# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_60 - 647 ATP-synt_ab PF00006.20 215 8.5e-05 16.3 0.6 1 3 0.0013 0.33 4.6 0.1 11 33 30 52 24 56 0.88 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_60 - 647 ATP-synt_ab PF00006.20 215 8.5e-05 16.3 0.6 2 3 0.00034 0.086 6.5 0.0 100 143 190 233 173 241 0.88 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_60 - 647 ATP-synt_ab PF00006.20 215 8.5e-05 16.3 0.6 3 3 0.013 3.4 1.3 0.0 119 173 481 544 464 557 0.80 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_10 - 646 KaiC PF06745.8 227 0.00093 12.5 0.8 1 2 0.0017 0.21 4.8 0.0 16 35 31 50 21 52 0.89 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_10 - 646 KaiC PF06745.8 227 0.00093 12.5 0.8 2 2 0.0018 0.22 4.7 0.0 135 192 178 232 171 243 0.84 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 4_7 - 303 KaiC PF06745.8 227 0.0028 11.0 0.0 1 2 0.079 9.9 -0.6 0.0 21 39 63 81 49 96 0.85 # 3779 # 4687 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 4_7 - 303 KaiC PF06745.8 227 0.0028 11.0 0.0 2 2 9.9e-05 0.013 8.8 0.0 105 151 135 180 112 187 0.84 # 3779 # 4687 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 4_22 - 286 HTH_IclR PF09339.5 52 1.6e-17 57.1 0.6 1 1 6.4e-19 5.4e-17 55.4 0.1 1 49 41 89 41 92 0.96 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_74 - 53 HTH_IclR PF09339.5 52 0.0011 12.8 0.0 1 1 1.6e-05 0.0014 12.5 0.0 17 36 33 52 20 52 0.92 # 68148 # 68306 # 1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 2_17 - 211 HTH_IclR PF09339.5 52 0.0018 12.1 0.0 1 1 5.5e-05 0.0046 10.8 0.0 18 46 34 62 30 63 0.84 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_9 - 99 APOBEC_C PF05240.9 55 0.00065 13.3 0.1 1 1 4.4e-06 0.0011 12.6 0.1 4 27 54 77 52 79 0.91 # 7305 # 7601 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 3_10 - 646 ABC_tran PF00005.22 137 4.7e-33 108.6 0.0 1 1 1.1e-34 8.9e-33 107.7 0.0 1 136 24 172 24 173 0.91 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_60 - 647 ABC_tran PF00005.22 137 1.3e-31 103.9 0.0 1 1 4e-33 3.4e-31 102.6 0.0 1 136 24 172 24 173 0.89 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_12 - 368 ABC_tran PF00005.22 137 2.1e-27 90.3 0.0 1 1 4.1e-29 3.4e-27 89.6 0.0 2 137 162 312 161 312 0.86 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 4_9 - 205 HTH_22 PF13309.1 64 0.00069 13.6 0.0 1 1 1e-05 0.0013 12.7 0.0 48 63 172 187 168 188 0.89 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 8_1 - 93 HTH_22 PF13309.1 64 0.002 12.1 2.3 1 1 1.8e-05 0.0022 12.0 0.2 25 63 10 43 1 44 0.77 # 64 # 342 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 1_38 - 874 DUF815 PF05673.8 250 0.00086 12.5 0.0 1 1 6.1e-06 0.0015 11.6 0.0 27 81 167 221 148 230 0.82 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_74 - 53 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 7e-05 16.6 0.0 1 1 6.9e-07 8.7e-05 16.3 0.0 17 35 34 52 23 52 0.86 # 68148 # 68306 # 1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 2_17 - 211 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00017 15.4 0.0 1 1 5.3e-06 0.00066 13.4 0.0 18 36 35 53 29 59 0.84 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_28 - 421 Cdd1 PF11731.3 93 0.001 13.2 0.0 1 1 3.2e-05 0.004 11.3 0.0 10 43 176 209 120 234 0.84 # 22344 # 23606 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.564 2_38 - 275 Cdd1 PF11731.3 93 0.0017 12.5 0.0 1 1 2.6e-05 0.0033 11.6 0.0 14 47 32 65 19 77 0.85 # 31437 # 32261 # -1 # ID=2_38;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 1_65 - 430 FAD_binding_3 PF01494.14 356 2e-05 18.0 0.1 1 1 1.2e-07 3.1e-05 17.3 0.1 4 27 46 69 44 79 0.88 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_28 - 421 HHH_5 PF14520.1 60 4.3e-05 17.9 0.1 1 2 0.033 8.2 1.0 0.0 4 35 101 151 98 162 0.55 # 22344 # 23606 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.564 2_28 - 421 HHH_5 PF14520.1 60 4.3e-05 17.9 0.1 2 2 3.7e-06 0.00093 13.6 0.0 6 37 179 210 176 228 0.86 # 22344 # 23606 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.564 1_65 - 430 ThiF PF00899.16 136 0.00025 15.1 0.1 1 1 3.2e-06 0.0008 13.5 0.1 4 32 45 73 44 77 0.93 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 3_4 - 141 rve_3 PF13683.1 67 2.2e-31 101.4 0.8 1 1 4.8e-33 3.1e-31 101.0 0.8 1 67 53 119 53 119 0.99 # 1556 # 1978 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.456 8_2 - 271 rve_3 PF13683.1 67 5e-16 52.3 0.1 1 1 3.3e-17 2.1e-15 50.3 0.0 1 67 189 256 189 256 0.97 # 399 # 1211 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.518 4_6 - 591 rve_3 PF13683.1 67 0.00012 15.8 0.0 1 1 2.6e-05 0.0016 12.2 0.0 1 27 315 341 315 354 0.91 # 2004 # 3776 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 5_21 - 36 rve_3 PF13683.1 67 0.00091 13.0 0.0 1 1 1.9e-05 0.0012 12.6 0.0 50 67 3 21 1 21 0.86 # 18139 # 18246 # -1 # ID=5_21;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.417 1_60 - 647 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00065 13.4 0.1 1 1 1.2e-05 0.0015 12.3 0.1 36 57 32 53 18 56 0.80 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_14 - 882 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.0011 12.7 0.0 1 1 3.1e-05 0.004 10.8 0.0 39 62 483 509 469 512 0.82 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_30 - 165 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.00027 15.1 0.0 1 1 1.2e-06 0.00031 14.9 0.0 7 67 42 105 38 147 0.76 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 3_36 - 93 HTH_38 PF13936.1 44 1.4e-12 41.3 0.2 1 2 9e-06 0.00045 14.0 0.0 6 37 10 41 9 43 0.92 # 30185 # 30463 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 3_36 - 93 HTH_38 PF13936.1 44 1.4e-12 41.3 0.2 2 2 2.4e-09 1.2e-07 25.5 0.1 4 34 62 92 59 92 0.94 # 30185 # 30463 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 5_17 - 74 HTH_38 PF13936.1 44 3.5e-06 20.8 0.0 1 1 1.4e-07 6.9e-06 19.8 0.0 6 38 10 42 8 47 0.93 # 13542 # 13763 # 1 # ID=5_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 1_64 - 84 HTH_38 PF13936.1 44 0.00013 15.7 0.1 1 1 4e-06 0.0002 15.1 0.1 5 42 2 39 2 39 0.91 # 60989 # 61240 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 2_22 - 216 HTH_38 PF13936.1 44 0.0013 12.5 0.9 1 1 6.5e-05 0.0033 11.2 0.1 8 39 169 202 167 203 0.82 # 17127 # 17774 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 3_29 - 207 HTH_38 PF13936.1 44 0.0016 12.3 0.0 1 2 0.011 0.56 4.1 0.0 24 39 123 138 100 141 0.73 # 25431 # 26051 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 3_29 - 207 HTH_38 PF13936.1 44 0.0016 12.3 0.0 2 2 0.0033 0.17 5.8 0.0 10 36 158 184 153 184 0.88 # 25431 # 26051 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 1_65 - 430 FAD_oxidored PF12831.2 428 1.7e-05 18.2 0.0 1 1 9.9e-08 2.5e-05 17.7 0.0 2 45 46 90 45 114 0.88 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_34 - 215 MobB PF03205.9 140 1.2e-05 19.3 0.1 1 2 3.2e-06 0.0002 15.3 0.0 10 35 11 36 1 45 0.78 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_34 - 215 MobB PF03205.9 140 1.2e-05 19.3 0.1 2 2 0.044 2.8 1.9 0.0 43 85 82 123 71 132 0.63 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_38 - 874 MobB PF03205.9 140 0.00031 14.7 0.0 1 1 1.3e-05 0.00083 13.3 0.0 5 34 198 227 195 236 0.89 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_60 - 647 MobB PF03205.9 140 0.0012 12.8 0.2 1 1 0.00012 0.0077 10.2 0.1 2 19 36 53 35 55 0.90 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_10 - 646 MobB PF03205.9 140 0.0055 10.6 2.4 1 1 0.0001 0.0065 10.4 0.1 3 19 37 53 35 56 0.89 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 2_30 - 661 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.2e-08 25.9 0.0 1 2 9.7e-06 0.0024 11.3 0.0 11 70 179 237 169 261 0.75 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 2_30 - 661 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.2e-08 25.9 0.0 2 2 8.6e-06 0.0022 11.5 0.0 252 297 304 347 271 348 0.83 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 5_8 - 332 MarR PF01047.17 59 0.0014 12.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.0031 11.5 0.0 12 43 16 47 11 48 0.89 # 6844 # 7839 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_65 - 430 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 4.8e-06 20.9 0.0 1 2 1.6e-07 4.1e-05 17.9 0.0 1 37 47 84 47 125 0.87 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_65 - 430 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 4.8e-06 20.9 0.0 2 2 0.034 8.6 0.5 0.0 99 150 300 348 266 369 0.64 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 4_9 - 205 HTH_8 PF02954.14 42 9.7e-06 19.3 0.7 1 2 0.014 1.8 2.4 0.2 2 11 118 127 117 128 0.87 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 4_9 - 205 HTH_8 PF02954.14 42 9.7e-06 19.3 0.7 2 2 2.2e-06 0.00028 14.7 0.0 22 37 170 185 159 188 0.81 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 4_6 - 591 HTH_8 PF02954.14 42 0.00017 15.4 0.4 1 1 1.3e-06 0.00017 15.4 0.4 12 36 66 91 65 96 0.92 # 2004 # 3776 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 4_9 - 205 TetR_N PF00440.18 47 1.9e-05 18.5 0.0 1 2 0.0079 2 2.4 0.0 25 35 26 36 25 40 0.84 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 4_9 - 205 TetR_N PF00440.18 47 1.9e-05 18.5 0.0 2 2 3.1e-06 0.00077 13.3 0.0 16 36 166 186 159 187 0.91 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_39 - 1933 AAA_19 PF13245.1 76 3.9e-07 24.0 2.2 1 1 2.9e-08 2.5e-06 21.4 0.3 7 75 1098 1163 1092 1164 0.78 # 30346 # 36144 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.611 2_30 - 661 AAA_19 PF13245.1 76 3.7e-05 17.7 0.0 1 1 8.1e-07 6.8e-05 16.8 0.0 13 62 185 232 178 246 0.76 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 3_10 - 646 AAA_19 PF13245.1 76 9.4e-05 16.4 0.1 1 1 5.3e-06 0.00045 14.2 0.0 10 34 34 57 28 64 0.83 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_3 - 265 CbiA PF01656.18 195 5.2e-26 85.4 0.5 1 1 7.9e-28 6.6e-26 85.1 0.5 1 174 7 201 7 224 0.68 # 679 # 1473 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 4_17 - 403 CbiA PF01656.18 195 7.6e-24 78.4 0.0 1 1 1.8e-25 1.5e-23 77.4 0.0 1 147 114 300 114 348 0.77 # 13321 # 14529 # 1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 2_34 - 215 CbiA PF01656.18 195 1.4e-16 54.7 0.0 1 1 6.1e-18 5.2e-16 52.8 0.0 1 167 3 154 3 174 0.77 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_17 - 211 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.9e-06 21.5 0.0 1 1 1.9e-07 1.2e-05 18.9 0.0 18 49 26 57 25 61 0.86 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 3_38 - 95 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 2.6e-06 21.1 0.0 1 1 5.9e-08 3.7e-06 20.6 0.0 18 54 19 55 15 55 0.90 # 30921 # 31205 # -1 # ID=3_38;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_74 - 53 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 3.4e-06 20.7 0.0 1 1 6.5e-08 4.1e-06 20.4 0.0 18 42 26 50 25 52 0.92 # 68148 # 68306 # 1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 1_64 - 84 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0011 12.7 0.0 1 1 2.9e-05 0.0019 11.9 0.0 31 47 22 38 21 39 0.94 # 60989 # 61240 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 4_16 - 289 Rep_3 PF01051.16 222 3e-23 76.8 0.2 1 1 1.6e-25 3.9e-23 76.4 0.2 2 214 20 271 19 277 0.89 # 11328 # 12194 # 1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 8_2 - 271 rve PF00665.21 120 1.4e-37 122.7 0.1 1 1 3.1e-39 2.6e-37 121.8 0.1 2 119 102 217 101 218 0.98 # 399 # 1211 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.518 4_6 - 591 rve PF00665.21 120 9.8e-26 84.5 0.0 1 1 2.6e-27 2.2e-25 83.3 0.0 3 120 205 344 203 344 0.95 # 2004 # 3776 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 3_4 - 141 rve PF00665.21 120 5.6e-13 43.3 0.0 1 1 1.1e-14 9.2e-13 42.6 0.0 62 119 21 81 8 82 0.86 # 1556 # 1978 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.456 2_17 - 211 Fe_dep_repress PF01325.14 60 0.001 13.2 0.0 1 1 1.9e-05 0.0024 12.0 0.0 26 50 38 62 32 63 0.90 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 5_8 - 332 Fe_dep_repress PF01325.14 60 0.0022 12.2 0.1 1 1 3.3e-05 0.0042 11.3 0.1 26 48 25 47 19 49 0.90 # 6844 # 7839 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_42 - 608 GATase_2 PF00310.16 361 2.5e-08 27.2 0.1 1 3 0.00021 0.052 6.4 0.1 1 47 2 40 2 51 0.76 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_42 - 608 GATase_2 PF00310.16 361 2.5e-08 27.2 0.1 2 3 6.2e-06 0.0016 11.4 0.0 215 260 59 105 54 116 0.80 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_42 - 608 GATase_2 PF00310.16 361 2.5e-08 27.2 0.1 3 3 0.00023 0.057 6.2 0.0 314 360 113 160 106 161 0.87 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_3 - 265 YhjQ PF06564.7 244 2.1e-06 21.4 0.1 1 1 3.4e-08 8.4e-06 19.5 0.1 9 150 12 157 5 165 0.85 # 679 # 1473 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 8_1 - 93 Terminase_5 PF06056.7 58 4.3e-06 20.5 0.1 1 1 7.5e-08 6.3e-06 19.9 0.1 12 49 21 58 13 68 0.84 # 64 # 342 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 3_38 - 95 Terminase_5 PF06056.7 58 1.4e-05 18.8 0.5 1 1 2.5e-07 2.1e-05 18.2 0.1 7 37 21 51 14 55 0.86 # 30921 # 31205 # -1 # ID=3_38;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 2_17 - 211 Terminase_5 PF06056.7 58 0.00029 14.6 0.0 1 2 0.0018 0.15 5.9 0.0 15 37 36 58 31 69 0.73 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_17 - 211 Terminase_5 PF06056.7 58 0.00029 14.6 0.0 2 2 0.0012 0.1 6.5 0.0 16 47 117 148 116 151 0.90 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 3_10 - 646 AAA_23 PF13476.1 202 0.00025 15.6 0.1 1 1 5.1e-06 0.00064 14.3 0.1 15 39 27 54 19 57 0.80 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_60 - 647 AAA_23 PF13476.1 202 0.0014 13.2 0.0 1 1 2.4e-05 0.003 12.1 0.0 12 37 26 52 19 57 0.78 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_39 - 1933 AAA_30 PF13604.1 196 2e-43 142.4 1.8 1 2 0.00047 0.04 7.7 0.1 20 127 562 664 555 675 0.79 # 30346 # 36144 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.611 1_39 - 1933 AAA_30 PF13604.1 196 2e-43 142.4 1.8 2 2 1.8e-42 1.6e-40 133.0 0.1 2 186 1086 1274 1085 1278 0.95 # 30346 # 36144 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.611 2_30 - 661 AAA_30 PF13604.1 196 0.00032 14.5 0.0 1 1 2.9e-05 0.0024 11.6 0.0 21 63 185 229 169 233 0.75 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 3_12 - 368 AAA_30 PF13604.1 196 0.00041 14.2 0.0 1 2 0.026 2.2 2.0 0.0 19 38 172 191 166 203 0.85 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 3_12 - 368 AAA_30 PF13604.1 196 0.00041 14.2 0.0 2 2 0.0001 0.0087 9.8 0.0 90 128 285 337 264 346 0.78 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 1_44 - 425 ATPgrasp_Ter PF15632.1 330 4.6e-12 39.5 0.0 1 1 2.8e-14 7e-12 38.9 0.0 40 285 46 296 9 301 0.79 # 41126 # 42400 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_42 - 608 GATase_6 PF13522.1 133 1.6e-38 125.9 0.0 1 1 1.3e-40 3.2e-38 124.9 0.0 1 133 32 160 32 160 0.98 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_10 - 646 SMC_N PF02463.14 220 6.2e-08 26.3 0.3 1 1 3.7e-08 4.6e-06 20.2 0.3 24 211 34 216 19 223 0.69 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_60 - 647 SMC_N PF02463.14 220 1.5e-05 18.5 0.6 1 2 0.00024 0.03 7.7 0.3 25 42 35 52 24 83 0.86 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_60 - 647 SMC_N PF02463.14 220 1.5e-05 18.5 0.6 2 2 0.00013 0.017 8.6 0.0 136 211 144 216 82 220 0.85 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 8_1 - 93 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.5e-20 65.1 0.2 1 1 1.3e-21 8e-20 64.9 0.2 1 76 1 72 1 72 0.86 # 64 # 342 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 1_75 - 159 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 2.2e-18 60.2 0.0 1 1 7.7e-20 4.8e-18 59.2 0.0 2 58 40 100 39 117 0.85 # 68307 # 68783 # 1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.595 2_17 - 211 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 9.9e-18 58.2 0.0 1 1 2.2e-18 1.4e-16 54.5 0.0 2 57 93 148 92 168 0.87 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 4_9 - 205 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.0004 14.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.00087 13.5 0.0 16 42 160 185 152 203 0.76 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_15 - 450 TIGR02432 TIGR02432 189 6.3e-05 16.9 0.0 1 1 8.6e-07 0.00022 15.1 0.0 2 67 126 188 125 198 0.79 # 12204 # 13553 # -1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 3_38 - 95 GerE PF00196.14 58 7.9e-13 41.8 0.1 1 1 1.4e-14 1.7e-12 40.7 0.0 6 57 15 66 11 67 0.94 # 30921 # 31205 # -1 # ID=3_38;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_64 - 84 GerE PF00196.14 58 7.5e-05 16.3 0.0 1 1 8.6e-07 0.00011 15.7 0.0 17 40 16 39 8 40 0.86 # 60989 # 61240 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_38 - 874 TraG-D_C PF12696.2 128 2.2e-21 70.3 0.0 1 1 1.8e-23 4.6e-21 69.2 0.0 1 127 426 548 426 549 0.84 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 2_34 - 215 MipZ PF09140.6 261 5.5e-12 39.5 0.1 1 2 3.4e-06 0.00028 14.2 0.0 2 52 2 51 1 55 0.86 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_34 - 215 MipZ PF09140.6 261 5.5e-12 39.5 0.1 2 2 4.9e-09 4.1e-07 23.5 0.0 90 149 69 129 61 155 0.81 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 3_3 - 265 MipZ PF09140.6 261 6.5e-09 29.4 1.1 1 2 1.8e-08 1.5e-06 21.7 0.1 1 40 5 44 5 51 0.94 # 679 # 1473 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 3_3 - 265 MipZ PF09140.6 261 6.5e-09 29.4 1.1 2 2 0.00077 0.065 6.5 0.1 84 129 110 155 83 225 0.81 # 679 # 1473 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 4_17 - 403 MipZ PF09140.6 261 2.8e-06 20.8 0.4 1 2 0.00024 0.02 8.1 0.1 2 51 113 167 112 193 0.73 # 13321 # 14529 # 1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_17 - 403 MipZ PF09140.6 261 2.8e-06 20.8 0.4 2 2 4.5e-05 0.0038 10.5 0.1 91 135 240 284 224 289 0.89 # 13321 # 14529 # 1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 3_10 - 646 AAA_21 PF13304.1 303 6.2e-13 43.5 3.8 1 1 5.2e-13 4.4e-11 37.4 0.4 3 301 38 206 36 208 0.70 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_60 - 647 AAA_21 PF13304.1 303 1.7e-09 32.2 0.2 1 1 1e-07 8.5e-06 20.1 0.2 2 298 37 203 36 206 0.60 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_12 - 368 AAA_21 PF13304.1 303 0.00012 16.3 1.0 1 1 1e-05 0.00084 13.5 0.1 235 302 282 343 263 344 0.90 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 1_74 - 53 Sigma70_r4 PF04545.11 50 1.3e-06 21.9 0.0 1 1 2.4e-08 1.5e-06 21.7 0.0 12 35 26 49 25 52 0.91 # 68148 # 68306 # 1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 2_17 - 211 Sigma70_r4 PF04545.11 50 1.7e-06 21.5 0.0 1 1 4.7e-08 3e-06 20.7 0.0 12 36 26 50 24 59 0.90 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_22 - 216 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00012 15.6 0.1 1 1 1.9e-06 0.00012 15.6 0.1 7 41 170 204 169 206 0.96 # 17127 # 17774 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 3_36 - 93 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00067 13.2 0.2 1 1 4e-05 0.0025 11.4 0.0 6 30 10 34 10 36 0.94 # 30185 # 30463 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 1_65 - 430 Thi4 PF01946.12 230 0.00021 14.7 0.0 1 1 1.4e-06 0.00034 13.9 0.0 20 58 46 85 41 99 0.90 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_30 - 165 AAA PF00004.24 132 0.00064 14.1 0.0 1 1 6.5e-06 0.00082 13.8 0.0 2 66 38 96 37 145 0.85 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_7 - 303 AAA PF00004.24 132 0.0013 13.1 0.0 1 1 4.4e-05 0.0055 11.1 0.0 1 111 64 189 64 210 0.59 # 3779 # 4687 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 4_22 - 286 Rrf2 PF02082.15 83 7.8e-08 26.6 0.0 1 1 3.3e-09 4.2e-07 24.3 0.0 20 62 53 95 42 98 0.90 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 2_17 - 211 Rrf2 PF02082.15 83 0.00033 15.0 0.0 1 1 3e-05 0.0037 11.6 0.0 17 54 27 63 22 63 0.85 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_34 - 215 TIGR00064 TIGR00064 279 2.2e-05 17.7 0.5 1 2 5.9e-06 0.0015 11.7 0.0 89 116 11 38 1 45 0.89 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_34 - 215 TIGR00064 TIGR00064 279 2.2e-05 17.7 0.5 2 2 0.0014 0.34 3.9 0.0 160 172 76 88 71 99 0.83 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 8_2 - 271 rve_2 PF13333.1 52 7.5e-18 58.6 3.0 1 1 1.7e-19 1.4e-17 57.8 3.0 1 51 208 263 208 264 0.94 # 399 # 1211 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.518 5_21 - 36 rve_2 PF13333.1 52 8.6e-07 23.2 1.7 1 1 1.2e-08 9.9e-07 23.0 1.7 29 51 1 28 1 29 0.87 # 18139 # 18246 # -1 # ID=5_21;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.417 3_4 - 141 rve_2 PF13333.1 52 0.00014 16.1 0.3 1 1 2.8e-06 0.00023 15.4 0.3 1 47 72 122 72 125 0.94 # 1556 # 1978 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.456 3_38 - 95 MerR_1 PF13411.1 69 0.00053 14.0 0.0 1 1 9.3e-06 0.0012 12.9 0.0 1 30 28 57 28 63 0.83 # 30921 # 31205 # -1 # ID=3_38;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 8_1 - 93 MerR_1 PF13411.1 69 0.00071 13.6 0.1 1 1 3.5e-05 0.0044 11.0 0.1 1 25 23 47 23 70 0.90 # 64 # 342 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 2_30 - 661 cobW PF02492.14 178 0.00061 13.5 0.1 1 1 5.1e-06 0.0013 12.4 0.1 3 31 185 216 183 221 0.89 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 1_38 - 874 AAA_16 PF13191.1 185 3.3e-08 27.9 0.3 1 1 1.6e-08 5.9e-07 23.8 0.0 18 63 187 241 182 260 0.87 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 3_10 - 646 AAA_16 PF13191.1 185 1.1e-06 22.9 0.4 1 1 1.4e-07 5.1e-06 20.8 0.4 20 165 30 210 18 218 0.51 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_30 - 165 AAA_16 PF13191.1 185 3.6e-05 18.0 0.0 1 1 2.1e-05 0.00074 13.7 0.0 8 51 22 61 16 115 0.82 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_7 - 303 AAA_16 PF13191.1 185 3.7e-05 18.0 0.0 1 1 7.6e-05 0.0027 11.9 0.0 8 86 45 121 43 186 0.54 # 3779 # 4687 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 1_60 - 647 AAA_16 PF13191.1 185 0.00015 16.0 0.3 1 1 2e-05 0.00073 13.7 0.3 22 44 32 53 14 218 0.70 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_14 - 882 AAA_16 PF13191.1 185 0.00073 13.8 0.0 1 1 8.4e-05 0.003 11.7 0.0 24 55 485 517 470 544 0.82 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 2_34 - 215 AAA_16 PF13191.1 185 0.00096 13.4 0.1 1 1 0.00028 0.01 10.0 0.0 34 84 11 73 3 114 0.76 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_44 - 425 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 2.9e-08 27.9 0.0 1 1 2e-10 4.9e-08 27.2 0.0 31 160 151 294 114 295 0.82 # 41126 # 42400 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 4_7 - 303 AAA_22 PF13401.1 131 1.3e-14 48.7 0.0 1 1 5.7e-16 2.4e-14 47.8 0.0 7 125 64 189 59 193 0.92 # 3779 # 4687 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 1_30 - 165 AAA_22 PF13401.1 131 3.7e-05 18.1 0.1 1 1 1.7e-06 7e-05 17.2 0.1 3 68 33 90 30 123 0.69 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_60 - 647 AAA_22 PF13401.1 131 5.7e-05 17.5 0.5 1 1 2.3e-05 0.00096 13.5 0.5 4 122 34 200 31 209 0.62 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_10 - 646 AAA_22 PF13401.1 131 0.00016 16.0 1.6 1 2 0.0001 0.0043 11.4 0.1 5 22 35 52 30 58 0.87 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_10 - 646 AAA_22 PF13401.1 131 0.00016 16.0 1.6 2 2 0.052 2.2 2.7 0.0 55 123 125 201 101 209 0.70 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_14 - 882 AAA_22 PF13401.1 131 0.0004 14.7 0.1 1 1 0.00019 0.0081 10.5 0.0 7 28 488 509 484 540 0.82 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 2_15 - 528 AAA_22 PF13401.1 131 0.003 11.9 0.8 1 2 0.036 1.5 3.2 0.5 37 89 28 79 5 91 0.78 # 11494 # 13077 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.612 2_15 - 528 AAA_22 PF13401.1 131 0.003 11.9 0.8 2 2 0.0039 0.16 6.3 0.0 12 40 265 293 263 367 0.62 # 11494 # 13077 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.612 3_29 - 207 HTH_AraC PF00165.18 42 6e-17 55.2 0.4 1 2 1.4e-09 3.4e-07 24.2 0.0 2 42 113 153 112 153 0.94 # 25431 # 26051 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 3_29 - 207 HTH_AraC PF00165.18 42 6e-17 55.2 0.4 2 2 3.8e-11 9.5e-09 29.1 0.1 6 42 166 203 164 203 0.95 # 25431 # 26051 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 5_8 - 332 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0019 12.3 0.1 1 1 1.9e-05 0.0047 11.0 0.1 18 35 23 40 18 42 0.89 # 6844 # 7839 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 4_22 - 286 HTH_9 PF08221.6 62 0.00011 16.3 0.0 1 1 1.1e-06 0.00027 15.0 0.0 29 57 60 88 55 91 0.94 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_60 - 647 AAA_29 PF13555.1 62 1e-06 22.4 0.1 1 1 3.9e-08 3.3e-06 20.8 0.1 18 41 30 52 23 68 0.78 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_10 - 646 AAA_29 PF13555.1 62 2.9e-06 21.0 0.1 1 1 1.5e-07 1.2e-05 19.0 0.1 22 40 33 51 24 57 0.85 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_12 - 368 AAA_29 PF13555.1 62 0.0019 12.0 0.1 1 1 4.4e-05 0.0037 11.0 0.1 13 41 162 189 158 207 0.81 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 1_65 - 430 Pyr_redox PF00070.22 80 3.2e-05 18.5 0.0 1 1 2.3e-07 5.9e-05 17.7 0.0 1 36 45 82 45 98 0.90 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 5_8 - 332 HTH_1 PF00126.22 60 1e-20 67.5 0.2 1 1 1.6e-22 2e-20 66.5 0.2 2 60 10 68 9 68 0.96 # 6844 # 7839 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 4_29 - 311 HTH_1 PF00126.22 60 6.9e-17 55.2 3.7 1 1 1.2e-18 1.5e-16 54.2 3.7 1 59 13 71 13 72 0.97 # 24715 # 25647 # -1 # ID=4_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.617 2_17 - 211 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 1.6e-06 22.6 0.0 1 2 3.4e-05 0.0086 10.7 0.0 23 55 32 64 27 78 0.87 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_17 - 211 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 1.6e-06 22.6 0.0 2 2 6.9e-05 0.017 9.7 0.0 23 70 112 155 105 164 0.83 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_30 - 661 TK PF00265.13 176 0.0013 12.5 0.3 1 2 0.055 14 -0.6 0.1 6 31 187 212 183 232 0.75 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 2_30 - 661 TK PF00265.13 176 0.0013 12.5 0.3 2 2 5.1e-06 0.0013 12.5 0.3 73 145 304 366 287 373 0.74 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 8_1 - 93 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 6.5e-05 16.8 0.4 1 1 3.2e-07 7.9e-05 16.5 0.4 13 73 17 77 5 90 0.71 # 64 # 342 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 1_44 - 425 CPSase_L_D2 PF02786.12 211 0.0012 12.3 0.0 1 1 3e-05 0.0077 9.7 0.0 24 92 137 206 115 296 0.73 # 41126 # 42400 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 2_34 - 215 SRP54 PF00448.17 196 1.1e-06 22.4 0.6 1 1 5.9e-08 1.5e-05 18.7 0.6 10 97 10 91 1 138 0.77 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_34 - 215 AAA_28 PF13521.1 163 0.0004 14.6 0.0 1 1 4e-06 0.00051 14.2 0.0 2 94 2 99 1 157 0.72 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_60 - 647 AAA_28 PF13521.1 163 0.002 12.3 0.0 1 1 6.8e-05 0.0086 10.2 0.0 2 18 37 53 36 66 0.90 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_65 - 430 HI0933_like PF03486.9 409 0.0006 12.5 0.7 1 1 3.5e-06 0.00089 12.0 0.2 2 36 45 80 44 83 0.86 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 4_22 - 286 GntR PF00392.16 64 0.0014 12.3 0.0 1 2 4.8e-05 0.012 9.3 0.0 18 60 52 94 48 97 0.90 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 4_22 - 286 GntR PF00392.16 64 0.0014 12.3 0.0 2 2 0.098 25 -1.3 0.0 12 26 154 168 152 170 0.87 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 2_17 - 211 HTH_23 PF13384.1 50 1.1e-10 35.2 0.0 1 2 1.1e-06 2.3e-05 18.2 0.0 16 46 33 63 25 64 0.87 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_17 - 211 HTH_23 PF13384.1 50 1.1e-10 35.2 0.0 2 2 1.4e-05 0.0003 14.7 0.0 17 46 114 142 100 146 0.82 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 8_1 - 93 HTH_23 PF13384.1 50 8.5e-08 25.9 0.2 1 1 7.2e-09 1.5e-07 25.1 0.1 4 41 8 46 5 61 0.87 # 64 # 342 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 2_22 - 216 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-06 22.2 0.1 1 1 1.5e-07 3.2e-06 20.9 0.1 4 42 169 208 166 214 0.83 # 17127 # 17774 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 1_64 - 84 HTH_23 PF13384.1 50 5.4e-06 20.2 0.4 1 1 5.9e-07 1.2e-05 19.1 0.1 10 39 10 39 8 40 0.90 # 60989 # 61240 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 4_6 - 591 HTH_23 PF13384.1 50 1.5e-05 18.8 1.0 1 1 2e-06 4.1e-05 17.4 1.0 4 44 55 101 52 108 0.76 # 2004 # 3776 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 4_10 - 161 HTH_23 PF13384.1 50 4e-05 17.4 0.1 1 1 4.3e-06 9e-05 16.3 0.1 7 37 113 143 107 155 0.84 # 6745 # 7227 # 1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 1_75 - 159 HTH_23 PF13384.1 50 0.00013 15.8 0.0 1 1 1.3e-05 0.00027 14.8 0.0 7 45 50 88 44 93 0.88 # 68307 # 68783 # 1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.595 3_38 - 95 HTH_23 PF13384.1 50 0.00039 14.3 0.0 1 1 3.6e-05 0.00076 13.4 0.0 10 41 20 51 15 59 0.85 # 30921 # 31205 # -1 # ID=3_38;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_63 - 555 HTH_23 PF13384.1 50 0.00047 14.1 0.1 1 1 6.3e-05 0.0013 12.6 0.1 28 42 8 22 7 29 0.87 # 59179 # 60843 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 4_9 - 205 HTH_23 PF13384.1 50 0.00056 13.8 0.0 1 1 8.8e-05 0.0018 12.1 0.0 7 38 156 187 150 189 0.72 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 5_8 - 332 HTH_23 PF13384.1 50 0.00058 13.7 0.0 1 1 5.4e-05 0.0011 12.8 0.0 15 41 19 45 9 51 0.81 # 6844 # 7839 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_74 - 53 HTH_23 PF13384.1 50 0.0017 12.2 0.0 1 1 0.00013 0.0026 11.7 0.0 16 31 33 48 23 50 0.78 # 68148 # 68306 # 1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 4_17 - 403 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00012 15.5 0.0 1 1 8e-07 0.0002 14.8 0.0 8 72 120 189 114 200 0.77 # 13321 # 14529 # 1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_10 - 161 HTH_7 PF02796.10 45 7.4e-08 26.4 0.0 1 1 2.6e-09 1.6e-07 25.3 0.0 1 43 105 145 105 146 0.94 # 6745 # 7227 # 1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 4_9 - 205 HTH_7 PF02796.10 45 1.4e-06 22.3 0.0 1 1 4.5e-08 2.8e-06 21.4 0.0 1 42 145 187 145 189 0.74 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_64 - 84 HTH_7 PF02796.10 45 2.6e-05 18.2 0.2 1 1 6.4e-07 4.1e-05 17.7 0.2 6 42 2 38 1 40 0.92 # 60989 # 61240 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 8_1 - 93 HTH_7 PF02796.10 45 0.00042 14.4 0.1 1 1 2e-05 0.0013 12.9 0.0 8 39 8 40 4 41 0.89 # 64 # 342 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 1_27 - 71 ATP-synt_A PF00119.15 215 0.0029 11.3 3.7 1 1 1.2e-05 0.0031 11.2 3.7 63 107 3 48 1 56 0.88 # 18903 # 19115 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 1_48 - 347 OCD_Mu_crystall PF02423.10 314 1.7e-37 123.0 0.0 1 1 8.9e-40 2.2e-37 122.6 0.0 19 308 26 321 17 325 0.86 # 45859 # 46899 # -1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.458 2_21 - 412 TIGR01246 TIGR01246 370 4.4e-09 29.6 0.0 1 1 3.4e-11 8.7e-09 28.7 0.0 3 192 45 234 43 330 0.75 # 15902 # 17137 # -1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.452 8_1 - 93 Val_tRNA-synt_C PF10458.4 66 0.00078 13.8 0.6 1 1 3.1e-06 0.00078 13.8 0.6 1 23 58 80 58 89 0.87 # 64 # 342 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 4_7 - 303 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00062 13.2 0.0 1 1 4.6e-06 0.0012 12.3 0.0 24 52 63 91 58 106 0.87 # 3779 # 4687 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 2_41 - 95 FeoC PF09012.5 69 0.002 12.1 0.0 1 1 1.3e-05 0.0033 11.4 0.0 7 36 12 41 9 44 0.93 # 33682 # 33966 # 1 # ID=2_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 2_17 - 211 HTH_29 PF13551.1 112 2.9e-06 21.6 0.0 1 2 0.00032 0.02 9.3 0.0 9 50 32 72 25 82 0.80 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_17 - 211 HTH_29 PF13551.1 112 2.9e-06 21.6 0.0 2 2 0.00017 0.011 10.2 0.0 15 46 117 148 106 153 0.90 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 4_6 - 591 HTH_29 PF13551.1 112 7.6e-06 20.3 0.5 1 1 1.2e-07 7.6e-06 20.3 0.5 14 76 75 139 65 160 0.80 # 2004 # 3776 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 4_9 - 205 HTH_29 PF13551.1 112 0.0011 13.4 0.4 1 2 0.061 3.9 1.9 0.3 37 62 130 154 123 168 0.71 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 4_9 - 205 HTH_29 PF13551.1 112 0.0011 13.4 0.4 2 2 0.00021 0.013 9.8 0.0 8 34 160 188 153 202 0.79 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_20 - 285 HTH_29 PF13551.1 112 0.0045 11.4 6.1 1 1 0.00016 0.0098 10.3 3.2 40 106 121 183 108 187 0.70 # 17333 # 18187 # -1 # ID=3_20;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_65 - 430 NAD_binding_9 PF13454.1 156 5.1e-08 27.0 0.1 1 2 9e-09 2.3e-06 21.7 0.0 1 44 47 86 47 117 0.89 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_65 - 430 NAD_binding_9 PF13454.1 156 5.1e-08 27.0 0.1 2 2 0.0041 1 3.3 0.0 109 153 288 334 279 337 0.64 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_65 - 430 GIDA PF01134.17 392 0.0035 10.4 0.2 1 1 2.2e-05 0.0055 9.7 0.2 2 24 46 68 45 86 0.82 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_44 - 425 RimK PF08443.6 190 3.6e-06 20.8 0.0 1 1 4e-08 1e-05 19.3 0.0 2 86 114 205 113 217 0.79 # 41126 # 42400 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 4_7 - 303 G-alpha PF00503.15 389 0.0029 10.5 0.0 1 1 1.6e-05 0.0041 10.0 0.0 56 93 59 94 50 105 0.81 # 3779 # 4687 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 1_65 - 430 NAD_binding_8 PF13450.1 68 1.6e-13 44.7 0.0 1 1 1.6e-15 4e-13 43.5 0.0 1 65 48 115 48 118 0.85 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_15 - 528 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.8e-100 328.7 3.4 1 2 0.024 3 1.1 1.5 160 209 38 89 19 124 0.51 # 11494 # 13077 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.612 2_15 - 528 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3.8e-100 328.7 3.4 2 2 7.2e-102 9e-100 327.5 0.0 1 271 185 472 185 472 0.99 # 11494 # 13077 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.612 1_77 - 187 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 8.2e-58 189.9 0.1 1 1 7.3e-60 9.2e-58 189.7 0.1 111 271 2 168 1 168 0.98 # 69213 # 69773 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 1_38 - 874 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00015 15.8 0.0 1 1 1.2e-06 0.00031 14.7 0.0 22 76 195 251 185 357 0.84 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_30 - 165 AAA_5 PF07728.9 139 0.0014 12.5 0.0 1 1 1.6e-05 0.004 11.1 0.0 4 33 39 69 36 148 0.87 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 2_30 - 661 ResIII PF04851.10 184 0.00022 15.3 0.1 1 2 8.6e-07 0.00022 15.3 0.1 25 82 182 243 153 257 0.80 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 2_30 - 661 ResIII PF04851.10 184 0.00022 15.3 0.1 2 2 0.031 7.9 0.4 0.1 137 155 579 603 547 603 0.74 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 1_38 - 874 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 5.9e-141 463.7 0.0 1 1 6e-143 7.5e-141 463.3 0.0 2 386 180 568 179 568 0.99 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_14 - 882 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 3.9e-06 19.9 0.0 1 1 5.8e-08 7.3e-06 19.0 0.0 15 62 485 531 475 558 0.82 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 3_3 - 265 TIGR01968 TIGR01968 261 3.8e-15 49.8 0.3 1 1 3.8e-17 4.8e-15 49.5 0.3 3 174 6 190 4 260 0.75 # 679 # 1473 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 2_34 - 215 TIGR01968 TIGR01968 261 4e-07 23.5 0.4 1 2 4.1e-08 5.2e-06 19.9 0.1 3 39 2 38 1 45 0.93 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_34 - 215 TIGR01968 TIGR01968 261 4e-07 23.5 0.4 2 2 0.012 1.6 1.9 0.0 107 176 73 148 66 157 0.72 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_30 - 165 AAA_18 PF13238.1 129 3.7e-05 18.2 0.0 1 1 6.8e-07 5.7e-05 17.7 0.0 3 37 39 74 38 110 0.76 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 3_10 - 646 AAA_18 PF13238.1 129 4.2e-05 18.1 0.5 1 1 1.2e-05 0.00099 13.6 0.5 1 19 37 55 37 241 0.82 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_38 - 874 AAA_18 PF13238.1 129 0.0013 13.2 0.0 1 1 6.6e-05 0.0056 11.2 0.0 2 56 197 271 197 309 0.62 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 4_7 - 303 AAA_32 PF13654.1 509 0.0021 10.9 0.1 1 2 2.8e-05 0.007 9.2 0.0 8 81 34 112 27 114 0.86 # 3779 # 4687 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 4_7 - 303 AAA_32 PF13654.1 509 0.0021 10.9 0.1 2 2 0.048 12 -1.5 0.1 472 502 255 285 239 287 0.87 # 3779 # 4687 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 2_38 - 275 IMS_HHH PF11798.3 32 4.7e-09 30.2 0.0 1 1 1.1e-10 1.4e-08 28.7 0.0 4 32 23 51 20 51 0.92 # 31437 # 32261 # -1 # ID=2_38;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 2_28 - 421 IMS_HHH PF11798.3 32 2.5e-06 21.6 0.1 1 1 6.3e-08 7.9e-06 20.0 0.1 6 32 173 199 170 199 0.89 # 22344 # 23606 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.564 1_42 - 608 QueC PF06508.8 210 1.3e-05 18.8 0.0 1 1 2.4e-07 3e-05 17.6 0.0 5 59 261 316 258 326 0.88 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_15 - 450 QueC PF06508.8 210 0.00021 14.8 0.0 1 1 2.7e-06 0.00035 14.1 0.0 3 59 127 185 125 199 0.76 # 12204 # 13553 # -1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 1_42 - 608 NAD_synthase PF02540.12 242 3e-08 27.0 0.0 1 1 4.1e-10 5.2e-08 26.2 0.0 3 138 238 373 236 375 0.82 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_15 - 450 NAD_synthase PF02540.12 242 6.2e-05 16.2 0.0 1 2 0.0077 0.97 2.4 0.0 182 203 32 53 3 65 0.81 # 12204 # 13553 # -1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 3_15 - 450 NAD_synthase PF02540.12 242 6.2e-05 16.2 0.0 2 2 1.5e-05 0.0019 11.3 0.0 5 84 109 190 106 202 0.82 # 12204 # 13553 # -1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 3_10 - 646 DUF258 PF03193.11 161 1.3e-05 18.6 0.1 1 1 3.2e-07 2.7e-05 17.6 0.1 24 55 22 54 2 66 0.71 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_12 - 368 DUF258 PF03193.11 161 0.0001 15.7 0.1 1 1 2e-06 0.00017 15.0 0.1 25 58 160 194 136 222 0.80 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 1_60 - 647 DUF258 PF03193.11 161 0.0001 15.7 0.2 1 1 3.7e-06 0.00031 14.2 0.1 33 55 31 54 14 61 0.83 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 4_15 - 68 UBX PF00789.15 82 2e-05 18.8 0.0 1 1 9.1e-08 2.3e-05 18.7 0.0 21 60 11 48 9 62 0.85 # 10738 # 10941 # 1 # ID=4_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 4_7 - 303 TniB PF05621.6 302 6.7e-192 630.0 3.4 1 1 3e-194 7.4e-192 629.8 3.4 1 302 1 302 1 302 1.00 # 3779 # 4687 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 1_14 - 882 DUF87 PF01935.12 229 8.2e-06 20.0 0.0 1 1 1.3e-07 1.7e-05 18.9 0.0 26 68 488 529 483 599 0.87 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_60 - 647 DUF87 PF01935.12 229 0.0026 11.8 0.9 1 1 3.9e-05 0.0049 10.9 0.2 26 42 37 53 21 56 0.82 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 2_17 - 211 HTH_28 PF13518.1 52 1.4e-09 32.0 0.0 1 2 9e-06 0.00038 14.7 0.0 13 42 34 64 26 69 0.88 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_17 - 211 HTH_28 PF13518.1 52 1.4e-09 32.0 0.0 2 2 7.1e-06 0.0003 15.0 0.0 15 41 117 142 117 150 0.86 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 4_6 - 591 HTH_28 PF13518.1 52 1.3e-08 29.0 0.5 1 1 8.3e-10 3.5e-08 27.6 0.5 2 51 58 115 57 118 0.77 # 2004 # 3776 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 8_1 - 93 HTH_28 PF13518.1 52 4.5e-08 27.2 0.0 1 1 1.9e-09 7.9e-08 26.5 0.0 1 36 10 46 10 49 0.93 # 64 # 342 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 4_9 - 205 HTH_28 PF13518.1 52 0.00022 15.4 0.0 1 1 2e-05 0.00083 13.6 0.0 14 32 168 186 155 189 0.83 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_63 - 555 HTH_28 PF13518.1 52 0.0006 14.1 0.1 1 1 3.8e-05 0.0016 12.7 0.1 23 36 8 21 3 22 0.92 # 59179 # 60843 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 4_10 - 161 HTH_28 PF13518.1 52 0.00085 13.6 0.2 1 1 4.2e-05 0.0018 12.6 0.2 4 39 115 150 114 155 0.87 # 6745 # 7227 # 1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 1_48 - 347 Shikimate_DH PF01488.15 135 1.2e-07 26.1 0.0 1 2 0.038 9.7 0.5 0.0 109 126 85 102 70 108 0.83 # 45859 # 46899 # -1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.458 1_48 - 347 Shikimate_DH PF01488.15 135 1.2e-07 26.1 0.0 2 2 4.1e-09 1e-06 23.1 0.0 10 120 141 249 131 261 0.79 # 45859 # 46899 # -1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.458 2_17 - 211 HTH_24 PF13412.1 48 1.7e-07 24.8 0.0 1 1 7.7e-09 3.9e-07 23.6 0.0 15 46 32 63 28 63 0.91 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 1_74 - 53 HTH_24 PF13412.1 48 2.5e-06 21.0 0.0 1 1 6.3e-08 3.2e-06 20.7 0.0 15 35 32 52 22 52 0.82 # 68148 # 68306 # 1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 4_22 - 286 HTH_24 PF13412.1 48 1.8e-05 18.3 0.0 1 1 1.9e-06 9.4e-05 16.0 0.0 18 47 59 88 46 89 0.89 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 5_8 - 332 HTH_24 PF13412.1 48 8.7e-05 16.1 0.2 1 1 1.2e-05 0.0006 13.4 0.1 19 43 23 47 20 48 0.95 # 6844 # 7839 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 4_18 - 329 HTH_24 PF13412.1 48 0.00076 13.1 0.2 1 1 0.00015 0.0076 9.9 0.0 17 37 159 179 157 182 0.90 # 14526 # 15512 # 1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.508 3_29 - 207 HTH_18 PF12833.2 81 1.2e-21 70.8 0.1 1 1 9.5e-24 2.4e-21 69.9 0.1 1 81 125 204 125 204 0.98 # 25431 # 26051 # 1 # ID=3_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 5_8 - 332 HTH_30 PF13556.1 59 0.0021 11.9 0.0 1 1 2.3e-05 0.0059 10.5 0.0 11 42 20 51 18 64 0.88 # 6844 # 7839 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 3_38 - 95 HTH_10 PF04967.7 53 5e-05 17.1 0.0 1 1 1e-06 8.8e-05 16.3 0.0 25 51 29 55 27 56 0.94 # 30921 # 31205 # -1 # ID=3_38;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 4_9 - 205 HTH_10 PF04967.7 53 0.00036 14.3 0.0 1 1 9.7e-06 0.00081 13.2 0.0 25 47 168 190 166 192 0.88 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_17 - 211 HTH_10 PF04967.7 53 0.00085 13.1 0.0 1 1 2.8e-05 0.0024 11.7 0.0 25 46 36 57 34 61 0.86 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 1_38 - 874 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00047 14.3 0.0 1 1 1.5e-05 0.00093 13.4 0.0 4 41 198 241 195 343 0.81 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 2_34 - 215 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00055 14.1 0.0 1 1 1.7e-05 0.0011 13.2 0.0 3 100 3 121 1 144 0.56 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_60 - 647 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00089 13.4 0.2 1 1 5.8e-05 0.0037 11.5 0.0 2 18 37 53 36 67 0.92 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_10 - 646 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0023 12.1 1.2 1 1 0.00025 0.016 9.4 1.2 2 19 37 54 36 235 0.68 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 2_30 - 661 DEAD PF00270.24 169 0.0015 12.3 0.5 1 1 2.3e-05 0.0058 10.3 0.0 14 75 182 241 170 251 0.82 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 2_22 - 216 HTH_31 PF13560.1 64 0.00017 16.0 0.4 1 1 6.7e-06 0.00085 13.8 0.1 9 35 178 204 142 209 0.78 # 17127 # 17774 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 2_41 - 95 HTH_31 PF13560.1 64 0.00065 14.1 0.2 1 1 9.6e-06 0.0012 13.3 0.2 3 52 8 56 8 62 0.91 # 33682 # 33966 # 1 # ID=2_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 2_30 - 661 DUF2075 PF09848.4 352 2.3e-05 17.7 0.1 1 1 5.1e-07 6.4e-05 16.2 0.0 4 55 185 236 182 323 0.78 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 1_30 - 165 DUF2075 PF09848.4 352 8e-05 15.9 0.0 1 1 1.1e-06 0.00014 15.1 0.0 4 42 37 72 34 91 0.71 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 2_30 - 661 UvrD_C_2 PF13538.1 104 8e-13 42.7 0.0 1 1 1e-14 2.5e-12 41.1 0.0 2 104 460 555 459 555 0.86 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 1_14 - 882 IIGP PF05049.8 376 0.0017 11.3 0.1 1 1 1.1e-05 0.0029 10.6 0.1 34 56 484 507 476 512 0.82 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 4_16 - 289 HTH_36 PF13730.1 55 0.00045 14.6 0.1 1 1 6.5e-06 0.0016 12.8 0.0 6 55 208 261 205 261 0.84 # 11328 # 12194 # 1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.426 3_10 - 646 T2SE PF00437.15 272 0.00076 12.6 0.3 1 1 1.8e-05 0.0023 11.1 0.0 123 148 29 54 5 60 0.80 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_14 - 882 T2SE PF00437.15 272 0.0019 11.3 0.0 1 1 2.8e-05 0.0036 10.4 0.0 81 152 446 509 390 513 0.58 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_38 - 874 NACHT PF05729.7 166 0.00041 14.2 0.1 1 3 0.00011 0.014 9.3 0.0 4 28 197 221 195 226 0.88 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_38 - 874 NACHT PF05729.7 166 0.00041 14.2 0.1 2 3 0.096 12 -0.3 0.0 100 156 366 425 357 429 0.73 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_38 - 874 NACHT PF05729.7 166 0.00041 14.2 0.1 3 3 0.032 4 1.2 0.1 78 99 422 443 375 453 0.67 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_14 - 882 NACHT PF05729.7 166 0.00084 13.2 0.2 1 2 0.0032 0.41 4.5 0.0 102 134 73 106 57 128 0.79 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_14 - 882 NACHT PF05729.7 166 0.00084 13.2 0.2 2 2 0.0014 0.17 5.7 0.1 3 24 488 509 487 516 0.88 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 4_32 - 631 AP_endonuc_2 PF01261.19 213 1.1e-35 117.1 0.1 1 1 1.9e-37 4.9e-35 114.9 0.0 1 212 18 217 18 218 0.95 # 27296 # 29188 # 1 # ID=4_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 1_30 - 165 AAA_17 PF13207.1 121 5.1e-05 18.3 0.0 1 1 1.6e-06 7.9e-05 17.7 0.0 4 41 39 79 36 152 0.68 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 3_10 - 646 AAA_17 PF13207.1 121 5.7e-05 18.2 0.5 1 1 4.8e-06 0.00024 16.1 0.3 2 18 37 53 37 67 0.93 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_60 - 647 AAA_17 PF13207.1 121 0.00014 16.9 0.4 1 1 8.8e-06 0.00044 15.3 0.4 2 18 37 53 36 138 0.81 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 1_14 - 882 AAA_17 PF13207.1 121 0.00016 16.7 0.0 1 1 7.2e-06 0.00036 15.6 0.0 2 85 488 594 487 634 0.55 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_38 - 874 AAA_17 PF13207.1 121 0.00053 15.0 1.6 1 1 2.1e-05 0.0011 14.1 0.0 3 62 197 247 197 322 0.67 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 2_15 - 528 DZR PF12773.2 50 0.0017 12.4 0.6 1 1 1.5e-05 0.0039 11.3 0.6 8 41 123 176 119 180 0.89 # 11494 # 13077 # -1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.612 3_10 - 646 TIGR02211 TIGR02211 221 1.1e-71 234.7 0.4 1 1 2.1e-73 1.7e-71 234.1 0.4 1 219 4 221 4 223 0.97 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_60 - 647 TIGR02211 TIGR02211 221 1.6e-69 227.6 0.1 1 1 3e-71 2.5e-69 227.0 0.1 1 220 4 222 4 223 0.98 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_12 - 368 TIGR02211 TIGR02211 221 1.7e-19 64.1 0.6 1 2 1.2e-09 1e-07 25.6 0.1 22 71 162 211 149 221 0.90 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 3_12 - 368 TIGR02211 TIGR02211 221 1.7e-19 64.1 0.6 2 2 4.9e-13 4.1e-11 36.7 0.0 134 212 276 350 265 357 0.83 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 1_65 - 430 FAD_binding_2 PF00890.19 417 0.00015 14.9 0.4 1 1 1.1e-06 0.00027 14.1 0.4 2 37 46 82 45 86 0.87 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_60 - 647 AAA_25 PF13481.1 194 0.00048 13.8 0.1 1 1 4.6e-05 0.0039 10.8 0.0 30 50 31 51 22 81 0.87 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_12 - 368 AAA_25 PF13481.1 194 0.0017 12.0 0.1 1 2 0.0017 0.14 5.7 0.0 32 50 170 188 152 199 0.87 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 3_12 - 368 AAA_25 PF13481.1 194 0.0017 12.0 0.1 2 2 0.0059 0.5 3.9 0.0 166 191 316 341 306 342 0.84 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 1_14 - 882 AAA_25 PF13481.1 194 0.0023 11.5 0.0 1 2 0.00054 0.045 7.3 0.1 37 62 489 514 483 544 0.74 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_14 - 882 AAA_25 PF13481.1 194 0.0023 11.5 0.0 2 2 0.056 4.7 0.7 0.0 142 188 690 738 631 742 0.69 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_44 - 425 GARS_A PF01071.14 194 6.5e-11 36.3 0.0 1 2 9e-12 2.3e-09 31.3 0.0 5 102 118 216 114 234 0.80 # 41126 # 42400 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_44 - 425 GARS_A PF01071.14 194 6.5e-11 36.3 0.0 2 2 0.0047 1.2 2.9 0.0 166 189 269 292 245 298 0.84 # 41126 # 42400 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 2_30 - 661 Viral_helicase1 PF01443.13 234 3.2e-08 27.6 0.2 1 3 4.1e-06 0.001 12.8 0.0 1 38 185 220 185 243 0.80 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 2_30 - 661 Viral_helicase1 PF01443.13 234 3.2e-08 27.6 0.2 2 3 1.5e-05 0.0038 10.9 0.0 51 122 296 367 287 385 0.77 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 2_30 - 661 Viral_helicase1 PF01443.13 234 3.2e-08 27.6 0.2 3 3 0.061 15 -0.9 0.0 23 73 556 605 543 617 0.71 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 3_10 - 646 AAA_15 PF13175.1 415 7.5e-05 16.1 0.0 1 2 0.00045 0.11 5.6 0.3 17 48 20 69 1 105 0.71 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_10 - 646 AAA_15 PF13175.1 415 7.5e-05 16.1 0.0 2 2 0.00012 0.03 7.5 0.0 371 411 162 203 147 206 0.89 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_14 - 882 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0024 11.4 0.0 1 1 1.9e-05 0.0048 10.4 0.0 11 38 483 510 475 521 0.87 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 2_30 - 661 AAA_14 PF13173.1 128 9.9e-06 19.7 1.0 1 3 5.4e-05 0.0068 10.5 0.0 3 42 183 224 181 262 0.76 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 2_30 - 661 AAA_14 PF13173.1 128 9.9e-06 19.7 1.0 2 3 0.0074 0.94 3.6 0.0 60 96 307 340 283 359 0.75 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 2_30 - 661 AAA_14 PF13173.1 128 9.9e-06 19.7 1.0 3 3 0.037 4.6 1.4 0.1 43 73 575 606 538 629 0.54 # 24284 # 26266 # -1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 3_10 - 646 AAA_14 PF13173.1 128 0.00071 13.7 0.1 1 1 7.5e-05 0.0095 10.1 0.1 3 42 35 74 33 98 0.71 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 2_34 - 215 VirC1 PF07015.6 231 3e-08 27.2 0.0 1 1 7.8e-10 6.5e-08 26.1 0.0 3 149 2 144 1 207 0.73 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 3_3 - 265 VirC1 PF07015.6 231 0.00022 14.5 0.7 1 1 6.4e-06 0.00054 13.3 0.1 3 43 6 46 5 54 0.90 # 679 # 1473 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 4_17 - 403 VirC1 PF07015.6 231 0.00064 13.0 0.0 1 1 4.1e-05 0.0035 10.6 0.0 78 140 242 305 214 347 0.80 # 13321 # 14529 # 1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_64 - 84 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00036 13.9 0.1 1 1 2.8e-06 0.00071 13.0 0.0 32 49 22 39 20 40 0.92 # 60989 # 61240 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_30 - 165 AAA_33 PF13671.1 143 0.0016 12.5 0.0 1 1 1.8e-05 0.0023 12.0 0.0 4 40 39 80 37 122 0.76 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 3_10 - 646 AAA_33 PF13671.1 143 0.0029 11.7 0.1 1 2 0.00017 0.022 8.9 0.0 2 16 37 51 37 68 0.90 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_10 - 646 AAA_33 PF13671.1 143 0.0029 11.7 0.1 2 2 0.098 12 -0.1 0.0 64 118 156 212 122 225 0.61 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 8_1 - 93 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00012 15.8 0.0 1 1 2.1e-06 0.00026 14.6 0.0 12 45 11 45 8 46 0.88 # 64 # 342 # 1 # ID=8_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 3_36 - 93 CENP-B_N PF04218.8 53 0.0002 15.0 0.1 1 2 1e-05 0.0013 12.4 0.0 1 32 3 34 3 41 0.94 # 30185 # 30463 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 3_36 - 93 CENP-B_N PF04218.8 53 0.0002 15.0 0.1 2 2 0.052 6.5 0.5 0.0 20 30 67 78 57 87 0.74 # 30185 # 30463 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 2_34 - 215 ArgK PF03308.11 267 0.00054 13.0 0.5 1 2 5.3e-06 0.0013 11.7 0.1 36 66 6 38 1 44 0.85 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_34 - 215 ArgK PF03308.11 267 0.00054 13.0 0.5 2 2 0.042 11 -1.1 0.0 123 138 79 94 65 126 0.71 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_38 - 874 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 8.5e-16 51.7 0.0 1 1 1.5e-17 3.7e-15 49.6 0.0 217 453 338 576 247 591 0.81 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 3_10 - 646 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00024 15.1 0.3 1 2 0.00012 0.015 9.2 0.0 2 18 37 53 36 63 0.87 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_10 - 646 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00024 15.1 0.3 2 2 0.0078 0.98 3.3 0.0 89 160 156 231 140 248 0.77 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 2_34 - 215 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00067 13.6 0.2 1 2 0.00025 0.031 8.2 0.2 7 30 9 32 2 33 0.81 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_34 - 215 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00067 13.6 0.2 2 2 0.002 0.25 5.2 0.0 46 114 29 98 26 133 0.88 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_65 - 430 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.0028 11.4 0.1 1 1 2.8e-05 0.007 10.1 0.1 12 44 35 67 26 80 0.81 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_25 - 102 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 0.0012 13.1 0.0 1 1 6.1e-06 0.0015 12.8 0.0 19 57 32 71 23 92 0.78 # 20513 # 20818 # 1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.588 3_15 - 450 ATP_bind_3 PF01171.15 182 2.6e-05 18.0 0.0 1 2 4.8e-07 0.00012 15.8 0.0 2 65 126 186 125 199 0.79 # 12204 # 13553 # -1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 3_15 - 450 ATP_bind_3 PF01171.15 182 2.6e-05 18.0 0.0 2 2 0.074 19 -1.1 0.0 77 100 299 322 277 325 0.82 # 12204 # 13553 # -1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 1_42 - 608 TIGR01134 TIGR01134 432 5.1e-15 49.6 0.0 1 2 0.00045 0.11 5.6 0.1 1 36 2 40 2 50 0.76 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_42 - 608 TIGR01134 TIGR01134 432 5.1e-15 49.6 0.0 2 2 5.1e-15 1.3e-12 41.7 0.0 82 200 57 165 53 184 0.78 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_42 - 608 TIGR01135 TIGR01135 607 7.2e-14 45.0 0.0 1 2 0.0048 1.2 1.3 0.0 1 37 2 41 2 51 0.72 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_42 - 608 TIGR01135 TIGR01135 607 7.2e-14 45.0 0.0 2 2 3.4e-15 8.5e-13 41.5 0.0 82 199 57 166 39 172 0.86 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_45 - 312 Trans_reg_C PF00486.23 77 9.6e-11 35.7 0.0 1 1 6.3e-13 1.6e-10 35.0 0.0 5 77 47 120 43 120 0.92 # 37485 # 38420 # 1 # ID=3_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.390 1_44 - 425 GSH-S_ATP PF02955.11 174 0.0022 11.3 0.0 1 1 1.5e-05 0.0039 10.5 0.0 19 78 137 203 121 208 0.74 # 41126 # 42400 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 4_22 - 286 RP-C PF03428.8 177 0.00025 14.7 0.0 1 1 1.8e-06 0.00046 13.9 0.0 72 108 60 95 53 99 0.93 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 8_2 - 271 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.3e-10 35.7 0.4 1 1 1.9e-12 1.6e-10 35.3 0.4 2 139 107 248 106 249 0.85 # 399 # 1211 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.518 1_63 - 555 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.9e-06 22.1 0.0 1 1 7.1e-08 5.9e-06 20.5 0.0 3 23 41 61 40 79 0.93 # 59179 # 60843 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 3_4 - 141 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 7.8e-06 20.1 0.0 1 1 1.1e-07 9.4e-06 19.9 0.0 57 139 28 111 16 112 0.72 # 1556 # 1978 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.456 2_41 - 95 HTH_26 PF13443.1 63 6.9e-06 20.4 0.0 1 1 9.3e-08 1.2e-05 19.7 0.0 2 36 11 45 10 55 0.88 # 33682 # 33966 # 1 # ID=2_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 4_9 - 205 HTH_26 PF13443.1 63 0.00027 15.3 0.0 1 1 5e-06 0.00063 14.2 0.0 1 32 154 188 154 198 0.91 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 3_12 - 368 TIGR00634 TIGR00634 563 0.002 11.0 0.2 1 2 0.099 25 -2.6 0.0 386 426 118 168 115 175 0.78 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 3_12 - 368 TIGR00634 TIGR00634 563 0.002 11.0 0.2 2 2 1.8e-05 0.0044 9.8 0.0 442 522 285 359 282 363 0.88 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 1_14 - 882 KAP_NTPase PF07693.9 325 0.00017 14.9 0.0 1 1 1.1e-06 0.00027 14.2 0.0 7 94 472 698 468 741 0.87 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 4_9 - 205 HTH_17 PF12728.2 51 8.3e-05 17.1 0.0 1 2 0.058 7.3 1.2 0.0 12 27 28 43 27 48 0.80 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 4_9 - 205 HTH_17 PF12728.2 51 8.3e-05 17.1 0.0 2 2 1.5e-05 0.0018 12.7 0.0 4 30 169 196 168 201 0.83 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 5_4 - 152 HTH_17 PF12728.2 51 0.00044 14.7 0.8 1 2 0.00016 0.02 9.4 0.1 3 32 14 47 13 52 0.76 # 2376 # 2831 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 5_4 - 152 HTH_17 PF12728.2 51 0.00044 14.7 0.8 2 2 0.011 1.4 3.5 0.1 23 40 115 132 104 134 0.80 # 2376 # 2831 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 1_8 - 172 TIGR00922 TIGR00922 172 7.9e-10 32.7 0.0 1 1 1.2e-11 3e-09 30.8 0.0 1 145 4 137 4 159 0.79 # 5376 # 5891 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.630 4_22 - 286 HTH_11 PF08279.7 55 5.1e-05 17.1 0.0 1 1 9.7e-06 0.00049 14.0 0.0 5 51 48 93 44 95 0.85 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 5_8 - 332 HTH_11 PF08279.7 55 0.00043 14.2 0.0 1 1 1.8e-05 0.00091 13.1 0.0 16 45 22 52 10 61 0.76 # 6844 # 7839 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 4_9 - 205 HTH_11 PF08279.7 55 0.00071 13.5 0.0 1 1 3.3e-05 0.0017 12.3 0.0 17 36 168 187 157 188 0.85 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_64 - 84 HTH_11 PF08279.7 55 0.00083 13.2 0.0 1 1 3.5e-05 0.0017 12.2 0.0 20 37 22 39 7 40 0.87 # 60989 # 61240 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 2_17 - 211 HTH_11 PF08279.7 55 0.001 12.9 0.0 1 1 4.5e-05 0.0023 11.8 0.0 15 43 34 62 27 64 0.81 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_17 - 211 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.0025 11.7 0.0 1 1 3.1e-05 0.0039 11.1 0.0 139 176 22 59 2 66 0.81 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 1_64 - 84 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.005 10.7 0.9 1 1 5.5e-05 0.0069 10.3 0.0 143 174 9 40 2 53 0.85 # 60989 # 61240 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 4_22 - 286 MarR_2 PF12802.2 62 7e-06 19.9 0.3 1 1 3.6e-07 2.3e-05 18.3 0.1 21 56 57 93 40 99 0.86 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 4_9 - 205 MarR_2 PF12802.2 62 3.1e-05 17.8 0.0 1 1 1.6e-06 9.9e-05 16.2 0.0 6 42 153 187 148 190 0.75 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 5_8 - 332 MarR_2 PF12802.2 62 5.8e-05 17.0 0.1 1 1 2.2e-06 0.00014 15.7 0.1 11 47 13 47 7 59 0.87 # 6844 # 7839 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 2_17 - 211 MarR_2 PF12802.2 62 0.00093 13.1 0.0 1 1 5e-05 0.0031 11.4 0.0 14 49 29 62 19 63 0.87 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 1_30 - 165 PIF1 PF05970.9 364 0.0023 11.0 0.0 1 1 1.4e-05 0.0034 10.5 0.0 17 47 29 59 18 64 0.84 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_22 - 286 HTH_5 PF01022.15 47 4.2e-05 17.4 0.0 1 1 2.3e-06 0.00019 15.3 0.0 14 46 57 89 46 90 0.89 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 4_9 - 205 HTH_5 PF01022.15 47 5.9e-05 16.9 0.0 1 1 2e-06 0.00017 15.5 0.0 15 37 166 188 154 188 0.88 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_17 - 211 HTH_5 PF01022.15 47 0.002 12.0 0.0 1 2 0.0015 0.13 6.3 0.0 14 32 33 51 23 63 0.78 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_17 - 211 HTH_5 PF01022.15 47 0.002 12.0 0.0 2 2 0.016 1.4 3.0 0.0 11 28 109 127 106 131 0.82 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 4_22 - 286 TrmB PF01978.14 68 7.6e-07 23.0 0.0 1 1 5.6e-09 1.4e-06 22.2 0.0 23 59 59 95 47 104 0.87 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_64 - 84 LacI PF00356.16 46 0.00033 14.5 0.0 1 1 1.8e-06 0.00045 14.1 0.0 2 35 20 53 19 62 0.91 # 60989 # 61240 # -1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 1_42 - 608 GATase_7 PF13537.1 125 1.8e-44 144.7 0.0 1 2 4.5e-46 1.1e-43 142.1 0.0 2 124 48 165 47 166 0.97 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_42 - 608 GATase_7 PF13537.1 125 1.8e-44 144.7 0.0 2 2 0.064 16 -0.5 0.0 67 86 574 593 557 597 0.84 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_24 - 616 CoA_binding_2 PF13380.1 116 0.00081 13.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.0028 12.1 0.0 2 90 162 255 161 286 0.79 # 15802 # 17649 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 1_44 - 425 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1e-38 127.1 0.0 1 1 7.3e-41 1.8e-38 126.3 0.0 2 182 113 295 112 297 0.97 # 41126 # 42400 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 2_17 - 211 UPF0122 PF04297.9 101 0.0013 13.0 0.0 1 1 8.8e-06 0.0022 12.2 0.0 26 57 27 58 23 64 0.89 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 4_18 - 329 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.0014 12.7 0.0 1 1 1.7e-05 0.0044 11.1 0.0 8 51 146 182 137 191 0.84 # 14526 # 15512 # 1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.508 1_74 - 53 HTH_Mga PF08280.6 59 0.00035 14.5 0.0 1 1 1.7e-06 0.00043 14.3 0.0 15 34 29 49 18 50 0.83 # 68148 # 68306 # 1 # ID=1_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.522 1_65 - 430 Amino_oxidase PF01593.19 450 2.8e-54 179.0 0.0 1 1 2.7e-56 3.4e-54 178.8 0.0 1 332 53 408 53 421 0.93 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_66 - 150 Amino_oxidase PF01593.19 450 5.2e-22 72.7 0.1 1 1 4.6e-24 5.8e-22 72.5 0.1 338 450 1 127 1 127 0.93 # 62979 # 63428 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_42 - 608 Asn_synthase PF00733.16 255 1.3e-71 235.2 0.2 1 1 1.5e-73 1.9e-71 234.7 0.2 1 255 239 537 239 537 0.98 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_15 - 450 Asn_synthase PF00733.16 255 1.6e-05 18.7 0.0 1 1 2.4e-07 3e-05 17.8 0.0 14 137 120 244 111 368 0.63 # 12204 # 13553 # -1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 1_65 - 430 DAO PF01266.19 358 1.1e-09 31.9 1.4 1 2 2.7e-09 6.9e-07 22.6 0.8 2 35 46 81 45 102 0.86 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_65 - 430 DAO PF01266.19 358 1.1e-09 31.9 1.4 2 2 0.00011 0.027 7.5 0.0 160 226 292 367 277 399 0.77 # 61741 # 63030 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_30 - 165 SKI PF01202.17 158 0.0004 14.5 0.1 1 1 3.7e-06 0.00094 13.3 0.0 2 40 44 82 43 93 0.89 # 20076 # 20570 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_14 - 882 AAA_10 PF12846.2 304 1.8e-45 149.8 0.0 1 1 6.7e-47 2.8e-45 149.2 0.0 1 288 485 771 485 780 0.87 # 7935 # 10580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 1_38 - 874 AAA_10 PF12846.2 304 1.6e-12 41.6 0.1 1 1 1.7e-13 7e-12 39.5 0.1 5 300 197 505 194 508 0.73 # 27728 # 30349 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 3_10 - 646 AAA_10 PF12846.2 304 0.00011 15.9 0.0 1 1 6.9e-06 0.00029 14.5 0.1 3 22 36 55 34 67 0.84 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_60 - 647 AAA_10 PF12846.2 304 0.00011 15.9 0.1 1 1 5.5e-06 0.00023 14.8 0.1 4 26 37 60 35 68 0.78 # 55122 # 57062 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 3_12 - 368 AAA_10 PF12846.2 304 0.00016 15.4 0.1 1 2 0.00036 0.015 8.9 0.1 4 24 174 194 172 224 0.79 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 3_12 - 368 AAA_10 PF12846.2 304 0.00016 15.4 0.1 2 2 0.0084 0.35 4.4 0.0 218 267 299 344 272 361 0.78 # 9800 # 10903 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.374 2_34 - 215 AAA_10 PF12846.2 304 0.0022 11.6 0.0 1 1 5.5e-05 0.0023 11.6 0.0 11 43 11 45 1 189 0.92 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 4_9 - 205 HTH_20 PF12840.2 61 0.00013 15.9 0.2 1 1 8.1e-06 0.00068 13.7 0.0 25 46 167 188 148 189 0.87 # 5962 # 6576 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_17 - 211 HTH_20 PF12840.2 61 0.0014 12.7 0.0 1 2 0.001 0.084 7.0 0.0 19 45 29 55 23 63 0.77 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 2_17 - 211 HTH_20 PF12840.2 61 0.0014 12.7 0.0 2 2 0.019 1.6 2.8 0.0 23 55 113 144 106 148 0.83 # 13441 # 14073 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.599 5_8 - 332 HTH_20 PF12840.2 61 0.0016 12.5 0.0 1 1 3.7e-05 0.0031 11.6 0.0 14 55 8 53 2 59 0.86 # 6844 # 7839 # -1 # ID=5_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_69 - 93 IPT PF01745.11 233 8.6e-33 107.6 0.0 1 1 7.3e-35 9.2e-33 107.5 0.0 30 116 2 89 1 92 0.97 # 65533 # 65811 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.401 1_70 - 271 IPT PF01745.11 233 1.3e-29 97.2 0.0 1 1 1.3e-31 1.7e-29 96.8 0.0 142 228 1 87 1 92 0.96 # 65874 # 66686 # 1 # ID=1_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 1_42 - 608 DUF3700 PF12481.3 228 1.1e-06 22.2 0.0 1 1 1.3e-08 3.2e-06 20.7 0.0 125 175 114 163 65 168 0.86 # 38097 # 39920 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_10 - 646 AAA_13 PF13166.1 712 0.00019 14.2 0.2 1 2 0.00031 0.079 5.5 0.0 23 52 41 70 34 130 0.87 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_10 - 646 AAA_13 PF13166.1 712 0.00019 14.2 0.2 2 2 0.00014 0.034 6.7 0.0 526 582 161 215 151 259 0.83 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 4_22 - 286 RPA_C PF08784.6 102 0.001 13.7 0.0 1 1 1.5e-05 0.002 12.8 0.0 66 97 59 90 16 91 0.90 # 18665 # 19522 # -1 # ID=4_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 4_17 - 403 RPA_C PF08784.6 102 0.0013 13.4 0.0 1 1 3.6e-05 0.0046 11.6 0.0 74 96 49 72 44 77 0.86 # 13321 # 14529 # 1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 3_3 - 265 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.4e-08 27.1 0.5 1 1 6.4e-10 8.1e-08 25.8 0.5 5 49 9 53 5 135 0.90 # 679 # 1473 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 2_34 - 215 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.1e-06 22.1 0.0 1 1 1.7e-08 2.2e-06 21.1 0.0 3 50 3 50 1 59 0.89 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 3_3 - 265 AAA_31 PF13614.1 157 9.8e-13 42.5 0.1 1 1 4e-14 3.4e-12 40.8 0.1 2 151 6 157 5 162 0.87 # 679 # 1473 # -1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.434 4_17 - 403 AAA_31 PF13614.1 157 9.6e-07 23.1 0.0 1 2 2.5e-05 0.0021 12.2 0.0 2 90 113 206 112 220 0.76 # 13321 # 14529 # 1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 4_17 - 403 AAA_31 PF13614.1 157 9.6e-07 23.1 0.0 2 2 0.00037 0.031 8.4 0.0 109 148 239 277 233 282 0.84 # 13321 # 14529 # 1 # ID=4_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 2_34 - 215 AAA_31 PF13614.1 157 1.1e-06 22.9 0.1 1 2 4.7e-06 0.00039 14.6 0.0 2 49 2 49 1 55 0.84 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 2_34 - 215 AAA_31 PF13614.1 157 1.1e-06 22.9 0.1 2 2 0.0023 0.19 5.9 0.0 111 151 71 110 62 113 0.88 # 29528 # 30172 # 1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 3_30 - 314 Yae1_N PF09811.4 39 1.7e-05 18.5 3.3 1 1 1.3e-07 3.3e-05 17.6 3.3 5 26 255 276 253 282 0.88 # 26595 # 27536 # 1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 3_10 - 646 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0014 12.2 0.0 1 2 0.00041 0.1 6.2 0.0 31 63 17 50 3 56 0.75 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_10 - 646 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0014 12.2 0.0 2 2 0.003 0.74 3.4 0.0 104 154 157 209 144 217 0.74 # 6595 # 8532 # -1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 2_28 - 421 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 0.0017 12.2 0.9 1 2 0.0057 0.72 3.7 0.1 13 35 151 176 148 181 0.75 # 22344 # 23606 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.564 2_28 - 421 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 0.0017 12.2 0.9 2 2 0.0014 0.18 5.7 0.0 5 29 181 205 177 215 0.84 # 22344 # 23606 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.564 2_38 - 275 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 0.0021 11.8 0.0 1 1 4.5e-05 0.0056 10.5 0.0 6 29 34 57 31 70 0.83 # 31437 # 32261 # -1 # ID=2_38;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 3_30 - 314 Glyco_trans_4_3 PF12000.3 171 7.7e-06 19.8 0.1 1 2 0.00019 0.049 7.4 0.0 14 84 112 182 89 188 0.78 # 26595 # 27536 # 1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 3_30 - 314 Glyco_trans_4_3 PF12000.3 171 7.7e-06 19.8 0.1 2 2 2.9e-05 0.0073 10.1 0.0 19 66 209 257 200 262 0.90 # 26595 # 27536 # 1 # ID=3_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 8_2 - 271 HTH_21 PF13276.1 60 1.9e-15 50.9 0.6 1 1 2.1e-17 5.2e-15 49.5 0.6 2 56 23 76 22 84 0.90 # 399 # 1211 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.518 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/cc081fb7-9163-4902-a8c5-c0c8a6fd77e7 # Target file: checkm_output/bins/pm24/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm24/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/cc081fb7-9163-4902-a8c5-c0c8a6fd77e7 checkm_output/bins/pm24/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:00:43 2017 # [ok]