# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_37 - 332 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.00041 12.4 0.0 1 1 8.8e-06 0.00066 11.7 0.0 16 62 159 205 151 247 0.86 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 KaiC PF06745.8 227 0.00013 13.6 0.0 1 1 3e-06 0.00023 12.8 0.0 16 53 155 190 148 240 0.77 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_57 - 92 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 6e-24 75.8 4.5 1 1 1.6e-25 1.2e-23 74.9 4.5 1 36 1 36 1 36 0.99 # 46052 # 46327 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_15 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 4.3e-06 18.3 0.0 1 3 0.0039 0.3 2.4 0.0 187 220 94 125 59 130 0.79 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 4.3e-06 18.3 0.0 2 3 3.3e-06 0.00025 12.5 0.0 132 231 218 308 202 332 0.82 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 4.3e-06 18.3 0.0 3 3 0.057 4.3 -1.4 0.0 132 160 346 369 314 377 0.67 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 2_11 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 9.3e-06 17.7 0.2 1 1 4.6e-07 3.4e-05 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_37 - 332 ABC_tran PF00005.22 137 1.2e-06 21.4 0.0 1 1 5e-08 1.9e-06 20.8 0.0 6 45 153 192 150 257 0.87 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_44 - 867 ABC_tran PF00005.22 137 0.00051 12.9 0.0 1 1 4.6e-05 0.0017 11.2 0.0 14 38 494 518 481 550 0.83 # 37462 # 40062 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_61 - 199 HTH_22 PF13309.1 64 4.2e-06 19.0 0.1 1 1 4.7e-07 1.2e-05 17.6 0.1 45 62 168 185 166 187 0.92 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_34 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 4.2e-06 19.0 0.3 1 2 0.067 1.7 1.1 0.0 23 38 70 85 58 87 0.81 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_34 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 4.2e-06 19.0 0.3 2 2 4e-06 0.0001 14.6 0.0 47 64 166 183 164 183 0.93 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_11 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 0.00021 13.6 1.5 1 1 3.5e-05 0.00089 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 2_5 - 422 HHH_5 PF14520.1 60 2.1e-07 23.6 0.6 1 1 7.4e-08 5.6e-06 19.0 0.6 8 55 181 278 177 282 0.65 # 3225 # 4490 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_37 - 332 Sigma54_activat PF00158.21 168 6.4e-06 18.2 0.0 1 1 3.1e-07 1.2e-05 17.4 0.0 14 54 150 190 138 213 0.82 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_9 - 1079 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00012 14.0 0.4 1 1 9.5e-06 0.00035 12.5 0.4 8 130 480 600 473 606 0.79 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_37 - 332 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 6.5e-07 21.5 0.0 1 1 5.1e-08 1.3e-06 20.5 0.0 38 64 158 184 139 191 0.81 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_44 - 867 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 8.8e-06 17.8 0.0 1 1 8.1e-07 2e-05 16.6 0.0 21 62 462 515 445 522 0.82 # 37462 # 40062 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_8 - 510 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00048 12.1 0.0 1 1 3.3e-05 0.00084 11.3 0.0 39 59 124 147 94 153 0.78 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 2_11 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.00049 12.8 0.6 1 1 2.1e-05 0.0016 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 2_11 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 2.3e-06 19.6 1.4 1 1 5.9e-08 4.4e-06 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_61 - 199 SpoIIID PF12116.3 82 2e-05 17.0 0.1 1 2 0.01 0.76 2.3 0.0 33 55 8 30 5 44 0.87 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_61 - 199 SpoIIID PF12116.3 82 2e-05 17.0 0.1 2 2 8.2e-06 0.00061 12.2 0.0 17 42 163 188 151 197 0.84 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_15 - 565 FAD_oxidored PF12831.2 428 2.2e-06 19.4 3.6 1 1 2.9e-08 2.2e-06 19.4 3.6 2 41 100 138 99 167 0.83 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_37 - 332 MobB PF03205.9 140 6.6e-06 18.4 1.9 1 1 1.5e-07 1.1e-05 17.6 0.3 2 39 160 196 159 201 0.83 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_25 - 102 HTH_34 PF13601.1 80 3.5e-10 32.4 0.1 1 1 6.6e-12 4.9e-10 31.9 0.1 25 79 39 93 30 94 0.92 # 20434 # 20739 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_25 - 102 MarR PF01047.17 59 3.3e-05 16.1 0.0 1 1 6.2e-07 4.6e-05 15.6 0.0 29 58 40 69 13 70 0.92 # 20434 # 20739 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_15 - 565 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 9.6e-18 57.4 0.1 1 2 4.4e-14 3.3e-12 39.3 0.1 1 201 101 303 101 305 0.75 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 9.6e-18 57.4 0.1 2 2 9e-07 6.8e-05 15.5 0.0 93 147 320 375 309 430 0.76 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 NAD_binding_7 PF13241.1 103 2.5e-07 23.4 1.2 1 2 5.4e-05 0.0041 9.9 0.2 9 38 99 128 96 184 0.89 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 NAD_binding_7 PF13241.1 103 2.5e-07 23.4 1.2 2 2 1.4e-05 0.0011 11.8 0.1 8 41 270 306 264 380 0.74 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_34 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 7.7e-05 14.7 0.2 1 2 0.023 1.8 0.8 0.1 2 12 114 124 113 124 0.85 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_34 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 7.7e-05 14.7 0.2 2 2 1.6e-05 0.0012 10.9 0.0 20 37 163 180 159 183 0.86 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_37 - 332 Myosin_head PF00063.16 689 0.00012 12.7 0.0 1 1 2.2e-06 0.00017 12.2 0.0 84 110 157 183 147 209 0.90 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_23 - 195 TetR_N PF00440.18 47 2.4e-08 26.0 0.0 1 1 1.3e-09 4.7e-08 25.1 0.0 2 46 13 57 12 58 0.95 # 18366 # 18950 # 1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.609 1_61 - 199 TetR_N PF00440.18 47 0.0002 13.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.00039 12.6 0.0 17 36 166 185 164 185 0.94 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_37 - 332 AAA_19 PF13245.1 76 0.00048 12.4 0.1 1 1 2.8e-05 0.001 11.3 0.1 5 48 153 191 149 224 0.78 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_9 - 1079 AAA_19 PF13245.1 76 0.0018 10.6 3.7 1 2 0.00056 0.021 7.2 0.2 2 75 485 551 484 552 0.75 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_9 - 1079 AAA_19 PF13245.1 76 0.0018 10.6 3.7 2 2 0.027 1 1.7 0.0 17 32 706 721 705 731 0.82 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_5 - 239 CbiA PF01656.18 195 2.1e-06 19.8 0.7 1 2 0.00041 0.031 6.1 0.1 1 19 3 21 3 24 0.89 # 1683 # 2399 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.416 1_5 - 239 CbiA PF01656.18 195 2.1e-06 19.8 0.7 2 2 6.6e-06 0.00049 12.0 0.0 110 165 89 142 33 168 0.77 # 1683 # 2399 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.416 1_25 - 102 PadR PF03551.9 75 4.3e-23 73.4 0.5 1 1 8e-25 6e-23 73.0 0.5 1 74 15 84 15 85 0.97 # 20434 # 20739 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 2_2 - 240 Rep_3 PF01051.16 222 8.4e-44 142.2 0.4 1 1 1.3e-45 9.7e-44 142.0 0.4 2 213 8 227 7 233 0.92 # 648 # 1367 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_19 - 423 rve PF00665.21 120 7.6e-27 86.3 0.0 1 1 5.8e-28 1.4e-26 85.4 0.0 2 120 173 313 172 313 0.95 # 14085 # 15353 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 1_24 - 255 rve PF00665.21 120 8.1e-14 44.3 0.0 1 2 0.061 1.5 1.5 0.0 83 102 30 49 7 51 0.90 # 19443 # 20207 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_24 - 255 rve PF00665.21 120 8.1e-14 44.3 0.0 2 2 5e-14 1.3e-12 40.5 0.0 8 117 73 179 69 182 0.90 # 19443 # 20207 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_20 - 235 rve PF00665.21 120 1.3e-13 43.6 0.1 1 2 0.045 1.1 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 15400 # 16104 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_20 - 235 rve PF00665.21 120 1.3e-13 43.6 0.1 2 2 9.5e-14 2.4e-12 39.6 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 15400 # 16104 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_37 - 332 AAA_23 PF13476.1 202 0.00033 13.5 0.0 1 1 1.4e-05 0.00054 12.8 0.0 19 39 158 178 105 184 0.91 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_44 - 867 AAA_23 PF13476.1 202 0.0036 10.1 0.0 1 1 9.5e-05 0.0036 10.1 0.0 22 39 494 511 464 521 0.84 # 37462 # 40062 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_37 - 332 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.2e-06 20.3 0.0 1 1 2.7e-08 2e-06 19.5 0.0 12 51 154 193 145 204 0.86 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_9 - 1079 AAA_30 PF13604.1 196 1.6e-53 173.7 7.6 1 1 1.5e-54 5.8e-53 171.9 6.4 1 192 477 660 477 663 0.97 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_37 - 332 AAA_30 PF13604.1 196 0.00011 14.3 0.1 1 2 4.7e-05 0.0018 10.4 0.1 11 51 151 190 145 197 0.80 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 AAA_30 PF13604.1 196 0.00011 14.3 0.1 2 2 0.024 0.88 1.6 0.0 121 178 204 258 191 272 0.77 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_15 - 565 F420_oxidored PF03807.12 96 0.0053 9.7 4.1 1 2 0.0023 0.17 4.9 1.2 2 31 100 126 99 131 0.87 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 F420_oxidored PF03807.12 96 0.0053 9.7 4.1 2 2 0.0075 0.56 3.3 0.1 1 34 271 300 271 323 0.87 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_34 - 187 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00015 14.3 0.1 1 1 8.9e-06 0.00033 13.1 0.1 15 44 154 182 140 186 0.79 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_20 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00019 13.9 0.3 1 1 1.1e-05 0.0004 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 15400 # 16104 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_8 - 510 TraG-D_C PF12696.2 128 1e-21 69.7 0.0 1 1 2.2e-23 1.7e-21 69.0 0.0 1 127 350 471 350 472 0.80 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_20 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.00032 13.0 0.0 1 1 1.3e-05 0.00098 11.4 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 15400 # 16104 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_61 - 199 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00038 12.3 0.0 1 1 1.8e-05 0.0014 10.5 0.0 19 37 164 182 154 189 0.88 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_25 - 102 Replic_Relax PF13814.1 191 2.6e-05 16.6 0.1 1 1 3.9e-07 2.9e-05 16.5 0.1 16 77 31 90 17 96 0.85 # 20434 # 20739 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_9 - 1079 AAA PF00004.24 132 2.5e-06 20.2 0.9 1 1 1.3e-07 9.7e-06 18.3 0.1 4 111 500 600 497 612 0.73 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_37 - 332 Parvo_NS1 PF01057.12 272 0.00064 11.1 0.0 1 1 1.4e-05 0.0011 10.4 0.0 104 138 148 182 140 188 0.90 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_9 - 1079 Herpes_Helicase PF02689.9 819 1.6e-05 15.3 0.0 1 2 0.0014 0.1 2.7 0.0 173 208 539 574 515 584 0.81 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_9 - 1079 Herpes_Helicase PF02689.9 819 1.6e-05 15.3 0.0 2 2 9.3e-06 0.00069 9.9 0.0 739 782 850 894 831 914 0.80 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_61 - 199 MRP-L20 PF12824.2 164 1.6e-06 20.7 0.0 1 1 2.9e-08 2.2e-06 20.2 0.0 69 133 132 194 116 198 0.77 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_9 - 1079 Torsin PF06309.6 127 1.6e-05 17.3 0.0 1 1 6.1e-07 4.6e-05 15.8 0.0 19 85 460 526 452 537 0.83 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_11 - 145 MerR_1 PF13411.1 69 6.7e-20 63.2 0.0 1 1 4.5e-21 1.1e-19 62.5 0.0 2 67 9 75 8 77 0.96 # 9344 # 9778 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_16 - 121 MerR_1 PF13411.1 69 4.1e-14 44.7 0.0 1 1 2.6e-15 6.6e-14 44.0 0.0 1 68 4 72 4 73 0.97 # 12711 # 13073 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_61 - 199 MerR_1 PF13411.1 69 7.1e-06 18.3 0.1 1 2 0.022 0.55 2.6 0.0 45 66 78 99 75 102 0.83 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_61 - 199 MerR_1 PF13411.1 69 7.1e-06 18.3 0.1 2 2 1.3e-05 0.00033 13.0 0.0 1 29 166 194 166 198 0.88 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_37 - 332 cobW PF02492.14 178 1.6e-06 20.1 0.0 1 1 4.1e-08 3.1e-06 19.2 0.0 3 45 161 202 159 257 0.77 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 AAA_16 PF13191.1 185 5.1e-07 22.3 0.0 1 1 3.4e-08 1.3e-06 21.0 0.0 24 61 158 195 149 274 0.82 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_44 - 867 AAA_16 PF13191.1 185 0.00073 12.0 0.0 1 1 0.00018 0.0068 8.9 0.0 25 47 492 514 481 574 0.85 # 37462 # 40062 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_37 - 332 AAA_22 PF13401.1 131 2.1e-07 23.7 0.0 1 1 1.8e-08 4.6e-07 22.6 0.0 3 54 157 202 153 241 0.74 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_44 - 867 AAA_22 PF13401.1 131 8.1e-05 15.3 0.0 1 1 7.5e-05 0.0019 10.9 0.0 5 28 492 515 489 549 0.85 # 37462 # 40062 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_9 - 1079 AAA_22 PF13401.1 131 0.00048 12.8 0.2 1 1 0.00022 0.0056 9.3 0.2 4 125 494 598 490 603 0.81 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_16 - 121 DUF977 PF06163.6 127 0.00022 13.5 0.1 1 1 5.9e-06 0.00044 12.5 0.0 27 70 4 47 2 65 0.90 # 12711 # 13073 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_34 - 187 NUMOD1 PF07453.8 37 0.0004 12.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.0008 11.8 0.0 19 37 164 182 164 182 0.94 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_25 - 102 DUF3116 PF11313.3 85 0.00031 12.9 0.1 1 1 5.7e-06 0.00043 12.4 0.1 49 83 50 88 39 90 0.75 # 20434 # 20739 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_37 - 332 AAA_29 PF13555.1 62 0.00075 11.6 0.0 1 1 2.3e-05 0.0017 10.4 0.0 19 43 157 178 145 188 0.75 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_15 - 565 Pyr_redox PF00070.22 80 2.7e-20 65.1 6.0 1 2 1.4e-06 0.00011 15.2 1.5 1 31 99 129 99 131 0.96 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 Pyr_redox PF00070.22 80 2.7e-20 65.1 6.0 2 2 6.2e-18 4.7e-16 51.6 0.2 1 74 271 345 271 354 0.90 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_34 - 187 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 2.5e-05 16.5 0.0 1 1 1.3e-06 4.8e-05 15.6 0.0 10 42 157 185 151 186 0.86 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_11 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 7.1e-05 15.0 0.0 1 1 3.9e-06 0.00015 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_15 - 565 HI0933_like PF03486.9 409 1.7e-08 25.8 3.7 1 2 1.2e-06 9e-05 13.5 2.5 2 33 99 130 98 138 0.91 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 HI0933_like PF03486.9 409 1.7e-08 25.8 3.7 2 2 7.2e-06 0.00054 10.9 0.0 82 164 284 366 276 385 0.83 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_20 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 9.8e-07 22.1 0.2 1 1 2.3e-07 4.2e-06 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 15400 # 16104 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_61 - 199 HTH_32 PF13565.1 77 2e-05 17.9 0.2 1 1 6.1e-06 0.00011 15.5 0.1 7 76 127 185 121 186 0.71 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_24 - 255 HTH_32 PF13565.1 77 0.00014 15.1 0.2 1 1 2.7e-05 0.0005 13.4 0.2 37 76 15 50 6 51 0.83 # 19443 # 20207 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_34 - 187 HTH_32 PF13565.1 77 0.00054 13.3 5.4 1 1 0.00011 0.002 11.5 3.5 7 77 124 182 119 182 0.68 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_34 - 187 HTH_3 PF01381.17 55 0.00032 13.1 0.4 1 1 1.1e-05 0.00085 11.7 0.4 2 31 152 183 151 184 0.86 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_19 - 423 HTH_23 PF13384.1 50 2.7e-07 22.7 0.9 1 1 6.5e-08 8.1e-07 21.2 0.9 3 45 23 71 21 76 0.87 # 14085 # 15353 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 1_61 - 199 HTH_23 PF13384.1 50 4.3e-06 18.9 0.0 1 1 1.4e-06 1.7e-05 16.9 0.0 10 37 158 185 150 188 0.82 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_20 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 4.6e-06 18.8 0.7 1 2 0.095 1.2 1.6 0.0 7 27 11 35 7 36 0.69 # 15400 # 16104 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_20 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 4.6e-06 18.8 0.7 2 2 1.1e-05 0.00014 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 15400 # 16104 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_57 - 92 HTH_23 PF13384.1 50 1.7e-05 17.0 0.0 1 1 2.2e-06 2.7e-05 16.3 0.0 7 40 53 86 51 90 0.93 # 46052 # 46327 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_34 - 187 HTH_23 PF13384.1 50 1.7e-05 16.9 1.3 1 1 1.8e-06 2.2e-05 16.6 0.1 10 39 151 183 148 184 0.82 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_11 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 3.3e-05 16.0 0.3 1 1 2.6e-06 3.3e-05 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_61 - 199 HTH_7 PF02796.10 45 4.3e-18 57.5 0.1 1 1 6.3e-19 1.6e-17 55.7 0.0 1 44 144 188 144 189 0.98 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_34 - 187 HTH_7 PF02796.10 45 9.1e-17 53.3 0.3 1 1 7.1e-18 1.8e-16 52.3 0.3 1 44 141 184 141 185 0.98 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_11 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 1.7e-13 42.7 1.1 1 1 1.5e-14 3.9e-13 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_57 - 92 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 4.2e-05 15.7 4.1 1 1 1.6e-06 0.00012 14.3 4.1 3 35 6 39 5 40 0.86 # 46052 # 46327 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_25 - 102 FeoC PF09012.5 69 0.0007 11.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.001 11.3 0.0 24 48 38 62 30 72 0.81 # 20434 # 20739 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_19 - 423 HTH_29 PF13551.1 112 1.3e-06 21.0 2.2 1 1 6.5e-08 1.6e-06 20.8 0.3 13 77 39 109 27 133 0.79 # 14085 # 15353 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 2_11 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 8e-05 15.3 0.6 1 2 0.074 1.8 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 2_11 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 8e-05 15.3 0.6 2 2 3.1e-05 0.00077 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_61 - 199 HTH_29 PF13551.1 112 0.00033 13.3 2.2 1 1 0.00034 0.0085 8.8 0.0 5 33 159 186 155 192 0.80 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_15 - 565 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 0.00015 14.5 1.7 1 1 4.2e-06 0.00032 13.4 0.1 2 26 276 306 276 340 0.70 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 2.1e-05 16.8 2.8 1 3 0.0081 0.61 2.3 0.1 1 41 101 135 101 162 0.81 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 2.1e-05 16.8 2.8 2 3 0.034 2.5 0.3 0.0 134 155 218 241 202 242 0.72 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 2.1e-05 16.8 2.8 3 3 6.6e-06 0.0005 12.4 0.1 112 155 321 366 311 367 0.85 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 GIDA PF01134.17 392 1.9e-08 26.0 6.6 1 3 3.5e-10 2.6e-08 25.5 3.3 2 187 100 279 99 302 0.72 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 GIDA PF01134.17 392 1.9e-08 26.0 6.6 2 3 0.038 2.8 -0.9 0.0 3 31 273 301 271 315 0.84 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 GIDA PF01134.17 392 1.9e-08 26.0 6.6 3 3 0.018 1.4 0.1 0.1 349 385 393 429 387 433 0.77 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 NAD_binding_8 PF13450.1 68 2.6e-05 16.7 1.2 1 2 3.5e-07 2.6e-05 16.7 1.2 1 35 102 135 102 155 0.90 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 NAD_binding_8 PF13450.1 68 2.6e-05 16.7 1.2 2 2 0.041 3.1 0.5 0.2 1 25 274 298 274 303 0.81 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_20 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 8e-13 40.6 0.3 1 1 2.7e-14 1e-12 40.3 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 15400 # 16104 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_24 - 255 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 8.4e-10 30.7 0.4 1 1 3.4e-11 1.3e-09 30.2 0.4 11 133 16 144 8 183 0.86 # 19443 # 20207 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_37 - 332 Arch_ATPase PF01637.13 234 6.6e-06 18.4 0.0 1 1 1.6e-07 1.2e-05 17.6 0.0 15 68 155 205 149 226 0.87 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_9 - 1079 PhoH PF02562.11 205 2.4e-09 29.2 4.8 1 2 9.6e-07 3.6e-05 15.5 0.4 5 39 478 514 475 536 0.80 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_9 - 1079 PhoH PF02562.11 205 2.4e-09 29.2 4.8 2 2 3e-06 0.00011 13.9 0.1 120 162 562 605 553 635 0.82 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_37 - 332 PhoH PF02562.11 205 0.00023 12.9 0.0 1 1 1.1e-05 0.00042 12.1 0.0 14 45 153 184 143 210 0.79 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 2_4 - 264 SprT-like PF10263.4 157 2.9e-37 120.2 0.0 1 1 5.3e-39 4e-37 119.8 0.0 1 150 12 236 12 262 0.92 # 2283 # 3074 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_37 - 332 ResIII PF04851.10 184 4.6e-06 19.0 0.0 1 1 9.8e-08 7.3e-06 18.4 0.0 22 61 148 196 104 202 0.81 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_8 - 510 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 7.9e-119 389.1 0.0 1 1 3.7e-120 9.3e-119 388.9 0.0 1 385 112 490 112 491 0.95 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_44 - 867 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 6.9e-07 20.6 1.6 1 2 1.5e-06 3.7e-05 14.9 0.0 16 51 492 527 484 536 0.92 # 37462 # 40062 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_44 - 867 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 6.9e-07 20.6 1.6 2 2 0.0042 0.11 3.5 0.0 102 168 741 806 720 812 0.79 # 37462 # 40062 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_37 - 332 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1e-05 16.8 0.1 1 1 6.4e-07 1.6e-05 16.1 0.1 14 49 157 191 150 202 0.81 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 AAA_18 PF13238.1 129 3.5e-06 19.9 0.0 1 1 2e-07 7.3e-06 18.8 0.0 1 29 161 194 161 213 0.77 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_8 - 510 AAA_18 PF13238.1 129 9.7e-05 15.2 0.0 1 1 5.2e-06 0.0002 14.2 0.0 3 21 131 149 130 238 0.78 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 2_5 - 422 IMS_HHH PF11798.3 32 3.5e-07 22.6 0.0 1 1 1.4e-08 1e-06 21.2 0.0 4 32 171 199 168 199 0.85 # 3225 # 4490 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_37 - 332 GvpD PF07088.6 484 1.9e-06 18.9 0.0 1 1 3.9e-08 2.9e-06 18.3 0.0 10 89 158 241 150 262 0.76 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_34 - 187 HTH_psq PF05225.11 45 9.3e-05 14.5 0.0 1 1 2.5e-06 0.00019 13.5 0.0 21 39 166 184 165 186 0.91 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_57 - 92 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 1.5e-31 100.1 0.2 1 1 3.2e-33 2.4e-31 99.5 0.2 1 46 43 88 43 88 0.99 # 46052 # 46327 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_37 - 332 DUF258 PF03193.11 161 8.3e-05 14.3 0.0 1 1 2e-06 0.00015 13.5 0.0 29 61 151 184 129 224 0.81 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_8 - 510 DUF87 PF01935.12 229 8.3e-08 24.8 0.0 1 1 3.4e-09 1.3e-07 24.2 0.0 10 68 116 170 109 262 0.85 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_37 - 332 DUF87 PF01935.12 229 2e-06 20.3 0.0 1 1 9.7e-08 3.6e-06 19.4 0.0 9 61 144 195 138 196 0.78 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_19 - 423 HTH_28 PF13518.1 52 1.7e-08 26.9 0.1 1 1 1.4e-09 1.7e-08 26.9 0.1 1 46 26 78 26 87 0.76 # 14085 # 15353 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 1_61 - 199 HTH_28 PF13518.1 52 2.8e-05 16.6 0.0 1 1 1.3e-05 0.00017 14.1 0.0 13 32 166 185 158 191 0.87 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_34 - 187 HTH_28 PF13518.1 52 3.6e-05 16.3 0.1 1 1 2.9e-06 3.6e-05 16.3 0.1 9 34 158 183 147 184 0.84 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_20 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 4.4e-05 16.0 1.2 1 1 1.5e-05 0.00019 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 15400 # 16104 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_57 - 92 HTH_28 PF13518.1 52 6.6e-05 15.4 0.0 1 1 8.1e-06 0.0001 14.8 0.0 4 35 55 86 53 90 0.90 # 46052 # 46327 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 2_11 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 0.0001 14.8 0.0 1 1 2.5e-05 0.00032 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_25 - 102 HTH_12 PF08461.5 66 2e-06 20.0 0.7 1 1 4.3e-08 3.3e-06 19.3 0.7 6 65 15 82 12 83 0.77 # 20434 # 20739 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_11 - 145 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 1.6e-21 69.1 0.6 1 1 9.7e-23 3.6e-21 67.9 0.5 1 65 51 113 51 113 0.95 # 9344 # 9778 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_16 - 121 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.00059 12.8 7.4 1 1 2.5e-05 0.00095 12.1 7.4 1 64 47 108 47 109 0.85 # 12711 # 13073 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_61 - 199 HTH_24 PF13412.1 48 3.3e-05 15.8 0.0 1 2 0.032 2.4 0.2 0.0 30 46 74 90 69 104 0.81 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_61 - 199 HTH_24 PF13412.1 48 3.3e-05 15.8 0.0 2 2 4.4e-06 0.00033 12.6 0.0 10 38 158 186 157 188 0.92 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_37 - 332 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 1.8e-06 20.6 0.0 1 1 5e-08 3.8e-06 19.5 0.0 14 65 151 202 145 212 0.92 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_25 - 102 FUR PF01475.14 120 1.5e-05 17.4 0.0 1 1 2.1e-07 1.6e-05 17.4 0.0 29 74 29 77 12 99 0.79 # 20434 # 20739 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_34 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 8.7e-06 17.8 0.2 1 2 0.055 4.1 -0.3 0.1 3 18 124 139 123 154 0.71 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_34 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 8.7e-06 17.8 0.2 2 2 8.6e-07 6.5e-05 15.0 0.0 27 45 165 183 162 185 0.93 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_15 - 565 TIGR01292 TIGR01292 300 1.2e-19 62.3 2.9 1 2 3.8e-05 0.0029 8.6 1.1 3 39 100 136 98 142 0.89 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 TIGR01292 TIGR01292 300 1.2e-19 62.3 2.9 2 2 1.1e-18 8e-17 53.1 0.0 142 296 270 428 213 430 0.81 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_37 - 332 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00033 13.2 0.0 1 1 7.1e-06 0.00053 12.5 0.0 2 41 161 205 160 310 0.84 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 DEAD PF00270.24 169 2.2e-06 19.7 0.0 1 1 5.7e-08 4.2e-06 18.8 0.0 13 70 157 211 144 242 0.78 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 DUF2075 PF09848.4 352 6.8e-05 14.4 0.0 1 1 1.3e-06 9.7e-05 13.9 0.0 1 32 158 187 158 216 0.76 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_9 - 1079 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.9e-16 52.6 0.1 1 1 1e-17 7.8e-16 50.7 0.1 2 102 797 896 796 898 0.76 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_37 - 332 T2SE PF00437.15 272 2.4e-52 170.0 0.1 1 1 7.4e-54 2.8e-52 169.7 0.1 3 271 10 311 8 312 0.94 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_8 - 510 T2SE PF00437.15 272 0.00066 11.1 0.1 1 1 3.1e-05 0.0012 10.3 0.1 130 149 128 147 103 160 0.84 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_19 - 423 HTH_Tnp_Mu_2 PF09039.6 108 5.7e-06 18.6 0.0 1 1 1.8e-07 1.4e-05 17.4 0.0 37 101 100 163 83 166 0.91 # 14085 # 15353 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 1_37 - 332 NACHT PF05729.7 166 6.7e-05 15.1 0.0 1 1 1.9e-06 0.00014 14.0 0.0 1 27 159 185 159 188 0.90 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 UPF0079 PF02367.12 123 4.6e-06 18.8 0.0 1 1 1.2e-07 9.2e-06 17.8 0.0 9 45 152 188 145 193 0.85 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 AAA_17 PF13207.1 121 0.0003 14.1 0.1 1 1 2.8e-05 0.00071 12.9 0.1 2 40 161 195 160 229 0.75 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_8 - 510 AAA_17 PF13207.1 121 0.00039 13.8 0.1 1 1 6.7e-05 0.0017 11.7 0.0 4 42 131 191 129 260 0.58 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_44 - 867 AAA_17 PF13207.1 121 0.0007 12.9 4.9 1 1 0.00023 0.0056 10.0 0.0 3 21 495 513 494 565 0.80 # 37462 # 40062 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_37 - 332 AAA_7 PF12775.2 272 7.4e-05 14.4 0.0 1 1 2.3e-06 0.00018 13.2 0.0 25 64 150 189 139 209 0.86 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 TIGR03346 TIGR03346 853 0.00011 12.8 0.0 1 1 2e-06 0.00015 12.3 0.0 598 641 161 204 149 238 0.89 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_15 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.2e-06 18.6 4.7 1 3 4.3e-08 3.2e-06 18.6 4.7 2 32 100 130 99 137 0.90 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.2e-06 18.6 4.7 2 3 0.034 2.6 -0.8 0.1 143 204 311 369 297 388 0.72 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.2e-06 18.6 4.7 3 3 0.074 5.6 -1.9 0.0 376 402 388 408 377 424 0.82 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_9 - 1079 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5.2e-15 48.0 5.4 1 2 2.3e-08 1.7e-06 20.2 0.0 3 104 499 605 497 654 0.74 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_9 - 1079 Viral_helicase1 PF01443.13 234 5.2e-15 48.0 5.4 2 2 3e-11 2.3e-09 29.6 0.5 157 234 818 899 774 899 0.74 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_37 - 332 Pox_A32 PF04665.7 241 7.5e-05 14.6 0.0 1 1 1.7e-06 0.00013 13.8 0.0 12 46 157 191 150 210 0.85 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_8 - 510 AAA_14 PF13173.1 128 9.3e-06 18.1 0.0 1 2 4.3e-06 0.00016 14.1 0.0 6 89 130 213 125 234 0.76 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_8 - 510 AAA_14 PF13173.1 128 9.3e-06 18.1 0.0 2 2 0.043 1.6 1.1 0.0 53 81 340 372 300 391 0.57 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_37 - 332 AAA_14 PF13173.1 128 0.00021 13.7 0.1 1 2 0.0044 0.17 4.3 0.0 64 96 135 165 98 166 0.69 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 AAA_14 PF13173.1 128 0.00021 13.7 0.1 2 2 6.3e-05 0.0024 10.3 0.0 2 35 158 191 157 213 0.80 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_25 - 102 Penicillinase_R PF03965.11 115 1.9e-05 17.3 0.0 1 1 2.8e-07 2.1e-05 17.1 0.0 22 58 28 67 13 99 0.81 # 20434 # 20739 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_11 - 145 MerR PF00376.18 38 6.1e-14 43.9 0.2 1 1 3e-15 1.1e-13 43.1 0.2 1 38 9 46 9 46 0.99 # 9344 # 9778 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_16 - 121 MerR PF00376.18 38 9.3e-07 20.9 0.0 1 1 3.9e-08 1.5e-06 20.3 0.0 1 38 5 42 5 42 0.95 # 12711 # 13073 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_37 - 332 AAA_33 PF13671.1 143 0.00028 13.3 0.0 1 1 5.9e-06 0.00044 12.6 0.0 2 26 161 188 160 256 0.81 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_34 - 187 CENP-B_N PF04218.8 53 2.2e-06 19.6 0.0 1 1 5.4e-08 4e-06 18.7 0.0 17 43 156 182 152 186 0.92 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_8 - 510 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 4.1e-12 37.8 0.0 1 1 7.9e-14 5.9e-12 37.3 0.0 263 426 313 472 297 500 0.74 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_37 - 332 RNA_helicase PF00910.17 107 1.5e-05 17.7 0.1 1 2 3.5e-06 0.00026 13.7 0.0 1 25 161 185 161 242 0.75 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 RNA_helicase PF00910.17 107 1.5e-05 17.7 0.1 2 2 0.027 2 1.2 0.1 69 100 290 322 281 328 0.78 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_37 - 332 AAA_2 PF07724.9 171 4.3e-06 19.2 0.0 1 1 1e-07 7.7e-06 18.4 0.0 3 54 158 204 156 216 0.89 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 1_15 - 565 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 1.8e-05 16.9 3.1 1 2 0.00051 0.039 6.0 0.8 15 50 92 127 89 130 0.90 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 1.8e-05 16.9 3.1 2 2 2.1e-05 0.0016 10.5 0.1 16 58 265 307 257 339 0.84 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_59 - 478 DNA_methylase PF00145.12 335 1.6e-79 259.9 0.0 1 1 4.4e-81 3.3e-79 258.8 0.0 1 331 96 457 96 460 0.86 # 46950 # 48383 # 1 # ID=1_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.480 1_56 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 2.5e-76 246.5 1.5 1 1 7.4e-78 2.8e-76 246.4 1.5 7 131 1 125 1 125 1.00 # 45630 # 46007 # -1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 1_58 - 89 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 2.9e-47 152.5 0.4 1 1 8.5e-49 3.2e-47 152.4 0.4 44 131 1 88 1 88 0.99 # 46584 # 46850 # -1 # ID=1_58;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.521 1_15 - 565 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0024 10.0 6.4 1 2 0.0047 0.36 2.9 2.4 1 30 99 128 99 134 0.93 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0024 10.0 6.4 2 2 9e-05 0.0068 8.6 0.1 2 39 272 309 271 348 0.73 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_57 - 92 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 8.5e-06 17.9 2.9 1 1 3.2e-07 2.4e-05 16.4 2.9 3 36 6 40 5 41 0.83 # 46052 # 46327 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_15 - 565 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 4.6e-06 19.0 0.1 1 1 1.3e-07 1e-05 17.8 0.1 13 40 276 303 272 356 0.82 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_24 - 255 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 7.7e-54 174.0 0.0 1 1 2.6e-55 9.8e-54 173.6 0.0 3 139 73 211 71 212 0.98 # 19443 # 20207 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 1_20 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.3e-52 170.0 0.0 1 1 4.8e-54 1.8e-52 169.5 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 15400 # 16104 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.530 1_61 - 199 HTH_17 PF12728.2 51 1.5e-05 17.8 0.0 1 1 4.2e-07 3.2e-05 16.7 0.0 2 27 166 191 165 196 0.90 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_6 - 140 RuvA_C PF07499.8 47 0.0012 11.5 0.8 1 2 0.01 0.78 2.6 0.3 39 46 6 13 5 14 0.92 # 2408 # 2827 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 1_6 - 140 RuvA_C PF07499.8 47 0.0012 11.5 0.8 2 2 0.00038 0.028 7.2 0.0 11 25 21 35 21 36 0.92 # 2408 # 2827 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 1_57 - 92 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 0.00013 14.3 2.3 1 1 3.4e-06 0.00026 13.4 2.3 21 46 8 38 5 38 0.74 # 46052 # 46327 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_61 - 199 HTH_11 PF08279.7 55 8.7e-07 21.1 0.0 1 1 1.1e-07 4.2e-06 18.9 0.0 7 35 158 185 152 187 0.85 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_34 - 187 HTH_11 PF08279.7 55 9.1e-05 14.6 0.1 1 1 2.5e-05 0.00095 11.4 0.0 20 37 166 183 162 184 0.91 # 27319 # 27879 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_9 - 1079 PIF1 PF05970.9 364 1.5e-06 19.8 0.1 1 2 1.3e-07 1e-05 17.1 0.0 2 65 478 537 477 588 0.85 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_9 - 1079 PIF1 PF05970.9 364 1.5e-06 19.8 0.1 2 2 0.089 6.7 -2.1 0.0 334 363 795 823 783 824 0.84 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_61 - 199 TrmB PF01978.14 68 6e-06 18.5 0.0 1 1 5.6e-07 1.4e-05 17.3 0.0 6 42 149 185 146 188 0.94 # 49870 # 50466 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_11 - 186 TrmB PF01978.14 68 4.2e-05 15.8 0.0 1 1 3.4e-06 8.5e-05 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_25 - 102 TrmB PF01978.14 68 0.00019 13.7 0.1 1 1 2.2e-05 0.00055 12.2 0.1 34 62 40 73 31 78 0.84 # 20434 # 20739 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_9 - 1079 Helicase_RecD PF05127.9 177 1.5e-05 17.2 4.8 1 2 0.00059 0.044 5.9 0.1 122 146 498 522 481 539 0.76 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_9 - 1079 Helicase_RecD PF05127.9 177 1.5e-05 17.2 4.8 2 2 8.1e-06 0.0006 12.0 0.1 75 114 548 585 529 653 0.69 # 5287 # 8523 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 1_21 - 302 LYTB PF02401.13 281 0.00051 11.5 0.0 1 1 2e-05 0.0015 9.9 0.0 236 272 81 117 70 124 0.91 # 16226 # 17131 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_15 - 565 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 5.9e-44 142.8 0.0 1 1 3.2e-45 2.4e-43 140.8 0.0 2 199 100 410 99 412 0.96 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 DFP PF04127.10 185 0.00058 12.0 2.4 1 2 0.00039 0.03 6.4 0.4 28 51 105 128 99 156 0.83 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 DFP PF04127.10 185 0.00058 12.0 2.4 2 2 0.0014 0.1 4.7 0.1 32 53 281 302 276 336 0.77 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 DAO PF01266.19 358 3.2e-09 28.6 11.7 1 3 1.4e-08 1e-06 20.3 0.7 1 38 99 134 99 190 0.84 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 DAO PF01266.19 358 3.2e-09 28.6 11.7 2 3 0.032 2.4 -0.6 0.1 3 31 273 301 271 307 0.75 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_15 - 565 DAO PF01266.19 358 3.2e-09 28.6 11.7 3 3 9.4e-07 7.1e-05 14.3 0.5 152 208 314 372 307 433 0.74 # 10999 # 12693 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 1_44 - 867 AAA_10 PF12846.2 304 1.8e-35 115.3 0.1 1 1 2.4e-36 6e-35 113.6 0.0 2 292 492 772 491 780 0.84 # 37462 # 40062 # -1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_8 - 510 AAA_10 PF12846.2 304 4.1e-07 22.2 0.1 1 2 2.1e-05 0.00052 12.0 0.1 3 41 128 166 126 177 0.92 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_8 - 510 AAA_10 PF12846.2 304 4.1e-07 22.2 0.1 2 2 0.00034 0.0084 8.0 0.0 214 286 339 414 307 431 0.75 # 3758 # 5287 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_37 - 332 AAA_10 PF12846.2 304 0.0002 13.3 0.0 1 1 1.2e-05 0.00031 12.7 0.0 3 29 160 185 158 233 0.81 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 2_11 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 1.5e-06 20.5 0.2 1 2 0.0037 0.28 3.6 0.0 33 52 8 27 4 28 0.91 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 2_11 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 1.5e-06 20.5 0.2 2 2 9.1e-06 0.00068 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 7801 # 8358 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.523 1_57 - 92 DUF2387 PF09526.5 71 0.00013 14.4 0.2 1 1 2.3e-06 0.00017 14.0 0.2 10 47 7 47 5 72 0.76 # 46052 # 46327 # -1 # ID=1_57;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_28 - 280 Pterin_bind PF00809.17 210 1.9e-58 189.7 0.0 1 1 3e-60 2.3e-58 189.5 0.0 1 210 7 216 7 216 0.98 # 22442 # 23281 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 1_37 - 332 IstB_IS21 PF01695.12 178 2.1e-05 16.5 0.0 1 1 4.5e-07 3.3e-05 15.8 0.0 44 73 155 184 127 201 0.82 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 2_5 - 422 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 1.7e-06 20.1 0.1 1 2 3e-07 2.2e-05 16.5 0.0 6 35 182 211 180 216 0.84 # 3225 # 4490 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 2_5 - 422 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 1.7e-06 20.1 0.1 2 2 0.048 3.6 -0.2 0.0 6 20 265 279 256 283 0.80 # 3225 # 4490 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 1_37 - 332 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.00016 13.6 0.2 1 1 3.5e-06 0.00026 12.9 0.2 2 32 157 187 156 205 0.83 # 31431 # 32426 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/309cc78f-7fb2-49c0-90c4-abb9d1314582 # Target file: checkm_output/bins/pm1938/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1938/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/309cc78f-7fb2-49c0-90c4-abb9d1314582 checkm_output/bins/pm1938/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:55:58 2017 # [ok]