# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_23 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 1.8e-06 18.3 0.0 1 3 0.0039 0.12 2.4 0.0 187 220 94 125 59 130 0.79 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 1.8e-06 18.3 0.0 2 3 3.3e-06 0.0001 12.5 0.0 132 231 218 308 202 332 0.82 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 1.8e-06 18.3 0.0 3 3 0.057 1.8 -1.4 0.0 132 160 346 369 314 377 0.67 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 505 HTH_IclR PF09339.5 52 5.5e-08 23.6 0.2 1 2 8.2e-08 1.3e-06 19.3 0.0 17 41 14 38 1 38 0.81 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_15 - 505 HTH_IclR PF09339.5 52 5.5e-08 23.6 0.2 2 2 0.04 0.62 1.1 0.0 6 31 427 454 426 455 0.88 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_27 - 186 HTH_IclR PF09339.5 52 3.9e-06 17.7 0.2 1 1 9.2e-07 1.4e-05 15.9 0.0 15 40 155 180 151 181 0.85 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_7 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 8.6e-06 16.8 0.5 1 2 0.088 1.4 0.1 0.0 23 38 70 85 57 85 0.79 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_7 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 8.6e-06 16.8 0.5 2 2 6e-06 9.3e-05 13.5 0.0 47 64 166 183 164 183 0.92 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_27 - 186 HTH_22 PF13309.1 64 7.4e-05 13.8 1.2 1 1 2.4e-05 0.00037 11.6 0.1 35 63 156 179 143 180 0.76 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_14 - 262 DUF815 PF05673.8 250 6.9e-05 13.1 0.0 1 1 3.6e-06 0.00011 12.4 0.0 23 76 65 122 46 139 0.79 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_15 - 505 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00018 12.3 0.0 1 1 1.6e-05 0.0005 10.9 0.0 18 35 16 33 13 36 0.94 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_18 - 289 rve_3 PF13683.1 67 3.9e-18 56.1 0.0 1 1 2.5e-19 7.8e-18 55.1 0.0 4 67 215 279 212 279 0.96 # 17687 # 18553 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.550 1_15 - 505 HTH_40 PF14493.1 91 1.9e-05 16.2 0.0 1 1 8.5e-06 0.00013 13.5 0.0 10 36 12 38 6 51 0.90 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_27 - 186 HTH_40 PF14493.1 91 0.0002 12.9 0.6 1 1 4.3e-05 0.00066 11.2 0.1 7 32 152 177 147 183 0.89 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_27 - 186 HTH_38 PF13936.1 44 1.8e-06 18.7 0.0 1 1 1.2e-07 1.8e-06 18.7 0.0 9 41 147 179 145 182 0.93 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_15 - 505 HTH_38 PF13936.1 44 5.5e-06 17.2 0.2 1 1 7.7e-07 1.2e-05 16.1 0.2 13 41 7 36 5 38 0.87 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_23 - 565 FAD_oxidored PF12831.2 428 9.1e-07 19.4 3.6 1 1 2.9e-08 9.1e-07 19.4 3.6 2 41 100 138 99 167 0.83 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 4e-18 57.4 0.1 1 2 4.4e-14 1.4e-12 39.3 0.1 1 201 101 303 101 305 0.75 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 4e-18 57.4 0.1 2 2 9e-07 2.8e-05 15.5 0.0 93 147 320 375 309 430 0.76 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 NAD_binding_7 PF13241.1 103 1.1e-07 23.4 1.2 1 2 5.4e-05 0.0017 9.9 0.2 9 38 99 128 96 184 0.89 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 NAD_binding_7 PF13241.1 103 1.1e-07 23.4 1.2 2 2 1.4e-05 0.00044 11.8 0.1 8 41 270 306 264 380 0.74 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_2 - 302 HTH_8 PF02954.14 42 0.00025 11.9 0.2 1 1 3.4e-05 0.0011 9.9 0.1 27 40 281 294 280 294 0.93 # 1325 # 2230 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.528 1_15 - 505 TetR_N PF00440.18 47 5.6e-05 14.1 0.0 1 1 3.9e-06 0.00012 13.0 0.0 15 40 14 39 14 40 0.91 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_14 - 262 AAA_19 PF13245.1 76 1.2e-07 22.8 0.0 1 1 9.7e-09 3e-07 21.4 0.0 11 37 101 126 95 147 0.81 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 KTI12 PF08433.5 270 5.4e-05 13.7 0.4 1 2 6.4e-05 0.002 8.6 0.0 4 81 102 172 101 174 0.68 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 KTI12 PF08433.5 270 5.4e-05 13.7 0.4 2 2 0.0037 0.11 2.8 0.1 34 59 232 257 212 261 0.77 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_15 - 505 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 1.7e-06 18.8 0.1 1 1 1.7e-07 5.4e-06 17.2 0.0 23 48 12 37 9 38 0.91 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_18 - 289 rve PF00665.21 120 1.6e-32 103.5 0.2 1 1 4.1e-33 4.2e-32 102.1 0.0 3 119 126 240 124 241 0.96 # 17687 # 18553 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.550 1_19 - 560 rve PF00665.21 120 5.5e-27 85.6 0.0 1 1 9.9e-28 1e-26 84.7 0.0 2 120 173 313 172 313 0.95 # 18598 # 20277 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 1_15 - 505 rve PF00665.21 120 5e-16 50.2 0.2 1 1 9.5e-17 9.8e-16 49.2 0.2 4 119 127 253 125 254 0.95 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_14 - 262 MCM PF00493.18 331 6.3e-05 13.1 0.0 1 2 7.5e-06 0.00023 11.2 0.0 56 120 98 162 82 172 0.81 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 MCM PF00493.18 331 6.3e-05 13.1 0.0 2 2 0.034 1.1 -0.8 0.0 161 211 190 237 186 259 0.71 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 AAA_30 PF13604.1 196 0.00015 12.7 0.2 1 2 1.4e-05 0.00043 11.1 0.1 16 49 97 131 87 162 0.73 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 AAA_30 PF13604.1 196 0.00015 12.7 0.2 2 2 0.069 2.2 -0.9 0.0 86 104 149 172 117 179 0.62 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_23 - 565 F420_oxidored PF03807.12 96 0.0022 9.7 4.1 1 2 0.0023 0.072 4.9 1.2 2 31 100 126 99 131 0.87 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 F420_oxidored PF03807.12 96 0.0022 9.7 4.1 2 2 0.0075 0.23 3.3 0.1 1 34 271 300 271 323 0.87 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_17 - 100 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 1.7e-11 35.3 2.9 1 1 7e-13 2.2e-11 34.9 2.9 3 76 11 79 9 79 0.90 # 17391 # 17690 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_4 - 239 TIGR00464 TIGR00464 470 5e-05 13.2 3.1 1 1 2.4e-06 7.4e-05 12.6 3.1 316 434 21 141 9 154 0.84 # 4159 # 4875 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 1_14 - 262 Bac_DnaA PF00308.13 219 4e-11 34.2 0.0 1 1 2.1e-12 6.4e-11 33.5 0.0 36 136 101 199 80 221 0.87 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 AAA PF00004.24 132 3.2e-08 25.1 0.0 1 1 1.8e-09 5.5e-08 24.4 0.0 1 111 102 202 102 230 0.70 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_18 - 289 rve_2 PF13333.1 52 4.3e-22 69.3 0.6 1 1 2.9e-23 9.1e-22 68.3 0.1 1 52 231 287 231 287 0.98 # 17687 # 18553 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.550 1_31 - 145 MerR_1 PF13411.1 69 1.4e-19 61.0 0.0 1 1 2.2e-20 2.3e-19 60.3 0.0 3 67 10 75 8 77 0.95 # 29537 # 29971 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_22 - 121 MerR_1 PF13411.1 69 1.7e-14 44.7 0.0 1 1 2.6e-15 2.7e-14 44.0 0.0 1 68 4 72 4 73 0.97 # 21289 # 21651 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_15 - 505 MerR_1 PF13411.1 69 3.2e-05 15.0 0.0 1 1 8.2e-06 8.5e-05 13.6 0.0 2 30 17 45 16 51 0.90 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_16 - 269 AAA_16 PF13191.1 185 4e-06 18.2 0.0 1 2 1.4e-05 0.00022 12.5 0.0 8 52 27 76 25 127 0.70 # 16474 # 17280 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 1_16 - 269 AAA_16 PF13191.1 185 4e-06 18.2 0.0 2 2 0.0074 0.12 3.6 0.0 139 183 116 166 98 168 0.72 # 16474 # 17280 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 1_14 - 262 AAA_16 PF13191.1 185 4.4e-05 14.7 0.1 1 1 6.8e-06 0.00011 13.5 0.1 23 51 98 126 84 166 0.79 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_16 - 269 AAA_22 PF13401.1 131 1e-17 55.8 0.0 1 1 1.1e-18 1.8e-17 55.0 0.0 7 126 46 172 41 176 0.94 # 16474 # 17280 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 1_14 - 262 AAA_22 PF13401.1 131 8.5e-07 20.5 0.1 1 2 5.5e-06 8.6e-05 14.0 0.2 2 28 97 123 96 159 0.74 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 AAA_22 PF13401.1 131 8.5e-07 20.5 0.1 2 2 0.0041 0.064 4.7 0.0 87 117 151 196 132 204 0.62 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_22 - 121 DUF977 PF06163.6 127 9.3e-05 13.5 0.1 1 1 5.9e-06 0.00018 12.5 0.0 27 70 4 47 2 65 0.90 # 21289 # 21651 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_14 - 262 TIGR00362 TIGR00362 437 1.4e-13 41.5 0.0 1 1 7.2e-15 2.2e-13 40.9 0.0 138 240 100 200 77 220 0.90 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_7 - 187 NUMOD1 PF07453.8 37 0.00024 12.2 0.0 1 1 1.5e-05 0.00046 11.4 0.0 20 37 165 182 164 182 0.92 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_14 - 262 AAA_29 PF13555.1 62 4.2e-06 17.5 0.0 1 1 2.8e-07 8.7e-06 16.5 0.0 5 47 80 125 78 136 0.83 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_23 - 565 Pyr_redox PF00070.22 80 1.1e-20 65.1 6.0 1 2 1.4e-06 4.4e-05 15.2 1.5 1 31 99 129 99 131 0.96 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 Pyr_redox PF00070.22 80 1.1e-20 65.1 6.0 2 2 6.2e-18 1.9e-16 51.6 0.2 1 74 271 345 271 354 0.90 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 505 HTH_Tnp_Tc3_1 PF11427.3 50 0.00019 12.3 0.1 1 1 1.6e-05 0.00051 11.0 0.1 20 42 15 37 11 41 0.91 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_27 - 186 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 2.9e-05 15.0 0.0 1 1 1.9e-06 6e-05 14.0 0.0 8 44 148 184 145 185 0.90 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_14 - 262 AAA_28 PF13521.1 163 2.8e-06 18.6 1.1 1 1 4.6e-07 1.4e-05 16.3 0.8 1 24 101 124 101 239 0.90 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_23 - 565 HI0933_like PF03486.9 409 6.9e-09 25.8 3.7 1 2 1.2e-06 3.7e-05 13.5 2.5 2 33 99 130 98 138 0.91 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 HI0933_like PF03486.9 409 6.9e-09 25.8 3.7 2 2 7.2e-06 0.00022 10.9 0.0 82 164 284 366 276 385 0.83 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 505 HTH_23 PF13384.1 50 1.2e-07 22.6 0.5 1 1 6e-08 3.7e-07 21.0 0.5 14 39 12 37 2 39 0.87 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_19 - 560 HTH_23 PF13384.1 50 1.2e-07 22.5 0.9 1 1 7.9e-08 4.9e-07 20.6 0.9 3 45 23 71 21 76 0.87 # 18598 # 20277 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 1_7 - 187 HTH_23 PF13384.1 50 3.3e-06 18.0 0.6 1 1 1.3e-06 7.9e-06 16.8 0.0 11 39 154 183 144 184 0.81 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_17 - 100 HTH_23 PF13384.1 50 3.8e-06 17.8 0.0 1 1 1.2e-06 7.7e-06 16.8 0.0 7 40 20 52 14 60 0.86 # 17391 # 17690 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_27 - 186 HTH_23 PF13384.1 50 1.4e-05 16.0 0.3 1 1 2.2e-06 1.4e-05 16.0 0.3 5 39 146 180 142 184 0.87 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_7 - 187 HTH_7 PF02796.10 45 9e-16 48.8 0.1 1 1 1.9e-16 2e-15 47.7 0.1 1 44 141 184 141 185 0.98 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_27 - 186 HTH_7 PF02796.10 45 5.7e-14 43.1 0.5 1 1 1.5e-14 1.6e-13 41.6 0.1 1 44 141 181 141 182 0.97 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_15 - 505 HTH_7 PF02796.10 45 1.5e-06 19.3 0.1 1 1 3.4e-07 3.5e-06 18.1 0.1 20 43 14 37 12 39 0.92 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_14 - 262 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00016 12.1 0.0 1 1 1.1e-05 0.00033 11.1 0.0 23 43 100 120 96 153 0.86 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_19 - 560 HTH_29 PF13551.1 112 1.1e-06 20.1 0.3 1 1 1.4e-07 1.1e-06 20.1 0.3 13 77 39 109 27 132 0.79 # 18598 # 20277 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 1_7 - 187 HTH_29 PF13551.1 112 1e-05 17.0 3.1 1 1 3.6e-05 0.00028 12.3 1.6 33 108 122 182 115 183 0.64 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_27 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 3.3e-05 15.3 0.6 1 2 0.098 0.76 1.3 0.2 24 46 114 136 88 153 0.67 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_27 - 186 HTH_29 PF13551.1 112 3.3e-05 15.3 0.6 2 2 4.1e-05 0.00032 12.2 0.0 4 35 151 181 148 184 0.90 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_15 - 505 HTH_29 PF13551.1 112 0.0001 13.7 0.0 1 1 3.7e-05 0.00028 12.3 0.0 9 34 13 37 9 66 0.92 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_23 - 565 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 6.1e-05 14.5 1.7 1 1 4.2e-06 0.00013 13.4 0.1 2 26 276 306 276 340 0.70 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 8.8e-06 16.8 2.8 1 3 0.0081 0.25 2.3 0.1 1 41 101 135 101 162 0.81 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 8.8e-06 16.8 2.8 2 3 0.034 1 0.3 0.0 134 155 218 241 202 242 0.72 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 8.8e-06 16.8 2.8 3 3 6.6e-06 0.00021 12.4 0.1 112 155 321 366 311 367 0.85 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 GIDA PF01134.17 392 8e-09 26.0 6.6 1 3 3.5e-10 1.1e-08 25.5 3.3 2 187 100 279 99 302 0.72 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 GIDA PF01134.17 392 8e-09 26.0 6.6 2 3 0.038 1.2 -0.9 0.0 3 31 273 301 271 315 0.84 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 GIDA PF01134.17 392 8e-09 26.0 6.6 3 3 0.018 0.57 0.1 0.1 349 385 393 429 387 433 0.77 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 NAD_binding_8 PF13450.1 68 1.1e-05 16.7 1.2 1 2 3.5e-07 1.1e-05 16.7 1.2 1 35 102 135 102 155 0.90 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 NAD_binding_8 PF13450.1 68 1.1e-05 16.7 1.2 2 2 0.041 1.3 0.5 0.2 1 25 274 298 274 303 0.81 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_1 - 257 Spermine_synth PF01564.12 246 2e-05 14.9 0.1 1 1 1.1e-06 3.5e-05 14.1 0.1 143 206 162 221 156 240 0.82 # 2 # 772 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_14 - 262 PhoH PF02562.11 205 3.9e-09 27.2 0.1 1 1 2.9e-10 9.1e-09 26.0 0.1 3 61 83 142 81 179 0.77 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 AAA_5 PF07728.9 139 5.9e-05 14.1 0.2 1 1 4.3e-06 0.00013 12.9 0.2 1 19 101 119 101 243 0.78 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_16 - 269 AAA_32 PF13654.1 509 3.6e-05 13.8 0.1 1 2 5.8e-06 0.00018 11.4 0.0 8 81 16 94 8 106 0.86 # 16474 # 17280 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 1_16 - 269 AAA_32 PF13654.1 509 3.6e-05 13.8 0.1 2 2 0.019 0.58 -0.1 0.1 472 502 237 267 224 268 0.89 # 16474 # 17280 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 1_7 - 187 HTH_psq PF05225.11 45 8.9e-05 13.3 0.0 1 1 7.4e-06 0.00023 12.0 0.0 20 38 165 183 164 185 0.91 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_16 - 269 TniB PF05621.6 302 6.1e-188 614.0 5.7 1 1 2.2e-189 6.8e-188 613.8 5.7 19 285 1 267 1 268 1.00 # 16474 # 17280 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 1_14 - 262 AAA_3 PF07726.6 131 0.00016 12.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.00038 11.4 0.0 2 72 102 171 101 201 0.70 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_19 - 560 HTH_28 PF13518.1 52 2.6e-09 28.3 0.1 1 1 1.7e-09 1.1e-08 26.3 0.1 1 46 26 78 26 87 0.76 # 18598 # 20277 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 1_7 - 187 HTH_28 PF13518.1 52 1.2e-06 19.8 0.1 1 1 1.9e-07 1.2e-06 19.8 0.1 8 34 156 183 149 184 0.83 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_15 - 505 HTH_28 PF13518.1 52 2e-06 19.1 0.4 1 1 9.8e-07 6.1e-06 17.5 0.4 5 34 6 37 3 38 0.82 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_17 - 100 HTH_28 PF13518.1 52 1.7e-05 16.1 0.1 1 1 7.1e-06 4.4e-05 14.8 0.1 14 34 31 51 22 53 0.85 # 17391 # 17690 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_27 - 186 HTH_28 PF13518.1 52 4.1e-05 14.9 0.0 1 1 2.1e-05 0.00013 13.2 0.0 8 33 154 179 148 184 0.82 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_14 - 262 DnaB_C PF03796.10 259 4.6e-05 13.6 0.0 1 1 2.4e-06 7.5e-05 12.9 0.0 16 55 96 135 85 158 0.90 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_31 - 145 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 7.1e-22 69.0 0.7 1 1 9.7e-23 1.5e-21 67.9 0.5 1 65 51 113 51 113 0.95 # 29537 # 29971 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_22 - 121 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.00025 12.8 7.4 1 1 2.5e-05 0.00039 12.1 7.4 1 64 47 108 47 109 0.85 # 21289 # 21651 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_15 - 505 HTH_24 PF13412.1 48 1e-07 22.6 0.1 1 1 1e-08 3.2e-07 21.0 0.1 7 39 2 37 1 39 0.90 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_14 - 262 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 9.2e-05 13.8 0.1 1 1 7.7e-06 0.00024 12.4 0.0 3 44 79 122 77 151 0.81 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_15 - 505 HTH_30 PF13556.1 59 5.2e-05 14.1 0.3 1 1 5.2e-06 0.00016 12.6 0.1 7 34 10 37 8 38 0.90 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_7 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 1.9e-05 15.5 0.3 1 2 0.066 2.1 -0.6 0.1 3 16 124 137 123 156 0.74 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_7 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 1.9e-05 15.5 0.3 2 2 4.1e-06 0.00013 12.9 0.0 28 45 166 183 164 184 0.93 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_23 - 565 TIGR01292 TIGR01292 300 5.1e-20 62.3 2.9 1 2 3.8e-05 0.0012 8.6 1.1 3 39 100 136 98 142 0.89 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 TIGR01292 TIGR01292 300 5.1e-20 62.3 2.9 2 2 1.1e-18 3.3e-17 53.1 0.0 142 296 270 428 213 430 0.81 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 505 HTH_31 PF13560.1 64 0.00014 13.4 0.2 1 1 1.1e-05 0.00035 12.1 0.2 12 43 13 44 4 54 0.82 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_15 - 505 HTH_36 PF13730.1 55 3.6e-06 18.4 0.0 1 1 2.9e-07 9e-06 17.1 0.0 26 47 16 37 2 38 0.88 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_19 - 560 HTH_Tnp_Mu_2 PF09039.6 108 3.2e-06 18.2 0.0 1 1 2.8e-07 8.6e-06 16.8 0.0 37 101 100 163 83 166 0.91 # 18598 # 20277 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 1_14 - 262 NACHT PF05729.7 166 0.00038 11.4 2.1 1 2 5.9e-05 0.0018 9.2 0.3 3 23 102 122 100 148 0.84 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 NACHT PF05729.7 166 0.00038 11.4 2.1 2 2 0.012 0.36 1.7 0.1 80 127 156 200 139 221 0.76 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 AAA_17 PF13207.1 121 3.4e-05 15.9 0.0 1 1 1.6e-06 4.9e-05 15.4 0.0 2 38 102 133 101 232 0.74 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_23 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1.3e-06 18.6 4.7 1 3 4.3e-08 1.3e-06 18.6 4.7 2 32 100 130 99 137 0.90 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1.3e-06 18.6 4.7 2 3 0.034 1.1 -0.8 0.1 143 204 311 369 297 388 0.72 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 1.3e-06 18.6 4.7 3 3 0.074 2.3 -1.9 0.0 376 402 388 408 377 424 0.82 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_14 - 262 AAA_25 PF13481.1 194 3.4e-05 14.6 0.0 1 1 1.8e-06 5.6e-05 13.8 0.0 29 57 95 123 76 170 0.86 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 RuvB_N PF05496.7 234 0.00016 12.0 0.0 1 1 7.1e-06 0.00022 11.5 0.0 48 75 97 124 45 170 0.84 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_31 - 145 MerR PF00376.18 38 1.5e-13 41.4 0.2 1 1 2.7e-14 2.8e-13 40.5 0.2 2 38 10 46 9 46 0.99 # 29537 # 29971 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_22 - 121 MerR PF00376.18 38 3.8e-07 20.9 0.0 1 1 5.9e-08 6.1e-07 20.3 0.0 1 38 5 42 5 42 0.95 # 21289 # 21651 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_15 - 505 MerR PF00376.18 38 3.8e-05 14.5 0.1 1 1 8.7e-06 9e-05 13.3 0.1 1 28 17 43 17 48 0.85 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_14 - 262 AAA_33 PF13671.1 143 0.00011 13.3 0.2 1 1 8.9e-06 0.00028 12.1 0.2 2 36 102 142 102 255 0.67 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_7 - 187 CENP-B_N PF04218.8 53 8.8e-06 16.4 0.1 1 1 6.4e-07 2e-05 15.3 0.0 18 43 157 182 154 186 0.86 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_1 - 257 Methyltransf_23 PF13489.1 161 8.2e-05 13.6 0.0 1 1 4.2e-06 0.00013 13.0 0.0 30 148 101 237 75 238 0.71 # 2 # 772 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_23 - 565 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 7.4e-06 16.9 3.1 1 2 0.00051 0.016 6.0 0.8 15 50 92 127 89 130 0.90 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 7.4e-06 16.9 3.1 2 2 2.1e-05 0.00065 10.5 0.1 16 58 265 307 257 339 0.84 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 3HCDH_N PF02737.13 180 0.00099 10.0 6.4 1 2 0.0047 0.15 2.9 2.4 1 30 99 128 99 134 0.93 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 3HCDH_N PF02737.13 180 0.00099 10.0 6.4 2 2 9e-05 0.0028 8.6 0.1 2 39 272 309 271 348 0.73 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 1.9e-06 19.0 0.1 1 1 1.3e-07 4.1e-06 17.8 0.1 13 40 276 303 272 356 0.82 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_18 - 289 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 7.5e-13 39.9 0.0 1 1 4.7e-14 1.4e-12 39.0 0.0 2 129 130 260 129 272 0.88 # 17687 # 18553 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.550 1_2 - 302 HTH_17 PF12728.2 51 0.00013 13.5 0.6 1 2 0.00044 0.0068 8.0 0.2 1 17 147 163 147 189 0.90 # 1325 # 2230 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.528 1_2 - 302 HTH_17 PF12728.2 51 0.00013 13.5 0.6 2 2 0.026 0.41 2.3 0.0 10 21 281 292 280 297 0.83 # 1325 # 2230 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.528 1_15 - 505 HTH_17 PF12728.2 51 0.00013 13.5 0.0 1 1 3.7e-05 0.00057 11.5 0.0 3 25 17 39 17 53 0.90 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_7 - 187 HTH_11 PF08279.7 55 1.9e-05 15.6 0.0 1 1 9.2e-06 0.00014 12.8 0.0 19 37 165 183 162 184 0.91 # 8687 # 9247 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_15 - 505 HTH_11 PF08279.7 55 0.00015 12.7 0.2 1 1 2.6e-05 0.00041 11.3 0.1 16 37 16 37 11 38 0.89 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_27 - 186 TrmB PF01978.14 68 1.8e-05 15.7 0.0 1 1 2.3e-06 3.5e-05 14.8 0.0 19 44 155 180 150 181 0.89 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_15 - 505 TrmB PF01978.14 68 6.4e-05 14.0 0.0 1 1 1.6e-05 0.00025 12.1 0.1 22 45 15 38 13 38 0.92 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_15 - 505 LacI PF00356.16 46 6.2e-05 13.9 0.0 1 1 4.1e-06 0.00013 12.9 0.0 1 23 17 39 17 44 0.91 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_23 - 565 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.5e-44 142.8 0.0 1 1 3.2e-45 1e-43 140.8 0.0 2 199 100 410 99 412 0.96 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 DFP PF04127.10 185 0.00024 12.0 2.4 1 2 0.00039 0.012 6.4 0.4 28 51 105 128 99 156 0.83 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 DFP PF04127.10 185 0.00024 12.0 2.4 2 2 0.0014 0.043 4.7 0.1 32 53 281 302 276 336 0.77 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 DAO PF01266.19 358 1.3e-09 28.6 11.7 1 3 1.4e-08 4.2e-07 20.3 0.7 1 38 99 134 99 190 0.84 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 DAO PF01266.19 358 1.3e-09 28.6 11.7 2 3 0.032 0.98 -0.6 0.1 3 31 273 301 271 307 0.75 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_23 - 565 DAO PF01266.19 358 1.3e-09 28.6 11.7 3 3 9.4e-07 2.9e-05 14.3 0.5 152 208 314 372 307 433 0.74 # 21669 # 23363 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_27 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 1.3e-06 19.4 0.1 1 2 0.016 0.25 2.5 0.0 33 52 8 27 6 28 0.90 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_27 - 186 HTH_20 PF12840.2 61 1.3e-06 19.4 0.1 2 2 1.8e-05 0.00028 12.0 0.1 3 43 110 177 108 180 0.91 # 27239 # 27796 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_15 - 505 HTH_20 PF12840.2 61 6.1e-05 14.1 0.2 1 1 1.1e-05 0.00017 12.7 0.0 13 45 1 36 1 38 0.94 # 14849 # 16363 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_1 - 257 Methyltransf_18 PF12847.2 112 0.00021 13.1 0.0 1 1 1.1e-05 0.00035 12.4 0.0 56 110 157 205 99 207 0.79 # 2 # 772 # -1 # ID=1_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_12 - 280 Pterin_bind PF00809.17 210 7.9e-59 189.7 0.0 1 1 3e-60 9.4e-59 189.5 0.0 1 210 7 216 7 216 0.98 # 12434 # 13273 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 1_14 - 262 IstB_IS21 PF01695.12 178 9.6e-70 224.8 0.1 1 1 4.1e-71 1.3e-69 224.4 0.1 2 177 55 230 54 231 0.98 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_14 - 262 AAA_11 PF13086.1 236 0.00014 12.7 0.3 1 1 8.7e-06 0.00027 11.8 0.3 6 44 89 142 82 260 0.72 # 14077 # 14862 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.503 1_18 - 289 HTH_21 PF13276.1 60 4.6e-13 40.3 0.1 1 1 6.9e-14 2.1e-12 38.2 0.0 4 59 47 101 44 102 0.90 # 17687 # 18553 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.550 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/b4a45281-958a-4b05-83cf-5a28a3b5352c # Target file: checkm_output/bins/pm1851/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1851/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/b4a45281-958a-4b05-83cf-5a28a3b5352c checkm_output/bins/pm1851/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:53:35 2017 # [ok]