# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_87 - 447 KaiC PF06745.8 227 6.7e-11 34.8 0.4 1 3 0.0089 1.1 1.5 0.0 120 163 74 120 14 184 0.61 # 78764 # 80104 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_87 - 447 KaiC PF06745.8 227 6.7e-11 34.8 0.4 2 3 1.7e-11 2.1e-09 30.0 0.0 2 168 191 376 190 393 0.64 # 78764 # 80104 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_87 - 447 KaiC PF06745.8 227 6.7e-11 34.8 0.4 3 3 0.01 1.2 1.3 0.1 65 133 342 408 336 417 0.59 # 78764 # 80104 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_112 - 780 RecA PF00154.16 323 1.2e-40 132.7 0.0 1 2 1.5e-08 1.8e-06 20.3 0.0 22 70 16 68 7 101 0.81 # 101717 # 104056 # 1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_112 - 780 RecA PF00154.16 323 1.2e-40 132.7 0.0 2 2 8e-36 9.5e-34 110.0 0.0 64 281 484 728 480 753 0.81 # 101717 # 104056 # 1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_54 - 222 ABC_tran PF00005.22 137 1.7e-14 47.5 0.1 1 1 1.2e-13 4.9e-12 39.5 0.1 1 134 39 152 39 155 0.83 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_4 - 639 ABC_tran PF00005.22 137 1.6e-06 21.7 6.3 1 1 0.0003 0.012 9.1 6.3 79 125 482 564 40 568 0.86 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_13 - 215 ABC_tran PF00005.22 137 0.00011 15.7 0.0 1 1 5.6e-06 0.00022 14.7 0.0 13 35 4 26 2 34 0.90 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_54 - 222 DUF815 PF05673.8 250 2.6e-05 16.3 0.0 1 1 3.4e-07 4e-05 15.8 0.0 32 103 30 99 9 106 0.82 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_25 - 562 N6_Mtase PF02384.11 311 7.1e-05 15.1 0.0 1 2 0.00079 0.094 4.8 0.0 27 66 400 440 394 449 0.87 # 21208 # 22893 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_25 - 562 N6_Mtase PF02384.11 311 7.1e-05 15.1 0.0 2 2 0.00014 0.017 7.3 0.0 122 144 479 501 459 522 0.83 # 21208 # 22893 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_54 - 222 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00025 13.7 0.1 1 2 1.5e-05 0.0018 10.9 0.0 19 49 46 76 31 92 0.79 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00025 13.7 0.1 2 2 0.026 3.1 0.4 0.1 131 150 174 194 155 209 0.67 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_51 - 520 Helicase_C PF00271.26 78 1.6e-14 46.7 0.0 1 1 4.1e-16 4.8e-14 45.2 0.0 2 78 387 463 386 463 0.97 # 41775 # 43334 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_13 - 215 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 1.9e-05 17.7 0.8 1 1 4.6e-07 5.4e-05 16.3 0.8 2 30 5 33 4 206 0.96 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_114 - 277 TIGR01932 TIGR01932 318 1.3e-09 30.2 2.7 1 1 1.4e-11 1.7e-09 29.7 2.7 144 268 115 240 84 244 0.84 # 104354 # 105184 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.477 1_114 - 277 TIGR01933 TIGR01933 261 6e-06 18.7 1.8 1 1 6.6e-08 7.8e-06 18.3 1.8 84 201 115 234 80 252 0.78 # 104354 # 105184 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.477 1_54 - 222 MobB PF03205.9 140 3.9e-06 19.8 0.0 1 1 1.5e-07 9.2e-06 18.6 0.0 2 37 51 86 50 102 0.88 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_13 - 215 MobB PF03205.9 140 0.00069 12.5 0.0 1 1 2.2e-05 0.0013 11.6 0.0 2 20 4 22 3 35 0.90 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_13 - 215 AAA_19 PF13245.1 76 0.00058 12.8 0.1 1 1 3.3e-05 0.0013 11.7 0.1 15 35 7 26 4 52 0.78 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_58 - 419 AAA_19 PF13245.1 76 0.00088 12.2 0.0 1 1 4.5e-05 0.0018 11.2 0.0 22 58 36 70 20 94 0.79 # 47419 # 48675 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_34 - 367 AAA_19 PF13245.1 76 0.0027 10.7 2.0 1 2 0.0003 0.012 8.6 0.3 17 45 112 136 104 141 0.81 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_34 - 367 AAA_19 PF13245.1 76 0.0027 10.7 2.0 2 2 0.09 3.6 0.7 0.1 13 25 216 228 211 251 0.86 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_34 - 367 CbiA PF01656.18 195 4.4e-20 65.0 0.1 1 1 1.7e-21 6.8e-20 64.4 0.1 1 157 107 275 107 278 0.76 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_83 - 223 CbiA PF01656.18 195 2.4e-15 49.6 0.2 1 1 9.5e-17 3.8e-15 48.9 0.2 2 158 6 147 5 185 0.75 # 75959 # 76627 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_54 - 222 CbiA PF01656.18 195 0.00052 12.6 0.2 1 1 2e-05 0.0008 12.0 0.2 2 48 52 101 51 201 0.72 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 PRK PF00485.13 194 3.9e-05 16.4 0.1 1 1 1.3e-06 7.9e-05 15.4 0.0 1 39 51 88 51 107 0.78 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_13 - 215 PRK PF00485.13 194 9.2e-05 15.2 0.0 1 1 2.3e-06 0.00014 14.6 0.0 2 33 5 38 4 74 0.79 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_54 - 222 KTI12 PF08433.5 270 6.7e-07 21.9 0.1 1 2 1.6e-07 1.9e-05 17.1 0.0 4 40 52 88 50 102 0.90 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 KTI12 PF08433.5 270 6.7e-07 21.9 0.1 2 2 0.0037 0.44 2.8 0.0 187 219 149 181 136 217 0.65 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_35 - 653 TIGR00392 TIGR00392 861 4.4e-17 54.3 0.3 1 3 2.8e-07 3.3e-05 15.0 0.0 58 106 3 50 1 67 0.82 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_35 - 653 TIGR00392 TIGR00392 861 4.4e-17 54.3 0.3 2 3 0.015 1.8 -0.7 0.0 419 468 161 210 156 219 0.74 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_35 - 653 TIGR00392 TIGR00392 861 4.4e-17 54.3 0.3 3 3 1.3e-13 1.5e-11 35.9 0.0 597 792 295 485 276 544 0.76 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_35 - 653 TIGR00398 TIGR00398 530 5.9e-199 654.9 0.0 1 1 5.8e-201 6.9e-199 654.7 0.0 19 530 1 511 1 511 0.99 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_119 - 352 Rep_3 PF01051.16 222 2e-38 125.3 0.0 1 1 3.2e-40 3.8e-38 124.4 0.0 3 220 27 283 25 286 0.92 # 107285 # 108340 # -1 # ID=1_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_4 - 639 AAA_23 PF13476.1 202 1.2e-19 64.6 11.6 1 1 1.3e-19 1.6e-17 57.7 8.8 1 201 5 266 5 509 0.78 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_15 - 186 TIGR00573 TIGR00573 217 1.5e-16 53.4 0.0 1 1 1.6e-18 1.9e-16 53.1 0.0 12 173 8 171 2 176 0.87 # 14029 # 14586 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 1_13 - 215 AAA_24 PF13479.1 213 0.00084 12.1 0.0 1 1 1e-05 0.0012 11.6 0.0 5 25 4 24 2 65 0.86 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_25 - 562 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2.6e-09 30.3 0.0 1 1 4.2e-11 4.9e-09 29.4 0.0 2 116 422 519 421 520 0.89 # 21208 # 22893 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_54 - 222 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.4e-05 17.4 0.1 1 2 3.4e-07 4e-05 15.9 0.0 14 52 47 85 37 101 0.82 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.4e-05 17.4 0.1 2 2 0.064 7.7 -1.3 0.0 174 185 159 170 126 207 0.61 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 AAA_30 PF13604.1 196 3.4e-05 16.6 0.1 1 2 2.4e-06 0.00028 13.6 0.0 17 50 48 81 43 112 0.91 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 AAA_30 PF13604.1 196 3.4e-05 16.6 0.1 2 2 0.017 2.1 1.0 0.0 36 52 167 183 120 217 0.64 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_4 - 639 SMC_N PF02463.14 220 3.1e-16 52.4 0.1 1 1 8.8e-18 5.3e-16 51.6 0.1 32 199 41 617 4 633 0.91 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_54 - 222 SMC_N PF02463.14 220 4.8e-05 15.8 0.6 1 2 0.00099 0.059 5.7 0.1 25 41 50 66 39 72 0.82 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 SMC_N PF02463.14 220 4.8e-05 15.8 0.6 2 2 0.00012 0.007 8.7 0.0 135 204 117 192 67 208 0.65 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_83 - 223 MipZ PF09140.6 261 6.1e-17 54.6 0.2 1 1 7.5e-17 4.5e-15 48.5 0.2 2 150 4 133 3 145 0.84 # 75959 # 76627 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_34 - 367 MipZ PF09140.6 261 1.7e-10 33.6 0.0 1 1 5e-12 3e-10 32.7 0.0 2 117 106 232 105 260 0.68 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_28 - 184 DivIC PF04977.10 80 4.8e-05 16.0 0.0 1 1 6.8e-07 8.1e-05 15.3 0.0 5 51 50 96 49 104 0.89 # 24177 # 24728 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.495 1_4 - 639 AAA_21 PF13304.1 303 1.2e-07 25.1 0.1 1 2 0.00024 0.014 8.4 0.0 8 23 42 57 41 115 0.81 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_4 - 639 AAA_21 PF13304.1 303 1.2e-07 25.1 0.1 2 2 3.5e-06 0.00021 14.5 0.1 219 297 500 615 375 616 0.67 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_13 - 215 AAA_21 PF13304.1 303 0.00074 12.6 0.0 1 1 1.6e-05 0.00098 12.2 0.0 3 22 6 25 5 79 0.88 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_13 - 215 AAA PF00004.24 132 8.8e-05 15.9 0.1 1 1 1.5e-06 0.00018 14.9 0.0 3 42 7 49 5 72 0.82 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_101 - 129 HTH_37 PF13744.1 80 0.00025 14.0 0.0 1 1 3.7e-06 0.00044 13.2 0.0 17 56 11 51 2 70 0.80 # 88840 # 89226 # -1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_56 - 89 LexA_DNA_bind PF01726.11 65 0.00036 13.3 0.3 1 1 1.4e-05 0.0016 11.2 0.3 4 64 3 63 1 64 0.84 # 46324 # 46590 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_35 - 653 tRNA_bind PF01588.15 95 1.3e-24 79.1 0.0 1 1 2.4e-26 2.8e-24 78.0 0.0 1 94 556 649 556 650 0.98 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_56 - 89 HTH_27 PF13463.1 68 0.00049 13.6 0.2 1 2 0.042 5 0.8 0.0 19 43 5 30 2 32 0.73 # 46324 # 46590 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_56 - 89 HTH_27 PF13463.1 68 0.00049 13.6 0.2 2 2 2.8e-05 0.0033 10.9 0.0 29 58 36 63 34 79 0.75 # 46324 # 46590 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_35 - 653 tRNA-synt_1g PF09334.6 391 4.5e-146 479.5 0.1 1 1 4.8e-148 5.7e-146 479.2 0.1 19 390 1 372 1 373 0.98 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_106 - 72 CSD PF00313.17 66 9.8e-36 114.6 0.2 1 1 9e-38 1.1e-35 114.5 0.2 1 65 5 69 5 70 0.98 # 97219 # 97434 # -1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 1_35 - 653 tRNA-synt_1 PF00133.17 601 4e-12 38.0 0.9 1 3 1.7e-07 2e-05 15.8 0.0 44 103 2 60 1 87 0.81 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_35 - 653 tRNA-synt_1 PF00133.17 601 4e-12 38.0 0.9 2 3 0.023 2.7 -1.1 0.1 479 498 188 207 172 219 0.65 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_35 - 653 tRNA-synt_1 PF00133.17 601 4e-12 38.0 0.9 3 3 1.2e-08 1.5e-06 19.6 0.0 546 597 294 345 249 349 0.81 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_54 - 222 cobW PF02492.14 178 0.00067 12.3 0.0 1 1 9.8e-06 0.0012 11.5 0.0 2 33 51 83 50 112 0.78 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 AAA_16 PF13191.1 185 1.7e-08 27.8 0.0 1 1 1.8e-10 2.2e-08 27.4 0.0 13 87 39 107 30 194 0.78 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 AAA_22 PF13401.1 131 3.7e-07 23.5 0.0 1 1 2.4e-08 9.4e-07 22.2 0.0 3 86 48 176 44 194 0.73 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_87 - 447 AAA_22 PF13401.1 131 0.00073 12.9 0.1 1 1 9.9e-05 0.0039 10.5 0.1 3 118 208 361 203 371 0.65 # 78764 # 80104 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_13 - 215 AAA_22 PF13401.1 131 0.00079 12.7 0.2 1 1 2.7e-05 0.0011 12.3 0.2 9 28 7 26 3 153 0.92 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_97 - 82 TIGR00365 TIGR00365 99 6.1e-05 16.0 0.0 1 1 6e-07 7.1e-05 15.8 0.0 26 82 10 72 2 79 0.77 # 86490 # 86735 # 1 # ID=1_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_25 - 562 Methyltransf_27 PF13708.1 194 3.8e-45 146.9 1.2 1 2 1.3e-46 1.6e-44 144.9 1.3 3 194 87 300 85 300 0.91 # 21208 # 22893 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_25 - 562 Methyltransf_27 PF13708.1 194 3.8e-45 146.9 1.2 2 2 0.084 10 -1.3 0.0 108 135 348 375 334 384 0.78 # 21208 # 22893 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_54 - 222 AAA_29 PF13555.1 62 1.3e-07 24.2 0.0 1 1 5.9e-09 3.5e-07 22.9 0.0 8 40 35 66 32 70 0.91 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_4 - 639 AAA_29 PF13555.1 62 7.5e-05 15.4 0.0 1 1 3.5e-06 0.00021 14.0 0.0 31 51 41 61 4 66 0.82 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_34 - 367 SRP54 PF00448.17 196 0.001 11.7 0.1 1 1 1.8e-05 0.0021 10.6 0.1 7 41 111 145 104 153 0.90 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_13 - 215 AAA_28 PF13521.1 163 2.7e-11 36.8 0.0 1 1 3.4e-13 4.1e-11 36.2 0.0 1 101 4 102 4 158 0.82 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_15 - 186 RNase_H_2 PF13482.1 164 1.5e-07 24.5 0.0 1 1 1.5e-08 1.8e-06 21.0 0.0 45 121 75 154 6 160 0.66 # 14029 # 14586 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 1_101 - 129 HTH_3 PF01381.17 55 0.00044 13.3 0.0 1 1 6.4e-06 0.00076 12.5 0.0 10 53 26 70 23 72 0.96 # 88840 # 89226 # -1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_34 - 367 Fer4_NifH PF00142.13 273 3.1e-10 32.8 0.0 1 2 5.7e-08 3.4e-06 19.5 0.0 6 51 111 156 105 161 0.83 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_34 - 367 Fer4_NifH PF00142.13 273 3.1e-10 32.8 0.0 2 2 2.2e-05 0.0013 11.0 0.0 192 256 293 360 241 365 0.86 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_83 - 223 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00042 12.7 1.9 1 2 1.4e-05 0.00086 11.7 0.3 8 45 11 49 3 97 0.73 # 75959 # 76627 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_83 - 223 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00042 12.7 1.9 2 2 0.031 1.8 0.7 0.1 155 228 100 177 79 196 0.68 # 75959 # 76627 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_101 - 129 HTH_19 PF12844.2 64 2.3e-07 24.0 0.0 1 1 2.9e-09 3.5e-07 23.4 0.0 9 62 22 76 14 78 0.89 # 88840 # 89226 # -1 # ID=1_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 1_54 - 222 NB-ARC PF00931.17 287 0.00067 11.7 0.9 1 1 1.1e-05 0.00065 11.7 0.1 8 42 38 72 32 195 0.93 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_13 - 215 NB-ARC PF00931.17 287 0.00094 11.2 0.1 1 1 2.6e-05 0.0016 10.5 0.1 22 42 5 25 3 31 0.89 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_110 - 315 TIGR00593 TIGR00593 890 1.9e-37 121.9 0.0 1 1 1.9e-39 2.2e-37 121.6 0.0 3 278 5 287 3 307 0.81 # 100504 # 101448 # 1 # ID=1_110;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_51 - 520 TIGR00595 TIGR00595 509 0.00051 11.5 0.0 1 1 1e-05 0.0012 10.2 0.0 300 339 403 442 375 452 0.83 # 41775 # 43334 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_54 - 222 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00031 13.6 0.0 1 1 3.3e-06 0.00039 13.3 0.0 18 68 47 97 42 177 0.85 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_58 - 419 PhoH PF02562.11 205 7.3e-05 15.2 0.1 1 2 4.8e-05 0.0057 9.0 0.0 31 136 36 134 13 141 0.63 # 47419 # 48675 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_58 - 419 PhoH PF02562.11 205 7.3e-05 15.2 0.1 2 2 0.0032 0.38 3.1 0.0 62 106 348 392 320 397 0.87 # 47419 # 48675 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_104 - 412 AAA_5 PF07728.9 139 8.9e-18 57.5 0.0 1 1 1.3e-19 1.6e-17 56.7 0.0 4 126 173 293 172 308 0.93 # 91993 # 93228 # 1 # ID=1_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 1_51 - 520 ResIII PF04851.10 184 8.2e-18 58.0 0.0 1 1 1.5e-19 1.8e-17 56.9 0.0 26 183 112 268 96 269 0.82 # 41775 # 43334 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_51 - 520 SNF2_N PF00176.18 299 3.4e-05 15.9 0.0 1 1 4.7e-07 5.6e-05 15.2 0.0 106 182 186 277 145 285 0.84 # 41775 # 43334 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_34 - 367 TIGR01968 TIGR01968 261 9.9e-18 57.2 0.6 1 2 1.9e-14 1.1e-12 40.6 0.2 2 53 105 156 104 158 0.94 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_34 - 367 TIGR01968 TIGR01968 261 9.9e-18 57.2 0.6 2 2 2e-06 0.00012 14.3 0.0 98 237 199 347 193 353 0.65 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_83 - 223 TIGR01968 TIGR01968 261 2.8e-09 29.5 7.2 1 2 8e-07 4.7e-05 15.6 1.6 2 40 3 42 2 46 0.86 # 75959 # 76627 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_83 - 223 TIGR01968 TIGR01968 261 2.8e-09 29.5 7.2 2 2 2.2e-07 1.3e-05 17.5 0.4 99 199 69 173 52 213 0.84 # 75959 # 76627 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_13 - 215 AAA_18 PF13238.1 129 6.9e-07 22.8 0.2 1 1 2e-08 1.2e-06 22.1 0.1 1 25 5 29 5 93 0.86 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_54 - 222 AAA_18 PF13238.1 129 2e-06 21.3 0.0 1 1 6.4e-08 3.8e-06 20.4 0.0 1 40 52 91 52 106 0.82 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_50 - 93 Rho_N PF07498.7 43 0.00012 15.0 2.0 1 2 8.2e-06 0.00098 12.1 0.2 24 39 34 49 27 52 0.90 # 41494 # 41772 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 1_50 - 93 Rho_N PF07498.7 43 0.00012 15.0 2.0 2 2 0.011 1.3 2.0 0.1 22 30 76 84 69 90 0.82 # 41494 # 41772 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 1_106 - 72 OB_RNB PF08206.6 58 3.9e-06 19.5 0.5 1 1 4.7e-08 5.6e-06 19.0 0.4 6 29 14 37 10 41 0.88 # 97219 # 97434 # -1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 1_54 - 222 DUF258 PF03193.11 161 2.5e-05 16.6 0.0 1 1 3.8e-07 4.5e-05 15.8 0.0 26 84 39 110 14 119 0.74 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_15 - 186 TIGR01406 TIGR01406 231 2.4e-20 65.9 0.0 1 1 2.5e-22 3e-20 65.6 0.0 5 166 8 169 3 178 0.88 # 14029 # 14586 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 1_87 - 447 DnaB_C PF03796.10 259 4.2e-12 38.6 0.2 1 1 5.2e-14 6.2e-12 38.0 0.2 2 237 190 420 189 441 0.75 # 78764 # 80104 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_54 - 222 DUF2791 PF10923.3 417 0.00023 13.0 0.1 1 1 3.6e-06 0.00043 12.1 0.0 26 84 27 84 23 105 0.85 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_35 - 653 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 1.4e-12 40.5 0.1 1 2 6e-06 0.00072 11.8 0.0 31 120 4 94 2 107 0.89 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_35 - 653 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 1.4e-12 40.5 0.1 2 2 2.8e-10 3.3e-08 26.1 0.0 213 283 269 338 263 359 0.82 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_34 - 367 AAA_26 PF13500.1 199 0.00023 13.9 0.6 1 2 0.0011 0.13 5.0 0.1 3 33 107 137 105 144 0.88 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_34 - 367 AAA_26 PF13500.1 199 0.00023 13.9 0.6 2 2 0.00029 0.035 6.8 0.0 117 196 224 317 217 319 0.69 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_54 - 222 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 7.5e-05 16.0 0.0 1 1 1.1e-06 0.00013 15.2 0.0 11 88 39 134 34 191 0.69 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_58 - 419 Terminase_GpA PF05876.7 557 2.7e-05 15.8 0.1 1 1 3.8e-07 4.5e-05 15.0 0.1 35 149 26 132 11 136 0.79 # 47419 # 48675 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_15 - 186 TIGR01298 TIGR01298 200 9.2e-07 21.6 0.4 1 1 3.5e-07 4.2e-05 16.2 0.4 13 192 8 175 3 179 0.71 # 14029 # 14586 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 1_13 - 215 HTH_33 PF13592.1 60 0.00022 13.9 0.0 1 1 3.7e-06 0.00044 13.0 0.0 10 36 18 44 16 49 0.94 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_51 - 520 DEAD PF00270.24 169 5.3e-14 45.2 0.1 1 2 2.8e-13 1.7e-11 37.1 0.0 2 163 99 268 98 275 0.68 # 41775 # 43334 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_51 - 520 DEAD PF00270.24 169 5.3e-14 45.2 0.1 2 2 0.0028 0.17 4.5 0.0 64 102 384 425 371 428 0.79 # 41775 # 43334 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.469 1_58 - 419 DEAD PF00270.24 169 0.00018 14.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.00066 12.4 0.0 25 133 35 131 15 154 0.77 # 47419 # 48675 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_54 - 222 DUF2075 PF09848.4 352 7.9e-05 14.8 0.1 1 2 1.8e-06 0.00022 13.4 0.0 3 28 51 76 49 105 0.82 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 DUF2075 PF09848.4 352 7.9e-05 14.8 0.1 2 2 0.056 6.7 -1.4 0.0 207 245 166 203 147 212 0.70 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_25 - 562 TIGR00755 TIGR00755 256 1.2e-05 17.5 0.0 1 1 2.4e-07 2.8e-05 16.3 0.0 15 106 406 494 393 502 0.84 # 21208 # 22893 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_58 - 419 Terminase_6 PF03237.10 384 3e-21 68.7 0.0 1 1 3e-23 3.5e-21 68.5 0.0 4 382 31 403 28 405 0.89 # 47419 # 48675 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_54 - 222 T2SE PF00437.15 272 0.0003 12.9 0.1 1 1 4.6e-06 0.00055 12.0 0.1 117 164 38 85 6 109 0.79 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 NACHT PF05729.7 166 4.6e-05 16.3 0.0 1 1 1.8e-06 0.00011 15.1 0.0 2 30 51 79 50 106 0.84 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_13 - 215 NACHT PF05729.7 166 0.00092 12.0 0.1 1 1 2.8e-05 0.0017 11.2 0.1 4 20 6 22 3 27 0.87 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_54 - 222 UPF0079 PF02367.12 123 4.9e-06 19.4 0.0 1 1 8.9e-08 1.1e-05 18.3 0.0 10 47 44 82 36 93 0.87 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_75 - 198 Lambda_tail_I PF06805.7 82 0.00014 14.8 0.0 1 1 3.4e-06 0.00041 13.4 0.0 5 81 7 95 4 96 0.75 # 63731 # 64324 # 1 # ID=1_75;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.478 1_13 - 215 AAA_17 PF13207.1 121 1.8e-13 44.6 0.1 1 1 3.9e-15 2.3e-13 44.2 0.1 1 95 4 103 4 192 0.76 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_54 - 222 AAA_17 PF13207.1 121 5.5e-07 23.6 0.0 1 1 1.6e-08 9.7e-07 22.8 0.0 1 33 51 86 51 183 0.81 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 TIGR02211 TIGR02211 221 2.4e-16 52.8 0.2 1 2 1.5e-09 8.9e-08 24.7 0.0 15 51 33 69 22 81 0.90 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 TIGR02211 TIGR02211 221 2.4e-16 52.8 0.2 2 2 4.7e-10 2.8e-08 26.3 0.0 119 215 102 200 83 204 0.86 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_4 - 639 TIGR02211 TIGR02211 221 2.9e-05 16.5 0.2 1 2 0.041 2.5 0.4 0.1 39 51 41 53 31 77 0.83 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_4 - 639 TIGR02211 TIGR02211 221 2.9e-05 16.5 0.2 2 2 5.2e-06 0.00031 13.1 0.0 137 218 543 634 520 636 0.79 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_87 - 447 AAA_25 PF13481.1 194 2.3e-13 43.1 0.1 1 2 0.067 2.7 0.5 0.0 120 176 44 103 12 114 0.63 # 78764 # 80104 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_87 - 447 AAA_25 PF13481.1 194 2.3e-13 43.1 0.1 2 2 5e-14 2e-12 40.1 0.0 14 193 189 372 175 373 0.75 # 78764 # 80104 # 1 # ID=1_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 1_54 - 222 AAA_25 PF13481.1 194 0.00023 13.8 0.1 1 2 7.3e-05 0.0029 10.2 0.0 18 50 30 66 15 88 0.77 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 AAA_25 PF13481.1 194 0.00023 13.8 0.1 2 2 0.037 1.5 1.3 0.1 165 185 162 182 144 186 0.80 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_34 - 367 AAA_25 PF13481.1 194 0.00034 13.2 0.1 1 1 1.6e-05 0.00063 12.3 0.1 36 60 108 133 99 191 0.84 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_71 - 1526 YajC PF02699.10 83 0.0088 8.9 4.4 1 1 2.5e-05 0.0029 10.5 0.2 28 61 659 692 646 709 0.83 # 57217 # 61794 # 1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_54 - 222 AAA_15 PF13175.1 415 0.00015 14.0 0.0 1 1 1.5e-06 0.00018 13.8 0.0 22 54 44 95 5 142 0.75 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_13 - 215 AAA_14 PF13173.1 128 0.0002 14.4 0.1 1 1 1.1e-05 0.00066 12.8 0.1 5 35 5 31 2 41 0.80 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_54 - 222 AAA_14 PF13173.1 128 0.00037 13.6 0.0 1 1 1.9e-05 0.0011 12.0 0.0 2 44 49 90 48 122 0.72 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_83 - 223 VirC1 PF07015.6 231 1.5e-07 23.8 0.0 1 1 3.6e-09 2.2e-07 23.3 0.0 6 189 7 189 2 203 0.81 # 75959 # 76627 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_34 - 367 VirC1 PF07015.6 231 4e-05 15.9 0.0 1 1 1.2e-06 7e-05 15.1 0.0 2 40 105 143 104 149 0.93 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_50 - 93 GrpE PF01025.14 166 0.0004 13.1 2.2 1 1 3.8e-06 0.00045 12.9 2.2 43 108 19 90 2 91 0.74 # 41494 # 41772 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 1_79 - 231 MerR PF00376.18 38 4.9e-05 16.1 0.1 1 2 0.093 11 -1.1 0.0 10 17 62 69 62 73 0.87 # 73728 # 74420 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_79 - 231 MerR PF00376.18 38 4.9e-05 16.1 0.1 2 2 2.6e-06 0.0003 13.5 0.0 2 26 87 111 86 124 0.85 # 73728 # 74420 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_13 - 215 AAA_33 PF13671.1 143 0.00037 13.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.00065 12.7 0.0 5 78 8 81 5 119 0.63 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_54 - 222 AAA_33 PF13671.1 143 0.00038 13.5 0.1 1 1 1.1e-05 0.00066 12.7 0.1 1 33 51 94 51 213 0.69 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 ArgK PF03308.11 267 2.1e-05 16.5 0.0 1 1 6.2e-07 3.7e-05 15.7 0.0 28 63 48 83 5 86 0.89 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_34 - 367 ArgK PF03308.11 267 0.00075 11.4 0.4 1 1 2e-05 0.0012 10.7 0.4 35 66 111 142 89 155 0.82 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_4 - 639 SbcCD_C PF13558.1 90 3.8e-08 26.4 0.1 1 1 7.6e-10 9e-08 25.2 0.1 7 89 529 601 520 602 0.84 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_105 - 1169 HHH_6 PF14579.1 90 4.2e-17 55.2 0.0 1 1 1.3e-18 1.5e-16 53.4 0.0 1 84 862 952 862 955 0.94 # 93409 # 96915 # 1 # ID=1_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_25 - 562 MTS PF05175.9 170 0.0012 11.3 0.0 1 1 2.6e-05 0.0031 10.1 0.0 97 140 481 518 408 532 0.78 # 21208 # 22893 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_54 - 222 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00011 15.5 0.1 1 1 5.5e-06 0.00065 13.1 0.1 1 26 52 77 52 109 0.80 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_93 - 72 HTH_45 PF14947.1 77 0.00029 13.8 0.0 1 1 4.2e-06 0.0005 13.1 0.0 43 71 33 66 29 70 0.80 # 84242 # 84457 # 1 # ID=1_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 1_54 - 222 APS_kinase PF01583.15 157 4.1e-07 22.9 0.0 1 1 6.6e-09 7.9e-07 22.0 0.0 1 38 48 85 48 105 0.86 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 NTPase_1 PF03266.10 168 3.5e-05 16.7 0.0 1 2 5.6e-06 0.00034 13.5 0.0 2 31 52 81 51 85 0.94 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 NTPase_1 PF03266.10 168 3.5e-05 16.7 0.0 2 2 0.055 3.3 0.5 0.0 94 140 143 193 124 216 0.57 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_13 - 215 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00041 13.2 0.1 1 1 1.3e-05 0.00075 12.4 0.1 1 19 4 22 4 28 0.88 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_19 - 198 RNase_H PF00075.19 132 3.3e-34 111.2 0.0 1 1 3.8e-36 4.5e-34 110.8 0.0 3 131 40 178 38 179 0.90 # 17334 # 17927 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.465 1_35 - 653 TIGR00422 TIGR00422 863 7.1e-16 50.1 4.7 1 3 1.7e-06 0.00021 12.2 0.1 56 89 4 37 1 100 0.87 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_35 - 653 TIGR00422 TIGR00422 863 7.1e-16 50.1 4.7 2 3 0.0047 0.56 0.8 0.1 385 414 188 219 163 221 0.79 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_35 - 653 TIGR00422 TIGR00422 863 7.1e-16 50.1 4.7 3 3 4.8e-14 5.8e-12 37.2 0.1 512 696 295 479 267 518 0.79 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_57 - 211 HTH_26 PF13443.1 63 0.00067 13.0 0.0 1 2 4e-05 0.0048 10.3 0.0 11 34 29 52 25 55 0.90 # 46787 # 47419 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_57 - 211 HTH_26 PF13443.1 63 0.00067 13.0 0.0 2 2 0.081 9.7 -0.3 0.0 22 44 164 188 161 190 0.74 # 46787 # 47419 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_54 - 222 KAP_NTPase PF07693.9 325 3.7e-07 22.5 0.0 1 1 3.7e-09 4.4e-07 22.3 0.0 18 115 47 142 37 203 0.69 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_114 - 277 ATP-synt_B PF00430.13 132 0.00068 12.6 7.0 1 1 1.1e-05 0.0013 11.7 7.0 45 93 187 233 179 265 0.81 # 104354 # 105184 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.477 1_10 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 4.7e-67 219.0 0.5 1 4 6.4e-22 7.6e-20 64.0 0.0 2 84 18 101 17 103 0.95 # 10903 # 12006 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_10 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 4.7e-67 219.0 0.5 2 4 1.7e-08 2e-06 19.9 0.2 116 136 100 120 100 135 0.84 # 10903 # 12006 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_10 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 4.7e-67 219.0 0.5 3 4 4.1e-16 4.9e-14 45.0 0.0 139 188 157 206 149 221 0.90 # 10903 # 12006 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_10 - 368 TIGR03284 TIGR03284 296 4.7e-67 219.0 0.5 4 4 6.2e-29 7.4e-27 87.0 0.0 191 296 260 367 255 367 0.93 # 10903 # 12006 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.488 1_20 - 165 PdxJ PF03740.8 239 0.0008 11.7 0.0 1 1 9.5e-06 0.0011 11.2 0.0 149 226 22 99 9 103 0.85 # 18073 # 18567 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 1_56 - 89 MarR_2 PF12802.2 62 0.00037 13.4 0.1 1 1 5.9e-06 0.0007 12.5 0.1 34 54 38 58 36 72 0.75 # 46324 # 46590 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.461 1_54 - 222 PIF1 PF05970.9 364 5.4e-05 15.4 0.0 1 1 7.3e-07 8.7e-05 14.7 0.0 18 55 45 82 31 85 0.87 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_50 - 93 LacI PF00356.16 46 0.001 11.9 1.8 1 1 1.1e-05 0.0013 11.5 0.1 25 41 61 77 55 80 0.86 # 41494 # 41772 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 1_34 - 367 ParA PF10609.4 81 2.7e-38 122.9 0.4 1 1 4.2e-40 5e-38 122.1 0.4 1 81 213 293 213 293 0.99 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_35 - 653 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 1.1e-06 20.6 0.0 1 1 2.1e-08 2.5e-06 19.5 0.0 265 323 291 349 285 361 0.74 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_13 - 215 CoaE PF01121.15 180 1.5e-06 20.9 0.1 1 1 2.5e-08 3e-06 19.9 0.1 2 31 4 34 3 50 0.92 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_15 - 186 RNase_T PF00929.19 164 1.9e-21 70.2 0.0 1 1 1.9e-23 2.2e-21 70.0 0.0 3 164 8 168 6 168 0.93 # 14029 # 14586 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 1_13 - 215 SKI PF01202.17 158 0.00091 12.3 0.0 1 1 1.4e-05 0.0016 11.4 0.0 2 23 12 33 11 68 0.89 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_54 - 222 AAA_10 PF12846.2 304 3.3e-06 19.8 0.4 1 2 3.5e-06 0.00014 14.5 0.0 6 42 54 92 51 107 0.81 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_54 - 222 AAA_10 PF12846.2 304 3.3e-06 19.8 0.4 2 2 0.0063 0.25 3.8 0.1 216 260 140 184 94 191 0.78 # 44762 # 45427 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_4 - 639 AAA_10 PF12846.2 304 4.5e-06 19.4 3.0 1 2 0.00046 0.018 7.5 0.2 10 23 42 55 39 93 0.75 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_4 - 639 AAA_10 PF12846.2 304 4.5e-06 19.4 3.0 2 2 2.7e-05 0.0011 11.6 0.2 62 262 434 617 387 628 0.85 # 2919 # 4835 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.464 1_34 - 367 AAA_10 PF12846.2 304 0.00014 14.4 0.0 1 1 5.7e-06 0.00022 13.8 0.0 7 67 111 172 106 216 0.73 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_57 - 211 HTH_20 PF12840.2 61 0.00048 13.1 0.0 1 1 2.1e-05 0.0025 10.8 0.0 21 47 25 51 11 58 0.89 # 46787 # 47419 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.494 1_13 - 215 CPT PF07931.7 174 0.00062 12.6 0.0 1 2 2.2e-05 0.0026 10.5 0.0 7 45 8 46 5 84 0.81 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_13 - 215 CPT PF07931.7 174 0.00062 12.6 0.0 2 2 0.077 9.1 -1.0 0.0 61 86 170 195 142 206 0.58 # 12894 # 13538 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.474 1_25 - 562 RrnaAD PF00398.15 262 0.00015 13.9 0.0 1 1 2.4e-06 0.00028 13.1 0.0 11 108 401 493 394 500 0.81 # 21208 # 22893 # 1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.502 1_114 - 277 TIGR01144 TIGR01144 147 0.034 6.9 9.5 1 2 0.031 3.6 0.3 0.0 109 145 117 153 110 155 0.77 # 104354 # 105184 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.477 1_114 - 277 TIGR01144 TIGR01144 147 0.034 6.9 9.5 2 2 0.00028 0.033 6.9 6.6 41 89 187 235 179 252 0.84 # 104354 # 105184 # 1 # ID=1_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.477 1_35 - 653 TIGR00435 TIGR00435 466 2.3e-14 46.1 0.0 1 2 1.1e-05 0.0013 10.6 0.0 44 132 5 94 2 104 0.88 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_35 - 653 TIGR00435 TIGR00435 466 2.3e-14 46.1 0.0 2 2 1.5e-12 1.7e-10 33.3 0.0 223 375 267 428 263 465 0.62 # 29344 # 31302 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.523 1_34 - 367 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.8e-06 18.9 2.7 1 2 1.6e-07 9.4e-06 17.9 0.6 6 38 110 142 105 144 0.88 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_34 - 367 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.8e-06 18.9 2.7 2 2 0.083 4.9 -0.8 0.0 114 138 200 225 194 234 0.79 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_83 - 223 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.001 11.3 0.7 1 1 3.1e-05 0.0019 10.4 0.7 2 35 3 37 2 44 0.81 # 75959 # 76627 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_34 - 367 AAA_31 PF13614.1 157 8.9e-13 41.6 0.0 1 1 2e-13 1.2e-11 37.9 0.0 1 53 105 157 105 235 0.79 # 28011 # 29111 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.511 1_83 - 223 AAA_31 PF13614.1 157 2.9e-07 23.7 0.1 1 2 7.6e-06 0.00045 13.3 0.0 1 41 3 44 3 68 0.84 # 75959 # 76627 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_83 - 223 AAA_31 PF13614.1 157 2.9e-07 23.7 0.1 2 2 0.00025 0.015 8.4 0.0 109 151 70 114 51 120 0.74 # 75959 # 76627 # 1 # ID=1_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_112 - 780 TIGR02012 TIGR02012 321 1.3e-40 132.5 0.0 1 2 2e-07 2.4e-05 16.6 0.0 35 72 28 68 11 86 0.75 # 101717 # 104056 # 1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_112 - 780 TIGR02012 TIGR02012 321 1.3e-40 132.5 0.0 2 2 6.8e-37 8.1e-35 113.4 0.0 66 284 484 729 479 753 0.79 # 101717 # 104056 # 1 # ID=1_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.485 1_58 - 419 Terminase_3 PF04466.8 387 2.2e-08 26.7 0.0 1 2 6.8e-10 8.1e-08 24.8 0.0 2 123 24 143 23 159 0.92 # 47419 # 48675 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_58 - 419 Terminase_3 PF04466.8 387 2.2e-08 26.7 0.0 2 2 0.041 4.9 -0.8 0.0 342 385 357 402 321 404 0.70 # 47419 # 48675 # 1 # ID=1_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.486 1_50 - 93 SRP_SPB PF02978.14 104 5.3e-05 16.6 2.2 1 1 5.7e-07 6.8e-05 16.3 2.2 37 96 25 90 13 91 0.83 # 41494 # 41772 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/3b02d1d9-95eb-43a7-a1be-f16c1119c68e # Target file: checkm_output/bins/pm1919/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1919/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/3b02d1d9-95eb-43a7-a1be-f16c1119c68e checkm_output/bins/pm1919/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:55:41 2017 # [ok]