# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_10 - 92 Zn_Tnp_IS1 PF03811.8 36 1.1e-21 69.0 8.1 1 1 2.2e-23 2.1e-21 68.0 8.1 1 36 1 36 1 36 0.99 # 6976 # 7251 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_15 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.2e-06 19.0 0.2 1 3 0.0041 0.38 2.3 0.2 187 223 95 129 86 132 0.74 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.2e-06 19.0 0.2 2 3 2.9e-06 0.00027 12.7 0.0 130 231 217 309 200 339 0.79 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 3.2e-06 19.0 0.2 3 3 0.022 2 -0.0 0.0 139 160 345 366 314 376 0.63 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 18_1 - 106 HTH_IclR PF09339.5 52 4.2e-06 19.2 0.4 1 2 0.05 4.7 -0.2 0.1 7 18 29 40 27 58 0.70 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 18_1 - 106 HTH_IclR PF09339.5 52 4.2e-06 19.2 0.4 2 2 1.8e-07 1.7e-05 17.2 0.0 15 40 75 100 71 101 0.86 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 3_9 - 237 ABC_tran PF00005.22 137 8.6e-05 15.7 0.0 1 1 1.4e-06 0.00013 15.1 0.0 15 113 28 155 18 173 0.74 # 6232 # 6942 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 18_1 - 106 HTH_22 PF13309.1 64 0.00015 14.3 0.6 1 1 4.6e-06 0.00043 12.9 0.2 32 63 73 99 63 100 0.76 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 9_1 - 254 HTH_AsnC-type PF13404.1 42 0.00047 12.6 0.3 1 1 1.4e-05 0.0014 11.1 0.3 7 42 9 44 8 44 0.94 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_3 - 424 Cdd1 PF11731.3 93 0.00039 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.0011 11.8 0.0 10 47 177 214 143 227 0.86 # 2171 # 3442 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 2_7 - 71 rve_3 PF13683.1 67 2.7e-13 42.2 0.1 1 1 4.3e-15 4e-13 41.6 0.1 25 67 13 55 8 55 0.94 # 5666 # 5878 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 9_1 - 254 HTH_DeoR PF08220.7 57 2.5e-20 64.6 1.0 1 1 7.1e-22 6.7e-20 63.3 1.0 1 55 6 60 6 61 0.97 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 18_1 - 106 HTH_40 PF14493.1 91 0.00017 14.6 0.6 1 2 0.044 4.1 0.6 0.0 49 74 33 59 23 70 0.69 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 18_1 - 106 HTH_40 PF14493.1 91 0.00017 14.6 0.6 2 2 7.8e-06 0.00074 12.6 0.1 7 33 72 98 66 103 0.89 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 2_9 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.00044 13.0 0.0 1 2 6.6e-05 0.0062 9.3 0.0 1 23 2 24 2 46 0.78 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_9 - 181 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.00044 13.0 0.0 2 2 0.015 1.4 1.6 0.0 112 135 99 122 91 136 0.77 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 18_1 - 106 HTH_38 PF13936.1 44 9e-07 21.3 1.4 1 1 4.3e-08 2e-06 20.1 0.0 9 41 67 99 65 102 0.93 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 5_2 - 129 HTH_38 PF13936.1 44 0.00028 13.3 0.0 1 1 8.1e-06 0.00038 12.9 0.0 5 31 12 41 8 45 0.83 # 859 # 1245 # 1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_15 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 5.6e-07 21.7 3.8 1 2 5.9e-09 5.6e-07 21.7 3.8 1 41 100 139 100 159 0.83 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 5.6e-07 21.7 3.8 2 2 0.01 0.94 1.2 0.0 84 120 305 341 261 364 0.71 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 9_1 - 254 MarR PF01047.17 59 3.5e-07 22.8 0.1 1 1 1e-08 9.4e-07 21.4 0.1 7 47 9 49 5 52 0.95 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_15 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.4e-18 60.5 0.1 1 3 1.5e-06 0.00014 14.8 0.0 164 199 95 130 48 134 0.85 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.4e-18 60.5 0.1 2 3 5.8e-09 5.5e-07 22.6 0.0 115 201 219 304 174 306 0.81 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.4e-18 60.5 0.1 3 3 5.6e-08 5.3e-06 19.4 0.0 89 147 317 372 309 431 0.82 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 3.6e-06 20.0 1.2 1 2 1.9e-05 0.0017 11.4 0.2 9 38 100 129 96 164 0.90 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 3.6e-06 20.0 1.2 2 2 0.00049 0.046 6.9 0.1 8 45 271 314 264 382 0.66 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 11_3 - 94 HTH_39 PF14090.1 70 0.00025 13.4 0.0 1 1 4.1e-06 0.00039 12.7 0.0 5 36 7 38 5 52 0.89 # 921 # 1202 # -1 # ID=11_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_9 - 181 AAA_19 PF13245.1 76 0.00022 13.8 0.0 1 1 8.2e-06 0.00077 12.1 0.0 15 33 5 22 2 38 0.84 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 1_1 - 371 CbiA PF01656.18 195 1.3e-18 59.9 0.0 1 1 2.3e-20 2.1e-18 59.2 0.0 1 142 80 261 80 297 0.76 # 3 # 1115 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.458 1_2 - 325 Sigma70_r4_2 PF08281.7 54 0.0005 12.4 0.1 1 1 1.4e-05 0.0013 11.1 0.1 23 50 157 184 152 185 0.88 # 1115 # 2089 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 5_5 - 252 Rep_3 PF01051.16 222 5.5e-50 162.8 0.0 1 1 1.3e-51 6.2e-50 162.6 0.0 3 222 16 242 14 242 0.91 # 2457 # 3212 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 3_2 - 289 Rep_3 PF01051.16 222 1.1e-48 158.5 0.0 1 1 2.9e-50 1.4e-48 158.2 0.0 3 213 65 278 63 283 0.95 # 1087 # 1953 # -1 # ID=3_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.441 7_1 - 201 rve PF00665.21 120 4.8e-14 45.4 0.0 1 2 0.029 1.4 1.9 0.0 83 102 30 49 6 51 0.90 # 117 # 719 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 7_1 - 201 rve PF00665.21 120 4.8e-14 45.4 0.0 2 2 1.8e-14 8.7e-13 41.3 0.0 8 117 73 179 69 182 0.90 # 117 # 719 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 16_1 - 235 rve PF00665.21 120 3.1e-13 42.7 0.1 1 2 0.03 1.4 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 21 # 725 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 16_1 - 235 rve PF00665.21 120 3.1e-13 42.7 0.1 2 2 1.2e-13 5.7e-12 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 21 # 725 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 9_1 - 254 Fe_dep_repress PF01325.14 60 1.5e-06 21.0 0.2 1 1 4.1e-08 3.9e-06 19.6 0.1 13 53 10 50 8 55 0.93 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 3_9 - 237 AAA_23 PF13476.1 202 1.5e-11 37.8 0.0 1 1 1.6e-13 1.5e-11 37.8 0.0 1 53 6 58 6 202 0.88 # 6232 # 6942 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 2_9 - 181 AAA_24 PF13479.1 213 6.7e-05 15.3 0.0 1 1 1.4e-06 0.00013 14.4 0.0 6 33 3 34 1 73 0.90 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_9 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.2e-05 15.5 0.0 1 2 4.7e-06 0.00044 12.2 0.0 19 53 3 35 1 120 0.83 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_9 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.2e-05 15.5 0.0 2 2 0.024 2.2 0.1 0.0 45 74 106 133 95 150 0.73 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 1_2 - 325 CPSase_L_D3 PF02787.14 123 0.00025 13.6 0.2 1 1 7.2e-06 0.00067 12.3 0.2 48 97 133 185 124 190 0.84 # 1115 # 2089 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 3_9 - 237 SMC_N PF02463.14 220 2.5e-10 32.7 0.0 1 1 3.9e-12 3.6e-10 32.2 0.0 2 71 4 69 3 79 0.85 # 6232 # 6942 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 16_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00023 13.9 0.3 1 1 5.4e-06 0.00051 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 21 # 725 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 18_1 - 106 GerE PF00196.14 58 0.00035 12.7 0.1 1 1 7.1e-06 0.00066 11.8 0.1 11 35 71 95 69 98 0.93 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 16_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.00064 12.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.002 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 21 # 725 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_9 - 181 TIGR03263 TIGR03263 180 0.00068 11.8 0.0 1 1 1.6e-05 0.0015 10.7 0.0 3 26 2 25 1 31 0.81 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 1_1 - 371 MipZ PF09140.6 261 1.5e-06 20.3 0.0 1 2 0.0023 0.22 3.3 0.0 3 50 80 132 78 163 0.73 # 3 # 1115 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.458 1_1 - 371 MipZ PF09140.6 261 1.5e-06 20.3 0.0 2 2 7.7e-07 7.2e-05 14.7 0.0 87 136 202 251 189 265 0.87 # 3 # 1115 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.458 13_1 - 327 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 1.2e-35 115.7 0.1 1 1 4.6e-37 2.2e-35 114.9 0.1 5 212 138 312 135 313 0.90 # 72 # 1052 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 2_2 - 366 DDE_Tnp_1 PF01609.16 213 8.2e-35 113.0 0.0 1 1 2.3e-36 1.1e-34 112.7 0.0 6 213 73 307 68 307 0.96 # 257 # 1354 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.348 3_9 - 237 AAA_21 PF13304.1 303 1.2e-05 18.2 0.0 1 1 2.3e-07 2.2e-05 17.3 0.0 2 24 27 49 27 83 0.83 # 6232 # 6942 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 9_1 - 254 Sigma70_r4 PF04545.11 50 0.0039 9.4 4.2 1 1 1.3e-05 0.0012 11.0 0.4 7 39 5 38 5 43 0.90 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_15 - 562 Thi4 PF01946.12 230 0.00025 13.0 0.4 1 1 6.3e-06 0.0006 11.7 0.4 19 70 100 150 95 158 0.88 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_2 - 325 HTH_37 PF13744.1 80 0.00084 12.0 2.6 1 1 3e-05 0.0028 10.3 0.2 27 53 156 182 134 185 0.87 # 1115 # 2089 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 9_1 - 254 Rrf2 PF02082.15 83 1.8e-06 20.9 0.3 1 1 4.9e-08 4.6e-06 19.6 0.2 17 60 11 54 9 70 0.84 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 9_1 - 254 HTH_27 PF13463.1 68 6.8e-05 16.0 0.1 1 1 1.5e-06 0.00014 15.0 0.1 5 49 7 50 5 70 0.88 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_7 - 71 rve_2 PF13333.1 52 6.5e-10 31.8 1.6 1 1 9e-12 8.5e-10 31.5 1.6 8 51 15 62 13 63 0.92 # 5666 # 5878 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_11 - 152 MerR_1 PF13411.1 69 3.3e-20 64.5 0.0 1 1 1.3e-21 5.9e-20 63.7 0.0 2 67 9 75 8 77 0.96 # 8932 # 9387 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_16 - 122 MerR_1 PF13411.1 69 4.8e-13 41.6 0.0 1 1 1.5e-14 7e-13 41.1 0.0 1 68 4 72 4 73 0.97 # 12310 # 12675 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 2_9 - 181 cobW PF02492.14 178 0.00079 11.7 0.0 1 1 1.3e-05 0.0012 11.1 0.0 2 22 2 22 1 30 0.79 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_9 - 181 AAA_22 PF13401.1 131 1.6e-05 17.9 0.0 1 1 3.3e-07 3.1e-05 17.0 0.0 6 37 2 34 1 177 0.84 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 9_1 - 254 DUF977 PF06163.6 127 0.00017 14.2 0.3 1 1 4.9e-06 0.00046 12.8 0.3 15 57 8 50 4 65 0.87 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 3_9 - 237 AAA_29 PF13555.1 62 5.1e-08 25.2 0.0 1 1 9.2e-10 8.6e-08 24.5 0.0 2 49 5 50 4 57 0.82 # 6232 # 6942 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_15 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 8.9e-20 63.8 5.4 1 2 1.2e-06 0.00012 15.4 1.5 2 31 101 130 100 132 0.95 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 8.9e-20 63.8 5.4 2 2 3.2e-17 3e-15 49.3 0.1 1 72 272 342 272 351 0.91 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 18_1 - 106 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 3.7e-05 16.2 0.0 1 1 6.6e-07 6.2e-05 15.5 0.0 8 44 68 104 63 105 0.91 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 2_9 - 181 AAA_28 PF13521.1 163 0.00013 14.8 0.0 1 1 2.9e-06 0.00027 13.7 0.0 2 30 3 34 2 165 0.89 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 13_1 - 327 DDE_Tnp_1_3 PF13612.1 155 1.5e-10 33.8 0.3 1 1 3e-12 2.8e-10 33.0 0.1 5 151 137 292 134 296 0.72 # 72 # 1052 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 1_15 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 4.1e-09 28.1 5.0 1 2 4.3e-07 4e-05 15.0 2.8 2 33 100 131 99 139 0.91 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 4.1e-09 28.1 5.0 2 2 1.7e-06 0.00016 13.0 0.0 83 163 286 362 281 379 0.85 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 16_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 1.2e-06 22.1 0.2 1 1 1.1e-07 5.3e-06 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 21 # 725 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_1 - 201 HTH_32 PF13565.1 77 0.00031 14.4 1.3 1 1 9.2e-06 0.00043 13.9 0.2 37 76 15 50 6 51 0.83 # 117 # 719 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 9_1 - 254 GntR PF00392.16 64 3.3e-07 22.6 0.5 1 1 8.1e-09 7.6e-07 21.4 0.5 26 59 21 54 9 59 0.92 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_2 - 366 DDE_Tnp_1_4 PF13701.1 449 3.5e-27 87.4 1.1 1 1 5.4e-29 5.1e-27 86.9 1.1 138 438 68 363 28 365 0.82 # 257 # 1354 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.348 16_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 5.7e-06 18.8 0.7 1 2 0.095 1.5 1.6 0.0 7 27 11 35 7 36 0.69 # 21 # 725 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 16_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 5.7e-06 18.8 0.7 2 2 1.1e-05 0.00017 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 21 # 725 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 18_1 - 106 HTH_23 PF13384.1 50 8.2e-06 18.3 2.1 1 1 8.3e-07 1.3e-05 17.6 0.2 5 39 66 100 62 104 0.87 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 4_7 - 246 HTH_23 PF13384.1 50 9e-06 18.1 0.4 1 1 5.7e-07 9e-06 18.1 0.4 2 41 171 207 170 216 0.88 # 3937 # 4674 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 9_1 - 254 HTH_23 PF13384.1 50 2.3e-05 16.8 0.1 1 1 3.8e-06 5.9e-05 15.5 0.1 4 45 4 47 1 50 0.86 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 3_10 - 92 HTH_23 PF13384.1 50 5.6e-05 15.6 0.0 1 1 5.7e-06 8.9e-05 15.0 0.0 7 40 53 86 51 90 0.92 # 6976 # 7251 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_2 - 325 HTH_23 PF13384.1 50 0.00036 13.0 0.1 1 1 0.00015 0.0023 10.5 0.0 9 40 152 183 151 188 0.88 # 1115 # 2089 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 18_1 - 106 HTH_7 PF02796.10 45 6.9e-14 44.4 0.6 1 1 3.4e-15 1.6e-13 43.2 0.1 1 44 61 101 61 102 0.97 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 4_7 - 246 HTH_7 PF02796.10 45 9.2e-08 24.8 0.1 1 1 4.5e-09 2.1e-07 23.6 0.1 8 44 173 209 168 210 0.87 # 3937 # 4674 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 4_5 - 180 Ribosomal_S27e PF01667.12 55 0.00018 13.9 1.1 1 1 3.5e-06 0.00033 13.1 1.1 5 33 71 99 68 104 0.90 # 2966 # 3505 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 4_5 - 180 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 9.4e-05 14.9 0.2 1 2 0.0003 0.014 8.0 0.1 2 14 73 85 73 87 0.84 # 2966 # 3505 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 4_5 - 180 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 9.4e-05 14.9 0.2 2 2 0.0034 0.16 4.6 0.0 5 15 95 105 94 114 0.81 # 2966 # 3505 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 3_10 - 92 zinc_ribbon_4 PF13717.1 36 0.002 10.7 5.3 1 1 0.00014 0.0065 9.1 5.3 5 35 8 39 5 40 0.83 # 6976 # 7251 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 5_2 - 129 Ribosomal_S20p PF01649.13 84 0.00026 14.2 0.1 1 1 4.9e-06 0.00046 13.4 0.1 6 47 56 97 53 115 0.77 # 859 # 1245 # 1 # ID=5_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 18_1 - 106 HTH_29 PF13551.1 112 3.2e-05 16.9 0.9 1 2 0.013 1.2 2.2 0.3 24 54 34 63 18 70 0.64 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 18_1 - 106 HTH_29 PF13551.1 112 3.2e-05 16.9 0.9 2 2 3.4e-06 0.00032 13.7 0.0 4 35 71 101 68 105 0.90 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_15 - 562 GIDA PF01134.17 392 2.5e-06 19.4 5.3 1 2 2.6e-08 2.5e-06 19.4 5.3 1 53 100 154 100 290 0.87 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 GIDA PF01134.17 392 2.5e-06 19.4 5.3 2 2 0.01 0.95 1.0 0.3 349 385 390 426 376 430 0.79 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.00078 12.6 1.0 1 2 0.08 7.5 -0.3 0.1 1 29 101 129 101 163 0.86 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.00078 12.6 1.0 2 2 6.9e-05 0.0065 9.6 0.1 1 66 273 351 273 371 0.64 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 NAD_binding_8 PF13450.1 68 6.5e-05 15.8 1.2 1 1 6.9e-07 6.5e-05 15.8 1.2 1 35 103 136 103 155 0.91 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 16_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 2.2e-12 39.5 0.3 1 1 6e-14 2.8e-12 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 21 # 725 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_1 - 201 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 6.5e-10 31.4 0.5 1 1 2.2e-11 1e-09 30.8 0.3 10 132 15 143 8 152 0.83 # 117 # 719 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 1_15 - 562 Trp_halogenase PF04820.9 454 0.0042 8.5 3.3 1 1 8.1e-05 0.0076 7.6 3.3 1 47 100 143 100 151 0.76 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_1 - 371 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00066 11.5 0.0 1 2 0.0081 0.76 1.5 0.0 4 28 80 104 77 139 0.76 # 3 # 1115 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.458 1_1 - 371 TIGR01968 TIGR01968 261 0.00066 11.5 0.0 2 2 0.00014 0.013 7.3 0.0 102 138 204 240 195 257 0.87 # 3 # 1115 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.458 13_1 - 327 DDE_Tnp_4 PF13359.1 158 2.3e-07 23.3 0.1 1 1 5.2e-09 4.9e-07 22.3 0.1 6 153 147 306 142 311 0.65 # 72 # 1052 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 2_9 - 181 AAA_18 PF13238.1 129 6.3e-11 35.5 0.0 1 1 1.2e-12 1.1e-10 34.7 0.0 1 126 3 134 3 137 0.71 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 3_9 - 237 TIGR00611 TIGR00611 365 1.9e-08 26.2 0.0 1 1 3e-10 2.8e-08 25.7 0.0 3 56 4 57 2 81 0.92 # 6232 # 6942 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 1_3 - 424 IMS_HHH PF11798.3 32 2.4e-08 26.6 0.1 1 1 6.4e-10 6e-08 25.3 0.1 2 32 170 200 169 200 0.91 # 2171 # 3442 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 13_1 - 327 DDE_Tnp_1_6 PF13751.1 125 5.1e-09 29.1 0.2 1 1 1.4e-10 1.3e-08 27.7 0.2 59 123 253 314 244 316 0.81 # 72 # 1052 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.552 3_10 - 92 HTH_Tnp_IS1 PF12759.2 46 5.7e-31 98.6 0.2 1 1 1e-32 9.6e-31 97.9 0.2 1 46 43 88 43 88 0.99 # 6976 # 7251 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 9_1 - 254 HTH_28 PF13518.1 52 3.8e-05 16.5 0.0 1 1 4.7e-06 8.8e-05 15.3 0.0 4 41 9 48 6 53 0.89 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 16_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 5.5e-05 16.0 1.2 1 1 1.3e-05 0.00024 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 21 # 725 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 18_1 - 106 HTH_28 PF13518.1 52 6e-05 15.9 0.0 1 1 8e-06 0.00015 14.6 0.0 8 33 74 99 68 104 0.82 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 3_10 - 92 HTH_28 PF13518.1 52 8.2e-05 15.4 0.0 1 1 7e-06 0.00013 14.8 0.0 4 34 55 85 53 89 0.91 # 6976 # 7251 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 4_7 - 246 HTH_28 PF13518.1 52 0.00027 13.8 0.6 1 1 1.4e-05 0.00027 13.8 0.6 1 33 175 207 175 211 0.94 # 3937 # 4674 # -1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 1_11 - 152 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 3.1e-21 68.4 1.4 1 1 1.2e-22 5.7e-21 67.6 1.1 1 65 51 113 51 113 0.95 # 8932 # 9387 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_16 - 122 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.00018 14.8 6.6 1 1 6.7e-06 0.00031 14.0 6.6 1 64 47 108 47 109 0.80 # 12310 # 12675 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 9_1 - 254 HTH_24 PF13412.1 48 3.3e-07 22.5 0.4 1 1 1.9e-08 8.9e-07 21.1 0.2 5 47 7 49 5 50 0.95 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_2 - 325 HTH_24 PF13412.1 48 5.7e-05 15.3 1.1 1 1 2.3e-06 0.00011 14.5 0.1 15 39 158 182 151 184 0.84 # 1115 # 2089 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_15 - 562 TIGR01292 TIGR01292 300 1.2e-19 62.7 3.5 1 2 4.9e-06 0.00047 11.5 1.2 2 39 100 137 99 143 0.91 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 TIGR01292 TIGR01292 300 1.2e-19 62.7 3.5 2 2 3.9e-18 3.7e-16 51.2 0.0 143 296 272 425 214 427 0.82 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_9 - 181 NACHT PF05729.7 166 1.4e-05 17.6 0.0 1 2 7.7e-07 7.2e-05 15.3 0.0 2 22 2 22 1 37 0.89 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_9 - 181 NACHT PF05729.7 166 1.4e-05 17.6 0.0 2 2 0.045 4.3 -0.2 0.0 77 91 151 177 95 179 0.61 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_9 - 181 UPF0079 PF02367.12 123 0.00019 13.9 0.0 1 1 3.3e-06 0.00031 13.2 0.0 17 36 2 21 1 30 0.88 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_9 - 181 AAA_17 PF13207.1 121 5.7e-07 23.2 0.1 1 1 1.2e-08 1.1e-06 22.3 0.1 1 77 2 94 2 173 0.54 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 1_15 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 8.9e-07 20.8 5.3 1 3 9.5e-09 8.9e-07 20.8 5.3 2 32 101 131 100 138 0.91 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 8.9e-07 20.8 5.3 2 3 0.034 3.2 -0.8 0.2 142 204 311 366 286 382 0.67 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 8.9e-07 20.8 5.3 3 3 0.0019 0.17 3.4 0.1 373 402 374 405 368 419 0.86 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_9 - 237 AAA_15 PF13175.1 415 5.1e-09 28.4 0.0 1 1 7.2e-11 6.8e-09 28.0 0.0 2 46 5 48 4 67 0.90 # 6232 # 6942 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 2_9 - 181 AAA_14 PF13173.1 128 0.00056 12.7 0.0 1 1 1.1e-05 0.0011 11.7 0.0 4 27 2 25 1 54 0.79 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 1_11 - 152 MerR PF00376.18 38 9.2e-15 46.8 0.1 1 1 5.9e-16 1.9e-14 45.9 0.1 1 38 9 46 9 46 0.99 # 8932 # 9387 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 1_16 - 122 MerR PF00376.18 38 3.4e-07 22.6 0.1 1 1 1.7e-08 5.3e-07 22.0 0.1 2 38 6 42 5 42 0.89 # 12310 # 12675 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 9_1 - 254 MerR PF00376.18 38 0.00075 11.9 0.3 1 1 0.00019 0.0059 9.1 0.1 1 18 21 38 21 53 0.80 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_9 - 181 AAA_33 PF13671.1 143 5.4e-11 35.4 0.0 1 1 7.3e-13 6.9e-11 35.0 0.0 2 127 3 130 2 151 0.75 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 18_1 - 106 CENP-B_N PF04218.8 53 0.00035 12.8 0.1 1 1 2.3e-05 0.0021 10.3 0.1 26 47 82 103 67 104 0.86 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 9_1 - 254 PaaX PF07848.7 70 2.8e-06 20.1 0.2 1 1 5.5e-08 5.2e-06 19.3 0.2 15 68 14 64 10 66 0.85 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_9 - 181 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00054 13.0 0.0 1 1 9.1e-06 0.00086 12.3 0.0 1 26 3 28 3 47 0.84 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_9 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 1.3e-05 17.7 0.0 1 2 7.3e-06 0.00069 12.1 0.0 4 24 2 22 1 35 0.87 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 2_9 - 181 APS_kinase PF01583.15 157 1.3e-05 17.7 0.0 2 2 0.0032 0.3 3.5 0.1 34 73 107 148 95 160 0.86 # 6884 # 7426 # 1 # ID=2_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.571 1_15 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 8e-07 21.6 2.3 1 2 3.9e-06 0.00037 12.9 0.3 16 50 94 128 80 131 0.87 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 8e-07 21.6 2.3 2 2 0.00012 0.011 8.1 0.1 19 60 269 310 260 341 0.84 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_4 - 478 DNA_methylase PF00145.12 335 2.1e-79 259.8 0.0 1 1 4.4e-81 4.2e-79 258.8 0.0 1 331 96 457 96 460 0.86 # 1205 # 2638 # 1 # ID=6_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.481 3_11 - 126 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 1.1e-72 235.1 2.5 1 1 3.8e-74 1.2e-72 235.0 2.5 7 131 1 125 1 125 1.00 # 7296 # 7673 # 1 # ID=3_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.526 6_3 - 89 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.7e-47 152.5 0.4 1 1 1.3e-48 4e-47 152.4 0.4 44 131 1 88 1 88 0.99 # 834 # 1100 # -1 # ID=6_3;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 5_4 - 60 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.1e-22 71.9 1.2 1 2 6.2e-19 2e-17 56.4 0.0 35 79 1 45 1 45 0.98 # 1456 # 1635 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 5_4 - 60 DDE_Tnp_IS1 PF03400.8 131 3.1e-22 71.9 1.2 2 2 1.7e-07 5.4e-06 19.4 0.3 115 131 43 59 41 59 0.95 # 1456 # 1635 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.528 1_15 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.015 7.7 6.6 1 2 0.0086 0.81 2.1 2.8 1 30 100 129 100 133 0.93 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.015 7.7 6.6 2 2 0.0003 0.028 6.9 0.1 2 36 273 307 272 359 0.75 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_5 - 180 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 4.6e-05 15.8 0.1 1 2 0.00019 0.0088 8.5 0.0 2 14 73 85 72 87 0.84 # 2966 # 3505 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 4_5 - 180 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 4.6e-05 15.8 0.1 2 2 0.0026 0.12 4.8 0.0 5 15 95 105 94 115 0.81 # 2966 # 3505 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 3_10 - 92 zinc_ribbon_5 PF13719.1 37 0.0026 10.2 6.1 1 1 0.00021 0.0099 8.4 6.1 5 36 8 40 5 41 0.83 # 6976 # 7251 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 1_15 - 562 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 0.00014 14.4 0.5 1 1 2.7e-06 0.00025 13.6 0.1 13 39 277 303 274 335 0.84 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 16_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 7.1e-53 171.2 0.0 1 1 2.1e-54 9.9e-53 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 21 # 725 # -1 # ID=16_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 7_1 - 201 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 9.8e-49 157.8 0.0 1 1 2.9e-50 1.3e-48 157.3 0.0 3 125 73 197 71 199 0.98 # 117 # 719 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 18_1 - 106 HTH_26 PF13443.1 63 0.0006 12.9 0.0 1 1 1.1e-05 0.00099 12.2 0.0 6 34 74 102 70 105 0.90 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 3_9 - 237 TIGR00634 TIGR00634 563 8e-05 14.2 0.0 1 1 1.3e-06 0.00012 13.6 0.0 1 46 3 48 3 74 0.93 # 6232 # 6942 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 18_1 - 106 HTH_17 PF12728.2 51 0.00073 12.6 1.0 1 2 0.014 1.3 2.3 0.1 25 43 53 71 39 74 0.80 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 18_1 - 106 HTH_17 PF12728.2 51 0.00073 12.6 1.0 2 2 0.00011 0.01 9.0 0.1 6 23 83 100 81 103 0.87 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 4_5 - 180 Zn-ribbon_8 PF09723.5 42 0.0033 10.2 4.7 1 1 8.4e-05 0.0079 9.0 4.7 7 35 75 101 74 105 0.90 # 2966 # 3505 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 3_10 - 92 Zn_Tnp_IS1595 PF12760.2 46 0.00016 14.3 4.8 1 1 3e-06 0.00028 13.5 4.8 19 46 6 38 3 38 0.79 # 6976 # 7251 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.533 9_1 - 254 HTH_11 PF08279.7 55 8.9e-13 40.6 0.3 1 1 1.7e-14 1.6e-12 39.8 0.3 1 53 6 55 6 57 0.89 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 9_1 - 254 MarR_2 PF12802.2 62 1.4e-07 23.9 2.4 1 2 3.5e-09 3.3e-07 22.8 0.7 8 54 8 52 5 65 0.92 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 9_1 - 254 MarR_2 PF12802.2 62 1.4e-07 23.9 2.4 2 2 0.087 8.1 -0.9 0.0 26 44 227 245 219 248 0.73 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 9_1 - 254 HTH_5 PF01022.15 47 1.9e-05 17.1 0.4 1 1 9.3e-07 8.8e-05 15.0 0.2 7 45 10 49 8 51 0.90 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 9_1 - 254 TrmB PF01978.14 68 2.2e-05 17.0 0.2 1 1 9.4e-07 4.4e-05 16.0 0.2 15 54 11 51 10 62 0.90 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 18_1 - 106 TrmB PF01978.14 68 2.4e-05 16.9 0.0 1 1 8.5e-07 4e-05 16.1 0.0 19 44 75 100 69 101 0.89 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_15 - 562 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 6.6e-43 139.7 0.0 1 1 1.6e-44 1.5e-42 138.6 0.0 1 199 100 407 100 409 0.96 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_9 - 237 DUF2813 PF11398.3 373 5.8e-05 15.0 0.3 1 2 2e-06 0.00018 13.4 0.0 11 49 12 51 3 56 0.79 # 6232 # 6942 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 3_9 - 237 DUF2813 PF11398.3 373 5.8e-05 15.0 0.3 2 2 0.041 3.9 -0.8 0.1 94 148 126 180 118 226 0.52 # 6232 # 6942 # 1 # ID=3_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.534 9_1 - 254 HTH_Mga PF08280.6 59 0.00013 14.6 0.0 1 1 3.1e-06 0.00029 13.4 0.0 4 44 4 44 3 50 0.94 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 1_15 - 562 DAO PF01266.19 358 6.2e-12 37.8 7.5 1 2 1.9e-08 1.8e-06 19.9 1.5 2 35 101 134 100 161 0.85 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_15 - 562 DAO PF01266.19 358 6.2e-12 37.8 7.5 2 2 7.7e-09 7.2e-07 21.1 0.5 151 239 314 400 274 529 0.80 # 10607 # 12292 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 9_1 - 254 DUF1670 PF07900.6 220 9.9e-05 14.4 0.1 1 1 1.5e-06 0.00014 13.9 0.1 101 203 15 117 7 124 0.79 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 9_1 - 254 HTH_20 PF12840.2 61 5.5e-07 22.2 1.5 1 1 2.7e-08 1.3e-06 21.0 0.1 14 57 9 52 7 55 0.93 # 287 # 1048 # 1 # ID=9_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 18_1 - 106 HTH_20 PF12840.2 61 1.8e-05 17.4 0.1 1 1 4.1e-06 0.00019 14.0 0.1 2 43 29 97 28 101 0.93 # 202 # 519 # -1 # ID=18_1;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.531 1_1 - 371 AAA_31 PF13614.1 157 8.4e-05 15.4 0.0 1 2 0.089 8.4 -0.9 0.0 12 57 89 139 79 175 0.58 # 3 # 1115 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.458 1_1 - 371 AAA_31 PF13614.1 157 8.4e-05 15.4 0.0 2 2 4.8e-06 0.00045 13.0 0.0 108 147 204 242 198 248 0.87 # 3 # 1115 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.458 4_2 - 272 Pterin_bind PF00809.17 210 2.6e-60 196.1 0.0 1 1 6.8e-62 3.2e-60 195.9 0.0 1 209 10 216 10 217 0.98 # 479 # 1294 # 1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 7_3 - 280 Pterin_bind PF00809.17 210 2.4e-58 189.7 0.0 1 1 6.1e-60 2.9e-58 189.5 0.0 1 210 7 216 7 216 0.98 # 1233 # 2072 # -1 # ID=7_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 4_5 - 180 NOB1_Zn_bind PF08772.6 73 0.00038 13.1 0.4 1 1 7.8e-06 0.00073 12.2 0.4 10 36 74 104 71 125 0.75 # 2966 # 3505 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.574 1_3 - 424 DNA_pol_lambd_f PF10391.4 52 4.9e-05 15.7 0.1 1 1 4.5e-06 0.00042 12.7 0.0 5 29 182 206 178 217 0.87 # 2171 # 3442 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/7b4fc6a1-a5e8-4ddd-af1f-e4f48b8bc460 # Target file: checkm_output/bins/pm18/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm18/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/7b4fc6a1-a5e8-4ddd-af1f-e4f48b8bc460 checkm_output/bins/pm18/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:52:32 2017 # [ok]