# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_28 - 91 HTH_IclR PF09339.5 52 3.2e-06 19.8 0.0 1 1 1.6e-07 5.9e-06 18.9 0.0 4 43 9 47 8 49 0.92 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 2_11 - 214 HTH_IclR PF09339.5 52 9.1e-05 15.1 0.1 1 1 1.2e-05 0.00044 12.9 0.0 16 39 185 208 182 210 0.88 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_59 - 98 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00093 11.9 0.0 1 1 6.2e-05 0.0023 10.6 0.0 25 49 38 62 28 64 0.95 # 38661 # 38954 # -1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_11 - 214 HTH_22 PF13309.1 64 9.4e-05 15.2 0.3 1 1 2.6e-06 0.0003 13.7 0.1 44 63 189 208 187 209 0.91 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_92 - 91 HTH_35 PF13693.1 78 1.6e-16 53.0 0.2 1 1 1.8e-18 2e-16 52.7 0.2 7 71 20 83 15 89 0.89 # 59664 # 59936 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_47 - 488 DUF815 PF05673.8 250 1.8e-06 20.1 0.0 1 1 1e-07 5.6e-06 18.5 0.0 19 154 208 353 194 365 0.75 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_65 - 252 DUF815 PF05673.8 250 3.9e-05 15.7 0.1 1 1 1.6e-06 8.9e-05 14.5 0.1 42 84 85 130 49 187 0.68 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 2_11 - 214 DUF134 PF02001.11 106 0.00084 12.3 0.0 1 2 0.082 9.1 -0.6 0.0 39 63 134 160 120 166 0.71 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 2_11 - 214 DUF134 PF02001.11 106 0.00084 12.3 0.0 2 2 5e-05 0.0055 9.7 0.0 45 83 175 213 160 213 0.83 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_27 - 212 N6_Mtase PF02384.11 311 4.1e-07 22.3 0.0 1 1 5.9e-09 6.7e-07 21.7 0.0 3 97 71 166 69 201 0.72 # 19405 # 20040 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_8 - 622 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 9.6e-08 24.8 0.0 1 2 2.6e-08 1.4e-06 20.9 0.0 36 81 168 211 136 234 0.79 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_8 - 622 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 9.6e-08 24.8 0.0 2 2 0.028 1.6 1.2 0.0 176 204 481 509 472 510 0.86 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_15 - 206 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00081 11.9 0.2 1 1 4.7e-05 0.0026 10.3 0.0 34 53 4 23 1 28 0.83 # 13004 # 13621 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_92 - 91 HTH_38 PF13936.1 44 6.3e-05 15.6 0.0 1 2 0.00016 0.0036 10.0 0.1 9 39 16 47 14 49 0.87 # 59664 # 59936 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_92 - 91 HTH_38 PF13936.1 44 6.3e-05 15.6 0.0 2 2 0.016 0.35 3.6 0.0 25 35 59 69 53 72 0.92 # 59664 # 59936 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 2_11 - 214 HTH_38 PF13936.1 44 0.00021 13.9 0.1 1 1 3e-05 0.00068 12.3 0.0 2 44 168 211 167 211 0.92 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_37 - 313 HTH_38 PF13936.1 44 0.00024 13.7 0.0 1 1 2.9e-05 0.00065 12.4 0.0 5 33 133 162 130 164 0.89 # 25593 # 26531 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_64 - 521 HTH_38 PF13936.1 44 0.0003 13.4 0.7 1 1 6.3e-05 0.0014 11.3 0.2 12 43 13 45 9 46 0.91 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_29 - 394 HTH_38 PF13936.1 44 0.00043 12.9 0.0 1 1 3.6e-05 0.00082 12.0 0.0 5 33 120 149 116 157 0.83 # 20414 # 21595 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 1_8 - 622 MobB PF03205.9 140 0.0006 12.6 0.0 1 1 1.7e-05 0.002 10.9 0.0 4 34 176 206 175 214 0.90 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_97 - 504 UvrD-helicase PF00580.16 315 6.1e-17 54.9 3.9 1 2 2.9e-06 0.00032 13.1 0.1 2 38 8 44 7 64 0.81 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 UvrD-helicase PF00580.16 315 6.1e-17 54.9 3.9 2 2 3.4e-15 3.8e-13 42.4 0.3 236 305 161 239 46 246 0.72 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_58 - 101 MarR PF01047.17 59 5.7e-05 15.9 0.0 1 1 9.5e-07 0.00011 15.0 0.0 9 37 33 61 32 63 0.93 # 38332 # 38634 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_64 - 521 HTH_Tnp_4 PF13613.1 53 3.1e-05 16.6 0.6 1 2 0.00041 0.023 7.4 0.1 20 42 23 45 17 49 0.85 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_64 - 521 HTH_Tnp_4 PF13613.1 53 3.1e-05 16.6 0.6 2 2 0.00066 0.037 6.7 0.0 18 30 235 247 235 249 0.93 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_11 - 214 HTH_Tnp_4 PF13613.1 53 7.8e-05 15.3 0.1 1 1 7.6e-06 0.00043 12.9 0.0 23 40 191 208 189 210 0.91 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_99 - 347 DUF3584 PF12128.3 1201 0.019 5.3 51.1 1 2 0.0051 0.57 0.4 32.3 377 534 86 242 42 246 0.65 # 69063 # 70103 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_99 - 347 DUF3584 PF12128.3 1201 0.019 5.3 51.1 2 2 2e-05 0.0022 8.3 20.6 613 709 225 327 220 345 0.80 # 69063 # 70103 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_8 - 622 DUF853 PF05872.7 504 9.6e-07 20.5 0.0 1 1 1.4e-08 1.5e-06 19.8 0.0 7 60 158 211 153 225 0.93 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_97 - 504 AAA_19 PF13245.1 76 1.8e-09 30.4 0.0 1 1 8.4e-11 4.7e-09 29.0 0.0 8 75 18 77 12 78 0.88 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_65 - 252 AAA_19 PF13245.1 76 0.00014 14.7 0.0 1 1 6.2e-06 0.00035 13.4 0.0 9 37 99 126 93 142 0.78 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_30 - 262 CbiA PF01656.18 195 1.3e-30 99.3 0.0 1 1 1.5e-32 1.7e-30 98.9 0.0 1 170 5 205 5 229 0.77 # 21599 # 22384 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_79 - 372 tRNA_Me_trans PF03054.11 356 4.2e-05 15.2 0.0 1 2 1.1e-06 0.00013 13.6 0.0 2 71 52 122 51 144 0.74 # 51170 # 52285 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_79 - 372 tRNA_Me_trans PF03054.11 356 4.2e-05 15.2 0.0 2 2 0.042 4.7 -1.4 0.0 193 224 274 305 236 311 0.83 # 51170 # 52285 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_64 - 521 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.3e-06 20.9 0.6 1 1 7.3e-08 2.7e-06 19.9 0.6 15 50 11 46 9 48 0.95 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_11 - 214 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 6e-05 15.6 0.0 1 1 4.7e-06 0.00018 14.1 0.0 14 50 175 211 170 213 0.88 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_29 - 394 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 7e-05 15.4 0.0 1 2 0.082 3.1 0.5 0.0 22 38 115 131 103 131 0.76 # 20414 # 21595 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 1_29 - 394 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 7e-05 15.4 0.0 2 2 5.3e-06 0.0002 13.9 0.0 17 48 127 158 122 161 0.91 # 20414 # 21595 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 1_83 - 355 Rep_3 PF01051.16 222 1.3e-07 24.5 0.0 1 1 2.8e-09 3.1e-07 23.2 0.0 43 221 127 310 101 311 0.83 # 53775 # 54839 # -1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_64 - 521 rve PF00665.21 120 9.6e-17 54.3 0.0 1 1 3.9e-18 2.2e-16 53.2 0.0 3 120 143 275 141 275 0.95 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_1 - 235 rve PF00665.21 120 3.7e-13 42.7 0.1 1 2 0.03 1.7 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 65 # 769 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_1 - 235 rve PF00665.21 120 3.7e-13 42.7 0.1 2 2 1.2e-13 6.8e-12 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 65 # 769 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_58 - 101 Fe_dep_repress PF01325.14 60 0.00015 14.8 0.1 1 1 3e-06 0.00033 13.7 0.1 23 42 42 61 23 63 0.84 # 38332 # 38634 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 2_5 - 290 TIGR00573 TIGR00573 217 2.5e-16 52.5 0.0 1 1 3.6e-18 4e-16 51.9 0.0 10 180 107 275 101 288 0.76 # 2098 # 2967 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_33 - 415 Methyltransf_26 PF13659.1 117 6.8e-05 16.0 0.0 1 2 6.1e-06 0.00069 12.8 0.0 68 116 126 180 47 181 0.83 # 23314 # 24558 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_33 - 415 Methyltransf_26 PF13659.1 117 6.8e-05 16.0 0.0 2 2 0.04 4.5 0.4 0.0 1 31 352 381 352 395 0.71 # 23314 # 24558 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_47 - 488 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00019 13.6 0.0 1 1 3.1e-06 0.00035 12.7 0.0 18 52 244 277 239 314 0.90 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_97 - 504 AAA_30 PF13604.1 196 5.5e-08 25.7 0.1 1 2 9.2e-07 0.0001 15.0 0.0 19 80 20 81 11 109 0.77 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 AAA_30 PF13604.1 196 5.5e-08 25.7 0.1 2 2 0.00017 0.019 7.5 0.0 115 133 211 229 174 278 0.75 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00028 13.9 0.3 1 1 5.4e-06 0.0006 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 65 # 769 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_79 - 372 TIGR02432 TIGR02432 189 4.5e-05 16.2 0.1 1 2 1.1e-05 0.0012 11.5 0.0 1 58 52 109 52 119 0.85 # 51170 # 52285 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_79 - 372 TIGR02432 TIGR02432 189 4.5e-05 16.2 0.1 2 2 0.0084 0.94 2.1 0.0 140 165 235 260 207 262 0.76 # 51170 # 52285 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_64 - 521 GerE PF00196.14 58 0.00035 13.0 0.1 1 1 8.3e-06 0.00093 11.6 0.1 11 42 14 46 9 48 0.76 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_8 - 622 TraG-D_C PF12696.2 128 3.2e-15 49.2 0.0 1 1 5.1e-17 5.7e-15 48.4 0.0 1 124 471 595 471 599 0.83 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.00077 12.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.0023 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 65 # 769 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_65 - 252 Bac_DnaA PF00308.13 219 0.00026 13.7 0.0 1 1 3.7e-06 0.00042 13.0 0.0 35 110 100 175 67 199 0.84 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_30 - 262 MipZ PF09140.6 261 2e-10 33.2 0.0 1 2 6.6e-10 7.4e-08 24.8 0.0 2 52 4 55 3 81 0.83 # 21599 # 22384 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_30 - 262 MipZ PF09140.6 261 2e-10 33.2 0.0 2 2 0.00031 0.035 6.2 0.0 89 122 117 150 89 166 0.74 # 21599 # 22384 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_58 - 101 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00014 14.2 0.0 1 1 4.4e-06 0.00025 13.5 0.0 15 42 36 63 35 67 0.88 # 38332 # 38634 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_37 - 313 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00016 14.0 0.0 1 1 6.5e-06 0.00036 12.9 0.0 5 38 133 167 132 172 0.96 # 25593 # 26531 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_47 - 488 AAA PF00004.24 132 2.4e-29 95.3 0.0 1 1 1.8e-30 1e-28 93.3 0.0 1 131 245 371 245 372 0.97 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_65 - 252 AAA PF00004.24 132 0.00073 12.8 0.0 1 1 3.2e-05 0.0018 11.6 0.0 1 35 102 139 102 202 0.73 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_29 - 394 KorB PF08535.5 93 9.5e-32 102.2 0.2 1 1 5.9e-33 3.3e-31 100.4 0.0 1 92 134 222 134 223 0.97 # 20414 # 21595 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 1_37 - 313 KorB PF08535.5 93 1.3e-07 24.8 0.4 1 1 6.3e-09 3.5e-07 23.4 0.4 3 90 149 232 147 235 0.88 # 25593 # 26531 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_58 - 101 HTH_37 PF13744.1 80 1.1e-11 37.4 0.3 1 1 1.2e-13 1.3e-11 37.3 0.3 8 79 11 88 4 89 0.88 # 38332 # 38634 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_3 - 221 LexA_DNA_bind PF01726.11 65 0.00049 12.8 0.0 1 1 8.2e-06 0.00092 11.9 0.0 39 62 124 147 118 149 0.87 # 1180 # 1842 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 1_28 - 91 Rrf2 PF02082.15 83 0.00062 13.0 0.4 1 1 1.1e-05 0.0012 12.0 0.4 1 52 1 49 1 74 0.86 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_28 - 91 HTH_43 PF09904.4 90 4.6e-12 38.7 0.0 1 1 4.7e-14 5.2e-12 38.6 0.0 2 77 2 81 1 89 0.87 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_12 - 731 zf-C4_Topoisom PF01396.14 39 8.8e-15 47.1 16.8 1 2 5.3e-08 5.9e-06 18.8 4.7 3 37 636 669 634 671 0.90 # 9706 # 11898 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_12 - 731 zf-C4_Topoisom PF01396.14 39 8.8e-15 47.1 16.8 2 2 1.5e-12 1.7e-10 33.4 4.2 3 38 684 725 683 726 0.89 # 9706 # 11898 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_28 - 91 HTH_27 PF13463.1 68 0.00056 13.3 0.0 1 1 6.4e-06 0.00071 13.0 0.0 8 44 13 48 9 76 0.78 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_33 - 415 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 6.4e-25 81.0 0.0 1 1 9.2e-27 1e-24 80.3 0.0 1 228 129 389 129 392 0.81 # 23314 # 24558 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_65 - 252 AAA_16 PF13191.1 185 2.9e-05 17.1 1.5 1 2 0.072 4.1 0.4 0.1 44 84 55 92 43 98 0.77 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_65 - 252 AAA_16 PF13191.1 185 2.9e-05 17.1 1.5 2 2 9.6e-07 5.4e-05 16.3 0.2 11 55 86 130 79 227 0.81 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_15 - 206 AAA_16 PF13191.1 185 4.8e-05 16.5 0.1 1 1 1.3e-06 7.1e-05 15.9 0.1 27 68 11 54 3 168 0.79 # 13004 # 13621 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_97 - 504 AAA_22 PF13401.1 131 3.6e-05 17.0 0.0 1 2 8e-05 0.003 10.8 0.0 8 68 23 92 17 122 0.63 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 AAA_22 PF13401.1 131 3.6e-05 17.0 0.0 2 2 0.015 0.56 3.4 0.0 82 124 189 225 164 229 0.77 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_8 - 622 AAA_22 PF13401.1 131 0.00014 15.1 0.0 1 1 1.2e-05 0.00047 13.4 0.0 3 68 171 231 166 287 0.83 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_47 - 488 AAA_22 PF13401.1 131 0.00054 13.2 1.1 1 1 0.00089 0.033 7.4 0.8 69 121 283 344 243 354 0.66 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_65 - 252 TIGR00362 TIGR00362 437 5e-07 21.8 0.0 1 1 5.1e-09 5.7e-07 21.6 0.0 135 209 97 169 17 199 0.80 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_97 - 504 TIGR01074 TIGR01074 668 1.4e-10 32.7 0.8 1 3 0.0039 0.43 1.4 0.0 8 33 12 38 7 57 0.74 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 TIGR01074 TIGR01074 668 1.4e-10 32.7 0.8 2 3 4.1e-07 4.6e-05 14.5 0.0 205 254 192 238 179 271 0.87 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 TIGR01074 TIGR01074 668 1.4e-10 32.7 0.8 3 3 7.5e-07 8.4e-05 13.6 0.1 534 614 396 472 347 493 0.80 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_28 - 91 HTH_9 PF08221.6 62 0.00031 13.7 0.0 1 1 4.4e-06 0.0005 13.0 0.0 19 51 14 46 11 47 0.90 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_65 - 252 AAA_29 PF13555.1 62 0.00087 11.9 0.0 1 1 1.6e-05 0.0018 10.9 0.0 23 41 99 117 90 132 0.79 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_28 - 91 HTH_1 PF00126.22 60 4e-05 16.4 0.0 1 1 5.4e-07 6.1e-05 15.8 0.0 22 51 31 61 30 76 0.79 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 1.5e-06 22.1 0.2 1 1 1.1e-07 6.3e-06 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 65 # 769 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_11 - 214 HTH_32 PF13565.1 77 0.00054 13.8 1.0 1 1 5.5e-05 0.0031 11.4 0.1 19 77 157 208 146 208 0.69 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_97 - 504 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.8e-12 37.5 1.1 1 4 0.0098 1.1 -0.2 0.0 13 27 23 37 13 47 0.82 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.8e-12 37.5 1.1 2 4 1.4e-10 1.6e-08 25.8 0.0 368 454 190 270 179 282 0.80 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.8e-12 37.5 1.1 3 4 0.011 1.2 -0.3 0.0 728 746 412 430 401 437 0.88 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 TIGR00609 TIGR00609 1175 4.8e-12 37.5 1.1 4 4 7.4e-05 0.0083 6.8 0.1 789 818 446 475 417 502 0.70 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_58 - 101 HTH_3 PF01381.17 55 5.1e-08 25.8 0.1 1 1 6.6e-10 7.4e-08 25.3 0.1 1 44 33 76 33 84 0.86 # 38332 # 38634 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_65 - 252 Rad17 PF03215.10 519 0.001 10.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.0015 10.2 0.0 30 61 86 115 80 134 0.86 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 2_11 - 214 HTH_23 PF13384.1 50 4.4e-06 19.4 0.1 1 1 3.3e-06 7.5e-05 15.5 0.0 18 40 188 210 170 210 0.91 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 6.8e-06 18.8 0.7 1 2 0.079 1.8 1.6 0.0 7 27 11 35 7 36 0.69 # 65 # 769 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 6.8e-06 18.8 0.7 2 2 9.3e-06 0.00021 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 65 # 769 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_37 - 313 HTH_23 PF13384.1 50 1e-05 18.2 1.4 1 1 1.6e-06 3.6e-05 16.5 0.1 3 38 134 170 132 176 0.89 # 25593 # 26531 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_29 - 394 HTH_23 PF13384.1 50 0.00014 14.6 0.2 1 1 4.3e-05 0.00097 11.9 0.0 4 35 122 154 119 161 0.81 # 20414 # 21595 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 1_64 - 521 HTH_23 PF13384.1 50 0.00098 11.9 2.0 1 1 5.5e-05 0.0012 11.6 0.2 8 40 12 45 5 51 0.84 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_11 - 214 HTH_7 PF02796.10 45 2.1e-11 36.7 0.0 1 1 6.3e-13 7e-11 35.0 0.0 1 43 166 209 166 211 0.94 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_58 - 101 HTH_19 PF12844.2 64 4.1e-08 26.3 0.0 1 1 5.2e-10 5.8e-08 25.8 0.0 4 52 33 81 31 86 0.95 # 38332 # 38634 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_65 - 252 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00052 12.3 0.0 1 1 1.8e-05 0.001 11.3 0.0 21 42 98 119 84 125 0.88 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_47 - 488 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00064 12.0 0.1 1 1 2.3e-05 0.0013 11.0 0.1 1 47 215 267 215 281 0.79 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 2_11 - 214 HTH_29 PF13551.1 112 5.2e-05 16.5 0.4 1 2 0.034 1.9 1.8 0.1 36 68 150 181 145 184 0.64 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 2_11 - 214 HTH_29 PF13551.1 112 5.2e-05 16.5 0.4 2 2 1.4e-05 0.0008 12.6 0.0 5 35 180 210 176 213 0.87 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_64 - 521 HTH_29 PF13551.1 112 0.00038 13.7 4.2 1 2 9.3e-05 0.0052 10.0 0.5 3 46 13 58 12 132 0.60 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_64 - 521 HTH_29 PF13551.1 112 0.00038 13.7 4.2 2 2 0.07 3.9 0.8 0.0 31 71 374 413 369 427 0.77 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_5 - 290 DNA_pol_A_exo1 PF01612.15 176 0.00021 13.8 0.2 1 1 1.3e-05 0.0015 11.1 0.2 9 96 93 202 85 272 0.75 # 2098 # 2967 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 2.6e-12 39.5 0.3 1 1 3e-14 3.3e-12 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 65 # 769 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_97 - 504 PhoH PF02562.11 205 2.9e-06 19.7 0.2 1 2 0.0026 0.15 4.3 0.0 22 45 22 45 4 61 0.78 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 PhoH PF02562.11 205 2.9e-06 19.7 0.2 2 2 1.5e-05 0.00084 11.7 0.0 122 168 196 240 193 255 0.83 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_65 - 252 PhoH PF02562.11 205 3.2e-06 19.6 0.2 1 2 0.028 1.6 0.9 0.0 140 169 56 83 49 95 0.76 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_65 - 252 PhoH PF02562.11 205 3.2e-06 19.6 0.2 2 2 3e-07 1.7e-05 17.2 0.1 8 51 88 131 81 196 0.77 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_47 - 488 TIGR00763 TIGR00763 795 1.4e-05 16.4 0.1 1 1 9.9e-07 0.00011 13.4 0.1 340 520 227 395 218 407 0.79 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_97 - 504 ResIII PF04851.10 184 1.2e-06 21.5 0.0 1 1 5.5e-08 3.1e-06 20.2 0.0 23 75 17 69 7 107 0.78 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_8 - 622 ResIII PF04851.10 184 0.00012 15.0 0.0 1 1 4.2e-06 0.00024 14.0 0.0 23 57 170 206 129 214 0.74 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_79 - 372 PAPS_reduct PF01507.14 174 3.9e-12 39.4 0.4 1 2 0.014 1.6 1.6 0.0 2 17 53 68 52 91 0.76 # 51170 # 52285 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_79 - 372 PAPS_reduct PF01507.14 174 3.9e-12 39.4 0.4 2 2 4.4e-13 4.9e-11 35.8 0.1 58 172 154 279 145 281 0.85 # 51170 # 52285 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_8 - 622 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.2e-19 62.3 0.0 1 2 4.4e-13 5e-11 34.8 0.0 10 54 167 211 161 313 0.70 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_8 - 622 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.2e-19 62.3 0.0 2 2 3.5e-10 3.9e-08 25.3 0.0 242 377 469 609 445 616 0.82 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_30 - 262 TIGR01968 TIGR01968 261 5.7e-09 28.4 0.1 1 2 5e-07 5.7e-05 15.3 0.1 2 39 3 41 2 45 0.84 # 21599 # 22384 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_30 - 262 TIGR01968 TIGR01968 261 5.7e-09 28.4 0.1 2 2 9e-06 0.001 11.2 0.0 105 135 120 150 111 218 0.80 # 21599 # 22384 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 2_11 - 214 HTH_psq PF05225.11 45 0.00022 13.9 0.0 1 2 0.0033 0.37 3.5 0.0 5 16 73 84 72 91 0.86 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 2_11 - 214 HTH_psq PF05225.11 45 0.00022 13.9 0.0 2 2 0.00015 0.017 7.8 0.0 16 41 187 212 185 213 0.88 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 2_5 - 290 TIGR01406 TIGR01406 231 1.2e-18 60.3 0.0 1 1 1.5e-20 1.7e-18 59.8 0.0 3 179 107 279 105 288 0.85 # 2098 # 2967 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_8 - 622 DUF87 PF01935.12 229 8.2e-09 28.6 0.1 1 1 3.3e-10 1.8e-08 27.5 0.1 24 63 173 211 168 379 0.87 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_65 - 252 DUF87 PF01935.12 229 0.0012 11.7 2.7 1 2 0.00051 0.029 7.2 1.1 133 196 28 91 5 105 0.69 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_65 - 252 DUF87 PF01935.12 229 0.0012 11.7 2.7 2 2 0.0048 0.27 4.0 0.0 27 47 103 123 97 130 0.79 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 2_11 - 214 HTH_28 PF13518.1 52 1.7e-06 21.0 0.0 1 2 0.038 2.1 1.6 0.0 15 30 43 58 37 59 0.84 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 2_11 - 214 HTH_28 PF13518.1 52 1.7e-06 21.0 0.0 2 2 6.8e-07 3.8e-05 16.8 0.0 12 35 186 210 177 213 0.86 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 6.5e-05 16.0 1.2 1 1 5.1e-06 0.00028 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 65 # 769 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_28 - 91 HTH_24 PF13412.1 48 2e-05 17.0 0.1 1 1 8.2e-07 3.1e-05 16.4 0.1 5 44 10 49 7 49 0.93 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_29 - 394 HTH_24 PF13412.1 48 2.1e-05 16.9 0.3 1 2 0.00048 0.018 7.6 0.2 1 29 104 131 104 131 0.90 # 20414 # 21595 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 1_29 - 394 HTH_24 PF13412.1 48 2.1e-05 16.9 0.3 2 2 0.00071 0.026 7.0 0.0 20 41 139 160 138 161 0.90 # 20414 # 21595 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 1_64 - 521 HTH_24 PF13412.1 48 8.3e-05 15.1 0.4 1 1 4.7e-06 0.00017 14.0 0.4 8 41 14 46 9 51 0.81 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_65 - 252 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 3.6e-06 20.2 0.2 1 1 9.9e-08 1.1e-05 18.6 0.0 17 113 95 205 79 230 0.70 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_64 - 521 HTH_30 PF13556.1 59 0.00028 13.6 0.5 1 2 1.5e-05 0.0017 11.1 0.6 3 39 13 49 11 52 0.87 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_64 - 521 HTH_30 PF13556.1 59 0.00028 13.6 0.5 2 2 0.082 9.2 -0.9 0.0 31 46 479 494 476 500 0.80 # 41225 # 42787 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_5 - 290 TIGR01298 TIGR01298 200 2e-07 23.7 1.1 1 1 5.8e-08 6.5e-06 18.8 1.1 1 196 97 276 97 280 0.83 # 2098 # 2967 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_8 - 622 DEAD PF00270.24 169 2.6e-05 16.8 0.0 1 1 4.4e-07 4.9e-05 15.9 0.0 13 52 171 208 159 231 0.85 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_58 - 101 HTH_31 PF13560.1 64 1e-07 25.1 0.0 1 1 1.4e-09 1.5e-07 24.6 0.0 5 55 32 81 29 90 0.90 # 38332 # 38634 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_65 - 252 Methyltransf_32 PF13679.1 141 0.0012 11.6 0.3 1 1 2.4e-05 0.0027 10.5 0.2 32 55 108 131 84 148 0.81 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_97 - 504 UvrD_C_2 PF13538.1 104 8.5e-11 35.0 0.0 1 1 3.5e-12 3.9e-10 32.9 0.0 46 99 393 463 352 467 0.67 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_48 - 311 TIGR01973 TIGR01973 606 1.7e-05 16.5 0.8 1 1 2.2e-07 2.4e-05 16.0 0.8 384 504 62 181 59 212 0.85 # 32957 # 33889 # -1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 1_8 - 622 T2SE PF00437.15 272 0.00021 13.3 0.0 1 1 5.9e-06 0.00033 12.6 0.0 116 162 163 206 124 227 0.78 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_65 - 252 T2SE PF00437.15 272 0.00031 12.7 0.0 1 1 8.6e-06 0.00048 12.1 0.0 54 148 18 119 3 128 0.62 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_65 - 252 NACHT PF05729.7 166 0.001 11.8 3.2 1 3 0.039 4.4 -0.0 0.2 107 160 38 93 14 99 0.62 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_65 - 252 NACHT PF05729.7 166 0.001 11.8 3.2 2 3 1.6e-05 0.0017 11.1 0.1 3 20 102 119 100 128 0.90 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_65 - 252 NACHT PF05729.7 166 0.001 11.8 3.2 3 3 0.077 8.6 -1.0 0.0 53 89 134 168 120 187 0.70 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_65 - 252 AAA_17 PF13207.1 121 4.5e-05 17.4 0.0 1 1 1.7e-06 9.3e-05 16.3 0.0 3 47 103 151 101 238 0.68 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_47 - 488 AAA_17 PF13207.1 121 0.00014 15.8 0.0 1 1 1.3e-05 0.00071 13.5 0.0 2 63 245 299 245 388 0.63 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_65 - 252 AAA_25 PF13481.1 194 7.2e-06 18.6 0.2 1 2 2.1e-06 6e-05 15.6 0.0 23 54 88 120 71 131 0.83 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_65 - 252 AAA_25 PF13481.1 194 7.2e-06 18.6 0.2 2 2 0.094 2.6 0.4 0.0 135 151 153 169 129 185 0.76 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_47 - 488 AAA_25 PF13481.1 194 7.1e-05 15.3 3.6 1 3 0.049 1.4 1.3 1.4 36 55 245 264 224 275 0.81 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_47 - 488 AAA_25 PF13481.1 194 7.1e-05 15.3 3.6 2 3 0.00014 0.0039 9.6 0.0 127 176 287 336 270 348 0.69 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_47 - 488 AAA_25 PF13481.1 194 7.1e-05 15.3 3.6 3 3 0.017 0.47 2.9 0.0 69 172 337 440 325 448 0.66 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_30 - 262 AAA_25 PF13481.1 194 0.00044 12.7 0.0 1 1 2.4e-05 0.00068 12.1 0.0 42 91 12 51 11 134 0.78 # 21599 # 22384 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_8 - 622 AAA_25 PF13481.1 194 0.00044 12.7 0.0 1 1 4.9e-05 0.0014 11.1 0.0 20 137 159 265 145 272 0.78 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_97 - 504 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1e-10 34.6 0.0 1 3 1.4e-05 0.0016 11.0 0.0 2 49 23 73 22 87 0.67 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1e-10 34.6 0.0 2 3 1.8e-05 0.0021 10.7 0.0 56 105 188 234 146 256 0.78 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 Viral_helicase1 PF01443.13 234 1e-10 34.6 0.0 3 3 5.2e-05 0.0058 9.2 0.0 176 227 404 462 344 467 0.75 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 AAA_14 PF13173.1 128 1.8e-05 17.7 1.3 1 2 5.1e-05 0.0028 10.6 0.1 11 46 28 62 18 156 0.76 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_97 - 504 AAA_14 PF13173.1 128 1.8e-05 17.7 1.3 2 2 0.0023 0.13 5.3 0.0 51 99 176 227 127 241 0.73 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_65 - 252 AAA_14 PF13173.1 128 3.2e-05 16.9 0.0 1 1 1.1e-06 6.4e-05 16.0 0.0 3 71 100 170 98 241 0.74 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_28 - 91 Mga PF05043.8 87 0.00028 14.2 0.1 1 1 3.1e-06 0.00035 13.9 0.1 17 55 9 47 2 62 0.89 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 2_11 - 214 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.0007 11.9 0.0 1 1 1.6e-05 0.0017 10.6 0.0 22 50 183 210 182 212 0.91 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_47 - 488 AAA_33 PF13671.1 143 0.00031 13.7 0.0 1 1 8.2e-06 0.00091 12.2 0.0 2 33 245 297 245 399 0.73 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_8 - 622 ArgK PF03308.11 267 0.00012 13.9 0.0 1 1 1.8e-06 0.00021 13.2 0.0 12 68 158 209 153 214 0.88 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_59 - 98 PaaX PF07848.7 70 0.00011 15.2 0.0 1 1 1.4e-06 0.00016 14.8 0.0 19 70 28 79 10 79 0.88 # 38661 # 38954 # -1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_8 - 622 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 2.9e-05 15.8 0.0 1 2 5.6e-07 6.2e-05 14.7 0.0 37 114 168 248 125 346 0.72 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_8 - 622 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 2.9e-05 15.8 0.0 2 2 0.097 11 -2.6 0.0 328 389 494 555 474 572 0.74 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_65 - 252 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0013 12.0 0.0 1 1 2e-05 0.0022 11.3 0.0 2 27 103 137 102 190 0.63 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_47 - 488 AAA_2 PF07724.9 171 3.9e-06 19.9 0.0 1 1 1.9e-07 2.2e-05 17.5 0.0 6 92 245 325 240 333 0.90 # 31420 # 32883 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 1_65 - 252 APS_kinase PF01583.15 157 0.00025 13.8 0.2 1 1 7.4e-06 0.00083 12.1 0.0 5 34 102 131 98 142 0.88 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_19 - 476 DNA_methylase PF00145.12 335 1.2e-10 34.1 0.0 1 2 2.1e-11 2.3e-09 29.8 0.0 71 160 228 320 199 324 0.83 # 14795 # 16222 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_19 - 476 DNA_methylase PF00145.12 335 1.2e-10 34.1 0.0 2 2 0.0056 0.62 2.1 0.0 290 330 407 448 343 452 0.74 # 14795 # 16222 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_79 - 372 ATP_bind_3 PF01171.15 182 0.00017 14.2 0.0 1 2 5.2e-05 0.0059 9.2 0.0 1 59 52 110 52 129 0.78 # 51170 # 52285 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_79 - 372 ATP_bind_3 PF01171.15 182 0.00017 14.2 0.0 2 2 0.005 0.56 2.7 0.0 134 161 232 260 207 262 0.72 # 51170 # 52285 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_79 - 372 TIGR00420 TIGR00420 351 0.0011 10.5 0.0 1 2 0.00011 0.012 7.2 0.0 2 64 52 110 51 128 0.77 # 51170 # 52285 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_79 - 372 TIGR00420 TIGR00420 351 0.0011 10.5 0.0 2 2 0.0073 0.82 1.1 0.0 192 223 274 305 245 313 0.89 # 51170 # 52285 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.520 1_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 8.5e-53 171.2 0.0 1 1 1.1e-54 1.2e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 65 # 769 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_56 - 183 HTH_26 PF13443.1 63 0.0001 15.6 0.1 1 2 0.0022 0.25 4.7 0.0 9 48 53 91 45 92 0.86 # 37266 # 37814 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_56 - 183 HTH_26 PF13443.1 63 0.0001 15.6 0.1 2 2 0.00018 0.02 8.2 0.0 39 56 163 180 155 182 0.92 # 37266 # 37814 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 2_11 - 214 HTH_17 PF12728.2 51 2.1e-06 21.0 0.0 1 2 0.034 3.8 1.0 0.0 11 19 50 58 44 62 0.83 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 2_11 - 214 HTH_17 PF12728.2 51 2.1e-06 21.0 0.0 2 2 2.9e-07 3.3e-05 17.2 0.0 2 25 188 211 187 213 0.89 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_12 - 731 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0076 9.3 6.9 1 2 0.0047 0.52 3.5 0.1 23 40 631 647 624 648 0.85 # 9706 # 11898 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_12 - 731 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0076 9.3 6.9 2 2 0.00059 0.066 6.3 3.4 20 38 676 693 657 696 0.81 # 9706 # 11898 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_11 - 214 HTH_11 PF08279.7 55 6.7e-05 15.6 0.0 1 1 3e-06 0.00017 14.3 0.0 17 37 189 209 183 210 0.91 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_28 - 91 HTH_11 PF08279.7 55 0.0004 13.1 0.0 1 1 9.5e-06 0.00053 12.7 0.0 1 46 9 54 9 70 0.77 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_58 - 101 MarR_2 PF12802.2 62 7.8e-06 18.6 0.0 1 1 1.4e-07 1.6e-05 17.6 0.0 11 40 33 60 28 61 0.93 # 38332 # 38634 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_28 - 91 HTH_5 PF01022.15 47 3.1e-06 19.9 0.0 1 1 1.2e-07 4.5e-06 19.4 0.0 6 41 12 48 8 49 0.91 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 2_11 - 214 HTH_5 PF01022.15 47 6.1e-05 15.8 0.0 1 1 3.2e-06 0.00012 14.8 0.0 14 36 186 208 177 210 0.86 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_58 - 101 HTH_5 PF01022.15 47 0.00049 12.9 0.0 1 1 2.9e-05 0.0011 11.7 0.0 15 34 41 60 33 60 0.84 # 38332 # 38634 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_28 - 91 TrmB PF01978.14 68 0.001 11.9 0.0 1 1 1.4e-05 0.0016 11.3 0.0 19 48 19 48 11 52 0.85 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 2_11 - 214 UPF0122 PF04297.9 101 4e-05 16.7 0.0 1 1 6e-07 6.7e-05 16.0 0.0 19 57 173 211 168 213 0.85 # 5196 # 5837 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_58 - 101 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 1.4e-05 17.9 0.0 1 1 2.1e-07 2.3e-05 17.2 0.0 24 48 37 61 23 63 0.81 # 38332 # 38634 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_28 - 91 HTH_Mga PF08280.6 59 9.9e-07 21.6 0.0 1 1 1e-08 1.2e-06 21.4 0.0 2 54 5 57 4 62 0.93 # 20093 # 20365 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_99 - 347 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.029 7.5 46.3 1 5 0.019 2.1 1.5 8.8 39 98 89 152 77 158 0.72 # 69063 # 70103 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_99 - 347 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.029 7.5 46.3 2 5 0.00084 0.094 5.9 3.1 50 100 146 196 143 199 0.89 # 69063 # 70103 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_99 - 347 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.029 7.5 46.3 3 5 2.6e-06 0.00029 13.9 12.2 19 100 216 294 201 297 0.85 # 69063 # 70103 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_99 - 347 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.029 7.5 46.3 4 5 0.00031 0.034 7.3 2.1 62 105 284 327 282 330 0.90 # 69063 # 70103 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_99 - 347 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.029 7.5 46.3 5 5 0.0059 0.66 3.1 1.6 82 105 304 327 296 345 0.51 # 69063 # 70103 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_5 - 290 RNase_T PF00929.19 164 4.4e-23 75.4 0.0 1 1 5.8e-25 6.5e-23 74.9 0.0 1 163 107 264 107 265 0.94 # 2098 # 2967 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_8 - 622 AAA_10 PF12846.2 304 1.1e-18 60.8 0.2 1 1 2.7e-20 3e-18 59.3 0.2 2 299 173 549 172 553 0.71 # 3866 # 5731 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_22 - 169 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 8.4e-05 15.7 2.0 1 1 2.5e-06 0.00028 14.0 2.0 1 31 6 37 6 48 0.74 # 17052 # 17558 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_97 - 504 UvrD_C PF13361.1 351 1e-10 34.6 0.0 1 1 1.7e-12 1.9e-10 33.7 0.0 238 347 359 468 334 472 0.76 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_99 - 347 AAA_13 PF13166.1 712 0.0075 7.7 36.6 1 2 0.0019 0.21 2.9 28.3 283 457 85 259 71 272 0.58 # 69063 # 70103 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_99 - 347 AAA_13 PF13166.1 712 0.0075 7.7 36.6 2 2 2.3e-05 0.0026 9.2 23.2 287 474 160 339 154 345 0.78 # 69063 # 70103 # -1 # ID=1_99;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_30 - 262 ArsA_ATPase PF02374.10 305 6.4e-06 18.4 0.0 1 2 3e-07 3.4e-05 16.0 0.0 7 40 9 43 2 79 0.84 # 21599 # 22384 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_30 - 262 ArsA_ATPase PF02374.10 305 6.4e-06 18.4 0.0 2 2 0.029 3.2 -0.3 0.0 124 136 124 136 106 143 0.79 # 21599 # 22384 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_30 - 262 AAA_31 PF13614.1 157 1.5e-10 34.3 0.0 1 1 2.6e-12 3e-10 33.3 0.0 1 149 3 157 3 165 0.79 # 21599 # 22384 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_65 - 252 IstB_IS21 PF01695.12 178 1e-57 187.5 0.1 1 1 1.2e-59 1.4e-57 187.1 0.1 1 177 53 229 53 230 0.99 # 42813 # 43568 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_97 - 504 AAA_11 PF13086.1 236 3.2e-07 23.2 0.1 1 1 1.9e-08 2.1e-06 20.5 0.1 23 228 25 228 8 229 0.66 # 67265 # 68776 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.510 1_12 - 731 Zn_ribbon_recom PF13408.1 58 5.3e-06 19.7 8.2 1 2 0.00033 0.037 7.5 0.7 8 40 637 668 636 680 0.71 # 9706 # 11898 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_12 - 731 Zn_ribbon_recom PF13408.1 58 5.3e-06 19.7 8.2 2 2 1.1e-06 0.00012 15.4 1.4 8 41 685 719 685 728 0.80 # 9706 # 11898 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/340fa927-b964-4a92-a0c9-72469c72e67e # Target file: checkm_output/bins/pm449/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm449/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/340fa927-b964-4a92-a0c9-72469c72e67e checkm_output/bins/pm449/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:06:18 2017 # [ok]