# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_17 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.4e-05 17.6 0.0 1 2 0.00037 0.043 6.3 0.0 112 128 18 34 5 81 0.69 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_17 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.4e-05 17.6 0.0 2 2 4e-05 0.0047 9.4 0.0 41 62 162 183 145 218 0.78 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 4_2 - 92 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 9.5e-24 75.8 4.5 1 1 1.6e-25 1.8e-23 74.9 4.5 1 36 1 36 1 36 0.99 # 724 # 999 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 3_5 - 229 HTH_IclR PF09339.5 52 0.00021 14.0 0.1 1 1 3.6e-06 0.00041 13.1 0.1 7 48 29 69 28 72 0.91 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 5_1 - 230 ABC_tran PF00005.22 137 5.3e-08 26.4 0.0 1 1 5.3e-10 6.2e-08 26.2 0.0 11 42 33 64 22 134 0.79 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_17 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00014 14.3 0.0 1 2 0.0006 0.07 5.5 0.0 122 138 18 34 3 79 0.71 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_17 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00014 14.3 0.0 2 2 0.00024 0.028 6.8 0.0 53 86 164 199 155 218 0.77 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_4 - 288 rve_3 PF13683.1 67 3.8e-18 58.0 0.0 1 1 3.5e-19 1e-17 56.6 0.0 2 67 213 278 212 278 0.98 # 1674 # 2537 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 4_6 - 136 rve_3 PF13683.1 67 4.8e-14 44.8 0.0 1 1 4e-15 1.1e-13 43.6 0.0 1 37 96 132 96 134 0.93 # 2376 # 2783 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.498 5_2 - 296 rve_3 PF13683.1 67 1.9e-13 43.0 0.0 1 1 1.4e-14 4.1e-13 41.8 0.0 6 67 216 277 211 277 0.92 # 590 # 1477 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 2_7 - 391 rve_3 PF13683.1 67 1.8e-07 23.8 0.1 1 1 1.6e-08 4.6e-07 22.5 0.1 9 52 219 263 215 268 0.93 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_28 - 877 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.7e-05 17.5 0.1 1 2 4.1e-06 0.00024 13.7 0.0 39 63 477 505 464 508 0.84 # 27646 # 30276 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_28 - 877 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.7e-05 17.5 0.1 2 2 0.03 1.8 1.1 0.0 75 166 531 626 530 669 0.82 # 27646 # 30276 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 5_1 - 230 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00014 14.5 0.0 1 1 3.6e-06 0.00021 13.9 0.0 41 60 36 55 5 62 0.82 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_7 - 391 HTH_38 PF13936.1 44 1.8e-07 23.8 0.1 1 1 4.1e-09 4.8e-07 22.4 0.1 5 42 2 39 2 39 0.94 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_28 - 877 MobB PF03205.9 140 0.00085 12.2 0.1 1 1 5.4e-05 0.0031 10.3 0.0 4 37 484 516 482 524 0.79 # 27646 # 30276 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_10 - 745 MobB PF03205.9 140 0.0012 11.7 0.0 1 1 5.3e-05 0.0031 10.3 0.0 7 34 192 219 188 225 0.89 # 11168 # 13402 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 3_5 - 229 HTH_34 PF13601.1 80 1.9e-08 27.4 0.4 1 2 5e-08 5.8e-06 19.4 0.0 2 49 27 74 26 81 0.91 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 3_5 - 229 HTH_34 PF13601.1 80 1.9e-08 27.4 0.4 2 2 0.00083 0.096 5.9 0.1 59 74 212 227 206 228 0.90 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 3_5 - 229 MarR PF01047.17 59 0.00025 13.9 0.1 1 1 9.6e-06 0.0011 11.8 0.1 6 48 28 70 25 73 0.88 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 3_2 - 223 TetR_N PF00440.18 47 1.8e-18 59.1 0.0 1 1 5.2e-20 3e-18 58.4 0.0 2 47 44 89 43 89 0.96 # 507 # 1175 # 1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 3_4 - 208 TetR_N PF00440.18 47 3.9e-18 58.0 0.0 1 2 1.7e-18 9.9e-17 53.5 0.0 2 47 10 55 9 55 0.97 # 2575 # 3198 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 3_4 - 208 TetR_N PF00440.18 47 3.9e-18 58.0 0.0 2 2 0.016 0.93 2.4 0.0 1 15 169 183 169 185 0.86 # 2575 # 3198 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_6 - 145 AAA_19 PF13245.1 76 8.9e-08 25.0 0.1 1 1 1.2e-08 3.4e-07 23.1 0.1 13 48 100 131 87 141 0.83 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_9 - 1757 AAA_19 PF13245.1 76 2.1e-07 23.8 2.0 1 1 2.2e-08 6.5e-07 22.2 0.5 7 76 981 1047 974 1047 0.74 # 5898 # 11168 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 5_1 - 230 AAA_19 PF13245.1 76 0.00012 15.0 0.0 1 1 7.5e-06 0.00022 14.1 0.0 10 39 33 61 27 71 0.83 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_34 - 123 AAA_19 PF13245.1 76 0.00078 12.3 0.0 1 1 4.3e-05 0.0013 11.7 0.0 13 37 91 115 82 122 0.78 # 32815 # 33183 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 2_6 - 145 CbiA PF01656.18 195 0.00024 13.6 0.0 1 1 4e-06 0.00046 12.7 0.0 9 31 107 129 100 136 0.93 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_34 - 123 KTI12 PF08433.5 270 0.00098 11.4 0.1 1 1 1.4e-05 0.0017 10.7 0.1 5 30 92 117 91 120 0.87 # 32815 # 33183 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 2_17 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00051 12.6 0.0 1 2 0.021 2.5 0.6 0.0 175 188 18 31 10 39 0.85 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_17 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00051 12.6 0.0 2 2 4e-05 0.0046 9.5 0.0 20 46 163 189 148 197 0.78 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 6_5 - 217 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 6.6e-05 15.5 0.0 1 1 5.5e-06 0.00032 13.3 0.0 18 49 18 49 16 49 0.93 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 2_7 - 391 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0002 14.0 0.0 1 1 6.7e-06 0.00039 13.0 0.0 31 47 22 38 13 39 0.92 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_4 - 288 rve PF00665.21 120 2.6e-28 91.7 0.0 1 1 1.7e-29 4.9e-28 90.8 0.0 2 120 125 241 124 241 0.96 # 1674 # 2537 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 5_2 - 296 rve PF00665.21 120 4.3e-28 91.0 0.1 1 1 3.8e-29 1.1e-27 89.7 0.0 2 119 125 239 124 240 0.97 # 590 # 1477 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 4_6 - 136 rve PF00665.21 120 3.6e-22 71.9 0.0 1 1 1.4e-23 4.1e-22 71.7 0.0 3 120 11 125 9 125 0.95 # 2376 # 2783 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.498 2_7 - 391 rve PF00665.21 120 3.6e-20 65.4 0.1 1 1 2.3e-21 6.8e-20 64.5 0.1 3 120 113 240 112 240 0.94 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_5 - 169 Terminase_5 PF06056.7 58 2.3e-06 20.2 0.0 1 2 1.8e-05 0.001 11.7 0.0 14 44 21 51 7 63 0.83 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 Terminase_5 PF06056.7 58 2.3e-06 20.2 0.0 2 2 0.00073 0.042 6.6 0.0 14 43 76 106 74 115 0.86 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 4_4 - 93 Terminase_5 PF06056.7 58 1.9e-05 17.3 0.1 1 1 4.9e-07 2.8e-05 16.8 0.1 15 48 23 56 20 66 0.87 # 1808 # 2086 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 5_1 - 230 AAA_23 PF13476.1 202 8.4e-12 38.9 0.0 1 1 1.6e-13 9.4e-12 38.8 0.0 2 54 14 78 13 137 0.72 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 13_1 - 122 AAA_23 PF13476.1 202 0.031 7.7 6.8 1 1 0.00066 0.039 7.4 6.8 149 199 28 93 3 95 0.58 # 3 # 368 # -1 # ID=13_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.571 2_6 - 145 AAA_24 PF13479.1 213 0.00055 12.6 0.0 1 1 7.2e-06 0.00084 12.1 0.0 5 23 99 117 95 129 0.84 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_29 - 188 Methyltransf_26 PF13659.1 117 5.4e-14 45.4 0.0 1 1 1.6e-15 9.2e-14 44.6 0.0 2 114 52 147 51 150 0.90 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 2_17 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2e-12 40.3 0.1 1 2 8.4e-08 4.9e-06 19.7 0.0 54 114 4 71 2 86 0.76 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_17 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2e-12 40.3 0.1 2 2 1.8e-07 1e-05 18.7 0.0 4 45 167 207 164 225 0.82 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 3_6 - 129 ACT_7 PF13840.1 65 7.9e-05 15.3 0.1 1 1 2e-06 0.00024 13.8 0.0 9 60 65 120 57 123 0.74 # 3870 # 4256 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_9 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 2e-44 144.6 15.6 1 3 0.04 2.3 0.8 0.0 41 86 223 269 218 282 0.84 # 5898 # 11168 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_9 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 2e-44 144.6 15.6 2 3 1.9e-05 0.0011 11.6 3.9 7 146 420 551 416 561 0.81 # 5898 # 11168 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_9 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 2e-44 144.6 15.6 3 3 9.9e-44 5.7e-42 136.6 1.9 1 186 968 1156 968 1162 0.94 # 5898 # 11168 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_10 - 745 AAA_30 PF13604.1 196 0.00072 12.3 0.0 1 1 2.6e-05 0.0015 11.2 0.0 21 57 188 224 180 230 0.85 # 11168 # 13402 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 5_1 - 230 SMC_N PF02463.14 220 1.2e-10 34.1 0.0 1 1 1.2e-12 1.3e-10 33.9 0.0 3 83 12 91 10 121 0.78 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 6_5 - 217 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.4e-26 83.3 0.0 1 2 0.0079 0.18 5.0 0.0 9 47 12 50 11 70 0.92 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 6_5 - 217 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 6.4e-26 83.3 0.0 2 2 4.5e-25 1e-23 76.2 0.0 2 69 92 163 91 182 0.86 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 4_4 - 93 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5.4e-20 64.3 0.0 1 1 3.5e-21 8e-20 63.8 0.0 1 75 1 71 1 72 0.96 # 1808 # 2086 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 2_5 - 169 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 4.9e-18 58.0 0.1 1 2 1e-08 2.3e-07 23.8 0.0 6 49 3 46 1 50 0.92 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 4.9e-18 58.0 0.1 2 2 2.5e-11 5.8e-10 32.2 0.0 3 75 55 148 53 149 0.85 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_2 - 63 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 2.4e-14 46.3 0.1 1 1 1.2e-15 2.7e-14 46.1 0.1 1 51 5 55 5 60 0.92 # 570 # 758 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 5_3 - 109 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 5e-13 42.0 1.3 1 1 8.5e-14 2e-12 40.1 1.3 1 74 1 87 1 88 0.86 # 1477 # 1803 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 2_7 - 391 GerE PF00196.14 58 0.00049 12.6 0.0 1 1 9.8e-06 0.0011 11.4 0.0 18 40 17 39 10 40 0.82 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_10 - 745 TraG-D_C PF12696.2 128 9.1e-21 67.2 0.0 1 1 1.4e-22 1.6e-20 66.4 0.0 1 127 419 541 419 542 0.86 # 11168 # 13402 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 2_6 - 145 Bac_DnaA PF00308.13 219 0.00094 11.9 0.0 1 1 1.5e-05 0.0017 11.1 0.0 35 69 98 130 70 134 0.74 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_17 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 6.6e-06 18.9 0.0 1 2 0.00025 0.014 8.0 0.0 102 118 16 32 5 77 0.83 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_17 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 6.6e-06 18.9 0.0 2 2 0.00013 0.0073 9.0 0.0 28 54 163 189 158 220 0.67 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_29 - 188 UPF0020 PF01170.13 180 0.001 11.8 0.0 1 1 5.8e-05 0.0034 10.1 0.0 18 43 40 65 32 130 0.71 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 2_29 - 188 Methyltransf_25 PF13649.1 101 0.00014 15.3 0.0 1 1 1.8e-06 0.00021 14.8 0.0 1 101 54 142 54 142 0.81 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 11_1 - 348 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.2e-27 90.0 0.0 1 1 1.5e-29 1.8e-27 89.4 0.0 4 210 59 296 56 299 0.93 # 2 # 1045 # -1 # ID=11_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.453 5_1 - 230 MukB PF04310.7 227 0.00077 11.9 0.0 1 1 8.7e-06 0.001 11.5 0.0 21 53 27 59 13 96 0.85 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_5 - 169 DUF1804 PF08822.6 165 2e-07 24.0 0.0 1 2 1.4e-06 0.00017 14.5 0.0 5 46 6 47 1 49 0.89 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 DUF1804 PF08822.6 165 2e-07 24.0 0.0 2 2 0.00028 0.033 7.0 0.0 3 49 59 106 58 116 0.89 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 3_6 - 129 ACT PF01842.20 66 1.1e-07 24.4 0.2 1 2 0.011 1.2 1.9 0.0 6 26 7 27 3 47 0.85 # 3870 # 4256 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 3_6 - 129 ACT PF01842.20 66 1.1e-07 24.4 0.2 2 2 1.6e-08 1.9e-06 20.5 0.0 9 29 78 98 74 115 0.91 # 3870 # 4256 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_36 - 484 DivIC PF04977.10 80 0.0011 11.6 4.6 1 1 3.7e-05 0.0022 10.7 4.6 17 66 76 124 72 125 0.92 # 33678 # 35129 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 13_1 - 122 DivIC PF04977.10 80 0.047 6.4 12.9 1 2 0.00077 0.045 6.4 2.7 20 64 17 58 4 65 0.64 # 3 # 368 # -1 # ID=13_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.571 13_1 - 122 DivIC PF04977.10 80 0.047 6.4 12.9 2 2 0.0019 0.11 5.2 3.0 27 49 68 90 58 97 0.62 # 3 # 368 # -1 # ID=13_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.571 5_1 - 230 AAA_21 PF13304.1 303 1.2e-08 28.3 0.1 1 1 1.4e-10 1.7e-08 27.8 0.1 1 62 35 90 35 114 0.70 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_5 - 169 Sigma70_r4 PF04545.11 50 5.4e-05 15.6 0.1 1 1 4.9e-06 0.00029 13.3 0.0 11 38 10 38 6 40 0.88 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 6_5 - 217 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.00042 12.8 0.1 1 1 1.4e-05 0.00079 11.9 0.1 11 41 17 47 15 52 0.88 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 2_6 - 145 AAA PF00004.24 132 9e-06 19.1 0.1 1 2 0.092 11 -0.6 0.0 23 54 31 62 16 67 0.69 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 AAA PF00004.24 132 9e-06 19.1 0.1 2 2 3e-07 3.5e-05 17.1 0.1 1 22 100 121 100 142 0.74 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 7_1 - 474 KorB PF08535.5 93 3.7e-05 17.0 0.0 1 1 9.1e-07 0.00011 15.5 0.0 2 42 152 192 151 206 0.91 # 293 # 1714 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 3_5 - 229 HTH_27 PF13463.1 68 7.5e-05 16.2 0.3 1 1 2.5e-06 0.00029 14.3 0.0 7 48 29 69 25 82 0.85 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 5_1 - 230 TIGR00064 TIGR00064 279 0.00033 12.7 0.0 1 1 3.6e-06 0.00041 12.4 0.0 76 108 30 62 2 65 0.74 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_17 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.3e-35 116.0 0.0 1 2 1.8e-14 2.1e-12 40.1 0.0 1 114 21 124 21 141 0.85 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_17 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.3e-35 116.0 0.0 2 2 5.4e-25 6.3e-23 74.5 0.0 169 228 141 200 126 203 0.90 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_4 - 288 rve_2 PF13333.1 52 9.2e-23 73.3 0.8 1 1 3.3e-24 1.9e-22 72.2 0.8 1 48 231 282 231 285 0.95 # 1674 # 2537 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 5_2 - 296 rve_2 PF13333.1 52 2.3e-08 27.2 0.0 1 1 8e-10 4.7e-08 26.2 0.0 1 44 230 276 230 283 0.88 # 590 # 1477 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 2_14 - 320 Hydantoinase_A PF01968.13 290 0.00012 14.3 0.2 1 4 0.042 4.9 -0.8 0.0 82 106 6 30 4 39 0.87 # 8448 # 9407 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 2_14 - 320 Hydantoinase_A PF01968.13 290 0.00012 14.3 0.2 2 4 0.076 8.8 -1.6 0.0 176 231 106 158 90 165 0.69 # 8448 # 9407 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 2_14 - 320 Hydantoinase_A PF01968.13 290 0.00012 14.3 0.2 3 4 0.00014 0.016 7.3 0.0 73 100 163 189 149 206 0.83 # 8448 # 9407 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 2_14 - 320 Hydantoinase_A PF01968.13 290 0.00012 14.3 0.2 4 4 0.0026 0.3 3.2 0.0 209 270 242 308 190 319 0.66 # 8448 # 9407 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 2_6 - 145 AAA_16 PF13191.1 185 1.8e-06 21.1 0.2 1 2 0.011 0.41 3.7 0.0 125 173 23 88 3 94 0.61 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 AAA_16 PF13191.1 185 1.8e-06 21.1 0.2 2 2 1.8e-06 7e-05 16.0 0.1 23 59 96 133 88 142 0.75 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_10 - 745 AAA_16 PF13191.1 185 4.9e-06 19.7 0.0 1 1 6.1e-07 2.4e-05 17.5 0.0 21 60 182 222 179 263 0.81 # 11168 # 13402 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_34 - 123 AAA_16 PF13191.1 185 0.0016 11.6 0.1 1 1 6.8e-05 0.0026 10.8 0.1 22 48 86 112 80 119 0.88 # 32815 # 33183 # -1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 2_6 - 145 AAA_22 PF13401.1 131 0.00058 13.1 0.0 1 1 2.2e-05 0.0013 12.0 0.0 5 21 98 114 94 132 0.85 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 5_1 - 230 AAA_22 PF13401.1 131 0.00091 12.5 0.0 1 1 2.2e-05 0.0013 12.1 0.0 4 51 33 82 29 122 0.79 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_6 - 145 TIGR00362 TIGR00362 437 2.3e-05 16.3 0.0 1 1 2.1e-07 2.4e-05 16.3 0.0 138 172 98 130 5 133 0.70 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 3_1 - 139 HTH_AraC PF00165.18 42 1.2e-21 69.1 2.3 1 2 2.6e-12 3e-10 32.8 0.0 1 42 37 78 37 78 0.97 # 78 # 494 # -1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 3_1 - 139 HTH_AraC PF00165.18 42 1.2e-21 69.1 2.3 2 2 3.6e-13 4.1e-11 35.6 1.1 2 42 90 128 89 128 0.95 # 78 # 494 # -1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 5_1 - 230 AAA_29 PF13555.1 62 6.7e-09 28.3 0.0 1 1 1e-10 1.2e-08 27.5 0.0 16 52 26 62 14 70 0.82 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 3_9 - 42 HTH_1 PF00126.22 60 3e-15 48.9 0.1 1 1 2.8e-17 3.2e-15 48.8 0.1 1 38 3 40 3 41 0.96 # 6449 # 6574 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 2_5 - 169 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 2.9e-08 27.1 0.0 1 2 1.2e-05 0.0007 13.1 0.0 20 63 15 58 4 67 0.86 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 2.9e-08 27.1 0.0 2 2 1.5e-05 0.00089 12.7 0.0 15 68 65 119 55 129 0.80 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 4_4 - 93 LZ_Tnp_IS481 PF13011.1 85 1.7e-05 18.3 0.0 1 1 3.9e-07 2.3e-05 17.8 0.0 6 49 3 45 1 67 0.87 # 1808 # 2086 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 1_14 - 941 Orn_Arg_deC_N PF02784.11 251 0.0012 11.2 0.0 1 1 1e-05 0.0012 11.2 0.0 171 212 610 650 598 684 0.76 # 15674 # 18496 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.512 5_1 - 230 SRP54 PF00448.17 196 0.00033 13.3 0.1 1 1 4e-06 0.00046 12.8 0.1 2 30 34 62 33 65 0.89 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_6 - 145 AAA_28 PF13521.1 163 0.00035 13.7 0.2 1 2 0.052 6 -0.1 0.0 98 125 22 49 7 76 0.55 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 AAA_28 PF13521.1 163 0.00035 13.7 0.2 2 2 1.3e-05 0.0016 11.6 0.0 2 20 100 118 99 132 0.80 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 13_1 - 122 Mnd1 PF03962.10 188 0.0018 11.0 6.6 1 1 2.3e-05 0.0027 10.5 6.4 65 135 24 99 15 111 0.69 # 3 # 368 # -1 # ID=13_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.571 2_5 - 169 HTH_32 PF13565.1 77 2.5e-08 27.8 0.4 1 2 3.4e-05 0.0039 11.1 0.1 1 55 36 82 36 85 0.75 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 HTH_32 PF13565.1 77 2.5e-08 27.8 0.4 2 2 2.6e-06 0.00031 14.7 0.0 1 60 92 159 92 167 0.67 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 HTH_23 PF13384.1 50 1.6e-11 36.7 0.5 1 2 2.9e-08 3.3e-07 23.0 0.1 18 46 21 49 13 53 0.89 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 HTH_23 PF13384.1 50 1.6e-11 36.7 0.5 2 2 0.00014 0.0016 11.2 0.1 32 48 91 107 60 109 0.80 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 6_5 - 217 HTH_23 PF13384.1 50 5.8e-11 34.9 0.0 1 2 4e-05 0.00046 13.0 0.0 9 41 17 50 13 53 0.86 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 6_5 - 217 HTH_23 PF13384.1 50 5.8e-11 34.9 0.0 2 2 3.2e-07 3.8e-06 19.6 0.0 14 48 106 144 99 146 0.84 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 4_4 - 93 HTH_23 PF13384.1 50 2.4e-09 29.8 0.0 1 1 3.5e-10 4e-09 29.1 0.0 9 47 13 49 7 52 0.89 # 1808 # 2086 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 2_7 - 391 HTH_23 PF13384.1 50 3.4e-07 23.0 0.1 1 1 7.2e-08 8.3e-07 21.7 0.1 10 39 10 39 8 40 0.92 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_1 - 474 HTH_23 PF13384.1 50 6.5e-07 22.1 0.0 1 1 3.8e-07 4.4e-06 19.4 0.0 12 40 148 176 141 180 0.92 # 293 # 1714 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 4_2 - 92 HTH_23 PF13384.1 50 4.1e-05 16.3 0.0 1 1 5.7e-06 6.7e-05 15.7 0.0 7 40 53 86 51 90 0.92 # 724 # 999 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 5_3 - 109 HTH_23 PF13384.1 50 9e-05 15.3 0.4 1 1 2.2e-05 0.00025 13.8 0.2 5 42 10 55 8 69 0.84 # 1477 # 1803 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.547 3_4 - 208 HTH_23 PF13384.1 50 0.00029 13.6 0.0 1 1 6.6e-05 0.00076 12.3 0.0 10 39 13 47 11 56 0.81 # 2575 # 3198 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_2 - 63 HTH_23 PF13384.1 50 0.00031 13.5 0.1 1 1 3.2e-05 0.00038 13.3 0.1 7 44 16 54 12 60 0.81 # 570 # 758 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 2_4 - 288 HTH_23 PF13384.1 50 0.0039 10.0 4.1 1 2 0.0094 0.11 5.4 0.0 3 41 3 41 1 51 0.87 # 1674 # 2537 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_4 - 288 HTH_23 PF13384.1 50 0.0039 10.0 4.1 2 2 0.017 0.2 4.6 0.0 16 30 80 96 67 97 0.77 # 1674 # 2537 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_7 - 391 HTH_7 PF02796.10 45 1.2e-05 18.2 0.2 1 1 4.1e-07 2.4e-05 17.3 0.2 7 42 3 38 1 40 0.91 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 4_4 - 93 HTH_7 PF02796.10 45 0.001 12.1 0.2 1 1 3.7e-05 0.0021 11.1 0.0 2 39 2 39 2 43 0.89 # 1808 # 2086 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 4_2 - 92 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 6.7e-05 15.7 4.1 1 1 1.6e-06 0.00018 14.3 4.1 3 35 6 39 5 40 0.86 # 724 # 999 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 5_1 - 230 NB-ARC PF00931.17 287 0.00071 11.6 0.0 1 1 8.8e-06 0.001 11.0 0.0 18 38 32 52 20 61 0.89 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_6 - 145 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00032 13.0 0.0 1 1 4.2e-06 0.00048 12.4 0.0 23 42 98 117 83 124 0.89 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_5 - 169 HTH_29 PF13551.1 112 1.7e-11 37.4 0.0 1 2 4.7e-09 1.1e-07 25.2 0.0 7 55 15 60 9 73 0.80 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 HTH_29 PF13551.1 112 1.7e-11 37.4 0.0 2 2 0.00013 0.003 10.9 0.0 8 50 71 114 64 163 0.73 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 4_4 - 93 HTH_29 PF13551.1 112 6.5e-06 19.4 0.1 1 1 4.1e-07 9.5e-06 18.9 0.1 3 37 13 46 12 87 0.76 # 1808 # 2086 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 6_5 - 217 HTH_29 PF13551.1 112 2.5e-05 17.5 0.0 1 2 0.018 0.41 4.0 0.0 7 38 22 52 16 69 0.87 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 6_5 - 217 HTH_29 PF13551.1 112 2.5e-05 17.5 0.0 2 2 9.1e-05 0.0021 11.3 0.0 15 44 116 145 104 165 0.84 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 2_7 - 391 HTH_29 PF13551.1 112 0.00042 13.6 1.0 1 1 5.8e-05 0.0014 12.0 0.0 8 34 14 39 8 43 0.83 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_1 - 474 HTH_29 PF13551.1 112 0.00047 13.5 0.0 1 1 0.00013 0.0029 10.9 0.0 8 36 150 177 143 189 0.86 # 293 # 1714 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.587 2_29 - 188 Met_10 PF02475.11 200 0.001 11.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.0013 11.4 0.0 98 189 47 132 29 145 0.78 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 4_8 - 443 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 2.8e-105 344.4 0.2 1 1 6.4e-107 3.7e-105 344.1 0.2 1 270 105 391 105 392 0.99 # 3137 # 4465 # -1 # ID=4_8;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.572 10_1 - 443 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 2.2e-104 341.5 0.1 1 1 5e-106 2.9e-104 341.1 0.1 1 270 105 391 105 392 0.98 # 3 # 1331 # 1 # ID=10_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.572 2_29 - 188 Methyltransf_31 PF13847.1 152 3.9e-07 22.9 0.0 1 1 4.2e-09 4.8e-07 22.6 0.0 5 119 52 162 48 183 0.84 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 2_6 - 145 PhoH PF02562.11 205 8.6e-07 21.5 0.0 1 1 1.1e-08 1.3e-06 20.8 0.0 15 48 93 126 80 140 0.85 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 AAA_5 PF07728.9 139 3.1e-05 16.8 0.4 1 2 0.048 5.6 -0.2 0.0 92 126 14 49 4 61 0.52 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 AAA_5 PF07728.9 139 3.1e-05 16.8 0.4 2 2 1e-06 0.00012 14.9 0.1 1 17 99 115 99 135 0.88 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 TIGR00763 TIGR00763 795 0.00067 10.9 0.0 1 1 6.8e-06 0.00079 10.7 0.0 356 372 100 116 66 125 0.87 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_10 - 745 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 4.3e-150 492.6 0.0 1 1 9.2e-152 5.4e-150 492.3 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 11168 # 13402 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_28 - 877 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 6.3e-07 21.4 0.2 1 2 4.8e-08 2.8e-06 19.2 0.0 15 53 480 518 471 548 0.80 # 27646 # 30276 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_28 - 877 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 6.3e-07 21.4 0.2 2 2 0.054 3.1 -0.7 0.1 261 317 714 770 706 773 0.92 # 27646 # 30276 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_6 - 145 AAA_18 PF13238.1 129 0.00028 14.3 0.1 1 1 6.1e-06 0.00071 13.0 0.0 1 19 100 118 100 140 0.82 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 5_1 - 230 TIGR00611 TIGR00611 365 0.0002 13.3 0.0 1 1 2.3e-06 0.00027 12.9 0.0 5 47 13 57 10 71 0.74 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_17 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.00021 14.0 0.0 1 2 0.0074 0.86 2.2 0.0 53 80 4 30 2 37 0.93 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_17 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.00021 14.0 0.0 2 2 4.2e-05 0.0049 9.5 0.0 3 31 166 194 164 209 0.86 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_5 - 169 HTH_psq PF05225.11 45 7.9e-06 18.5 0.0 1 2 1.6e-05 0.0019 10.9 0.0 11 34 15 38 14 47 0.86 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 HTH_psq PF05225.11 45 7.9e-06 18.5 0.0 2 2 0.001 0.12 5.2 0.0 17 30 76 89 68 89 0.80 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_29 - 188 Methyltransf_12 PF08242.7 99 2e-05 18.1 0.0 1 1 3.1e-07 3.6e-05 17.3 0.0 1 99 55 144 55 144 0.87 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 4_2 - 92 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 6.4e-32 101.9 0.3 1 1 8.7e-34 1e-31 101.3 0.3 1 46 43 88 43 88 0.99 # 724 # 999 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 2_29 - 188 Methyltrans_SAM PF10672.4 286 0.00084 11.3 0.0 1 1 9.9e-06 0.0011 10.9 0.0 196 261 113 173 93 180 0.78 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 5_1 - 230 DUF258 PF03193.11 161 0.0001 14.6 0.0 1 1 1.2e-06 0.00014 14.2 0.0 28 60 26 58 2 72 0.72 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_28 - 877 DUF87 PF01935.12 229 2.7e-07 23.7 0.0 1 1 6.9e-09 8e-07 22.2 0.0 26 222 483 670 469 677 0.77 # 27646 # 30276 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_5 - 169 HTH_28 PF13518.1 52 1.2e-23 75.9 0.1 1 2 6.2e-13 1.2e-11 37.6 0.2 2 50 9 58 8 58 0.93 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 HTH_28 PF13518.1 52 1.2e-23 75.9 0.1 2 2 1.7e-12 3.2e-11 36.2 0.0 2 49 64 113 63 115 0.89 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 4_4 - 93 HTH_28 PF13518.1 52 2.4e-09 30.2 0.3 1 1 1.9e-10 3.8e-09 29.6 0.3 3 37 12 46 10 68 0.91 # 1808 # 2086 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 6_5 - 217 HTH_28 PF13518.1 52 3.8e-08 26.4 0.0 1 2 0.00053 0.01 9.0 0.0 4 38 17 52 15 52 0.84 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 6_5 - 217 HTH_28 PF13518.1 52 3.8e-08 26.4 0.0 2 2 8.7e-06 0.00017 14.7 0.0 15 42 116 143 116 146 0.93 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 2_2 - 63 HTH_28 PF13518.1 52 1.2e-06 21.6 0.1 1 1 7.7e-08 1.5e-06 21.3 0.1 1 35 15 50 15 58 0.95 # 570 # 758 # -1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 4_2 - 92 HTH_28 PF13518.1 52 7.3e-05 15.9 0.0 1 1 5.8e-06 0.00011 15.3 0.0 4 35 55 86 53 90 0.91 # 724 # 999 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 2_4 - 288 HTH_28 PF13518.1 52 0.00026 14.1 0.6 1 2 0.02 0.39 4.0 0.0 1 36 6 41 6 49 0.91 # 1674 # 2537 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 2_4 - 288 HTH_28 PF13518.1 52 0.00026 14.1 0.6 2 2 0.0026 0.05 6.8 0.0 10 25 81 96 77 111 0.87 # 1674 # 2537 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 3_4 - 208 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.00012 15.1 0.0 1 1 1.7e-06 0.00019 14.3 0.0 26 77 15 64 2 68 0.78 # 2575 # 3198 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 13_1 - 122 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.0019 11.7 13.4 1 2 9.7e-05 0.011 9.3 3.6 20 64 12 56 10 57 0.93 # 3 # 368 # -1 # ID=13_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.571 13_1 - 122 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.0019 11.7 13.4 2 2 0.00024 0.028 8.0 2.2 32 57 61 86 58 95 0.81 # 3 # 368 # -1 # ID=13_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.571 3_5 - 229 HTH_24 PF13412.1 48 8.9e-07 21.4 0.1 1 1 3e-08 1.8e-06 20.5 0.1 3 48 25 70 23 70 0.90 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 6_5 - 217 HTH_24 PF13412.1 48 0.0003 13.3 0.0 1 1 1.2e-05 0.00072 12.1 0.0 8 40 15 49 10 52 0.93 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 3_1 - 139 HTH_18 PF12833.2 81 9.3e-24 76.5 2.0 1 1 1.1e-25 1.2e-23 76.1 2.0 1 81 50 129 50 129 0.97 # 78 # 494 # -1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 2_29 - 188 TIGR03533 TIGR03533 284 1.9e-05 16.9 0.0 1 1 2.6e-07 3e-05 16.2 0.0 114 210 43 133 36 141 0.86 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 2_29 - 188 TIGR03534 TIGR03534 253 4.2e-08 25.7 0.0 1 1 4.3e-10 5e-08 25.4 0.0 81 175 45 131 15 148 0.86 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 3_5 - 229 HTH_10 PF04967.7 53 0.00084 12.1 0.2 1 1 2.7e-05 0.0032 10.2 0.0 22 46 38 62 36 65 0.92 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 5_1 - 230 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00085 12.4 0.0 1 1 1e-05 0.0012 12.0 0.0 3 28 37 64 35 100 0.81 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 5_1 - 230 Miro PF08477.8 119 0.00011 15.9 0.0 1 1 1.4e-06 0.00017 15.3 0.0 3 32 37 66 35 93 0.81 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_9 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.5e-07 24.7 0.7 1 2 0.013 1.5 2.2 0.0 6 44 1227 1265 1223 1295 0.74 # 5898 # 11168 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_9 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.5e-07 24.7 0.7 2 2 5.2e-08 6e-06 19.5 0.2 3 102 1341 1444 1339 1446 0.77 # 5898 # 11168 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 2_29 - 188 TIGR00755 TIGR00755 256 4.2e-09 28.8 0.0 1 1 4.9e-11 5.7e-09 28.4 0.0 8 105 29 123 25 134 0.91 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 2_14 - 320 StbA PF06406.6 318 1.2e-148 487.3 0.1 1 1 1.1e-150 1.3e-148 487.2 0.1 1 317 2 318 2 319 0.99 # 8448 # 9407 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 2_6 - 145 NACHT PF05729.7 166 0.00016 14.5 0.0 1 1 3.1e-06 0.00036 13.3 0.0 3 43 100 135 98 143 0.74 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 AAA_17 PF13207.1 121 2e-05 18.5 0.1 1 2 0.077 4.4 1.3 0.0 22 52 10 45 5 91 0.60 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 AAA_17 PF13207.1 121 2e-05 18.5 0.1 2 2 3.2e-06 0.00019 15.4 0.0 2 25 100 119 99 141 0.77 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_10 - 745 AAA_17 PF13207.1 121 0.00038 14.4 0.0 1 1 1.8e-05 0.001 13.0 0.0 3 28 189 218 187 303 0.70 # 11168 # 13402 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 5_1 - 230 TIGR02211 TIGR02211 221 3e-05 16.4 0.0 1 1 1.1e-06 4.3e-05 15.9 0.0 15 57 13 59 4 70 0.73 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_10 - 94 TIGR02211 TIGR02211 221 0.00015 14.1 0.0 1 1 4.3e-06 0.00017 14.0 0.0 114 167 14 72 2 87 0.78 # 5165 # 5446 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 9_2 - 96 TIGR02211 TIGR02211 221 0.00016 14.1 0.0 1 1 4.7e-06 0.00018 13.8 0.0 111 167 11 72 2 82 0.78 # 194 # 481 # -1 # ID=9_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 2_6 - 145 TIGR03346 TIGR03346 853 0.00045 11.3 0.0 1 1 5.6e-06 0.00064 10.8 0.0 581 622 84 124 79 132 0.78 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 AAA_25 PF13481.1 194 5.4e-07 22.3 0.0 1 1 6.1e-09 7.1e-07 21.9 0.0 19 66 78 133 58 143 0.74 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_9 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.00044 12.9 0.0 1 2 0.00014 0.016 7.8 0.0 1 118 988 1121 988 1212 0.52 # 5898 # 11168 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 1_9 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.00044 12.9 0.0 2 2 0.0066 0.76 2.3 0.0 171 234 1387 1447 1342 1447 0.63 # 5898 # 11168 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 5_1 - 230 AAA_15 PF13175.1 415 2.1e-09 29.9 0.1 1 1 2.2e-11 2.5e-09 29.7 0.1 2 56 12 84 11 109 0.66 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 1_28 - 877 Pox_A32 PF04665.7 241 0.00085 11.7 0.1 1 1 2.3e-05 0.0027 10.1 0.0 7 38 474 505 470 520 0.85 # 27646 # 30276 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_6 - 145 RuvB_N PF05496.7 234 0.00012 14.3 0.0 1 1 1.2e-06 0.00014 14.0 0.0 48 70 95 117 68 140 0.85 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 5_1 - 230 AAA_14 PF13173.1 128 0.00043 13.3 0.0 1 1 5.1e-06 0.00059 12.9 0.0 2 42 33 78 32 105 0.73 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_5 - 169 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 3.8e-07 22.4 0.0 1 2 8.3e-08 4.8e-06 18.9 0.0 12 50 4 43 3 45 0.91 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 3.8e-07 22.4 0.0 2 2 0.03 1.7 1.1 0.0 8 39 55 87 52 88 0.85 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_7 - 391 HTH_Tnp_ISL3 PF13542.1 52 0.00059 12.2 0.0 1 1 3e-05 0.0018 10.7 0.0 31 49 21 39 20 40 0.90 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_5 - 169 DUF1153 PF06627.6 90 0.00066 12.7 0.3 1 2 9.4e-05 0.011 8.8 0.0 46 81 17 52 5 56 0.86 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 DUF1153 PF06627.6 90 0.00066 12.7 0.3 2 2 0.019 2.2 1.4 0.0 32 80 58 107 53 116 0.75 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_6 - 145 AAA_33 PF13671.1 143 0.00054 13.0 0.2 1 2 0.098 11 -1.0 0.0 49 49 44 44 5 77 0.51 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 AAA_33 PF13671.1 143 0.00054 13.0 0.2 2 2 1.3e-05 0.0016 11.5 0.1 2 19 100 117 100 128 0.88 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_5 - 169 CENP-B_N PF04218.8 53 3e-07 22.9 0.0 1 2 1.6e-06 6e-05 15.6 0.0 20 42 17 40 9 45 0.89 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 CENP-B_N PF04218.8 53 3e-07 22.9 0.0 2 2 0.0039 0.15 4.7 0.0 12 45 64 99 62 103 0.81 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 4_4 - 93 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00033 13.2 0.4 1 1 2.5e-05 0.00096 11.7 0.1 13 43 12 42 4 44 0.91 # 1808 # 2086 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 3_4 - 208 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00058 12.4 0.0 1 1 3e-05 0.0012 11.5 0.0 26 51 28 53 23 55 0.90 # 2575 # 3198 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 5_1 - 230 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0019 9.8 0.0 1 1 2.1e-05 0.0024 9.5 0.0 243 265 32 54 7 60 0.79 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_6 - 145 ArgK PF03308.11 267 0.00012 14.0 0.0 1 1 1.6e-06 0.00019 13.4 0.0 27 60 95 128 80 136 0.86 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 1_10 - 745 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 8.6e-10 30.8 0.0 1 1 3.8e-11 2.2e-09 29.4 0.0 264 361 382 476 198 500 0.82 # 11168 # 13402 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 1_28 - 877 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00038 12.2 0.0 1 2 0.0047 0.27 2.8 0.0 105 182 534 605 471 624 0.82 # 27646 # 30276 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_28 - 877 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00038 12.2 0.0 2 2 0.00023 0.013 7.1 0.0 319 378 712 770 663 772 0.91 # 27646 # 30276 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 3_1 - 139 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.0015 11.5 1.8 1 2 0.0059 0.68 2.9 0.1 41 73 2 29 1 35 0.56 # 78 # 494 # -1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 3_1 - 139 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 0.0015 11.5 1.8 2 2 0.00012 0.014 8.4 0.1 50 87 90 128 50 135 0.79 # 78 # 494 # -1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 2_29 - 188 MTS PF05175.9 170 1e-09 31.1 0.0 1 1 1.2e-11 1.4e-09 30.7 0.0 31 141 50 149 41 166 0.84 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 3_5 - 229 HTH_45 PF14947.1 77 0.0001 15.2 0.1 1 2 1.1e-05 0.0013 11.7 0.0 10 53 29 76 26 97 0.75 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 3_5 - 229 HTH_45 PF14947.1 77 0.0001 15.2 0.1 2 2 0.051 5.9 -0.0 0.0 55 65 211 221 198 225 0.79 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 4_2 - 92 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 1.3e-05 17.8 2.9 1 1 3.2e-07 3.8e-05 16.4 2.9 3 36 6 40 5 41 0.83 # 724 # 999 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 5_1 - 230 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00028 13.6 0.0 1 1 3.3e-06 0.00038 13.1 0.0 1 26 38 63 38 68 0.87 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_4 - 288 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 1.9e-11 37.2 0.1 1 1 5e-13 2.9e-11 36.6 0.1 2 137 130 268 129 271 0.88 # 1674 # 2537 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 5_2 - 296 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 5.6e-08 26.0 0.0 1 1 1.5e-09 8.5e-08 25.4 0.0 2 137 130 267 129 269 0.92 # 590 # 1477 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 5_1 - 230 TIGR00634 TIGR00634 563 2.7e-05 16.0 0.0 1 1 2.8e-07 3.2e-05 15.7 0.0 4 49 13 60 11 81 0.90 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_5 - 169 HTH_17 PF12728.2 51 4.6e-05 16.8 0.9 1 1 1.4e-06 0.00017 15.0 0.2 2 34 21 58 20 61 0.81 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 4_2 - 92 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 0.00021 14.2 2.3 1 1 3.4e-06 0.0004 13.4 2.3 21 46 8 38 5 38 0.74 # 724 # 999 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 2_7 - 391 HTH_11 PF08279.7 55 0.00011 15.0 0.0 1 1 2e-06 0.00023 13.9 0.0 18 37 20 39 5 40 0.81 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 3_5 - 229 MarR_2 PF12802.2 62 9.3e-05 15.2 0.1 1 1 4.1e-06 0.00024 13.9 0.1 9 55 29 73 21 78 0.83 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 3_9 - 42 MarR_2 PF12802.2 62 0.00011 15.0 0.0 1 1 2e-06 0.00011 14.9 0.0 5 46 3 40 1 41 0.85 # 6449 # 6574 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 3_5 - 229 HTH_5 PF01022.15 47 9.5e-11 34.4 0.1 1 1 1.8e-12 2.1e-10 33.3 0.1 3 46 26 70 24 71 0.92 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 3_5 - 229 TrmB PF01978.14 68 1.3e-07 24.4 0.0 1 1 2.4e-09 2.8e-07 23.4 0.0 11 62 28 79 26 83 0.93 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 2_7 - 391 LacI PF00356.16 46 0.00068 12.4 0.0 1 1 4.2e-05 0.0049 9.7 0.0 2 34 20 52 19 61 0.91 # 3460 # 4632 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 5_1 - 230 DUF2813 PF11398.3 373 1.2e-05 17.7 0.0 1 1 1.2e-07 1.4e-05 17.4 0.0 4 70 12 83 10 123 0.84 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 3_2 - 223 UPF0122 PF04297.9 101 5.6e-05 16.3 1.4 1 1 2.2e-06 0.00013 15.1 1.4 3 76 29 102 26 125 0.83 # 507 # 1175 # 1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 6_5 - 217 UPF0122 PF04297.9 101 0.00061 13.0 0.0 1 1 1.7e-05 0.001 12.3 0.0 25 63 18 56 14 59 0.92 # 2910 # 3560 # 1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 1_28 - 877 AAA_10 PF12846.2 304 4.8e-49 160.5 0.0 1 1 2.2e-50 8.5e-49 159.6 0.0 1 294 480 769 480 775 0.89 # 27646 # 30276 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 1_10 - 745 AAA_10 PF12846.2 304 1.7e-10 33.9 0.0 1 1 9.4e-11 3.6e-09 29.5 0.0 3 296 187 494 186 500 0.68 # 11168 # 13402 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.524 2_6 - 145 AAA_10 PF12846.2 304 0.00017 14.1 0.0 1 1 7.2e-06 0.00028 13.5 0.0 2 33 98 129 97 135 0.92 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 3_5 - 229 HTH_20 PF12840.2 61 1.5e-12 40.3 0.2 1 1 6.8e-14 4e-12 39.0 0.1 3 61 18 76 16 76 0.94 # 3176 # 3862 # -1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.419 3_4 - 208 HTH_20 PF12840.2 61 0.00069 12.6 0.0 1 1 2.7e-05 0.0016 11.4 0.0 21 46 21 46 12 61 0.84 # 2575 # 3198 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 2_29 - 188 RrnaAD PF00398.15 262 1.3e-08 27.3 0.0 1 1 1.4e-10 1.6e-08 26.9 0.0 9 113 29 128 24 148 0.87 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 2_29 - 188 Methyltransf_18 PF12847.2 112 2.2e-10 34.3 0.0 1 1 3.9e-12 4.5e-10 33.3 0.0 4 109 53 146 50 148 0.90 # 17535 # 18098 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.580 2_17 - 228 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00056 13.5 0.0 1 3 0.061 7.1 0.4 0.0 55 65 15 25 2 28 0.73 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_17 - 228 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00056 13.5 0.0 2 3 0.0054 0.63 3.8 0.0 79 93 54 68 45 70 0.84 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 2_17 - 228 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00056 13.5 0.0 3 3 0.0018 0.2 5.3 0.0 5 53 172 219 168 226 0.82 # 11132 # 11815 # 1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.573 5_1 - 230 AAA_13 PF13166.1 712 1.1e-05 17.2 0.3 1 1 1.1e-07 1.3e-05 16.9 0.3 11 54 28 73 18 109 0.65 # 94 # 783 # 1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.484 2_6 - 145 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.0011 11.1 0.0 1 1 1.6e-05 0.0019 10.3 0.0 6 34 102 130 98 134 0.87 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 4_2 - 92 DUF2387 PF09526.5 71 0.0002 14.4 0.2 1 1 2.3e-06 0.00026 14.0 0.2 10 47 7 47 5 72 0.76 # 724 # 999 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.525 4_7 - 124 ADH_zinc_N PF00107.21 130 9.1e-07 21.6 0.0 1 1 8.9e-09 1e-06 21.4 0.0 9 93 2 85 1 106 0.85 # 2845 # 3216 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.535 2_6 - 145 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.5e-34 112.1 0.2 1 2 0.029 3.3 0.2 0.2 83 111 4 32 2 33 0.86 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_6 - 145 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.5e-34 112.1 0.2 2 2 7.2e-36 8.3e-34 109.6 0.0 1 81 51 131 51 136 0.98 # 3026 # 3460 # -1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.559 2_5 - 169 Bot1p PF12298.3 172 1.5e-05 18.1 0.0 1 2 0.00031 0.036 7.1 0.0 20 47 7 34 3 38 0.89 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 Bot1p PF12298.3 172 1.5e-05 18.1 0.0 2 2 0.00013 0.015 8.4 0.0 18 45 60 87 58 89 0.94 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_9 - 1757 AAA_11 PF13086.1 236 0.00024 13.8 0.0 1 1 2.1e-06 0.00024 13.8 0.0 2 75 969 1039 968 1059 0.81 # 5898 # 11168 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.599 7_3 - 176 SSB PF00436.20 104 2.8e-41 132.8 0.4 1 1 3.4e-43 3.9e-41 132.3 0.4 1 101 6 109 6 112 0.96 # 2066 # 2593 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.576 2_5 - 169 BrkDBD PF09607.5 58 0.00013 14.6 0.1 1 2 0.00012 0.014 8.2 0.0 29 45 24 40 4 45 0.90 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 2_5 - 169 BrkDBD PF09607.5 58 0.00013 14.6 0.1 2 2 0.0021 0.24 4.2 0.0 2 38 55 88 54 106 0.75 # 2513 # 3019 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 5_2 - 296 HTH_21 PF13276.1 60 5.6e-19 61.1 2.7 1 1 2.4e-20 1.4e-18 59.9 2.7 3 60 47 103 45 103 0.94 # 590 # 1477 # -1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.536 2_4 - 288 HTH_21 PF13276.1 60 7e-17 54.4 4.1 1 1 2.7e-18 1.6e-16 53.3 4.1 7 59 51 102 44 104 0.89 # 1674 # 2537 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/466f6ad5-1da3-4a6f-b99c-3ae92100676e # Target file: checkm_output/bins/pm1878/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1878/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/466f6ad5-1da3-4a6f-b99c-3ae92100676e checkm_output/bins/pm1878/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:54:22 2017 # [ok]