# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_9 - 234 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 5e-06 19.2 0.0 1 2 0.00016 0.021 7.4 0.0 113 169 19 77 12 86 0.70 # 4413 # 5114 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_9 - 234 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 5e-06 19.2 0.0 2 2 3.1e-05 0.0039 9.8 0.0 20 60 149 188 142 225 0.73 # 4413 # 5114 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_56 - 342 HTH_IclR PF09339.5 52 2.4e-05 17.1 0.1 1 1 5.1e-07 6.4e-05 15.8 0.1 15 40 14 39 10 40 0.86 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_55 - 260 ABC_tran PF00005.22 137 0.00066 13.2 0.2 1 1 2e-05 0.0026 11.3 0.1 8 31 98 121 95 132 0.86 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_56 - 342 HTH_22 PF13309.1 64 0.00011 15.2 0.0 1 1 1.8e-06 0.00023 14.2 0.0 44 64 19 39 16 39 0.94 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_12 - 324 DDR PF08841.5 332 3.9e-05 15.8 1.6 1 2 1.8e-06 0.00023 13.3 0.1 120 161 151 193 121 207 0.78 # 6516 # 7487 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.568 1_12 - 324 DDR PF08841.5 332 3.9e-05 15.8 1.6 2 2 0.0068 0.85 1.5 0.1 240 287 242 285 207 294 0.62 # 6516 # 7487 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.568 1_14 - 424 Cdd1 PF11731.3 93 0.00039 13.6 0.1 1 1 1.1e-05 0.0013 11.9 0.0 10 47 177 214 144 236 0.87 # 8150 # 9421 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_20 - 676 N6_Mtase PF02384.11 311 1.6e-52 171.7 0.0 1 1 5.9e-54 2.5e-52 171.1 0.0 5 275 155 460 152 472 0.84 # 14477 # 16504 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 3_13 - 278 N6_Mtase PF02384.11 311 4.4e-12 38.9 0.0 1 1 1.7e-13 7e-12 38.2 0.0 25 117 139 237 130 250 0.85 # 7375 # 8208 # 1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.565 4_2 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00012 14.4 0.0 1 2 7.9e-05 0.0033 9.7 0.0 28 71 32 75 21 93 0.82 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 4_2 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00012 14.4 0.0 2 2 0.017 0.71 2.0 0.0 124 138 111 125 95 133 0.81 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_56 - 342 rve_3 PF13683.1 67 7.2e-09 28.4 0.0 1 1 1.2e-10 1.5e-08 27.3 0.0 2 66 216 288 215 288 0.93 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_56 - 342 HTH_DeoR PF08220.7 57 0.00053 12.8 1.2 1 1 1e-05 0.0013 11.5 0.5 9 34 13 37 4 40 0.82 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 2_16 - 880 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00014 14.6 0.0 1 1 2.7e-06 0.00034 13.3 0.0 39 63 480 506 466 508 0.85 # 10866 # 13505 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_56 - 342 HTH_38 PF13936.1 44 5.3e-11 35.2 0.8 1 1 3.6e-12 1.1e-10 34.1 0.8 5 42 2 39 1 40 0.97 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_44 - 202 HTH_38 PF13936.1 44 6.2e-08 25.4 1.0 1 1 7e-09 2.2e-07 23.6 0.0 15 44 168 197 160 197 0.93 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_17 - 325 HTH_38 PF13936.1 44 5.6e-05 15.9 0.2 1 2 0.074 2.3 1.1 0.2 5 29 128 154 126 157 0.77 # 12242 # 13216 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_17 - 325 HTH_38 PF13936.1 44 5.6e-05 15.9 0.2 2 2 3.5e-05 0.0011 11.8 0.0 16 39 158 181 156 183 0.94 # 12242 # 13216 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_46 - 207 HTH_38 PF13936.1 44 0.0014 11.5 0.1 1 1 4.5e-05 0.0014 11.5 0.1 13 39 172 199 164 202 0.82 # 40945 # 41565 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_46 - 207 SpoIIID PF12116.3 82 0.00073 12.7 1.2 1 2 0.0073 0.92 2.8 0.1 34 71 109 147 103 158 0.79 # 40945 # 41565 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_46 - 207 SpoIIID PF12116.3 82 0.00073 12.7 1.2 2 2 0.00021 0.026 7.7 0.0 18 38 179 199 171 203 0.85 # 40945 # 41565 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_56 - 342 HTH_8 PF02954.14 42 2.3e-05 17.1 0.6 1 1 3.3e-07 4.2e-05 16.3 0.1 12 37 11 36 5 40 0.91 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 2_36 - 1754 AAA_19 PF13245.1 76 2.5e-06 20.4 0.4 1 1 4e-08 2.5e-06 20.4 0.4 8 74 984 1047 976 1051 0.71 # 30498 # 35759 # 1 # ID=2_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_55 - 260 AAA_19 PF13245.1 76 0.00085 12.3 0.2 1 1 5.3e-05 0.0033 10.5 0.0 11 35 103 126 95 157 0.81 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_16 - 402 CbiA PF01656.18 195 1.1e-23 76.9 0.1 1 1 3.7e-25 2.4e-23 75.8 0.0 1 148 112 299 112 346 0.76 # 11040 # 12245 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_55 - 260 CbiA PF01656.18 195 0.0012 11.5 0.0 1 1 2.5e-05 0.0016 11.1 0.0 3 42 105 145 104 254 0.75 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_44 - 202 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.6e-06 20.8 0.0 1 1 1.2e-07 5.1e-06 19.2 0.0 17 44 165 191 165 199 0.86 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_56 - 342 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 2.2e-06 20.3 0.6 1 1 2.6e-07 1.1e-05 18.1 0.0 25 48 16 39 5 40 0.92 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_17 - 325 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0004 13.1 0.0 1 1 2.5e-05 0.001 11.8 0.0 23 48 159 184 155 187 0.88 # 12242 # 13216 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_15 - 299 Rep_3 PF01051.16 222 1.3e-26 86.8 0.0 1 1 2.1e-28 2.6e-26 85.8 0.0 1 212 20 272 20 279 0.83 # 9822 # 10718 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 1_56 - 342 rve PF00665.21 120 6.6e-23 74.4 0.0 1 1 1.9e-24 2.4e-22 72.5 0.0 3 119 118 243 117 244 0.96 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_55 - 260 AFG1_ATPase PF03969.11 362 0.00038 12.5 0.0 1 1 5.8e-06 0.00073 11.6 0.0 64 214 103 251 81 258 0.78 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_55 - 260 AAA_24 PF13479.1 213 0.0017 11.2 0.1 1 1 3e-05 0.0038 10.0 0.1 5 23 103 121 99 127 0.85 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_2 - 188 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2.3e-13 43.5 0.1 1 1 1.2e-14 3.7e-13 42.8 0.1 2 111 52 144 51 148 0.90 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_9 - 234 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3.3e-11 36.5 0.2 1 2 1.3e-06 4e-05 16.9 0.0 63 113 13 70 3 86 0.72 # 4413 # 5114 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_9 - 234 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3.3e-11 36.5 0.2 2 2 7.9e-07 2.5e-05 17.6 0.1 4 44 174 213 171 228 0.80 # 4413 # 5114 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_20 - 676 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.5e-08 27.9 0.0 1 1 1.1e-09 3.5e-08 26.7 0.0 4 88 210 310 208 391 0.75 # 14477 # 16504 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 3_13 - 278 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.00011 15.5 0.1 1 1 7.2e-06 0.00023 14.5 0.1 3 66 171 239 170 271 0.81 # 7375 # 8208 # 1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.565 2_36 - 1754 AAA_30 PF13604.1 196 1.9e-45 148.0 6.6 1 2 7.8e-07 9.8e-05 15.2 0.8 9 126 424 536 422 561 0.85 # 30498 # 35759 # 1 # ID=2_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 2_36 - 1754 AAA_30 PF13604.1 196 1.9e-45 148.0 6.6 2 2 2.6e-43 3.2e-41 134.3 0.6 2 186 971 1158 970 1162 0.94 # 30498 # 35759 # 1 # ID=2_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_56 - 342 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.0001 15.5 0.2 1 2 2.7e-05 0.0034 10.6 0.0 22 46 16 40 8 68 0.81 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_56 - 342 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.0001 15.5 0.2 2 2 0.011 1.4 2.2 0.0 35 58 284 311 275 330 0.73 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_44 - 202 GerE PF00196.14 58 3.7e-05 16.3 0.0 1 1 1.5e-06 6.5e-05 15.5 0.0 11 35 166 190 165 201 0.88 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_56 - 342 GerE PF00196.14 58 0.00043 12.9 0.0 1 1 1.9e-05 0.00078 12.0 0.0 16 40 15 39 4 40 0.87 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 2_4 - 229 GerE PF00196.14 58 0.001 11.7 0.0 1 1 4e-05 0.0017 11.0 0.0 3 56 148 201 146 203 0.89 # 2980 # 3666 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 2_35 - 771 TraG-D_C PF12696.2 128 8.8e-20 64.1 0.0 1 1 1.6e-21 2e-19 63.0 0.0 1 127 419 541 419 542 0.88 # 28186 # 30498 # 1 # ID=2_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_55 - 260 Bac_DnaA PF00308.13 219 6.5e-09 28.9 0.0 1 1 7.8e-11 9.8e-09 28.4 0.0 36 136 103 201 90 209 0.84 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_16 - 402 MipZ PF09140.6 261 1.1e-06 21.1 0.4 1 2 3.3e-05 0.0041 9.4 0.1 1 50 110 164 110 192 0.75 # 11040 # 12245 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_16 - 402 MipZ PF09140.6 261 1.1e-06 21.1 0.4 2 2 2.9e-05 0.0037 9.6 0.0 90 135 237 282 217 287 0.85 # 11040 # 12245 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_9 - 234 UPF0020 PF01170.13 180 4.4e-06 19.6 0.0 1 2 0.00015 0.0064 9.3 0.0 103 120 17 34 5 80 0.83 # 4413 # 5114 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_9 - 234 UPF0020 PF01170.13 180 4.4e-06 19.6 0.0 2 2 0.00028 0.012 8.4 0.0 28 51 170 193 165 227 0.75 # 4413 # 5114 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 4_2 - 188 UPF0020 PF01170.13 180 1.6e-05 17.8 0.0 1 1 2.2e-06 9.2e-05 15.3 0.0 19 54 41 78 39 138 0.74 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_20 - 676 UPF0020 PF01170.13 180 0.00029 13.7 0.1 1 2 0.00032 0.014 8.2 0.1 31 45 209 223 201 230 0.88 # 14477 # 16504 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_20 - 676 UPF0020 PF01170.13 180 0.00029 13.7 0.1 2 2 0.015 0.65 2.7 0.0 106 125 292 311 272 318 0.79 # 14477 # 16504 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_51 - 395 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.1e-20 67.2 0.0 1 1 2.7e-22 1.7e-20 66.7 0.0 6 212 106 338 102 339 0.87 # 43594 # 44778 # 1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_52 - 440 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 5.1e-19 61.9 0.0 1 2 0.037 2.3 0.9 0.0 6 41 138 172 135 227 0.77 # 45055 # 46374 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_52 - 440 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 5.1e-19 61.9 0.0 2 2 7.3e-20 4.6e-18 58.7 0.0 6 213 264 433 259 433 0.85 # 45055 # 46374 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_25 - 339 DivIC PF04977.10 80 0.012 8.4 3.9 1 2 0.0006 0.076 5.8 0.0 17 56 189 228 180 229 0.84 # 22020 # 23036 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_25 - 339 DivIC PF04977.10 80 0.012 8.4 3.9 2 2 0.0033 0.41 3.5 0.1 14 38 281 305 272 307 0.74 # 22020 # 23036 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_23 - 423 DDE_Tnp_ISL3 PF01610.12 249 1.2e-70 231.2 0.1 1 1 1.9e-72 2.4e-70 230.1 0.0 1 248 148 382 148 383 0.94 # 20417 # 21685 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_56 - 342 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00038 13.0 0.6 1 1 7.7e-06 0.00098 11.7 0.6 18 40 15 37 3 40 0.82 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_55 - 260 AAA PF00004.24 132 2.7e-08 27.3 0.0 1 1 4.1e-10 5.2e-08 26.4 0.0 1 70 104 175 104 207 0.82 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_33 - 191 HTH_27 PF13463.1 68 0.00052 13.6 0.1 1 2 0.00021 0.026 8.1 0.0 4 68 12 84 10 84 0.69 # 27119 # 27691 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 1_33 - 191 HTH_27 PF13463.1 68 0.00052 13.6 0.1 2 2 0.0097 1.2 2.8 0.0 57 68 143 154 139 154 0.90 # 27119 # 27691 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 1_9 - 234 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.5e-32 106.2 0.0 1 2 6.8e-13 8.5e-11 34.9 0.0 1 113 21 130 21 137 0.85 # 4413 # 5114 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_9 - 234 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.5e-32 106.2 0.0 2 2 2e-23 2.5e-21 69.4 0.0 170 227 149 206 135 210 0.92 # 4413 # 5114 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_22 - 1086 DEAD_2 PF06733.10 174 0.0011 11.6 0.2 1 1 2.3e-05 0.0029 10.3 0.0 122 156 412 444 404 454 0.86 # 17155 # 20412 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_12 - 324 Hydantoinase_A PF01968.13 290 0.00028 13.3 2.6 1 3 0.014 1.8 0.8 0.0 153 177 129 152 74 162 0.68 # 6516 # 7487 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.568 1_12 - 324 Hydantoinase_A PF01968.13 290 0.00028 13.3 2.6 2 3 5.8e-05 0.0074 8.6 1.2 76 100 164 187 147 239 0.64 # 6516 # 7487 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.568 1_12 - 324 Hydantoinase_A PF01968.13 290 0.00028 13.3 2.6 3 3 0.0059 0.74 2.0 0.1 209 260 246 293 200 313 0.68 # 6516 # 7487 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.568 2_35 - 771 AAA_16 PF13191.1 185 3.6e-06 20.3 0.0 1 1 4.2e-07 1.8e-05 18.0 0.0 20 56 181 218 179 254 0.78 # 28186 # 30498 # 1 # ID=2_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_22 - 1086 AAA_16 PF13191.1 185 8.5e-06 19.1 0.1 1 2 6.6e-06 0.00028 14.1 0.0 5 175 297 459 294 467 0.69 # 17155 # 20412 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_22 - 1086 AAA_16 PF13191.1 185 8.5e-06 19.1 0.1 2 2 0.041 1.7 1.8 0.0 31 160 459 596 456 621 0.52 # 17155 # 20412 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_55 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 1.9e-05 18.0 2.4 1 1 3.6e-06 0.00015 15.0 0.1 23 51 100 128 86 149 0.80 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_33 - 191 NodS PF05401.6 201 0.00096 11.8 0.0 1 2 0.049 6.1 -0.6 0.0 42 154 34 59 19 69 0.63 # 27119 # 27691 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 1_33 - 191 NodS PF05401.6 201 0.00096 11.8 0.0 2 2 2.8e-05 0.0035 9.9 0.0 25 70 99 144 87 172 0.84 # 27119 # 27691 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 1_55 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 1.6e-06 21.6 0.0 1 2 8.3e-06 0.00052 13.4 0.1 4 28 101 125 98 148 0.75 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_55 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 1.6e-06 21.6 0.0 2 2 0.0016 0.1 6.0 0.0 77 101 151 178 124 201 0.64 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 2_36 - 1754 AAA_22 PF13401.1 131 0.00033 14.1 0.0 1 2 0.011 0.72 3.2 0.0 89 121 505 536 468 538 0.72 # 30498 # 35759 # 1 # ID=2_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 2_36 - 1754 AAA_22 PF13401.1 131 0.00033 14.1 0.0 2 2 0.00079 0.05 7.0 0.0 3 28 986 1011 983 1065 0.79 # 30498 # 35759 # 1 # ID=2_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_55 - 260 TIGR00362 TIGR00362 437 2.9e-10 32.6 0.0 1 1 3.3e-12 4.2e-10 32.1 0.0 140 240 104 202 94 210 0.89 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_56 - 342 NUMOD1 PF07453.8 37 2.5e-05 17.3 0.1 1 1 6.8e-07 8.6e-05 15.6 0.0 17 37 18 38 15 38 0.95 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_56 - 342 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 1.8e-06 20.8 0.0 1 1 2.8e-08 3.5e-06 19.9 0.0 13 45 10 42 3 46 0.90 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_56 - 342 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00074 12.4 0.0 1 1 1.7e-05 0.0021 11.0 0.0 16 57 15 56 8 76 0.77 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_55 - 260 AAA_28 PF13521.1 163 0.00032 13.9 0.0 1 1 5e-06 0.00063 13.0 0.0 1 49 103 156 103 171 0.73 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_56 - 342 GntR PF00392.16 64 0.0003 13.5 0.0 1 1 1.2e-05 0.0015 11.3 0.0 26 45 19 38 15 40 0.88 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_56 - 342 HTH_3 PF01381.17 55 0.00015 14.9 0.0 1 1 2.4e-06 0.00031 13.9 0.0 7 32 15 40 9 57 0.83 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_56 - 342 HTH_23 PF13384.1 50 3.2e-09 29.5 0.4 1 1 1.5e-10 3.2e-09 29.5 0.4 13 39 13 39 8 44 0.91 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_44 - 202 HTH_23 PF13384.1 50 1.5e-07 24.2 0.2 1 1 7.3e-09 1.5e-07 24.2 0.2 10 42 166 198 160 201 0.92 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_46 - 207 HTH_23 PF13384.1 50 2.2e-05 17.3 0.2 1 1 2.9e-06 6.1e-05 15.9 0.2 10 37 171 200 163 204 0.77 # 40945 # 41565 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_17 - 325 HTH_23 PF13384.1 50 0.00018 14.4 0.0 1 1 2.1e-05 0.00044 13.2 0.0 12 38 157 183 145 187 0.90 # 12242 # 13216 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_30 - 230 HTH_23 PF13384.1 50 0.00021 14.2 0.0 1 1 2.1e-05 0.00044 13.2 0.0 2 38 82 125 81 128 0.87 # 25027 # 25716 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 3_3 - 670 HTH_23 PF13384.1 50 0.0003 13.7 0.7 1 1 9.3e-05 0.0019 11.1 0.0 13 40 150 177 142 183 0.88 # 1027 # 3036 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_16 - 402 Fer4_NifH PF00142.13 273 1.3e-05 17.7 0.0 1 1 2e-07 2.6e-05 16.7 0.0 7 72 117 187 112 198 0.80 # 11040 # 12245 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_56 - 342 HTH_7 PF02796.10 45 1.4e-08 27.8 0.1 1 1 4.5e-10 2.9e-08 26.8 0.1 12 44 8 40 2 41 0.89 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_44 - 202 HTH_7 PF02796.10 45 1.9e-05 17.7 0.0 1 1 8.7e-07 5.5e-05 16.3 0.0 13 38 165 190 156 190 0.93 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_56 - 342 HTH_29 PF13551.1 112 4.7e-06 20.0 1.1 1 1 2.4e-07 1.5e-05 18.4 0.0 7 35 13 40 8 72 0.86 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_44 - 202 HTH_29 PF13551.1 112 5.3e-05 16.6 0.5 1 2 0.014 0.9 3.0 0.0 51 88 43 87 25 101 0.62 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_44 - 202 HTH_29 PF13551.1 112 5.3e-05 16.6 0.5 2 2 3.8e-05 0.0024 11.3 0.2 4 36 166 197 165 200 0.89 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_55 - 260 PhoH PF02562.11 205 4e-07 22.7 0.1 1 1 5e-09 6.3e-07 22.0 0.1 14 56 96 138 84 163 0.80 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_55 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 2.3e-05 17.4 0.0 1 1 4.6e-07 5.7e-05 16.1 0.0 1 74 103 172 103 177 0.80 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_22 - 1086 ResIII PF04851.10 184 2.5e-14 46.8 1.4 1 2 7.4e-16 9.3e-14 44.9 0.1 3 183 295 498 293 499 0.77 # 17155 # 20412 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_22 - 1086 ResIII PF04851.10 184 2.5e-14 46.8 1.4 2 2 0.037 4.6 0.2 0.1 138 158 655 675 587 708 0.72 # 17155 # 20412 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_22 - 1086 SNF2_N PF00176.18 299 0.00044 12.3 0.1 1 1 7.6e-06 0.00096 11.2 0.1 1 159 299 459 299 469 0.70 # 17155 # 20412 # 1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 2_35 - 771 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.2e-148 488.0 0.0 1 1 2.5e-150 1.5e-148 487.6 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 28186 # 30498 # 1 # ID=2_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 2_16 - 880 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.9e-05 16.6 0.2 1 1 8e-07 5.1e-05 15.2 0.0 16 91 482 553 474 569 0.71 # 10866 # 13505 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_14 - 424 IMS_HHH PF11798.3 32 3.4e-08 26.5 0.1 1 1 6.4e-10 8e-08 25.3 0.1 2 32 170 200 169 200 0.91 # 8150 # 9421 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_52 - 440 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 5e-19 61.8 0.2 1 1 4e-21 5e-19 61.8 0.2 52 125 364 437 356 437 0.92 # 45055 # 46374 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 4_2 - 188 Methyltransf_2 PF00891.13 242 0.0015 11.0 0.0 1 1 1.7e-05 0.0022 10.4 0.0 111 159 60 110 40 119 0.83 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_9 - 234 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.00094 12.0 0.0 1 2 0.023 2.9 0.6 0.0 53 80 4 30 2 38 0.91 # 4413 # 5114 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_9 - 234 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.00094 12.0 0.0 2 2 7e-05 0.0088 8.8 0.0 3 30 173 200 171 213 0.90 # 4413 # 5114 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_56 - 342 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 2.4e-05 17.0 0.1 1 1 7.2e-07 4.5e-05 16.1 0.1 17 43 13 39 3 41 0.83 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_46 - 207 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 0.00097 11.8 0.1 1 1 3e-05 0.0019 10.9 0.1 19 41 178 200 168 204 0.88 # 40945 # 41565 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_55 - 260 DUF258 PF03193.11 161 0.00027 13.4 0.0 1 1 3.7e-06 0.00046 12.6 0.0 26 59 92 125 80 153 0.82 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 2_16 - 880 DUF87 PF01935.12 229 5.8e-06 19.5 0.0 1 2 0.056 7 -0.4 0.2 113 171 312 362 304 396 0.60 # 10866 # 13505 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 2_16 - 880 DUF87 PF01935.12 229 5.8e-06 19.5 0.0 2 2 3e-07 3.8e-05 16.8 0.0 26 222 484 674 479 681 0.81 # 10866 # 13505 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_44 - 202 HTH_28 PF13518.1 52 3.2e-08 26.7 0.4 1 1 1.2e-09 7.7e-08 25.5 0.4 4 38 165 199 165 201 0.92 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_56 - 342 HTH_28 PF13518.1 52 1.6e-06 21.3 1.6 1 1 3.9e-08 2.4e-06 20.7 0.3 9 34 14 39 10 40 0.89 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_56 - 342 DUF2089 PF09862.4 113 0.00017 14.7 0.0 1 1 2.3e-06 0.00029 13.9 0.0 34 70 2 38 1 45 0.94 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_44 - 202 HTH_24 PF13412.1 48 3e-05 16.6 0.0 1 1 1e-06 6.5e-05 15.6 0.0 16 40 172 196 168 196 0.89 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_56 - 342 HTH_24 PF13412.1 48 6.2e-05 15.6 0.1 1 1 1.8e-06 0.00011 14.8 0.1 11 39 12 39 10 40 0.87 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_55 - 260 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.0005 13.4 0.0 1 1 6.3e-06 0.00079 12.7 0.0 9 64 87 144 84 229 0.70 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_56 - 342 HTH_30 PF13556.1 59 2.2e-05 17.3 0.4 1 1 4.1e-07 5.2e-05 16.1 0.4 6 34 11 39 10 40 0.90 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 4_2 - 188 TIGR03533 TIGR03533 284 1.2e-05 17.7 0.0 1 1 1.6e-07 2e-05 17.0 0.0 115 208 44 131 39 146 0.84 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 4_2 - 188 TIGR03534 TIGR03534 253 2.3e-09 29.9 0.0 1 1 3.7e-11 4.7e-09 28.9 0.0 68 189 34 145 1 162 0.83 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_44 - 202 HTH_10 PF04967.7 53 0.00055 12.8 0.0 1 1 2.6e-05 0.0016 11.3 0.0 27 46 177 196 173 199 0.86 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_56 - 342 HTH_10 PF04967.7 53 0.0008 12.3 0.0 1 1 3.1e-05 0.0019 11.0 0.0 25 45 19 39 16 41 0.92 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_46 - 207 HTH_31 PF13560.1 64 0.00069 13.1 0.1 1 1 1.1e-05 0.00069 13.1 0.1 5 35 171 201 170 205 0.90 # 40945 # 41565 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_44 - 202 HTH_31 PF13560.1 64 0.003 11.0 4.3 1 2 0.046 2.9 1.5 0.1 15 38 23 56 16 77 0.73 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_44 - 202 HTH_31 PF13560.1 64 0.003 11.0 4.3 2 2 9.8e-05 0.0062 10.0 0.5 11 39 170 198 142 201 0.90 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_36 - 1754 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.1e-07 25.2 0.2 1 1 5.7e-09 7.1e-07 22.6 0.0 3 102 1340 1443 1336 1445 0.77 # 30498 # 35759 # 1 # ID=2_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 4_2 - 188 TIGR00755 TIGR00755 256 8e-08 24.7 0.0 1 1 9e-10 1.1e-07 24.2 0.0 8 105 29 123 26 128 0.90 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_56 - 342 HTH_36 PF13730.1 55 8.8e-05 15.9 0.0 1 1 1.4e-06 0.00018 14.9 0.0 27 47 19 39 11 40 0.93 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_12 - 324 StbA PF06406.6 318 9e-126 412.3 0.0 1 1 8.2e-128 1e-125 412.1 0.0 1 316 1 317 1 319 0.98 # 6516 # 7487 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.568 1_55 - 260 NACHT PF05729.7 166 0.00016 14.6 0.0 1 1 2.1e-06 0.00026 13.9 0.0 3 49 104 151 102 200 0.81 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_55 - 260 AAA_17 PF13207.1 121 0.00048 14.2 0.0 1 1 6.5e-06 0.00082 13.4 0.0 2 26 104 131 103 216 0.74 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_55 - 260 AAA_25 PF13481.1 194 9.1e-07 21.7 0.1 1 1 2.2e-08 2.8e-06 20.1 0.1 9 60 72 128 68 201 0.77 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 2_16 - 880 Pox_A32 PF04665.7 241 9.4e-05 15.0 0.0 1 1 1.5e-06 0.00019 14.0 0.0 6 40 474 508 470 523 0.82 # 10866 # 13505 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_55 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 4.5e-07 23.1 0.0 1 2 1.7e-08 2.2e-06 20.9 0.0 3 97 102 203 100 219 0.64 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_55 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 4.5e-07 23.1 0.0 2 2 0.048 6.1 0.0 0.0 14 46 215 247 212 257 0.80 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_16 - 402 VirC1 PF07015.6 231 0.00018 13.8 0.0 1 3 0.082 10 -1.7 0.0 71 86 57 72 49 82 0.87 # 11040 # 12245 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_16 - 402 VirC1 PF07015.6 231 0.00018 13.8 0.0 2 3 0.015 1.9 0.7 0.0 4 26 112 134 110 141 0.83 # 11040 # 12245 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_16 - 402 VirC1 PF07015.6 231 0.00018 13.8 0.0 3 3 3.1e-05 0.0039 9.5 0.0 82 136 244 298 221 316 0.86 # 11040 # 12245 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_37 - 335 Transposase_20 PF02371.11 87 1.4e-24 79.3 0.2 1 1 2.3e-26 2.9e-24 78.3 0.2 2 78 210 286 209 296 0.94 # 29264 # 30268 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_23 - 423 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 4.8e-12 38.2 0.0 1 1 5.8e-13 2.4e-11 35.9 0.0 2 50 84 131 83 133 0.95 # 20417 # 21685 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_56 - 342 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 3.7e-05 16.1 0.3 1 1 2.1e-06 8.9e-05 14.9 0.3 23 50 13 40 9 40 0.87 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_44 - 202 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 5.2e-05 15.7 0.2 1 1 3e-06 0.00013 14.4 0.2 29 51 175 197 166 198 0.85 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_44 - 202 CENP-B_N PF04218.8 53 0.0002 14.0 0.0 1 1 3.9e-06 0.0005 12.8 0.0 21 45 172 196 165 199 0.87 # 37259 # 37864 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_33 - 191 PaaX PF07848.7 70 0.00039 13.7 0.1 1 1 8.5e-06 0.0011 12.3 0.0 37 60 50 73 16 84 0.69 # 27119 # 27691 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 2_35 - 771 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.7e-08 26.6 0.0 1 2 0.08 10 -2.3 0.0 130 199 262 330 253 360 0.69 # 28186 # 30498 # 1 # ID=2_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 2_35 - 771 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.7e-08 26.6 0.0 2 2 3.3e-10 4.2e-08 25.3 0.0 274 393 392 507 361 559 0.74 # 28186 # 30498 # 1 # ID=2_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 4_2 - 188 MTS PF05175.9 170 1.4e-09 30.8 0.0 1 1 1.5e-11 1.9e-09 30.3 0.0 24 142 43 150 38 170 0.84 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_55 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00029 13.8 0.1 1 2 0.0015 0.19 4.6 0.1 2 30 104 132 103 143 0.82 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_55 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00029 13.8 0.1 2 2 0.0003 0.038 6.9 0.0 87 108 155 176 141 202 0.77 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_25 - 339 Med9 PF07544.8 83 0.0012 11.8 3.9 1 2 0.00011 0.014 8.4 0.3 58 81 202 225 187 226 0.91 # 22020 # 23036 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_25 - 339 Med9 PF07544.8 83 0.0012 11.8 3.9 2 2 0.0022 0.28 4.3 0.3 54 79 279 304 264 306 0.91 # 22020 # 23036 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_12 - 324 MreB_Mbl PF06723.8 327 0.00011 14.1 0.0 1 2 0.00011 0.014 7.2 0.0 109 162 127 182 120 193 0.82 # 6516 # 7487 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.568 1_12 - 324 MreB_Mbl PF06723.8 327 0.00011 14.1 0.0 2 2 0.00058 0.074 4.8 0.0 246 286 246 286 233 317 0.83 # 6516 # 7487 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.568 1_56 - 342 HTH_17 PF12728.2 51 0.00019 14.9 0.0 1 1 4.4e-06 0.00055 13.4 0.0 4 24 20 40 19 50 0.88 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_56 - 342 HTH_11 PF08279.7 55 6.9e-06 18.9 0.4 1 1 1.1e-07 1.4e-05 17.9 0.4 4 37 6 39 3 40 0.81 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_56 - 342 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.0005 13.0 0.0 1 1 8.2e-06 0.001 12.0 0.0 140 172 4 38 2 46 0.82 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_33 - 191 MarR_2 PF12802.2 62 0.00024 14.0 0.2 1 2 0.0013 0.16 5.0 0.1 5 31 11 40 10 42 0.77 # 27119 # 27691 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 1_33 - 191 MarR_2 PF12802.2 62 0.00024 14.0 0.2 2 2 0.00043 0.055 6.5 0.0 41 57 56 72 50 75 0.84 # 27119 # 27691 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 1_46 - 207 LacI PF00356.16 46 4.4e-06 19.5 0.2 1 1 2e-07 1.2e-05 18.1 0.2 2 20 183 201 182 206 0.86 # 40945 # 41565 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_56 - 342 LacI PF00356.16 46 4.3e-05 16.4 0.2 1 1 2.3e-06 0.00015 14.6 0.0 2 25 20 43 19 50 0.86 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 2_16 - 880 AAA_10 PF12846.2 304 9.7e-46 149.7 0.0 1 1 3.7e-47 1.6e-45 149.1 0.0 1 294 481 773 481 779 0.85 # 10866 # 13505 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 2_35 - 771 AAA_10 PF12846.2 304 2.7e-09 30.1 0.0 1 1 1.9e-08 7.8e-07 22.0 0.0 3 296 187 494 186 499 0.63 # 28186 # 30498 # 1 # ID=2_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_55 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 4.7e-05 16.1 0.2 1 2 0.043 1.8 1.1 0.0 106 155 28 69 4 89 0.61 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_55 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 4.7e-05 16.1 0.2 2 2 1.3e-05 0.00055 12.6 0.1 3 35 103 135 101 172 0.84 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_56 - 342 HTH_20 PF12840.2 61 9.6e-05 15.4 0.0 1 1 2e-06 0.00025 14.1 0.0 18 46 12 39 10 40 0.91 # 48569 # 49594 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 4_2 - 188 RrnaAD PF00398.15 262 3.2e-07 22.8 0.0 1 1 3.4e-09 4.3e-07 22.4 0.0 9 113 29 128 26 140 0.90 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 4_2 - 188 Methyltransf_18 PF12847.2 112 1.2e-07 25.5 0.0 1 1 1.6e-09 2e-07 24.8 0.0 2 107 51 144 50 146 0.92 # 293 # 856 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_23 - 423 RPA_C PF08784.6 102 0.0014 12.3 0.0 1 1 2.7e-05 0.0034 11.1 0.0 44 92 90 135 67 135 0.83 # 20417 # 21685 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_16 - 402 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.7e-05 17.2 0.0 1 1 3e-07 3.8e-05 16.0 0.0 4 136 113 255 110 257 0.75 # 11040 # 12245 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_16 - 402 AAA_31 PF13614.1 157 1.8e-07 24.4 0.3 1 2 2.8e-05 0.0035 10.5 0.0 2 71 111 183 110 211 0.76 # 11040 # 12245 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_16 - 402 AAA_31 PF13614.1 157 1.8e-07 24.4 0.3 2 2 1.6e-05 0.0021 11.3 0.1 110 148 238 275 233 280 0.89 # 11040 # 12245 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.482 1_55 - 260 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.1e-65 213.6 0.0 1 1 2.2e-67 2.8e-65 212.3 0.0 2 177 56 233 55 234 0.96 # 47793 # 48572 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_14 - 424 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 7.9e-05 15.4 0.2 1 1 4.5e-06 0.00056 12.7 0.0 5 29 182 206 178 217 0.87 # 8150 # 9421 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_36 - 1754 AAA_11 PF13086.1 236 1.4e-05 18.0 0.1 1 1 7.3e-07 9.2e-05 15.3 0.0 2 75 971 1041 970 1064 0.81 # 30498 # 35759 # 1 # ID=2_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 3_1 - 171 SSB PF00436.20 104 9.1e-43 137.7 0.3 1 1 8.7e-45 1.1e-42 137.4 0.3 1 103 6 112 6 113 0.97 # 156 # 668 # 1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_23 - 423 Zn_ribbon_recom PF13408.1 58 0.00076 13.0 0.1 1 1 1.5e-05 0.0019 11.7 0.1 8 32 36 77 35 95 0.87 # 20417 # 21685 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/c6ef3e9c-c086-404d-a5b5-56e798d3afce # Target file: checkm_output/bins/pm431/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm431/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/c6ef3e9c-c086-404d-a5b5-56e798d3afce checkm_output/bins/pm431/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:05:39 2017 # [ok]