# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_14 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.2e-05 17.4 0.0 1 2 0.00046 0.069 6.0 0.0 113 146 19 54 10 81 0.65 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 3_14 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.2e-05 17.4 0.0 2 2 4e-05 0.0061 9.4 0.0 41 62 162 183 145 218 0.78 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 12_1 - 442 TrkA_N PF02254.13 116 8.5e-06 19.3 0.7 1 2 3.1e-06 0.00046 13.7 0.0 2 31 7 36 6 40 0.91 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 TrkA_N PF02254.13 116 8.5e-06 19.3 0.7 2 2 0.011 1.6 2.3 0.0 3 31 163 191 162 227 0.82 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 10_2 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 1.9e-05 17.7 0.2 1 1 4.6e-07 6.9e-05 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 11_5 - 344 ABC_tran PF00005.22 137 3.2e-05 17.7 0.0 1 1 1.1e-06 5.7e-05 16.9 0.0 11 61 174 224 166 293 0.67 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 2_6 - 322 ABC_tran PF00005.22 137 0.0016 12.3 0.0 1 1 5.6e-05 0.0028 11.5 0.0 104 136 24 61 7 62 0.73 # 5343 # 6308 # 1 # ID=2_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.489 2_4 - 407 ABC_tran PF00005.22 137 0.0085 9.9 3.5 1 1 0.00063 0.032 8.0 1.7 19 37 29 47 27 177 0.58 # 2832 # 4052 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 6_2 - 63 HTH_22 PF13309.1 64 9.7e-05 15.6 0.2 1 1 3.3e-06 0.00025 14.3 0.2 23 64 8 44 1 44 0.79 # 415 # 603 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 10_2 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 0.00043 13.6 1.5 1 1 2.4e-05 0.0018 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 3_14 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00044 13.1 0.0 1 2 0.0015 0.22 4.3 0.0 123 138 19 34 7 78 0.75 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 3_14 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00044 13.1 0.0 2 2 0.00024 0.037 6.8 0.0 53 86 164 199 155 218 0.77 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 12_1 - 442 FAD_binding_3 PF01494.14 356 2e-05 17.2 0.5 1 2 2e-06 0.0003 13.3 0.1 2 35 4 37 3 42 0.91 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 FAD_binding_3 PF01494.14 356 2e-05 17.2 0.5 2 2 0.006 0.91 1.9 0.0 6 37 163 194 160 272 0.71 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_18 - 424 HHH_5 PF14520.1 60 0.00052 13.7 0.0 1 1 9.2e-06 0.0014 12.3 0.0 9 37 184 212 175 229 0.93 # 10954 # 12225 # 1 # ID=3_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_12 - 519 N6_Mtase PF02384.11 311 4.5e-118 387.3 1.0 1 1 7.9e-120 6e-118 386.9 1.0 2 310 171 479 170 480 0.97 # 6364 # 7920 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 3_3 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00036 13.1 0.0 1 2 6.8e-05 0.0051 9.3 0.0 28 62 32 66 21 75 0.89 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 3_3 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.00036 13.1 0.0 2 2 0.028 2.1 0.7 0.0 127 137 114 124 103 134 0.82 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 1_40 - 302 rve_3 PF13683.1 67 1e-19 63.4 0.1 1 1 1.7e-20 3.6e-19 61.6 0.0 2 67 216 281 215 281 0.98 # 37710 # 38615 # -1 # ID=1_40;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.552 14_1 - 216 rve_3 PF13683.1 67 4.3e-16 51.7 0.1 1 1 7.2e-17 1.6e-15 50.0 0.1 1 67 147 214 147 214 0.96 # 1 # 648 # 1 # ID=14_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.515 2_19 - 271 rve_3 PF13683.1 67 5.8e-16 51.3 0.1 1 1 1.1e-16 2.4e-15 49.4 0.1 1 67 189 256 189 256 0.96 # 15113 # 15925 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 2_17 - 296 rve_3 PF13683.1 67 2.4e-13 43.0 0.1 1 1 2.5e-14 5.4e-13 41.8 0.0 6 67 216 277 211 277 0.92 # 13216 # 14103 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_42 - 69 rve_3 PF13683.1 67 2.3e-10 33.4 0.1 1 1 1.3e-11 2.8e-10 33.1 0.1 19 67 2 50 1 50 0.94 # 39240 # 39446 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 6_4 - 55 rve_3 PF13683.1 67 1e-06 21.7 0.0 1 1 5.6e-08 1.2e-06 21.5 0.0 33 67 5 40 1 40 0.87 # 5053 # 5217 # -1 # ID=6_4;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.424 7_6 - 55 rve_3 PF13683.1 67 1e-06 21.7 0.0 1 1 5.6e-08 1.2e-06 21.5 0.0 33 67 5 40 1 40 0.87 # 4669 # 4833 # -1 # ID=7_6;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.424 11_5 - 344 Sigma54_activat PF00158.21 168 4.5e-05 16.5 0.0 1 1 6.6e-07 9.9e-05 15.3 0.0 12 76 164 231 158 242 0.79 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 1_45 - 104 HTH_Tnp_Tc3_2 PF01498.13 72 0.0008 13.0 0.0 1 1 8.3e-06 0.0013 12.4 0.0 14 40 26 52 14 64 0.90 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 11_5 - 344 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.2e-06 20.8 0.0 1 1 4.7e-08 3.6e-06 20.1 0.0 32 62 168 198 153 203 0.80 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 1_17 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.5e-05 18.0 0.1 1 2 4.1e-06 0.00031 13.7 0.0 39 63 476 504 463 507 0.84 # 9650 # 12277 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_17 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.5e-05 18.0 0.1 2 2 0.021 1.6 1.6 0.0 75 166 530 625 529 640 0.80 # 9650 # 12277 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 2_18 - 274 HTH_40 PF14493.1 91 3.9e-05 17.3 0.2 1 2 0.00015 0.011 9.5 0.0 5 32 12 39 8 52 0.89 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_40 PF14493.1 91 3.9e-05 17.3 0.2 2 2 0.0043 0.33 4.8 0.0 10 31 71 92 62 103 0.87 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 10_2 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.00099 12.8 0.6 1 1 4.3e-05 0.0032 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_37 - 86 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.00022 14.6 0.3 1 1 1.8e-06 0.00027 14.4 0.3 112 155 40 83 30 85 0.85 # 34721 # 34978 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 2_18 - 274 HTH_38 PF13936.1 44 2.1e-25 81.6 2.2 1 2 3.8e-06 0.00014 14.9 0.0 4 42 4 42 1 43 0.90 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_38 PF13936.1 44 2.1e-25 81.6 2.2 2 2 3.4e-21 1.3e-19 63.0 1.2 4 44 58 98 55 98 0.97 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 10_2 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 4.7e-06 19.6 1.4 1 1 2.4e-07 8.9e-06 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_6 - 230 HTH_38 PF13936.1 44 0.00094 12.3 0.0 1 1 7.7e-05 0.0029 10.7 0.0 15 36 164 185 157 185 0.90 # 3114 # 3803 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 1_45 - 104 HTH_38 PF13936.1 44 0.0013 11.8 0.0 1 1 8.3e-05 0.0031 10.6 0.0 30 43 40 53 38 54 0.90 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 12_1 - 442 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 3.2e-07 23.1 1.0 1 2 7.3e-05 0.011 8.4 0.0 38 69 5 36 1 88 0.85 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 3.2e-07 23.1 1.0 2 2 3.1e-06 0.00047 12.8 0.2 38 67 160 189 151 252 0.88 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_21 - 215 MobB PF03205.9 140 0.00023 14.4 0.2 1 1 9.1e-06 0.00046 13.4 0.2 5 39 4 39 1 88 0.70 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_17 - 876 MobB PF03205.9 140 0.00039 13.6 0.2 1 1 8.1e-05 0.0041 10.3 0.0 4 37 483 515 481 523 0.79 # 9650 # 12277 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 11_5 - 344 MobB PF03205.9 140 0.00062 13.0 0.0 1 1 2.8e-05 0.0014 11.8 0.0 3 28 177 202 175 216 0.77 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 2_18 - 274 MarR PF01047.17 59 0.00064 13.0 5.3 1 3 0.0013 0.2 5.0 0.0 18 39 21 42 16 43 0.89 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 MarR PF01047.17 59 0.00064 13.0 5.3 2 3 0.00017 0.026 7.8 0.1 18 37 75 94 70 97 0.88 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 MarR PF01047.17 59 0.00064 13.0 5.3 3 3 0.063 9.4 -0.4 0.7 48 58 220 230 220 231 0.91 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_17 - 296 Sigma54_DBD PF04552.8 160 0.001 12.1 0.2 1 1 1.3e-05 0.0019 11.2 0.2 100 154 45 97 30 103 0.78 # 13216 # 14103 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 12_1 - 442 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 6e-06 19.2 1.4 1 2 0.00081 0.12 5.2 0.1 4 32 7 35 5 42 0.91 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 6e-06 19.2 1.4 2 2 4.6e-06 0.0007 12.5 0.1 4 30 162 188 160 193 0.91 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.9e-10 34.6 0.4 1 2 7.2e-05 0.011 9.3 0.1 1 56 7 64 7 194 0.52 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.9e-10 34.6 0.4 2 2 2.5e-07 3.7e-05 17.3 0.0 82 155 199 267 193 287 0.86 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 NAD_binding_7 PF13241.1 103 6.7e-06 19.8 0.2 1 2 9.2e-05 0.014 9.2 0.0 8 40 4 36 1 94 0.71 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 NAD_binding_7 PF13241.1 103 6.7e-06 19.8 0.2 2 2 0.00026 0.04 7.7 0.0 11 53 162 231 157 269 0.69 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 2_18 - 274 TetR_N PF00440.18 47 0.00014 14.9 0.3 1 3 0.0032 0.48 3.7 0.0 16 34 20 38 19 39 0.92 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 TetR_N PF00440.18 47 0.00014 14.9 0.3 2 3 0.0018 0.27 4.5 0.1 16 35 74 93 72 96 0.89 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 TetR_N PF00440.18 47 0.00014 14.9 0.3 3 3 0.0058 0.87 2.8 0.0 27 43 163 181 160 183 0.79 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_32 - 1757 AAA_19 PF13245.1 76 2e-07 24.3 1.8 1 1 8.9e-09 6.7e-07 22.5 0.4 7 76 981 1047 974 1047 0.75 # 26862 # 32132 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 3_21 - 215 AAA_19 PF13245.1 76 0.00033 13.9 0.6 1 1 1.1e-05 0.00081 12.7 0.4 20 56 11 45 3 64 0.81 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 CbiA PF01656.18 195 7.2e-18 58.2 0.0 1 1 6.5e-20 9.8e-18 57.7 0.0 2 148 4 138 3 182 0.72 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 KTI12 PF08433.5 270 0.00023 13.9 0.1 1 2 3.3e-06 0.0005 12.8 0.0 11 49 11 49 1 64 0.86 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 KTI12 PF08433.5 270 0.00023 13.9 0.1 2 2 0.079 12 -1.6 0.0 222 222 113 113 58 163 0.50 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_14 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00063 12.7 0.0 1 2 0.015 2.2 1.1 0.0 175 188 18 31 8 93 0.80 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 3_14 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00063 12.7 0.0 2 2 4e-05 0.006 9.5 0.0 20 46 163 189 148 197 0.78 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 2_18 - 274 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 9.4e-05 15.4 0.1 1 2 0.0069 0.52 3.4 0.0 26 47 20 41 9 43 0.86 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 9.4e-05 15.4 0.1 2 2 0.00017 0.013 8.5 0.2 27 49 75 97 54 101 0.91 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_6 - 230 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00041 13.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.00081 12.4 0.0 26 48 169 191 159 194 0.84 # 3114 # 3803 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 7_3 - 326 Rep_3 PF01051.16 222 2.3e-33 109.1 0.1 1 1 2.1e-35 3.2e-33 108.6 0.1 3 214 10 265 8 271 0.90 # 2264 # 3241 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 2_19 - 271 rve PF00665.21 120 1.1e-37 122.3 0.1 1 1 1.3e-38 2.1e-37 121.4 0.1 2 119 102 217 101 218 0.98 # 15113 # 15925 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 14_1 - 216 rve PF00665.21 120 4.6e-37 120.3 0.1 1 1 5.1e-38 8.5e-37 119.4 0.1 2 119 60 175 59 176 0.98 # 1 # 648 # 1 # ID=14_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.515 2_17 - 296 rve PF00665.21 120 2.5e-28 92.1 0.1 1 1 3.9e-29 6.6e-28 90.8 0.0 2 119 125 239 124 240 0.97 # 13216 # 14103 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_40 - 302 rve PF00665.21 120 5.1e-26 84.6 0.1 1 1 7e-27 1.2e-25 83.5 0.0 3 119 123 243 121 244 0.97 # 37710 # 38615 # -1 # ID=1_40;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.552 15_1 - 173 rve PF00665.21 120 2.6e-12 40.4 0.0 1 1 2.4e-13 4e-12 39.8 0.0 9 119 13 120 8 121 0.89 # 1 # 519 # 1 # ID=15_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 1_45 - 104 rve PF00665.21 120 1.5e-06 21.8 0.2 1 2 0.03 0.5 4.0 0.0 77 102 26 49 4 55 0.82 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_45 - 104 rve PF00665.21 120 1.5e-06 21.8 0.2 2 2 4.7e-06 8e-05 16.3 0.0 9 38 75 102 69 104 0.87 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 11_1 - 60 rve PF00665.21 120 1.5e-05 18.6 0.1 1 1 1.3e-06 2.2e-05 18.1 0.1 9 38 31 58 23 60 0.86 # 2 # 181 # -1 # ID=11_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_15 - 96 rve PF00665.21 120 2.1e-05 18.1 0.0 1 1 1.8e-06 3.1e-05 17.6 0.0 85 113 7 35 2 37 0.89 # 12479 # 12766 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 2_18 - 274 rve PF00665.21 120 0.00016 15.2 0.0 1 1 2.3e-05 0.00038 14.1 0.0 3 51 228 271 226 273 0.85 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 3_21 - 215 YhjQ PF06564.7 244 0.00082 12.2 0.8 1 2 3.3e-05 0.0049 9.7 0.2 6 36 5 35 1 39 0.87 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 YhjQ PF06564.7 244 0.00082 12.2 0.8 2 2 0.015 2.3 0.9 0.0 99 160 62 124 49 131 0.63 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 6_2 - 63 Terminase_5 PF06056.7 58 2.2e-06 20.7 0.0 1 1 1.8e-08 2.7e-06 20.4 0.0 12 40 21 49 13 54 0.93 # 415 # 603 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 2_4 - 407 AAA_23 PF13476.1 202 4.8e-09 30.3 0.6 1 1 9.2e-11 1.4e-08 28.8 0.6 2 177 3 272 2 383 0.70 # 2832 # 4052 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 3_3 - 188 Methyltransf_26 PF13659.1 117 6.3e-14 45.5 0.1 1 1 2.2e-15 1.1e-13 44.7 0.1 2 114 52 147 51 150 0.90 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 4_12 - 519 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.9e-12 40.8 0.0 1 1 1.6e-13 8e-12 38.8 0.0 3 114 220 354 218 358 0.73 # 6364 # 7920 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 3_14 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.7e-11 37.7 0.1 1 2 8e-07 4e-05 17.1 0.0 58 114 8 71 2 74 0.69 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 3_14 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.7e-11 37.7 0.1 2 2 2.9e-07 1.5e-05 18.6 0.0 4 45 167 207 164 223 0.82 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 11_5 - 344 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00014 14.5 0.0 1 1 5.4e-06 0.00027 13.5 0.0 15 51 173 209 163 211 0.88 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_21 - 215 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00018 14.1 0.0 1 1 6e-06 0.0003 13.4 0.0 20 109 4 94 1 103 0.79 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_31 - 721 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0011 11.5 0.0 1 1 0.0001 0.0052 9.4 0.0 21 49 190 219 182 236 0.85 # 24700 # 26862 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_32 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 2e-44 145.0 14.4 1 3 0.083 6.3 -0.2 0.0 41 86 223 269 219 281 0.81 # 26862 # 32132 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_32 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 2e-44 145.0 14.4 2 3 1.7e-05 0.0013 11.9 3.3 7 133 420 540 416 561 0.85 # 26862 # 32132 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_32 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 2e-44 145.0 14.4 3 3 6.9e-44 5.2e-42 137.1 1.7 1 186 968 1156 968 1162 0.94 # 26862 # 32132 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_31 - 721 AAA_30 PF13604.1 196 0.00083 12.4 0.0 1 1 2.5e-05 0.0019 11.3 0.0 21 57 188 224 180 230 0.85 # 24700 # 26862 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 12_1 - 442 F420_oxidored PF03807.12 96 0.00054 13.9 6.5 1 2 5e-05 0.0076 10.2 0.2 3 31 7 32 5 65 0.84 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 F420_oxidored PF03807.12 96 0.00054 13.9 6.5 2 2 0.0017 0.25 5.3 0.5 2 33 161 189 160 249 0.90 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_41 - 122 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.00077 12.7 0.2 1 2 0.0027 0.41 3.9 0.0 5 31 11 37 8 49 0.85 # 38573 # 38938 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_41 - 122 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.00077 12.7 0.2 2 2 0.00031 0.047 7.0 0.1 42 80 76 112 73 117 0.89 # 38573 # 38938 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_41 - 122 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.6e-21 67.8 1.1 1 1 2.4e-22 7.3e-21 67.5 0.6 2 74 8 87 7 89 0.89 # 38573 # 38938 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 6_2 - 63 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6e-17 54.9 0.0 1 1 2.1e-18 6.3e-17 54.9 0.0 1 48 1 47 1 61 0.88 # 415 # 603 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 2_16 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.5e-13 44.1 1.2 1 1 2.3e-14 7e-13 41.9 1.2 1 74 1 87 1 88 0.85 # 12890 # 13216 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_45 - 104 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.1e-05 16.5 0.3 1 1 4.7e-06 0.00014 15.3 0.3 4 52 6 59 4 63 0.79 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_18 - 274 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00029 14.3 0.1 1 1 0.00062 0.019 8.5 0.0 4 50 2 46 1 121 0.87 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 GerE PF00196.14 58 1.8e-06 20.7 0.2 1 2 0.00024 0.018 7.9 0.0 10 37 12 39 4 43 0.89 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 GerE PF00196.14 58 1.8e-06 20.7 0.2 2 2 0.00014 0.011 8.6 0.1 15 37 71 93 58 98 0.70 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_6 - 230 GerE PF00196.14 58 2.1e-05 17.3 0.1 1 1 7e-07 5.3e-05 16.0 0.0 14 57 165 208 160 209 0.90 # 3114 # 3803 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 1_31 - 721 TraG-D_C PF12696.2 128 1.1e-20 67.3 0.0 1 1 1.4e-22 2e-20 66.4 0.0 1 127 419 541 419 542 0.86 # 24700 # 26862 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 15_1 - 173 DDE_3 PF13358.1 146 0.0012 12.1 0.0 1 1 9.3e-06 0.0014 11.9 0.0 33 90 21 79 5 120 0.90 # 1 # 519 # 1 # ID=15_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 11_5 - 344 TIGR03263 TIGR03263 180 0.0014 11.4 0.0 1 1 1.8e-05 0.0027 10.5 0.0 4 27 177 200 174 210 0.83 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_21 - 215 MipZ PF09140.6 261 1.4e-15 50.6 3.3 1 3 1.9e-11 2.9e-09 29.8 0.2 2 53 2 52 1 61 0.88 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 MipZ PF09140.6 261 1.4e-15 50.6 3.3 2 3 3.3e-08 5e-06 19.2 0.2 84 145 64 125 59 134 0.90 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 MipZ PF09140.6 261 1.4e-15 50.6 3.3 3 3 0.015 2.2 0.7 0.0 231 256 184 209 171 211 0.76 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 4_12 - 519 UPF0020 PF01170.13 180 2.4e-09 30.5 0.1 1 1 2.5e-10 1.9e-08 27.6 0.0 11 117 202 304 195 311 0.76 # 6364 # 7920 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 3_14 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 1.9e-05 17.8 0.0 1 2 0.00056 0.042 6.9 0.0 103 119 17 33 4 88 0.73 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 3_14 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 1.9e-05 17.8 0.0 2 2 0.00012 0.0093 9.0 0.0 28 54 163 189 158 221 0.67 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 4_6 - 327 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2e-35 115.7 0.1 1 1 9.9e-37 3.7e-35 114.8 0.1 5 212 138 312 135 313 0.90 # 3197 # 4177 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 2_5 - 403 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.3e-27 90.2 0.0 1 1 5.3e-29 2e-27 89.6 0.0 4 210 91 328 88 331 0.93 # 4021 # 5229 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.449 10_4 - 247 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.1e-24 80.7 0.0 1 1 5.1e-26 1.9e-24 79.8 0.0 5 106 138 244 135 247 0.97 # 2141 # 2881 # 1 # ID=10_4;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 13_4 - 77 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.1e-09 31.6 0.1 1 1 3.2e-11 1.2e-09 31.5 0.1 168 212 14 62 2 63 0.82 # 1010 # 1240 # -1 # ID=13_4;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.511 1_12 - 476 DivIC PF04977.10 80 0.0014 11.7 4.6 1 1 1.8e-05 0.0027 10.7 4.6 17 66 76 124 72 125 0.92 # 6311 # 7738 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_4 - 407 AAA_21 PF13304.1 303 0.0002 14.8 0.0 1 1 5.1e-06 0.00039 13.9 0.0 7 77 29 112 27 212 0.62 # 2832 # 4052 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 2_6 - 322 AAA_21 PF13304.1 303 0.0005 13.5 0.1 1 1 1.8e-05 0.0014 12.1 0.0 231 298 24 96 5 98 0.83 # 5343 # 6308 # 1 # ID=2_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.489 12_1 - 442 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 1.7e-05 18.1 0.1 1 2 4.7e-05 0.007 9.6 0.1 3 73 7 74 5 93 0.63 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 1.7e-05 18.1 0.1 2 2 0.00069 0.1 5.8 0.0 3 28 162 187 160 237 0.87 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_16 - 74 zf-dskA_traR PF01258.12 36 5.6e-15 48.3 3.3 1 1 5.4e-17 8.2e-15 47.8 3.3 5 36 35 67 30 67 0.91 # 9269 # 9490 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.446 12_1 - 442 Thi4 PF01946.12 230 1.9e-06 20.6 0.2 1 2 1.5e-07 2.3e-05 17.1 0.0 20 57 6 43 1 73 0.84 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 Thi4 PF01946.12 230 1.9e-06 20.6 0.2 2 2 0.014 2.1 0.8 0.0 22 48 163 189 154 193 0.91 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 5_2 - 160 Rrf2 PF02082.15 83 2.3e-15 50.0 0.0 1 1 2.4e-17 3.5e-15 49.4 0.0 3 82 2 82 1 83 0.89 # 164 # 643 # 1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 4_12 - 519 Eco57I PF07669.6 106 7e-07 23.1 0.1 1 2 2.3e-07 3.4e-05 17.7 0.0 3 104 294 406 291 408 0.81 # 6364 # 7920 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 4_12 - 519 Eco57I PF07669.6 106 7e-07 23.1 0.1 2 2 0.014 2.2 2.2 0.1 54 85 412 444 409 461 0.79 # 6364 # 7920 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 2_12 - 378 TIGR00065 TIGR00065 353 0.00079 11.9 0.0 1 1 7.3e-06 0.0011 11.5 0.0 146 175 50 80 46 110 0.72 # 10800 # 11933 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 3_21 - 215 TIGR00064 TIGR00064 279 1.9e-06 20.4 1.4 1 1 2.7e-08 4.1e-06 19.4 1.4 83 175 3 92 1 97 0.78 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 4_2 - 78 TOBE_2 PF08402.5 75 1.2e-15 50.8 0.1 1 1 9e-18 1.4e-15 50.6 0.1 1 75 2 73 2 73 0.87 # 289 # 522 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.581 3_14 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 8.4e-37 120.3 0.0 1 2 1e-15 1.5e-13 44.2 0.0 1 114 21 124 21 137 0.89 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 3_14 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 8.4e-37 120.3 0.0 2 2 5.4e-25 8.1e-23 74.5 0.0 169 228 141 200 126 203 0.90 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 2_19 - 271 rve_2 PF13333.1 52 4.5e-19 61.8 3.6 1 1 3.4e-20 8.5e-19 60.9 3.6 1 51 208 263 208 264 0.94 # 15113 # 15925 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 14_1 - 216 rve_2 PF13333.1 52 1.5e-16 53.8 0.5 1 1 1e-17 2.6e-16 53.0 0.5 1 46 166 216 166 216 0.91 # 1 # 648 # 1 # ID=14_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.515 6_4 - 55 rve_2 PF13333.1 52 3e-14 46.4 2.4 1 1 1.3e-15 3.4e-14 46.2 2.4 10 51 1 47 1 48 0.91 # 5053 # 5217 # -1 # ID=6_4;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.424 7_6 - 55 rve_2 PF13333.1 52 3e-14 46.4 2.4 1 1 1.3e-15 3.4e-14 46.2 2.4 10 51 1 47 1 48 0.91 # 4669 # 4833 # -1 # ID=7_6;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.424 1_42 - 69 rve_2 PF13333.1 52 2.1e-09 30.8 0.0 1 1 9.7e-11 2.4e-09 30.7 0.0 1 44 3 49 3 57 0.88 # 39240 # 39446 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 2_17 - 296 rve_2 PF13333.1 52 2.9e-08 27.2 0.0 1 1 2.5e-09 6.3e-08 26.1 0.0 1 44 230 276 230 282 0.88 # 13216 # 14103 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 3_20 - 324 Hydantoinase_A PF01968.13 290 4.9e-06 19.3 2.1 1 2 8.4e-07 0.00013 14.6 0.7 75 100 164 188 153 201 0.84 # 12627 # 13598 # -1 # ID=3_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 3_20 - 324 Hydantoinase_A PF01968.13 290 4.9e-06 19.3 2.1 2 2 0.0019 0.29 3.6 0.0 217 260 251 294 202 319 0.75 # 12627 # 13598 # -1 # ID=3_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 6_2 - 63 MerR_1 PF13411.1 69 0.00016 15.0 0.0 1 2 0.029 4.4 0.7 0.0 55 67 8 20 4 22 0.74 # 415 # 603 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 6_2 - 63 MerR_1 PF13411.1 69 0.00016 15.0 0.0 2 2 6.7e-06 0.001 12.4 0.0 1 31 23 53 23 60 0.83 # 415 # 603 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 11_5 - 344 cobW PF02492.14 178 0.00023 14.1 0.0 1 1 6.2e-06 0.00047 13.1 0.0 3 43 177 216 175 342 0.87 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_21 - 215 cobW PF02492.14 178 0.00074 12.5 0.8 1 1 2.4e-05 0.0018 11.2 0.8 3 46 3 48 1 130 0.69 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_31 - 721 AAA_16 PF13191.1 185 6.8e-06 19.6 0.0 1 1 3.9e-07 3e-05 17.6 0.0 21 60 182 222 179 263 0.81 # 24700 # 26862 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 11_5 - 344 AAA_16 PF13191.1 185 7.2e-05 16.3 0.0 1 1 1.9e-06 0.00014 15.4 0.0 25 51 175 201 156 225 0.80 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 11_5 - 344 AAA_22 PF13401.1 131 0.00015 15.4 0.0 1 1 2.6e-06 0.0004 14.0 0.0 4 29 174 199 171 243 0.83 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_21 - 215 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.00077 12.3 0.3 1 2 2.2e-05 0.0034 10.2 0.0 6 29 11 34 9 47 0.91 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.00077 12.3 0.3 2 2 0.042 6.3 -0.4 0.0 115 164 128 185 108 209 0.53 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 11_5 - 344 AAA_29 PF13555.1 62 0.0002 14.4 0.2 1 1 3e-06 0.00045 13.2 0.2 24 39 174 190 164 195 0.78 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 12_1 - 442 Pyr_redox PF00070.22 80 3.7e-26 84.9 0.8 1 2 0.00033 0.049 7.6 0.2 2 33 6 37 5 43 0.92 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 Pyr_redox PF00070.22 80 3.7e-26 84.9 0.8 2 2 2.4e-25 3.7e-23 75.3 0.0 1 78 160 235 160 238 0.95 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 10_2 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00014 15.0 0.0 1 1 1.9e-06 0.00029 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 3_21 - 215 SRP54 PF00448.17 196 4e-11 36.2 0.3 1 1 5e-13 7.5e-11 35.3 0.3 6 98 4 93 1 98 0.79 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 11_5 - 344 AAA_28 PF13521.1 163 0.0012 12.3 0.0 1 1 1.8e-05 0.0027 11.1 0.0 1 33 176 212 176 237 0.78 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 4_6 - 327 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 3.1e-10 33.5 0.0 1 1 7.4e-12 5.6e-10 32.7 0.0 5 151 137 292 134 296 0.72 # 3197 # 4177 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 10_4 - 247 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 3.5e-10 33.3 0.0 1 1 1e-11 7.8e-10 32.2 0.0 5 108 137 240 134 245 0.84 # 2141 # 2881 # 1 # ID=10_4;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 12_1 - 442 HI0933_like PF03486.9 409 3.8e-10 32.2 0.1 1 2 5.4e-06 0.00081 11.4 0.0 2 35 5 38 4 82 0.90 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 HI0933_like PF03486.9 409 3.8e-10 32.2 0.1 2 2 3.2e-08 4.8e-06 18.7 0.0 81 164 172 252 167 271 0.91 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 2_18 - 274 HTH_32 PF13565.1 77 4e-08 27.5 2.0 1 2 0.00031 0.024 9.0 0.3 21 75 50 93 36 95 0.63 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_32 PF13565.1 77 4e-08 27.5 2.0 2 2 5.3e-10 4e-08 27.5 2.0 1 77 90 173 90 173 0.69 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_45 - 104 HTH_32 PF13565.1 77 9.7e-07 23.1 0.0 1 1 2.3e-08 1.7e-06 22.3 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 4_9 - 60 HTH_3 PF01381.17 55 0.00037 13.8 0.1 1 1 3e-06 0.00046 13.6 0.1 4 44 2 42 1 44 0.88 # 5396 # 5575 # -1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 2_18 - 274 HTH_23 PF13384.1 50 3.4e-09 29.7 2.2 1 1 9.2e-08 1.5e-06 21.2 0.5 14 42 71 98 48 103 0.77 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 6_2 - 63 HTH_23 PF13384.1 50 1.9e-08 27.3 0.0 1 1 1.3e-09 2.1e-08 27.1 0.0 4 41 8 46 5 59 0.89 # 415 # 603 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_41 - 122 HTH_23 PF13384.1 50 3.5e-07 23.3 0.1 1 1 4.2e-08 7e-07 22.3 0.1 3 48 14 60 12 62 0.90 # 38573 # 38938 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_45 - 104 HTH_23 PF13384.1 50 3.3e-06 20.2 1.5 1 2 0.04 0.67 3.3 0.1 7 27 11 35 7 36 0.70 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 1_45 - 104 HTH_23 PF13384.1 50 3.3e-06 20.2 1.5 2 2 5.7e-06 9.6e-05 15.5 0.3 28 42 41 55 40 64 0.87 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 8_5 - 653 HTH_23 PF13384.1 50 6.8e-06 19.2 0.0 1 1 6.7e-06 0.00011 15.3 0.0 13 40 149 176 143 180 0.91 # 2729 # 4687 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 10_2 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 6.7e-05 16.0 0.3 1 1 4e-06 6.7e-05 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 2_16 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 0.00011 15.4 0.9 1 1 4.2e-05 0.0007 12.8 0.2 5 42 10 55 8 66 0.83 # 12890 # 13216 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 2_13 - 95 HTH_23 PF13384.1 50 0.00044 13.4 0.0 1 1 4.2e-05 0.0007 12.8 0.0 18 39 46 67 37 69 0.85 # 11953 # 12237 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 3_23 - 285 HTH_23 PF13384.1 50 0.00052 13.2 0.1 1 1 7e-05 0.0012 12.1 0.1 24 43 161 180 161 188 0.79 # 14807 # 15661 # -1 # ID=3_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_21 - 215 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00017 14.3 1.4 1 2 2.4e-06 0.00036 13.2 0.3 8 37 9 38 1 47 0.85 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00017 14.3 1.4 2 2 0.031 4.7 -0.3 0.0 189 210 67 88 40 147 0.59 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 10_2 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 3.5e-13 42.7 1.1 1 1 2.1e-14 7.8e-13 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 2_18 - 274 HTH_7 PF02796.10 45 4.4e-06 20.0 0.8 1 3 0.01 0.38 4.2 0.0 11 32 10 31 2 33 0.86 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_7 PF02796.10 45 4.4e-06 20.0 0.8 2 3 0.00025 0.0094 9.4 0.1 12 38 65 91 58 94 0.85 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_7 PF02796.10 45 4.4e-06 20.0 0.8 3 3 0.033 1.3 2.6 0.2 31 41 162 172 160 174 0.82 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_6 - 230 HTH_7 PF02796.10 45 9.4e-06 19.0 0.1 1 1 6e-07 2.3e-05 17.7 0.1 11 37 159 185 128 188 0.87 # 3114 # 3803 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 6_2 - 63 HTH_7 PF02796.10 45 0.00018 14.8 0.0 1 1 7.4e-06 0.00028 14.3 0.0 8 39 8 40 4 42 0.89 # 415 # 603 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 2_18 - 274 HTH_29 PF13551.1 112 2.7e-08 27.5 4.6 1 3 0.00061 0.031 8.0 0.0 2 66 11 67 10 72 0.79 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_29 PF13551.1 112 2.7e-08 27.5 4.6 2 3 1.5e-07 7.5e-06 19.6 1.7 7 108 70 173 64 175 0.82 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_29 PF13551.1 112 2.7e-08 27.5 4.6 3 3 0.063 3.2 1.5 0.2 22 74 162 217 160 241 0.58 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_41 - 122 HTH_29 PF13551.1 112 3.4e-05 17.5 0.2 1 1 1e-06 5.2e-05 16.9 0.2 11 71 29 88 18 109 0.67 # 38573 # 38938 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 10_2 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00016 15.3 0.6 1 2 0.074 3.7 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 10_2 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 0.00016 15.3 0.6 2 2 3.1e-05 0.0015 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 12_1 - 442 GIDA PF01134.17 392 4.8e-08 25.7 1.4 1 3 7.7e-08 1.2e-05 17.8 1.0 2 46 6 54 5 69 0.89 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 GIDA PF01134.17 392 4.8e-08 25.7 1.4 2 3 0.025 3.8 -0.3 0.0 103 150 84 129 65 138 0.82 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 GIDA PF01134.17 392 4.8e-08 25.7 1.4 3 3 0.0011 0.17 4.1 0.0 4 28 163 187 160 212 0.82 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_3 - 188 Met_10 PF02475.11 200 0.00041 13.5 0.0 1 1 3.6e-06 0.00055 13.0 0.0 94 189 43 132 29 145 0.80 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 12_1 - 442 ApbA PF02558.11 151 6.9e-05 15.8 1.5 1 2 2.8e-06 0.00043 13.2 0.0 2 31 7 36 6 81 0.86 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 ApbA PF02558.11 151 6.9e-05 15.8 1.5 2 2 0.022 3.3 0.6 0.1 2 27 162 187 161 194 0.90 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 XdhC_C PF13478.1 136 1.5e-06 22.0 0.1 1 2 3.5e-05 0.0053 10.6 0.0 2 47 7 53 6 81 0.75 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 XdhC_C PF13478.1 136 1.5e-06 22.0 0.1 2 2 0.0001 0.016 9.1 0.0 1 68 161 241 161 259 0.59 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 NAD_binding_8 PF13450.1 68 3.6e-06 20.5 0.7 1 2 6.2e-06 0.00093 12.7 0.1 1 33 8 41 8 71 0.89 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 NAD_binding_8 PF13450.1 68 3.6e-06 20.5 0.7 2 2 0.0012 0.18 5.4 0.1 1 29 163 191 163 193 0.94 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 16_2 - 90 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.7e-10 32.9 0.1 1 1 9.3e-12 4.7e-10 32.6 0.1 243 271 11 39 5 39 0.95 # 98 # 367 # 1 # ID=16_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.559 1_45 - 104 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 7.9e-10 31.8 0.2 1 1 1.6e-11 8.1e-10 31.8 0.2 5 96 10 97 6 104 0.90 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 15_1 - 173 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 0.00017 14.3 0.1 1 1 5.8e-06 0.00029 13.6 0.1 71 132 14 82 12 104 0.82 # 1 # 519 # 1 # ID=15_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 3_3 - 188 Methyltransf_31 PF13847.1 152 7.8e-07 22.3 0.0 1 1 1.3e-08 9.6e-07 22.0 0.0 5 119 52 162 48 183 0.83 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 4_12 - 519 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00018 14.6 0.0 1 1 6.8e-06 0.00051 13.1 0.0 3 84 217 308 215 378 0.68 # 6364 # 7920 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 4_14 - 1039 ResIII PF04851.10 184 2.5e-36 118.7 0.7 1 1 9.7e-38 1.5e-35 116.2 0.1 3 183 271 439 269 440 0.90 # 9310 # 12426 # 1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 1_31 - 721 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 3.7e-150 493.2 0.0 1 1 9.1e-152 4.6e-150 492.9 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 24700 # 26862 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_17 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 6.1e-07 21.8 0.1 1 2 7.2e-08 3.6e-06 19.2 0.0 15 53 479 517 470 547 0.80 # 9650 # 12277 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_17 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 6.1e-07 21.8 0.1 2 2 0.061 3.1 -0.3 0.0 261 317 713 769 685 772 0.92 # 9650 # 12277 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 11_5 - 344 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00014 14.0 0.0 1 1 4.2e-06 0.00021 13.4 0.0 14 40 173 199 168 235 0.88 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_21 - 215 TIGR01968 TIGR01968 261 6.2e-10 32.0 1.7 1 2 9.3e-11 1.4e-08 27.5 0.7 3 40 2 39 1 42 0.92 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 TIGR01968 TIGR01968 261 6.2e-10 32.0 1.7 2 2 0.002 0.31 3.5 0.0 99 134 66 101 54 130 0.78 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 4_6 - 327 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 4.2e-07 23.2 0.0 1 1 1.1e-08 8.1e-07 22.2 0.0 6 153 147 306 142 311 0.65 # 3197 # 4177 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 13_4 - 77 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 0.00074 12.6 0.1 1 1 1.1e-05 0.0008 12.5 0.1 113 156 18 59 2 61 0.74 # 1010 # 1240 # -1 # ID=13_4;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.511 11_5 - 344 AAA_18 PF13238.1 129 2.7e-05 18.0 0.0 1 1 7.2e-07 5.4e-05 17.0 0.0 1 33 177 221 177 252 0.75 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_21 - 215 AAA_18 PF13238.1 129 0.00067 13.5 0.1 1 1 2e-05 0.0015 12.4 0.1 8 42 11 45 9 130 0.73 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_18 - 424 IMS_HHH PF11798.3 32 1.6e-08 27.8 0.2 1 1 3.1e-10 4.6e-08 26.3 0.2 6 32 175 201 170 201 0.92 # 10954 # 12225 # 1 # ID=3_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 13_4 - 77 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 1.3e-09 31.6 0.2 1 1 1.9e-11 1.4e-09 31.5 0.2 62 123 6 64 1 66 0.81 # 1010 # 1240 # -1 # ID=13_4;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.511 4_6 - 327 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 1.1e-08 28.6 0.3 1 1 4.1e-10 3.1e-08 27.2 0.3 59 123 253 314 243 315 0.81 # 3197 # 4177 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 3_14 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.00054 13.0 0.0 1 2 0.016 2.4 1.2 0.0 53 79 4 29 2 33 0.92 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 3_14 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.00054 13.0 0.0 2 2 4.2e-05 0.0064 9.5 0.0 3 31 166 194 164 209 0.86 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 3_3 - 188 Methyltransf_12 PF08242.7 99 1.5e-05 18.9 0.0 1 1 1.7e-07 2.6e-05 18.2 0.0 1 99 55 144 55 144 0.86 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 3_3 - 188 Methyltrans_SAM PF10672.4 286 0.0013 11.0 0.0 1 1 1.2e-05 0.0018 10.6 0.0 196 261 113 173 99 180 0.79 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 11_5 - 344 DUF258 PF03193.11 161 9.4e-05 15.1 0.0 1 2 0.0036 0.54 2.9 0.0 13 59 45 95 37 141 0.75 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 11_5 - 344 DUF258 PF03193.11 161 9.4e-05 15.1 0.0 2 2 2.9e-05 0.0043 9.7 0.0 29 59 167 198 145 222 0.75 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 1_17 - 876 DUF87 PF01935.12 229 5.8e-07 23.0 0.0 1 1 2.3e-08 1.8e-06 21.4 0.0 26 221 482 668 468 676 0.74 # 9650 # 12277 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 11_5 - 344 DUF87 PF01935.12 229 3.5e-05 17.2 0.0 1 1 9.1e-07 6.9e-05 16.2 0.0 28 47 179 198 166 211 0.91 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 6_2 - 63 HTH_28 PF13518.1 52 4.4e-09 29.8 0.0 1 1 1.6e-10 4.9e-09 29.6 0.0 1 36 10 46 10 57 0.92 # 415 # 603 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 2_18 - 274 HTH_28 PF13518.1 52 2e-08 27.7 3.5 1 2 0.0033 0.099 6.3 0.0 1 41 9 47 9 55 0.77 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_28 PF13518.1 52 2e-08 27.7 3.5 2 2 2.1e-06 6.4e-05 16.4 0.4 11 41 73 103 65 115 0.79 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_41 - 122 HTH_28 PF13518.1 52 2.8e-08 27.2 0.5 1 1 2e-09 5.9e-08 26.2 0.0 1 43 17 60 17 63 0.93 # 38573 # 38938 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_45 - 104 HTH_28 PF13518.1 52 2.8e-05 17.6 1.5 1 1 4.1e-06 0.00012 15.5 1.5 22 36 40 54 12 55 0.73 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 10_2 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.0002 14.8 0.0 1 1 2.1e-05 0.00064 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 2_18 - 274 HTH_24 PF13412.1 48 0.0001 15.2 0.1 1 2 0.019 2.9 0.9 0.0 15 38 19 41 14 43 0.77 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_24 PF13412.1 48 0.0001 15.2 0.1 2 2 1.1e-05 0.0017 11.3 0.4 16 40 73 97 71 97 0.92 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 11_5 - 344 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00051 13.6 0.0 1 1 1.5e-05 0.0023 11.5 0.0 15 63 168 216 161 223 0.84 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 4_12 - 519 TIGR03533 TIGR03533 284 6e-07 22.2 0.1 1 2 6.1e-08 4.6e-06 19.3 0.0 118 200 214 304 201 314 0.82 # 6364 # 7920 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 4_12 - 519 TIGR03533 TIGR03533 284 6e-07 22.2 0.1 2 2 0.039 3 0.2 0.1 172 208 446 480 398 500 0.79 # 6364 # 7920 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 3_3 - 188 TIGR03533 TIGR03533 284 0.00059 12.4 0.0 1 1 1.2e-05 0.00093 11.7 0.0 118 210 47 133 37 141 0.87 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 4_12 - 519 TIGR03534 TIGR03534 253 1.8e-10 33.8 0.1 1 1 8.3e-12 6.3e-10 32.1 0.0 84 166 210 303 196 350 0.76 # 6364 # 7920 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 3_3 - 188 TIGR03534 TIGR03534 253 1.6e-07 24.2 0.0 1 1 2.5e-09 1.9e-07 23.9 0.0 80 175 44 131 12 148 0.86 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 12_1 - 442 TIGR01292 TIGR01292 300 7.7e-16 50.9 0.3 1 2 2.7e-05 0.0041 9.1 0.1 2 34 5 37 4 73 0.90 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 TIGR01292 TIGR01292 300 7.7e-16 50.9 0.3 2 2 1.3e-14 2e-12 39.7 0.0 144 276 161 295 158 302 0.81 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 4_14 - 1039 DEAD PF00270.24 169 6.2e-09 29.0 0.0 1 1 1.4e-10 2.1e-08 27.3 0.0 22 142 308 424 293 441 0.75 # 9310 # 12426 # 1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 12_1 - 442 NAD_binding_2 PF03446.10 163 0.00072 12.9 0.1 1 2 2.7e-05 0.0041 10.4 0.0 6 36 8 38 3 97 0.76 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 NAD_binding_2 PF03446.10 163 0.00072 12.9 0.1 2 2 0.055 8.3 -0.3 0.0 4 31 161 188 159 251 0.87 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 11_5 - 344 Miro PF08477.8 119 0.00049 14.1 0.0 1 1 7e-06 0.0011 13.0 0.0 2 25 177 200 176 230 0.74 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_21 - 215 DUF2075 PF09848.4 352 1.2e-05 17.8 0.1 1 1 9.3e-08 1.4e-05 17.7 0.1 5 95 4 90 1 137 0.75 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_32 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.1e-07 24.6 1.0 1 2 0.013 2 2.1 0.0 6 44 1227 1265 1223 1294 0.75 # 26862 # 32132 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_32 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.1e-07 24.6 1.0 2 2 4e-08 6e-06 19.9 0.2 3 102 1341 1444 1339 1446 0.74 # 26862 # 32132 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 3_3 - 188 TIGR00755 TIGR00755 256 9.1e-09 28.1 0.0 1 1 8.1e-11 1.2e-08 27.7 0.0 8 105 29 123 25 134 0.90 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 11_5 - 344 IIGP PF05049.8 376 0.00055 12.3 0.0 1 1 5.9e-06 0.0009 11.6 0.0 32 55 171 194 161 203 0.84 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 11_5 - 344 T2SE PF00437.15 272 4.3e-48 157.0 0.0 1 1 3.4e-50 5.2e-48 156.7 0.0 2 269 25 323 24 326 0.91 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_20 - 324 StbA PF06406.6 318 8.3e-150 491.5 0.7 1 1 6.2e-152 9.4e-150 491.3 0.7 1 317 1 319 1 320 0.99 # 12627 # 13598 # -1 # ID=3_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 11_5 - 344 UPF0079 PF02367.12 123 0.00097 12.3 0.0 1 1 1.7e-05 0.0026 10.9 0.0 18 44 177 203 164 210 0.80 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 11_5 - 344 AAA_17 PF13207.1 121 4.7e-05 17.7 0.0 1 1 2.6e-06 0.00013 16.3 0.0 2 27 177 200 176 261 0.79 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 1_31 - 721 AAA_17 PF13207.1 121 0.00046 14.5 0.0 1 1 3.5e-05 0.0018 12.6 0.0 3 27 189 217 187 262 0.68 # 24700 # 26862 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 3_21 - 215 AAA_17 PF13207.1 121 0.00058 14.2 0.1 1 1 1.6e-05 0.00079 13.8 0.1 9 76 11 85 2 183 0.69 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 2_6 - 322 TIGR02211 TIGR02211 221 5.1e-06 19.3 0.0 1 1 5e-08 7.6e-06 18.7 0.0 127 207 15 103 4 117 0.76 # 5343 # 6308 # 1 # ID=2_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.489 12_1 - 442 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1.7e-05 17.3 3.0 1 2 2e-07 3e-05 16.4 0.2 2 41 6 45 5 69 0.89 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1.7e-05 17.3 3.0 2 2 0.013 1.9 0.6 0.2 370 407 260 298 218 302 0.78 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_21 - 215 AAA_25 PF13481.1 194 4.6e-05 16.4 0.5 1 1 1.7e-06 0.00013 14.9 0.3 41 149 9 85 2 109 0.65 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_14 - 123 AAA_25 PF13481.1 194 0.0013 11.7 0.1 1 1 2.4e-05 0.0018 11.2 0.1 33 58 89 113 78 121 0.85 # 8254 # 8622 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.398 11_5 - 344 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.00021 14.3 0.0 1 1 4.7e-06 0.00036 13.6 0.0 1 22 177 198 177 224 0.79 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 1_32 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.00033 13.7 0.1 1 2 0.00062 0.047 6.6 0.0 1 24 988 1012 988 1192 0.77 # 26862 # 32132 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_32 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.00033 13.7 0.1 2 2 0.0038 0.28 4.1 0.0 146 234 1355 1447 1326 1447 0.65 # 26862 # 32132 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 11_5 - 344 Pox_A32 PF04665.7 241 0.00075 12.3 0.2 1 1 2.1e-05 0.0016 11.2 0.0 11 37 172 198 165 206 0.85 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 1_17 - 876 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0013 11.5 0.0 1 1 4.6e-05 0.0035 10.1 0.0 7 38 473 504 469 519 0.85 # 9650 # 12277 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 3_21 - 215 VirC1 PF07015.6 231 4e-08 26.1 0.1 1 1 3.3e-10 5e-08 25.8 0.1 8 200 7 199 1 209 0.72 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_41 - 122 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00053 12.7 1.6 1 2 7.2e-06 0.0011 11.7 0.1 7 42 8 44 8 46 0.92 # 38573 # 38938 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_41 - 122 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00053 12.7 1.6 2 2 0.081 12 -1.3 0.0 24 34 53 62 51 64 0.81 # 38573 # 38938 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 11_5 - 344 AAA_33 PF13671.1 143 9.5e-06 19.0 0.0 1 1 5.7e-07 4.3e-05 16.9 0.0 2 32 177 210 177 268 0.79 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_21 - 215 AAA_33 PF13671.1 143 0.00019 14.8 0.1 1 2 1.6e-05 0.0012 12.3 0.1 9 85 11 94 3 182 0.74 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 AAA_33 PF13671.1 143 0.00019 14.8 0.1 2 2 0.054 4.1 0.8 0.0 75 96 145 166 134 208 0.73 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_41 - 122 CENP-B_N PF04218.8 53 4.7e-06 19.5 0.0 1 1 1.2e-07 9e-06 18.6 0.0 3 44 9 51 8 55 0.86 # 38573 # 38938 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 6_2 - 63 CENP-B_N PF04218.8 53 3.6e-05 16.7 0.0 1 1 6.7e-07 5.1e-05 16.2 0.0 12 45 11 45 8 46 0.88 # 415 # 603 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 1_31 - 721 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 6.6e-10 31.5 0.0 1 1 2e-11 1.5e-09 30.4 0.0 250 362 362 477 198 501 0.76 # 24700 # 26862 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_17 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 8.8e-05 14.6 0.0 1 2 0.00085 0.064 5.2 0.0 105 185 533 607 470 623 0.86 # 9650 # 12277 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_17 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 8.8e-05 14.6 0.0 2 2 0.00022 0.017 7.1 0.0 319 378 711 769 664 771 0.91 # 9650 # 12277 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 3_3 - 188 MTS PF05175.9 170 5.9e-09 29.0 0.0 1 1 1.1e-10 8.2e-09 28.5 0.0 24 141 45 149 41 166 0.84 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 4_12 - 519 MTS PF05175.9 170 6.2e-06 19.1 0.8 1 1 2.5e-07 1.9e-05 17.6 0.0 31 140 217 355 199 374 0.82 # 6364 # 7920 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.454 1_45 - 104 Arg_repressor PF01316.16 70 0.0014 11.7 0.0 1 1 1.4e-05 0.0021 11.1 0.0 23 46 29 52 26 55 0.92 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 11_5 - 344 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00041 14.0 0.0 1 1 6.4e-06 0.00097 12.8 0.0 1 23 177 199 177 229 0.83 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_3 - 188 Methyltransf_23 PF13489.1 161 0.00014 15.1 0.0 1 1 1.1e-06 0.00017 14.8 0.0 11 120 40 153 10 174 0.79 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 3_21 - 215 APS_kinase PF01583.15 157 4.2e-06 20.0 0.1 1 1 5.8e-08 8.8e-06 18.9 0.1 11 43 10 42 2 53 0.88 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 2_1 - 99 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.5e-56 183.6 0.3 1 1 5.3e-58 1.6e-56 183.5 0.3 34 131 1 98 1 98 0.99 # 3 # 299 # 1 # ID=2_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.529 19_1 - 82 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 5.3e-46 149.5 0.1 1 1 1.9e-47 5.8e-46 149.3 0.1 34 115 1 82 1 82 0.99 # 2 # 247 # -1 # ID=19_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.565 17_1 - 68 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.6e-40 131.7 0.5 1 1 5.9e-42 1.8e-40 131.6 0.5 7 74 1 68 1 68 0.99 # 3 # 206 # -1 # ID=17_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.574 2_21 - 59 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1e-30 100.0 2.7 1 1 3.6e-32 1.1e-30 99.9 2.7 74 131 1 58 1 58 0.98 # 16409 # 16585 # -1 # ID=2_21;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.486 4_1 - 59 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.1e-30 98.5 2.7 1 1 1.1e-31 3.3e-30 98.4 2.7 74 131 1 58 1 58 0.98 # 1 # 177 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 12_1 - 442 3HCDH_N PF02737.13 180 4.4e-11 36.2 0.4 1 2 3.1e-06 0.00047 13.3 0.1 2 34 6 38 5 72 0.91 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 3HCDH_N PF02737.13 180 4.4e-11 36.2 0.4 2 2 1.2e-08 1.9e-06 21.1 0.0 2 75 161 233 160 249 0.79 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 15_1 - 173 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 3.3e-53 172.9 0.1 1 1 1.6e-54 4e-53 172.6 0.1 4 139 13 150 11 151 0.99 # 1 # 519 # 1 # ID=15_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.530 11_1 - 60 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 9e-17 54.8 0.1 1 1 4.6e-18 1.2e-16 54.5 0.1 4 33 31 60 29 60 0.98 # 2 # 181 # -1 # ID=11_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_45 - 104 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.2e-16 53.6 0.1 1 1 1.6e-17 3.9e-16 52.8 0.1 4 33 75 104 73 104 0.98 # 43109 # 43420 # 1 # ID=1_45;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.558 2_19 - 271 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 8.5e-11 35.5 0.4 1 1 4.4e-12 1.1e-10 35.1 0.4 2 139 107 248 106 249 0.85 # 15113 # 15925 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 14_1 - 216 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 5.9e-10 32.7 0.5 1 1 2.9e-11 7.4e-10 32.4 0.5 2 139 65 206 64 207 0.82 # 1 # 648 # 1 # ID=14_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.515 2_17 - 296 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 6.6e-08 26.1 0.0 1 1 3.9e-09 9.8e-08 25.6 0.0 2 137 130 267 129 269 0.91 # 13216 # 14103 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 3_20 - 324 MreB_Mbl PF06723.8 327 0.00035 12.7 0.6 1 2 7.7e-05 0.012 7.7 0.1 141 162 162 183 141 194 0.86 # 12627 # 13598 # -1 # ID=3_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 3_20 - 324 MreB_Mbl PF06723.8 327 0.00035 12.7 0.6 2 2 0.0016 0.24 3.4 0.0 250 318 251 320 236 323 0.74 # 12627 # 13598 # -1 # ID=3_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 2_18 - 274 HTH_17 PF12728.2 51 1.8e-05 18.5 1.2 1 3 0.00029 0.022 8.6 0.0 5 32 24 53 23 58 0.82 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_17 PF12728.2 51 1.8e-05 18.5 1.2 2 3 0.03 2.3 2.1 0.0 2 26 75 99 75 108 0.79 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 HTH_17 PF12728.2 51 1.8e-05 18.5 1.2 3 3 0.0085 0.64 3.9 0.2 10 20 161 171 159 204 0.77 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 6_2 - 63 HTH_17 PF12728.2 51 0.001 12.9 0.0 1 1 1.7e-05 0.0013 12.5 0.0 2 25 23 46 22 61 0.81 # 415 # 603 # -1 # ID=6_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 10_2 - 186 TrmB PF01978.14 68 8.4e-05 15.8 0.0 1 1 1.1e-06 0.00017 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 12_1 - 442 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 7.9e-37 120.5 6.0 1 1 4.6e-37 7e-35 114.2 6.0 2 199 6 296 5 298 0.94 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 DAO PF01266.19 358 7.1e-13 41.6 1.4 1 3 5.6e-08 8.5e-06 18.3 0.0 2 41 6 45 5 110 0.82 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 DAO PF01266.19 358 7.1e-13 41.6 1.4 2 3 0.0004 0.06 5.6 0.1 4 31 163 190 160 193 0.92 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 DAO PF01266.19 358 7.1e-13 41.6 1.4 3 3 3.7e-07 5.6e-05 15.6 0.1 148 233 200 284 197 377 0.71 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 2_13 - 95 Phage_terminase PF10668.4 60 1.6e-06 21.3 0.0 1 1 5.3e-08 2.6e-06 20.7 0.0 26 46 49 69 43 70 0.83 # 11953 # 12237 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 2_18 - 274 Phage_terminase PF10668.4 60 4.1e-05 16.8 0.2 1 2 0.0096 0.48 3.8 0.0 13 39 14 37 9 39 0.78 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_18 - 274 Phage_terminase PF10668.4 60 4.1e-05 16.8 0.2 2 2 0.00052 0.026 7.9 0.0 21 40 73 92 69 98 0.91 # 14143 # 14964 # -1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_16 - 109 Phage_terminase PF10668.4 60 0.00065 13.0 0.0 1 1 2.3e-05 0.0012 12.2 0.0 9 45 12 53 5 69 0.80 # 12890 # 13216 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 3_21 - 215 SKI PF01202.17 158 0.001 12.4 0.4 1 2 0.0009 0.14 5.5 0.2 2 16 11 25 10 31 0.89 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 SKI PF01202.17 158 0.001 12.4 0.4 2 2 0.0013 0.2 5.0 0.0 87 150 31 95 24 109 0.72 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 1_17 - 876 AAA_10 PF12846.2 304 4e-49 161.1 0.0 1 1 1.3e-50 6.7e-49 160.4 0.0 1 294 479 768 479 774 0.89 # 9650 # 12277 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.545 1_31 - 721 AAA_10 PF12846.2 304 2e-10 34.1 0.0 1 1 7.1e-11 3.6e-09 29.9 0.0 3 296 187 494 186 500 0.68 # 24700 # 26862 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 11_5 - 344 AAA_10 PF12846.2 304 0.00014 14.8 0.0 1 1 4.6e-06 0.00023 14.1 0.0 3 26 176 199 174 234 0.82 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 10_2 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 3e-06 20.5 0.2 1 2 0.0074 0.56 3.6 0.0 33 52 8 27 4 28 0.91 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 10_2 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 3e-06 20.5 0.2 2 2 1.8e-05 0.0014 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 345 # 902 # 1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_3 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.00012 15.4 0.0 1 2 0.0015 0.11 5.9 0.0 24 47 102 125 97 125 0.89 # 2264 # 3241 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 7_3 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.00012 15.4 0.0 2 2 0.00069 0.052 6.9 0.1 19 58 213 259 185 262 0.77 # 2264 # 3241 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 2_5 - 403 Dimerisation PF08100.6 51 0.00062 13.1 0.2 1 1 2.9e-05 0.0044 10.4 0.0 16 47 29 65 27 66 0.80 # 4021 # 5229 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.449 3_3 - 188 RrnaAD PF00398.15 262 8.1e-09 28.3 0.0 1 1 6.9e-11 1e-08 28.0 0.0 9 113 29 128 24 148 0.89 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 3_3 - 188 Methyltransf_18 PF12847.2 112 8.4e-11 36.0 0.0 1 1 1.2e-12 1.8e-10 34.9 0.0 4 109 53 146 50 148 0.89 # 1610 # 2173 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 3_14 - 228 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.0016 12.4 0.0 1 2 0.0024 0.36 4.9 0.0 78 93 53 68 47 70 0.84 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 3_14 - 228 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.0016 12.4 0.0 2 2 0.0027 0.4 4.8 0.0 5 52 172 218 168 224 0.82 # 7884 # 8567 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 2_4 - 407 AAA_13 PF13166.1 712 8.2e-15 47.7 0.0 1 2 5.5e-12 4.1e-10 32.1 0.0 15 130 20 152 10 170 0.76 # 2832 # 4052 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 2_4 - 407 AAA_13 PF13166.1 712 8.2e-15 47.7 0.0 2 2 2.3e-06 0.00017 13.6 0.0 239 390 194 383 183 387 0.61 # 2832 # 4052 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 2_6 - 322 AAA_13 PF13166.1 712 2.3e-13 42.9 0.1 1 1 4.3e-15 3.3e-13 42.4 0.0 498 572 27 98 6 180 0.90 # 5343 # 6308 # 1 # ID=2_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.489 3_21 - 215 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.7e-08 27.3 3.9 1 3 1.6e-08 2.4e-06 20.2 0.8 6 38 5 38 1 39 0.85 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.7e-08 27.3 3.9 2 3 0.0001 0.015 7.7 0.0 96 135 46 87 35 89 0.83 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.7e-08 27.3 3.9 3 3 0.095 14 -2.0 0.0 73 108 133 167 111 187 0.54 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 11_5 - 344 Septin PF00735.13 281 0.0005 12.6 0.0 1 1 5.3e-06 0.00079 11.9 0.0 4 33 174 203 172 228 0.82 # 1362 # 2393 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.492 3_21 - 215 AAA_31 PF13614.1 157 1.9e-09 31.1 0.2 1 2 1e-09 1.6e-07 24.9 0.1 2 42 2 42 1 70 0.86 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 3_21 - 215 AAA_31 PF13614.1 157 1.9e-09 31.1 0.2 2 2 0.0022 0.34 4.3 0.0 106 134 67 95 60 109 0.82 # 13820 # 14464 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 12_1 - 442 ADH_zinc_N PF00107.21 130 0.0002 14.4 0.0 1 2 0.0018 0.27 4.3 0.0 38 65 193 220 188 225 0.88 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 ADH_zinc_N PF00107.21 130 0.0002 14.4 0.0 2 2 0.00023 0.034 7.2 0.0 28 97 346 415 343 428 0.81 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_32 - 1757 AAA_11 PF13086.1 236 0.00039 13.5 0.0 1 1 2.6e-06 0.00039 13.5 0.0 2 75 969 1039 968 1059 0.81 # 26862 # 32132 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 3_2 - 180 SSB PF00436.20 104 1.1e-40 131.3 0.4 1 1 9.1e-43 1.4e-40 130.9 0.4 1 101 6 109 6 112 0.96 # 219 # 758 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 12_1 - 442 Lycopene_cycl PF05834.7 374 5.1e-05 15.7 1.1 1 2 1.1e-05 0.0017 10.7 0.1 3 36 7 38 5 43 0.90 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 12_1 - 442 Lycopene_cycl PF05834.7 374 5.1e-05 15.7 1.1 2 2 0.0018 0.27 3.5 0.1 96 142 212 257 197 271 0.74 # 224 # 1549 # -1 # ID=12_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 1_40 - 302 HTH_21 PF13276.1 60 9.3e-19 60.8 2.0 1 2 1.1e-18 4.2e-17 55.5 0.6 6 57 49 106 45 109 0.79 # 37710 # 38615 # -1 # ID=1_40;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.552 1_40 - 302 HTH_21 PF13276.1 60 9.3e-19 60.8 2.0 2 2 0.013 0.48 4.0 0.0 11 33 264 288 255 301 0.77 # 37710 # 38615 # -1 # ID=1_40;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.552 2_17 - 296 HTH_21 PF13276.1 60 6.3e-17 54.9 5.8 1 1 1.7e-18 6.3e-17 54.9 5.8 3 60 47 103 44 103 0.92 # 13216 # 14103 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 2_19 - 271 HTH_21 PF13276.1 60 1.1e-15 50.9 0.6 1 1 8.3e-17 3.1e-15 49.5 0.6 2 56 23 76 22 84 0.90 # 15113 # 15925 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.508 14_1 - 216 HTH_21 PF13276.1 60 9.4e-09 28.7 1.9 1 1 7e-10 2.7e-08 27.3 1.9 22 56 1 34 1 43 0.89 # 1 # 648 # 1 # ID=14_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.515 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/7a4a843f-19e3-4646-9ec5-973e9b802bd8 # Target file: checkm_output/bins/pm349/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm349/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/7a4a843f-19e3-4646-9ec5-973e9b802bd8 checkm_output/bins/pm349/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:03:25 2017 # [ok]