# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_49 - 213 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.00074 12.2 0.1 1 1 9.4e-06 0.0011 11.6 0.1 13 48 47 82 43 188 0.72 # 35901 # 36539 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_84 - 447 KaiC PF06745.8 227 8.4e-12 37.8 0.8 1 3 0.016 0.97 1.6 0.1 85 142 74 132 35 182 0.61 # 69625 # 70965 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_84 - 447 KaiC PF06745.8 227 8.4e-12 37.8 0.8 2 3 5.4e-12 3.3e-10 32.6 0.1 2 165 191 373 190 408 0.63 # 69625 # 70965 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_84 - 447 KaiC PF06745.8 227 8.4e-12 37.8 0.8 3 3 0.012 0.75 2.0 0.1 64 137 341 412 336 432 0.65 # 69625 # 70965 # 1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_110 - 358 KaiC PF06745.8 227 8.3e-06 18.2 0.0 1 1 2.2e-07 1.4e-05 17.5 0.0 13 46 41 78 20 95 0.76 # 93510 # 94583 # 1 # ID=1_110;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_110 - 358 RecA PF00154.16 323 7.9e-48 156.3 0.0 1 1 1.2e-49 1.5e-47 155.4 0.0 22 281 16 306 11 323 0.79 # 93510 # 94583 # 1 # ID=1_110;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_105 - 1174 HHH_3 PF12836.2 65 4e-05 16.7 0.0 1 2 0.0061 0.74 3.1 0.0 19 40 793 814 785 817 0.91 # 86992 # 90513 # 1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_105 - 1174 HHH_3 PF12836.2 65 4e-05 16.7 0.0 2 2 3.2e-05 0.0039 10.4 0.0 17 48 898 930 888 932 0.82 # 86992 # 90513 # 1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_49 - 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