# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_44 - 284 RepC PF06504.6 283 9.7e-159 520.5 0.0 1 1 5.5e-161 1.1e-158 520.3 0.0 2 282 2 282 1 283 0.99 # 38310 # 39161 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.660 9_7 - 209 HTH_IclR PF09339.5 52 3.1e-05 17.4 0.2 1 1 1.1e-06 0.00011 15.7 0.0 15 40 178 203 174 204 0.85 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 10_1 - 511 HTH_IclR PF09339.5 52 0.0001 15.7 0.2 1 2 0.042 4.1 1.0 0.0 24 36 165 177 163 186 0.81 # 398 # 1930 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_1 - 511 HTH_IclR PF09339.5 52 0.0001 15.7 0.2 2 2 1.9e-05 0.0018 11.7 0.2 25 50 228 253 222 255 0.93 # 398 # 1930 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 11_4 - 341 HHH_3 PF12836.2 65 0.00016 15.5 0.0 1 1 1.8e-06 0.00036 14.4 0.0 14 57 212 255 210 257 0.95 # 2050 # 3072 # -1 # ID=11_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_8 - 276 ABC_tran PF00005.22 137 7.4e-30 97.9 0.0 1 1 1.1e-31 1.1e-29 97.4 0.0 1 136 23 170 23 171 0.89 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_35 - 519 ABC_tran PF00005.22 137 3.4e-11 37.4 0.4 1 1 8.8e-12 8.6e-10 32.9 0.4 8 134 33 235 29 237 0.56 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 9_7 - 209 HTH_22 PF13309.1 64 0.0006 13.5 0.5 1 1 2.9e-05 0.0029 11.3 0.1 44 63 183 202 167 203 0.77 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_12 - 119 HTH_22 PF13309.1 64 0.0013 12.4 0.0 1 1 4.1e-05 0.004 10.8 0.0 28 64 8 39 1 39 0.80 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 11_4 - 341 HHH_5 PF14520.1 60 7.1e-05 16.8 0.0 1 1 1.2e-06 0.00024 15.1 0.0 6 49 213 253 210 257 0.91 # 2050 # 3072 # -1 # ID=11_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 3_19 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.0003 13.8 0.0 1 2 1.6e-05 0.0032 10.4 0.0 28 64 32 68 21 83 0.87 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 3_19 - 188 N6_Mtase PF02384.11 311 0.0003 13.8 0.0 2 2 0.018 3.6 0.4 0.0 127 137 114 124 103 134 0.82 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 16_1 - 296 rve_3 PF13683.1 67 1.5e-13 44.0 0.1 1 1 1.8e-15 3.5e-13 42.8 0.0 6 67 216 277 211 277 0.93 # 40 # 927 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 4_12 - 1588 Sigma54_activat PF00158.21 168 1.9e-05 18.0 0.0 1 1 2.1e-07 4.2e-05 16.9 0.0 11 83 215 286 209 307 0.81 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 1_12 - 119 HTH_DeoR PF08220.7 57 0.00098 12.6 0.0 1 1 7.8e-06 0.0015 11.9 0.0 5 36 9 39 7 50 0.80 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 10_5 - 246 Methyltransf_4 PF02390.12 197 0.00028 13.8 0.1 1 1 2.7e-06 0.00053 12.9 0.0 17 52 27 62 3 102 0.72 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 6_8 - 159 HTH_Tnp_Tc3_2 PF01498.13 72 0.0004 14.3 0.0 1 1 1.4e-05 0.00069 13.5 0.0 6 46 19 60 17 77 0.79 # 6347 # 6823 # 1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 10_7 - 50 HTH_Tnp_Tc3_2 PF01498.13 72 0.00073 13.5 0.0 1 1 1.5e-05 0.00073 13.5 0.0 14 37 26 49 11 50 0.91 # 4631 # 4780 # 1 # ID=10_7;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 12_1 - 50 HTH_Tnp_Tc3_2 PF01498.13 72 0.00073 13.5 0.0 1 1 1.5e-05 0.00073 13.5 0.0 14 37 26 49 11 50 0.91 # 1 # 150 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 8_1 - 50 HTH_Tnp_Tc3_2 PF01498.13 72 0.00073 13.5 0.0 1 1 1.5e-05 0.00073 13.5 0.0 14 37 26 49 11 50 0.91 # 1 # 150 # -1 # ID=8_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 2_23 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 8.1e-06 19.3 0.2 1 2 4.1e-06 0.0004 13.7 0.0 39 63 476 504 463 507 0.84 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_23 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 8.1e-06 19.3 0.2 2 2 0.0077 0.75 3.0 0.1 75 167 530 626 529 632 0.85 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_35 - 519 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00049 13.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.001 12.4 0.0 36 58 34 56 15 62 0.82 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 9_7 - 209 HTH_40 PF14493.1 91 0.0011 13.0 0.2 1 1 2.4e-05 0.0047 11.1 0.1 7 32 175 200 169 206 0.89 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 12_3 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.002 11.9 0.0 1 2 9.1e-05 0.018 8.8 0.0 1 22 2 23 2 44 0.81 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 12_3 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.002 11.9 0.0 2 2 0.026 5.2 0.8 0.0 110 135 96 122 94 136 0.74 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_12 - 119 HTH_38 PF13936.1 44 5e-08 26.3 0.1 1 1 1.2e-09 1.2e-07 25.1 0.1 5 42 2 39 2 39 0.94 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 9_7 - 209 HTH_38 PF13936.1 44 8.5e-06 19.2 1.4 1 1 1.4e-07 1.4e-05 18.5 0.0 9 41 170 202 168 205 0.93 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 2_23 - 876 MobB PF03205.9 140 0.0005 13.7 0.2 1 2 5.4e-05 0.0053 10.3 0.0 4 37 483 515 481 523 0.79 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_23 - 876 MobB PF03205.9 140 0.0005 13.7 0.2 2 2 0.069 6.7 0.3 0.0 25 64 695 732 690 744 0.86 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_5 - 727 MobB PF03205.9 140 0.0016 12.0 0.0 1 1 3.5e-05 0.0035 10.9 0.0 7 34 192 219 188 225 0.89 # 7260 # 9440 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 7_4 - 102 HTH_34 PF13601.1 80 9.2e-10 32.4 0.1 1 1 6.6e-12 1.3e-09 31.9 0.1 25 79 39 93 30 94 0.92 # 2458 # 2763 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 7_4 - 102 MarR PF01047.17 59 8.7e-05 16.1 0.0 1 1 6.2e-07 0.00012 15.6 0.0 29 58 40 69 13 70 0.92 # 2458 # 2763 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 16_1 - 296 Sigma54_DBD PF04552.8 160 0.0014 12.0 0.1 1 1 1.1e-05 0.0022 11.4 0.1 100 153 45 96 28 103 0.78 # 40 # 927 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 1_40 - 218 TetR_N PF00440.18 47 6.4e-20 64.5 0.1 1 2 1.3e-20 1.3e-18 60.3 0.0 2 47 19 64 18 64 0.97 # 34512 # 35165 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_40 - 218 TetR_N PF00440.18 47 6.4e-20 64.5 0.1 2 2 0.024 2.4 1.8 0.1 1 16 171 186 171 188 0.91 # 34512 # 35165 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 7_6 - 195 TetR_N PF00440.18 47 6.4e-08 26.0 0.0 1 1 1.3e-09 1.2e-07 25.1 0.0 2 46 13 57 12 58 0.95 # 4247 # 4831 # -1 # ID=7_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 2_4 - 1707 AAA_19 PF13245.1 76 2.3e-07 24.4 1.6 1 1 1.3e-08 8.5e-07 22.6 0.3 7 76 981 1047 974 1047 0.74 # 2140 # 7260 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 1_35 - 519 AAA_19 PF13245.1 76 2.3e-05 18.0 0.0 1 1 9.1e-07 6e-05 16.7 0.0 9 37 35 62 30 73 0.85 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 12_3 - 181 AAA_19 PF13245.1 76 0.00084 13.0 0.0 1 1 5.3e-05 0.0034 11.0 0.0 15 33 5 22 2 36 0.85 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 3_5 - 389 CbiA PF01656.18 195 2e-36 119.1 0.0 1 1 1.3e-38 2.6e-36 118.7 0.0 2 194 110 339 109 340 0.80 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_12 - 119 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 7.3e-05 16.1 0.0 1 1 1.9e-06 0.00012 15.4 0.0 31 47 22 38 9 39 0.92 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 5_5 - 230 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00053 13.3 0.0 1 1 1.6e-05 0.0011 12.4 0.0 26 48 169 191 159 194 0.84 # 3064 # 3753 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 1_30 - 230 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.00079 12.8 0.0 1 1 3.8e-05 0.0025 11.2 0.0 27 46 105 124 103 129 0.94 # 21479 # 22168 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 7_4 - 102 PadR PF03551.9 75 1.1e-22 73.4 0.5 1 1 8e-25 1.6e-22 73.0 0.5 1 74 15 84 15 85 0.97 # 2458 # 2763 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_14 - 326 Rep_3 PF01051.16 222 3.1e-33 109.0 0.1 1 1 4.3e-35 4.2e-33 108.6 0.1 3 214 10 265 8 271 0.90 # 9244 # 10221 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_44 - 284 Rep_3 PF01051.16 222 1.1e-05 18.9 0.0 1 1 1.5e-07 1.5e-05 18.6 0.0 48 167 116 231 97 254 0.80 # 38310 # 39161 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.660 16_1 - 296 rve PF00665.21 120 9.4e-28 90.6 0.1 1 1 6.6e-29 3.2e-27 88.9 0.0 2 119 125 239 124 240 0.97 # 40 # 927 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 12_5 - 225 rve PF00665.21 120 1.1e-19 64.6 0.0 1 1 7.3e-21 3.6e-19 62.9 0.0 2 95 104 193 103 196 0.92 # 2072 # 2746 # 1 # ID=12_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 7_5 - 255 rve PF00665.21 120 2.1e-13 44.3 0.0 1 2 0.082 4 1.5 0.0 83 102 30 49 7 51 0.90 # 2990 # 3754 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 7_5 - 255 rve PF00665.21 120 2.1e-13 44.3 0.0 2 2 6.7e-14 3.3e-12 40.5 0.0 8 117 73 179 69 182 0.90 # 2990 # 3754 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 18_1 - 227 rve PF00665.21 120 6.5e-13 42.7 0.1 1 2 0.067 3.3 1.7 0.0 78 102 19 41 9 46 0.84 # 53 # 733 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 18_1 - 227 rve PF00665.21 120 6.5e-13 42.7 0.1 2 2 2.2e-13 1.1e-11 38.8 0.0 9 119 67 174 62 175 0.89 # 53 # 733 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 1_35 - 519 AAA_23 PF13476.1 202 2e-12 41.7 0.6 1 1 5.5e-14 5.4e-12 40.3 0.5 1 177 16 236 16 403 0.70 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_8 - 276 AAA_23 PF13476.1 202 2.1e-05 18.7 0.2 1 1 3.8e-07 3.7e-05 17.9 0.2 21 40 35 54 22 64 0.86 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 12_3 - 181 AAA_24 PF13479.1 213 0.0002 14.9 0.0 1 1 2.5e-06 0.00024 14.5 0.0 6 33 3 34 1 99 0.87 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_35 - 519 AAA_24 PF13479.1 213 0.0021 11.5 0.9 1 3 0.0055 0.54 3.6 0.0 6 21 39 54 36 59 0.86 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 AAA_24 PF13479.1 213 0.0021 11.5 0.9 2 3 0.059 5.8 0.3 0.0 103 143 105 147 95 191 0.73 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 AAA_24 PF13479.1 213 0.0021 11.5 0.9 3 3 0.0045 0.44 3.9 0.1 114 156 247 291 238 307 0.74 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 3_19 - 188 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.9e-14 46.2 0.0 1 1 9e-16 8.8e-14 45.4 0.0 2 114 52 147 51 150 0.91 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 10_5 - 246 Methyltransf_26 PF13659.1 117 8.8e-09 29.3 0.0 1 1 1.5e-10 1.5e-08 28.6 0.0 2 83 31 106 30 200 0.81 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 12_3 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00016 14.7 0.0 1 2 4.2e-05 0.0041 10.1 0.0 19 50 3 32 1 39 0.78 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 12_3 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00016 14.7 0.0 2 2 0.009 0.88 2.4 0.0 94 123 73 102 57 160 0.77 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 4_12 - 1588 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0011 11.9 0.0 1 1 2.8e-05 0.0027 10.6 0.0 14 56 224 267 215 305 0.84 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 2_4 - 1707 AAA_30 PF13604.1 196 3.1e-42 138.2 22.3 1 2 1.8e-05 0.00089 12.7 3.7 7 132 420 539 416 559 0.83 # 2140 # 7260 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 2_4 - 1707 AAA_30 PF13604.1 196 3.1e-42 138.2 22.3 2 2 9.8e-44 4.8e-42 137.6 1.6 1 186 968 1156 968 1160 0.94 # 2140 # 7260 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 1_35 - 519 AAA_30 PF13604.1 196 0.00098 12.6 0.0 1 1 5.1e-05 0.0025 11.2 0.0 12 44 30 62 26 76 0.85 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_8 - 276 AAA_30 PF13604.1 196 0.0012 12.3 0.3 1 1 5.9e-05 0.0029 11.0 0.1 15 53 30 68 21 83 0.74 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_5 - 727 AAA_30 PF13604.1 196 0.0016 11.8 0.0 1 1 7.2e-05 0.0035 10.8 0.0 21 57 188 224 180 230 0.85 # 7260 # 9440 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_35 - 519 SMC_N PF02463.14 220 5.2e-15 49.1 3.0 1 2 6.5e-10 6.4e-08 25.9 0.1 2 45 14 57 13 62 0.92 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 SMC_N PF02463.14 220 5.2e-15 49.1 3.0 2 2 3.8e-09 3.7e-07 23.4 0.4 135 208 181 279 132 289 0.68 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_8 - 276 SMC_N PF02463.14 220 4.4e-08 26.4 0.2 1 1 1.1e-09 1.1e-07 25.1 0.2 25 198 34 201 22 218 0.75 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 16_2 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.3e-13 44.6 1.3 1 1 1.3e-14 5.2e-13 42.7 1.3 1 74 1 87 1 88 0.86 # 927 # 1253 # -1 # ID=16_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 6_11 - 119 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.5e-11 38.0 0.1 1 1 5.8e-13 2.3e-11 37.4 0.0 15 50 1 37 1 71 0.81 # 7779 # 8135 # -1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 12_4 - 104 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.7e-09 29.7 0.0 1 1 1.6e-10 6.4e-09 29.6 0.0 2 57 4 59 3 85 0.86 # 1764 # 2075 # 1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 3_25 - 24 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 4.6e-06 20.4 0.1 1 1 1.2e-07 4.6e-06 20.4 0.1 1 22 1 22 1 24 0.92 # 18837 # 18908 # 1 # ID=3_25;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 5_16 - 24 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 4.6e-06 20.4 0.1 1 1 1.2e-07 4.6e-06 20.4 0.1 1 22 1 22 1 24 0.92 # 8863 # 8934 # 1 # ID=5_16;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 5_5 - 230 GerE PF00196.14 58 2.7e-05 17.3 0.1 1 1 7e-07 6.9e-05 16.0 0.0 14 57 165 208 160 209 0.90 # 3064 # 3753 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 1_12 - 119 GerE PF00196.14 58 0.00019 14.6 0.0 1 1 3.5e-06 0.00034 13.8 0.0 17 40 16 39 9 40 0.83 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 2_5 - 727 TraG-D_C PF12696.2 128 1.4e-20 67.3 0.0 1 1 1.4e-22 2.7e-20 66.4 0.0 1 127 419 541 419 542 0.86 # 7260 # 9440 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 10_5 - 246 CMAS PF02353.15 273 0.00033 13.6 0.6 1 1 3e-06 0.00058 12.8 0.0 51 105 18 71 12 99 0.78 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 18_1 - 227 DDE_3 PF13358.1 146 0.0013 12.4 0.0 1 1 1.9e-05 0.0038 10.8 0.0 32 90 74 133 51 138 0.87 # 53 # 733 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 3_5 - 389 MipZ PF09140.6 261 8.4e-06 18.8 0.4 1 2 3.5e-06 0.00069 12.6 0.0 2 47 108 153 107 157 0.87 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_5 - 389 MipZ PF09140.6 261 8.4e-06 18.8 0.4 2 2 0.0011 0.22 4.4 0.0 88 134 224 270 197 292 0.84 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_19 - 188 Methyltransf_25 PF13649.1 101 0.00022 15.4 0.0 1 1 1.7e-06 0.00033 14.9 0.0 1 101 54 142 54 142 0.81 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 8_5 - 421 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.6e-34 113.2 0.2 1 1 3.4e-36 3.3e-34 112.1 0.0 6 213 128 362 123 362 0.96 # 3881 # 5143 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 8_3 - 323 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 4.8e-24 78.9 0.8 1 1 6.9e-26 6.8e-24 78.4 0.8 4 205 130 301 127 308 0.88 # 1753 # 2721 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.534 5_11 - 476 DivIC PF04977.10 80 0.0017 11.7 4.6 1 1 1.8e-05 0.0036 10.7 4.6 17 66 76 124 72 125 0.92 # 6274 # 7701 # 1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 1_35 - 519 AAA_21 PF13304.1 303 1.4e-22 74.8 11.6 1 1 3.1e-23 3e-21 70.4 8.0 1 297 38 268 38 272 0.64 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_8 - 276 AAA_21 PF13304.1 303 1.4e-17 58.4 0.0 1 2 2.6e-09 2.5e-07 24.7 0.0 1 25 35 63 35 100 0.77 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_8 - 276 AAA_21 PF13304.1 303 1.4e-17 58.4 0.0 2 2 1.7e-11 1.7e-09 31.9 0.0 232 298 138 201 107 203 0.84 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 7_4 - 102 Replic_Relax PF13814.1 191 6.8e-05 16.6 0.1 1 1 3.9e-07 7.6e-05 16.5 0.1 16 77 31 90 17 96 0.85 # 2458 # 2763 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_35 - 519 AAA PF00004.24 132 6.4e-07 23.5 0.2 1 2 0.00026 0.026 8.6 0.0 3 21 41 59 39 105 0.80 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 AAA PF00004.24 132 6.4e-07 23.5 0.2 2 2 2.3e-05 0.0023 12.0 0.3 39 115 208 275 174 288 0.78 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_12 - 1588 AAA PF00004.24 132 0.00014 15.9 0.0 1 1 3.9e-06 0.00038 14.5 0.0 1 94 229 318 229 343 0.70 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 4_7 - 653 KorB PF08535.5 93 0.00014 15.9 0.0 1 1 2.2e-06 0.00043 14.3 0.0 2 43 152 193 151 204 0.93 # 4840 # 6798 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 5_7 - 122 CTP_transf_2 PF01467.21 157 0.0015 12.4 0.0 1 1 8.5e-06 0.0017 12.3 0.0 32 67 7 41 2 98 0.65 # 4280 # 4645 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 10_2 - 114 Cpn60_TCP1 PF00118.19 485 0.00021 13.8 0.1 1 1 1.1e-06 0.00023 13.7 0.1 457 484 64 91 39 92 0.92 # 2157 # 2498 # -1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.637 6_9 - 74 FbpA PF05833.6 455 0.00067 12.1 3.6 1 1 3.7e-06 0.00072 12.0 3.6 396 451 9 63 2 67 0.77 # 7180 # 7401 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.518 1_39 - 400 TIGR01394 TIGR01394 594 0.0029 9.3 0.0 1 1 2.2e-05 0.0043 8.8 0.0 408 486 267 343 261 354 0.84 # 33234 # 34433 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 16_1 - 296 rve_2 PF13333.1 52 4e-08 27.1 0.0 1 1 4.2e-10 8.2e-08 26.1 0.0 1 44 230 276 230 283 0.88 # 40 # 927 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 3_5 - 389 MerR_1 PF13411.1 69 0.0007 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.0021 11.7 0.0 2 44 41 88 40 105 0.75 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 12_3 - 181 cobW PF02492.14 178 0.0015 11.9 0.0 1 1 1.3e-05 0.0025 11.1 0.0 2 21 2 21 1 29 0.81 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 2_5 - 727 AAA_16 PF13191.1 185 7e-06 20.0 0.0 1 1 8.7e-07 4.2e-05 17.4 0.0 21 60 182 222 179 263 0.81 # 7260 # 9440 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 4_12 - 1588 AAA_16 PF13191.1 185 0.0003 14.7 0.0 1 1 2.7e-05 0.0013 12.6 0.0 10 58 217 259 210 315 0.71 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 1_8 - 276 AAA_16 PF13191.1 185 0.00043 14.1 0.2 1 1 2.1e-05 0.001 12.9 0.0 12 63 23 74 16 92 0.72 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_35 - 519 AAA_16 PF13191.1 185 0.00046 14.0 0.1 1 2 0.00015 0.0073 10.1 0.0 27 46 39 58 34 67 0.86 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 AAA_16 PF13191.1 185 0.00046 14.0 0.1 2 2 0.08 3.9 1.2 0.0 138 166 215 243 183 266 0.72 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 10_5 - 246 NodS PF05401.6 201 5.1e-08 26.4 0.0 1 1 4.2e-10 8.3e-08 25.7 0.0 41 120 27 106 7 116 0.86 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 1_35 - 519 AAA_22 PF13401.1 131 4.9e-07 23.8 0.1 1 2 0.00027 0.017 9.1 0.0 6 27 38 59 34 89 0.85 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 AAA_22 PF13401.1 131 4.9e-07 23.8 0.1 2 2 3.4e-05 0.0022 12.0 0.1 69 121 209 265 165 275 0.77 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_12 - 1588 AAA_22 PF13401.1 131 1.9e-05 18.7 0.3 1 1 2.4e-06 0.00015 15.7 0.3 3 98 225 300 220 335 0.68 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 12_3 - 181 AAA_22 PF13401.1 131 3e-05 18.0 0.0 1 1 1.4e-06 9.2e-05 16.5 0.0 6 50 2 50 1 105 0.72 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 3_5 - 389 HTH_AraC PF00165.18 42 0.0018 12.1 0.0 1 1 1.8e-05 0.0035 11.1 0.0 4 26 35 57 33 62 0.81 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 7_4 - 102 DUF3116 PF11313.3 85 0.00081 12.9 0.1 1 1 5.7e-06 0.0011 12.4 0.1 49 83 50 88 39 90 0.75 # 2458 # 2763 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_35 - 519 AAA_29 PF13555.1 62 3e-09 30.2 0.0 1 1 1e-10 9.9e-09 28.5 0.0 15 51 29 64 14 67 0.82 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_8 - 276 AAA_29 PF13555.1 62 1.4e-06 21.6 0.2 1 1 3.4e-08 3.4e-06 20.4 0.2 18 44 29 54 14 63 0.83 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_12 - 119 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 0.00043 13.8 0.0 1 1 3.6e-06 0.00071 13.1 0.0 12 44 9 41 2 43 0.92 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_35 - 519 MutS_V PF00488.16 235 7.2e-05 16.1 1.2 1 2 3e-05 0.0059 9.9 0.1 37 67 32 60 5 64 0.78 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 MutS_V PF00488.16 235 7.2e-05 16.1 1.2 2 2 0.0013 0.26 4.4 0.1 117 177 222 281 209 301 0.71 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 9_7 - 209 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 0.00025 14.6 0.0 1 1 2.3e-06 0.00046 13.7 0.0 8 43 171 206 168 208 0.90 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 12_3 - 181 AAA_28 PF13521.1 163 0.0003 14.6 0.0 1 1 4.7e-06 0.00092 13.0 0.0 2 29 3 33 2 58 0.77 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_18 - 370 adh_short PF00106.20 167 0.0013 12.5 0.1 1 1 2.4e-05 0.0048 10.7 0.1 3 49 4 48 2 175 0.83 # 12901 # 14010 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 10_7 - 50 HTH_32 PF13565.1 77 4.2e-07 24.6 0.0 1 1 1.7e-08 4.8e-07 24.4 0.0 26 76 5 50 2 50 0.85 # 4631 # 4780 # 1 # ID=10_7;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 12_1 - 50 HTH_32 PF13565.1 77 4.2e-07 24.6 0.0 1 1 1.7e-08 4.8e-07 24.4 0.0 26 76 5 50 2 50 0.85 # 1 # 150 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 8_1 - 50 HTH_32 PF13565.1 77 4.2e-07 24.6 0.0 1 1 1.7e-08 4.8e-07 24.4 0.0 26 76 5 50 2 50 0.85 # 1 # 150 # -1 # ID=8_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 23_1 - 83 HTH_32 PF13565.1 77 5.2e-06 21.1 0.1 1 1 2e-07 5.6e-06 21.0 0.1 33 76 44 83 19 83 0.83 # 1 # 249 # -1 # ID=23_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.574 18_1 - 227 HTH_32 PF13565.1 77 2.3e-05 19.0 1.0 1 1 2.2e-06 6.2e-05 17.6 0.2 41 76 11 42 2 43 0.79 # 53 # 733 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 6_8 - 159 HTH_32 PF13565.1 77 0.00037 15.2 0.1 1 1 2.7e-05 0.00075 14.2 0.1 33 77 10 53 6 53 0.77 # 6347 # 6823 # 1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 7_5 - 255 HTH_32 PF13565.1 77 0.00038 15.1 0.2 1 1 4.7e-05 0.0013 13.4 0.2 37 76 15 50 6 51 0.83 # 2990 # 3754 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 8_5 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 6.3e-27 87.6 3.5 1 2 0.0052 1 1.2 0.0 11 42 5 36 3 62 0.72 # 3881 # 5143 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 8_5 - 421 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 6.3e-27 87.6 3.5 2 2 1.5e-28 2.9e-26 85.4 2.2 137 438 122 418 41 420 0.82 # 3881 # 5143 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 1_18 - 370 Epimerase PF01370.16 236 3.5e-12 40.1 0.0 1 1 2.7e-14 5.3e-12 39.5 0.0 2 174 5 195 4 255 0.70 # 12901 # 14010 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 1_12 - 119 HTH_23 PF13384.1 50 1.2e-07 25.1 0.1 1 1 1.5e-08 2.3e-07 24.2 0.1 9 39 9 39 8 40 0.92 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 6_11 - 119 HTH_23 PF13384.1 50 2e-07 24.4 0.0 1 1 1.8e-08 2.7e-07 24.0 0.0 11 45 2 37 1 43 0.87 # 7779 # 8135 # -1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 18_1 - 227 HTH_23 PF13384.1 50 2e-05 18.1 1.2 1 1 2.3e-05 0.00035 14.1 0.1 28 42 33 47 32 55 0.87 # 53 # 733 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 4_7 - 653 HTH_23 PF13384.1 50 2e-05 18.0 0.0 1 1 7.4e-06 0.00011 15.7 0.0 13 40 149 176 143 180 0.91 # 4840 # 6798 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 16_2 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 2.1e-05 18.0 0.5 1 1 2.7e-06 4.1e-05 17.1 0.1 5 42 10 55 8 65 0.86 # 927 # 1253 # -1 # ID=16_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 9_7 - 209 HTH_23 PF13384.1 50 0.0001 15.8 0.3 1 1 6.9e-06 0.0001 15.8 0.3 5 39 169 203 165 207 0.87 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_30 - 230 HTH_23 PF13384.1 50 0.00015 15.2 0.0 1 1 2.4e-05 0.00036 14.1 0.0 8 38 92 125 82 127 0.83 # 21479 # 22168 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_27 - 264 HTH_23 PF13384.1 50 0.00056 13.4 0.1 1 1 9.1e-05 0.0014 12.2 0.1 24 43 161 180 161 188 0.79 # 19076 # 19867 # -1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 12_4 - 104 HTH_23 PF13384.1 50 0.00072 13.1 0.0 1 1 6.3e-05 0.00095 12.7 0.0 7 48 14 55 8 57 0.82 # 1764 # 2075 # 1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 10_7 - 50 HTH_23 PF13384.1 50 0.0011 12.5 1.6 1 2 0.012 0.19 5.4 0.1 7 27 11 35 7 36 0.72 # 4631 # 4780 # 1 # ID=10_7;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 10_7 - 50 HTH_23 PF13384.1 50 0.0011 12.5 1.6 2 2 0.0052 0.078 6.6 0.3 28 37 41 50 40 50 0.92 # 4631 # 4780 # 1 # ID=10_7;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 12_1 - 50 HTH_23 PF13384.1 50 0.0011 12.5 1.6 1 2 0.012 0.19 5.4 0.1 7 27 11 35 7 36 0.72 # 1 # 150 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 12_1 - 50 HTH_23 PF13384.1 50 0.0011 12.5 1.6 2 2 0.0052 0.078 6.6 0.3 28 37 41 50 40 50 0.92 # 1 # 150 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 8_1 - 50 HTH_23 PF13384.1 50 0.0011 12.5 1.6 1 2 0.012 0.19 5.4 0.1 7 27 11 35 7 36 0.72 # 1 # 150 # -1 # ID=8_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 8_1 - 50 HTH_23 PF13384.1 50 0.0011 12.5 1.6 2 2 0.0052 0.078 6.6 0.3 28 37 41 50 40 50 0.92 # 1 # 150 # -1 # ID=8_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_40 - 218 HTH_23 PF13384.1 50 0.0016 12.0 0.2 1 1 0.00059 0.0089 9.6 0.0 10 35 22 51 14 64 0.75 # 34512 # 35165 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 2_10 - 131 zf-DHHC PF01529.15 174 0.015 8.6 3.7 1 1 0.00011 0.021 8.1 3.7 90 166 28 107 24 123 0.43 # 15125 # 15517 # -1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 9_7 - 209 HTH_7 PF02796.10 45 5.5e-13 42.5 0.5 1 1 1.9e-14 1.2e-12 41.4 0.1 1 44 164 204 164 205 0.97 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_12 - 119 HTH_7 PF02796.10 45 3.1e-06 20.9 0.2 1 1 9.2e-08 6e-06 20.0 0.2 7 42 3 38 1 40 0.91 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 5_5 - 230 HTH_7 PF02796.10 45 1.2e-05 19.0 0.1 1 1 4.5e-07 2.9e-05 17.7 0.1 11 37 159 185 128 188 0.87 # 3064 # 3753 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 4_12 - 1588 NB-ARC PF00931.17 287 1.4e-05 17.9 0.4 1 1 3.5e-07 6.8e-05 15.6 0.4 9 50 216 254 209 349 0.71 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 7_4 - 102 FeoC PF09012.5 69 0.0018 11.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.0027 11.3 0.0 24 48 38 62 30 72 0.81 # 2458 # 2763 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_18 - 370 NAD_binding_10 PF13460.1 183 2.7e-06 21.3 0.0 1 1 1.6e-06 0.00032 14.6 0.0 2 148 5 193 4 204 0.70 # 12901 # 14010 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 1_12 - 119 HTH_29 PF13551.1 112 0.0002 15.4 0.0 1 1 5.2e-06 0.00034 14.6 0.0 8 34 14 39 8 51 0.84 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 6_11 - 119 HTH_29 PF13551.1 112 0.00021 15.3 0.0 1 1 3.5e-06 0.00023 15.2 0.0 11 40 9 37 1 87 0.79 # 7779 # 8135 # -1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 9_7 - 209 HTH_29 PF13551.1 112 0.00031 14.8 0.5 1 1 3.7e-05 0.0024 11.9 0.0 4 35 174 204 171 207 0.90 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 3_19 - 188 Met_10 PF02475.11 200 0.001 12.5 0.0 1 1 7e-06 0.0014 12.1 0.0 99 189 48 132 38 145 0.78 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 18_1 - 227 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 6e-12 39.1 0.3 1 1 2.3e-13 7.6e-12 38.8 0.3 8 132 5 136 1 167 0.87 # 53 # 733 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 7_5 - 255 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 2.2e-09 30.7 0.4 1 1 1e-10 3.3e-09 30.2 0.4 11 133 16 144 8 183 0.86 # 2990 # 3754 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 10_7 - 50 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 0.00026 14.1 0.0 1 1 7.9e-06 0.00026 14.1 0.0 4 45 9 50 6 50 0.91 # 4631 # 4780 # 1 # ID=10_7;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 12_1 - 50 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 0.00026 14.1 0.0 1 1 7.9e-06 0.00026 14.1 0.0 4 45 9 50 6 50 0.91 # 1 # 150 # -1 # ID=12_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 8_1 - 50 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 0.00026 14.1 0.0 1 1 7.9e-06 0.00026 14.1 0.0 4 45 9 50 6 50 0.91 # 1 # 150 # -1 # ID=8_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 23_1 - 83 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 0.0012 11.9 0.0 1 1 4.4e-05 0.0014 11.7 0.0 6 45 44 83 40 83 0.90 # 1 # 249 # -1 # ID=23_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.574 10_5 - 246 Methyltransf_31 PF13847.1 152 2.1e-07 24.5 0.1 1 1 3.1e-09 3e-07 24.0 0.1 2 76 28 97 27 213 0.87 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 3_19 - 188 Methyltransf_31 PF13847.1 152 1.2e-06 22.0 0.0 1 1 1.5e-08 1.5e-06 21.7 0.0 5 119 52 162 48 183 0.83 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 1_35 - 519 Arch_ATPase PF01637.13 234 9.7e-07 22.5 0.6 1 2 1.7e-05 0.0017 11.9 0.0 7 42 24 58 19 115 0.89 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 Arch_ATPase PF01637.13 234 9.7e-07 22.5 0.6 2 2 0.00023 0.023 8.2 0.5 103 163 212 267 137 284 0.82 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_12 - 1588 Arch_ATPase PF01637.13 234 8.2e-06 19.5 3.0 1 1 9.6e-08 9.4e-06 19.3 0.3 3 83 211 306 210 354 0.66 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 2_5 - 727 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 3.9e-150 493.5 0.0 1 1 4.9e-152 4.8e-150 493.3 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 7260 # 9440 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 2_23 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 7.9e-07 21.8 0.1 1 2 4.8e-08 4.7e-06 19.2 0.0 15 53 479 517 470 547 0.80 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_23 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 7.9e-07 21.8 0.1 2 2 0.041 4 -0.3 0.0 261 317 713 769 684 772 0.92 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 3_5 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 8.6e-08 25.3 0.1 1 2 2.6e-06 0.00051 13.0 0.0 3 37 108 142 106 145 0.93 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_5 - 389 TIGR01968 TIGR01968 261 8.6e-08 25.3 0.1 2 2 1.5e-05 0.003 10.4 0.0 104 145 227 268 215 340 0.81 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 12_3 - 181 AAA_18 PF13238.1 129 3.9e-09 30.8 0.0 1 1 7.8e-11 7.6e-09 29.8 0.0 1 126 3 134 3 137 0.76 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 4_12 - 1588 AAA_18 PF13238.1 129 0.00031 14.9 0.1 1 1 2.7e-05 0.0027 11.9 0.1 1 106 229 353 229 368 0.76 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 1_35 - 519 TIGR00611 TIGR00611 365 0.0011 11.7 0.0 1 1 1.1e-05 0.0022 10.7 0.0 21 45 33 58 13 64 0.73 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 3_19 - 188 Methyltransf_12 PF08242.7 99 2.2e-05 18.8 0.0 1 1 2e-07 3.9e-05 18.0 0.0 1 99 55 144 55 144 0.86 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 3_19 - 188 Methyltrans_SAM PF10672.4 286 0.0018 11.0 0.0 1 1 1.3e-05 0.0026 10.5 0.0 196 261 113 173 100 180 0.78 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 4_12 - 1588 DUF258 PF03193.11 161 9.6e-05 15.5 0.0 1 1 2.5e-06 0.00025 14.1 0.0 14 62 204 253 191 264 0.81 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 1_8 - 276 DUF258 PF03193.11 161 0.00047 13.2 0.1 1 1 8.7e-06 0.00085 12.4 0.1 25 67 22 65 2 71 0.79 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_23 - 876 DUF87 PF01935.12 229 2.2e-07 24.7 0.0 1 1 3.3e-09 6.4e-07 23.2 0.0 26 222 482 669 468 676 0.77 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 12_4 - 104 HTH_28 PF13518.1 52 1.8e-07 25.0 0.0 1 1 9.2e-09 3e-07 24.2 0.0 1 41 13 53 13 58 0.93 # 1764 # 2075 # 1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 18_1 - 227 HTH_28 PF13518.1 52 0.00011 16.1 1.2 1 1 1.5e-05 0.00048 14.0 1.2 22 36 32 46 5 47 0.76 # 53 # 733 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 6_11 - 119 HTH_28 PF13518.1 52 0.00015 15.6 0.1 1 1 6.9e-06 0.00022 15.1 0.1 15 41 12 38 2 42 0.91 # 7779 # 8135 # -1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.499 9_7 - 209 HTH_28 PF13518.1 52 0.00036 14.4 0.0 1 1 3e-05 0.001 13.0 0.0 8 33 177 202 171 207 0.82 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_30 - 230 HTH_28 PF13518.1 52 0.00037 14.4 0.0 1 1 3.5e-05 0.0011 12.8 0.0 11 33 101 125 91 135 0.79 # 21479 # 22168 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_12 - 119 HTH_28 PF13518.1 52 0.00082 13.3 0.1 1 1 5.5e-05 0.0018 12.2 0.1 14 34 19 39 8 40 0.74 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 7_4 - 102 HTH_12 PF08461.5 66 5.2e-06 20.0 0.7 1 1 4.3e-08 8.5e-06 19.3 0.7 6 65 15 82 12 83 0.77 # 2458 # 2763 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_40 - 218 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.0015 12.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.0021 11.7 0.0 22 77 24 73 5 79 0.76 # 34512 # 35165 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_12 - 119 HTH_24 PF13412.1 48 0.0017 11.7 0.0 1 1 1.8e-05 0.0035 10.6 0.0 21 39 21 39 20 40 0.94 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 3_19 - 188 TIGR03533 TIGR03533 284 4.3e-05 16.5 0.0 1 1 3.5e-07 6.8e-05 15.8 0.0 116 210 45 133 37 141 0.87 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 3_19 - 188 TIGR03534 TIGR03534 253 6.2e-08 25.9 0.0 1 1 7.4e-10 7.3e-08 25.7 0.0 81 175 45 131 11 148 0.85 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 10_5 - 246 TIGR03534 TIGR03534 253 1.3e-06 21.6 0.0 1 1 2.5e-08 2.4e-06 20.7 0.0 73 166 14 103 12 119 0.80 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 7_4 - 102 FUR PF01475.14 120 3.9e-05 17.4 0.0 1 1 4.2e-07 4.1e-05 17.4 0.0 29 74 29 77 12 99 0.79 # 2458 # 2763 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 6_8 - 159 FUR PF01475.14 120 4.9e-05 17.1 0.0 1 1 7.7e-07 7.6e-05 16.5 0.0 13 55 16 59 11 76 0.78 # 6347 # 6823 # 1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_8 - 276 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00073 13.4 0.5 1 1 6.4e-06 0.0013 12.6 0.5 2 21 36 55 35 200 0.75 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_12 - 1588 Miro PF08477.8 119 0.00034 15.0 0.1 1 1 5.6e-06 0.0011 13.3 0.1 2 44 229 270 227 302 0.73 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 3_5 - 389 HTH_31 PF13560.1 64 0.00025 15.1 0.4 1 1 3.8e-06 0.00074 13.6 0.2 12 45 37 69 31 73 0.87 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 10_5 - 246 Methyltransf_32 PF13679.1 141 2.4e-05 17.9 0.0 1 1 1.9e-07 3.7e-05 17.3 0.0 12 70 17 68 9 121 0.82 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 2_4 - 1707 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.8e-07 24.6 0.7 1 2 0.012 2.4 2.2 0.0 6 44 1227 1265 1223 1295 0.74 # 2140 # 7260 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 2_4 - 1707 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.8e-07 24.6 0.7 2 2 5e-08 9.8e-06 19.6 0.2 3 102 1341 1444 1339 1446 0.77 # 2140 # 7260 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 10_5 - 246 TIGR00755 TIGR00755 256 3.1e-44 144.7 2.8 1 1 3.9e-46 3.8e-44 144.4 2.8 5 227 5 221 1 235 0.88 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 3_19 - 188 TIGR00755 TIGR00755 256 5e-09 29.3 0.0 1 1 6.8e-11 6.7e-09 28.9 0.0 8 105 29 123 25 134 0.90 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 1_12 - 119 HTH_36 PF13730.1 55 0.00063 13.8 0.0 1 1 5.7e-06 0.0011 12.9 0.0 28 47 20 39 3 40 0.88 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_35 - 519 NACHT PF05729.7 166 4.3e-06 20.3 0.0 1 2 7.2e-06 0.00071 13.1 0.0 3 41 39 78 37 92 0.80 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 NACHT PF05729.7 166 4.3e-06 20.3 0.0 2 2 0.0026 0.25 4.8 0.0 72 109 218 249 177 293 0.72 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 12_3 - 181 NACHT PF05729.7 166 0.00016 15.2 0.1 1 1 4.2e-06 0.00041 13.9 0.0 2 21 2 21 1 29 0.91 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 12_3 - 181 AAA_17 PF13207.1 121 4.7e-06 21.3 0.0 1 1 1.4e-07 9.4e-06 20.3 0.0 1 32 2 34 2 175 0.59 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_35 - 519 AAA_17 PF13207.1 121 0.00058 14.6 0.0 1 1 6.1e-05 0.004 11.8 0.0 3 25 40 66 39 122 0.84 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 2_5 - 727 AAA_17 PF13207.1 121 0.00065 14.4 0.0 1 1 2.4e-05 0.0016 13.2 0.0 3 28 189 218 187 336 0.74 # 7260 # 9440 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_8 - 276 TIGR02211 TIGR02211 221 8.1e-25 81.1 0.0 1 1 1.2e-26 1.1e-24 80.6 0.0 19 212 21 212 7 221 0.84 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_35 - 519 TIGR02211 TIGR02211 221 1.5e-06 21.4 1.5 1 2 8.4e-07 8.2e-05 15.7 0.0 21 60 25 65 12 74 0.78 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 TIGR02211 TIGR02211 221 1.5e-06 21.4 1.5 2 2 0.0036 0.35 3.8 0.2 141 212 207 279 181 287 0.78 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_45 - 236 AAA_25 PF13481.1 194 1e-24 80.8 0.0 1 1 2.1e-26 1.4e-24 80.4 0.0 48 193 1 140 1 141 0.86 # 39148 # 39855 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.679 1_35 - 519 AAA_25 PF13481.1 194 0.00046 13.5 0.0 1 1 1.6e-05 0.001 12.3 0.0 30 58 33 61 22 84 0.80 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_8 - 276 AAA_25 PF13481.1 194 0.0013 12.0 0.1 1 1 6.5e-05 0.0043 10.3 0.1 30 57 30 57 23 87 0.85 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_4 - 1707 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0017 11.7 0.0 1 2 0.00032 0.063 6.6 0.0 1 23 988 1011 988 1151 0.76 # 2140 # 7260 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 2_4 - 1707 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0017 11.7 0.0 2 2 0.0064 1.2 2.3 0.0 171 234 1387 1447 1342 1447 0.63 # 2140 # 7260 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 10_5 - 246 DOT1 PF08123.8 205 6.4e-05 16.2 0.2 1 1 8.2e-07 0.00016 14.9 0.0 28 88 15 73 11 100 0.79 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 1_35 - 519 AAA_15 PF13175.1 415 6.4e-14 45.6 19.0 1 2 9.7e-09 9.5e-07 22.0 5.1 2 91 15 146 14 177 0.63 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 AAA_15 PF13175.1 415 6.4e-14 45.6 19.0 2 2 6.8e-10 6.6e-08 25.8 10.5 285 410 148 268 137 272 0.75 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_8 - 276 AAA_15 PF13175.1 415 3.9e-07 23.2 0.0 1 2 3e-05 0.0029 10.5 0.0 23 42 34 53 19 86 0.82 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_8 - 276 AAA_15 PF13175.1 415 3.9e-07 23.2 0.0 2 2 2.4e-05 0.0024 10.8 0.0 370 410 160 200 151 202 0.91 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_23 - 876 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0017 11.5 0.0 1 1 2.3e-05 0.0045 10.1 0.0 7 38 473 504 469 519 0.85 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_35 - 519 AAA_14 PF13173.1 128 4.6e-06 20.4 0.1 1 2 0.00035 0.034 7.9 0.0 5 27 39 61 36 79 0.84 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 AAA_14 PF13173.1 128 4.6e-06 20.4 0.1 2 2 0.00016 0.016 9.0 0.2 50 102 218 273 172 298 0.60 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_12 - 1588 AAA_14 PF13173.1 128 0.00057 13.7 0.2 1 1 5.8e-06 0.00057 13.7 0.2 2 101 226 333 225 340 0.72 # 8815 # 13578 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 3_5 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00013 14.9 0.1 1 2 0.00028 0.055 6.3 0.0 4 42 109 147 107 154 0.91 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_5 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00013 14.9 0.1 2 2 0.0003 0.059 6.2 0.1 84 139 235 290 222 312 0.77 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 7_4 - 102 Penicillinase_R PF03965.11 115 5e-05 17.3 0.0 1 1 2.8e-07 5.6e-05 17.1 0.0 22 58 28 67 13 99 0.81 # 2458 # 2763 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 11_4 - 341 Transposase_20 PF02371.11 87 6.9e-30 96.9 0.1 1 1 1.5e-31 1.5e-29 95.9 0.1 2 76 212 286 211 297 0.94 # 2050 # 3072 # -1 # ID=11_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 3_12 - 324 Transposase_20 PF02371.11 87 5.2e-19 62.1 0.2 1 1 1.2e-20 1.2e-18 61.0 0.2 2 87 196 279 195 279 0.96 # 8656 # 9627 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_18 - 370 3Beta_HSD PF01073.14 280 1.1e-08 27.9 0.0 1 1 8.7e-11 1.7e-08 27.3 0.0 1 158 5 175 5 196 0.75 # 12901 # 14010 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 12_4 - 104 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00017 14.6 0.0 1 1 3.5e-06 0.00035 13.6 0.0 7 44 4 42 4 45 0.93 # 1764 # 2075 # 1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 1_12 - 119 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00025 14.1 0.0 1 1 6.2e-06 0.00061 12.9 0.0 31 49 21 39 20 40 0.90 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 3_5 - 389 MerR PF00376.18 38 7.4e-07 22.6 0.0 1 1 1.8e-08 1.7e-06 21.4 0.0 1 28 41 68 41 74 0.95 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_12 - 119 MerR PF00376.18 38 0.0018 11.8 3.0 1 2 0.00027 0.027 8.0 0.1 4 21 22 39 19 49 0.84 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_12 - 119 MerR PF00376.18 38 0.0018 11.8 3.0 2 2 0.0054 0.53 3.8 0.7 14 22 90 98 89 110 0.69 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 12_3 - 181 AAA_33 PF13671.1 143 6e-10 33.0 0.0 1 1 8.5e-12 8.4e-10 32.6 0.0 2 127 3 130 2 151 0.73 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_8 - 276 AAA_33 PF13671.1 143 1.5e-05 18.7 0.1 1 1 6.7e-07 6.6e-05 16.7 0.1 3 33 37 82 35 203 0.61 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_2 - 150 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00081 12.7 0.1 1 1 1.9e-05 0.0037 10.6 0.1 11 36 113 145 111 147 0.75 # 483 # 932 # -1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 11_4 - 341 HHH PF00633.18 30 0.0019 11.8 0.1 1 1 2.7e-05 0.0053 10.4 0.1 13 24 214 225 214 230 0.92 # 2050 # 3072 # -1 # ID=11_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_8 - 276 SbcCD_C PF13558.1 90 1.3e-06 22.1 0.0 1 1 4.8e-08 9.3e-06 19.4 0.0 26 89 136 186 119 187 0.79 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 2_5 - 727 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.1e-09 31.2 0.0 1 1 3.1e-11 3.1e-09 29.7 0.0 264 361 382 476 198 500 0.83 # 7260 # 9440 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 2_23 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.0004 12.8 0.0 1 2 0.0031 0.31 3.3 0.0 105 184 533 606 470 625 0.82 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_23 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.0004 12.8 0.0 2 2 0.00021 0.021 7.2 0.0 319 378 711 769 662 771 0.90 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 3_19 - 188 MTS PF05175.9 170 1.7e-09 31.1 0.0 1 1 2.4e-11 2.3e-09 30.7 0.0 31 141 50 149 41 166 0.84 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 10_5 - 246 MTS PF05175.9 170 1.2e-07 25.1 0.0 1 1 2e-09 2e-07 24.4 0.0 24 118 22 113 9 121 0.85 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 6_8 - 159 Arg_repressor PF01316.16 70 1.1e-15 50.9 0.2 1 1 9.1e-18 1.8e-15 50.2 0.2 10 67 17 75 8 78 0.90 # 6347 # 6823 # 1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 10_5 - 246 Methyltransf_23 PF13489.1 161 2e-06 21.5 0.1 1 1 2.9e-08 5.8e-06 20.0 0.1 7 60 16 85 9 225 0.83 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 12_3 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 2.6e-05 17.8 0.0 1 2 1e-05 0.002 11.6 0.0 4 24 2 22 1 30 0.89 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 12_3 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 2.6e-05 17.8 0.0 2 2 0.0021 0.41 4.1 0.1 34 72 107 147 91 157 0.86 # 1130 # 1672 # 1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.560 1_35 - 519 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00011 15.8 0.5 1 2 0.0004 0.078 6.5 0.0 4 22 41 59 39 72 0.82 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00011 15.8 0.5 2 2 0.00033 0.065 6.8 0.3 86 148 219 283 191 296 0.80 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_20 - 168 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 7.9e-80 259.2 1.0 1 1 3.4e-81 9.4e-80 259.0 1.0 1 131 37 167 37 167 0.99 # 14771 # 15274 # -1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.554 1_10 - 168 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 2e-79 257.9 0.8 1 1 8.6e-81 2.4e-79 257.7 0.8 1 131 37 167 37 167 0.99 # 6812 # 7315 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.544 3_4 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 6.6e-76 246.5 1.5 1 1 2.6e-77 7.3e-76 246.4 1.5 7 131 1 125 1 125 1.00 # 2657 # 3034 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 3_10 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.6e-75 245.3 1.3 1 1 6.3e-77 1.8e-75 245.2 1.3 7 131 1 125 1 125 1.00 # 7524 # 7901 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 6_12 - 103 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 5.6e-57 185.3 0.4 1 1 2.2e-58 6.2e-57 185.2 0.4 31 131 2 102 1 102 0.99 # 8250 # 8558 # -1 # ID=6_12;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.528 22_1 - 65 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1e-38 126.2 0.5 1 1 4e-40 1.1e-38 126.1 0.5 7 71 1 65 1 65 0.99 # 2 # 196 # -1 # ID=22_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 1_1 - 74 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.9e-21 70.4 0.1 1 1 9.8e-23 2.8e-21 69.9 0.1 55 97 1 43 1 49 0.96 # 3 # 224 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.541 7_5 - 255 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 2e-53 174.0 0.0 1 1 6.5e-55 2.6e-53 173.6 0.0 3 139 73 211 71 212 0.98 # 2990 # 3754 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 18_1 - 227 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.4e-52 171.3 0.0 1 1 4.8e-54 1.9e-52 170.8 0.0 4 139 67 204 65 205 0.99 # 53 # 733 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.532 16_1 - 296 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 7.9e-08 26.2 0.0 1 1 3.2e-09 1.2e-07 25.6 0.0 3 137 131 267 129 269 0.92 # 40 # 927 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 12_5 - 225 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.4e-07 25.5 0.0 1 1 5.2e-09 2e-07 24.9 0.0 2 68 109 175 108 181 0.94 # 2072 # 2746 # 1 # ID=12_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 3_10 - 126 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 0.0013 12.6 0.3 1 1 0.00013 0.0049 10.7 0.3 10 112 7 96 1 124 0.71 # 7524 # 7901 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.537 6_8 - 159 HTH_26 PF13443.1 63 0.0002 15.4 0.0 1 1 1.8e-06 0.00035 14.7 0.0 4 32 19 54 18 62 0.87 # 6347 # 6823 # 1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_35 - 519 TIGR00634 TIGR00634 563 0.00052 12.5 0.1 1 2 0.00023 0.045 6.1 0.0 1 43 13 57 13 65 0.88 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 TIGR00634 TIGR00634 563 0.00052 12.5 0.1 2 2 0.00076 0.15 4.4 0.0 442 511 209 278 195 311 0.80 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_30 - 230 HTH_17 PF12728.2 51 6.7e-05 17.0 0.0 1 2 0.094 9.2 0.5 0.0 30 49 80 100 63 102 0.69 # 21479 # 22168 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_30 - 230 HTH_17 PF12728.2 51 6.7e-05 17.0 0.0 2 2 6.8e-06 0.00066 13.8 0.0 1 27 104 130 104 143 0.86 # 21479 # 22168 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_12 - 119 HTH_17 PF12728.2 51 0.00053 14.1 1.4 1 2 3.1e-05 0.003 11.7 0.0 6 41 22 56 20 65 0.77 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_12 - 119 HTH_17 PF12728.2 51 0.00053 14.1 1.4 2 2 0.057 5.5 1.2 0.4 14 34 88 109 82 116 0.81 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 10_1 - 511 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0077 10.1 6.7 1 2 0.0015 0.29 5.1 4.6 8 35 84 109 83 114 0.87 # 398 # 1930 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_1 - 511 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0077 10.1 6.7 2 2 0.0027 0.54 4.2 0.0 22 38 454 469 447 473 0.76 # 398 # 1930 # -1 # ID=10_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 1_18 - 370 NAD_binding_4 PF07993.7 249 1.8e-53 174.8 0.0 1 1 1.1e-55 2.3e-53 174.5 0.0 1 248 6 237 6 238 0.94 # 12901 # 14010 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 6_5 - 304 TIGR02075 TIGR02075 233 0.00084 12.5 0.1 1 2 0.013 2.6 1.1 0.0 5 90 8 98 4 128 0.67 # 2812 # 3723 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 6_5 - 304 TIGR02075 TIGR02075 233 0.00084 12.5 0.1 2 2 0.0001 0.02 8.0 0.1 135 166 206 236 158 252 0.70 # 2812 # 3723 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.577 1_12 - 119 HTH_11 PF08279.7 55 3.4e-05 17.3 0.0 1 1 3.5e-07 6.8e-05 16.4 0.0 18 37 20 39 5 40 0.80 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 8_3 - 323 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 3.2e-48 156.5 0.0 1 2 2.4e-49 4.7e-47 152.7 0.0 1 112 34 145 34 145 0.96 # 1753 # 2721 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.534 8_3 - 323 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 3.2e-48 156.5 0.0 2 2 0.034 6.6 0.8 0.0 42 67 278 305 249 312 0.82 # 1753 # 2721 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.534 1_12 - 119 Sigma70_ECF PF07638.6 185 0.00047 13.7 0.0 1 1 3.8e-06 0.00074 13.1 0.0 143 174 9 40 2 52 0.86 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 9_7 - 209 TrmB PF01978.14 68 0.00014 15.5 0.0 1 1 2.7e-06 0.00026 14.5 0.0 19 44 178 203 173 204 0.89 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 7_4 - 102 TrmB PF01978.14 68 0.00049 13.7 0.1 1 1 1.5e-05 0.0014 12.2 0.1 34 62 40 73 31 78 0.84 # 2458 # 2763 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 7_8 - 302 LYTB PF02401.13 281 0.0013 11.5 0.0 1 1 2e-05 0.0039 9.9 0.0 236 272 81 117 70 124 0.91 # 6066 # 6971 # -1 # ID=7_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 1_12 - 119 LacI PF00356.16 46 0.00053 13.5 0.0 1 1 5.9e-06 0.0012 12.4 0.0 2 34 20 52 19 62 0.91 # 8142 # 8498 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 12_4 - 104 Phage_terminase PF10668.4 60 0.00063 13.4 0.0 1 1 4.9e-06 0.00096 12.8 0.0 11 44 14 47 1 49 0.77 # 1764 # 2075 # 1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 8_6 - 292 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.018 9.0 13.5 1 4 0.02 3.9 1.4 0.1 57 104 11 59 2 63 0.69 # 5500 # 6375 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 8_6 - 292 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.018 9.0 13.5 2 4 0.0053 1 3.3 0.8 39 96 39 107 17 111 0.52 # 5500 # 6375 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 8_6 - 292 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.018 9.0 13.5 3 4 0.00048 0.095 6.6 0.1 27 59 90 122 75 144 0.84 # 5500 # 6375 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 8_6 - 292 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.018 9.0 13.5 4 4 0.00026 0.051 7.5 1.6 17 107 162 251 155 252 0.76 # 5500 # 6375 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 2_23 - 876 AAA_10 PF12846.2 304 7.6e-49 160.6 0.0 1 1 2.6e-50 1.3e-48 159.8 0.0 1 294 479 768 479 774 0.88 # 22825 # 25452 # -1 # ID=2_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 2_5 - 727 AAA_10 PF12846.2 304 1.9e-10 34.5 0.0 1 1 7.1e-11 3.5e-09 30.3 0.0 3 296 187 494 186 500 0.69 # 7260 # 9440 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_35 - 519 AAA_10 PF12846.2 304 0.00027 14.3 0.1 1 2 7.4e-05 0.0036 10.6 0.0 3 22 38 57 36 67 0.86 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_35 - 519 AAA_10 PF12846.2 304 0.00027 14.3 0.1 2 2 0.058 2.9 1.0 0.0 212 261 222 268 202 273 0.80 # 28055 # 29611 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_8 - 276 AAA_10 PF12846.2 304 0.00036 13.9 1.4 1 2 4e-05 0.0019 11.4 1.0 4 34 36 66 33 159 0.89 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_8 - 276 AAA_10 PF12846.2 304 0.00036 13.9 1.4 2 2 0.081 4 0.6 0.0 242 266 181 205 170 210 0.87 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_14 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.00015 15.4 0.0 1 2 0.0022 0.14 5.9 0.0 24 47 102 125 97 125 0.89 # 9244 # 10221 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_14 - 326 HTH_20 PF12840.2 61 0.00015 15.4 0.0 2 2 0.001 0.067 6.9 0.1 19 58 213 259 185 262 0.77 # 9244 # 10221 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 9_7 - 209 HTH_20 PF12840.2 61 0.00019 15.1 0.1 1 1 3.5e-05 0.0023 11.6 0.1 3 43 133 200 131 203 0.91 # 5862 # 6488 # -1 # ID=9_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 1_40 - 218 HTH_20 PF12840.2 61 0.00042 14.0 0.1 1 1 5.1e-05 0.0033 11.1 0.0 21 46 30 55 18 63 0.85 # 34512 # 35165 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 10_5 - 246 PCMT PF01135.14 210 1.5e-06 21.7 0.0 1 1 1.6e-08 3.1e-06 20.7 0.0 58 122 14 75 2 87 0.83 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 10_5 - 246 RrnaAD PF00398.15 262 5.8e-74 242.2 6.7 1 1 6.6e-76 6.4e-74 242.1 6.7 3 261 2 242 1 243 0.96 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 3_19 - 188 RrnaAD PF00398.15 262 6.7e-09 28.9 0.0 1 1 8.8e-11 8.6e-09 28.6 0.0 9 113 29 128 24 148 0.89 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 3_19 - 188 Methyltransf_18 PF12847.2 112 5.8e-10 33.6 0.0 1 1 1.3e-11 1.2e-09 32.6 0.0 4 109 53 146 50 148 0.89 # 13780 # 14343 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.583 10_5 - 246 Methyltransf_18 PF12847.2 112 2.6e-09 31.5 0.0 1 1 3.9e-11 3.8e-09 31.0 0.0 2 74 30 98 29 153 0.87 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 10_5 - 246 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00012 16.5 0.0 1 1 1.2e-06 0.00023 15.5 0.0 2 59 35 92 34 100 0.85 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 4_2 - 556 UPF0547 PF10571.4 26 0.018 8.7 3.8 1 2 0.085 17 -0.8 0.2 16 22 94 102 93 103 0.80 # 1135 # 2802 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 4_2 - 556 UPF0547 PF10571.4 26 0.018 8.7 3.8 2 2 5.7e-05 0.011 9.3 0.5 1 10 498 507 498 511 0.89 # 1135 # 2802 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 8_6 - 292 AAA_13 PF13166.1 712 0.0017 10.7 18.3 1 2 4.3e-05 0.0042 9.4 3.4 365 471 17 125 5 133 0.60 # 5500 # 6375 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 8_6 - 292 AAA_13 PF13166.1 712 0.0017 10.7 18.3 2 2 0.00021 0.021 7.1 7.2 322 439 158 285 138 291 0.75 # 5500 # 6375 # 1 # ID=8_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.501 1_8 - 276 AAA_13 PF13166.1 712 0.0023 10.2 0.1 1 2 0.0015 0.15 4.2 0.2 23 36 40 53 29 66 0.83 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 1_8 - 276 AAA_13 PF13166.1 712 0.0023 10.2 0.1 2 2 0.0021 0.21 3.8 0.0 529 572 162 203 152 210 0.90 # 4521 # 5348 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 3_5 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.4e-06 20.1 0.4 1 2 1.7e-06 0.00032 13.6 0.1 9 36 115 142 109 151 0.89 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_5 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.4e-06 20.1 0.4 2 2 0.0011 0.22 4.3 0.0 123 136 231 244 221 251 0.84 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_5 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 1.9e-09 31.5 0.0 1 2 1.4e-08 2.7e-06 21.3 0.0 2 49 108 155 107 195 0.91 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 3_5 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 1.9e-09 31.5 0.0 2 2 0.00018 0.035 7.9 0.1 110 152 227 268 223 272 0.84 # 3334 # 4500 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_43 - 272 Pterin_bind PF00809.17 210 2.2e-60 197.4 0.0 1 1 5.5e-62 2.7e-60 197.2 0.0 1 209 10 216 10 217 0.98 # 37187 # 38002 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 7_1 - 251 Pterin_bind PF00809.17 210 1.4e-49 162.2 0.0 1 1 3.3e-51 1.6e-49 161.9 0.0 25 210 2 187 1 187 0.98 # 3 # 755 # 1 # ID=7_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.616 19_1 - 70 Pterin_bind PF00809.17 210 5.4e-18 59.0 0.0 1 1 1.2e-19 5.8e-18 58.8 0.0 1 63 7 69 7 70 0.98 # 3 # 212 # -1 # ID=19_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 8_7 - 52 Pterin_bind PF00809.17 210 2.6e-10 33.8 0.0 1 1 5.3e-12 2.6e-10 33.8 0.0 25 67 2 44 1 51 0.91 # 6523 # 6678 # -1 # ID=8_7;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.590 1_18 - 370 KR PF08659.5 181 0.0014 12.2 0.0 1 1 1.3e-05 0.0026 11.3 0.0 4 49 5 51 3 101 0.75 # 12901 # 14010 # -1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 2_4 - 1707 AAA_11 PF13086.1 236 0.00032 14.2 2.3 1 1 3e-06 0.00058 13.3 0.0 2 75 969 1039 968 1060 0.80 # 2140 # 7260 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 3_22 - 176 SSB PF00436.20 104 1.8e-40 130.9 0.3 1 1 1.1e-42 2.2e-40 130.6 0.3 1 101 6 109 6 112 0.95 # 15234 # 15761 # 1 # ID=3_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.585 16_1 - 296 HTH_21 PF13276.1 60 1.3e-18 60.7 3.5 1 1 3.1e-20 3.1e-18 59.5 3.5 2 60 46 103 44 103 0.94 # 40 # 927 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.538 12_5 - 225 HTH_21 PF13276.1 60 7.5e-11 35.8 0.2 1 1 1.6e-12 1.6e-10 34.8 0.2 4 59 36 89 34 90 0.93 # 2072 # 2746 # 1 # ID=12_5;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 10_5 - 246 TRM13 PF05206.9 259 0.00026 14.1 0.1 1 1 2.1e-06 0.00041 13.5 0.1 4 67 15 78 12 101 0.79 # 3538 # 4275 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/146a0647-e506-4950-855e-72373ab96c42 # Target file: checkm_output/bins/pm1987/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1987/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/146a0647-e506-4950-855e-72373ab96c42 checkm_output/bins/pm1987/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:57:09 2017 # [ok]