# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_81 - 388 KaiC PF06745.8 227 0.00075 11.4 0.0 1 1 1.5e-05 0.0013 10.6 0.0 14 59 147 191 137 201 0.76 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_59 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 1.1e-05 17.7 0.2 1 1 4.6e-07 4.1e-05 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_81 - 388 ABC_tran PF00005.22 137 0.00012 15.1 0.0 1 1 2.7e-06 0.00024 14.2 0.0 16 33 157 174 149 217 0.83 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_59 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 0.00025 13.6 1.5 1 1 1.2e-05 0.0011 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_81 - 388 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 8.8e-05 14.8 0.0 1 1 1.9e-06 0.00017 13.8 0.0 41 59 155 173 129 184 0.85 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_59 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.00059 12.8 0.6 1 1 2.1e-05 0.0019 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_59 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 2.7e-06 19.6 1.4 1 1 5.9e-08 5.2e-06 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_81 - 388 MobB PF03205.9 140 0.00045 12.7 0.0 1 1 1e-05 0.00092 11.7 0.0 4 25 156 177 154 190 0.85 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_29 - 83 HTH_8 PF02954.14 42 9e-06 18.0 0.1 1 1 1.8e-07 1.6e-05 17.2 0.1 18 36 14 32 13 33 0.92 # 14678 # 14926 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_67 - 1017 AAA_19 PF13245.1 76 0.00045 12.7 0.0 1 1 1.6e-05 0.0014 11.1 0.0 14 31 492 508 481 518 0.90 # 48136 # 51186 # -1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_81 - 388 AAA_23 PF13476.1 202 1.8e-06 21.2 0.1 1 1 4.2e-08 3.7e-06 20.1 0.0 19 44 152 177 140 226 0.87 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_42 - 258 TIGR00573 TIGR00573 217 3.1e-12 38.8 0.0 1 1 5.1e-14 4.6e-12 38.3 0.0 12 104 107 195 103 198 0.93 # 22287 # 23060 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_81 - 388 SMC_N PF02463.14 220 0.001 11.0 0.0 1 1 2.1e-05 0.0019 10.2 0.0 26 50 154 178 147 195 0.81 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_57 - 170 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 8.5e-05 15.3 0.1 1 1 3.3e-06 0.00029 13.5 0.1 10 48 124 165 122 168 0.76 # 34960 # 35469 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_56 - 696 TraG-D_C PF12696.2 128 0.00012 14.7 0.1 1 1 2.4e-06 0.00021 13.9 0.1 3 94 437 524 435 556 0.78 # 32825 # 34912 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_48 - 421 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 7.1e-35 113.2 0.2 1 1 1.7e-36 1.5e-34 112.1 0.0 6 213 128 362 123 362 0.96 # 26687 # 27949 # -1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 1_35 - 425 ACT PF01842.20 66 3.3e-05 16.1 0.5 1 3 0.039 3.5 0.1 0.0 13 27 232 246 231 246 0.91 # 18393 # 19667 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_35 - 425 ACT PF01842.20 66 3.3e-05 16.1 0.5 2 3 1.3e-05 0.0011 11.2 0.0 7 27 319 339 316 339 0.93 # 18393 # 19667 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_35 - 425 ACT PF01842.20 66 3.3e-05 16.1 0.5 3 3 0.056 5 -0.4 0.0 30 59 365 392 363 394 0.75 # 18393 # 19667 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_29 - 83 HTH_37 PF13744.1 80 3.8e-05 16.2 0.0 1 1 1.8e-06 7.8e-05 15.2 0.0 24 54 7 37 4 46 0.89 # 14678 # 14926 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_36 - 91 HTH_37 PF13744.1 80 0.00035 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.00049 12.7 0.0 25 53 22 50 19 54 0.92 # 19685 # 19957 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 1_24 - 325 Hydantoinase_A PF01968.13 290 9.9e-08 24.1 3.6 1 2 5.2e-07 4.6e-05 15.3 0.1 67 96 158 186 140 193 0.83 # 11409 # 12383 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_24 - 325 Hydantoinase_A PF01968.13 290 9.9e-08 24.1 3.6 2 2 3.1e-05 0.0028 9.5 0.1 212 265 248 301 191 322 0.76 # 11409 # 12383 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_81 - 388 AAA_16 PF13191.1 185 0.00078 12.2 0.0 1 1 1.8e-05 0.0016 11.2 0.0 26 50 154 178 140 211 0.85 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_81 - 388 AAA_22 PF13401.1 131 2.6e-06 20.4 0.0 1 1 1.4e-07 6.4e-06 19.1 0.0 4 30 152 178 149 243 0.84 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_67 - 1017 AAA_22 PF13401.1 131 0.00018 14.4 0.0 1 1 1.3e-05 0.0006 12.7 0.0 8 73 492 561 486 594 0.70 # 48136 # 51186 # -1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_12 - 287 Methyltransf_27 PF13708.1 194 1.7e-69 225.9 0.0 1 1 3.3e-71 2.9e-69 225.2 0.0 2 194 89 282 88 282 0.98 # 4155 # 5015 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_81 - 388 AAA_29 PF13555.1 62 7.9e-06 18.1 0.1 1 1 2.2e-07 2e-05 16.9 0.1 26 43 155 172 147 175 0.84 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_57 - 170 Limkain-b1 PF11608.3 91 0.00042 12.8 0.1 1 1 8.7e-06 0.00077 12.0 0.1 16 70 90 144 80 151 0.89 # 34960 # 35469 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_59 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 8.4e-05 15.0 0.0 1 1 1.9e-06 0.00017 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_29 - 83 HTH_3 PF01381.17 55 1.6e-09 30.2 0.1 1 1 1.2e-10 2.8e-09 29.5 0.1 4 45 9 50 6 56 0.86 # 14678 # 14926 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_15 - 89 HTH_3 PF01381.17 55 9.9e-07 21.4 0.0 1 1 5.6e-08 1.3e-06 21.0 0.0 8 36 41 69 33 78 0.88 # 7220 # 7486 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_36 - 91 HTH_3 PF01381.17 55 2.8e-05 16.7 0.0 1 1 1.9e-06 4.3e-05 16.1 0.0 2 32 21 51 21 55 0.90 # 19685 # 19957 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 1_20 - 160 HTH_3 PF01381.17 55 0.00013 14.6 0.1 1 2 0.0029 0.065 5.9 0.0 2 20 15 33 14 37 0.91 # 9306 # 9785 # -1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_20 - 160 HTH_3 PF01381.17 55 0.00013 14.6 0.1 2 2 0.0022 0.049 6.3 0.0 1 23 96 118 96 120 0.89 # 9306 # 9785 # -1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_48 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 2.9e-27 87.6 3.5 1 2 0.0052 0.46 1.2 0.0 11 42 5 36 3 62 0.72 # 26687 # 27949 # -1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 1_48 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 2.9e-27 87.6 3.5 2 2 1.5e-28 1.3e-26 85.4 2.2 137 438 122 418 41 420 0.82 # 26687 # 27949 # -1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 1_36 - 91 HTH_23 PF13384.1 50 3.9e-06 19.2 0.1 1 1 3.5e-07 6.2e-06 18.6 0.1 12 38 23 49 19 54 0.85 # 19685 # 19957 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 1_15 - 89 HTH_23 PF13384.1 50 6.2e-06 18.6 0.0 1 1 5.3e-07 9.4e-06 18.0 0.0 16 39 38 64 33 68 0.83 # 7220 # 7486 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_57 - 170 HTH_23 PF13384.1 50 1.4e-05 17.4 0.1 1 1 1.8e-06 3.2e-05 16.3 0.1 4 40 123 163 121 167 0.91 # 34960 # 35469 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_59 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 3.9e-05 16.0 0.3 1 1 2.2e-06 3.9e-05 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_29 - 83 HTH_23 PF13384.1 50 4e-05 16.0 0.0 1 1 4.4e-06 7.8e-05 15.1 0.0 15 34 10 31 6 40 0.81 # 14678 # 14926 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_59 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 2.1e-13 42.7 1.1 1 1 5.1e-15 4.6e-13 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_29 - 83 HTH_19 PF12844.2 64 3.5e-08 26.2 0.0 1 1 1.7e-09 5.1e-08 25.7 0.0 8 45 10 47 8 56 0.86 # 14678 # 14926 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_36 - 91 HTH_19 PF12844.2 64 9e-06 18.5 0.0 1 1 4.1e-07 1.2e-05 18.1 0.0 5 35 21 51 21 60 0.91 # 19685 # 19957 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 1_15 - 89 HTH_19 PF12844.2 64 7.5e-05 15.5 0.0 1 1 3.4e-06 0.0001 15.1 0.0 4 39 33 69 30 73 0.85 # 7220 # 7486 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_59 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 9.5e-05 15.3 0.6 1 2 0.025 2.2 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_59 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 9.5e-05 15.3 0.6 2 2 1e-05 0.00091 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_56 - 696 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.7e-06 19.6 0.9 1 3 1.7e-05 0.0015 9.8 0.0 16 36 134 154 125 158 0.88 # 32825 # 34912 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_56 - 696 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.7e-06 19.6 0.9 2 3 9.3e-05 0.0083 7.4 0.1 93 140 235 281 229 303 0.80 # 32825 # 34912 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_56 - 696 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.7e-06 19.6 0.9 3 3 0.083 7.4 -2.3 0.0 293 323 482 512 405 546 0.58 # 32825 # 34912 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_67 - 1017 AAA_18 PF13238.1 129 7.6e-05 15.8 1.3 1 1 3.5e-06 0.00032 13.8 0.0 2 19 492 509 492 571 0.76 # 48136 # 51186 # -1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_43 - 435 IMS_HHH PF11798.3 32 0.00044 13.1 0.0 1 1 1.5e-05 0.0013 11.6 0.0 12 32 192 212 182 212 0.83 # 23157 # 24461 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.597 1_42 - 258 TIGR01406 TIGR01406 231 6.5e-14 44.5 0.0 1 1 1.1e-15 9.4e-14 44.0 0.0 4 100 106 196 104 225 0.88 # 22287 # 23060 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_81 - 388 DUF87 PF01935.12 229 8.1e-05 15.2 0.0 1 1 1.8e-06 0.00016 14.2 0.0 28 45 157 174 155 188 0.89 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_57 - 170 HTH_28 PF13518.1 52 2.6e-06 20.2 0.5 1 1 2.3e-07 5.2e-06 19.2 0.1 2 37 126 165 125 167 0.90 # 34960 # 35469 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_15 - 89 HTH_28 PF13518.1 52 5.5e-05 15.9 0.0 1 1 3.5e-06 7.7e-05 15.4 0.0 7 34 34 64 33 68 0.82 # 7220 # 7486 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_59 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.00012 14.8 0.0 1 1 1.7e-05 0.00038 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_29 - 83 HTH_28 PF13518.1 52 0.00037 13.3 0.1 1 1 3.6e-05 0.00081 12.2 0.1 8 29 8 31 6 35 0.78 # 14678 # 14926 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_81 - 388 Miro PF08477.8 119 0.00085 12.6 0.0 1 1 2.1e-05 0.0019 11.5 0.0 4 28 157 186 156 220 0.72 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_29 - 83 HTH_31 PF13560.1 64 1.7e-09 30.6 0.9 1 1 9.9e-11 2.2e-09 30.2 0.9 9 56 9 55 6 72 0.90 # 14678 # 14926 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_36 - 91 HTH_31 PF13560.1 64 1.4e-07 24.4 0.5 1 1 1.1e-08 2.5e-07 23.6 0.5 7 36 21 50 6 65 0.90 # 19685 # 19957 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 1_20 - 160 HTH_31 PF13560.1 64 6e-07 22.4 1.2 1 2 0.0047 0.1 5.6 0.0 6 33 14 41 12 48 0.88 # 9306 # 9785 # -1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_20 - 160 HTH_31 PF13560.1 64 6e-07 22.4 1.2 2 2 3.7e-06 8.2e-05 15.6 0.3 4 39 94 129 91 135 0.88 # 9306 # 9785 # -1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.546 1_15 - 89 HTH_31 PF13560.1 64 1.8e-06 20.9 0.0 1 1 1.1e-07 2.5e-06 20.4 0.0 2 42 29 69 28 80 0.84 # 7220 # 7486 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_67 - 1017 DUF2075 PF09848.4 352 0.00031 12.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.00098 10.8 0.0 5 22 492 509 489 537 0.87 # 48136 # 51186 # -1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_81 - 388 T2SE PF00437.15 272 2.5e-23 75.0 0.0 1 1 4.6e-25 4.1e-23 74.3 0.0 11 269 24 303 15 306 0.78 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_24 - 325 StbA PF06406.6 318 2.9e-157 515.2 0.2 1 1 3.7e-159 3.3e-157 515.1 0.2 1 318 1 322 1 322 0.99 # 11409 # 12383 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_81 - 388 NACHT PF05729.7 166 0.0003 13.2 0.0 1 1 6.6e-06 0.00059 12.3 0.0 4 29 156 181 154 188 0.83 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_67 - 1017 AAA_17 PF13207.1 121 4.5e-05 17.0 0.1 1 1 4.3e-06 0.00038 14.0 0.0 3 27 492 522 492 581 0.72 # 48136 # 51186 # -1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_81 - 388 AAA_25 PF13481.1 194 5.1e-06 18.7 0.0 1 1 1.3e-07 1.2e-05 17.6 0.0 24 53 143 172 120 178 0.86 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_24 - 325 Hydant_A_N PF05378.8 176 0.00089 11.5 3.9 1 4 0.08 7.1 -1.2 0.0 1 19 2 20 2 48 0.82 # 11409 # 12383 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_24 - 325 Hydant_A_N PF05378.8 176 0.00089 11.5 3.9 2 4 0.049 4.4 -0.5 0.0 108 154 38 86 15 103 0.67 # 11409 # 12383 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_24 - 325 Hydant_A_N PF05378.8 176 0.00089 11.5 3.9 3 4 0.057 5.1 -0.7 0.0 95 129 113 147 89 153 0.76 # 11409 # 12383 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_24 - 325 Hydant_A_N PF05378.8 176 0.00089 11.5 3.9 4 4 3.6e-05 0.0032 9.7 0.2 2 51 170 217 169 226 0.82 # 11409 # 12383 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.554 1_15 - 89 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00033 12.6 0.0 1 1 5e-06 0.00044 12.2 0.0 19 49 35 64 33 65 0.91 # 7220 # 7486 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_15 - 89 CENP-B_N PF04218.8 53 0.0013 11.0 0.0 1 1 1.9e-05 0.0017 10.6 0.0 24 49 44 69 34 72 0.88 # 7220 # 7486 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_81 - 388 Ribosomal_S5 PF00333.15 67 2.7e-05 16.7 0.1 1 2 0.00091 0.081 5.5 0.0 26 45 84 103 76 114 0.83 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_81 - 388 Ribosomal_S5 PF00333.15 67 2.7e-05 16.7 0.1 2 2 0.00012 0.01 8.4 0.0 21 54 242 274 230 278 0.91 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_81 - 388 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00099 12.1 0.0 1 1 2.5e-05 0.0022 10.9 0.0 3 26 157 180 156 197 0.81 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_36 - 91 Mor PF08765.6 108 0.00035 13.1 0.0 1 1 5e-06 0.00045 12.8 0.0 71 93 27 49 18 57 0.85 # 19685 # 19957 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 1_15 - 89 Phage_CII PF05269.6 91 0.00064 12.5 0.0 1 1 9.2e-06 0.00082 12.2 0.0 17 45 36 64 32 81 0.83 # 7220 # 7486 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_81 - 388 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00073 11.8 0.0 1 1 1.3e-05 0.0012 11.2 0.0 1 25 157 181 157 191 0.84 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_77 - 66 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 0.00023 13.9 0.0 1 1 2.8e-06 0.00025 13.8 0.0 29 64 18 52 5 58 0.83 # 57099 # 57296 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.460 1_36 - 91 HTH_26 PF13443.1 63 0.00011 15.1 0.0 1 1 4.2e-06 0.00019 14.4 0.0 4 34 22 52 21 56 0.91 # 19685 # 19957 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 1_15 - 89 HTH_26 PF13443.1 63 0.00024 14.1 0.0 1 1 7.2e-06 0.00032 13.7 0.0 11 47 43 78 33 82 0.90 # 7220 # 7486 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_59 - 186 TrmB PF01978.14 68 4.9e-05 15.8 0.0 1 1 1.1e-06 0.0001 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_15 - 89 HTH_Crp_2 PF13545.1 76 0.0004 12.9 0.0 1 1 6.6e-06 0.00059 12.4 0.0 26 50 40 64 32 65 0.88 # 7220 # 7486 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_42 - 258 RNase_T PF00929.19 164 4.1e-15 49.2 0.0 1 1 6.2e-17 5.5e-15 48.7 0.0 1 151 105 249 105 250 0.91 # 22287 # 23060 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_67 - 1017 AAA_10 PF12846.2 304 7.7e-41 133.1 0.0 1 1 5.5e-42 1.6e-40 132.1 0.0 5 297 492 884 489 889 0.91 # 48136 # 51186 # -1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_56 - 696 AAA_10 PF12846.2 304 5.6e-10 31.8 0.0 1 1 2.8e-11 8.3e-10 31.2 0.0 2 292 134 503 133 514 0.76 # 32825 # 34912 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 1_81 - 388 AAA_10 PF12846.2 304 1.3e-06 20.8 0.0 1 1 2.5e-07 7.4e-06 18.3 0.0 3 27 154 178 152 196 0.74 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_59 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 1.8e-06 20.5 0.2 1 2 0.0037 0.33 3.6 0.0 33 52 8 27 4 28 0.91 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_59 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 1.8e-06 20.5 0.2 2 2 9.1e-06 0.00081 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 39193 # 39750 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_2 - 145 SSB PF00436.20 104 2.9e-32 103.4 0.2 1 1 3.8e-34 3.4e-32 103.2 0.2 2 103 7 111 6 112 0.96 # 52 # 486 # -1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 1_81 - 388 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.00095 11.4 0.0 1 1 2e-05 0.0017 10.5 0.0 8 34 157 183 155 195 0.87 # 61261 # 62424 # -1 # ID=1_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/f4813e7a-6f36-4fe7-ab6f-fe6a34797e1c # Target file: checkm_output/bins/pm2029/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm2029/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/f4813e7a-6f36-4fe7-ab6f-fe6a34797e1c checkm_output/bins/pm2029/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:58:27 2017 # [ok]