# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_38 - 208 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00035 14.2 0.1 1 1 3.1e-06 0.00069 13.3 0.1 7 48 8 48 7 51 0.91 # 26879 # 27502 # 1 # ID=2_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_144 - 351 ABC_tran PF00005.22 137 0.00038 14.8 0.0 1 1 3.8e-06 0.00085 13.7 0.0 14 117 99 225 95 229 0.56 # 126716 # 127768 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_5 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 1.3e-05 19.0 0.3 1 2 0.022 5 1.1 0.0 23 38 70 85 58 87 0.81 # 4751 # 5311 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_5 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 1.3e-05 19.0 0.3 2 2 1.3e-06 0.0003 14.6 0.0 47 64 166 183 164 183 0.93 # 4751 # 5311 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_2 - 468 FAD_binding_3 PF01494.14 356 7.1e-06 19.3 0.0 1 1 9e-08 2e-05 17.8 0.0 2 172 2 185 1 208 0.66 # 1339 # 2742 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 1_12 - 418 HHH_5 PF14520.1 60 0.00059 14.1 0.0 1 1 1.9e-05 0.0043 11.3 0.0 9 45 180 216 169 226 0.85 # 9388 # 10641 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_96 - 559 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00012 15.3 0.0 1 1 9.6e-07 0.00022 14.4 0.0 76 138 433 493 400 512 0.87 # 78081 # 79757 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_1 - 466 rve_3 PF13683.1 67 1.6e-05 18.5 0.1 1 1 2.3e-07 5.1e-05 16.8 0.0 13 56 249 295 240 296 0.92 # 163 # 1560 # 1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_144 - 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