# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_8 - 564 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0016 12.3 0.0 1 1 9.7e-06 0.003 11.5 0.0 105 138 471 502 451 516 0.71 # 6109 # 7800 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_7 - 695 KaiC PF06745.8 227 5.8e-05 16.7 0.0 1 2 1.4e-05 0.0021 11.6 0.0 22 78 201 259 199 342 0.79 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_7 - 695 KaiC PF06745.8 227 5.8e-05 16.7 0.0 2 2 0.0078 1.2 2.6 0.0 48 105 357 414 348 425 0.85 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_84 - 483 KaiC PF06745.8 227 8.5e-05 16.2 0.3 1 1 9.9e-07 0.00015 15.4 0.0 18 172 126 281 117 306 0.82 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 5_2 - 373 TrkA_N PF02254.13 116 0.00065 14.2 0.0 1 1 3.3e-06 0.001 13.6 0.0 1 42 190 233 190 245 0.82 # 218 # 1336 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 2_26 - 156 MADF_DNA_bdg PF10545.4 85 0.00056 14.6 0.0 1 1 4.4e-06 0.0013 13.4 0.0 31 65 27 62 23 86 0.80 # 23434 # 23901 # 1 # ID=2_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 1_101 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 1e-05 19.0 0.2 1 3 0.0041 1.2 2.3 0.2 187 223 95 129 86 132 0.74 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 1e-05 19.0 0.2 2 3 2.9e-06 0.00088 12.7 0.0 130 231 217 309 200 339 0.79 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 1e-05 19.0 0.2 3 3 0.022 6.6 -0.0 0.0 139 160 345 366 314 376 0.63 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_5 - 208 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00048 14.2 0.1 1 1 3.1e-06 0.00093 13.3 0.1 7 48 8 48 7 51 0.91 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_80 - 609 ABC_tran PF00005.22 137 7.7e-05 17.5 0.1 1 1 1.6e-06 0.00025 15.8 0.0 11 50 24 61 15 160 0.83 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_84 - 483 ABC_tran PF00005.22 137 0.00042 15.1 0.0 1 1 7.8e-06 0.0012 13.6 0.0 10 32 126 148 123 162 0.86 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_20 - 330 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0024 11.0 0.0 1 2 0.052 16 -1.6 0.0 262 305 102 149 89 175 0.69 # 17253 # 18242 # 1 # ID=2_20;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 2_20 - 330 CP_ATPgrasp_1 PF04174.8 330 0.0024 11.0 0.0 2 2 2.5e-05 0.0076 9.3 0.0 78 105 253 280 246 306 0.84 # 17253 # 18242 # 1 # ID=2_20;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 5_2 - 373 ADH_N PF08240.7 109 7.4e-29 94.2 1.6 1 2 2.4e-31 7.4e-29 94.2 1.6 2 108 28 154 27 155 0.88 # 218 # 1336 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 5_2 - 373 ADH_N PF08240.7 109 7.4e-29 94.2 1.6 2 2 0.087 27 -0.9 0.1 47 61 179 192 160 201 0.72 # 218 # 1336 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 3_19 - 254 N6_Mtase PF02384.11 311 1.3e-08 28.7 0.0 1 2 1.3e-05 0.0014 12.2 0.0 55 136 109 176 79 179 0.58 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_19 - 254 N6_Mtase PF02384.11 311 1.3e-08 28.7 0.0 2 2 6.1e-06 0.00063 13.3 0.0 161 200 179 219 176 247 0.76 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_8 - 564 N6_Mtase PF02384.11 311 7.6e-06 19.6 0.0 1 1 1.3e-07 1.4e-05 18.8 0.0 89 138 445 492 427 504 0.87 # 6109 # 7800 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 3_53 - 164 N6_Mtase PF02384.11 311 0.0026 11.3 0.0 1 1 3.2e-05 0.0032 11.0 0.0 37 78 14 59 5 84 0.72 # 45818 # 46309 # 1 # ID=3_53;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 5_2 - 373 ThiF PF00899.16 136 0.0019 12.5 1.2 1 1 1.5e-05 0.0047 11.3 0.4 4 34 189 219 186 222 0.94 # 218 # 1336 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_104 - 71 DUF2116 PF09889.4 59 0.005 11.1 5.7 1 1 0.00073 0.22 5.9 5.7 6 35 14 54 12 60 0.75 # 97123 # 97335 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 3_63 - 284 rve_3 PF13683.1 67 1.3e-17 57.6 0.0 1 1 3e-19 4.6e-17 55.9 0.0 1 67 205 271 205 271 0.98 # 50448 # 51299 # 1 # ID=3_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_38 - 468 rve_3 PF13683.1 67 4.9e-05 17.3 0.4 1 1 8.9e-07 0.00014 15.9 0.1 11 56 247 295 237 295 0.86 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_55 - 353 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00038 14.4 0.0 1 1 7.9e-06 0.0024 11.8 0.0 20 120 94 189 78 223 0.65 # 49634 # 50692 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 1_7 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3.8e-07 24.2 0.0 1 2 5.4e-07 0.00017 15.6 0.0 22 80 181 236 170 243 0.86 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_7 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3.8e-07 24.2 0.0 2 2 0.00047 0.14 6.0 0.0 169 204 510 542 500 543 0.81 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_19 - 254 N6-adenineMlase PF10237.4 162 2.2e-05 18.6 0.0 1 1 1.1e-07 3.5e-05 18.0 0.0 84 133 163 214 133 225 0.77 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_6 - 388 HTH_38 PF13936.1 44 0.00018 15.5 0.1 1 1 1.3e-06 0.00039 14.4 0.1 17 42 178 204 171 204 0.86 # 4698 # 5861 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 5_2 - 373 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 0.00062 13.4 0.1 1 1 3.4e-06 0.001 12.7 0.1 35 73 186 225 175 241 0.81 # 218 # 1336 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_101 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 1.8e-06 21.7 3.8 1 2 5.9e-09 1.8e-06 21.7 3.8 1 41 100 139 100 159 0.83 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 1.8e-06 21.7 3.8 2 2 0.01 3.1 1.2 0.0 84 120 305 341 261 364 0.71 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_84 - 483 MobB PF03205.9 140 0.00023 15.4 0.0 1 1 2.7e-06 0.00042 14.5 0.0 3 22 130 149 128 161 0.90 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_80 - 609 MobB PF03205.9 140 0.0024 12.1 0.0 1 1 7.7e-05 0.012 9.8 0.0 4 28 28 52 25 59 0.84 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 2_8 - 680 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.1e-39 128.0 0.2 1 1 7e-40 1.1e-37 124.5 0.2 2 307 6 260 5 266 0.90 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_59 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.3e-30 101.2 2.8 1 3 1.1e-16 1.6e-14 48.4 0.0 2 105 5 91 4 95 0.92 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.3e-30 101.2 2.8 2 3 1.1e-17 1.7e-15 51.6 0.3 208 314 145 248 107 249 0.86 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.3e-30 101.2 2.8 3 3 0.072 11 -0.4 0.0 91 128 412 455 373 525 0.73 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_5 - 208 HTH_34 PF13601.1 80 3.9e-08 27.8 0.4 1 2 4.2e-08 1.3e-05 19.7 0.0 2 49 6 53 5 60 0.91 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 4_5 - 208 HTH_34 PF13601.1 80 3.9e-08 27.8 0.4 2 2 0.00072 0.22 6.1 0.1 59 74 191 206 184 207 0.90 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 4_5 - 208 MarR PF01047.17 59 0.00052 14.2 0.1 1 1 8.2e-06 0.0025 12.0 0.1 6 48 7 49 4 52 0.88 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_101 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 4.4e-18 60.5 0.1 1 3 1.5e-06 0.00045 14.8 0.0 164 199 95 130 48 134 0.85 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 4.4e-18 60.5 0.1 2 3 5.8e-09 1.8e-06 22.6 0.0 115 201 219 304 174 306 0.81 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 4.4e-18 60.5 0.1 3 3 5.6e-08 1.7e-05 19.4 0.0 89 147 317 372 309 431 0.82 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 1.2e-05 20.0 1.2 1 2 1.9e-05 0.0057 11.4 0.2 9 38 100 129 96 164 0.90 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 1.2e-05 20.0 1.2 2 2 0.00049 0.15 6.9 0.1 8 45 271 314 264 382 0.66 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_7 - 695 DUF853 PF05872.7 504 8.7e-05 15.4 0.0 1 1 6.2e-07 0.00019 14.3 0.0 10 60 187 237 179 245 0.87 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 4_2 - 223 TetR_N PF00440.18 47 4.8e-18 59.1 0.0 1 1 7.8e-20 8e-18 58.4 0.0 2 47 44 89 43 89 0.96 # 507 # 1175 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 4_4 - 208 TetR_N PF00440.18 47 1e-17 58.0 0.0 1 2 2.6e-18 2.6e-16 53.5 0.0 2 47 10 55 9 55 0.97 # 2575 # 3198 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 4_4 - 208 TetR_N PF00440.18 47 1e-17 58.0 0.0 2 2 0.024 2.4 2.4 0.0 1 15 169 183 169 185 0.86 # 2575 # 3198 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_41 - 86 TetR_N PF00440.18 47 0.0017 12.5 0.0 1 1 3.1e-05 0.0032 11.6 0.0 2 26 33 57 32 57 0.93 # 37100 # 37357 # -1 # ID=2_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 2_8 - 680 AAA_19 PF13245.1 76 1.3e-10 35.4 0.1 1 1 2.7e-12 2.8e-10 34.4 0.1 14 75 21 86 11 87 0.87 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_59 - 595 AAA_19 PF13245.1 76 4.5e-09 30.5 0.0 1 1 6.1e-10 6.2e-08 26.8 0.0 3 75 12 86 10 87 0.84 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_77 - 418 AAA_19 PF13245.1 76 0.0011 13.2 0.0 1 1 2.7e-05 0.0028 11.9 0.0 20 48 125 152 123 182 0.82 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_77 - 418 CbiA PF01656.18 195 2.3e-22 73.8 0.0 1 1 1.1e-24 3.3e-22 73.3 0.0 1 178 117 348 117 365 0.73 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 5_3 - 92 MEDS PF14417.1 191 0.0018 11.9 0.0 1 1 7.2e-06 0.0022 11.5 0.0 40 75 25 60 13 69 0.86 # 1382 # 1657 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_86 - 281 Phage_rep_org_N PF09681.5 121 0.0011 13.0 0.1 1 2 0.0021 0.65 4.1 0.0 67 98 43 74 37 81 0.87 # 87410 # 88252 # -1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_86 - 281 Phage_rep_org_N PF09681.5 121 0.0011 13.0 0.1 2 2 0.0004 0.12 6.4 0.1 56 86 222 252 218 275 0.87 # 87410 # 88252 # -1 # ID=1_86;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 3_21 - 175 Pox_D5 PF03288.11 86 0.0021 12.8 0.6 1 1 1e-05 0.0031 12.3 0.1 34 67 38 79 35 99 0.87 # 21959 # 22483 # 1 # ID=3_21;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.448 3_5 - 278 MethyltransfD12 PF02086.10 260 2.2e-47 156.2 0.0 1 1 8e-50 2.4e-47 156.0 0.0 1 256 13 255 13 259 0.91 # 3516 # 4349 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.447 2_76 - 335 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00044 14.2 0.0 1 1 1e-05 0.001 13.0 0.0 28 51 175 198 173 200 0.94 # 74100 # 75104 # -1 # ID=2_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.376 1_81 - 100 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0011 12.9 0.0 1 1 1.8e-05 0.0019 12.2 0.0 22 42 21 41 3 45 0.84 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 1_38 - 468 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0046 10.9 1.5 1 2 0.00071 0.072 7.1 0.1 28 51 29 52 27 54 0.85 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_38 - 468 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0046 10.9 1.5 2 2 0.044 4.5 1.4 0.0 9 38 330 359 323 359 0.87 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_92 - 292 Rep_3 PF01051.16 222 1.6e-27 91.0 1.1 1 1 1.5e-29 2.4e-27 90.5 1.1 2 220 22 276 21 280 0.83 # 90953 # 91828 # -1 # ID=2_92;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.426 3_14 - 363 Rep_3 PF01051.16 222 1e-15 52.4 1.8 1 1 1.1e-17 1.6e-15 51.7 1.8 6 219 32 285 27 288 0.82 # 13366 # 14454 # 1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.449 3_63 - 284 rve PF00665.21 120 7.1e-30 98.1 0.0 1 1 1.4e-31 1.1e-29 97.5 0.0 2 120 118 234 117 234 0.97 # 50448 # 51299 # 1 # ID=3_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 10_1 - 235 rve PF00665.21 120 1e-12 42.7 0.1 1 2 0.059 4.5 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 10_1 - 235 rve PF00665.21 120 1e-12 42.7 0.1 2 2 2.4e-13 1.9e-11 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_38 - 468 rve PF00665.21 120 1.8e-10 35.4 0.0 1 1 5.2e-12 4e-10 34.4 0.0 4 119 142 265 139 266 0.87 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_85 - 708 rve PF00665.21 120 1.2e-09 32.8 0.0 1 1 9.1e-11 7e-09 30.3 0.0 5 119 289 427 285 428 0.82 # 85300 # 87423 # -1 # ID=1_85;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_77 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0023 11.8 0.2 1 2 0.00059 0.18 5.6 0.1 6 41 119 157 115 170 0.78 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_77 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0023 11.8 0.2 2 2 0.002 0.61 3.8 0.0 115 149 257 291 233 297 0.83 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_80 - 609 AAA_23 PF13476.1 202 1.4e-12 42.8 1.3 1 1 1e-14 3.1e-12 41.7 1.3 1 179 5 252 5 278 0.51 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_19 - 254 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3e-13 44.4 0.1 1 1 8.2e-15 1.2e-12 42.3 0.0 1 115 101 201 101 207 0.81 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_8 - 564 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.3e-08 29.3 0.0 1 1 1.9e-10 2.9e-08 28.3 0.0 3 116 422 516 416 517 0.80 # 6109 # 7800 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_84 - 483 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0018 11.9 0.0 1 2 3.1e-05 0.0095 9.5 0.0 18 60 129 167 122 195 0.81 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_84 - 483 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0018 11.9 0.0 2 2 0.042 13 -0.7 0.0 157 197 424 466 412 469 0.79 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 4_6 - 129 ACT_7 PF13840.1 65 0.00021 15.3 0.1 1 1 2e-06 0.00062 13.8 0.0 9 60 65 120 57 123 0.74 # 3870 # 4256 # -1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 2_59 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 0.00011 16.3 0.3 1 2 4.4e-05 0.0045 11.1 0.0 4 66 6 66 4 90 0.72 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 0.00011 16.3 0.3 2 2 0.027 2.7 2.0 0.0 91 132 187 227 162 261 0.83 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_8 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.00092 13.3 0.0 1 2 0.00027 0.027 8.5 0.0 7 42 10 42 4 80 0.71 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_8 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.00092 13.3 0.0 2 2 0.02 2.1 2.3 0.0 97 133 213 248 196 300 0.84 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_84 - 483 AAA_30 PF13604.1 196 0.0021 12.1 0.0 1 1 4.2e-05 0.0042 11.1 0.0 16 44 125 153 121 304 0.72 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_20 - 330 ATPgrasp_Ter PF15632.1 330 1e-122 403.4 0.0 1 1 3.8e-125 1.2e-122 403.3 0.0 19 329 4 321 1 322 0.98 # 17253 # 18242 # 1 # ID=2_20;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 1_37 - 106 RNA_POL_M_15KD PF02150.11 35 0.0015 12.7 1.3 1 2 0.00012 0.036 8.3 0.1 23 35 13 25 6 25 0.90 # 39023 # 39340 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.453 1_37 - 106 RNA_POL_M_15KD PF02150.11 35 0.0015 12.7 1.3 2 2 0.0049 1.5 3.1 0.1 22 30 38 46 30 50 0.75 # 39023 # 39340 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.453 1_80 - 609 SMC_N PF02463.14 220 8.1e-08 26.2 0.1 1 1 5.2e-10 1.6e-07 25.2 0.1 2 49 3 49 2 63 0.86 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 3_62 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 7e-07 23.7 0.2 1 2 1.8e-07 2.7e-05 18.6 0.0 5 49 4 49 1 63 0.87 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 3_62 - 174 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 7e-07 23.7 0.2 2 2 0.015 2.3 2.8 0.1 9 52 65 113 62 137 0.70 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 10_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00076 13.9 0.3 1 1 1.1e-05 0.0016 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 3_40 - 795 TIGR02432 TIGR02432 189 0.00069 13.7 0.0 1 1 4.4e-06 0.0013 12.8 0.0 2 41 77 116 76 148 0.70 # 35964 # 38348 # 1 # ID=3_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 1_7 - 695 TraG-D_C PF12696.2 128 2.2e-11 38.2 0.0 1 1 1.5e-13 4.4e-11 37.2 0.0 2 112 505 617 504 631 0.82 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 10_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.0021 12.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.0064 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_77 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.4e-11 38.4 0.1 1 2 1.4e-08 4.3e-06 20.4 0.1 2 39 116 156 115 170 0.78 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_77 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.4e-11 38.4 0.1 2 2 5.4e-07 0.00016 15.2 0.0 77 126 236 287 213 297 0.75 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_19 - 254 UPF0020 PF01170.13 180 0.00014 16.0 0.0 1 1 1.8e-06 0.00056 14.0 0.0 15 126 87 185 76 221 0.72 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_65 - 371 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 5.7e-31 102.2 0.0 1 1 4.8e-33 7.3e-31 101.8 0.0 2 213 107 348 106 348 0.96 # 51750 # 52862 # -1 # ID=3_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.519 9_1 - 348 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.8e-27 90.8 0.0 1 1 1.7e-29 2.6e-27 90.2 0.0 4 210 59 296 56 299 0.93 # 1 # 1044 # 1 # ID=9_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.454 4_6 - 129 ACT PF01842.20 66 2.9e-07 24.4 0.2 1 2 0.011 3.2 1.9 0.0 6 26 7 27 3 47 0.85 # 3870 # 4256 # -1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 4_6 - 129 ACT PF01842.20 66 2.9e-07 24.4 0.2 2 2 1.6e-08 4.9e-06 20.5 0.0 9 29 78 98 74 115 0.91 # 3870 # 4256 # -1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_58 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.09 6.8 32.9 1 5 0.063 19 -0.7 6.4 35 50 141 156 119 200 0.62 # 53927 # 55132 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_58 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.09 6.8 32.9 2 5 0.018 5.6 1.1 0.5 18 47 208 237 202 239 0.70 # 53927 # 55132 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_58 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.09 6.8 32.9 3 5 3e-05 0.0091 10.0 1.0 19 57 244 282 236 290 0.86 # 53927 # 55132 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_58 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.09 6.8 32.9 4 5 0.002 0.62 4.1 0.1 21 49 302 330 296 338 0.76 # 53927 # 55132 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 1_58 - 402 DivIC PF04977.10 80 0.09 6.8 32.9 5 5 0.00036 0.11 6.5 1.0 23 49 339 365 333 374 0.89 # 53927 # 55132 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.473 3_63 - 284 DDE_Tnp_1_2 PF13586.1 88 0.0015 13.2 0.1 1 1 2.6e-05 0.0081 10.9 0.1 3 58 187 231 185 235 0.82 # 50448 # 51299 # 1 # ID=3_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 2_59 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 2.1e-08 28.3 0.1 1 3 0.00079 0.24 5.2 0.0 98 153 33 84 13 94 0.78 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 2.1e-08 28.3 0.1 2 3 0.0026 0.8 3.5 0.0 5 52 240 287 237 400 0.74 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 2.1e-08 28.3 0.1 3 3 5.1e-07 0.00016 15.6 0.0 136 196 497 563 409 567 0.81 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_80 - 609 AAA_21 PF13304.1 303 8.5e-17 56.5 0.0 1 2 3.1e-08 9.4e-06 20.2 0.0 1 37 26 73 26 135 0.69 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_80 - 609 AAA_21 PF13304.1 303 8.5e-17 56.5 0.0 2 2 1.6e-12 4.8e-10 34.3 0.0 219 300 269 374 182 376 0.73 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_81 - 100 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00017 15.4 0.0 1 1 1.7e-06 0.00026 14.8 0.0 1 36 6 41 6 48 0.82 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 1_38 - 468 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00062 13.6 0.7 1 2 0.0011 0.17 5.8 0.4 12 43 19 50 15 53 0.88 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_38 - 468 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00062 13.6 0.7 2 2 0.0019 0.28 5.1 0.0 11 44 82 120 74 121 0.78 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_76 - 335 Phage_CI_repr PF07022.8 66 2.1e-06 22.2 0.0 1 1 1.4e-08 4.4e-06 21.2 0.0 7 50 168 244 164 256 0.92 # 74100 # 75104 # -1 # ID=2_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.376 1_101 - 562 Thi4 PF01946.12 230 0.00082 13.0 0.4 1 1 6.3e-06 0.0019 11.7 0.4 19 70 100 150 95 158 0.88 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_10 - 152 Ribosomal_L28 PF00830.14 61 0.0013 13.1 0.7 1 1 9.1e-06 0.0028 12.0 0.3 35 58 114 135 111 138 0.82 # 8022 # 8477 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.410 1_84 - 483 AAA PF00004.24 132 1.2e-05 20.0 0.1 1 1 4.3e-07 6.6e-05 17.6 0.1 3 111 132 269 130 288 0.58 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_55 - 353 AAA PF00004.24 132 0.00066 14.4 0.0 1 1 9.4e-06 0.0014 13.3 0.0 1 74 99 178 99 237 0.73 # 49634 # 50692 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 3_72 - 395 KorB PF08535.5 93 3.9e-05 18.3 0.3 1 1 8.3e-07 0.00025 15.7 0.1 5 48 170 213 166 252 0.76 # 57522 # 58706 # 1 # ID=3_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_81 - 100 HTH_37 PF13744.1 80 7.1e-06 20.3 0.0 1 1 2.7e-08 8.3e-06 20.1 0.0 23 75 17 68 3 73 0.83 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 2_8 - 680 Herpes_ori_bp PF02399.10 824 0.0011 11.4 0.0 1 1 7.3e-06 0.0022 10.4 0.0 52 109 20 83 9 102 0.80 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 4_5 - 208 HTH_27 PF13463.1 68 0.00016 16.5 0.3 1 1 6.8e-06 0.00069 14.4 0.0 8 48 9 48 5 61 0.85 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_40 - 107 HTH_27 PF13463.1 68 0.00025 15.8 0.0 1 1 3.3e-06 0.00034 15.4 0.0 21 66 31 73 14 74 0.88 # 41759 # 42079 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 2_26 - 156 HTH_27 PF13463.1 68 0.0011 13.8 0.3 1 1 0.00011 0.011 10.6 0.0 1 44 3 48 3 49 0.87 # 23434 # 23901 # 1 # ID=2_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 3_34 - 417 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 5.5e-22 72.8 0.0 1 1 2.7e-24 8.3e-22 72.2 0.0 1 227 128 389 128 393 0.81 # 31520 # 32770 # 1 # ID=3_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 3_63 - 284 rve_2 PF13333.1 52 5.6e-23 75.3 1.1 1 1 4.6e-25 1.4e-22 74.0 1.1 1 51 224 278 224 279 0.96 # 50448 # 51299 # 1 # ID=3_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 2_71 - 346 Hydantoinase_A PF01968.13 290 7e-08 26.3 0.8 1 2 1.2e-06 0.00036 14.2 0.2 72 101 186 214 177 222 0.82 # 69957 # 70994 # -1 # ID=2_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 2_71 - 346 Hydantoinase_A PF01968.13 290 7e-08 26.3 0.8 2 2 1.4e-05 0.0043 10.6 0.0 195 275 258 332 231 344 0.78 # 69957 # 70994 # -1 # ID=2_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 1_97 - 152 MerR_1 PF13411.1 69 1.1e-19 64.5 0.0 1 1 1.3e-21 1.9e-19 63.7 0.0 2 67 9 75 8 77 0.96 # 93081 # 93536 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_102 - 122 MerR_1 PF13411.1 69 1.6e-12 41.6 0.0 1 1 1.5e-14 2.3e-12 41.1 0.0 1 68 4 72 4 73 0.97 # 96459 # 96824 # 1 # ID=1_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 1_81 - 100 HTH_25 PF13413.1 62 0.00085 13.5 0.0 1 1 4.5e-06 0.0014 12.8 0.0 6 33 21 48 16 52 0.91 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 1_84 - 483 cobW PF02492.14 178 0.0015 12.4 0.0 1 1 9e-06 0.0027 11.6 0.0 3 21 130 148 128 158 0.87 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_84 - 483 AAA_16 PF13191.1 185 1.7e-07 25.9 0.0 1 1 2.7e-09 8.4e-07 23.6 0.0 23 175 126 257 119 266 0.62 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_4 - 394 Mt_ATP-synt_B PF05405.9 163 0.0015 12.5 0.0 1 1 9.5e-06 0.0029 11.5 0.0 105 146 248 289 234 299 0.84 # 2572 # 3753 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.477 2_20 - 330 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00028 15.3 0.0 1 2 0.031 9.4 0.5 0.0 110 146 53 92 16 97 0.75 # 17253 # 18242 # 1 # ID=2_20;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 2_20 - 330 ATP-grasp_3 PF02655.9 161 0.00028 15.3 0.0 2 2 7.2e-06 0.0022 12.3 0.0 2 87 92 209 91 216 0.84 # 17253 # 18242 # 1 # ID=2_20;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 1_84 - 483 AAA_22 PF13401.1 131 2.2e-23 77.3 0.0 1 1 9.2e-25 9.4e-23 75.3 0.0 4 129 127 273 123 275 0.85 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_8 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 3.7e-05 18.4 0.2 1 2 0.00019 0.02 9.6 0.0 4 65 17 75 13 106 0.77 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_8 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 3.7e-05 18.4 0.2 2 2 0.002 0.21 6.2 0.0 41 108 152 232 112 246 0.62 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_7 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00051 14.7 0.1 1 2 0.00011 0.012 10.3 0.1 5 24 199 218 198 295 0.71 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_7 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00051 14.7 0.1 2 2 0.065 6.6 1.4 0.0 89 121 505 534 458 544 0.72 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 4_1 - 139 HTH_AraC PF00165.18 42 3.2e-21 69.1 2.3 1 2 2.6e-12 8e-10 32.8 0.0 1 42 37 78 37 78 0.97 # 78 # 494 # -1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 4_1 - 139 HTH_AraC PF00165.18 42 3.2e-21 69.1 2.3 2 2 3.6e-13 1.1e-10 35.6 1.1 2 42 90 128 89 128 0.95 # 78 # 494 # -1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 2_59 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 1.2e-54 179.8 1.3 1 2 2.2e-33 3.4e-31 102.3 0.4 5 404 7 377 4 381 0.83 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 TIGR01074 TIGR01074 668 1.2e-54 179.8 1.3 2 2 5.8e-25 8.8e-23 74.5 0.0 498 610 451 563 413 575 0.77 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_8 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 3.7e-51 168.3 0.0 1 2 2.5e-38 3.9e-36 118.6 0.0 2 304 5 308 4 404 0.84 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_8 - 680 TIGR01074 TIGR01074 668 3.7e-51 168.3 0.0 2 2 9e-17 1.4e-14 47.4 0.0 533 610 517 607 502 613 0.80 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 3_8 - 564 Methyltransf_27 PF13708.1 194 1.1e-56 185.9 0.1 1 1 1.5e-58 2.3e-56 184.9 0.0 2 194 93 296 92 296 0.95 # 6109 # 7800 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_59 - 273 Methyltransf_27 PF13708.1 194 5.4e-47 154.3 0.0 1 1 4.3e-49 6.5e-47 154.0 0.0 3 194 72 266 70 266 0.95 # 55129 # 55947 # -1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 1_19 - 180 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0012 13.2 0.0 1 2 3.4e-05 0.01 10.2 0.0 18 30 22 34 21 37 0.89 # 23521 # 24060 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_19 - 180 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0012 13.2 0.0 2 2 0.086 26 -0.6 0.0 6 17 41 52 40 55 0.86 # 23521 # 24060 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_80 - 609 AAA_29 PF13555.1 62 4.5e-06 20.6 0.0 1 1 6.1e-08 9.4e-06 19.6 0.0 1 46 3 47 3 59 0.87 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_84 - 483 AAA_29 PF13555.1 62 0.00052 14.0 0.1 1 1 8.2e-06 0.0013 12.8 0.1 21 40 125 144 118 148 0.83 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_101 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 2.9e-19 63.8 5.4 1 2 1.2e-06 0.00038 15.4 1.5 2 31 101 130 100 132 0.95 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 2.9e-19 63.8 5.4 2 2 3.2e-17 9.7e-15 49.3 0.1 1 72 272 342 272 351 0.91 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_9 - 42 HTH_1 PF00126.22 60 8e-15 48.9 0.1 1 1 2.8e-17 8.5e-15 48.8 0.1 1 38 3 40 3 41 0.96 # 6449 # 6574 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 1_38 - 468 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 1.6e-06 22.9 0.2 1 1 2.2e-08 6.6e-06 20.9 0.2 14 61 16 63 9 78 0.87 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_101 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 1.3e-08 28.1 5.0 1 2 4.3e-07 0.00013 15.0 2.8 2 33 100 131 99 139 0.91 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 1.3e-08 28.1 5.0 2 2 1.7e-06 0.00052 13.0 0.0 83 163 286 362 281 379 0.85 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_62 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 1.2e-09 33.3 0.3 1 2 3.2e-06 0.00033 15.9 0.0 2 57 39 88 38 92 0.82 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 3_62 - 174 HTH_32 PF13565.1 77 1.2e-09 33.3 0.3 2 2 4.6e-06 0.00047 15.5 0.2 1 45 96 141 96 167 0.71 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 1_38 - 468 HTH_32 PF13565.1 77 1.3e-09 33.2 0.6 1 1 1.4e-10 1.4e-08 30.0 0.0 3 77 45 117 43 117 0.82 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 10_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 4e-06 22.1 0.2 1 1 1.7e-07 1.7e-05 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_59 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 5.5e-17 55.2 7.9 1 4 6.8e-07 0.0001 14.6 0.0 12 67 19 71 11 80 0.87 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 5.5e-17 55.2 7.9 2 4 4.7e-10 7.2e-08 25.1 0.0 376 457 194 275 190 285 0.83 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 5.5e-17 55.2 7.9 3 4 0.025 3.8 -0.5 0.3 240 287 418 468 405 505 0.76 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 TIGR00609 TIGR00609 1175 5.5e-17 55.2 7.9 4 4 3.5e-07 5.4e-05 15.5 0.2 781 812 533 564 494 570 0.80 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_8 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.1e-16 54.2 0.0 1 3 0.0035 0.53 2.3 0.1 10 55 18 61 12 83 0.86 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_8 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.1e-16 54.2 0.0 2 3 4.2e-11 6.5e-09 28.5 0.0 331 419 179 255 96 258 0.77 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_8 - 680 TIGR00609 TIGR00609 1175 1.1e-16 54.2 0.0 3 3 2.7e-08 4.1e-06 19.3 0.0 731 813 539 609 529 627 0.81 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_81 - 100 HTH_3 PF01381.17 55 9.3e-14 45.6 0.0 1 1 4.6e-16 1.4e-13 45.0 0.0 5 52 21 68 20 70 0.97 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 3_62 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-12 41.5 0.6 1 2 1.9e-09 9.8e-08 26.0 0.0 5 49 9 54 6 55 0.89 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 3_62 - 174 HTH_23 PF13384.1 50 1.3e-12 41.5 0.6 2 2 2.8e-05 0.0014 12.8 0.4 3 50 64 113 62 113 0.90 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 1_38 - 468 HTH_23 PF13384.1 50 9.1e-11 35.6 0.4 1 1 7.4e-12 3.8e-10 33.7 0.2 2 48 11 58 10 60 0.94 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 10_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 1.9e-05 18.8 0.7 1 2 0.095 4.8 1.6 0.0 7 27 11 35 7 36 0.69 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 10_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 1.9e-05 18.8 0.7 2 2 1.1e-05 0.00057 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_81 - 100 HTH_23 PF13384.1 50 0.0001 16.4 0.0 1 1 2.8e-06 0.00015 15.9 0.0 15 37 23 45 15 58 0.79 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 4_4 - 208 HTH_23 PF13384.1 50 0.00076 13.6 0.0 1 1 3.9e-05 0.002 12.3 0.0 10 39 13 47 11 56 0.81 # 2575 # 3198 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 3_6 - 388 HTH_23 PF13384.1 50 0.0014 12.8 0.4 1 1 8.3e-05 0.0042 11.3 0.1 13 39 179 204 173 208 0.84 # 4698 # 5861 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 2_77 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00028 14.6 0.0 1 2 2.7e-06 0.00081 13.1 0.0 7 58 122 176 116 201 0.79 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_77 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00028 14.6 0.0 2 2 0.1 30 -1.9 0.0 30 65 324 358 321 391 0.61 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_81 - 100 HTH_19 PF12844.2 64 2.4e-09 31.6 0.0 1 1 1.1e-11 3.5e-09 31.1 0.0 7 54 20 67 19 69 0.91 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 1_84 - 483 NB-ARC PF00931.17 287 4e-08 26.9 0.0 1 1 2.3e-10 7.2e-08 26.0 0.0 17 108 125 232 121 240 0.73 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_38 - 468 HTH_29 PF13551.1 112 1.7e-16 54.9 0.6 1 1 2.5e-18 3.9e-16 53.7 0.6 1 110 16 119 16 121 0.89 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 3_62 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 1.5e-12 42.2 0.3 1 2 4.2e-08 6.5e-06 20.8 0.0 16 76 26 81 11 88 0.82 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 3_62 - 174 HTH_29 PF13551.1 112 1.5e-12 42.2 0.3 2 2 7e-09 1.1e-06 23.3 0.3 1 76 68 145 68 167 0.78 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 1_101 - 562 GIDA PF01134.17 392 8e-06 19.4 5.3 1 2 2.6e-08 8e-06 19.4 5.3 1 53 100 154 100 290 0.87 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 GIDA PF01134.17 392 8e-06 19.4 5.3 2 2 0.01 3.1 1.0 0.3 349 385 390 426 376 430 0.79 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 5_2 - 373 Met_10 PF02475.11 200 0.00047 14.3 0.1 1 1 3.1e-06 0.00094 13.3 0.1 98 142 183 228 178 256 0.85 # 218 # 1336 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_101 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.0025 12.6 1.0 1 2 0.08 25 -0.3 0.1 1 29 101 129 101 163 0.86 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.0025 12.6 1.0 2 2 6.9e-05 0.021 9.6 0.1 1 66 273 351 273 371 0.64 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 NAD_binding_8 PF13450.1 68 0.00021 15.8 1.2 1 1 6.9e-07 0.00021 15.8 1.2 1 35 103 136 103 155 0.91 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 10_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 7.1e-12 39.5 0.3 1 1 3e-14 9.1e-12 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 6_5 - 287 TIGR00508 TIGR00508 419 1.2e-56 186.2 0.0 1 1 4.9e-59 1.5e-56 185.9 0.0 171 418 13 274 3 275 0.90 # 2604 # 3464 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.582 3_19 - 254 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00043 14.4 0.0 1 1 2.6e-06 0.0008 13.5 0.0 7 106 104 197 99 240 0.78 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_84 - 483 Arch_ATPase PF01637.13 234 4.8e-07 24.1 0.0 1 1 2.9e-09 8.9e-07 23.3 0.0 20 163 127 267 120 294 0.76 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 3_33 - 203 Spermine_synth PF01564.12 246 0.0011 12.4 0.0 1 1 5e-06 0.0015 11.9 0.0 79 143 83 141 65 156 0.84 # 30741 # 31349 # 1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.498 2_59 - 595 PhoH PF02562.11 205 9.6e-07 22.7 0.5 1 1 8.8e-08 2.7e-05 17.9 0.5 6 177 5 246 2 258 0.76 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_55 - 353 AAA_5 PF07728.9 139 7.5e-34 110.9 0.0 1 1 3.9e-36 1.2e-33 110.3 0.0 1 139 98 238 98 238 0.96 # 49634 # 50692 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 1_101 - 562 Trp_halogenase PF04820.9 454 0.014 8.5 3.3 1 1 8.1e-05 0.025 7.6 3.3 1 47 100 143 100 151 0.76 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_40 - 795 PAPS_reduct PF01507.14 174 4.8e-08 27.5 0.0 1 1 4e-10 1.2e-07 26.1 0.0 3 150 78 264 76 269 0.71 # 35964 # 38348 # 1 # ID=3_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 1_7 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.5e-16 54.5 0.0 1 2 6.5e-07 0.0002 14.5 0.0 16 52 199 235 191 341 0.88 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_7 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.5e-16 54.5 0.0 2 2 8.1e-14 2.5e-11 37.2 0.0 164 345 412 604 391 646 0.77 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_77 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 3e-06 20.9 0.1 1 2 3.9e-06 0.0012 12.4 0.1 2 39 115 155 114 185 0.85 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_77 - 418 TIGR01968 TIGR01968 261 3e-06 20.9 0.1 2 2 0.00024 0.074 6.5 0.0 103 143 251 291 226 382 0.85 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_84 - 483 AAA_18 PF13238.1 129 1.2e-05 20.1 0.2 1 2 3.2e-07 9.7e-05 17.2 0.0 1 66 130 198 130 261 0.72 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_84 - 483 AAA_18 PF13238.1 129 1.2e-05 20.1 0.2 2 2 0.065 20 0.0 0.1 39 89 419 466 394 471 0.67 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_80 - 609 TIGR00611 TIGR00611 365 7.6e-07 22.7 0.0 1 1 5.1e-09 1.6e-06 21.7 0.0 1 48 1 49 1 60 0.86 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_38 - 468 B5 PF03484.10 70 0.0044 11.4 0.9 1 1 4.1e-05 0.013 9.9 0.0 6 51 95 139 93 141 0.91 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_25 - 418 IMS_HHH PF11798.3 32 4.8e-06 21.0 0.1 1 1 6.3e-08 1.9e-05 19.0 0.1 8 32 173 197 167 197 0.82 # 27463 # 28716 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.482 3_62 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.0013 12.8 0.2 1 2 0.018 5.6 1.1 0.0 23 31 29 37 28 37 0.87 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 3_62 - 174 HTH_psq PF05225.11 45 0.0013 12.8 0.2 2 2 7e-05 0.022 8.9 0.1 10 26 73 89 72 89 0.85 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 1_84 - 483 DUF258 PF03193.11 161 0.0012 12.5 0.0 1 1 7.4e-06 0.0023 11.6 0.0 34 61 126 153 102 170 0.85 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_60 - 145 EFP PF01132.15 55 0.00084 13.5 1.3 1 1 4.9e-06 0.0015 12.7 1.3 10 34 50 74 49 77 0.92 # 56325 # 56759 # -1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_7 - 695 DUF87 PF01935.12 229 0.00053 14.3 0.0 1 1 4e-06 0.0012 13.1 0.0 25 68 200 242 189 278 0.89 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_62 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 1.3e-24 80.3 0.3 1 2 1.8e-13 1.8e-11 38.4 0.0 1 50 10 60 10 61 0.93 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 3_62 - 174 HTH_28 PF13518.1 52 1.3e-24 80.3 0.3 2 2 6.2e-14 6.4e-12 39.8 0.2 2 47 68 115 67 121 0.93 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 1_38 - 468 HTH_28 PF13518.1 52 8e-13 42.7 0.8 1 1 5.6e-14 5.7e-12 40.0 0.8 2 51 16 66 15 67 0.96 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 10_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 0.00018 16.0 1.2 1 1 7.6e-06 0.00078 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_84 - 483 TIGR00041 TIGR00041 196 0.0012 12.7 0.0 1 1 1.1e-05 0.0034 11.3 0.0 7 30 130 153 125 164 0.85 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 4_4 - 208 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.00031 15.1 0.0 1 1 1.7e-06 0.00051 14.3 0.0 26 77 15 64 2 68 0.78 # 2575 # 3198 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_97 - 152 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 1e-20 68.4 1.4 1 1 1.2e-22 1.9e-20 67.6 1.1 1 65 51 113 51 113 0.95 # 93081 # 93536 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_102 - 122 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.00058 14.8 6.6 1 1 6.7e-06 0.001 14.0 6.6 1 64 47 108 47 109 0.80 # 96459 # 96824 # 1 # ID=1_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 4_5 - 208 HTH_24 PF13412.1 48 2e-06 21.6 0.1 1 1 6.5e-08 4e-06 20.7 0.1 3 48 4 49 2 49 0.90 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_81 - 100 HTH_24 PF13412.1 48 8.7e-05 16.4 0.0 1 1 2.2e-06 0.00013 15.8 0.0 14 36 22 44 17 45 0.86 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 1_38 - 468 HTH_24 PF13412.1 48 0.00061 13.7 0.1 1 1 3.3e-05 0.002 12.0 0.1 9 45 17 55 17 55 0.93 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_76 - 335 HTH_24 PF13412.1 48 0.0015 12.4 0.7 1 1 0.00032 0.02 8.8 0.2 14 39 170 195 165 197 0.87 # 74100 # 75104 # -1 # ID=2_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.376 2_92 - 292 HTH_24 PF13412.1 48 0.0027 11.6 0.8 1 1 0.00026 0.016 9.2 0.0 17 39 112 134 108 135 0.91 # 90953 # 91828 # -1 # ID=2_92;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.426 4_1 - 139 HTH_18 PF12833.2 81 2.4e-23 76.5 2.0 1 1 1.1e-25 3.3e-23 76.1 2.0 1 81 50 129 50 129 0.97 # 78 # 494 # -1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 3_19 - 254 TIGR03533 TIGR03533 284 6.3e-06 19.9 0.0 1 1 2.8e-08 8.6e-06 19.4 0.0 119 208 98 184 69 192 0.81 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_19 - 254 TIGR03534 TIGR03534 253 1.5e-10 35.1 0.0 1 1 2.2e-12 2.2e-10 34.6 0.0 74 177 86 186 71 191 0.88 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 2_71 - 346 TIGR03534 TIGR03534 253 0.0011 12.6 0.0 1 1 1.9e-05 0.0019 11.8 0.0 80 128 290 337 280 341 0.85 # 69957 # 70994 # -1 # ID=2_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 3_8 - 564 TIGR03534 TIGR03534 253 0.0018 11.9 0.0 1 1 3e-05 0.003 11.2 0.0 135 175 456 498 444 505 0.74 # 6109 # 7800 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 4_5 - 208 HTH_10 PF04967.7 53 0.002 12.2 0.3 1 1 2.4e-05 0.0073 10.4 0.0 22 46 17 41 15 44 0.92 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_101 - 562 TIGR01292 TIGR01292 300 4e-19 62.7 3.5 1 2 4.9e-06 0.0015 11.5 1.2 2 39 100 137 99 143 0.91 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 TIGR01292 TIGR01292 300 4e-19 62.7 3.5 2 2 3.9e-18 1.2e-15 51.2 0.0 143 296 272 425 214 427 0.82 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_84 - 483 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0018 12.8 0.0 1 1 3.7e-05 0.0057 11.1 0.0 2 91 130 236 129 278 0.67 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_80 - 609 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0024 12.3 0.0 1 1 4.6e-05 0.007 10.8 0.0 3 20 28 45 26 110 0.86 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 2_59 - 595 DEAD PF00270.24 169 9.1e-05 16.5 0.7 1 1 3.8e-06 0.0012 12.9 0.7 4 105 8 107 5 222 0.77 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_84 - 483 Miro PF08477.8 119 0.00047 15.2 0.0 1 1 4.5e-06 0.0014 13.6 0.0 2 25 130 152 129 195 0.83 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_81 - 100 HTH_31 PF13560.1 64 1.5e-07 26.0 0.0 1 1 6.3e-10 1.9e-07 25.7 0.0 9 56 20 66 12 76 0.85 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 1_84 - 483 DUF2075 PF09848.4 352 0.00033 14.1 0.1 1 2 0.0059 1.8 1.8 0.0 3 25 129 151 127 175 0.82 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_84 - 483 DUF2075 PF09848.4 352 0.00033 14.1 0.1 2 2 1.8e-05 0.0055 10.1 0.0 109 169 215 285 192 301 0.80 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_59 - 595 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.6e-12 41.3 0.0 1 1 4e-14 6.1e-12 40.1 0.0 47 103 496 562 450 563 0.79 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_8 - 680 UvrD_C_2 PF13538.1 104 6.2e-11 36.9 0.0 1 1 1.4e-12 2.2e-10 35.1 0.0 23 104 505 607 490 607 0.83 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 3_33 - 203 TIGR00755 TIGR00755 256 7.6e-05 16.2 0.1 1 1 4.8e-07 0.00015 15.3 0.1 32 86 83 139 61 150 0.86 # 30741 # 31349 # 1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.498 2_77 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00077 13.3 0.0 1 2 0.00072 0.22 5.4 0.1 24 38 40 54 40 55 0.89 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_77 - 418 HTH_OrfB_IS605 PF12323.3 46 0.00077 13.3 0.0 2 2 0.00036 0.11 6.4 0.0 17 37 53 73 52 76 0.85 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_77 - 418 HTH_36 PF13730.1 55 0.00086 13.9 0.1 1 1 1.8e-05 0.0028 12.3 0.0 28 54 52 78 31 79 0.91 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_14 - 363 HTH_36 PF13730.1 55 0.0092 10.6 2.0 1 1 0.00019 0.028 9.1 0.8 6 55 220 273 217 273 0.83 # 13366 # 14454 # 1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.449 2_71 - 346 StbA PF06406.6 318 2.8e-132 434.9 0.7 1 1 1e-134 3.2e-132 434.7 0.7 1 317 22 340 22 341 0.98 # 69957 # 70994 # -1 # ID=2_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 1_84 - 483 NACHT PF05729.7 166 0.00022 15.4 0.0 1 1 1.2e-06 0.00037 14.7 0.0 2 94 129 238 128 259 0.79 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_84 - 483 AAA_17 PF13207.1 121 1.1e-05 20.7 0.1 1 1 1.6e-07 5e-05 18.6 0.0 2 26 130 152 129 297 0.73 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_84 - 483 TIGR02211 TIGR02211 221 0.0009 13.0 0.0 1 1 6.4e-06 0.002 11.9 0.0 30 48 126 144 118 150 0.90 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_101 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 2.9e-06 20.8 5.3 1 3 9.5e-09 2.9e-06 20.8 5.3 2 32 101 131 100 138 0.91 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 2.9e-06 20.8 5.3 2 3 0.034 10 -0.8 0.2 142 204 311 366 286 382 0.67 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 2.9e-06 20.8 5.3 3 3 0.0019 0.57 3.4 0.1 373 402 374 405 368 419 0.86 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_28 - 214 Bd3614-deam PF14439.1 136 0.00034 15.0 0.1 1 1 1.6e-06 0.0005 14.4 0.1 3 68 47 112 45 122 0.77 # 25025 # 25666 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 1_84 - 483 AAA_25 PF13481.1 194 0.0003 14.7 0.2 1 2 7.7e-05 0.012 9.5 0.1 35 186 129 266 123 269 0.71 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_84 - 483 AAA_25 PF13481.1 194 0.0003 14.7 0.2 2 2 0.042 6.4 0.6 0.0 125 154 454 482 372 482 0.66 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_59 - 595 AAA_25 PF13481.1 194 0.001 12.9 0.0 1 1 3.5e-05 0.0054 10.6 0.0 17 63 3 46 1 62 0.78 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_8 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5.6e-11 36.8 0.0 1 3 7.7e-07 0.00012 16.2 0.0 2 60 21 78 20 86 0.84 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_8 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5.6e-11 36.8 0.0 2 3 0.00023 0.035 8.1 0.0 62 118 209 263 186 343 0.73 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_8 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5.6e-11 36.8 0.0 3 3 0.0011 0.16 5.9 0.0 213 232 572 606 528 608 0.62 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_59 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 8.5e-08 26.4 0.1 1 3 0.0057 0.87 3.5 0.0 2 21 20 39 19 91 0.63 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 8.5e-08 26.4 0.1 2 3 0.0086 1.3 2.9 0.0 40 135 167 261 132 297 0.74 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_59 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 8.5e-08 26.4 0.1 3 3 7e-07 0.00011 16.3 0.0 183 232 494 562 401 563 0.72 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_80 - 609 AAA_15 PF13175.1 415 9.7e-36 118.1 0.0 1 2 4.2e-15 1.3e-12 41.9 0.1 1 57 3 64 3 179 0.77 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_80 - 609 AAA_15 PF13175.1 415 9.7e-36 118.1 0.0 2 2 5.9e-25 1.8e-22 74.4 0.0 239 415 216 376 186 376 0.89 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_84 - 483 AAA_14 PF13173.1 128 1.1e-05 19.8 0.0 1 1 4.6e-07 0.00014 16.2 0.0 4 98 129 269 126 287 0.68 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 3_62 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 1.9e-07 25.4 0.1 1 2 0.00077 0.24 5.9 0.0 58 81 31 54 20 57 0.87 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 3_62 - 174 DUF1153 PF06627.6 90 1.9e-07 25.4 0.1 2 2 2e-07 6e-05 17.4 0.2 39 86 69 117 66 121 0.89 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 1_97 - 152 MerR PF00376.18 38 3e-14 46.8 0.1 1 1 4e-16 6.1e-14 45.9 0.1 1 38 9 46 9 46 0.99 # 93081 # 93536 # -1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_102 - 122 MerR PF00376.18 38 1.1e-06 22.6 0.1 1 1 1.1e-08 1.7e-06 22.0 0.1 2 38 6 42 5 42 0.89 # 96459 # 96824 # 1 # ID=1_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 1_84 - 483 AAA_33 PF13671.1 143 0.00014 16.2 0.0 1 1 1.1e-06 0.00033 15.0 0.0 4 23 132 151 130 226 0.86 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 4_4 - 208 CENP-B_N PF04218.8 53 0.0015 12.4 0.0 1 1 1e-05 0.003 11.5 0.0 26 51 28 53 23 55 0.90 # 2575 # 3198 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_43 - 276 Usp PF00582.21 140 7e-39 127.7 0.1 1 3 4e-19 1.2e-16 55.6 0.1 1 140 1 152 1 152 0.93 # 43912 # 44739 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_43 - 276 Usp PF00582.21 140 7e-39 127.7 0.1 2 3 0.001 0.32 5.7 0.0 4 24 160 180 158 200 0.74 # 43912 # 44739 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_43 - 276 Usp PF00582.21 140 7e-39 127.7 0.1 3 3 1.5e-21 4.5e-19 63.5 0.0 70 140 203 275 179 275 0.87 # 43912 # 44739 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_59 - 273 ThiS-like PF14453.1 57 0.0024 12.2 0.0 1 1 1.7e-05 0.0051 11.2 0.0 25 54 165 194 146 196 0.94 # 55129 # 55947 # -1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 1_80 - 609 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0016 11.5 0.0 1 1 8.7e-06 0.0027 10.8 0.0 240 265 20 45 5 47 0.87 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 4_1 - 139 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.004 11.5 1.8 1 2 0.0059 1.8 2.9 0.1 41 73 2 29 1 35 0.56 # 78 # 494 # -1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 4_1 - 139 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.004 11.5 1.8 2 2 0.00012 0.037 8.4 0.1 50 87 90 128 50 135 0.79 # 78 # 494 # -1 # ID=4_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 3_19 - 254 MTS PF05175.9 170 2.2e-08 28.1 0.0 1 1 2.3e-10 3.6e-08 27.4 0.0 35 144 104 205 89 224 0.72 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_8 - 564 MTS PF05175.9 170 9.6e-07 22.8 0.0 1 1 1.1e-08 1.7e-06 22.0 0.0 94 156 475 532 447 543 0.80 # 6109 # 7800 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_84 - 483 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0012 13.5 0.0 1 1 8.5e-06 0.0026 12.4 0.0 1 61 130 190 130 226 0.86 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 4_5 - 208 HTH_45 PF14947.1 77 0.00021 15.6 0.2 1 2 9e-06 0.0028 12.0 0.0 10 53 8 55 5 76 0.75 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 4_5 - 208 HTH_45 PF14947.1 77 0.00021 15.6 0.2 2 2 0.045 14 0.2 0.0 55 65 190 200 177 204 0.79 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 2_55 - 353 AAA_2 PF07724.9 171 1.5e-05 19.5 0.0 1 1 1.1e-07 3.4e-05 18.3 0.0 5 83 98 177 95 184 0.74 # 49634 # 50692 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 1_84 - 483 NTPase_1 PF03266.10 168 0.0026 12.0 0.1 1 1 2.8e-05 0.0086 10.3 0.1 2 22 130 150 129 163 0.89 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_101 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 2.6e-06 21.6 2.3 1 2 3.9e-06 0.0012 12.9 0.3 16 50 94 128 80 131 0.87 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 2.6e-06 21.6 2.3 2 2 0.00012 0.035 8.1 0.1 19 60 269 310 260 341 0.84 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_54 - 476 DNA_methylase PF00145.12 335 1e-75 249.4 0.0 1 1 4.2e-78 1.3e-75 249.0 0.0 1 333 92 455 92 457 0.87 # 50650 # 52077 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.468 1_101 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.049 7.7 6.6 1 2 0.0086 2.6 2.1 2.8 1 30 100 129 100 133 0.93 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.049 7.7 6.6 2 2 0.0003 0.091 6.9 0.1 2 36 273 307 272 359 0.75 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_76 - 227 Trans_reg_C PF00486.23 77 5.4e-27 88.1 0.0 1 1 6.5e-29 1e-26 87.2 0.0 1 77 146 221 146 221 0.96 # 74778 # 75458 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_62 - 227 Trans_reg_C PF00486.23 77 4.8e-26 85.0 0.4 1 1 8.1e-28 1.2e-25 83.7 0.0 1 77 146 221 146 221 0.97 # 58374 # 59054 # -1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_101 - 562 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 0.00045 14.4 0.5 1 1 2.7e-06 0.00082 13.6 0.1 13 39 277 303 274 335 0.84 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_84 - 483 ATP_bind_1 PF03029.12 238 4.7e-05 17.5 0.0 1 1 2.7e-07 8.1e-05 16.7 0.0 1 23 132 154 132 160 0.90 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 10_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2.3e-52 171.2 0.0 1 1 2.1e-54 3.2e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 53 # 757 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 3_63 - 284 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.7e-11 38.7 0.0 1 1 2e-13 3e-11 37.9 0.0 2 137 123 261 122 264 0.92 # 50448 # 51299 # 1 # ID=3_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_81 - 100 HTH_26 PF13443.1 63 0.00093 13.9 0.0 1 1 5.2e-06 0.0016 13.2 0.0 7 52 22 66 19 68 0.82 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 1_84 - 483 DAP3 PF10236.4 309 0.00076 12.9 0.0 1 2 0.0012 0.38 4.1 0.0 20 44 124 148 117 150 0.88 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_84 - 483 DAP3 PF10236.4 309 0.00076 12.9 0.0 2 2 0.00028 0.086 6.2 0.0 258 304 292 339 267 343 0.80 # 83852 # 85300 # -1 # ID=1_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_92 - 292 TrfA PF07042.6 282 2.7e-06 20.9 0.0 1 1 1e-08 3.2e-06 20.6 0.0 84 173 77 170 34 231 0.79 # 90953 # 91828 # -1 # ID=2_92;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.426 2_26 - 156 HTH_11 PF08279.7 55 9.4e-06 19.7 0.0 1 1 1.3e-07 2e-05 18.7 0.0 4 42 9 49 6 62 0.82 # 23434 # 23901 # 1 # ID=2_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 4_5 - 208 HTH_11 PF08279.7 55 0.0032 11.6 0.1 1 1 6.9e-05 0.011 10.0 0.0 4 43 8 46 6 60 0.82 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 4_5 - 208 MarR_2 PF12802.2 62 0.00026 15.2 0.1 1 1 8.3e-06 0.00064 13.9 0.1 10 55 9 52 2 57 0.83 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 4_9 - 42 MarR_2 PF12802.2 62 0.0003 15.0 0.0 1 1 3.9e-06 0.0003 14.9 0.0 5 46 3 40 1 41 0.85 # 6449 # 6574 # 1 # ID=4_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 2_26 - 156 MarR_2 PF12802.2 62 0.00073 13.7 0.1 1 1 2.6e-05 0.002 12.3 0.1 11 47 13 48 5 49 0.84 # 23434 # 23901 # 1 # ID=2_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 1_81 - 100 MarR_2 PF12802.2 62 0.0012 13.1 0.0 1 1 2.3e-05 0.0018 12.5 0.0 12 39 18 43 7 45 0.82 # 80665 # 80964 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.457 1_40 - 107 HTH_5 PF01022.15 47 5.3e-20 65.4 0.2 1 1 5e-22 7.6e-20 64.9 0.2 1 46 13 59 13 60 0.98 # 41759 # 42079 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 4_5 - 208 HTH_5 PF01022.15 47 2.1e-10 34.7 0.1 1 1 3.1e-12 4.7e-10 33.5 0.1 3 46 5 49 3 50 0.92 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 4_5 - 208 TrmB PF01978.14 68 2.9e-07 24.6 0.0 1 1 2.1e-09 6.5e-07 23.5 0.0 11 62 7 58 6 62 0.93 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_101 - 562 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.2e-42 139.7 0.0 1 1 1.6e-44 4.9e-42 138.6 0.0 1 199 100 407 100 409 0.96 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_80 - 609 DUF2813 PF11398.3 373 6.1e-10 33.1 0.5 1 2 2.9e-08 8.8e-06 19.4 0.1 1 49 1 51 1 67 0.87 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_80 - 609 DUF2813 PF11398.3 373 6.1e-10 33.1 0.5 2 2 6.8e-06 0.0021 11.6 0.1 267 341 312 391 193 407 0.80 # 78275 # 80101 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 2_20 - 330 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.5e-26 87.7 0.0 1 2 0.069 21 -0.8 0.0 107 155 12 54 6 69 0.65 # 17253 # 18242 # 1 # ID=2_20;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 2_20 - 330 ATP-grasp_4 PF13535.1 184 1.5e-26 87.7 0.0 2 2 2.4e-28 7.4e-26 85.5 0.0 2 182 91 270 90 273 0.93 # 17253 # 18242 # 1 # ID=2_20;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 4_2 - 223 UPF0122 PF04297.9 101 0.00015 16.3 1.4 1 1 1.1e-06 0.00034 15.1 1.4 3 76 29 102 26 125 0.83 # 507 # 1175 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 2_77 - 418 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.00033 14.9 0.0 1 1 2.7e-06 0.00081 13.7 0.0 21 58 42 79 28 89 0.88 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_101 - 562 DAO PF01266.19 358 2e-11 37.8 7.5 1 2 1.9e-08 5.8e-06 19.9 1.5 2 35 101 134 100 161 0.85 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_101 - 562 DAO PF01266.19 358 2e-11 37.8 7.5 2 2 7.7e-09 2.3e-06 21.1 0.5 151 239 314 400 274 529 0.80 # 94756 # 96441 # 1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 204 LptE PF04390.7 155 6.1e-06 20.5 0.0 1 1 3.5e-08 1.1e-05 19.7 0.0 2 80 8 88 7 126 0.80 # 25890 # 26501 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 2_35 - 392 SAC3_GANP PF03399.11 204 0.0019 12.3 1.0 1 1 1.2e-05 0.0037 11.3 0.1 43 104 191 252 183 254 0.85 # 32582 # 33757 # 1 # ID=2_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.457 2_80 - 894 AAA_10 PF12846.2 304 2.6e-65 215.3 0.0 1 1 3.7e-67 3.8e-65 214.7 0.0 1 303 456 812 456 813 0.93 # 80193 # 82874 # -1 # ID=2_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 1_7 - 695 AAA_10 PF12846.2 304 1e-16 55.7 0.0 1 1 2e-18 2e-16 54.7 0.0 2 296 199 578 198 585 0.73 # 5522 # 7606 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_59 - 595 AAA_10 PF12846.2 304 0.00087 13.2 0.3 1 1 3.5e-05 0.0036 11.2 0.0 1 25 16 40 16 49 0.80 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_5 - 208 HTH_20 PF12840.2 61 4.6e-11 36.9 0.3 1 1 1.9e-12 1.2e-10 35.6 0.0 11 61 5 55 1 55 0.94 # 3176 # 3799 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_40 - 107 HTH_20 PF12840.2 61 6.5e-11 36.4 0.3 1 1 1.5e-12 9.1e-11 36.0 0.3 2 61 6 65 5 65 0.97 # 41759 # 42079 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 2_26 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00018 15.8 0.4 1 2 0.00011 0.0066 10.8 0.0 19 50 17 48 7 49 0.91 # 23434 # 23901 # 1 # ID=2_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 2_26 - 156 HTH_20 PF12840.2 61 0.00018 15.8 0.4 2 2 0.045 2.8 2.4 0.1 7 20 108 121 103 142 0.72 # 23434 # 23901 # 1 # ID=2_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.502 3_63 - 284 HTH_20 PF12840.2 61 0.00038 14.8 0.0 1 1 1.2e-05 0.00072 13.9 0.0 27 50 13 36 1 41 0.80 # 50448 # 51299 # 1 # ID=3_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 4_4 - 208 HTH_20 PF12840.2 61 0.0018 12.6 0.0 1 1 6.8e-05 0.0042 11.4 0.0 21 46 21 46 12 61 0.84 # 2575 # 3198 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 3_80 - 74 Dimerisation PF08100.6 51 0.00029 15.2 0.5 1 1 1.4e-06 0.00043 14.6 0.1 15 47 28 65 26 66 0.81 # 62867 # 63088 # 1 # ID=3_80;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.441 3_33 - 203 RrnaAD PF00398.15 262 4.2e-05 17.1 0.0 1 1 2.1e-07 6.4e-05 16.5 0.0 47 92 98 144 80 183 0.85 # 30741 # 31349 # 1 # ID=3_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.498 3_19 - 254 Methyltransf_18 PF12847.2 112 5.7e-06 21.4 0.0 1 1 3.5e-08 1.1e-05 20.5 0.0 3 107 102 198 100 203 0.77 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_27 - 157 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 9.3e-06 20.2 0.8 1 1 1.3e-07 2e-05 19.1 0.8 1 31 35 65 18 75 0.67 # 26954 # 27424 # 1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 3_3 - 239 DnaJ_CXXCXGXG PF00684.14 66 1.1e-05 19.9 1.7 1 1 1.2e-07 1.8e-05 19.2 1.7 36 64 27 54 17 56 0.85 # 1702 # 2418 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 2_59 - 595 UvrD_C PF13361.1 351 4.9e-42 139.1 0.0 1 1 5.9e-44 9e-42 138.2 0.0 2 348 254 564 253 567 0.86 # 53490 # 55274 # -1 # ID=2_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_8 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 8.4e-23 75.8 0.0 1 2 0.0018 0.28 5.0 0.0 74 118 332 377 289 388 0.79 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_8 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 8.4e-23 75.8 0.0 2 2 2e-22 3e-20 67.4 0.0 290 347 538 607 519 611 0.91 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 3_19 - 254 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00066 14.7 0.0 1 1 4.7e-06 0.0014 13.6 0.0 5 86 109 191 105 198 0.82 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 2_77 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.8e-09 31.5 0.6 1 2 0.0088 2.7 1.4 0.0 214 274 14 76 6 85 0.80 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_77 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.8e-09 31.5 0.6 2 2 2.4e-10 7.4e-08 26.2 0.1 8 136 122 269 115 274 0.80 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_77 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 6e-08 27.2 0.4 1 2 9.4e-08 2.9e-05 18.5 0.0 9 128 123 270 121 292 0.83 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_77 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 6e-08 27.2 0.4 2 2 0.00088 0.27 5.6 0.1 14 89 299 381 284 410 0.72 # 75101 # 76354 # -1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 5_2 - 373 ADH_zinc_N PF00107.21 130 1.4e-25 83.8 0.4 1 1 7.2e-28 2.2e-25 83.2 0.4 1 127 197 329 197 332 0.92 # 218 # 1336 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 3_34 - 417 FaeA PF04703.7 62 0.0016 13.1 0.1 1 1 1.1e-05 0.0034 12.1 0.1 31 54 59 82 52 87 0.90 # 31520 # 32770 # 1 # ID=3_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_8 - 680 AAA_11 PF13086.1 236 0.00072 13.6 0.1 1 1 1.1e-05 0.0032 11.5 0.0 17 72 17 67 4 146 0.73 # 5949 # 7988 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_57 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0016 12.8 0.1 1 2 3.3e-05 0.01 10.2 0.1 2 83 8 87 7 94 0.74 # 51788 # 52165 # -1 # ID=2_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.368 2_57 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0016 12.8 0.1 2 2 0.033 10 0.6 0.0 43 60 92 109 88 112 0.83 # 51788 # 52165 # -1 # ID=2_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.368 5_2 - 373 ADH_zinc_N_2 PF13602.1 127 4.4e-08 28.6 0.0 1 1 3.3e-10 1e-07 27.4 0.0 2 121 231 362 230 363 0.67 # 218 # 1336 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 3_19 - 254 MetW PF07021.7 193 0.00021 15.1 0.0 1 1 2.1e-06 0.00032 14.6 0.0 13 102 100 192 90 202 0.77 # 20030 # 20791 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_8 - 564 MetW PF07021.7 193 0.002 12.0 0.0 1 1 2.3e-05 0.0035 11.2 0.0 18 83 424 487 410 499 0.85 # 6109 # 7800 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 3_62 - 174 BrkDBD PF09607.5 58 0.0025 11.9 0.0 1 1 3.6e-05 0.011 9.8 0.0 11 47 11 44 2 51 0.80 # 49930 # 50451 # 1 # ID=3_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.462 3_63 - 284 HTH_21 PF13276.1 60 1.3e-16 54.9 4.2 1 2 8.5e-19 1.3e-16 54.9 4.2 6 60 43 96 38 97 0.90 # 50448 # 51299 # 1 # ID=3_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 3_63 - 284 HTH_21 PF13276.1 60 1.3e-16 54.9 4.2 2 2 0.081 12 0.5 0.1 44 56 199 211 185 215 0.73 # 50448 # 51299 # 1 # ID=3_63;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.428 1_38 - 468 HTH_21 PF13276.1 60 0.012 10.2 3.6 1 1 0.00012 0.018 9.6 0.0 34 59 104 129 81 130 0.84 # 39532 # 40935 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/db7bbb32-4dee-47ee-80d7-ec846478461e # Target file: checkm_output/bins/pm2070/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm2070/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/db7bbb32-4dee-47ee-80d7-ec846478461e checkm_output/bins/pm2070/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:59:32 2017 # [ok]