# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_51 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.2e-05 17.5 0.0 1 2 0.00041 0.067 6.1 0.0 112 146 18 54 8 81 0.66 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 1_51 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.2e-05 17.5 0.0 2 2 4e-05 0.0066 9.4 0.0 41 62 162 183 145 218 0.78 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 2_8 - 249 KaiC PF06745.8 227 0.00017 14.3 0.0 1 1 1.9e-06 0.00031 13.5 0.0 17 53 96 131 79 167 0.83 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 5_7 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 2e-05 17.7 0.2 1 1 9.2e-07 7.5e-05 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_7 - 494 HTH_IclR PF09339.5 52 8.1e-05 15.8 0.2 1 2 0.04 3.3 1.1 0.0 24 36 165 177 163 186 0.81 # 2765 # 4246 # 1 # ID=7_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 7_7 - 494 HTH_IclR PF09339.5 52 8.1e-05 15.8 0.2 2 2 1.8e-05 0.0015 11.8 0.2 25 50 228 253 222 255 0.93 # 2765 # 4246 # 1 # ID=7_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 1_68 - 713 ABC_tran PF00005.22 137 5e-07 23.7 0.5 1 2 0.00035 0.057 7.3 1.2 19 37 29 47 16 174 0.64 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_68 - 713 ABC_tran PF00005.22 137 5e-07 23.7 0.5 2 2 1.5e-05 0.0025 11.7 0.0 87 136 398 452 283 453 0.74 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 6_6 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 9.2e-06 19.0 0.3 1 2 0.045 3.7 1.1 0.0 23 38 70 85 58 87 0.81 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 6_6 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 9.2e-06 19.0 0.3 2 2 2.7e-06 0.00022 14.6 0.0 47 64 166 183 164 183 0.93 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 5_7 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 0.00046 13.6 1.5 1 1 2.4e-05 0.0019 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 9_4 - 211 TIGR01173 TIGR01173 452 7.3e-10 31.5 0.1 1 1 6.4e-12 1.1e-09 30.9 0.1 390 446 109 165 100 170 0.87 # 1872 # 2504 # 1 # ID=9_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_51 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00053 13.0 0.0 1 2 0.0016 0.26 4.2 0.0 124 138 20 34 9 79 0.75 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 1_51 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00053 13.0 0.0 2 2 0.00024 0.04 6.8 0.0 53 86 164 199 155 218 0.77 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 3_4 - 519 N6_Mtase PF02384.11 311 6e-118 387.0 0.8 1 1 9.9e-120 8.1e-118 386.5 0.8 2 310 171 479 170 480 0.97 # 4931 # 6487 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_41 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00046 12.9 0.0 1 2 6.8e-05 0.0056 9.3 0.0 28 62 32 66 21 75 0.89 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 1_41 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00046 12.9 0.0 2 2 0.035 2.9 0.4 0.0 128 137 115 124 106 133 0.84 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 1_32 - 284 rve_3 PF13683.1 67 7.2e-18 57.6 0.0 1 1 3e-19 2.4e-17 55.9 0.0 1 67 205 271 205 271 0.98 # 21907 # 22758 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 3_9 - 125 rve_3 PF13683.1 67 7.3e-15 47.9 0.1 1 1 1.3e-16 1.1e-14 47.4 0.1 2 67 40 106 39 106 0.96 # 7805 # 8179 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_8 - 249 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00018 14.6 0.0 1 1 1.9e-06 0.00031 13.8 0.0 20 52 96 128 82 185 0.82 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 7_3 - 246 Methyltransf_4 PF02390.12 197 0.00023 13.8 0.1 1 1 2.7e-06 0.00044 12.9 0.0 17 52 27 62 3 102 0.72 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 1_15 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.4e-05 17.5 0.1 1 2 2e-06 0.00033 13.7 0.0 39 63 476 504 463 507 0.84 # 8776 # 11403 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_15 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.4e-05 17.5 0.1 2 2 0.015 2.5 1.1 0.0 75 166 530 625 529 668 0.82 # 8776 # 11403 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 5_7 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.0011 12.8 0.6 1 1 2.1e-05 0.0035 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 5_7 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 5.1e-06 19.6 1.4 1 1 1.2e-07 9.7e-06 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 2_7 - 514 HTH_38 PF13936.1 44 0.0005 13.3 0.1 1 1 3.4e-05 0.0028 10.9 0.0 12 40 13 42 11 46 0.84 # 4926 # 6467 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 2_8 - 249 MobB PF03205.9 140 0.00076 12.8 0.0 1 1 3.1e-05 0.0017 11.7 0.0 3 34 101 132 99 141 0.92 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_15 - 876 MobB PF03205.9 140 0.0011 12.3 0.1 1 1 8.1e-05 0.0044 10.3 0.0 4 37 483 515 481 523 0.79 # 8776 # 11403 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 2_15 - 616 MobB PF03205.9 140 0.0014 11.9 0.0 1 1 6.4e-05 0.0035 10.7 0.0 7 34 75 102 71 108 0.89 # 15938 # 17785 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 5_9 - 252 FmrO PF07091.6 251 3.5e-82 268.7 0.0 1 1 2.4e-84 4e-82 268.5 0.0 1 251 12 246 12 246 0.98 # 6259 # 7014 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_4 - 512 TBPIP PF07106.8 169 0.062 6.4 7.8 1 2 0.00023 0.037 7.2 3.3 101 157 18 70 3 80 0.68 # 1006 # 2541 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.600 1_4 - 512 TBPIP PF07106.8 169 0.062 6.4 7.8 2 2 0.021 3.4 0.8 0.1 76 123 348 395 334 412 0.69 # 1006 # 2541 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.600 6_6 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00017 14.7 0.2 1 2 0.023 3.8 0.8 0.1 2 12 114 124 113 124 0.85 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 6_6 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00017 14.7 0.2 2 2 1.6e-05 0.0026 10.9 0.0 20 37 163 180 159 183 0.86 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 8_4 - 223 TetR_N PF00440.18 47 2.6e-18 59.1 0.0 1 1 7.8e-20 4.3e-18 58.4 0.0 2 47 44 89 43 89 0.96 # 2267 # 2935 # -1 # ID=8_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 8_2 - 208 TetR_N PF00440.18 47 5.5e-18 58.0 0.0 1 2 2.6e-18 1.4e-16 53.5 0.0 2 47 10 55 9 55 0.97 # 244 # 867 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 8_2 - 208 TetR_N PF00440.18 47 5.5e-18 58.0 0.0 2 2 0.024 1.3 2.4 0.0 1 15 169 183 169 185 0.86 # 244 # 867 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 5_4 - 195 TetR_N PF00440.18 47 5.4e-08 26.0 0.0 1 1 1.9e-09 1e-07 25.1 0.0 2 46 13 57 12 58 0.95 # 2346 # 2930 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.609 2_14 - 1757 AAA_19 PF13245.1 76 2.9e-07 23.8 2.0 1 1 1.7e-08 9.2e-07 22.2 0.5 7 76 981 1047 974 1047 0.74 # 10668 # 15938 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 2_8 - 249 AAA_19 PF13245.1 76 0.00026 14.4 0.0 1 1 1.1e-05 0.00058 13.2 0.0 8 33 98 120 84 137 0.78 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_19 - 120 AAA_19 PF13245.1 76 0.0004 13.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.00074 12.9 0.0 13 38 89 114 80 119 0.79 # 12434 # 12793 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_55 - 389 CbiA PF01656.18 195 1.6e-36 119.1 0.0 1 1 2.7e-38 2.2e-36 118.7 0.0 2 194 110 339 109 340 0.80 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_8 - 249 CbiA PF01656.18 195 0.00012 15.1 0.1 1 1 2.9e-06 0.00023 14.2 0.1 5 30 104 129 101 136 0.91 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_19 - 120 KTI12 PF08433.5 270 0.001 11.9 0.0 1 1 1e-05 0.0017 11.1 0.0 5 30 90 115 89 118 0.90 # 12434 # 12793 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_51 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00063 12.8 0.0 1 2 0.014 2.2 1.2 0.0 173 188 16 31 10 92 0.81 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 1_51 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00063 12.8 0.0 2 2 4e-05 0.0066 9.5 0.0 20 46 163 189 148 197 0.78 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 2_7 - 514 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 2.2e-05 17.5 0.9 1 1 8.5e-07 7e-05 15.9 0.1 15 50 11 46 9 48 0.94 # 4926 # 6467 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_27 - 226 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00089 12.4 0.0 1 1 2.2e-05 0.0018 11.4 0.0 22 49 157 184 140 185 0.86 # 17069 # 17746 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.317 1_56 - 252 Rep_3 PF01051.16 222 5.4e-50 163.6 0.0 1 1 7.5e-52 6.1e-50 163.4 0.0 3 222 16 242 14 242 0.91 # 40228 # 40983 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 3_10 - 326 Rep_3 PF01051.16 222 2.6e-33 109.0 0.1 1 1 4.3e-35 3.6e-33 108.6 0.1 3 214 10 265 8 271 0.90 # 8975 # 9952 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_32 - 284 rve PF00665.21 120 3.8e-30 98.1 0.0 1 1 1.4e-31 5.9e-30 97.5 0.0 2 120 118 234 117 234 0.97 # 21907 # 22758 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 3_9 - 125 rve PF00665.21 120 7.6e-19 61.6 0.1 1 1 2.5e-20 1e-18 61.2 0.1 55 120 3 68 1 68 0.92 # 7805 # 8179 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_7 - 514 rve PF00665.21 120 1.5e-18 60.7 0.0 1 1 7.6e-20 3.1e-18 59.6 0.0 2 119 137 268 136 269 0.96 # 4926 # 6467 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 11_1 - 235 rve PF00665.21 120 5.4e-13 42.7 0.1 1 2 0.059 2.4 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 64 # 768 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 11_1 - 235 rve PF00665.21 120 5.4e-13 42.7 0.1 2 2 2.4e-13 9.9e-12 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 64 # 768 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 4_7 - 514 zf-ribbon_3 PF13248.1 26 0.093 5.7 9.1 1 2 9.1e-05 0.015 8.2 0.9 18 24 95 101 93 108 0.74 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 4_7 - 514 zf-ribbon_3 PF13248.1 26 0.093 5.7 9.1 2 2 0.0085 1.4 1.9 0.1 18 23 449 454 446 457 0.83 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_68 - 713 AAA_23 PF13476.1 202 1.7e-08 28.6 0.1 1 1 3.4e-10 5.5e-08 26.9 0.1 2 177 3 271 2 351 0.67 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_41 - 188 Methyltransf_26 PF13659.1 117 8.2e-14 45.3 0.1 1 1 3.6e-15 1.5e-13 44.5 0.1 2 114 52 147 51 150 0.90 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 3_4 - 519 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2e-12 40.8 0.0 1 1 2.1e-13 8.7e-12 38.8 0.0 3 114 220 354 218 358 0.73 # 4931 # 6487 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_51 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.4e-11 38.1 0.0 1 2 8.2e-07 3.4e-05 17.5 0.0 57 114 7 71 2 74 0.69 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 1_51 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.4e-11 38.1 0.0 2 2 3.9e-07 1.6e-05 18.6 0.0 4 45 167 207 164 223 0.82 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 7_3 - 246 Methyltransf_26 PF13659.1 117 7.4e-09 29.3 0.0 1 1 3e-10 1.2e-08 28.6 0.0 2 83 31 106 30 200 0.81 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 2_15 - 616 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00094 11.9 0.0 1 1 5.6e-05 0.0046 9.6 0.0 21 49 73 102 65 120 0.85 # 15938 # 17785 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_19 - 120 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0012 11.6 0.0 1 1 2.4e-05 0.002 10.9 0.0 14 37 84 107 74 115 0.80 # 12434 # 12793 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_14 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 3.3e-44 144.4 13.9 1 3 0.083 6.8 -0.2 0.0 41 86 223 269 219 281 0.81 # 10668 # 15938 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 2_14 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 3.3e-44 144.4 13.9 2 3 1.6e-05 0.0013 11.9 2.7 7 147 420 552 416 562 0.84 # 10668 # 15938 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 2_14 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 3.3e-44 144.4 13.9 3 3 9.9e-44 8.1e-42 136.6 1.9 1 186 968 1156 968 1162 0.94 # 10668 # 15938 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 2_15 - 616 AAA_30 PF13604.1 196 0.00094 12.4 0.0 1 1 2.1e-05 0.0017 11.5 0.0 21 57 71 107 63 113 0.85 # 15938 # 17785 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_68 - 713 SMC_N PF02463.14 220 0.00034 13.5 0.0 1 2 0.00049 0.08 5.7 0.0 5 45 3 42 1 50 0.78 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_68 - 713 SMC_N PF02463.14 220 0.00034 13.5 0.0 2 2 0.0005 0.081 5.7 0.0 135 186 243 470 100 500 0.73 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_2 - 135 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3e-18 59.2 0.0 1 1 9.6e-20 3.9e-18 58.8 0.0 2 58 9 72 8 101 0.84 # 209 # 613 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_33 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.8e-07 23.7 0.2 1 2 3.5e-07 1.4e-05 18.6 0.0 5 49 4 49 1 63 0.87 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_33 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 3.8e-07 23.7 0.2 2 2 0.03 1.2 2.8 0.1 9 52 65 113 62 137 0.70 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 6_6 - 187 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00032 14.3 0.1 1 1 1.8e-05 0.00073 13.1 0.1 15 44 154 182 140 186 0.79 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 11_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00041 13.9 0.3 1 1 2.2e-05 0.00088 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 64 # 768 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 4_5 - 157 TMP-TENI PF02581.12 180 1.4e-05 17.9 0.0 1 1 1e-07 1.7e-05 17.6 0.0 64 171 15 125 6 134 0.83 # 1977 # 2447 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.665 2_15 - 616 TraG-D_C PF12696.2 128 9.6e-21 67.6 0.0 1 1 1.1e-22 1.7e-20 66.8 0.0 1 127 302 424 302 425 0.86 # 15938 # 17785 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 7_3 - 246 CMAS PF02353.15 273 0.00027 13.6 0.6 1 1 3e-06 0.00049 12.8 0.0 51 105 18 71 12 99 0.78 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 11_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.0011 12.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.0034 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_8 - 249 Bac_DnaA PF00308.13 219 5.6e-07 23.0 0.0 1 1 5.2e-09 8.5e-07 22.4 0.0 37 136 101 198 83 204 0.88 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_55 - 389 MipZ PF09140.6 261 7.1e-06 18.8 0.4 1 2 3.5e-06 0.00058 12.6 0.0 2 47 108 153 107 157 0.87 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_55 - 389 MipZ PF09140.6 261 7.1e-06 18.8 0.4 2 2 0.0011 0.18 4.4 0.0 88 134 224 270 197 292 0.84 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_4 - 519 UPF0020 PF01170.13 180 3.1e-09 30.2 0.1 1 1 3.1e-10 2.5e-08 27.3 0.0 22 117 211 304 196 311 0.76 # 4931 # 6487 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_51 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 2.1e-05 17.7 0.0 1 2 0.00058 0.048 6.8 0.0 103 119 17 33 4 88 0.73 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 1_51 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 2.1e-05 17.7 0.0 2 2 0.00012 0.01 9.0 0.0 28 54 163 189 158 221 0.67 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 12_1 - 177 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2.3e-25 82.9 0.0 1 1 7.7e-27 3.1e-25 82.5 0.0 5 106 69 175 66 177 0.97 # 2 # 532 # 1 # ID=12_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.580 10_2 - 123 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 3.7e-16 52.9 0.0 1 1 1.2e-17 4.8e-16 52.5 0.0 67 212 5 108 1 109 0.81 # 496 # 864 # -1 # ID=10_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 2_17 - 101 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2.2e-15 50.3 0.1 1 1 6.8e-17 2.8e-15 50.0 0.1 67 204 5 99 1 100 0.82 # 18582 # 18884 # -1 # ID=2_17;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.558 8_6 - 115 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 6.6e-06 19.4 0.0 1 1 2.8e-07 1.2e-05 18.6 0.0 174 210 1 40 1 43 0.84 # 3374 # 3718 # -1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.472 1_21 - 484 DivIC PF04977.10 80 0.0015 11.6 4.6 1 1 3.7e-05 0.0031 10.7 4.6 17 66 76 124 72 125 0.92 # 13288 # 14739 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_4 - 512 DivIC PF04977.10 80 0.049 6.8 11.2 1 2 0.02 1.6 1.9 4.8 18 36 29 47 3 51 0.53 # 1006 # 2541 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.600 1_4 - 512 DivIC PF04977.10 80 0.049 6.8 11.2 2 2 0.00042 0.034 7.3 0.0 21 49 58 86 54 88 0.88 # 1006 # 2541 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.600 10_2 - 123 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.00034 14.4 0.0 1 1 9.6e-06 0.00053 13.8 0.0 1 86 13 107 13 109 0.77 # 496 # 864 # -1 # ID=10_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 1_32 - 284 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.00083 13.2 0.1 1 1 7.9e-05 0.0043 10.9 0.1 3 58 187 231 185 235 0.82 # 21907 # 22758 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 2_17 - 101 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.0009 13.1 0.2 1 1 2.7e-05 0.0014 12.4 0.2 1 68 13 90 13 98 0.76 # 18582 # 18884 # -1 # ID=2_17;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.558 1_68 - 713 AAA_21 PF13304.1 303 2.7e-08 27.7 0.2 1 2 6.8e-06 0.0011 12.5 0.0 7 71 29 106 27 212 0.63 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_68 - 713 AAA_21 PF13304.1 303 2.7e-08 27.7 0.2 2 2 6.5e-06 0.0011 12.6 0.0 219 298 386 487 301 489 0.75 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 2_7 - 514 Sigma70_r4 PF04545.11 50 7.2e-05 15.7 0.1 1 1 4.4e-07 7.2e-05 15.7 0.1 10 44 12 46 9 48 0.93 # 4926 # 6467 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_17 - 74 zf-dskA_traR PF01258.12 36 1.7e-15 50.1 2.5 1 1 1.5e-17 2.4e-15 49.6 2.5 5 36 35 67 29 67 0.90 # 11563 # 11784 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 2_8 - 249 AAA PF00004.24 132 6.4e-06 20.0 0.0 1 1 5.6e-08 9.1e-06 19.5 0.0 1 66 101 167 101 227 0.86 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_25 - 121 CTP_transf_2 PF01467.21 157 0.0017 12.0 0.0 1 1 1.2e-05 0.002 11.8 0.0 32 64 7 38 2 93 0.70 # 16358 # 16720 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 5_11 - 126 Cpn60_TCP1 PF00118.19 485 2.5e-26 85.9 0.0 1 1 3.6e-28 2.9e-26 85.6 0.0 388 483 10 102 4 104 0.95 # 7679 # 8056 # 1 # ID=5_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.672 7_6 - 114 Cpn60_TCP1 PF00118.19 485 0.00018 13.8 0.1 1 1 2.3e-06 0.00019 13.7 0.1 457 484 64 91 39 92 0.92 # 2197 # 2538 # 1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.635 2_8 - 249 TIGR00382 TIGR00382 414 0.00014 14.2 0.0 1 1 1.2e-06 0.0002 13.7 0.0 117 138 98 119 75 123 0.87 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 3_4 - 519 Eco57I PF07669.6 106 7.7e-07 23.1 0.1 1 2 2.3e-07 3.7e-05 17.7 0.0 3 104 294 406 291 408 0.81 # 4931 # 6487 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 3_4 - 519 Eco57I PF07669.6 106 7.7e-07 23.1 0.1 2 2 0.014 2.3 2.2 0.1 54 85 412 444 409 461 0.79 # 4931 # 6487 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_64 - 378 TIGR00065 TIGR00065 353 0.00086 11.9 0.0 1 1 7.3e-06 0.0012 11.5 0.0 146 175 50 80 46 110 0.72 # 44221 # 45354 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_51 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1e-36 120.1 0.0 1 2 1.2e-15 1.9e-13 44.0 0.0 1 114 21 124 21 137 0.89 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 1_51 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1e-36 120.1 0.0 2 2 5.4e-25 8.8e-23 74.5 0.0 169 228 141 200 126 203 0.90 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 1_32 - 284 rve_2 PF13333.1 52 3e-23 75.3 1.1 1 1 9.1e-25 7.5e-23 74.0 1.1 1 51 224 278 224 279 0.96 # 21907 # 22758 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 3_9 - 125 rve_2 PF13333.1 52 5.7e-09 29.6 0.1 1 1 1.6e-10 1.3e-08 28.4 0.0 1 50 58 112 58 114 0.86 # 7805 # 8179 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_55 - 389 MerR_1 PF13411.1 69 0.00059 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.0017 11.7 0.0 2 44 41 88 40 105 0.75 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_15 - 616 AAA_16 PF13191.1 185 4e-06 20.5 0.0 1 1 3.2e-07 2.6e-05 17.9 0.0 21 60 65 105 62 147 0.81 # 15938 # 17785 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 2_8 - 249 AAA_16 PF13191.1 185 8.8e-06 19.4 0.3 1 1 3.6e-07 3e-05 17.7 0.1 25 52 99 132 76 164 0.74 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 7_3 - 246 NodS PF05401.6 201 4.3e-08 26.4 0.0 1 1 4.2e-10 6.9e-08 25.7 0.0 41 120 27 106 7 116 0.86 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 2_8 - 249 AAA_22 PF13401.1 131 0.00014 15.7 0.2 1 1 2.4e-06 0.0004 14.1 0.2 5 49 99 138 95 183 0.80 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_8 - 249 TIGR00362 TIGR00362 437 3.3e-10 32.8 0.0 1 1 2.7e-12 4.4e-10 32.4 0.0 140 237 101 196 82 203 0.85 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 8_5 - 139 HTH_AraC PF00165.18 42 1.7e-21 69.1 2.3 1 2 5.2e-12 4.3e-10 32.8 0.0 1 42 37 78 37 78 0.97 # 2948 # 3364 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 8_5 - 139 HTH_AraC PF00165.18 42 1.7e-21 69.1 2.3 2 2 7.1e-13 5.9e-11 35.6 1.1 2 42 90 128 89 128 0.95 # 2948 # 3364 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 1_55 - 389 HTH_AraC PF00165.18 42 0.0015 12.1 0.0 1 1 3.6e-05 0.0029 11.1 0.0 4 26 35 57 33 62 0.81 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 6_6 - 187 NUMOD1 PF07453.8 37 0.00088 12.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.0018 11.8 0.0 19 37 164 182 164 182 0.94 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_8 - 249 AAA_29 PF13555.1 62 0.00017 14.7 0.2 1 2 4.7e-06 0.00077 12.6 0.1 22 37 98 112 88 118 0.80 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_8 - 249 AAA_29 PF13555.1 62 0.00017 14.7 0.2 2 2 0.095 16 -1.2 0.0 35 43 210 218 198 229 0.62 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 6_6 - 187 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 5.4e-05 16.5 0.0 1 1 1.3e-06 0.0001 15.6 0.0 10 42 157 185 151 186 0.86 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 5_7 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00015 15.0 0.0 1 1 3.9e-06 0.00032 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 2_8 - 249 SRP54 PF00448.17 196 0.00037 13.6 0.1 1 2 2.8e-05 0.0045 10.0 0.1 3 33 100 130 98 136 0.92 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_8 - 249 SRP54 PF00448.17 196 0.00037 13.6 0.1 2 2 0.013 2.2 1.3 0.0 82 124 158 200 151 218 0.87 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_8 - 249 AAA_28 PF13521.1 163 0.00016 15.3 0.0 1 1 1.6e-06 0.00027 14.5 0.0 2 27 101 130 100 167 0.82 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 12_1 - 177 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 1.4e-10 34.7 0.0 1 1 1.3e-12 2.2e-10 34.1 0.0 5 108 68 171 65 176 0.83 # 2 # 532 # 1 # ID=12_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.580 1_26 - 76 IF2_assoc PF08364.6 41 0.0036 11.0 2.8 1 2 0.043 7.1 0.4 0.3 19 29 6 16 3 16 0.78 # 16754 # 16981 # -1 # ID=1_26;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 1_26 - 76 IF2_assoc PF08364.6 41 0.0036 11.0 2.8 2 2 2.7e-05 0.0044 10.7 0.1 16 32 28 44 27 51 0.85 # 16754 # 16981 # -1 # ID=1_26;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 1_4 - 512 Mnd1 PF03962.10 188 0.048 6.9 8.8 1 2 7e-05 0.012 8.9 4.4 71 139 23 91 11 101 0.76 # 1006 # 2541 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.600 1_4 - 512 Mnd1 PF03962.10 188 0.048 6.9 8.8 2 2 0.06 9.8 -0.6 0.1 110 154 374 418 347 444 0.63 # 1006 # 2541 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.600 1_33 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 6.6e-10 33.3 0.3 1 2 3.2e-06 0.00018 15.9 0.0 2 57 39 88 38 92 0.82 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_33 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 6.6e-10 33.3 0.3 2 2 4.6e-06 0.00025 15.5 0.2 1 45 96 141 96 167 0.71 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 11_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 2.1e-06 22.1 0.2 1 1 1.7e-07 9.2e-06 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 64 # 768 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 6_6 - 187 HTH_32 PF13565.1 77 0.0012 13.3 5.4 1 1 7.9e-05 0.0043 11.5 3.5 7 77 124 182 119 182 0.68 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 4_7 - 514 A2L_zn_ribbon PF08792.5 33 0.011 8.9 4.7 1 2 0.00018 0.03 7.5 0.6 5 29 76 101 74 102 0.90 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 4_7 - 514 A2L_zn_ribbon PF08792.5 33 0.011 8.9 4.7 2 2 0.0078 1.3 2.3 0.3 20 28 446 454 444 457 0.62 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 3_7 - 60 HTH_3 PF01381.17 55 0.0004 13.8 0.1 1 1 6e-06 0.0005 13.6 0.1 4 44 2 42 1 44 0.88 # 7276 # 7455 # 1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 6_6 - 187 HTH_3 PF01381.17 55 0.00069 13.1 0.4 1 1 2.3e-05 0.0019 11.7 0.4 2 31 152 183 151 184 0.86 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 6_5 - 86 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 7.9e-07 21.1 0.3 1 1 5.3e-09 8.7e-07 21.0 0.3 365 438 10 83 6 85 0.92 # 1905 # 2162 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.368 1_33 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 6.9e-13 41.5 0.6 1 2 2.9e-09 5.2e-08 26.0 0.0 5 49 9 54 6 55 0.89 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_33 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 6.9e-13 41.5 0.6 2 2 4.2e-05 0.00077 12.8 0.4 3 50 64 113 62 113 0.90 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_37 - 653 HTH_23 PF13384.1 50 7.6e-06 19.1 0.0 1 1 6.7e-06 0.00012 15.3 0.0 13 40 149 176 143 180 0.91 # 24641 # 26599 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 11_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 9.9e-06 18.8 0.7 1 1 1.7e-05 0.00031 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_7 - 514 HTH_23 PF13384.1 50 2.5e-05 17.5 1.2 1 1 3.1e-06 5.7e-05 16.4 0.1 6 47 10 52 5 55 0.82 # 4926 # 6467 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 6_6 - 187 HTH_23 PF13384.1 50 3.8e-05 16.9 1.3 1 1 2.6e-06 4.8e-05 16.6 0.1 10 39 151 183 148 184 0.82 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 5_7 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 7.2e-05 16.0 0.3 1 1 4e-06 7.2e-05 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 8_2 - 208 HTH_23 PF13384.1 50 0.00041 13.6 0.0 1 1 5.9e-05 0.0011 12.3 0.0 10 39 13 47 11 56 0.81 # 244 # 867 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_2 - 135 HTH_23 PF13384.1 50 0.00045 13.5 0.0 1 1 3.9e-05 0.00071 12.9 0.0 7 44 19 57 14 62 0.85 # 209 # 613 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_63 - 95 HTH_23 PF13384.1 50 0.00048 13.4 0.0 1 1 4.2e-05 0.00076 12.8 0.0 18 39 46 67 37 69 0.85 # 43917 # 44201 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 6_6 - 187 HTH_7 PF02796.10 45 2e-16 53.3 0.3 1 1 4.7e-18 3.9e-16 52.3 0.3 1 44 141 184 141 185 0.98 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 5_7 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 3.8e-13 42.7 1.1 1 1 1e-14 8.4e-13 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 4_7 - 514 Ribosomal_S27e PF01667.12 55 0.00014 15.0 0.8 1 1 8.6e-07 0.00014 15.0 0.8 5 33 72 100 69 105 0.90 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 4_7 - 514 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.0093 9.3 4.0 1 2 0.00044 0.072 6.5 0.1 1 12 73 84 73 87 0.82 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 4_7 - 514 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.0093 9.3 4.0 2 2 0.0063 1 2.8 0.0 5 14 96 105 95 113 0.81 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_33 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 8e-13 42.2 0.3 1 2 6.4e-08 3.5e-06 20.8 0.0 16 76 26 81 11 88 0.82 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_33 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 8e-13 42.2 0.3 2 2 1e-08 5.7e-07 23.3 0.3 1 76 68 145 68 167 0.78 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 2_7 - 514 HTH_29 PF13551.1 112 1e-05 19.3 0.6 1 2 8.6e-06 0.00047 13.9 0.0 5 43 14 53 10 116 0.84 # 4926 # 6467 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 2_7 - 514 HTH_29 PF13551.1 112 1e-05 19.3 0.6 2 2 0.058 3.2 1.6 0.1 70 90 393 416 361 432 0.65 # 4926 # 6467 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 5_7 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00017 15.3 0.6 1 2 0.074 4 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 5_7 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00017 15.3 0.6 2 2 3.1e-05 0.0017 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 6_3 - 214 TIGR03413 TIGR03413 248 2.4e-06 20.4 0.0 1 1 3.5e-08 2.9e-06 20.1 0.0 41 146 56 173 16 183 0.73 # 1024 # 1665 # -1 # ID=6_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 4_3 - 271 TIGR03413 TIGR03413 248 5.1e-06 19.3 0.7 1 1 1.4e-07 1.1e-05 18.2 0.7 20 96 84 165 76 251 0.71 # 623 # 1435 # 1 # ID=4_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_41 - 188 Met_10 PF02475.11 200 0.0003 14.0 0.0 1 1 2.5e-06 0.00041 13.6 0.0 94 189 43 132 29 145 0.81 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 1_4 - 512 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 9.5e-104 339.9 0.0 1 1 1.2e-105 9.5e-104 339.9 0.0 1 271 175 462 175 462 0.98 # 1006 # 2541 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.600 11_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.8e-12 39.5 0.3 1 1 6e-14 4.9e-12 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_3 - 246 Methyltransf_31 PF13847.1 152 1.8e-07 24.5 0.1 1 1 4.6e-09 2.5e-07 24.0 0.1 2 76 28 97 27 213 0.87 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 1_41 - 188 Methyltransf_31 PF13847.1 152 3.3e-07 23.6 0.0 1 1 7.4e-09 4e-07 23.3 0.0 5 119 52 162 48 183 0.84 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 3_4 - 519 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.0002 14.6 0.0 1 1 1e-05 0.00055 13.1 0.0 3 84 217 308 215 378 0.68 # 4931 # 6487 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 2_8 - 249 PhoH PF02562.11 205 1.2e-05 18.2 0.1 1 2 2.7e-07 4.5e-05 16.3 0.0 19 47 98 126 87 136 0.86 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_8 - 249 PhoH PF02562.11 205 1.2e-05 18.2 0.1 2 2 0.064 11 -1.2 0.0 138 177 152 190 143 199 0.69 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_8 - 249 AAA_5 PF07728.9 139 0.0013 12.1 0.5 1 1 2.1e-05 0.0035 10.7 0.1 1 34 100 136 100 167 0.81 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 3_2 - 1039 ResIII PF04851.10 184 2.5e-36 118.8 0.7 1 1 1.8e-37 1.5e-35 116.3 0.1 3 183 271 439 269 440 0.90 # 413 # 3529 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 2_8 - 249 ResIII PF04851.10 184 4.2e-05 17.0 0.0 1 1 7.2e-07 5.9e-05 16.5 0.0 18 47 88 120 50 143 0.79 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_15 - 616 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.3e-150 494.1 0.0 1 1 5.1e-152 2.8e-150 493.8 0.0 2 386 55 444 54 444 0.99 # 15938 # 17785 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_15 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 8e-07 21.5 0.1 1 2 7.2e-08 3.9e-06 19.2 0.0 15 53 479 517 470 547 0.80 # 8776 # 11403 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_15 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 8e-07 21.5 0.1 2 2 0.077 4.2 -0.6 0.0 261 317 713 769 699 772 0.92 # 8776 # 11403 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 2_8 - 249 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.001 11.3 0.0 1 1 2.7e-05 0.0015 10.7 0.0 14 43 97 126 84 144 0.84 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_55 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 7.2e-08 25.3 0.1 1 2 2.6e-06 0.00043 13.0 0.0 3 37 108 142 106 145 0.93 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_55 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 7.2e-08 25.3 0.1 2 2 1.5e-05 0.0025 10.4 0.0 104 145 227 268 215 340 0.81 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 10_2 - 123 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 2.2e-05 17.7 0.0 1 1 3.4e-07 2.8e-05 17.3 0.0 74 155 9 104 1 107 0.63 # 496 # 864 # -1 # ID=10_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 2_17 - 101 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 5.3e-05 16.5 0.0 1 1 8e-07 6.6e-05 16.2 0.0 74 139 9 90 1 98 0.68 # 18582 # 18884 # -1 # ID=2_17;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.558 2_8 - 249 AAA_18 PF13238.1 129 0.0002 15.3 0.1 1 1 3e-06 0.00049 14.0 0.0 1 45 101 147 101 205 0.72 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 10_2 - 123 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 1.9e-09 31.2 0.2 1 1 3e-11 2.5e-09 30.9 0.2 62 123 52 110 39 112 0.80 # 496 # 864 # -1 # ID=10_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 2_17 - 101 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 6.5e-07 23.0 0.2 1 1 9.9e-09 8.1e-07 22.7 0.2 58 112 48 99 39 100 0.78 # 18582 # 18884 # -1 # ID=2_17;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.558 1_51 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.0013 11.9 0.0 1 2 0.045 7.4 -0.3 0.0 53 79 4 29 2 32 0.90 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 1_51 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.0013 11.9 0.0 2 2 4.2e-05 0.007 9.5 0.0 3 31 166 194 164 209 0.86 # 34666 # 35349 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 6_6 - 187 HTH_psq PF05225.11 45 0.0002 14.5 0.0 1 1 5e-06 0.00041 13.5 0.0 21 39 166 184 165 186 0.91 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_33 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.00071 12.8 0.2 1 2 0.037 3 1.1 0.0 23 31 29 37 28 37 0.87 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_33 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.00071 12.8 0.2 2 2 0.00014 0.012 8.9 0.1 10 26 73 89 72 89 0.85 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_41 - 188 Methyltransf_12 PF08242.7 99 3.4e-05 17.9 0.0 1 1 3.7e-07 6.1e-05 17.1 0.0 1 99 55 144 55 144 0.84 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 1_41 - 188 Methyltrans_SAM PF10672.4 286 0.0017 10.8 0.0 1 1 1.5e-05 0.0025 10.3 0.0 197 261 114 173 105 180 0.78 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 1_15 - 876 DUF87 PF01935.12 229 3.9e-07 23.7 0.0 1 1 6.9e-09 1.1e-06 22.2 0.0 26 222 482 669 468 676 0.77 # 8776 # 11403 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_33 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 7e-25 80.3 0.3 1 2 2.9e-13 9.6e-12 38.4 0.0 1 50 10 60 10 61 0.93 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_33 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 7e-25 80.3 0.3 2 2 1e-13 3.4e-12 39.8 0.2 2 47 68 115 67 121 0.93 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_2 - 135 HTH_28 PF13518.1 52 5.4e-06 20.0 0.0 1 1 2.6e-07 8.5e-06 19.4 0.0 1 39 18 57 18 63 0.91 # 209 # 613 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 6_6 - 187 HTH_28 PF13518.1 52 7.9e-05 16.3 0.1 1 1 2.4e-06 7.9e-05 16.3 0.1 9 34 158 183 147 184 0.84 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 11_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 9.5e-05 16.0 1.2 1 1 1.3e-05 0.00042 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 64 # 768 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 5_7 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.00022 14.8 0.0 1 1 2.1e-05 0.0007 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 8_2 - 208 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.00016 15.1 0.0 1 1 1.7e-06 0.00027 14.3 0.0 26 77 15 64 2 68 0.78 # 244 # 867 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_7 - 514 HTH_24 PF13412.1 48 0.00033 13.7 1.2 1 2 5.7e-05 0.0094 9.0 0.1 16 46 22 51 8 51 0.81 # 4926 # 6467 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 2_7 - 514 HTH_24 PF13412.1 48 0.00033 13.7 1.2 2 2 0.0055 0.9 2.7 0.1 25 43 275 293 270 294 0.83 # 4926 # 6467 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 2_8 - 249 AAA_26 PF13500.1 199 0.00076 12.7 0.0 1 1 6.6e-06 0.0011 12.2 0.0 5 60 103 160 99 200 0.71 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_8 - 249 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 2.1e-05 18.2 0.0 1 1 2.9e-07 4.8e-05 17.0 0.0 20 111 97 202 85 229 0.65 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 8_5 - 139 HTH_18 PF12833.2 81 1.3e-23 76.5 2.0 1 1 1.1e-25 1.8e-23 76.1 2.0 1 81 50 129 50 129 0.97 # 2948 # 3364 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 3_4 - 519 TIGR03533 TIGR03533 284 7.1e-07 22.1 0.1 1 2 6.8e-08 5.5e-06 19.1 0.0 118 200 214 304 202 314 0.82 # 4931 # 6487 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 3_4 - 519 TIGR03533 TIGR03533 284 7.1e-07 22.1 0.1 2 2 0.039 3.2 0.2 0.1 172 208 446 480 398 500 0.79 # 4931 # 6487 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_41 - 188 TIGR03533 TIGR03533 284 5.8e-05 15.8 0.0 1 1 1.1e-06 8.9e-05 15.2 0.0 118 210 47 133 37 141 0.88 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 3_4 - 519 TIGR03534 TIGR03534 253 2.4e-10 33.5 0.0 1 1 1.6e-11 8.5e-10 31.7 0.0 85 166 214 303 197 350 0.76 # 4931 # 6487 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_41 - 188 TIGR03534 TIGR03534 253 7.6e-08 25.4 0.0 1 1 1.6e-09 8.9e-08 25.1 0.0 80 175 44 131 12 148 0.88 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 7_3 - 246 TIGR03534 TIGR03534 253 1.1e-06 21.6 0.0 1 1 3.7e-08 2e-06 20.7 0.0 73 166 14 103 12 119 0.80 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 6_6 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 1.9e-05 17.8 0.2 1 2 0.055 9 -0.3 0.1 3 18 124 139 123 154 0.71 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 6_6 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 1.9e-05 17.8 0.2 2 2 8.6e-07 0.00014 15.0 0.0 27 45 165 183 162 185 0.93 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 3_2 - 1039 DEAD PF00270.24 169 5e-09 29.4 0.0 1 1 2e-10 1.7e-08 27.8 0.0 22 142 308 424 293 441 0.75 # 413 # 3529 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 2_8 - 249 DEAD PF00270.24 169 0.0001 15.4 0.0 1 1 1.7e-06 0.00014 15.0 0.0 14 62 98 143 84 197 0.87 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_55 - 389 HTH_31 PF13560.1 64 0.00021 15.1 0.4 1 1 3.8e-06 0.00062 13.6 0.2 12 45 37 69 31 73 0.87 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 7_3 - 246 Methyltransf_32 PF13679.1 141 2e-05 17.9 0.0 1 1 1.9e-07 3.1e-05 17.3 0.0 12 70 17 68 9 121 0.82 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 2_8 - 249 DUF2075 PF09848.4 352 0.0015 11.1 0.0 1 1 1.3e-05 0.0021 10.6 0.0 1 50 98 144 98 160 0.81 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_14 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.1e-07 24.7 0.7 1 2 0.013 2.1 2.2 0.0 6 44 1227 1265 1223 1295 0.74 # 10668 # 15938 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 2_14 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.1e-07 24.7 0.7 2 2 4.2e-08 6.9e-06 19.8 0.2 3 102 1341 1444 1339 1446 0.77 # 10668 # 15938 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 7_3 - 246 TIGR00755 TIGR00755 256 2.6e-44 144.7 2.8 1 1 3.9e-46 3.2e-44 144.4 2.8 5 227 5 221 1 235 0.88 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 1_41 - 188 TIGR00755 TIGR00755 256 2.8e-08 26.6 0.0 1 1 4.5e-10 3.7e-08 26.2 0.0 8 105 29 123 25 134 0.88 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 2_8 - 249 T2SE PF00437.15 272 4.7e-06 19.2 0.0 1 1 4.3e-08 7.1e-06 18.6 0.0 99 148 67 118 29 126 0.81 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_8 - 249 NACHT PF05729.7 166 0.0006 13.1 1.2 1 1 1e-05 0.0017 11.6 0.7 3 24 101 122 99 190 0.90 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_8 - 249 AAA_17 PF13207.1 121 3.2e-06 21.6 0.5 1 1 8.4e-08 6.9e-06 20.5 0.1 2 64 101 173 100 231 0.62 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_15 - 616 AAA_17 PF13207.1 121 0.0004 14.8 0.0 1 1 1.9e-05 0.0016 12.9 0.0 3 27 72 100 70 145 0.68 # 15938 # 17785 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_4 - 512 DZR PF12773.2 50 0.00012 15.6 0.7 1 1 2.7e-06 0.00022 14.7 0.7 10 41 115 166 110 170 0.88 # 1006 # 2541 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.600 4_7 - 514 DZR PF12773.2 50 0.0097 9.4 4.8 1 2 0.0033 0.27 4.8 3.4 1 20 77 101 64 109 0.61 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 4_7 - 514 DZR PF12773.2 50 0.0097 9.4 4.8 2 2 0.011 0.87 3.1 0.0 13 23 448 458 441 487 0.75 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 1_68 - 713 TIGR02211 TIGR02211 221 1.4e-05 18.0 0.0 1 1 1.9e-07 3.2e-05 16.8 0.0 127 203 406 489 393 507 0.77 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 2_8 - 249 AAA_25 PF13481.1 194 2.2e-07 24.1 0.1 1 1 2.9e-09 4.7e-07 23.0 0.1 28 63 93 129 83 197 0.72 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 2_14 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0005 13.2 0.1 1 2 0.00026 0.042 6.9 0.0 1 23 988 1012 988 1192 0.71 # 10668 # 15938 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 2_14 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0005 13.2 0.1 2 2 0.0033 0.55 3.3 0.0 170 234 1386 1447 1342 1447 0.61 # 10668 # 15938 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 7_3 - 246 DOT1 PF08123.8 205 5.4e-05 16.2 0.2 1 1 8.2e-07 0.00013 14.9 0.0 28 88 15 73 11 100 0.79 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 4_5 - 157 PRAI PF00697.17 197 1.8e-36 119.1 0.0 1 1 1.2e-38 2e-36 119.0 0.0 51 194 1 149 1 152 0.92 # 1977 # 2447 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.665 1_15 - 876 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0015 11.4 0.0 1 1 2.3e-05 0.0038 10.1 0.0 7 38 473 504 469 519 0.85 # 8776 # 11403 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 2_8 - 249 AAA_14 PF13173.1 128 0.00018 15.0 0.0 1 1 1.8e-06 0.0003 14.3 0.0 3 72 99 170 97 240 0.74 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_55 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00011 14.9 0.1 1 2 0.00028 0.046 6.3 0.0 4 42 109 147 107 154 0.91 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_55 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00011 14.9 0.1 2 2 0.0003 0.049 6.2 0.1 84 139 235 290 222 312 0.77 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_33 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 1e-07 25.4 0.1 1 2 0.00077 0.13 5.9 0.0 58 81 31 54 20 57 0.87 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_33 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 1e-07 25.4 0.1 2 2 2e-07 3.2e-05 17.4 0.2 39 86 69 117 66 121 0.89 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_55 - 389 MerR PF00376.18 38 6.2e-07 22.6 0.0 1 1 8.8e-09 1.4e-06 21.4 0.0 1 28 41 68 41 74 0.95 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 6_6 - 187 CENP-B_N PF04218.8 53 4.8e-06 19.6 0.0 1 1 1.1e-07 8.8e-06 18.7 0.0 17 43 156 182 152 186 0.92 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 8_2 - 208 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00082 12.4 0.0 1 1 2e-05 0.0016 11.5 0.0 26 51 28 53 23 55 0.90 # 244 # 867 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_15 - 616 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 8.2e-10 31.4 0.0 1 1 2.9e-11 2.4e-09 29.8 0.0 264 361 265 359 81 383 0.83 # 15938 # 17785 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_15 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00043 12.5 0.0 1 2 0.0046 0.38 2.8 0.0 105 182 533 604 470 627 0.83 # 8776 # 11403 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_15 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00043 12.5 0.0 2 2 0.00018 0.015 7.4 0.0 319 378 711 769 653 771 0.86 # 8776 # 11403 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 8_5 - 139 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.0022 11.5 1.8 1 2 0.0059 0.96 2.9 0.1 41 73 2 29 1 35 0.56 # 2948 # 3364 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 8_5 - 139 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.0022 11.5 1.8 2 2 0.00012 0.02 8.4 0.1 50 87 90 128 50 135 0.79 # 2948 # 3364 # 1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 1_41 - 188 MTS PF05175.9 170 3.7e-09 29.8 0.0 1 1 9.4e-11 5.1e-09 29.3 0.0 24 141 45 149 41 166 0.85 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 7_3 - 246 MTS PF05175.9 170 1e-07 25.1 0.0 1 1 3e-09 1.7e-07 24.4 0.0 24 118 22 113 9 121 0.85 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 3_4 - 519 MTS PF05175.9 170 7.1e-06 19.1 0.8 1 1 3.9e-07 2.1e-05 17.5 0.0 31 140 217 355 201 374 0.82 # 4931 # 6487 # -1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 7_3 - 246 Methyltransf_23 PF13489.1 161 1.6e-06 21.5 0.1 1 1 5.9e-08 4.8e-06 20.0 0.1 7 60 16 85 9 225 0.83 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 5_9 - 252 Methyltransf_23 PF13489.1 161 0.00059 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.00088 12.6 0.0 7 52 89 132 82 198 0.78 # 6259 # 7014 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 2_8 - 249 APS_kinase PF01583.15 157 6.5e-05 16.2 0.0 1 1 1.3e-06 0.00021 14.6 0.0 5 35 101 131 98 139 0.92 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 13_1 - 133 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1e-79 258.6 0.9 1 1 3.6e-81 1.2e-79 258.4 0.9 1 130 4 133 4 133 0.99 # 3 # 401 # -1 # ID=13_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.554 2_16 - 168 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.9e-76 247.0 1.7 1 1 1.4e-77 4.7e-76 246.8 1.7 1 131 37 167 37 167 0.99 # 17834 # 18337 # -1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 1_71 - 43 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.5e-22 73.7 0.6 1 1 5e-24 1.6e-22 73.6 0.6 90 131 1 42 1 42 0.99 # 54519 # 54647 # -1 # ID=1_71;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.496 8_1 - 43 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.5e-22 73.7 0.6 1 1 5e-24 1.6e-22 73.6 0.6 90 131 1 42 1 42 0.99 # 3 # 131 # 1 # ID=8_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.496 8_7 - 43 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.5e-22 73.7 0.6 1 1 5e-24 1.6e-22 73.6 0.6 90 131 1 42 1 42 0.99 # 3902 # 4030 # -1 # ID=8_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.496 1_27 - 226 Phage_antitermQ PF06530.7 126 0.0012 12.0 0.1 1 1 1.2e-05 0.002 11.3 0.1 58 110 141 193 136 201 0.83 # 17069 # 17746 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.317 4_7 - 514 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0073 9.6 3.9 1 2 0.0004 0.065 6.5 0.1 1 12 73 84 73 87 0.82 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 4_7 - 514 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0073 9.6 3.9 2 2 0.0051 0.84 3.0 0.0 5 14 96 105 95 113 0.81 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 11_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.2e-52 171.2 0.0 1 1 3.2e-54 1.7e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 64 # 768 # 1 # ID=11_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_32 - 284 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 9.1e-12 38.7 0.0 1 1 3e-13 1.6e-11 37.9 0.0 2 137 123 261 122 264 0.92 # 21907 # 22758 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 3_9 - 125 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.5e-05 17.9 0.0 1 1 4.9e-07 2.7e-05 17.8 0.0 50 139 6 98 1 99 0.75 # 7805 # 8179 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 4_7 - 514 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.00045 13.8 7.4 1 2 0.00046 0.038 7.6 5.0 7 35 76 102 75 106 0.81 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 4_7 - 514 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.00045 13.8 7.4 2 2 0.0016 0.13 5.9 0.0 8 24 450 466 437 470 0.75 # 3802 # 5343 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.555 7_7 - 494 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0059 10.2 6.7 1 2 0.0028 0.23 5.1 4.6 8 35 84 109 83 114 0.87 # 2765 # 4246 # 1 # ID=7_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 7_7 - 494 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0059 10.2 6.7 2 2 0.0053 0.43 4.2 0.0 22 38 454 469 447 473 0.76 # 2765 # 4246 # 1 # ID=7_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 6_6 - 187 HTH_11 PF08279.7 55 0.0002 14.6 0.1 1 2 0.076 12 -0.7 0.0 33 47 74 88 72 95 0.66 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 6_6 - 187 HTH_11 PF08279.7 55 0.0002 14.6 0.1 2 2 1.3e-05 0.0021 11.4 0.0 20 37 166 183 162 184 0.91 # 2238 # 2798 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 5_7 - 186 TrmB PF01978.14 68 9.1e-05 15.8 0.0 1 1 1.1e-06 0.00019 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 5_2 - 305 LYTB PF02401.13 281 0.0011 11.4 0.0 1 1 2e-05 0.0033 9.9 0.0 236 272 81 117 70 124 0.91 # 197 # 1111 # 1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 8_4 - 223 UPF0122 PF04297.9 101 7.9e-05 16.3 1.4 1 1 1.1e-06 0.00018 15.1 1.4 3 76 29 102 26 125 0.83 # 2267 # 2935 # -1 # ID=8_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 1_63 - 95 Phage_terminase PF10668.4 60 1.8e-06 21.3 0.0 1 1 1.8e-08 2.9e-06 20.7 0.0 26 46 49 69 43 70 0.83 # 43917 # 44201 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 1_15 - 876 AAA_10 PF12846.2 304 7.4e-49 160.3 0.0 1 1 2.3e-50 1.3e-48 159.6 0.0 1 294 479 768 479 774 0.89 # 8776 # 11403 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 2_15 - 616 AAA_10 PF12846.2 304 1.4e-10 34.7 0.0 1 1 4.8e-11 2.6e-09 30.5 0.0 3 296 70 377 69 383 0.69 # 15938 # 17785 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 2_8 - 249 AAA_10 PF12846.2 304 0.00013 15.0 0.1 1 1 4.7e-06 0.00026 14.1 0.1 2 33 99 130 98 132 0.92 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 5_7 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 3.3e-06 20.5 0.2 1 2 0.015 0.61 3.6 0.0 33 52 8 27 4 28 0.91 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 5_7 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 3.3e-06 20.5 0.2 2 2 3.6e-05 0.0015 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 4489 # 5046 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 3_10 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.00013 15.4 0.0 1 2 0.0029 0.12 5.9 0.0 24 47 102 125 97 125 0.89 # 8975 # 9952 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 3_10 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.00013 15.4 0.0 2 2 0.0014 0.056 6.9 0.1 19 58 213 259 185 262 0.77 # 8975 # 9952 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.525 1_32 - 284 HTH_20 PF12840.2 61 0.0002 14.8 0.0 1 1 9.4e-06 0.00039 13.9 0.0 27 50 13 36 1 41 0.80 # 21907 # 22758 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 8_2 - 208 HTH_20 PF12840.2 61 0.00098 12.6 0.0 1 1 5.5e-05 0.0022 11.4 0.0 21 46 21 46 12 61 0.84 # 244 # 867 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 7_3 - 246 PCMT PF01135.14 210 1.3e-06 21.7 0.0 1 1 1.6e-08 2.6e-06 20.7 0.0 58 122 14 75 2 87 0.83 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 7_3 - 246 RrnaAD PF00398.15 262 4.9e-74 242.2 6.7 1 1 6.6e-76 5.4e-74 242.1 6.7 3 261 2 242 1 243 0.96 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 1_41 - 188 RrnaAD PF00398.15 262 7.9e-08 25.2 0.0 1 1 1.2e-09 9.9e-08 24.9 0.0 9 113 29 128 24 148 0.87 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 1_41 - 188 Methyltransf_18 PF12847.2 112 2.6e-10 34.5 0.0 1 1 6.8e-12 5.5e-10 33.5 0.0 4 109 53 146 50 148 0.88 # 28381 # 28944 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 7_3 - 246 Methyltransf_18 PF12847.2 112 2.2e-09 31.5 0.0 1 1 3.9e-11 3.2e-09 31.0 0.0 2 74 30 98 29 153 0.87 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 7_3 - 246 Methyltransf_11 PF08241.7 95 9.7e-05 16.5 0.0 1 1 1.2e-06 0.00019 15.5 0.0 2 59 35 92 34 100 0.85 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 1_68 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 8.9e-27 87.4 0.0 1 3 7.6e-12 1.3e-09 30.7 0.0 15 129 20 151 10 169 0.76 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_68 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 8.9e-27 87.4 0.0 2 3 3.5e-06 0.00058 12.0 0.0 240 390 195 383 184 388 0.60 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_68 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 8.9e-27 87.4 0.0 3 3 2.5e-15 4e-13 42.2 0.0 461 572 376 489 309 509 0.77 # 49848 # 51986 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_55 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.9e-06 20.1 0.4 1 2 1.7e-06 0.00027 13.6 0.1 9 36 115 142 109 151 0.89 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_55 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.9e-06 20.1 0.4 2 2 0.0011 0.18 4.3 0.0 123 136 231 244 221 251 0.84 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_55 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 1.6e-09 31.5 0.0 1 2 1.4e-08 2.3e-06 21.3 0.0 2 49 108 155 107 195 0.91 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_55 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 1.6e-09 31.5 0.0 2 2 0.00018 0.029 7.9 0.1 110 152 227 268 223 272 0.84 # 38474 # 39640 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 4_8 - 280 Pterin_bind PF00809.17 210 4.2e-58 189.7 0.0 1 1 3e-60 5e-58 189.5 0.0 1 210 7 216 7 216 0.98 # 5748 # 6587 # -1 # ID=4_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 2_8 - 249 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.2e-61 200.8 0.0 1 1 9.2e-64 1.5e-61 200.5 0.0 2 176 53 227 52 229 0.98 # 6482 # 7228 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_17 - 74 GATA PF00320.22 36 0.00043 13.3 0.5 1 2 0.0004 0.066 6.3 0.1 22 27 36 41 30 43 0.86 # 11563 # 11784 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_17 - 74 GATA PF00320.22 36 0.00043 13.3 0.5 2 2 0.00074 0.12 5.4 0.0 21 35 56 70 52 71 0.87 # 11563 # 11784 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 2_14 - 1757 AAA_11 PF13086.1 236 0.00031 13.9 3.4 1 1 2.1e-06 0.00034 13.8 0.0 2 75 969 1039 968 1059 0.81 # 10668 # 15938 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_39 - 180 SSB PF00436.20 104 4.6e-41 132.6 0.4 1 1 3.5e-43 5.8e-41 132.2 0.4 1 101 6 109 6 112 0.96 # 26961 # 27500 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_33 - 174 BrkDBD PF09607.5 58 0.0013 11.9 0.0 1 1 3.6e-05 0.0058 9.8 0.0 11 47 11 44 2 51 0.80 # 22755 # 23276 # -1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_32 - 284 HTH_21 PF13276.1 60 6.9e-17 54.9 4.2 1 2 4.2e-19 6.9e-17 54.9 4.2 6 60 43 96 38 97 0.90 # 21907 # 22758 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_32 - 284 HTH_21 PF13276.1 60 6.9e-17 54.9 4.2 2 2 0.041 6.7 0.5 0.1 44 56 199 211 185 215 0.73 # 21907 # 22758 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 7_3 - 246 TRM13 PF05206.9 259 0.00022 14.1 0.1 1 1 2.1e-06 0.00035 13.5 0.1 4 67 15 78 12 101 0.79 # 420 # 1157 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/38aa37ed-c7c6-41e0-8d67-89af60b25cee # Target file: checkm_output/bins/pm443/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm443/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/38aa37ed-c7c6-41e0-8d67-89af60b25cee checkm_output/bins/pm443/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:05:59 2017 # [ok]