# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_33 - 196 HTH_22 PF13309.1 64 6e-06 18.4 0.1 1 1 2.9e-07 2e-05 16.7 0.0 43 63 159 179 150 180 0.83 # 26735 # 27322 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_33 - 196 HTH_40 PF14493.1 91 5.7e-05 15.7 0.0 1 1 1.5e-06 0.0001 14.9 0.0 2 34 147 179 146 189 0.93 # 26735 # 27322 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_66 - 190 MT-A70 PF05063.9 176 7.2e-34 109.2 0.0 1 1 1.2e-35 8.2e-34 109.0 0.0 1 176 2 174 2 174 0.92 # 44996 # 45565 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.539 1_59 - 99 DUF3584 PF12128.3 1201 0.0001 12.1 0.7 1 1 1.7e-06 0.00011 11.9 0.7 832 901 10 82 3 94 0.76 # 40836 # 41132 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_43 - 217 CbiA PF01656.18 195 7.7e-18 56.9 0.1 1 1 1.9e-19 1.3e-17 56.2 0.1 3 194 7 178 5 180 0.77 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_39 - 91 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 2.3e-06 19.4 0.2 1 2 1.1e-05 0.00038 12.3 0.0 21 46 9 34 8 34 0.91 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_39 - 91 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 2.3e-06 19.4 0.2 2 2 0.0022 0.077 5.0 0.4 3 22 51 70 49 74 0.87 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_37 - 100 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 2.8e-05 16.0 0.0 1 1 1.7e-06 5.8e-05 15.0 0.0 20 46 34 60 34 64 0.89 # 30015 # 30314 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_43 - 217 YhjQ PF06564.7 244 0.00057 11.6 0.0 1 2 5.2e-05 0.0036 9.0 0.1 10 38 11 39 3 43 0.91 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_43 - 217 YhjQ PF06564.7 244 0.00057 11.6 0.0 2 2 0.03 2 -0.0 0.0 105 143 69 107 53 113 0.78 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_33 - 196 Terminase_5 PF06056.7 58 0.00046 12.2 0.0 1 1 1e-05 0.00072 11.5 0.0 5 40 150 185 146 190 0.87 # 26735 # 27322 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_33 - 196 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.00026 13.1 0.0 1 1 8e-05 0.0055 8.9 0.0 26 72 91 134 66 189 0.71 # 26735 # 27322 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_33 - 196 GerE PF00196.14 58 0.00023 12.9 0.0 1 1 6.6e-06 0.00046 11.9 0.0 14 38 154 178 153 181 0.88 # 26735 # 27322 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_43 - 217 MipZ PF09140.6 261 2.3e-10 32.3 0.0 1 1 6.1e-12 4.2e-10 31.4 0.0 5 58 7 60 3 130 0.86 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_69 - 244 DUF1804 PF08822.6 165 2e-05 16.8 0.1 1 1 5.2e-07 3.6e-05 15.9 0.1 88 152 6 69 1 78 0.85 # 46500 # 47231 # 1 # ID=1_69;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 1_39 - 91 Sigma70_r4 PF04545.11 50 6.4e-06 17.9 0.2 1 2 1e-06 3.5e-05 15.5 0.0 16 38 10 32 7 37 0.85 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_39 - 91 Sigma70_r4 PF04545.11 50 6.4e-06 17.9 0.2 2 2 0.075 2.6 -0.1 0.1 2 16 56 70 55 79 0.82 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_37 - 100 Sigma70_r4 PF04545.11 50 1.1e-05 17.1 0.5 1 1 6.7e-07 2.3e-05 16.1 0.1 20 44 40 64 32 66 0.88 # 30015 # 30314 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_37 - 100 HTH_37 PF13744.1 80 3.4e-15 48.1 0.8 1 1 1.2e-16 4.2e-15 47.8 0.8 6 79 12 87 7 88 0.87 # 30015 # 30314 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_39 - 91 HTH_37 PF13744.1 80 3.2e-06 19.3 0.2 1 1 3.6e-07 1.2e-05 17.4 0.2 23 55 6 38 3 70 0.83 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_37 - 100 P22_Cro PF14549.1 60 0.00059 12.0 0.0 1 1 3.3e-05 0.0023 10.1 0.0 11 28 42 59 41 66 0.90 # 30015 # 30314 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_37 - 100 HTH_25 PF13413.1 62 2.4e-05 16.3 0.2 1 1 6.4e-07 4.4e-05 15.5 0.2 2 33 32 63 31 88 0.79 # 30015 # 30314 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_43 - 217 SRP54 PF00448.17 196 0.0002 13.2 0.0 1 1 5.1e-06 0.00036 12.4 0.0 4 91 6 89 3 108 0.80 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_45 - 220 HTH_3 PF01381.17 55 5.4e-15 47.5 0.1 1 1 4.1e-16 9.3e-15 46.7 0.1 1 54 16 69 16 70 0.94 # 34578 # 35237 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.445 1_37 - 100 HTH_3 PF01381.17 55 5.7e-10 31.4 0.3 1 1 3.6e-11 8.2e-10 30.9 0.3 2 52 33 83 32 85 0.94 # 30015 # 30314 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_39 - 91 HTH_3 PF01381.17 55 1.7e-07 23.5 0.0 1 1 1.4e-08 3.1e-07 22.6 0.0 1 36 6 40 6 46 0.90 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_39 - 91 HTH_23 PF13384.1 50 3.7e-05 15.8 0.1 1 1 5.7e-06 0.0002 13.4 0.0 12 37 7 34 6 40 0.83 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_33 - 196 HTH_23 PF13384.1 50 4.3e-05 15.6 0.1 1 1 5.6e-06 0.00019 13.5 0.0 13 38 154 179 148 183 0.88 # 26735 # 27322 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_33 - 196 HTH_7 PF02796.10 45 9.3e-08 24.3 0.1 1 1 2.2e-09 1.5e-07 23.6 0.1 1 44 138 181 138 182 0.97 # 26735 # 27322 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_45 - 220 HTH_19 PF12844.2 64 5.5e-11 34.8 0.0 1 1 4.4e-12 1e-10 34.0 0.0 3 60 15 72 13 76 0.93 # 34578 # 35237 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.445 1_37 - 100 HTH_19 PF12844.2 64 1.4e-06 20.7 0.1 1 1 8.6e-08 2e-06 20.2 0.1 7 54 35 82 32 89 0.90 # 30015 # 30314 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_39 - 91 HTH_19 PF12844.2 64 1.9e-05 17.1 0.0 1 1 1.1e-06 2.5e-05 16.7 0.0 4 41 6 43 5 68 0.84 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_33 - 196 HTH_29 PF13551.1 112 0.00015 14.3 0.1 1 2 0.038 2.6 0.7 0.1 39 62 125 147 116 160 0.68 # 26735 # 27322 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_33 - 196 HTH_29 PF13551.1 112 0.00015 14.3 0.1 2 2 2e-05 0.0014 11.2 0.0 11 44 158 190 150 195 0.84 # 26735 # 27322 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_4 - 458 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00015 13.8 0.0 1 2 0.016 1.1 1.2 0.0 8 23 242 257 237 268 0.83 # 1491 # 2864 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_4 - 458 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00015 13.8 0.0 2 2 3.1e-05 0.0022 10.0 0.0 66 126 293 353 281 396 0.67 # 1491 # 2864 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_43 - 217 TIGR01968 TIGR01968 261 1.5e-08 26.3 1.3 1 2 5e-10 3.5e-08 25.1 0.8 5 40 6 41 2 45 0.93 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_43 - 217 TIGR01968 TIGR01968 261 1.5e-08 26.3 1.3 2 2 0.079 5.5 -1.7 0.0 99 122 71 92 67 111 0.72 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_39 - 91 HTH_psq PF05225.11 45 0.00017 13.5 0.0 1 1 4.4e-06 0.0003 12.7 0.0 13 42 10 40 7 42 0.89 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_4 - 458 Methyltransf_12 PF08242.7 99 6.1e-05 15.9 0.1 1 1 2.5e-06 0.00017 14.4 0.1 2 98 243 333 242 334 0.71 # 1491 # 2864 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_39 - 91 HTH_28 PF13518.1 52 8.7e-06 18.1 0.1 1 1 4.5e-07 1.5e-05 17.3 0.1 7 32 7 34 6 37 0.81 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_35 - 99 HTH_28 PF13518.1 52 0.00039 12.8 0.0 1 1 1.8e-05 0.00063 12.2 0.0 8 33 33 61 31 63 0.84 # 29131 # 29427 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_8 - 620 Terminase_GpA PF05876.7 557 3.1e-178 585.9 0.0 1 1 6e-180 4.1e-178 585.5 0.0 4 551 34 583 31 590 0.96 # 5257 # 7116 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 1_45 - 220 HTH_31 PF13560.1 64 5.3e-11 35.0 0.0 1 1 3.5e-12 8.2e-11 34.4 0.0 2 59 12 68 11 76 0.94 # 34578 # 35237 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.445 1_37 - 100 HTH_31 PF13560.1 64 8.1e-11 34.4 0.0 1 1 5.2e-12 1.2e-10 33.9 0.0 6 56 32 81 31 89 0.92 # 30015 # 30314 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_39 - 91 HTH_31 PF13560.1 64 1.5e-10 33.6 0.0 1 1 9.3e-12 2.1e-10 33.1 0.0 3 43 3 43 2 57 0.86 # 30922 # 31194 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_43 - 217 AAA_17 PF13207.1 121 0.00012 15.3 0.0 1 2 7e-06 0.00048 13.4 0.0 6 35 10 52 5 131 0.62 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_43 - 217 AAA_17 PF13207.1 121 0.00012 15.3 0.0 2 2 0.095 6.5 0.0 0.0 24 40 161 178 99 213 0.57 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_43 - 217 AAA_25 PF13481.1 194 6.1e-06 18.1 0.8 1 1 4e-07 2.7e-05 16.0 0.8 34 149 4 88 2 97 0.68 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_43 - 217 VirC1 PF07015.6 231 0.00055 11.4 0.1 1 1 1.7e-05 0.0011 10.4 0.1 10 130 11 128 3 132 0.85 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_43 - 217 Methyltransf_16 PF10294.4 174 0.00025 12.9 0.0 1 1 5.4e-06 0.00037 12.3 0.0 62 146 23 107 19 112 0.88 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_4 - 458 Methyltransf_23 PF13489.1 161 7.3e-19 60.4 0.0 1 1 1.5e-20 1.1e-18 59.9 0.0 24 159 220 400 198 402 0.71 # 1491 # 2864 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_45 - 220 HTH_26 PF13443.1 63 1.2e-07 24.3 0.0 1 1 7.4e-09 5.1e-07 22.3 0.0 1 56 15 69 15 75 0.91 # 34578 # 35237 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.445 1_33 - 196 HTH_17 PF12728.2 51 0.00014 14.5 0.1 1 1 1e-05 0.00034 13.3 0.1 3 22 160 179 159 193 0.83 # 26735 # 27322 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_7 - 182 HTH_17 PF12728.2 51 0.00029 13.5 0.0 1 1 1.9e-05 0.00066 12.4 0.0 4 34 6 36 3 37 0.85 # 4706 # 5251 # 1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_8 - 620 Prim_Zn_Ribbon PF08273.7 40 0.0053 9.3 7.3 1 1 0.00031 0.021 7.4 7.3 2 20 231 248 230 279 0.65 # 5257 # 7116 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 1_35 - 99 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.00022 13.3 0.0 1 1 3.7e-06 0.00026 13.1 0.0 126 177 12 65 2 70 0.84 # 29131 # 29427 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_44 - 127 Dimerisation PF08100.6 51 0.00016 13.9 0.4 1 2 6.7e-05 0.0046 9.2 0.0 2 11 58 67 57 70 0.88 # 34103 # 34483 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 1_44 - 127 Dimerisation PF08100.6 51 0.00016 13.9 0.4 2 2 0.009 0.62 2.4 0.1 25 46 98 119 87 124 0.69 # 34103 # 34483 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.430 1_4 - 458 Methyltransf_18 PF12847.2 112 0.00013 14.9 0.1 1 1 5.6e-06 0.00039 13.4 0.1 2 108 238 335 237 338 0.81 # 1491 # 2864 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_21 - 819 AAA_13 PF13166.1 712 0.0019 9.0 11.9 1 2 4.5e-06 0.00031 11.6 7.7 320 476 28 194 7 212 0.74 # 15476 # 17932 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_21 - 819 AAA_13 PF13166.1 712 0.0019 9.0 11.9 2 2 0.066 4.5 -2.2 0.1 452 494 377 421 353 478 0.71 # 15476 # 17932 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_43 - 217 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.1e-07 23.5 0.1 1 2 3e-08 2.1e-06 19.3 0.3 5 38 7 40 3 42 0.93 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_43 - 217 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.1e-07 23.5 0.1 2 2 0.0089 0.61 1.4 0.0 117 133 72 88 64 91 0.91 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_43 - 217 AAA_31 PF13614.1 157 1.8e-09 30.1 0.0 1 2 3.7e-08 2.5e-06 19.9 0.0 3 44 5 46 4 65 0.90 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_43 - 217 AAA_31 PF13614.1 157 1.8e-09 30.1 0.0 2 2 0.00014 0.0099 8.2 0.0 114 149 76 112 69 119 0.85 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_43 - 217 IstB_IS21 PF01695.12 178 6.4e-05 14.8 0.3 1 1 3.4e-06 0.00024 12.9 0.3 51 88 7 44 4 108 0.89 # 33305 # 33955 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_54 - 94 FaeA PF04703.7 62 8.8e-05 15.1 0.0 1 1 1.8e-06 0.00012 14.6 0.0 3 46 9 51 7 59 0.85 # 39428 # 39709 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/8c5b6617-fa52-4430-9e3e-da5049473fb2 # Target file: checkm_output/bins/pm321/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm321/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/8c5b6617-fa52-4430-9e3e-da5049473fb2 checkm_output/bins/pm321/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:02:53 2017 # [ok]