# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_67 - 263 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.00063 12.3 0.0 1 1 7.2e-06 0.00079 12.0 0.0 6 63 22 79 17 214 0.80 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 KaiC PF06745.8 227 0.00038 12.6 0.0 1 1 7.1e-06 0.00077 11.6 0.0 2 40 16 50 15 57 0.91 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 ABC_tran PF00005.22 137 5.7e-33 107.2 0.0 1 1 7.5e-35 8.2e-33 106.6 0.0 3 136 21 167 19 168 0.96 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_52 - 69 rve_3 PF13683.1 67 1.7e-10 33.4 0.1 1 1 1.9e-12 2e-10 33.1 0.1 19 67 2 50 1 50 0.94 # 34062 # 34268 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_67 - 263 MobB PF03205.9 140 0.00048 12.9 0.0 1 1 9.8e-06 0.0011 11.8 0.0 4 32 33 61 30 78 0.86 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_57 - 702 HTH_34 PF13601.1 80 0.00067 12.8 0.1 1 1 3e-05 0.0033 10.5 0.0 40 72 259 291 248 294 0.89 # 37200 # 39305 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_104 - 185 AAA_19 PF13245.1 76 2.7e-08 26.6 0.9 1 1 8.6e-10 4.7e-08 25.8 0.9 3 76 25 95 23 104 0.81 # 77147 # 77701 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.620 1_67 - 263 AAA_19 PF13245.1 76 0.00016 14.5 0.0 1 1 8.4e-06 0.00046 13.0 0.0 10 51 29 65 22 68 0.82 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_36 - 239 CbiA PF01656.18 195 4.5e-05 15.9 2.0 1 2 0.00018 0.02 7.3 0.2 1 20 3 22 3 30 0.92 # 23494 # 24210 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 1_36 - 239 CbiA PF01656.18 195 4.5e-05 15.9 2.0 2 2 0.00017 0.018 7.4 0.1 118 170 97 147 91 175 0.83 # 23494 # 24210 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.324 1_53 - 137 rve PF00665.21 120 9.6e-20 64.0 0.0 1 1 1.1e-21 1.2e-19 63.6 0.0 2 98 37 131 36 136 0.94 # 34278 # 34688 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_23 PF13476.1 202 3.1e-05 17.4 0.0 1 1 5.5e-07 6e-05 16.4 0.0 11 39 20 49 11 56 0.78 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 Zeta_toxin PF06414.7 201 9.9e-05 14.5 0.0 1 1 1.8e-06 0.0002 13.5 0.0 17 52 30 66 23 74 0.91 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_104 - 185 AAA_30 PF13604.1 196 4.2e-40 130.4 0.4 1 1 8.6e-42 4.7e-40 130.3 0.4 2 162 17 182 16 184 0.96 # 77147 # 77701 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.620 1_67 - 263 AAA_30 PF13604.1 196 0.00013 14.6 0.2 1 1 7.3e-06 0.0004 13.0 0.0 16 51 27 62 20 81 0.87 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 SMC_N PF02463.14 220 5.6e-10 31.8 0.1 1 1 4.2e-10 4.6e-08 25.5 0.1 24 212 29 214 15 220 0.64 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_54 - 108 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 7.5e-11 34.9 1.0 1 1 2.7e-12 2.9e-10 33.1 1.0 1 74 1 86 1 87 0.87 # 34955 # 35278 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.522 1_83 - 139 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 3e-10 33.0 0.1 1 1 6.1e-12 3.3e-10 32.8 0.1 42 149 4 113 1 125 0.86 # 64494 # 64910 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 1_49 - 193 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 2.3e-06 20.3 0.0 1 1 6.1e-08 3.3e-06 19.8 0.0 3 64 114 176 112 186 0.90 # 32519 # 33097 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.511 1_59 - 402 Ala_racemase_N PF01168.15 218 3.9e-14 45.7 1.2 1 1 1.6e-15 1.7e-13 43.6 1.2 2 172 29 210 28 237 0.80 # 41120 # 42325 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_67 - 263 AAA_21 PF13304.1 303 2.9e-14 46.7 0.0 1 2 4e-09 4.3e-07 23.1 0.0 1 24 31 54 31 83 0.83 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_21 PF13304.1 303 2.9e-14 46.7 0.0 2 2 1.1e-08 1.2e-06 21.7 0.0 232 301 135 202 115 203 0.91 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA PF00004.24 132 2.1e-05 17.8 0.1 1 1 8.4e-07 9.2e-05 15.7 0.1 2 38 33 84 32 203 0.75 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 TIGR00064 TIGR00064 279 0.0002 13.4 0.0 1 1 3.1e-06 0.00034 12.6 0.0 79 117 29 67 8 75 0.88 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_52 - 69 rve_2 PF13333.1 52 2.4e-09 30.2 0.1 1 1 2.7e-11 2.9e-09 30.0 0.1 1 40 3 42 3 62 0.82 # 34062 # 34268 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_67 - 263 cobW PF02492.14 178 0.00014 14.3 0.0 1 1 2.9e-06 0.00032 13.2 0.0 2 36 31 64 30 79 0.89 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_16 PF13191.1 185 1.1e-08 28.3 1.5 1 1 3.4e-10 3.7e-08 26.6 1.5 2 160 12 201 11 221 0.61 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_69 - 212 NodS PF05401.6 201 0.00066 12.1 0.3 1 2 0.00019 0.02 7.3 0.0 133 160 70 97 62 111 0.79 # 52637 # 53272 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_69 - 212 NodS PF05401.6 201 0.00066 12.1 0.3 2 2 0.0035 0.38 3.1 0.1 54 79 111 136 103 154 0.81 # 52637 # 53272 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.544 1_67 - 263 AAA_22 PF13401.1 131 8.4e-07 22.2 0.5 1 1 4e-08 4.3e-06 19.9 0.5 6 123 31 197 26 205 0.70 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_29 PF13555.1 62 7.8e-08 24.8 0.0 1 1 2.6e-09 1.4e-07 24.0 0.0 21 51 27 57 18 65 0.86 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_4 - 316 AAA_29 PF13555.1 62 0.0013 11.3 0.4 1 1 5.1e-05 0.0028 10.3 0.4 12 38 153 176 148 179 0.84 # 4476 # 5423 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_59 - 402 Orn_Arg_deC_N PF02784.11 251 5.8e-34 110.4 0.0 1 1 6.6e-36 7.2e-34 110.0 0.0 5 250 33 279 29 280 0.87 # 41120 # 42325 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.591 1_67 - 263 SRP54 PF00448.17 196 2.5e-05 16.8 0.0 1 1 4e-07 4.4e-05 16.0 0.0 2 41 30 69 29 79 0.92 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_28 PF13521.1 163 0.00017 14.6 0.2 1 1 3.5e-06 0.00039 13.4 0.0 3 22 33 52 31 99 0.81 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_26 - 226 CmcH_NodU PF02543.10 360 0.00011 14.4 0.1 1 1 1.5e-06 0.00017 13.8 0.1 216 270 101 156 94 160 0.88 # 16085 # 16762 # -1 # ID=1_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.425 1_67 - 263 Rad17 PF03215.10 519 0.0013 10.5 0.3 1 1 2e-05 0.0022 9.7 0.0 41 74 27 58 18 78 0.77 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00018 13.7 0.1 1 2 1.3e-05 0.0014 10.8 0.0 26 61 33 68 16 101 0.86 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00018 13.7 0.1 2 2 0.014 1.6 0.9 0.0 90 134 140 190 117 230 0.68 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_104 - 185 Reprolysin_4 PF13583.1 206 0.0004 13.0 0.1 1 1 5.9e-06 0.00064 12.3 0.1 111 190 70 159 40 165 0.76 # 77147 # 77701 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.620 1_67 - 263 G-alpha PF00503.15 389 6.4e-05 14.7 0.0 1 1 1e-06 0.00011 14.0 0.0 62 85 33 56 27 72 0.92 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_57 - 702 Plug PF07715.10 108 3.2e-17 55.9 1.0 1 1 1.2e-18 1.3e-16 53.9 1.0 2 108 42 146 41 146 0.93 # 37200 # 39305 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_56 - 459 TIGR00508 TIGR00508 419 1.2e-67 221.0 0.0 1 1 1.4e-69 1.6e-67 220.6 0.0 13 415 37 446 29 450 0.89 # 35720 # 37096 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_67 - 263 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.9e-05 17.5 0.0 1 2 7.1e-07 7.7e-05 15.5 0.0 4 46 15 55 13 74 0.81 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.9e-05 17.5 0.0 2 2 0.057 6.2 -0.6 0.0 106 123 178 196 130 212 0.73 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_104 - 185 PhoH PF02562.11 205 0.00041 12.6 0.0 1 2 1.7e-05 0.0019 10.5 0.1 6 61 18 77 15 96 0.84 # 77147 # 77701 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.620 1_104 - 185 PhoH PF02562.11 205 0.00041 12.6 0.0 2 2 0.037 4 -0.4 0.0 122 158 115 152 111 159 0.80 # 77147 # 77701 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.620 1_67 - 263 AAA_5 PF07728.9 139 6e-06 19.1 0.4 1 2 7.6e-07 8.2e-05 15.4 0.0 3 30 33 62 32 79 0.81 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_5 PF07728.9 139 6e-06 19.1 0.4 2 2 0.017 1.9 1.3 0.1 59 123 151 224 134 234 0.54 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_2 - 425 Peptidase_M64 PF09471.5 264 3.4e-79 259.1 0.0 1 1 4e-81 4.4e-79 258.8 0.0 2 264 92 344 91 344 0.98 # 2523 # 3797 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.329 1_67 - 263 DUF258 PF03193.11 161 1e-06 21.0 0.0 1 1 1.5e-08 1.7e-06 20.3 0.0 14 60 7 54 1 78 0.82 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_32 - 137 RPA PF10134.4 229 2.5e-34 111.5 0.1 1 1 3.5e-36 3.8e-34 110.9 0.1 141 228 2 87 1 88 0.98 # 18912 # 19322 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.387 1_104 - 185 DEAD PF00270.24 169 3.2e-05 16.5 0.1 1 1 4.5e-07 5e-05 15.9 0.1 1 54 18 75 18 107 0.79 # 77147 # 77701 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.620 1_80 - 159 Dala_Dala_lig_C PF07478.8 203 0.00081 11.8 0.0 1 1 1e-05 0.0011 11.4 0.0 62 114 51 100 42 113 0.82 # 59606 # 60082 # -1 # ID=1_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.314 1_67 - 263 Miro PF08477.8 119 0.00014 15.4 0.0 1 1 2.9e-06 0.00032 14.2 0.0 3 25 33 55 30 124 0.85 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_106 - 141 UvrD_C_2 PF13538.1 104 4.9e-09 29.4 0.3 1 1 6.4e-11 6.9e-09 28.9 0.3 55 103 1 50 1 51 0.89 # 78241 # 78663 # 1 # ID=1_106;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.652 1_26 - 226 TIP49 PF06068.8 398 2.7e-05 16.0 0.2 1 1 4.2e-07 4.6e-05 15.2 0.1 136 195 89 149 61 163 0.81 # 16085 # 16762 # -1 # ID=1_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.425 1_109 - 299 HTH_36 PF13730.1 55 0.0002 14.5 0.0 1 1 7.1e-06 0.00077 12.7 0.0 12 55 93 145 90 145 0.75 # 80194 # 81090 # 1 # ID=1_109;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.584 1_4 - 316 T2SE PF00437.15 272 1.2e-49 161.7 0.0 1 1 1.5e-51 1.6e-49 161.2 0.0 6 240 18 278 14 286 0.95 # 4476 # 5423 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_67 - 263 NACHT PF05729.7 166 6e-06 19.0 1.6 1 2 3.5e-07 1.9e-05 17.4 0.1 2 27 31 56 30 62 0.89 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 NACHT PF05729.7 166 6e-06 19.0 1.6 2 2 0.056 3.1 0.5 0.2 110 155 147 190 92 200 0.63 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_17 - 487 NACHT PF05729.7 166 3.1e-05 16.7 0.2 1 1 3.4e-06 0.00019 14.2 0.0 5 36 178 206 176 218 0.79 # 10816 # 12276 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.465 1_67 - 263 UPF0079 PF02367.12 123 0.00053 12.7 0.0 1 1 9.8e-06 0.0011 11.7 0.0 10 42 24 56 16 64 0.84 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_17 PF13207.1 121 0.00039 14.3 0.1 1 1 1.1e-05 0.0012 12.7 0.1 4 35 34 68 31 254 0.82 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 TIGR02211 TIGR02211 221 1.4e-28 92.6 0.2 1 2 4e-11 4.3e-09 28.9 0.0 17 70 15 68 6 80 0.91 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 TIGR02211 TIGR02211 221 1.4e-28 92.6 0.2 2 2 3.4e-21 3.7e-19 61.8 0.1 118 213 116 211 107 239 0.89 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_25 PF13481.1 194 2.1e-06 20.3 0.6 1 2 2.5e-07 1.3e-05 17.6 0.0 28 55 21 51 12 82 0.78 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_25 PF13481.1 194 2.1e-06 20.3 0.6 2 2 0.04 2.2 0.7 0.2 135 188 152 198 106 199 0.56 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_17 - 487 AAA_25 PF13481.1 194 0.00048 12.6 0.1 1 1 2.6e-05 0.0014 11.0 0.0 37 93 177 233 171 292 0.77 # 10816 # 12276 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.465 1_67 - 263 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.00062 12.3 0.1 1 1 1.3e-05 0.0014 11.2 0.0 5 25 36 53 32 77 0.80 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_15 PF13175.1 415 7.9e-10 31.3 0.2 1 2 4.2e-06 0.00046 12.3 0.0 22 42 28 49 12 67 0.80 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_15 PF13175.1 415 7.9e-10 31.3 0.2 2 2 1.4e-07 1.5e-05 17.1 0.1 371 410 158 198 149 209 0.88 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_4 - 316 Pox_A32 PF04665.7 241 2e-06 20.2 0.0 1 1 2.8e-08 3e-06 19.7 0.0 17 78 165 223 154 238 0.84 # 4476 # 5423 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.513 1_67 - 263 AAA_14 PF13173.1 128 1.3e-05 18.2 0.0 1 2 6.4e-07 7e-05 15.8 0.0 2 36 29 63 28 84 0.81 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_14 PF13173.1 128 1.3e-05 18.2 0.0 2 2 0.054 5.9 -0.1 0.0 62 85 158 187 133 215 0.60 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_33 PF13671.1 143 3.1e-05 16.9 0.1 1 1 6.3e-07 6.8e-05 15.8 0.1 3 78 33 136 31 204 0.54 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00013 13.7 0.1 1 2 9.3e-05 0.01 7.4 0.0 242 264 26 49 10 53 0.90 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00013 13.7 0.1 2 2 0.00093 0.1 4.1 0.0 324 355 141 172 134 218 0.81 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 SbcCD_C PF13558.1 90 5.5e-05 16.1 0.2 1 1 9.5e-06 0.001 12.0 0.2 18 89 125 183 110 184 0.77 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00038 13.7 0.0 1 1 7.2e-06 0.00079 12.7 0.0 2 23 33 54 32 77 0.76 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_49 - 193 DDE_Tnp_1_5 PF13737.1 112 2.2e-44 143.3 0.0 1 1 3.3e-46 3.5e-44 142.6 0.0 1 112 19 130 19 130 0.96 # 32519 # 33097 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.511 1_67 - 263 DUF2813 PF11398.3 373 4.9e-05 15.5 0.0 1 1 1.4e-06 7.8e-05 14.8 0.0 23 71 30 78 19 85 0.85 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_37 - 103 DUF2813 PF11398.3 373 0.00037 12.6 0.1 1 1 7.5e-06 0.00041 12.5 0.1 210 289 8 84 1 91 0.83 # 24212 # 24520 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 1_62 - 259 LptE PF04390.7 155 0.00025 13.8 0.0 1 1 3.8e-06 0.00041 13.1 0.0 3 51 102 151 102 181 0.69 # 45532 # 46308 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_17 - 487 AAA_10 PF12846.2 304 7.2e-31 100.7 0.0 1 1 9.6e-33 1e-30 100.2 0.0 4 302 176 471 174 473 0.87 # 10816 # 12276 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.465 1_67 - 263 AAA_13 PF13166.1 712 6.2e-05 14.6 0.0 1 2 6.6e-06 0.00072 11.1 0.0 16 39 29 52 16 73 0.85 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_67 - 263 AAA_13 PF13166.1 712 6.2e-05 14.6 0.0 2 2 0.0056 0.61 1.4 0.0 527 572 157 201 151 211 0.86 # 51085 # 51873 # 1 # ID=1_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 1_75 - 309 Yae1_N PF09811.4 39 1.7e-05 17.3 2.2 1 1 5.8e-07 3.2e-05 16.5 2.2 10 31 251 272 251 277 0.90 # 56283 # 57209 # 1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 1_23 - 74 Yae1_N PF09811.4 39 0.00023 13.8 6.2 1 1 7.4e-06 0.0004 13.0 6.2 7 34 9 36 8 41 0.81 # 15094 # 15315 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_104 - 185 AAA_11 PF13086.1 236 8.8e-09 28.3 0.0 1 2 1.9e-07 2.1e-05 17.2 0.0 2 70 17 82 16 98 0.84 # 77147 # 77701 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.620 1_104 - 185 AAA_11 PF13086.1 236 8.8e-09 28.3 0.0 2 2 5.3e-05 0.0057 9.2 0.0 195 232 115 155 98 158 0.78 # 77147 # 77701 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.620 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/4edd6fac-4d91-4bf1-a847-871cf78db1f7 # Target file: checkm_output/bins/pm1949/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1949/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/4edd6fac-4d91-4bf1-a847-871cf78db1f7 checkm_output/bins/pm1949/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:56:13 2017 # [ok]