# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_31 - 173 KaiC PF06745.8 227 5.7e-05 15.1 0.1 1 2 3.6e-06 0.00034 12.6 0.0 16 43 22 49 11 54 0.85 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_31 - 173 KaiC PF06745.8 227 5.7e-05 15.1 0.1 2 2 0.02 1.9 0.3 0.0 133 184 106 151 85 165 0.54 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 ABC_tran PF00005.22 137 6.2e-07 22.6 0.0 1 1 4e-08 1.2e-06 21.6 0.0 14 73 186 243 178 310 0.78 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_31 - 173 ABC_tran PF00005.22 137 3.2e-06 20.3 0.0 1 1 2e-07 6.3e-06 19.4 0.0 4 31 18 45 16 53 0.84 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_35 - 518 ABC_tran PF00005.22 137 8.6e-05 15.7 0.0 1 1 1.9e-05 0.0006 13.0 0.0 12 37 240 265 233 342 0.89 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_31 - 173 DUF815 PF05673.8 250 0.00043 12.0 0.0 1 1 6.2e-06 0.00058 11.6 0.0 53 74 25 46 3 73 0.77 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_91 - 284 rve_3 PF13683.1 67 4.1e-18 57.6 0.0 1 1 1.5e-19 1.4e-17 55.9 0.0 1 67 205 271 205 271 0.98 # 71314 # 72165 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_31 - 173 Sigma54_activat PF00158.21 168 1e-06 21.1 0.0 1 1 3.7e-08 1.8e-06 20.4 0.0 7 47 10 51 5 68 0.80 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 Sigma54_activat PF00158.21 168 4e-06 19.2 0.0 1 2 1e-06 4.7e-05 15.7 0.0 10 46 171 207 163 223 0.81 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_29 - 352 Sigma54_activat PF00158.21 168 4e-06 19.2 0.0 2 2 0.034 1.6 1.0 0.0 42 91 234 284 229 291 0.76 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_31 - 173 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 5.7e-06 18.7 0.2 1 1 4.5e-07 1.1e-05 17.8 0.1 35 59 22 46 4 48 0.75 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 9.3e-06 18.0 0.0 1 1 6.8e-07 1.6e-05 17.3 0.0 20 58 163 203 150 205 0.82 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_24 - 786 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00021 13.6 0.1 1 1 1.7e-05 0.00039 12.7 0.1 39 54 418 439 381 442 0.79 # 12714 # 15071 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_67 - 556 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00024 13.4 0.0 1 2 0.00016 0.0038 9.5 0.0 39 59 128 150 104 154 0.79 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_67 - 556 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00024 13.4 0.0 2 2 0.056 1.3 1.2 0.0 145 189 275 343 188 361 0.72 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_4 - 326 TIGR01932 TIGR01932 318 4e-16 51.2 10.9 1 2 1.5e-11 1.4e-09 29.6 0.2 5 145 14 144 10 159 0.79 # 1475 # 2452 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_4 - 326 TIGR01932 TIGR01932 318 4e-16 51.2 10.9 2 2 1e-10 9.5e-09 26.9 5.2 174 279 142 254 140 293 0.79 # 1475 # 2452 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_4 - 326 TIGR01933 TIGR01933 261 3.9e-25 81.2 3.8 1 1 6.7e-27 6.3e-25 80.5 3.8 6 207 35 234 30 287 0.88 # 1475 # 2452 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_87 - 222 MobB PF03205.9 140 4.1e-07 22.6 0.1 1 2 1.9e-06 5.9e-05 15.6 0.1 10 38 13 41 3 48 0.81 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_87 - 222 MobB PF03205.9 140 4.1e-07 22.6 0.1 2 2 0.0037 0.12 5.0 0.0 44 75 85 119 75 137 0.78 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_31 - 173 MobB PF03205.9 140 6.5e-05 15.5 0.0 1 1 1.2e-05 0.00036 13.1 0.0 3 21 28 46 26 66 0.88 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 MobB PF03205.9 140 0.00039 13.0 0.0 1 1 8e-05 0.0025 10.3 0.0 4 24 187 207 185 221 0.81 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_24 - 786 DUF853 PF05872.7 504 0.00079 10.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.0013 9.9 0.0 19 36 421 438 409 459 0.79 # 12714 # 15071 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_29 - 352 AAA_19 PF13245.1 76 6.9e-07 21.8 0.0 1 1 5e-08 1.2e-06 21.1 0.0 5 35 178 207 174 287 0.86 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_67 - 556 AAA_19 PF13245.1 76 8.5e-06 18.3 0.0 1 1 8.5e-07 2e-05 17.2 0.0 10 45 130 167 122 179 0.77 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_35 - 518 AAA_19 PF13245.1 76 1.3e-05 17.8 0.0 1 1 3.6e-06 8.5e-05 15.1 0.0 5 35 233 263 229 286 0.82 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_31 - 173 AAA_19 PF13245.1 76 0.00051 12.6 0.0 1 1 0.00016 0.0038 9.8 0.0 8 30 23 45 16 48 0.70 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_87 - 222 CbiA PF01656.18 195 2.9e-19 62.0 0.3 1 1 1.4e-20 6.6e-19 60.9 0.3 2 174 6 161 5 182 0.70 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_58 - 234 CbiA PF01656.18 195 0.0003 13.0 2.3 1 2 4.1e-05 0.0019 10.4 0.4 1 20 5 24 5 86 0.92 # 47262 # 47963 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 1_58 - 234 CbiA PF01656.18 195 0.0003 13.0 2.3 2 2 0.0094 0.44 2.7 0.2 117 171 93 145 36 169 0.81 # 47262 # 47963 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 1_87 - 222 KTI12 PF08433.5 270 0.00046 12.2 0.1 1 1 9.8e-06 0.00092 11.2 0.1 11 41 13 43 4 57 0.81 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_81 - 84 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00061 12.1 0.0 1 1 9.5e-06 0.0009 11.6 0.0 26 44 18 36 13 38 0.91 # 66304 # 66555 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_91 - 284 rve PF00665.21 120 2.2e-30 98.1 0.0 1 1 7.2e-32 3.4e-30 97.5 0.0 2 120 118 234 117 234 0.97 # 71314 # 72165 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_66 - 703 rve PF00665.21 120 1e-25 83.0 0.0 1 1 6.4e-27 3e-25 81.5 0.0 3 120 264 406 262 406 0.96 # 52026 # 54134 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_31 - 173 MCM PF00493.18 331 0.00011 13.8 0.0 1 1 1.8e-06 0.00017 13.2 0.0 53 76 21 44 7 54 0.84 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 AAA_23 PF13476.1 202 1.7e-06 21.3 0.0 1 1 1.1e-07 3.6e-06 20.2 0.0 22 40 186 204 169 210 0.91 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_35 - 518 AAA_23 PF13476.1 202 1.3e-05 18.4 0.1 1 1 2.7e-06 8.6e-05 15.7 0.0 19 36 239 256 223 284 0.88 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_31 - 173 AAA_23 PF13476.1 202 3.2e-05 17.1 0.2 1 1 1.9e-06 5.9e-05 16.3 0.1 18 36 24 42 7 46 0.83 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_67 - 556 Zeta_toxin PF06414.7 201 4e-05 15.6 0.0 1 2 0.00055 0.017 7.0 0.0 14 39 127 152 117 161 0.82 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_67 - 556 Zeta_toxin PF06414.7 201 4e-05 15.6 0.0 2 2 0.0013 0.04 5.8 0.0 47 88 373 414 359 476 0.69 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_29 - 352 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.6e-05 15.4 0.0 1 1 3.5e-06 0.00011 14.1 0.0 14 47 181 215 168 231 0.82 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_35 - 518 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00049 12.0 0.0 1 1 3.7e-05 0.0011 10.8 0.0 18 39 241 262 227 275 0.85 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_35 - 518 AAA_30 PF13604.1 196 4e-07 22.6 0.0 1 1 3.1e-08 9.6e-07 21.3 0.0 3 42 224 263 222 272 0.92 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_31 - 173 AAA_30 PF13604.1 196 0.00032 13.1 0.1 1 1 2e-05 0.00062 12.2 0.0 7 37 15 44 14 47 0.84 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 AAA_30 PF13604.1 196 0.00035 13.0 0.0 1 1 1.9e-05 0.00061 12.2 0.0 10 42 176 207 168 216 0.74 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_92 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 2.2e-07 23.7 0.2 1 2 8.8e-08 8.3e-06 18.6 0.0 5 49 4 49 1 63 0.87 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_92 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 2.2e-07 23.7 0.2 2 2 0.0076 0.71 2.8 0.1 9 52 65 113 62 137 0.70 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_30 - 653 TraG-D_C PF12696.2 128 2.9e-27 87.9 0.0 1 1 5.7e-29 5.3e-27 87.0 0.0 2 127 427 551 426 552 0.87 # 19117 # 21075 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 1_87 - 222 MipZ PF09140.6 261 8.8e-13 40.7 0.4 1 1 1.9e-12 1.8e-10 33.1 0.4 3 131 5 112 3 133 0.81 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_91 - 284 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.00047 13.2 0.1 1 1 2.6e-05 0.0025 10.9 0.1 3 58 187 231 185 235 0.82 # 71314 # 72165 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_29 - 352 AAA_21 PF13304.1 303 0.00012 14.9 0.0 1 1 3.4e-06 0.00032 13.5 0.0 3 29 187 214 186 328 0.86 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_67 - 556 AAA PF00004.24 132 9.2e-07 22.0 0.0 1 1 4.5e-08 2.1e-06 20.8 0.0 1 120 132 280 132 286 0.73 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_29 - 352 AAA PF00004.24 132 5.4e-05 16.2 0.0 1 1 2.7e-06 0.00012 15.1 0.0 2 31 187 216 186 263 0.62 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_47 - 719 zf-C4_Topoisom PF01396.14 39 0.0012 11.3 1.5 1 1 2.7e-05 0.0025 10.2 1.5 4 33 636 658 634 664 0.79 # 37202 # 39358 # 1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 1_29 - 352 TIGR00382 TIGR00382 414 0.00043 11.8 0.0 1 1 6.3e-06 0.00059 11.4 0.0 116 140 182 206 112 209 0.83 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_91 - 284 rve_2 PF13333.1 52 1.7e-23 75.3 1.1 1 1 4.6e-25 4.3e-23 74.0 1.1 1 51 224 278 224 279 0.96 # 71314 # 72165 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_93 - 54 P22_Cro PF14549.1 60 0.00072 12.1 0.0 1 1 1e-05 0.00094 11.8 0.0 8 29 11 32 5 41 0.85 # 72850 # 73011 # -1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_67 - 556 AAA_16 PF13191.1 185 1.9e-07 24.0 1.9 1 1 1.1e-07 2.6e-06 20.4 0.1 19 84 124 197 92 266 0.67 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_31 - 173 AAA_16 PF13191.1 185 4.2e-06 19.7 0.1 1 1 3.2e-07 7.4e-06 18.9 0.1 23 45 24 46 11 131 0.82 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_35 - 518 AAA_16 PF13191.1 185 7.8e-06 18.8 0.1 1 1 8.3e-07 2e-05 17.5 0.1 8 49 227 264 226 390 0.83 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_29 - 352 AAA_16 PF13191.1 185 0.00017 14.4 0.0 1 1 1.2e-05 0.00028 13.7 0.0 24 51 183 210 155 235 0.79 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_67 - 556 AAA_22 PF13401.1 131 7.6e-31 99.8 0.3 1 1 1.5e-31 3.4e-30 97.7 0.0 3 131 128 275 124 275 0.93 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_31 - 173 AAA_22 PF13401.1 131 3.5e-07 23.3 0.0 1 1 2.9e-08 6.8e-07 22.3 0.0 3 37 24 66 21 163 0.69 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_35 - 518 AAA_22 PF13401.1 131 1.4e-05 18.1 0.0 1 1 1.4e-06 3.2e-05 16.9 0.0 4 28 239 263 235 335 0.82 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_29 - 352 AAA_22 PF13401.1 131 0.00014 14.8 0.0 1 1 3.2e-05 0.00075 12.5 0.0 6 30 185 209 177 251 0.80 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_31 - 173 AAA_29 PF13555.1 62 9e-07 21.2 0.0 1 1 5.8e-08 1.4e-06 20.7 0.0 6 40 8 42 3 55 0.73 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 AAA_29 PF13555.1 62 1.4e-06 20.6 0.0 1 1 1.4e-07 3.2e-06 19.5 0.0 25 51 185 211 174 216 0.86 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_35 - 518 AAA_29 PF13555.1 62 2.5e-05 16.6 0.0 1 1 2.3e-06 5.5e-05 15.5 0.0 19 40 236 256 226 262 0.82 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_67 - 556 AAA_29 PF13555.1 62 0.00015 14.1 0.0 1 1 1.4e-05 0.00033 13.0 0.0 11 40 119 146 110 154 0.73 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_87 - 222 SRP54 PF00448.17 196 3.8e-05 16.0 0.1 1 1 1.3e-06 0.00013 14.3 0.1 11 56 13 54 4 104 0.66 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_29 - 352 AAA_28 PF13521.1 163 2.2e-05 17.3 0.1 1 1 6.2e-07 5.8e-05 15.9 0.0 2 32 186 221 185 291 0.82 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_92 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 3.8e-10 33.3 0.3 1 2 1.1e-06 0.0001 15.9 0.0 2 57 39 88 38 92 0.82 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_92 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 3.8e-10 33.3 0.3 2 2 1.5e-06 0.00014 15.5 0.2 1 45 96 141 96 167 0.71 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_81 - 84 HTH_3 PF01381.17 55 0.0002 14.0 0.0 1 1 3.1e-06 0.00029 13.5 0.0 1 25 10 34 10 34 0.94 # 66304 # 66555 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_35 - 518 Rad17 PF03215.10 519 0.00084 10.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.0014 10.2 0.0 42 69 236 263 225 280 0.79 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_92 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 4e-13 41.5 0.6 1 2 9.6e-10 3e-08 26.0 0.0 5 49 9 54 6 55 0.89 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_92 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 4e-13 41.5 0.6 2 2 1.4e-05 0.00044 12.8 0.4 3 50 64 113 62 113 0.90 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_81 - 84 HTH_23 PF13384.1 50 0.00026 13.5 0.0 1 1 1.4e-05 0.00043 12.8 0.0 10 33 10 34 9 37 0.86 # 66304 # 66555 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_66 - 703 HTH_23 PF13384.1 50 0.00035 13.1 0.1 1 1 3.3e-05 0.001 11.6 0.1 23 46 108 131 103 137 0.84 # 52026 # 54134 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_87 - 222 Fer4_NifH PF00142.13 273 4.8e-06 18.7 0.1 1 1 9e-08 8.5e-06 17.9 0.1 8 41 11 44 6 74 0.92 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_81 - 84 HTH_19 PF12844.2 64 0.00032 13.6 0.2 1 1 3.4e-06 0.00032 13.6 0.2 2 29 8 35 7 75 0.81 # 66304 # 66555 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_29 - 352 NB-ARC PF00931.17 287 0.00025 12.7 0.0 1 1 1.2e-05 0.00058 11.5 0.0 11 40 175 204 165 213 0.84 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_31 - 173 NB-ARC PF00931.17 287 0.00038 12.1 0.0 1 1 1.3e-05 0.0006 11.5 0.0 4 50 13 56 10 66 0.74 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 Mg_chelatase PF01078.16 207 4.5e-06 18.8 0.0 1 1 2.5e-07 8e-06 17.9 0.0 9 53 171 214 166 244 0.81 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_67 - 556 Mg_chelatase PF01078.16 207 4.7e-05 15.4 0.0 1 2 9.3e-06 0.00029 12.8 0.0 20 65 127 172 111 197 0.85 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_67 - 556 Mg_chelatase PF01078.16 207 4.7e-05 15.4 0.0 2 2 0.093 2.9 -0.2 0.0 101 121 219 240 208 243 0.85 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_31 - 173 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00012 14.1 0.0 1 1 5.5e-06 0.00017 13.6 0.0 9 42 12 45 5 62 0.85 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_92 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 4.6e-13 42.2 0.3 1 2 2.1e-08 2e-06 20.8 0.0 16 76 26 81 11 88 0.82 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_92 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 4.6e-13 42.2 0.3 2 2 3.5e-09 3.3e-07 23.3 0.3 1 76 68 145 68 167 0.78 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_29 - 352 G-alpha PF00503.15 389 5.4e-07 21.4 0.0 1 1 3e-08 1.4e-06 20.0 0.0 44 124 169 260 147 344 0.78 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_67 - 556 G-alpha PF00503.15 389 0.00023 12.7 0.0 1 1 9.1e-06 0.00043 11.8 0.0 54 101 125 171 104 188 0.81 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_35 - 518 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00012 14.7 0.0 1 1 7.8e-06 0.00025 13.6 0.0 8 43 228 262 226 275 0.90 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_31 - 173 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00016 14.2 0.1 1 1 9.5e-06 0.0003 13.3 0.1 16 122 23 129 15 132 0.52 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_67 - 556 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00017 14.1 0.0 1 1 1.4e-05 0.00045 12.8 0.0 16 149 125 253 114 268 0.74 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_29 - 352 AAA_5 PF07728.9 139 0.00028 13.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.00049 12.7 0.0 1 31 185 215 185 280 0.90 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_31 - 173 AAA_5 PF07728.9 139 0.00049 12.7 0.0 1 1 2e-05 0.00092 11.8 0.0 1 19 27 45 27 50 0.90 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_31 - 173 ResIII PF04851.10 184 0.00011 14.9 0.1 1 1 2.7e-06 0.00013 14.7 0.1 11 45 17 45 4 132 0.80 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 ResIII PF04851.10 184 0.00032 13.4 0.0 1 1 1.3e-05 0.00062 12.4 0.0 22 49 174 206 140 223 0.76 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_30 - 653 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.7e-18 58.5 0.0 1 2 4.7e-07 1.5e-05 16.6 0.0 74 128 221 277 218 289 0.82 # 19117 # 21075 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 1_30 - 653 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.7e-18 58.5 0.0 2 2 3.8e-14 1.2e-12 39.9 0.0 164 369 341 554 292 563 0.85 # 19117 # 21075 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 1_31 - 173 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.1e-06 20.2 0.1 1 2 7.5e-07 2.3e-05 15.9 0.0 15 36 25 46 16 50 0.90 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_31 - 173 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.1e-06 20.2 0.1 2 2 0.011 0.35 2.1 0.0 30 49 111 130 110 136 0.89 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.0005 11.5 0.0 1 1 3.2e-05 0.001 10.5 0.0 15 36 183 204 176 218 0.85 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_87 - 222 TIGR01968 TIGR01968 261 2.9e-12 38.9 0.3 1 2 2.3e-09 2.1e-07 23.0 0.1 2 49 3 47 2 60 0.86 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_87 - 222 TIGR01968 TIGR01968 261 2.9e-12 38.9 0.3 2 2 1.1e-06 0.0001 14.2 0.0 100 143 68 111 62 132 0.93 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_31 - 173 AAA_18 PF13238.1 129 6.6e-07 22.5 0.0 1 1 4.3e-08 1e-06 21.9 0.0 1 82 28 133 28 157 0.64 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 AAA_18 PF13238.1 129 5.6e-06 19.5 0.0 1 1 4.6e-07 1.1e-05 18.6 0.0 2 56 187 243 187 278 0.71 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_35 - 518 AAA_18 PF13238.1 129 3.1e-05 17.1 0.0 1 1 5.5e-06 0.00013 15.1 0.0 1 29 242 274 242 367 0.90 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_87 - 222 AAA_18 PF13238.1 129 6e-05 16.2 0.0 1 1 4.4e-06 0.0001 15.4 0.0 8 79 13 86 12 110 0.66 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_92 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.00041 12.8 0.2 1 2 0.018 1.7 1.1 0.0 23 31 29 37 28 37 0.87 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_92 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.00041 12.8 0.2 2 2 7e-05 0.0066 8.9 0.1 10 26 73 89 72 89 0.85 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_31 - 173 DUF258 PF03193.11 161 1.6e-05 16.9 0.0 1 1 1.9e-07 1.8e-05 16.8 0.0 26 59 15 49 2 132 0.72 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_67 - 556 TniB PF05621.6 302 1.3e-05 16.9 0.0 1 1 2.2e-07 2.1e-05 16.2 0.0 54 194 122 274 104 294 0.78 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_31 - 173 DUF87 PF01935.12 229 9.9e-07 21.6 0.0 1 1 1.8e-08 1.7e-06 20.8 0.0 12 44 18 46 7 50 0.79 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_92 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 4e-25 80.3 0.3 1 2 5.8e-14 5.5e-12 38.4 0.0 1 50 10 60 10 61 0.93 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_92 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 4e-25 80.3 0.3 2 2 2.1e-14 2e-12 39.8 0.2 2 47 68 115 67 121 0.93 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_48 - 69 ATP-synt_8 PF00895.15 54 0.00061 12.8 0.1 1 1 7.5e-06 0.0007 12.7 0.1 9 33 4 29 2 52 0.83 # 39602 # 39808 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.353 1_31 - 173 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 1.5e-06 21.1 0.0 1 1 6.5e-08 3.1e-06 20.1 0.0 6 109 10 133 7 148 0.67 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00075 12.4 0.0 1 1 3.1e-05 0.0014 11.5 0.0 13 42 175 204 164 224 0.89 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_31 - 173 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.3e-05 17.2 0.1 1 1 8.5e-07 4e-05 16.4 0.1 2 38 28 63 27 157 0.65 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_58 - 234 MMR_HSR1 PF01926.18 116 5.1e-05 16.1 0.1 1 1 1.8e-06 8.5e-05 15.4 0.1 9 85 13 98 11 175 0.61 # 47262 # 47963 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 1_31 - 173 DEAD PF00270.24 169 0.00014 14.2 0.0 1 1 2.6e-06 0.00024 13.4 0.0 5 62 15 99 11 169 0.62 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_31 - 173 Miro PF08477.8 119 3.8e-05 17.0 0.0 1 1 1e-06 4.8e-05 16.7 0.0 1 25 27 51 27 130 0.86 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 Miro PF08477.8 119 0.00032 14.0 0.0 1 1 1.5e-05 0.00071 12.9 0.0 2 95 186 300 185 316 0.75 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_81 - 84 HTH_31 PF13560.1 64 7.5e-05 15.8 0.0 1 1 9.9e-07 9.3e-05 15.5 0.0 6 36 10 40 8 53 0.85 # 66304 # 66555 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_31 - 173 IIGP PF05049.8 376 0.00039 12.1 1.0 1 2 5.7e-06 0.00053 11.6 0.2 19 53 10 43 1 52 0.83 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_31 - 173 IIGP PF05049.8 376 0.00039 12.1 1.0 2 2 0.049 4.6 -1.3 0.0 195 225 46 75 43 115 0.72 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 T2SE PF00437.15 272 1.6e-65 213.4 0.0 1 1 1.1e-66 2e-65 213.1 0.0 5 266 29 327 26 333 0.95 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_35 - 518 T2SE PF00437.15 272 5e-39 126.6 0.0 1 1 4.1e-40 7.7e-39 126.0 0.0 66 271 171 390 154 391 0.87 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_31 - 173 T2SE PF00437.15 272 2.6e-07 22.6 0.1 1 1 2.6e-08 4.9e-07 21.7 0.1 115 149 12 46 2 53 0.77 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_67 - 556 T2SE PF00437.15 272 0.00024 12.8 0.0 1 1 2.3e-05 0.00044 12.0 0.0 123 155 124 156 77 187 0.76 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_24 - 786 T2SE PF00437.15 272 0.00059 11.6 0.0 1 1 8.6e-05 0.0016 10.1 0.0 124 155 421 450 403 461 0.79 # 12714 # 15071 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_67 - 556 NACHT PF05729.7 166 3.9e-06 19.4 0.0 1 1 2.4e-07 1.1e-05 17.9 0.0 3 142 132 282 130 290 0.80 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_31 - 173 NACHT PF05729.7 166 0.00022 13.7 0.1 1 1 1.2e-05 0.00056 12.4 0.0 3 20 28 45 26 54 0.90 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 AAA_17 PF13207.1 121 6.6e-07 23.0 0.0 1 1 6.1e-08 1.4e-06 21.9 0.0 3 38 187 235 185 306 0.66 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_35 - 518 AAA_17 PF13207.1 121 6.1e-06 19.9 0.0 1 1 5.9e-07 1.4e-05 18.8 0.0 1 35 241 281 241 375 0.66 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_87 - 222 AAA_17 PF13207.1 121 7.6e-06 19.6 0.0 1 1 9.3e-07 2.2e-05 18.1 0.0 9 101 13 111 12 128 0.60 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_31 - 173 AAA_17 PF13207.1 121 5.4e-05 16.8 0.2 1 1 3.6e-06 8.5e-05 16.2 0.2 2 34 28 61 27 128 0.68 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_31 - 173 TIGR02211 TIGR02211 221 2.1e-05 16.6 0.2 1 1 3.8e-07 3.6e-05 15.9 0.2 22 51 16 45 3 53 0.80 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_31 - 173 AAA_25 PF13481.1 194 2.9e-05 16.3 0.0 1 2 9e-07 8.5e-05 14.8 0.0 33 56 25 48 15 70 0.84 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_31 - 173 AAA_25 PF13481.1 194 2.9e-05 16.3 0.0 2 2 0.063 5.9 -1.0 0.0 178 185 122 129 90 163 0.54 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_31 - 173 AAA_15 PF13175.1 415 0.0002 13.2 0.1 1 1 2.2e-06 0.0002 13.2 0.1 25 43 23 53 2 127 0.72 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 Pox_A32 PF04665.7 241 3.6e-05 16.0 0.0 1 1 1.7e-06 7.8e-05 14.8 0.0 4 74 175 241 172 258 0.80 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_67 - 556 Pox_A32 PF04665.7 241 0.00059 12.0 0.0 1 1 2.1e-05 0.001 11.2 0.0 3 36 119 152 117 160 0.88 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_67 - 556 AAA_14 PF13173.1 128 2.4e-05 17.1 0.2 1 1 7.1e-06 0.00017 14.3 0.0 4 74 131 238 128 259 0.70 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_31 - 173 AAA_14 PF13173.1 128 2.9e-05 16.8 0.1 1 1 2.2e-06 5.1e-05 16.0 0.1 2 54 25 75 24 146 0.71 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_58 - 234 AAA_14 PF13173.1 128 0.00015 14.5 0.2 1 1 1.7e-05 0.0004 13.1 0.1 13 68 14 70 11 97 0.67 # 47262 # 47963 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 1_35 - 518 AAA_14 PF13173.1 128 0.00016 14.4 0.0 1 1 1.8e-05 0.00043 13.0 0.0 3 39 240 273 238 344 0.81 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_87 - 222 VirC1 PF07015.6 231 2.2e-08 26.2 0.0 1 1 4.8e-10 4.5e-08 25.2 0.0 5 55 6 56 3 61 0.93 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_92 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 5.8e-08 25.4 0.1 1 2 0.00077 0.073 5.9 0.0 58 81 31 54 20 57 0.87 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_92 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 5.8e-08 25.4 0.1 2 2 2e-07 1.9e-05 17.4 0.2 39 86 69 117 66 121 0.89 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_31 - 173 AAA_33 PF13671.1 143 2.7e-05 16.9 0.1 1 1 5.2e-06 0.00016 14.4 0.1 2 95 28 154 28 170 0.60 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_35 - 518 AAA_33 PF13671.1 143 0.00037 13.2 0.0 1 1 2.8e-05 0.00088 12.0 0.0 2 81 242 330 241 342 0.63 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_67 - 556 AAA_33 PF13671.1 143 0.00052 12.7 0.0 1 1 4.2e-05 0.0013 11.4 0.0 3 25 133 155 132 199 0.82 # 54131 # 55798 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 1_30 - 653 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 3.6e-88 288.9 0.0 1 1 5.7e-90 5.3e-88 288.3 0.0 20 456 127 591 102 601 0.88 # 19117 # 21075 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 1_31 - 173 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00067 12.7 0.0 1 1 1.2e-05 0.0011 11.9 0.0 1 23 28 51 28 122 0.65 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00045 12.6 0.0 1 1 9.6e-06 0.0009 11.6 0.0 1 25 188 212 188 219 0.85 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_91 - 284 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 5.2e-12 38.7 0.0 1 1 9.9e-14 9.3e-12 37.9 0.0 2 137 123 261 122 264 0.92 # 71314 # 72165 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_31 - 173 DAP3 PF10236.4 309 0.00071 11.3 0.0 1 1 1.2e-05 0.0011 10.7 0.0 20 44 22 46 3 48 0.75 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 PduV-EutP PF10662.4 143 1.8e-05 17.1 0.0 1 2 0.00041 0.039 6.3 0.0 103 135 12 44 6 48 0.87 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_29 - 352 PduV-EutP PF10662.4 143 1.8e-05 17.1 0.0 2 2 0.00013 0.012 7.9 0.0 5 22 187 204 184 212 0.90 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_47 - 719 Toprim_Crpt PF13342.1 62 1.3e-21 68.9 2.5 1 1 1.4e-23 1.3e-21 68.9 2.5 1 60 653 712 653 714 0.92 # 37202 # 39358 # 1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 1_24 - 786 AAA_10 PF12846.2 304 9.1e-23 73.9 0.0 1 1 1.6e-23 3.7e-22 71.9 0.0 2 291 424 698 423 709 0.78 # 12714 # 15071 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_31 - 173 AAA_10 PF12846.2 304 6.7e-07 21.8 0.0 1 2 1.5e-05 0.00035 12.8 0.0 3 22 27 46 25 56 0.84 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_31 - 173 AAA_10 PF12846.2 304 6.7e-07 21.8 0.0 2 2 0.00087 0.02 7.0 0.0 234 260 105 131 100 157 0.79 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_29 - 352 AAA_10 PF12846.2 304 0.00013 14.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.00025 13.3 0.0 3 34 185 216 183 224 0.81 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_35 - 518 AAA_10 PF12846.2 304 0.0009 11.5 0.1 1 1 7.4e-05 0.0017 10.6 0.1 4 26 242 264 239 269 0.85 # 25140 # 26693 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.479 1_91 - 284 HTH_20 PF12840.2 61 0.00012 14.8 0.0 1 1 2.4e-06 0.00022 13.9 0.0 27 50 13 36 1 41 0.80 # 71314 # 72165 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_87 - 222 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.3e-06 20.5 0.0 1 1 2.2e-08 2e-06 19.8 0.0 4 39 6 41 3 55 0.88 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_87 - 222 AAA_31 PF13614.1 157 2.2e-07 23.7 0.1 1 2 1.7e-06 0.00016 14.4 0.0 3 41 5 43 3 57 0.87 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_87 - 222 AAA_31 PF13614.1 157 2.2e-07 23.7 0.1 2 2 0.00027 0.025 7.3 0.0 106 151 68 112 63 115 0.90 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_29 - 352 IstB_IS21 PF01695.12 178 2.6e-05 16.5 0.0 1 1 1e-06 4.9e-05 15.6 0.0 44 68 180 204 155 238 0.91 # 18046 # 19101 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_31 - 173 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00062 12.0 0.0 1 1 2e-05 0.00095 11.4 0.0 39 65 17 43 3 63 0.76 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_92 - 174 BrkDBD PF09607.5 58 0.00077 11.9 0.0 1 1 3.6e-05 0.0034 9.8 0.0 11 47 11 44 2 51 0.80 # 72162 # 72683 # -1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.460 1_91 - 284 HTH_21 PF13276.1 60 4e-17 54.9 4.2 1 2 4.2e-19 4e-17 54.9 4.2 6 60 43 96 38 97 0.90 # 71314 # 72165 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_91 - 284 HTH_21 PF13276.1 60 4e-17 54.9 4.2 2 2 0.041 3.8 0.5 0.1 44 56 199 211 185 215 0.73 # 71314 # 72165 # -1 # ID=1_91;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_87 - 222 GTP_EFTU PF00009.22 188 7.3e-08 24.9 0.0 1 1 2.4e-09 1.2e-07 24.2 0.0 15 116 15 124 10 200 0.78 # 69262 # 69927 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.443 1_31 - 173 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.00045 12.5 0.1 1 1 3.1e-05 0.0015 10.8 0.0 5 28 27 50 23 57 0.86 # 21122 # 21640 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/1a4a95f4-1134-43a4-916e-8d3e914fcf58 # Target file: checkm_output/bins/pm2082/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm2082/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/1a4a95f4-1134-43a4-916e-8d3e914fcf58 checkm_output/bins/pm2082/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:59:41 2017 # [ok]