# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_90 - 846 KaiC PF06745.8 227 5.3e-07 22.5 0.0 1 3 6.1e-05 0.0099 8.5 0.0 15 46 36 67 26 91 0.86 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 KaiC PF06745.8 227 5.3e-07 22.5 0.0 2 3 5.3e-05 0.0086 8.7 0.0 16 36 519 539 511 552 0.86 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 KaiC PF06745.8 227 5.3e-07 22.5 0.0 3 3 0.021 3.3 0.3 0.0 69 113 736 778 716 783 0.80 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_6 - 471 TrkA_N PF02254.13 116 0.00083 13.0 0.2 1 1 2.2e-05 0.0035 10.9 0.1 1 37 6 45 6 55 0.88 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 K_oxygenase PF13434.1 341 3.6e-12 39.4 1.5 1 3 0.00029 0.047 6.1 0.3 189 227 2 41 1 44 0.83 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 K_oxygenase PF13434.1 341 3.6e-12 39.4 1.5 2 3 2.7e-11 4.3e-09 29.2 0.0 95 228 101 228 92 265 0.77 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 K_oxygenase PF13434.1 341 3.6e-12 39.4 1.5 3 3 0.0068 1.1 1.6 0.0 294 338 330 371 283 374 0.71 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_136 - 337 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00027 14.1 0.3 1 2 4e-05 0.0064 9.7 0.0 19 40 1 22 1 23 0.94 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_136 - 337 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00027 14.1 0.3 2 2 0.065 10 -0.6 0.0 34 41 31 38 24 44 0.79 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_118 - 728 ABC_tran PF00005.22 137 2.1e-33 109.1 0.0 1 1 4.9e-35 4e-33 108.2 0.0 2 137 511 659 510 659 0.88 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_90 - 846 ABC_tran PF00005.22 137 4.2e-20 66.0 0.1 1 3 1.8e-06 0.00014 15.7 0.0 1 28 30 57 30 68 0.90 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 ABC_tran PF00005.22 137 4.2e-20 66.0 0.1 2 3 5.5e-05 0.0044 10.9 0.0 91 137 361 409 307 409 0.81 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 ABC_tran PF00005.22 137 4.2e-20 66.0 0.1 3 3 2.1e-11 1.7e-09 31.7 0.1 3 136 514 757 512 758 0.84 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_31 - 339 ADH_N PF08240.7 109 2.6e-29 94.8 2.3 1 1 5.4e-31 4.4e-29 94.1 2.3 2 109 28 137 27 137 0.97 # 32014 # 33030 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_73 - 389 ADH_N PF08240.7 109 2.7e-27 88.3 1.4 1 1 3.3e-29 2.7e-27 88.3 1.4 1 103 25 149 25 155 0.88 # 80164 # 81330 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_139 - 143 DUF134 PF02001.11 106 0.00047 13.7 0.0 1 1 3.6e-06 0.00058 13.4 0.0 46 87 88 129 42 132 0.89 # 155298 # 155726 # 1 # ID=1_139;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.604 1_94 - 105 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00024 14.2 0.3 1 1 2.6e-06 0.00042 13.4 0.1 9 33 13 37 11 40 0.86 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_112 - 295 BcrAD_BadFG PF01869.15 271 1.3e-05 18.1 0.1 1 2 0.00064 0.1 5.4 0.1 4 24 7 27 6 44 0.89 # 122126 # 123010 # -1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_112 - 295 BcrAD_BadFG PF01869.15 271 1.3e-05 18.1 0.1 2 2 3e-05 0.0048 9.7 0.0 184 267 200 281 189 283 0.90 # 122126 # 123010 # -1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_6 - 471 FAD_binding_3 PF01494.14 356 0.00053 12.6 0.8 1 1 7e-06 0.0011 11.6 0.8 3 35 5 40 3 50 0.82 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_31 - 339 ThiF PF00899.16 136 0.00014 15.3 0.0 1 1 3e-06 0.00024 14.5 0.0 2 27 168 193 167 230 0.92 # 32014 # 33030 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_6 - 471 ThiF PF00899.16 136 0.0054 10.1 2.5 1 2 0.00036 0.029 7.8 1.2 2 31 3 32 2 35 0.90 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 ThiF PF00899.16 136 0.0054 10.1 2.5 2 2 0.055 4.5 0.7 0.0 7 34 337 365 334 372 0.89 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_4 - 630 Sigma54_activat PF00158.21 168 8.5e-70 227.1 0.1 1 1 1.1e-71 1.8e-69 226.1 0.1 9 167 14 172 9 173 0.96 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_128 - 212 HTH_40 PF14493.1 91 0.00015 15.6 0.0 1 1 1.6e-06 0.00025 14.8 0.0 5 42 145 182 142 208 0.80 # 140529 # 141164 # 1 # ID=1_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_128 - 212 HTH_38 PF13936.1 44 0.00086 12.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.0018 11.4 0.0 13 39 144 172 140 173 0.87 # 140529 # 141164 # 1 # ID=1_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_31 - 339 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 2.2e-07 23.8 0.0 1 1 2.1e-09 3.4e-07 23.1 0.0 34 80 166 212 156 235 0.82 # 32014 # 33030 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_98 - 258 TIGR01830 TIGR01830 239 1.6e-61 201.3 2.1 1 1 1.8e-63 2.9e-61 200.4 2.1 1 239 6 255 6 255 0.93 # 105583 # 106356 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_90 - 846 MobB PF03205.9 140 1.9e-05 18.0 0.1 1 2 0.0045 0.36 4.1 0.0 2 17 42 57 41 70 0.87 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 MobB PF03205.9 140 1.9e-05 18.0 0.1 2 2 2.8e-05 0.0023 11.2 0.0 3 25 525 547 523 552 0.88 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 MobB PF03205.9 140 0.00079 12.7 0.2 1 1 2.3e-05 0.0019 11.5 0.2 3 48 523 562 521 573 0.78 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_137 - 338 IlvN PF07991.7 165 1.9e-05 17.6 0.0 1 1 2.1e-07 3.3e-05 16.9 0.0 3 69 3 71 1 93 0.84 # 153496 # 154509 # 1 # ID=1_137;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_112 - 295 FGGY_N PF00370.16 245 1.3e-05 18.2 0.0 1 1 1.5e-07 2.5e-05 17.3 0.0 3 38 4 39 2 58 0.84 # 122126 # 123010 # -1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_67 - 512 DUF3584 PF12128.3 1201 0.094 3.5 15.3 1 1 0.00077 0.12 3.1 15.3 593 668 15 89 2 98 0.53 # 72616 # 74151 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.557 1_6 - 471 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 2.2e-09 31.2 0.6 1 2 6.4e-10 1e-07 25.8 0.3 1 199 7 224 7 227 0.65 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 2.2e-09 31.2 0.6 2 2 0.028 4.5 0.8 0.0 89 136 318 372 267 406 0.72 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 NAD_binding_7 PF13241.1 103 0.00076 13.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.0018 12.1 0.0 6 41 2 40 1 112 0.82 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_4 - 630 HTH_8 PF02954.14 42 3.7e-09 29.6 1.6 1 2 2.3e-11 3.7e-09 29.6 1.6 8 36 286 314 285 317 0.95 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_4 - 630 HTH_8 PF02954.14 42 3.7e-09 29.6 1.6 2 2 0.032 5.2 0.4 0.4 20 28 562 570 546 587 0.52 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_114 - 205 TetR_N PF00440.18 47 2.4e-14 46.4 0.6 1 1 3e-16 2.4e-14 46.4 0.6 1 44 22 65 22 68 0.96 # 124772 # 125386 # -1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 1_70 - 335 TetR_N PF00440.18 47 0.002 11.4 0.4 1 1 7.1e-05 0.0057 9.9 0.4 16 32 6 22 4 24 0.92 # 77028 # 78032 # 1 # ID=1_70;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_90 - 846 AAA_19 PF13245.1 76 7.3e-05 16.1 0.1 1 2 0.013 1.1 2.8 0.0 10 28 40 58 33 81 0.82 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_19 PF13245.1 76 7.3e-05 16.1 0.1 2 2 0.0001 0.0082 9.5 0.2 10 31 522 542 517 548 0.87 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 AAA_19 PF13245.1 76 0.00017 14.9 0.4 1 1 1.1e-05 0.00086 12.7 0.2 8 35 518 544 513 570 0.83 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_64 - 401 CbiA PF01656.18 195 6.4e-22 71.5 0.0 1 1 6e-24 9.7e-22 70.9 0.0 1 157 112 318 112 351 0.73 # 69142 # 70344 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_139 - 143 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 7.6e-16 51.0 0.1 1 1 2.4e-17 1.3e-15 50.3 0.1 2 54 75 127 74 127 0.96 # 155298 # 155726 # 1 # ID=1_139;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.604 1_121 - 221 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00026 14.0 0.2 1 1 8.7e-06 0.00047 13.2 0.2 24 54 172 202 158 202 0.84 # 132482 # 133144 # -1 # ID=1_121;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 1_128 - 212 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00061 12.8 0.0 1 1 2e-05 0.0011 12.1 0.0 26 53 153 180 149 181 0.93 # 140529 # 141164 # 1 # ID=1_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_63 - 358 Rep_3 PF01051.16 222 3.2e-34 112.0 0.2 1 1 2.6e-36 4.2e-34 111.6 0.2 3 220 27 282 25 284 0.92 # 66053 # 67126 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_49 - 546 Sigma70_ner PF04546.8 211 0.00035 13.8 0.3 1 2 0.094 15 -1.4 0.2 70 105 283 318 260 330 0.57 # 52534 # 54171 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_49 - 546 Sigma70_ner PF04546.8 211 0.00035 13.8 0.3 2 2 2.2e-06 0.00035 13.8 0.3 3 118 337 478 336 532 0.61 # 52534 # 54171 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_128 - 212 Terminase_5 PF06056.7 58 0.00033 13.8 0.0 1 1 6.7e-06 0.0011 12.2 0.0 12 34 152 174 142 180 0.89 # 140529 # 141164 # 1 # ID=1_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_90 - 846 AAA_23 PF13476.1 202 7.5e-06 19.9 0.0 1 2 0.00017 0.014 9.3 0.0 3 35 21 56 19 58 0.82 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_23 PF13476.1 202 7.5e-06 19.9 0.0 2 2 0.00033 0.026 8.4 0.0 20 37 523 540 509 565 0.87 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_119 - 420 AAA_23 PF13476.1 202 0.023 8.6 8.0 1 1 9e-05 0.0073 10.2 5.3 101 195 127 247 39 259 0.45 # 129838 # 131097 # -1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_139 - 143 Sigma70_r2 PF04542.9 71 2.6e-07 23.8 0.2 1 1 2.5e-09 4.1e-07 23.2 0.2 23 69 2 46 1 48 0.92 # 155298 # 155726 # 1 # ID=1_139;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.604 1_73 - 389 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.00023 14.8 0.2 1 1 4.6e-06 0.00073 13.2 0.1 7 79 193 267 186 308 0.57 # 80164 # 81330 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_4 - 630 AAA_30 PF13604.1 196 0.00011 15.4 0.9 1 2 0.0002 0.032 7.3 0.1 15 120 24 125 15 134 0.72 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_4 - 630 AAA_30 PF13604.1 196 0.00011 15.4 0.9 2 2 0.00061 0.098 5.8 0.1 53 89 561 597 543 612 0.79 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_137 - 338 F420_oxidored PF03807.12 96 2.4e-06 21.5 0.3 1 1 9e-08 4.9e-06 20.6 0.3 1 86 6 87 6 91 0.84 # 153496 # 154509 # 1 # ID=1_137;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_6 - 471 F420_oxidored PF03807.12 96 4.6e-05 17.4 1.2 1 2 3.5e-05 0.0019 12.2 0.3 2 36 6 39 5 61 0.83 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 F420_oxidored PF03807.12 96 4.6e-05 17.4 1.2 2 2 0.086 4.6 1.4 0.0 33 81 123 168 100 175 0.51 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_31 - 339 F420_oxidored PF03807.12 96 0.00041 14.4 0.4 1 1 2.8e-05 0.0015 12.6 0.4 1 61 170 226 170 241 0.88 # 32014 # 33030 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_90 - 846 SMC_N PF02463.14 220 6.1e-09 29.0 0.0 1 4 0.0012 0.095 5.4 0.0 5 41 20 57 18 89 0.81 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 SMC_N PF02463.14 220 6.1e-09 29.0 0.0 2 4 0.0016 0.13 5.0 0.0 136 211 378 452 119 457 0.72 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 SMC_N PF02463.14 220 6.1e-09 29.0 0.0 3 4 0.00041 0.033 6.9 0.0 18 43 517 541 509 578 0.84 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 SMC_N PF02463.14 220 6.1e-09 29.0 0.0 4 4 0.00051 0.041 6.6 0.0 136 207 726 797 581 803 0.80 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 SMC_N PF02463.14 220 1e-08 28.2 0.0 1 1 1.1e-09 9e-08 25.1 0.0 135 210 458 698 269 705 0.69 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_94 - 105 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.001 12.6 0.0 1 1 1.6e-05 0.0026 11.3 0.0 14 42 11 40 10 41 0.88 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_144 - 660 TIGR00460 TIGR00460 315 3.4e-55 180.6 0.0 1 1 3e-57 4.9e-55 180.1 0.0 17 301 17 293 1 298 0.90 # 159936 # 161915 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_121 - 221 GerE PF00196.14 58 1.4e-14 46.8 0.2 1 1 2.7e-16 2.2e-14 46.2 0.2 3 57 159 213 157 214 0.96 # 132482 # 133144 # -1 # ID=1_121;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 1_128 - 212 GerE PF00196.14 58 2.5e-11 36.4 0.0 1 1 5.2e-13 4.1e-11 35.7 0.0 8 52 143 187 136 192 0.90 # 140529 # 141164 # 1 # ID=1_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_90 - 846 TIGR03263 TIGR03263 180 0.00011 15.2 0.2 1 2 0.00023 0.038 6.9 0.0 2 37 41 78 40 84 0.75 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 TIGR03263 TIGR03263 180 0.00011 15.2 0.2 2 2 0.00042 0.068 6.0 0.1 2 23 523 544 522 549 0.87 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_64 - 401 MipZ PF09140.6 261 0.00033 13.3 0.5 1 2 0.0089 1.4 1.4 0.1 3 48 112 162 110 189 0.70 # 69142 # 70344 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_64 - 401 MipZ PF09140.6 261 0.00033 13.3 0.5 2 2 2.4e-05 0.0039 9.8 0.1 90 135 237 282 225 288 0.90 # 69142 # 70344 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_110 - 110 Methyltransf_25 PF13649.1 101 0.00065 13.7 0.0 1 1 4.4e-06 0.00071 13.5 0.0 4 58 6 65 4 99 0.84 # 120542 # 120871 # -1 # ID=1_110;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.506 1_65 - 324 Trp_repressor PF01371.14 88 0.00062 13.3 0.6 1 1 1.4e-05 0.0022 11.5 0.1 20 69 131 179 115 184 0.84 # 70341 # 71312 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_90 - 846 AAA_21 PF13304.1 303 8.8e-16 52.2 5.6 1 4 0.037 3 1.2 0.0 2 15 43 56 42 62 0.92 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_21 PF13304.1 303 8.8e-16 52.2 5.6 2 4 6.3e-08 5.1e-06 20.2 0.0 237 288 379 430 368 444 0.85 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_21 PF13304.1 303 8.8e-16 52.2 5.6 3 4 0.0037 0.3 4.5 0.7 1 16 524 539 524 540 0.93 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_21 PF13304.1 303 8.8e-16 52.2 5.6 4 4 1.4e-09 1.1e-07 25.6 0.0 233 295 723 785 704 793 0.94 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 AAA_21 PF13304.1 303 4e-06 20.5 0.1 1 2 0.00035 0.028 7.9 0.1 3 25 524 551 522 596 0.75 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_118 - 728 AAA_21 PF13304.1 303 4e-06 20.5 0.1 2 2 5.1e-05 0.0041 10.6 0.0 165 271 594 662 567 683 0.80 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_139 - 143 Sigma70_r4 PF04545.11 50 1.8e-10 33.6 0.0 1 1 2e-12 3.2e-10 32.8 0.0 3 48 82 127 81 129 0.94 # 155298 # 155726 # 1 # ID=1_139;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.604 1_6 - 471 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 9.2e-05 15.8 0.2 1 1 1.4e-06 0.00022 14.5 0.2 1 34 5 41 5 53 0.81 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_4 - 630 AAA PF00004.24 132 2.4e-08 27.8 0.0 1 1 6e-10 4.8e-08 26.9 0.0 1 128 30 163 30 167 0.82 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_118 - 728 AAA PF00004.24 132 0.00012 15.9 1.5 1 1 8.9e-06 0.00072 13.4 0.2 3 52 525 576 523 695 0.75 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_15 - 776 Parvo_NS1 PF01057.12 272 0.00049 12.6 0.3 1 1 4.4e-06 0.00071 12.0 0.3 113 142 2 31 1 36 0.89 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_65 - 324 KorB PF08535.5 93 0.0013 12.5 3.9 1 2 2.1e-05 0.0034 11.1 0.4 1 66 157 225 157 249 0.63 # 70341 # 71312 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_65 - 324 KorB PF08535.5 93 0.0013 12.5 3.9 2 2 0.015 2.5 2.0 0.3 19 91 224 294 221 296 0.77 # 70341 # 71312 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_153 - 93 Rrf2 PF02082.15 83 0.00023 14.9 0.0 1 1 1.9e-06 0.00031 14.4 0.0 26 69 28 74 10 82 0.82 # 167888 # 168166 # -1 # ID=1_153;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_54 - 255 MerR_1 PF13411.1 69 3e-09 30.2 0.0 1 1 3.2e-11 5.2e-09 29.4 0.0 2 67 5 66 4 67 0.93 # 58202 # 58966 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_144 - 660 DapB_N PF01113.15 124 0.00085 12.8 0.0 1 1 4.9e-05 0.0039 10.7 0.0 2 31 317 346 316 387 0.82 # 159936 # 161915 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_137 - 338 DapB_N PF01113.15 124 0.0014 12.1 0.0 1 1 4.2e-05 0.0034 10.9 0.0 2 58 6 57 5 93 0.64 # 153496 # 154509 # 1 # ID=1_137;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_90 - 846 cobW PF02492.14 178 2.3e-05 17.5 0.0 1 2 0.0028 0.46 3.5 0.0 2 22 42 62 41 70 0.78 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 cobW PF02492.14 178 2.3e-05 17.5 0.0 2 2 9.1e-06 0.0015 11.6 0.0 2 21 524 543 523 555 0.88 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_16 PF13191.1 185 2.7e-09 30.8 0.6 1 2 4.9e-05 0.004 10.7 0.0 26 52 42 71 26 123 0.75 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_16 PF13191.1 185 2.7e-09 30.8 0.6 2 2 1.1e-06 9.1e-05 16.1 0.0 24 50 522 548 514 561 0.87 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_4 - 630 AAA_16 PF13191.1 185 0.00055 13.5 3.7 1 1 6.9e-06 0.00056 13.5 0.0 11 63 15 66 10 177 0.80 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_90 - 846 AAA_22 PF13401.1 131 1e-07 25.7 0.0 1 2 0.00059 0.032 8.0 0.0 5 34 41 70 36 105 0.78 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_22 PF13401.1 131 1e-07 25.7 0.0 2 2 1.1e-05 0.00058 13.6 0.0 5 25 523 543 520 552 0.91 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 AAA_22 PF13401.1 131 6.7e-05 16.6 1.9 1 1 2.8e-05 0.0015 12.3 1.9 5 108 521 672 517 698 0.65 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_4 - 630 AAA_22 PF13401.1 131 0.00098 12.9 0.1 1 1 0.00036 0.019 8.7 0.0 7 49 30 67 25 143 0.81 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_15 - 776 FeoB_N PF02421.13 156 4.5e-61 198.3 0.1 1 1 5.3e-63 8.5e-61 197.4 0.1 1 154 4 161 4 163 0.96 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_28 - 331 HTH_AraC PF00165.18 42 5e-19 61.2 0.4 1 3 0.011 1.7 2.3 0.0 16 26 10 20 7 21 0.86 # 29100 # 30092 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_28 - 331 HTH_AraC PF00165.18 42 5e-19 61.2 0.4 2 3 1.9e-09 3.1e-07 23.7 0.0 1 42 220 261 220 261 0.96 # 29100 # 30092 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_28 - 331 HTH_AraC PF00165.18 42 5e-19 61.2 0.4 3 3 5.8e-12 9.3e-10 31.7 0.0 1 42 272 311 272 311 0.96 # 29100 # 30092 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_16 - 75 Macro_2 PF14519.1 280 0.0013 11.4 0.0 1 1 8.8e-06 0.0014 11.3 0.0 163 223 13 73 3 74 0.93 # 19635 # 19859 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 1_90 - 846 AAA_29 PF13555.1 62 6e-11 35.4 0.1 1 2 3.1e-06 0.00025 14.2 0.0 14 39 32 56 22 70 0.82 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_29 PF13555.1 62 6e-11 35.4 0.1 2 2 1.3e-07 1.1e-05 18.6 0.0 19 40 519 539 510 544 0.82 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 AAA_29 PF13555.1 62 0.00069 12.8 0.1 1 1 8.6e-06 0.00069 12.8 0.1 13 50 511 547 508 552 0.81 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_6 - 471 Pyr_redox PF00070.22 80 6.6e-07 23.3 1.0 1 1 1.7e-08 2.7e-06 21.4 0.6 2 35 6 42 5 49 0.86 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_101 - 302 HTH_1 PF00126.22 60 6.1e-27 86.8 0.6 1 1 1.5e-28 1.2e-26 85.9 0.6 1 60 3 62 3 62 0.99 # 108959 # 109864 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.597 1_37 - 299 HTH_1 PF00126.22 60 3.9e-24 77.8 1.3 1 1 8.2e-26 6.6e-24 77.1 1.3 1 60 5 64 5 64 0.98 # 36758 # 37654 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.576 1_153 - 93 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 6.4e-07 23.3 0.2 1 1 4.4e-09 7.2e-07 23.1 0.2 14 61 16 63 8 88 0.89 # 167888 # 168166 # -1 # ID=1_153;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_98 - 258 adh_short_C2 PF13561.1 241 8.4e-27 88.0 0.3 1 1 6.2e-29 1e-26 87.8 0.3 3 240 12 254 10 255 0.90 # 105583 # 106356 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_90 - 846 AAA_28 PF13521.1 163 0.00017 15.2 0.0 1 2 0.00022 0.036 7.6 0.0 2 63 43 109 42 116 0.71 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_28 PF13521.1 163 0.00017 15.2 0.0 2 2 0.0013 0.21 5.1 0.0 3 19 526 542 524 558 0.89 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_6 - 471 HI0933_like PF03486.9 409 0.0059 8.6 2.4 1 2 4.4e-05 0.007 8.4 0.8 2 37 5 43 4 48 0.84 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 HI0933_like PF03486.9 409 0.0059 8.6 2.4 2 2 0.077 12 -2.3 0.0 144 162 136 154 109 157 0.75 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_98 - 258 adh_short PF00106.20 167 7.6e-35 113.8 5.7 1 1 6.2e-37 1e-34 113.5 5.7 2 166 5 171 4 172 0.94 # 105583 # 106356 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_153 - 93 HTH_32 PF13565.1 77 0.00044 14.7 1.5 1 2 0.023 3.7 2.1 0.0 46 77 26 48 11 48 0.64 # 167888 # 168166 # -1 # ID=1_153;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_153 - 93 HTH_32 PF13565.1 77 0.00044 14.7 1.5 2 2 5.2e-06 0.00084 13.7 0.6 3 38 45 82 43 89 0.66 # 167888 # 168166 # -1 # ID=1_153;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_94 - 105 HTH_3 PF01381.17 55 4.5e-11 36.1 0.1 1 1 1.8e-12 5.9e-11 35.7 0.1 1 51 13 63 13 67 0.95 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_111 - 318 HTH_3 PF01381.17 55 0.00018 14.9 0.1 1 1 1.2e-05 0.00039 13.9 0.1 11 50 3 45 2 50 0.80 # 121160 # 122113 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_56 - 81 HTH_3 PF01381.17 55 0.00025 14.5 0.4 1 1 1.2e-05 0.00039 13.8 0.1 1 22 17 38 17 41 0.91 # 59704 # 59946 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_81 - 80 HTH_3 PF01381.17 55 0.00055 13.4 0.1 1 1 2.6e-05 0.00083 12.8 0.1 1 24 16 39 16 40 0.92 # 89866 # 90105 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_136 - 337 HTH_3 PF01381.17 55 0.0012 12.3 0.0 1 1 0.00012 0.0037 10.7 0.0 10 46 1 37 1 44 0.90 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_144 - 660 Epimerase PF01370.16 236 5.5e-43 140.6 0.0 1 1 5e-45 8.1e-43 140.1 0.0 1 236 318 566 318 566 0.92 # 159936 # 161915 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_153 - 93 HTH_23 PF13384.1 50 3.7e-09 29.6 0.1 1 1 1.5e-10 4.8e-09 29.3 0.1 3 48 12 58 10 60 0.93 # 167888 # 168166 # -1 # ID=1_153;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_128 - 212 HTH_23 PF13384.1 50 1.5e-05 18.2 0.0 1 1 1e-06 3.3e-05 17.1 0.0 8 41 144 175 140 187 0.86 # 140529 # 141164 # 1 # ID=1_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_136 - 337 HTH_23 PF13384.1 50 0.00016 14.9 2.2 1 2 4.7e-05 0.0015 11.8 0.0 19 47 2 28 1 30 0.90 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_136 - 337 HTH_23 PF13384.1 50 0.00016 14.9 2.2 2 2 0.07 2.3 1.7 0.0 28 46 26 44 23 48 0.80 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_139 - 143 HTH_23 PF13384.1 50 0.00029 14.1 0.0 1 1 2e-05 0.00064 13.0 0.0 7 35 89 117 83 127 0.76 # 155298 # 155726 # 1 # ID=1_139;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.604 1_65 - 324 HTH_23 PF13384.1 50 0.00051 13.3 0.0 1 1 0.00017 0.0054 10.0 0.0 10 38 152 180 150 185 0.84 # 70341 # 71312 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_64 - 401 Fer4_NifH PF00142.13 273 3.4e-05 16.7 0.0 1 1 3.6e-07 5.9e-05 15.9 0.0 8 74 118 189 112 197 0.79 # 69142 # 70344 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_137 - 338 GFO_IDH_MocA PF01408.17 120 7.9e-24 78.1 0.1 1 1 1.6e-25 1.3e-23 77.4 0.1 2 119 6 121 5 122 0.94 # 153496 # 154509 # 1 # ID=1_137;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_6 - 471 GFO_IDH_MocA PF01408.17 120 0.00018 15.6 0.6 1 3 0.011 0.87 3.7 0.2 2 42 5 45 4 64 0.82 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 GFO_IDH_MocA PF01408.17 120 0.00018 15.6 0.6 2 3 0.00086 0.069 7.3 0.0 2 34 192 224 192 242 0.92 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 GFO_IDH_MocA PF01408.17 120 0.00018 15.6 0.6 3 3 0.097 7.8 0.6 0.0 15 87 301 387 296 423 0.64 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_128 - 212 HTH_7 PF02796.10 45 2.7e-06 20.8 0.1 1 1 7e-08 5.6e-06 19.8 0.1 12 39 144 171 137 174 0.94 # 140529 # 141164 # 1 # ID=1_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_136 - 337 HTH_7 PF02796.10 45 0.00048 13.6 0.0 1 2 0.00022 0.018 8.6 0.0 22 44 1 23 1 24 0.92 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_136 - 337 HTH_7 PF02796.10 45 0.00048 13.6 0.0 2 2 0.027 2.1 1.9 0.0 32 44 26 38 23 39 0.86 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_94 - 105 HTH_19 PF12844.2 64 1.2e-06 22.1 0.0 1 1 4e-08 1.6e-06 21.7 0.0 3 47 12 56 10 69 0.92 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_89 - 128 HTH_19 PF12844.2 64 1.9e-05 18.3 0.0 1 1 6.3e-07 2.5e-05 17.9 0.0 2 59 63 119 62 124 0.93 # 96398 # 96781 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_111 - 318 HTH_19 PF12844.2 64 4e-05 17.2 0.0 1 1 2.1e-06 8.4e-05 16.2 0.0 14 55 3 47 1 54 0.92 # 121160 # 122113 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_70 - 335 HTH_19 PF12844.2 64 6.8e-05 16.5 0.0 1 1 2e-05 0.0008 13.1 0.0 8 40 2 35 1 56 0.80 # 77028 # 78032 # 1 # ID=1_70;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_137 - 338 OCD_Mu_crystall PF02423.10 314 0.00035 12.9 0.2 1 1 3.4e-06 0.00054 12.3 0.2 130 192 5 61 2 88 0.79 # 153496 # 154509 # 1 # ID=1_137;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_137 - 338 Saccharop_dh PF03435.13 386 5.9e-07 22.3 0.1 1 1 1.5e-08 7.9e-07 21.9 0.1 1 93 7 90 7 138 0.84 # 153496 # 154509 # 1 # ID=1_137;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_98 - 258 Saccharop_dh PF03435.13 386 6.8e-07 22.1 0.6 1 1 1.7e-08 9.3e-07 21.6 0.6 5 84 10 97 7 130 0.86 # 105583 # 106356 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_6 - 471 Saccharop_dh PF03435.13 386 0.002 10.6 1.8 1 1 5e-05 0.0027 10.2 0.2 1 40 6 46 6 66 0.86 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_4 - 630 Mg_chelatase PF01078.16 207 6e-05 15.8 0.0 1 2 0.0026 0.21 4.3 0.0 24 43 29 48 14 61 0.86 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_4 - 630 Mg_chelatase PF01078.16 207 6e-05 15.8 0.0 2 2 8.5e-05 0.0069 9.1 0.0 93 157 85 147 77 158 0.82 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_118 - 728 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.0014 11.4 0.4 1 1 4e-05 0.0032 10.2 0.4 22 48 520 546 512 560 0.87 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_98 - 258 NAD_binding_10 PF13460.1 183 9e-06 19.4 1.6 1 1 2.3e-07 1.8e-05 18.3 1.6 3 96 8 118 7 156 0.80 # 105583 # 106356 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_144 - 660 NAD_binding_10 PF13460.1 183 7.2e-05 16.4 0.0 1 1 3.1e-06 0.00025 14.6 0.0 1 65 318 387 318 526 0.82 # 159936 # 161915 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_153 - 93 HTH_29 PF13551.1 112 1.9e-07 24.8 0.8 1 1 2.6e-09 2.1e-07 24.7 0.8 1 58 16 72 16 89 0.82 # 167888 # 168166 # -1 # ID=1_153;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_136 - 337 HTH_29 PF13551.1 112 0.011 9.5 4.7 1 2 0.019 1.5 2.6 0.0 15 35 3 23 1 28 0.84 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_136 - 337 HTH_29 PF13551.1 112 0.011 9.5 4.7 2 2 0.0012 0.098 6.4 0.1 23 52 26 55 23 112 0.77 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_6 - 471 NAD_binding_9 PF13454.1 156 9e-27 87.3 1.8 1 3 6.9e-27 1.1e-24 80.5 0.3 1 156 7 157 7 157 0.89 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 NAD_binding_9 PF13454.1 156 9e-27 87.3 1.8 2 3 0.031 5 0.4 0.0 2 36 195 226 194 250 0.81 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 NAD_binding_9 PF13454.1 156 9e-27 87.3 1.8 3 3 0.003 0.48 3.8 0.0 104 154 317 371 295 373 0.80 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_29 - 260 TIGR03413 TIGR03413 248 0.00066 12.3 0.0 1 1 1.2e-05 0.00094 11.8 0.0 42 79 58 95 50 156 0.82 # 30166 # 30945 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_95 - 280 TIGR03413 TIGR03413 248 0.0016 11.1 0.2 1 2 0.00056 0.045 6.3 0.3 42 65 93 116 79 138 0.82 # 101267 # 102106 # -1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 1_95 - 280 TIGR03413 TIGR03413 248 0.0016 11.1 0.2 2 2 0.0088 0.71 2.4 0.0 102 132 181 213 165 216 0.72 # 101267 # 102106 # -1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 1_6 - 471 GIDA PF01134.17 392 0.0091 8.4 4.3 1 3 0.00011 0.017 7.5 2.0 1 23 5 27 5 50 0.83 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 GIDA PF01134.17 392 0.0091 8.4 4.3 2 3 0.059 9.5 -1.6 0.0 130 147 136 153 112 154 0.76 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 GIDA PF01134.17 392 0.0091 8.4 4.3 3 3 0.031 5 -0.6 0.0 141 153 363 375 306 391 0.76 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_137 - 338 ApbA PF02558.11 151 0.0011 12.0 0.1 1 1 2.6e-05 0.0021 11.1 0.1 1 77 7 74 7 91 0.67 # 153496 # 154509 # 1 # ID=1_137;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_6 - 471 ApbA PF02558.11 151 0.0062 9.6 3.3 1 1 5.6e-05 0.0045 10.0 0.3 1 35 6 43 6 70 0.84 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 NAD_binding_8 PF13450.1 68 1.1e-08 28.6 1.6 1 2 2.9e-10 4.6e-08 26.6 0.5 1 55 8 66 8 74 0.89 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 NAD_binding_8 PF13450.1 68 1.1e-08 28.6 1.6 2 2 0.078 13 -0.4 0.0 1 25 195 221 195 227 0.63 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_3 - 317 ETF PF01012.16 164 0.00069 12.9 0.5 1 2 0.02 3.3 1.0 0.1 35 72 81 112 68 120 0.66 # 1567 # 2517 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 1_3 - 317 ETF PF01012.16 164 0.00069 12.9 0.5 2 2 3.4e-05 0.0055 10.0 0.0 48 85 170 205 144 232 0.82 # 1567 # 2517 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 1_144 - 660 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00034 13.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.00085 12.5 0.0 14 80 324 389 323 462 0.67 # 159936 # 161915 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_73 - 389 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00043 13.5 0.0 1 1 8.6e-06 0.00069 12.8 0.0 10 124 192 326 183 356 0.69 # 80164 # 81330 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_4 - 630 AAA_5 PF07728.9 139 1.8e-12 40.8 0.0 1 1 8.7e-14 7e-12 38.8 0.0 2 123 30 148 29 167 0.85 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_118 - 728 AAA_5 PF07728.9 139 7.3e-05 16.1 0.0 1 1 8.2e-06 0.00066 13.0 0.0 2 72 523 592 522 668 0.89 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_6 - 471 Trp_halogenase PF04820.9 454 3.3e-05 16.2 0.6 1 1 3.2e-07 5.2e-05 15.5 0.6 1 40 5 44 5 57 0.85 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_64 - 401 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00048 12.8 0.0 1 2 0.00031 0.051 6.1 0.0 3 27 111 135 110 154 0.76 # 69142 # 70344 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_64 - 401 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00048 12.8 0.0 2 2 0.0012 0.19 4.2 0.0 102 141 236 275 228 299 0.86 # 69142 # 70344 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_90 - 846 AAA_18 PF13238.1 129 1.4e-06 22.2 0.0 1 2 0.00032 0.052 7.4 0.0 1 15 43 57 43 71 0.92 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_18 PF13238.1 129 1.4e-06 22.2 0.0 2 2 1.5e-05 0.0024 11.8 0.0 2 33 526 554 526 580 0.67 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_26 - 521 TIGR02209 TIGR02209 85 0.0006 13.1 0.6 1 1 1.3e-05 0.002 11.3 0.6 4 52 302 350 300 358 0.94 # 26769 # 28331 # -1 # ID=1_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_94 - 105 HTH_psq PF05225.11 45 0.001 12.2 0.1 1 1 1.1e-05 0.0018 11.4 0.1 11 44 15 49 13 50 0.82 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_90 - 846 DUF258 PF03193.11 161 2.9e-09 29.9 0.0 1 3 1.2e-05 0.0019 10.9 0.0 23 59 27 65 7 79 0.68 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 DUF258 PF03193.11 161 2.9e-09 29.9 0.0 2 3 5.6e-07 9e-05 15.3 0.0 36 59 523 546 501 583 0.75 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 DUF258 PF03193.11 161 2.9e-09 29.9 0.0 3 3 0.079 13 -1.5 0.0 13 48 670 705 663 708 0.78 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_4 - 630 AAA_3 PF07726.6 131 0.00012 15.3 0.0 1 1 2.3e-06 0.00037 13.7 0.0 65 111 101 147 29 150 0.76 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_153 - 93 HTH_28 PF13518.1 52 3.6e-12 39.7 0.3 1 1 5.9e-14 4.7e-12 39.3 0.3 2 51 16 66 15 68 0.94 # 167888 # 168166 # -1 # ID=1_153;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_128 - 212 HTH_28 PF13518.1 52 7.4e-05 16.3 0.0 1 1 1.9e-06 0.00015 15.3 0.0 3 31 144 172 142 177 0.92 # 140529 # 141164 # 1 # ID=1_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_31 - 339 Shikimate_DH PF01488.15 135 6e-05 16.8 0.0 1 1 2.6e-06 0.00014 15.6 0.0 12 86 168 241 161 274 0.90 # 32014 # 33030 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_6 - 471 Shikimate_DH PF01488.15 135 0.00095 12.9 0.5 1 2 0.00068 0.037 7.7 0.3 11 37 2 28 1 37 0.86 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 Shikimate_DH PF01488.15 135 0.00095 12.9 0.5 2 2 0.022 1.2 2.8 0.0 12 36 190 214 183 224 0.82 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_98 - 258 Shikimate_DH PF01488.15 135 0.0017 12.0 1.3 1 1 0.00014 0.0075 10.0 1.3 11 66 2 57 1 116 0.72 # 105583 # 106356 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_153 - 93 HTH_24 PF13412.1 48 2.7e-05 17.1 0.0 1 1 9e-07 3.6e-05 16.7 0.0 9 45 17 55 17 55 0.91 # 167888 # 168166 # -1 # ID=1_153;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_65 - 324 HTH_24 PF13412.1 48 4.3e-05 16.5 0.0 1 1 8.6e-06 0.00035 13.6 0.0 12 37 154 179 152 182 0.85 # 70341 # 71312 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_94 - 105 HTH_24 PF13412.1 48 0.00038 13.4 0.1 1 1 1.5e-05 0.00059 12.8 0.1 13 35 17 39 12 41 0.82 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_101 - 302 HTH_24 PF13412.1 48 0.00091 12.2 0.0 1 1 7.8e-05 0.0031 10.5 0.0 24 44 22 42 14 42 0.90 # 108959 # 109864 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.597 1_4 - 630 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 3e-25 82.5 0.0 1 1 5.1e-27 8.2e-25 81.0 0.0 5 138 11 177 10 177 0.96 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_28 - 331 HTH_18 PF12833.2 81 5.2e-23 74.6 0.4 1 1 5.5e-25 8.8e-23 73.9 0.4 1 80 233 311 233 312 0.96 # 29100 # 30092 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.566 1_11 - 157 DUF223 PF02721.9 95 0.0013 12.5 0.3 1 1 1.4e-05 0.0023 11.6 0.1 17 68 77 127 52 135 0.92 # 12188 # 12658 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_94 - 105 HTH_10 PF04967.7 53 0.00013 15.1 0.0 1 1 1.5e-06 0.00024 14.3 0.0 22 42 20 40 16 42 0.88 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_15 - 776 MMR_HSR1 PF01926.18 116 5.8e-19 61.8 0.0 1 1 1.6e-20 1.3e-18 60.7 0.0 2 115 6 120 5 121 0.70 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_90 - 846 MMR_HSR1 PF01926.18 116 8.4e-05 16.1 0.0 1 2 0.016 1.3 2.7 0.0 2 16 43 57 42 86 0.80 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 MMR_HSR1 PF01926.18 116 8.4e-05 16.1 0.0 2 2 0.0001 0.0083 9.7 0.0 3 20 526 543 524 572 0.83 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_31 - 339 NAD_binding_2 PF03446.10 163 3.1e-05 17.4 0.0 1 1 4.4e-07 7.1e-05 16.3 0.0 2 65 169 238 168 254 0.83 # 32014 # 33030 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_15 - 776 Miro PF08477.8 119 0.00022 15.3 0.0 1 1 5.2e-06 0.00042 14.4 0.0 2 118 6 122 5 123 0.54 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_90 - 846 Miro PF08477.8 119 0.00095 13.3 0.0 1 2 0.012 0.97 3.6 0.0 2 36 43 77 42 105 0.76 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 Miro PF08477.8 119 0.00095 13.3 0.0 2 2 0.0013 0.1 6.7 0.0 3 22 526 545 525 578 0.81 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_94 - 105 HTH_31 PF13560.1 64 8.2e-07 22.8 0.3 1 1 4.2e-08 1.1e-06 22.3 0.3 5 57 12 63 10 81 0.88 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_136 - 337 HTH_31 PF13560.1 64 2.9e-06 21.0 0.3 1 1 1.1e-07 2.9e-06 21.0 0.3 15 54 1 39 1 53 0.93 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_70 - 335 HTH_31 PF13560.1 64 1.7e-05 18.6 2.4 1 1 1e-05 0.00027 14.7 0.3 9 50 1 47 1 56 0.80 # 77028 # 78032 # 1 # ID=1_70;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_111 - 318 HTH_31 PF13560.1 64 2.5e-05 18.0 0.1 1 1 2.4e-06 6.4e-05 16.7 0.1 18 50 5 39 3 51 0.77 # 121160 # 122113 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_56 - 81 HTH_31 PF13560.1 64 3.1e-05 17.8 0.4 1 1 1.5e-06 4.1e-05 17.3 0.4 6 36 17 47 16 67 0.84 # 59704 # 59946 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_81 - 80 HTH_31 PF13560.1 64 4.6e-05 17.2 0.3 1 1 2.2e-06 6e-05 16.8 0.3 6 40 16 50 15 61 0.87 # 89866 # 90105 # 1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.529 1_90 - 846 DUF2075 PF09848.4 352 0.00013 14.6 0.0 1 2 0.0006 0.097 5.1 0.0 2 24 41 63 40 84 0.84 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 DUF2075 PF09848.4 352 0.00013 14.6 0.0 2 2 0.00013 0.021 7.3 0.0 3 26 524 554 522 573 0.77 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_63 - 358 HTH_36 PF13730.1 55 0.00039 14.1 0.2 1 2 0.056 9.1 0.2 0.0 25 38 119 132 106 141 0.82 # 66053 # 67126 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_63 - 358 HTH_36 PF13730.1 55 0.00039 14.1 0.2 2 2 3e-05 0.0048 10.7 0.1 6 55 216 269 214 269 0.89 # 66053 # 67126 # -1 # ID=1_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_45 - 776 TIGR01973 TIGR01973 606 1.6e-14 46.8 0.0 1 1 1.7e-16 2.7e-14 46.0 0.0 265 549 109 494 104 533 0.80 # 45365 # 47692 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.572 1_90 - 846 T2SE PF00437.15 272 0.00011 14.7 0.0 1 2 0.0019 0.3 3.5 0.0 121 145 35 57 11 71 0.76 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 T2SE PF00437.15 272 0.00011 14.7 0.0 2 2 5.6e-05 0.009 8.5 0.0 130 152 524 546 515 568 0.82 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_94 - 105 HTH_6 PF01418.12 77 0.001 12.4 0.4 1 1 1.4e-05 0.0022 11.3 0.2 35 55 22 42 13 44 0.88 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_90 - 846 NACHT PF05729.7 166 4.9e-05 16.6 0.0 1 2 0.0027 0.43 3.8 0.0 2 17 42 57 41 71 0.85 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 NACHT PF05729.7 166 4.9e-05 16.6 0.0 2 2 3.3e-05 0.0052 10.0 0.0 2 21 524 543 523 549 0.87 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_17 PF13207.1 121 1.3e-06 22.8 0.9 1 2 0.0006 0.048 8.1 0.2 2 16 43 57 42 58 0.92 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_17 PF13207.1 121 1.3e-06 22.8 0.9 2 2 2.8e-05 0.0022 12.4 0.0 3 19 526 542 525 551 0.92 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 AAA_17 PF13207.1 121 0.00076 13.9 0.0 1 1 4.6e-05 0.0037 11.7 0.0 3 26 524 544 523 621 0.63 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_118 - 728 TIGR02211 TIGR02211 221 4.2e-24 78.5 0.1 1 1 1e-25 8.4e-24 77.5 0.1 15 220 504 705 493 706 0.83 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_90 - 846 TIGR02211 TIGR02211 221 2.5e-23 76.0 0.0 1 4 9.5e-05 0.0076 9.0 0.0 16 48 25 57 15 63 0.89 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 TIGR02211 TIGR02211 221 2.5e-23 76.0 0.0 2 4 1.9e-09 1.5e-07 24.4 0.0 125 214 361 452 347 456 0.84 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 TIGR02211 TIGR02211 221 2.5e-23 76.0 0.0 3 4 1.7e-06 0.00014 14.7 0.0 21 49 512 540 505 553 0.88 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 TIGR02211 TIGR02211 221 2.5e-23 76.0 0.0 4 4 9.8e-09 7.9e-07 22.0 0.0 120 214 704 801 696 807 0.80 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_6 - 471 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.9e-05 16.2 4.6 1 2 9.6e-06 0.0016 10.9 0.9 2 42 6 43 5 64 0.72 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.9e-05 16.2 4.6 2 2 0.0003 0.048 6.0 0.1 358 406 385 432 293 438 0.70 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_90 - 846 AAA_25 PF13481.1 194 3.1e-07 23.5 0.2 1 2 6.8e-06 0.00055 12.9 0.0 29 73 36 79 23 81 0.83 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_25 PF13481.1 194 3.1e-07 23.5 0.2 2 2 0.00038 0.031 7.2 0.1 30 50 519 539 513 548 0.92 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 AAA_25 PF13481.1 194 0.00034 13.6 1.0 1 1 1e-05 0.00083 12.3 0.1 18 51 502 538 484 681 0.80 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_90 - 846 Viral_helicase1 PF01443.13 234 2.9e-05 17.2 0.0 1 2 0.0022 0.35 3.9 0.0 2 23 44 68 43 100 0.66 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 Viral_helicase1 PF01443.13 234 2.9e-05 17.2 0.0 2 2 1.4e-05 0.0023 11.0 0.0 2 21 526 545 525 576 0.81 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_15 PF13175.1 415 1.1e-06 21.5 0.0 1 3 9.2e-05 0.015 7.9 0.0 372 399 401 428 325 443 0.88 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_15 PF13175.1 415 1.1e-06 21.5 0.0 2 3 0.0099 1.6 1.2 0.0 24 42 524 542 507 570 0.81 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_15 PF13175.1 415 1.1e-06 21.5 0.0 3 3 0.00011 0.017 7.6 0.0 370 411 748 788 724 792 0.84 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_14 PF13173.1 128 2e-05 18.1 0.0 1 2 0.00052 0.084 6.4 0.0 2 27 40 65 39 88 0.82 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_14 PF13173.1 128 2e-05 18.1 0.0 2 2 8.1e-05 0.013 9.0 0.0 3 27 523 547 521 563 0.85 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_64 - 401 VirC1 PF07015.6 231 0.00048 12.8 0.1 1 2 0.0094 1.5 1.4 0.0 4 23 112 131 110 141 0.82 # 69142 # 70344 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_64 - 401 VirC1 PF07015.6 231 0.00048 12.8 0.1 2 2 4.9e-05 0.0079 8.8 0.0 84 178 246 346 237 358 0.66 # 69142 # 70344 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_144 - 660 3Beta_HSD PF01073.14 280 6.6e-07 21.8 0.0 1 1 1.2e-08 9.8e-07 21.3 0.0 1 129 319 444 319 498 0.79 # 159936 # 161915 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_98 - 258 3Beta_HSD PF01073.14 280 1.1e-06 21.1 0.9 1 1 2.3e-08 1.8e-06 20.3 0.9 2 103 8 122 7 128 0.81 # 105583 # 106356 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_136 - 337 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00011 14.9 0.2 1 2 6.9e-05 0.011 8.5 0.0 27 51 1 24 1 25 0.92 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_136 - 337 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00011 14.9 0.2 2 2 0.0062 1 2.3 0.0 38 50 26 38 26 40 0.88 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_54 - 255 MerR PF00376.18 38 1.5e-05 18.1 0.2 1 1 2.3e-07 3.7e-05 16.8 0.0 5 31 9 34 5 37 0.83 # 58202 # 58966 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_90 - 846 AAA_33 PF13671.1 143 4.4e-07 23.5 0.0 1 2 0.00013 0.01 9.3 0.0 1 16 42 57 42 106 0.87 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_33 PF13671.1 143 4.4e-07 23.5 0.0 2 2 3.5e-05 0.0028 11.1 0.0 3 20 526 543 524 552 0.87 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 AAA_33 PF13671.1 143 0.0013 12.2 2.4 1 2 0.00058 0.046 7.2 0.1 3 20 524 541 523 567 0.84 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_118 - 728 AAA_33 PF13671.1 143 0.0013 12.2 2.4 2 2 0.013 1 2.8 0.1 15 94 641 718 640 725 0.82 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_94 - 105 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00024 14.1 0.0 1 1 2.4e-06 0.00039 13.4 0.0 17 47 15 46 13 50 0.90 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_90 - 846 ArgK PF03308.11 267 0.00013 14.4 0.1 1 2 0.0012 0.2 3.9 0.0 22 55 33 67 22 73 0.76 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 ArgK PF03308.11 267 0.00013 14.4 0.1 2 2 7.4e-05 0.012 7.9 0.1 33 53 526 546 519 553 0.84 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_119 - 420 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.0016 11.8 0.9 1 2 3.7e-05 0.0059 10.0 0.3 18 83 164 227 143 246 0.82 # 129838 # 131097 # -1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_119 - 420 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.0016 11.8 0.9 2 2 0.092 15 -0.9 0.0 37 91 308 326 274 346 0.56 # 129838 # 131097 # -1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_33 - 80 Myb_DNA-bind_2 PF08914.6 65 0.0019 11.6 0.1 1 2 0.016 2.5 1.6 0.0 12 24 33 45 25 51 0.83 # 35449 # 35688 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_33 - 80 Myb_DNA-bind_2 PF08914.6 65 0.0019 11.6 0.1 2 2 0.00015 0.024 8.1 0.0 7 27 52 72 47 75 0.88 # 35449 # 35688 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_90 - 846 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00079 13.2 0.0 1 2 0.0093 0.75 3.6 0.0 1 17 43 59 43 79 0.80 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00079 13.2 0.0 2 2 0.00075 0.06 7.2 0.0 3 27 527 551 525 580 0.82 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0015 12.3 0.0 1 1 8e-05 0.0064 10.3 0.0 2 23 524 545 523 622 0.67 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_4 - 630 AAA_2 PF07724.9 171 4.4e-06 20.3 0.0 1 2 1.4e-07 2.3e-05 18.0 0.0 5 139 29 158 26 180 0.77 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_4 - 630 AAA_2 PF07724.9 171 4.4e-06 20.3 0.0 2 2 0.098 16 -1.1 0.0 93 106 457 470 453 475 0.84 # 2613 # 4502 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_90 - 846 APS_kinase PF01583.15 157 2.5e-05 17.6 0.0 1 2 4.2e-05 0.0067 9.7 0.0 2 21 40 59 39 71 0.85 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 APS_kinase PF01583.15 157 2.5e-05 17.6 0.0 2 2 0.00098 0.16 5.2 0.0 7 22 527 542 522 554 0.81 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 NTPase_1 PF03266.10 168 0.0011 12.3 0.5 1 1 1.6e-05 0.0026 11.0 0.2 2 37 523 561 522 577 0.73 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_31 - 339 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 3.1e-07 23.7 0.0 1 1 6.8e-09 5.5e-07 22.9 0.0 21 81 169 232 159 249 0.85 # 32014 # 33030 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_73 - 389 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.00014 15.1 0.0 1 1 3.8e-06 0.00031 13.9 0.0 21 63 187 230 173 285 0.86 # 80164 # 81330 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_15 - 776 TIGR03594 TIGR03594 432 1.2e-16 54.0 0.0 1 1 1.1e-18 1.7e-16 53.4 0.0 2 155 5 162 4 187 0.83 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_15 - 776 TIGR03598 TIGR03598 186 2.1e-07 24.1 0.0 1 1 1.8e-09 2.9e-07 23.6 0.0 18 183 3 161 1 164 0.72 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_98 - 258 3HCDH_N PF02737.13 180 1e-05 18.8 1.8 1 1 3e-07 2.4e-05 17.6 1.8 3 68 7 72 5 88 0.78 # 105583 # 106356 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_6 - 471 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0014 11.8 1.5 1 1 2.7e-05 0.0021 11.3 0.4 1 36 5 43 5 66 0.84 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_49 - 546 Med9 PF07544.8 83 0.017 8.5 8.5 1 3 0.052 8.4 -0.1 0.1 3 19 42 58 40 108 0.51 # 52534 # 54171 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_49 - 546 Med9 PF07544.8 83 0.017 8.5 8.5 2 3 0.0037 0.59 3.6 0.1 46 75 282 311 278 318 0.87 # 52534 # 54171 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_49 - 546 Med9 PF07544.8 83 0.017 8.5 8.5 3 3 0.00044 0.071 6.5 1.0 38 75 438 479 408 487 0.86 # 52534 # 54171 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_105 - 233 Trans_reg_C PF00486.23 77 7e-19 61.2 0.0 1 1 2e-20 1.6e-18 60.1 0.0 3 77 157 229 154 229 0.95 # 115665 # 116363 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 1_115 - 277 Trans_reg_C PF00486.23 77 1.4e-11 37.8 0.0 1 1 4.7e-13 3.8e-11 36.4 0.0 3 76 26 99 24 100 0.91 # 125794 # 126624 # 1 # ID=1_115;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.461 1_15 - 776 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00011 15.4 0.3 1 1 3.1e-06 0.0005 13.2 0.2 90 172 49 128 12 142 0.79 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_94 - 105 HTH_26 PF13443.1 63 1.1e-05 19.2 0.0 1 1 1.9e-07 1.5e-05 18.7 0.0 3 38 14 48 12 58 0.89 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_65 - 324 HTH_26 PF13443.1 63 5.9e-05 16.8 0.0 1 1 1.9e-06 0.00015 15.5 0.0 4 32 153 181 152 188 0.92 # 70341 # 71312 # 1 # ID=1_65;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_30 - 223 DUF2268 PF10026.4 195 3.2e-28 92.0 0.0 1 1 2.3e-30 3.7e-28 91.8 0.0 28 194 47 211 22 212 0.87 # 31296 # 31964 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_15 - 776 PduV-EutP PF10662.4 143 0.00067 12.7 0.1 1 1 1e-05 0.0017 11.5 0.1 4 141 6 163 1 165 0.66 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_6 - 471 Ldh_1_N PF00056.18 141 0.0015 12.0 0.1 1 2 0.00017 0.028 7.8 0.0 2 57 5 60 4 77 0.84 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 Ldh_1_N PF00056.18 141 0.0015 12.0 0.1 2 2 0.016 2.6 1.4 0.0 5 35 337 366 335 380 0.86 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_144 - 660 NAD_binding_4 PF07993.7 249 8.2e-05 15.2 0.0 1 1 1.7e-05 0.0027 10.2 0.0 3 200 322 495 320 528 0.74 # 159936 # 161915 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_94 - 105 HTH_11 PF08279.7 55 0.0015 11.8 0.1 1 2 0.062 10 -0.5 0.0 15 26 7 18 5 18 0.81 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_94 - 105 HTH_11 PF08279.7 55 0.0015 11.8 0.1 2 2 2.3e-05 0.0037 10.5 0.1 12 30 18 36 11 41 0.78 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_130 - 113 tRNA_anti-codon PF01336.20 75 1.7e-06 21.4 1.1 1 1 3.6e-08 2.9e-06 20.7 1.1 20 75 59 111 44 111 0.87 # 141730 # 142068 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.475 1_18 - 127 tRNA_anti-codon PF01336.20 75 1.1e-05 18.8 0.3 1 1 3.6e-07 2.9e-05 17.5 0.3 21 75 74 125 58 125 0.93 # 21102 # 21482 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_18 - 127 BOF PF04076.8 103 1.2e-41 134.3 0.5 1 1 1.9e-43 1.5e-41 134.0 0.5 2 102 23 123 22 124 0.96 # 21102 # 21482 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_130 - 113 BOF PF04076.8 103 1.5e-19 63.4 3.1 1 1 2.2e-21 1.8e-19 63.1 3.1 19 101 26 108 10 110 0.91 # 141730 # 142068 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.475 1_139 - 143 Sigma70_ECF PF07638.6 185 5.2e-07 23.1 0.0 1 1 3.4e-09 5.5e-07 23.0 0.0 117 182 65 130 3 133 0.79 # 155298 # 155726 # 1 # ID=1_139;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.604 1_105 - 233 MarR_2 PF12802.2 62 0.00037 13.8 0.3 1 2 0.011 1.7 2.0 0.0 9 20 64 75 63 94 0.78 # 115665 # 116363 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 1_105 - 233 MarR_2 PF12802.2 62 0.00037 13.8 0.3 2 2 6.8e-05 0.011 9.0 0.1 1 23 158 180 158 201 0.86 # 115665 # 116363 # -1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 1_144 - 660 RmlD_sub_bind PF04321.12 287 0.0013 11.2 0.0 1 1 1.6e-05 0.0025 10.3 0.0 2 116 317 447 316 481 0.85 # 159936 # 161915 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_111 - 318 LacI PF00356.16 46 6.8e-21 67.3 0.5 1 1 3.7e-22 1.5e-20 66.2 0.5 1 46 3 48 3 48 0.99 # 121160 # 122113 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_70 - 335 LacI PF00356.16 46 4.5e-19 61.4 0.0 1 1 2.8e-20 1.1e-18 60.2 0.0 1 46 8 56 8 56 0.96 # 77028 # 78032 # 1 # ID=1_70;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.598 1_136 - 337 LacI PF00356.16 46 2.7e-15 49.4 0.3 1 1 1.5e-16 6.2e-15 48.2 0.3 1 42 2 43 2 45 0.97 # 152377 # 153387 # -1 # ID=1_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.575 1_94 - 105 LacI PF00356.16 46 0.00058 13.1 0.4 1 1 2.2e-05 0.0009 12.5 0.4 2 33 24 55 23 59 0.87 # 100901 # 101215 # 1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_6 - 471 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 4.3e-09 30.1 0.0 1 1 1.5e-10 2.4e-08 27.6 0.0 1 198 5 429 5 432 0.68 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_112 - 295 ROK PF00480.15 179 1.7e-29 96.5 0.0 1 1 1.4e-31 2.3e-29 96.1 0.0 1 152 5 163 5 185 0.89 # 122126 # 123010 # -1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_6 - 471 DAO PF01266.19 358 1.4e-13 44.0 4.6 1 3 4.4e-12 7.1e-10 31.8 0.9 2 36 6 44 5 63 0.91 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 DAO PF01266.19 358 1.4e-13 44.0 4.6 2 3 6.2e-05 0.0099 8.3 0.0 178 233 134 182 112 290 0.68 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 DAO PF01266.19 358 1.4e-13 44.0 4.6 3 3 0.0011 0.17 4.2 0.0 188 223 358 391 308 457 0.70 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_90 - 846 AAA_10 PF12846.2 304 1.2e-06 21.7 0.0 1 2 0.0013 0.11 5.4 0.0 1 18 40 57 40 81 0.85 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 AAA_10 PF12846.2 304 1.2e-06 21.7 0.0 2 2 4.3e-06 0.00034 13.6 0.0 3 28 524 549 522 592 0.81 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_118 - 728 AAA_10 PF12846.2 304 0.00047 13.2 0.2 1 1 2.3e-05 0.0018 11.2 0.2 3 34 522 553 520 564 0.84 # 127637 # 129820 # -1 # ID=1_118;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_128 - 212 HTH_20 PF12840.2 61 0.0018 11.7 0.0 1 1 2e-05 0.0032 10.9 0.0 11 44 142 173 139 179 0.96 # 140529 # 141164 # 1 # ID=1_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_112 - 295 TIGR00329 TIGR00329 305 0.0012 11.3 0.0 1 1 1e-05 0.0017 10.9 0.0 193 302 170 278 151 281 0.70 # 122126 # 123010 # -1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_15 - 776 Dynamin_N PF00350.18 168 2.1e-05 17.9 0.0 1 2 0.00049 0.079 6.3 0.0 1 22 6 27 6 37 0.91 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_15 - 776 Dynamin_N PF00350.18 168 2.1e-05 17.9 0.0 2 2 5.6e-05 0.0091 9.4 0.0 100 143 49 100 42 121 0.78 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_73 - 389 Methyltransf_18 PF12847.2 112 1.4e-05 19.2 0.0 1 1 1.9e-07 3e-05 18.2 0.0 5 108 189 306 185 309 0.70 # 80164 # 81330 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_90 - 846 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 4.4e-09 29.9 1.6 1 3 0.00042 0.068 6.9 0.0 15 32 152 169 144 177 0.72 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 4.4e-09 29.9 1.6 2 3 0.002 0.33 4.7 0.1 34 50 280 296 271 302 0.68 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_90 - 846 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 4.4e-09 29.9 1.6 3 3 9.2e-07 0.00015 15.4 0.1 16 52 635 668 625 673 0.85 # 97507 # 100044 # 1 # ID=1_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 1_73 - 389 Methyltransf_11 PF08241.7 95 7.6e-05 16.8 0.0 1 1 3e-06 0.00048 14.2 0.0 4 93 193 305 190 307 0.71 # 80164 # 81330 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_15 - 776 TIGR00436 TIGR00436 270 4.7e-11 35.8 0.0 1 1 4.3e-13 6.9e-11 35.2 0.0 2 161 5 165 4 186 0.85 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_64 - 401 AAA_31 PF13614.1 157 3.6e-07 23.8 0.0 1 2 3e-05 0.0048 10.4 0.0 2 90 111 204 110 223 0.75 # 69142 # 70344 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_64 - 401 AAA_31 PF13614.1 157 3.6e-07 23.8 0.0 2 2 2.2e-05 0.0035 10.9 0.0 109 148 237 275 227 280 0.83 # 69142 # 70344 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_15 - 776 SRPRB PF09439.5 181 1.4e-07 24.5 0.0 1 1 1.3e-09 2.1e-07 23.9 0.0 5 129 5 129 1 142 0.76 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_151 - 307 Yae1_N PF09811.4 39 1.8e-05 17.8 0.7 1 1 2.1e-07 3.4e-05 17.0 0.7 4 22 255 273 254 282 0.91 # 166615 # 167535 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_31 - 339 ADH_zinc_N PF00107.21 130 5.6e-24 77.7 0.0 1 1 1.1e-25 8.7e-24 77.1 0.0 1 128 178 299 178 301 0.98 # 32014 # 33030 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_73 - 389 ADH_zinc_N PF00107.21 130 4.4e-20 65.2 0.2 1 3 0.058 4.7 0.4 0.0 72 121 69 128 61 132 0.79 # 80164 # 81330 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_73 - 389 ADH_zinc_N PF00107.21 130 4.4e-20 65.2 0.2 2 3 1.6e-15 1.3e-13 44.2 0.0 1 69 196 265 196 279 0.95 # 80164 # 81330 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_73 - 389 ADH_zinc_N PF00107.21 130 4.4e-20 65.2 0.2 3 3 5.1e-07 4.1e-05 16.7 0.0 69 129 289 348 284 349 0.92 # 80164 # 81330 # -1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_98 - 258 KR PF08659.5 181 1.9e-14 47.3 2.5 1 1 1.7e-16 2.8e-14 46.7 2.5 4 165 7 169 5 181 0.84 # 105583 # 106356 # -1 # ID=1_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_51 - 78 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 0.0002 14.5 0.0 1 1 1.7e-06 0.00027 14.1 0.0 13 34 44 66 42 72 0.82 # 55218 # 55451 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.543 1_130 - 113 tRNA_anti-like PF12869.2 144 0.00063 12.8 0.1 1 2 0.00055 0.088 5.9 0.0 111 142 32 63 10 65 0.77 # 141730 # 142068 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.475 1_130 - 113 tRNA_anti-like PF12869.2 144 0.00063 12.8 0.1 2 2 1.8e-05 0.0029 10.7 0.1 66 130 40 95 23 108 0.74 # 141730 # 142068 # -1 # ID=1_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.475 1_31 - 339 ADH_zinc_N_2 PF13602.1 127 1.7e-10 35.4 0.0 1 1 1.9e-12 3e-10 34.7 0.0 1 126 210 333 210 334 0.73 # 32014 # 33030 # -1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 1_137 - 338 Semialdhyde_dh PF01118.19 121 6.1e-06 20.2 0.0 1 1 1.4e-07 1.1e-05 19.3 0.0 1 92 6 90 6 114 0.80 # 153496 # 154509 # 1 # ID=1_137;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 1_144 - 660 Semialdhyde_dh PF01118.19 121 0.0017 12.2 0.0 1 1 4.5e-05 0.0036 11.2 0.0 1 35 317 351 317 399 0.75 # 159936 # 161915 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_6 - 471 Lycopene_cycl PF05834.7 374 3.3e-06 19.8 0.2 1 2 2.2e-07 3.5e-05 16.4 0.3 2 38 6 43 5 52 0.87 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_6 - 471 Lycopene_cycl PF05834.7 374 3.3e-06 19.8 0.2 2 2 0.016 2.6 0.3 0.0 96 140 110 156 98 173 0.68 # 5969 # 7381 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_151 - 307 Glyco_trans_4_3 PF12000.3 171 8.5e-06 19.1 0.1 1 2 0.00019 0.03 7.5 0.0 14 84 113 183 88 188 0.79 # 166615 # 167535 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_151 - 307 Glyco_trans_4_3 PF12000.3 171 8.5e-06 19.1 0.1 2 2 5.2e-05 0.0083 9.3 0.0 19 66 210 258 201 263 0.90 # 166615 # 167535 # 1 # ID=1_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_15 - 776 GTP_EFTU PF00009.22 188 6.8e-06 19.2 0.4 1 1 1.3e-06 0.00022 14.3 0.4 3 136 3 127 1 228 0.69 # 17308 # 19635 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/6b1c3176-1cc6-49d4-bc20-59c9b0b73750 # Target file: checkm_output/bins/pm23/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm23/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/6b1c3176-1cc6-49d4-bc20-59c9b0b73750 checkm_output/bins/pm23/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 10:00:37 2017 # [ok]