1 1 18 21 38 21 53 0.80 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 5_4 - 181 AAA_33 PF13671.1 143 3.3e-10 33.0 0.0 1 1 4.3e-12 4.6e-10 32.6 0.0 2 127 3 130 2 151 0.73 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_17 - 187 CENP-B_N PF04218.8 53 3e-06 19.6 0.0 1 1 5.4e-08 5.7e-06 18.7 0.0 17 43 156 182 152 186 0.92 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 2_18 - 254 PaaX PF07848.7 70 3.2e-06 20.1 0.2 1 1 5.5e-08 5.9e-06 19.3 0.2 15 68 14 64 10 66 0.85 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_8 - 325 AAA_2 PF07724.9 171 6.5e-06 19.1 0.0 1 1 1.2e-07 1.3e-05 18.1 0.0 6 131 32 152 30 178 0.85 # 3339 # 4313 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 5_4 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 1.4e-05 17.8 0.0 1 2 1e-05 0.0011 11.6 0.0 4 24 2 22 1 30 0.89 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 5_4 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 1.4e-05 17.8 0.0 2 2 0.0021 0.22 4.1 0.1 34 72 107 147 91 157 0.86 # 1393 # 1935 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_21 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 9.1e-07 21.6 2.3 1 2 7.8e-06 0.00042 12.9 0.3 16 50 94 128 80 131 0.87 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 9.1e-07 21.6 2.3 2 2 0.00023 0.012 8.1 0.1 19 60 269 310 260 341 0.84 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_17 - 301 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.00014 14.5 1.6 1 2 8.4e-06 0.00045 12.8 0.1 21 66 5 50 2 62 0.90 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 2_17 - 301 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.00014 14.5 1.6 2 2 0.056 3 0.4 0.2 13 42 84 113 72 117 0.84 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 3_3 - 478 DNA_methylase PF00145.12 335 2.4e-79 259.8 0.0 1 1 4.4e-81 4.8e-79 258.8 0.0 1 331 96 457 96 460 0.86 # 1194 # 2627 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.481 1_47 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.2e-72 235.1 2.5 1 1 2.5e-74 1.3e-72 235.0 2.5 7 131 1 125 1 125 1.00 # 37724 # 38101 # 1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 4_5 - 60 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.5e-22 71.9 1.2 1 2 4.2e-19 2.2e-17 56.4 0.0 35 79 1 45 1 45 0.98 # 1548 # 1727 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 4_5 - 60 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.5e-22 71.9 1.2 2 2 1.1e-07 6.1e-06 19.4 0.3 115 131 43 59 41 59 0.95 # 1548 # 1727 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 2_17 - 301 3HCDH_N PF02737.13 180 2.7e-07 23.4 0.7 1 1 2.1e-08 1.1e-06 21.3 0.7 1 40 6 45 6 116 0.91 # 12675 # 13577 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 1_21 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.017 7.7 6.6 1 2 0.017 0.92 2.1 2.8 1 30 100 129 100 133 0.93 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.017 7.7 6.6 2 2 0.0006 0.032 6.9 0.1 2 36 273 307 272 359 0.75 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_10 - 180 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 5.3e-05 15.8 0.1 1 2 0.00019 0.01 8.5 0.0 2 14 73 85 72 87 0.84 # 7532 # 8071 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_10 - 180 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 5.3e-05 15.8 0.1 2 2 0.0026 0.14 4.8 0.0 5 15 95 105 94 115 0.81 # 7532 # 8071 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_46 - 92 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0029 10.2 6.1 1 1 0.00021 0.011 8.4 6.1 5 36 8 40 5 41 0.83 # 37404 # 37679 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_21 - 562 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 0.00016 14.4 0.5 1 1 2.7e-06 0.00029 13.6 0.1 13 39 277 303 274 335 0.84 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 8_1 - 211 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.8e-52 169.4 0.0 1 1 2.9e-53 3.9e-52 169.0 0.0 4 138 75 211 73 211 0.99 # 64 # 696 # 1 # ID=8_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 5_2 - 283 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.2e-12 41.0 0.1 1 1 1.2e-13 1.6e-12 40.6 0.1 2 139 109 247 108 248 0.92 # 145 # 993 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 10_2 - 66 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 4.8e-11 35.8 0.0 1 1 4.1e-12 5.5e-11 35.6 0.0 97 139 1 43 1 44 0.98 # 239 # 436 # -1 # ID=10_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 4_1 - 66 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 4.8e-11 35.8 0.0 1 1 4.1e-12 5.5e-11 35.6 0.0 97 139 1 43 1 44 0.98 # 2 # 199 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 4_9 - 66 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 4.8e-11 35.8 0.0 1 1 4.1e-12 5.5e-11 35.6 0.0 97 139 1 43 1 44 0.98 # 6325 # 6522 # -1 # ID=4_9;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 5_1 - 66 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 4.8e-11 35.8 0.0 1 1 4.1e-12 5.5e-11 35.6 0.0 97 139 1 43 1 44 0.98 # 2 # 199 # 1 # ID=5_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 6_4 - 66 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 4.8e-11 35.8 0.0 1 1 4.1e-12 5.5e-11 35.6 0.0 97 139 1 43 1 44 0.98 # 1786 # 1983 # -1 # ID=6_4;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 7_1 - 66 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 4.8e-11 35.8 0.0 1 1 4.1e-12 5.5e-11 35.6 0.0 97 139 1 43 1 44 0.98 # 2 # 199 # 1 # ID=7_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_45 - 237 TIGR00634 TIGR00634 563 9.1e-05 14.2 0.0 1 1 1.3e-06 0.00014 13.6 0.0 1 46 3 48 3 74 0.93 # 36660 # 37370 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 3_8 - 190 HTH_17 PF12728.2 51 0.00025 14.3 0.1 1 1 4.8e-06 0.00052 13.3 0.1 2 22 166 186 165 188 0.93 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 180 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0038 10.2 4.7 1 1 8.4e-05 0.009 9.0 4.7 7 35 75 101 74 105 0.90 # 7532 # 8071 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_46 - 92 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 0.00018 14.3 4.8 1 1 3e-06 0.00032 13.5 4.8 19 46 6 38 3 38 0.79 # 37404 # 37679 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 2_18 - 254 HTH_11 PF08279.7 55 1e-12 40.6 0.3 1 1 5e-14 1.8e-12 39.8 0.3 1 53 6 55 6 57 0.89 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 3_8 - 190 HTH_11 PF08279.7 55 1.6e-06 20.7 0.1 1 1 1.4e-07 5e-06 19.2 0.0 6 35 157 185 154 187 0.84 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_17 - 187 HTH_11 PF08279.7 55 0.00016 14.4 0.2 1 1 3.8e-05 0.0013 11.4 0.0 20 37 166 183 162 184 0.91 # 15298 # 15858 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 2_18 - 254 MarR_2 PF12802.2 62 1.6e-07 23.9 2.4 1 2 3.5e-09 3.8e-07 22.8 0.7 8 54 8 52 5 65 0.92 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_18 - 254 MarR_2 PF12802.2 62 1.6e-07 23.9 2.4 2 2 0.087 9.3 -0.9 0.0 26 44 227 245 219 248 0.73 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_18 - 254 HTH_5 PF01022.15 47 2.2e-05 17.1 0.4 1 1 9.3e-07 0.0001 15.0 0.2 7 45 10 49 8 51 0.90 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_18 - 254 TrmB PF01978.14 68 2.5e-05 17.0 0.2 1 1 1.9e-06 5e-05 16.0 0.2 15 54 11 51 10 62 0.90 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 3_8 - 190 TrmB PF01978.14 68 4.4e-05 16.2 0.0 1 1 3.3e-06 8.9e-05 15.2 0.0 6 42 149 185 146 188 0.92 # 7565 # 8134 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_8 - 186 TrmB PF01978.14 68 5.9e-05 15.8 0.0 1 1 4.5e-06 0.00012 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_2 - 186 TrmB PF01978.14 68 6.1e-05 15.7 0.0 1 1 4.5e-06 0.00012 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_21 - 562 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 7.5e-43 139.7 0.0 1 1 1.6e-44 1.7e-42 138.6 0.0 1 199 100 407 100 409 0.96 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_45 - 237 DUF2813 PF11398.3 373 6.7e-05 15.0 0.3 1 2 2e-06 0.00021 13.4 0.0 11 49 12 51 3 56 0.79 # 36660 # 37370 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_45 - 237 DUF2813 PF11398.3 373 6.7e-05 15.0 0.3 2 2 0.041 4.4 -0.8 0.1 94 148 126 180 118 226 0.52 # 36660 # 37370 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 2_18 - 254 HTH_Mga PF08280.6 59 0.00015 14.6 0.0 1 1 3.1e-06 0.00033 13.4 0.0 4 44 4 44 3 50 0.94 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_21 - 562 DAO PF01266.19 358 7.1e-12 37.8 7.5 1 2 1.9e-08 2e-06 19.9 1.5 2 35 101 134 100 161 0.85 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_21 - 562 DAO PF01266.19 358 7.1e-12 37.8 7.5 2 2 7.7e-09 8.2e-07 21.1 0.5 151 239 314 400 274 529 0.80 # 16883 # 18568 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 5_3 - 104 Phage_terminase PF10668.4 60 0.00035 13.4 0.0 1 1 4.9e-06 0.00052 12.8 0.0 11 44 14 47 1 49 0.77 # 990 # 1301 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 2_18 - 254 DUF1670 PF07900.6 220 0.00011 14.4 0.1 1 1 1.5e-06 0.00016 13.9 0.1 101 203 15 117 7 124 0.79 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_18 - 254 HTH_20 PF12840.2 61 6.2e-07 22.2 1.5 1 1 4.1e-08 1.4e-06 21.0 0.1 14 57 9 52 7 55 0.93 # 13839 # 14600 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_8 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 2.1e-06 20.5 0.2 1 2 0.011 0.4 3.6 0.0 33 52 8 27 4 28 0.91 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_8 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 2.1e-06 20.5 0.2 2 2 2.7e-05 0.00097 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 5722 # 6279 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_2 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 4.6e-06 19.4 0.1 1 2 0.024 0.86 2.5 0.0 33 52 8 27 6 28 0.90 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_2 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 4.6e-06 19.4 0.1 2 2 2.7e-05 0.00097 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 505 # 1062 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_7 - 223 AAA_13 PF13166.1 712 0.0028 9.1 20.8 1 2 8.6e-07 9.2e-05 14.0 12.3 333 457 6 132 3 140 0.91 # 2500 # 3168 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 2_7 - 223 AAA_13 PF13166.1 712 0.0028 9.1 20.8 2 2 0.012 1.3 0.3 1.2 366 397 169 201 149 222 0.35 # 2500 # 3168 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_35 - 402 AAA_31 PF13614.1 157 0.0001 15.3 0.0 1 1 5.5e-06 0.00058 12.8 0.0 108 147 235 273 230 279 0.86 # 28060 # 29265 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_13 - 272 Pterin_bind PF00809.17 210 3e-60 196.1 0.0 1 1 3.4e-62 3.6e-60 195.9 0.0 1 209 10 216 10 217 0.98 # 9743 # 10558 # -1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.609 1_10 - 180 NOB1_Zn_bind PF08772.6 73 0.00044 13.1 0.4 1 1 7.8e-06 0.00083 12.2 0.4 10 36 74 104 71 125 0.75 # 7532 # 8071 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_33 - 424 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 5.6e-05 15.7 0.1 1 1 4.5e-06 0.00048 12.7 0.0 5 29 182 206 178 217 0.87 # 25733 # 27004 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 5_2 - 283 HTH_21 PF13276.1 60 4.5e-11 35.7 0.2 1 1 1.2e-12 1.3e-10 34.2 0.2 4 59 36 89 34 90 0.93 # 145 # 993 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/20695ec8-818c-499a-920e-bfd874f75bc7 # Target file: checkm_output/bins/pm521/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm521/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/20695ec8-818c-499a-920e-bfd874f75bc7 checkm_output/bins/pm521/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:08:03 2017 # [ok]