# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_29 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.6e-05 17.6 0.0 1 2 0.0004 0.051 6.2 0.0 112 146 18 54 9 82 0.65 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_29 - 228 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.6e-05 17.6 0.0 2 2 4e-05 0.0052 9.4 0.0 41 62 162 183 145 218 0.78 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 3_2 - 284 RepC PF06504.6 283 5.8e-159 520.6 0.0 1 1 5e-161 6.4e-159 520.5 0.0 2 282 2 282 1 283 0.99 # 831 # 1682 # 1 # ID=3_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.661 1_6 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 7.3e-06 18.3 0.0 1 3 0.0039 0.51 2.4 0.0 187 220 94 125 59 130 0.79 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 7.3e-06 18.3 0.0 2 3 3.3e-06 0.00043 12.5 0.0 132 231 218 308 202 332 0.82 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 K_oxygenase PF13434.1 341 7.3e-06 18.3 0.0 3 3 0.057 7.4 -1.4 0.0 132 160 346 369 314 377 0.67 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_1 - 155 HTH_IclR PF09339.5 52 1.2e-05 18.1 0.1 1 2 0.093 12 -1.1 0.0 7 18 78 89 76 106 0.74 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 4_1 - 155 HTH_IclR PF09339.5 52 1.2e-05 18.1 0.1 2 2 3.5e-07 4.5e-05 16.3 0.0 15 40 124 149 120 150 0.85 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_79 - 383 ABC_tran PF00005.22 137 3.1e-05 17.6 0.1 1 1 1.3e-06 8.3e-05 16.2 0.0 15 34 161 180 150 197 0.87 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_94 - 503 ABC_tran PF00005.22 137 0.00042 13.9 0.0 1 1 1.2e-05 0.00076 13.1 0.0 13 40 231 258 226 364 0.92 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 2_4 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 7.3e-06 19.0 0.3 1 2 0.045 2.9 1.1 0.0 23 38 70 85 58 87 0.81 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_4 - 187 HTH_22 PF13309.1 64 7.3e-06 19.0 0.3 2 2 2.7e-06 0.00017 14.6 0.0 47 64 166 183 164 183 0.93 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 4_1 - 155 HTH_22 PF13309.1 64 0.00012 15.1 0.0 1 1 1.8e-05 0.0011 12.0 0.1 34 63 124 148 112 149 0.76 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_29 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00037 13.1 0.0 1 2 0.0014 0.19 4.3 0.0 123 138 19 34 8 79 0.73 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_29 - 228 TIGR00095 TIGR00095 194 0.00037 13.1 0.0 2 2 0.00024 0.032 6.8 0.0 53 86 164 199 155 218 0.77 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_23 - 424 HHH_5 PF14520.1 60 0.00042 13.8 0.0 1 1 8.6e-06 0.0011 12.4 0.0 9 37 184 212 172 225 0.92 # 16857 # 18128 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 1_79 - 383 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00083 12.1 0.0 1 1 1.2e-05 0.0015 11.2 0.0 26 46 161 181 145 194 0.82 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_79 - 383 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00081 12.1 0.0 1 1 1e-05 0.0014 11.4 0.0 40 63 159 182 122 227 0.87 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 4_1 - 155 HTH_40 PF14493.1 91 0.00025 14.5 0.4 1 2 0.036 4.6 0.9 0.0 47 47 80 80 26 117 0.57 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 4_1 - 155 HTH_40 PF14493.1 91 0.00025 14.5 0.4 2 2 1.5e-05 0.002 11.7 0.1 7 32 121 146 115 152 0.89 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 4_1 - 155 HTH_38 PF13936.1 44 5.6e-06 19.2 0.0 1 2 0.094 12 -1.1 0.4 7 20 85 98 84 100 0.79 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 4_1 - 155 HTH_38 PF13936.1 44 5.6e-06 19.2 0.0 2 2 4.4e-08 5.6e-06 19.2 0.0 9 41 116 148 114 151 0.93 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_6 - 565 FAD_oxidored PF12831.2 428 3.8e-06 19.4 3.6 1 1 2.9e-08 3.8e-06 19.4 3.6 2 41 100 138 99 167 0.83 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_22 - 209 MobB PF03205.9 140 7.3e-05 15.8 0.1 1 1 1.6e-06 0.00021 14.3 0.0 10 42 11 41 1 46 0.79 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_6 - 565 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.6e-17 57.4 0.1 1 2 4.4e-14 5.7e-12 39.3 0.1 1 201 101 303 101 305 0.75 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.6e-17 57.4 0.1 2 2 9e-07 0.00012 15.5 0.0 93 147 320 375 309 430 0.76 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 NAD_binding_7 PF13241.1 103 4.4e-07 23.4 1.2 1 2 5.4e-05 0.007 9.9 0.2 9 38 99 128 96 184 0.89 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 NAD_binding_7 PF13241.1 103 4.4e-07 23.4 1.2 2 2 1.4e-05 0.0018 11.8 0.1 8 41 270 306 264 380 0.74 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_4 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00013 14.7 0.2 1 2 0.023 3 0.8 0.1 2 12 114 124 113 124 0.85 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_4 - 187 HTH_8 PF02954.14 42 0.00013 14.7 0.2 2 2 1.6e-05 0.0021 10.9 0.0 20 37 163 180 159 183 0.86 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_54 - 208 HTH_39 PF14090.1 70 5.4e-07 22.3 1.1 1 2 0.026 3.4 0.6 0.1 4 39 43 78 41 82 0.86 # 45149 # 45772 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.537 1_54 - 208 HTH_39 PF14090.1 70 5.4e-07 22.3 1.1 2 2 3.6e-08 4.7e-06 19.3 0.0 9 67 149 207 143 207 0.88 # 45149 # 45772 # 1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.537 1_12 - 226 TetR_N PF00440.18 47 4.6e-20 64.4 0.1 1 2 6.9e-21 8.9e-19 60.2 0.0 2 47 19 64 18 64 0.97 # 7397 # 8074 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_12 - 226 TetR_N PF00440.18 47 4.6e-20 64.4 0.1 2 2 0.013 1.6 1.8 0.1 1 16 179 194 179 196 0.91 # 7397 # 8074 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_94 - 503 AAA_19 PF13245.1 76 7.8e-05 15.7 0.8 1 1 2.6e-06 0.00017 14.6 0.1 4 37 222 256 219 271 0.70 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_22 - 209 AAA_19 PF13245.1 76 0.00037 13.5 0.1 1 2 0.00019 0.012 8.6 0.0 20 48 11 35 9 44 0.84 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 AAA_19 PF13245.1 76 0.00037 13.5 0.1 2 2 0.021 1.4 2.1 0.0 42 63 135 158 118 184 0.76 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 CbiA PF01656.18 195 2.3e-22 72.6 0.0 1 1 3.1e-24 4e-22 71.8 0.0 1 158 3 141 3 179 0.75 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_29 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00059 12.6 0.0 1 2 0.018 2.3 0.8 0.0 175 188 18 31 8 71 0.83 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_29 - 228 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.00059 12.6 0.0 2 2 4e-05 0.0052 9.5 0.0 20 46 163 189 148 197 0.78 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_2 - 423 rve PF00665.21 120 1.3e-26 86.3 0.0 1 1 3.9e-28 2.5e-26 85.4 0.0 2 120 173 313 172 313 0.95 # 111 # 1379 # -1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 6_1 - 235 rve PF00665.21 120 4.2e-13 42.7 0.1 1 2 0.03 1.9 1.9 0.0 78 102 27 49 6 54 0.84 # 64 # 768 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 6_1 - 235 rve PF00665.21 120 4.2e-13 42.7 0.1 2 2 1.2e-13 7.8e-12 38.7 0.0 9 119 75 182 70 183 0.89 # 64 # 768 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_22 - 209 YhjQ PF06564.7 244 3e-05 16.7 0.3 1 2 1.8e-06 0.00023 13.8 0.3 4 38 3 37 1 50 0.89 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 YhjQ PF06564.7 244 3e-05 16.7 0.3 2 2 0.029 3.8 0.0 0.0 108 144 69 103 44 113 0.78 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_79 - 383 AAA_23 PF13476.1 202 3.2e-05 17.6 0.1 1 1 1.1e-06 7.2e-05 16.4 0.0 20 40 158 178 144 206 0.85 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_94 - 503 AAA_23 PF13476.1 202 0.00034 14.2 0.0 1 1 1e-05 0.00065 13.3 0.0 19 37 229 247 211 262 0.86 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_29 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.1e-11 38.0 0.1 1 2 2.1e-07 2.7e-05 17.5 0.0 57 114 7 71 2 74 0.69 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_29 - 228 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.1e-11 38.0 0.1 2 2 9.7e-08 1.2e-05 18.6 0.0 4 45 167 207 164 223 0.82 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_94 - 503 AAA_30 PF13604.1 196 2.9e-07 23.5 0.0 1 1 4.1e-09 5.2e-07 22.7 0.0 2 45 213 256 212 263 0.90 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_6 - 565 F420_oxidored PF03807.12 96 0.0091 9.7 4.1 1 2 0.0023 0.3 4.9 1.2 2 31 100 126 99 131 0.87 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 F420_oxidored PF03807.12 96 0.0091 9.7 4.1 2 2 0.0075 0.97 3.3 0.1 1 34 271 300 271 323 0.87 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_4 - 187 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00025 14.3 0.1 1 1 8.9e-06 0.00057 13.1 0.1 15 44 154 182 140 186 0.79 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 6_1 - 235 HTH_Tnp_1 PF01527.15 76 0.00032 13.9 0.3 1 1 1.1e-05 0.00069 12.9 0.3 4 51 6 58 4 63 0.79 # 64 # 768 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 4_1 - 155 GerE PF00196.14 58 0.00084 12.0 0.1 1 1 1.3e-05 0.0017 11.0 0.1 11 35 120 144 118 147 0.93 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_43 - 768 TraG-D_C PF12696.2 128 6.4e-08 25.8 0.2 1 1 5e-10 6.4e-08 25.8 0.2 1 90 437 525 437 558 0.83 # 33195 # 35498 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 6_1 - 235 DDE_3 PF13358.1 146 0.00088 12.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.0027 10.7 0.0 32 90 82 141 59 146 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_22 - 209 MipZ PF09140.6 261 2.4e-21 69.2 0.5 1 2 1.2e-12 1.5e-10 33.8 0.0 2 53 2 52 1 60 0.89 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 MipZ PF09140.6 261 2.4e-21 69.2 0.5 2 2 1.6e-12 2e-10 33.4 0.0 87 140 65 118 58 128 0.92 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_29 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 1.8e-05 17.6 0.0 1 2 0.00031 0.04 6.7 0.0 103 119 17 33 4 88 0.74 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_29 - 228 UPF0020 PF01170.13 180 1.8e-05 17.6 0.0 2 2 6.2e-05 0.0079 9.0 0.0 28 54 163 189 158 221 0.67 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_22 - 209 TIGR00064 TIGR00064 279 0.00029 13.0 0.5 1 2 0.00073 0.094 4.8 0.1 89 116 11 38 1 45 0.88 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 TIGR00064 TIGR00064 279 0.00029 13.0 0.5 2 2 0.00024 0.031 6.4 0.0 153 175 68 90 60 99 0.82 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_13 - 400 TIGR01394 TIGR01394 594 0.0019 9.3 0.0 1 1 2.2e-05 0.0028 8.8 0.0 408 486 267 343 261 354 0.84 # 8153 # 9352 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_29 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.3e-36 119.5 0.0 1 2 2e-15 2.6e-13 43.2 0.0 1 113 21 123 21 133 0.89 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_29 - 228 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.3e-36 119.5 0.0 2 2 5.9e-25 7.6e-23 74.4 0.0 169 228 141 200 128 203 0.91 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_10 - 145 MerR_1 PF13411.1 69 9.1e-20 63.6 0.0 1 1 3e-21 1.9e-19 62.5 0.0 2 67 9 75 8 77 0.96 # 5686 # 6120 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_5 - 121 MerR_1 PF13411.1 69 7e-14 44.7 0.0 1 1 1.8e-15 1.1e-13 44.0 0.0 1 68 4 72 4 73 0.97 # 2391 # 2753 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_79 - 383 AAA_16 PF13191.1 185 1e-05 18.8 0.1 1 1 6.4e-07 4.1e-05 16.9 0.0 25 57 158 193 148 331 0.77 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_94 - 503 AAA_16 PF13191.1 185 0.00012 15.4 0.0 1 1 3.4e-06 0.00022 14.5 0.0 23 54 228 259 217 336 0.87 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_79 - 383 AAA_22 PF13401.1 131 8.9e-06 19.2 0.0 1 1 3.1e-07 2e-05 18.0 0.0 3 44 156 194 153 233 0.76 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_94 - 503 AAA_22 PF13401.1 131 1.5e-05 18.4 0.0 1 1 4.5e-07 2.9e-05 17.5 0.0 4 49 229 281 225 345 0.80 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_5 - 121 DUF977 PF06163.6 127 0.00039 13.5 0.1 1 1 5.9e-06 0.00076 12.5 0.0 27 70 4 47 2 65 0.90 # 2391 # 2753 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_79 - 383 TIGR00362 TIGR00362 437 0.0011 10.9 0.0 1 1 1.5e-05 0.002 10.2 0.0 141 171 161 191 155 199 0.93 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_36 - 283 Methyltransf_27 PF13708.1 194 5.5e-67 218.3 0.0 1 1 5.8e-69 7.4e-67 217.9 0.0 2 194 85 278 84 278 0.96 # 27345 # 28193 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_4 - 187 NUMOD1 PF07453.8 37 0.00069 12.8 0.0 1 1 1.1e-05 0.0014 11.8 0.0 19 37 164 182 164 182 0.94 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_94 - 503 AAA_29 PF13555.1 62 2.6e-05 17.0 0.0 1 1 1.1e-06 6.8e-05 15.7 0.0 20 40 227 246 217 262 0.80 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_79 - 383 AAA_29 PF13555.1 62 2.8e-05 16.9 0.0 1 1 1.1e-06 6.9e-05 15.6 0.0 25 43 159 177 149 185 0.84 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_6 - 565 Pyr_redox PF00070.22 80 4.6e-20 65.1 6.0 1 2 1.4e-06 0.00018 15.2 1.5 1 31 99 129 99 131 0.96 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 Pyr_redox PF00070.22 80 4.6e-20 65.1 6.0 2 2 6.2e-18 8e-16 51.6 0.2 1 74 271 345 271 354 0.90 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_4 - 187 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 4.3e-05 16.5 0.0 1 1 1.3e-06 8.2e-05 15.6 0.0 10 42 157 185 151 186 0.86 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 4_1 - 155 HTH_Tnp_IS630 PF01710.11 120 9.8e-05 15.3 0.0 1 1 2.9e-06 0.00018 14.4 0.0 8 44 117 153 114 154 0.90 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_22 - 209 SRP54 PF00448.17 196 3.2e-07 23.2 0.1 1 1 1.5e-08 2e-06 20.7 0.1 4 98 2 91 1 134 0.80 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_6 - 565 HI0933_like PF03486.9 409 2.9e-08 25.8 3.7 1 2 1.2e-06 0.00015 13.5 2.5 2 33 99 130 98 138 0.91 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 HI0933_like PF03486.9 409 2.9e-08 25.8 3.7 2 2 7.2e-06 0.00093 10.9 0.0 82 164 284 366 276 385 0.83 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_1 - 235 HTH_32 PF13565.1 77 1.7e-06 22.1 0.2 1 1 1.1e-07 7.3e-06 20.0 0.0 26 76 5 50 2 51 0.83 # 64 # 768 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_4 - 187 HTH_32 PF13565.1 77 0.00092 13.3 5.4 1 1 5.3e-05 0.0034 11.5 3.5 7 77 124 182 119 182 0.68 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_4 - 187 HTH_3 PF01381.17 55 0.00054 13.1 0.4 1 1 1.1e-05 0.0015 11.7 0.4 2 31 152 183 151 184 0.86 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_2 - 423 HTH_23 PF13384.1 50 4.7e-07 22.7 0.9 1 1 5.4e-08 1.4e-06 21.2 0.9 3 45 23 71 21 76 0.87 # 111 # 1379 # -1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 6_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 7.8e-06 18.8 0.7 1 2 0.079 2 1.6 0.0 7 27 11 35 7 36 0.69 # 64 # 768 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 6_1 - 235 HTH_23 PF13384.1 50 7.8e-06 18.8 0.7 2 2 9.3e-06 0.00024 14.0 0.1 28 42 41 55 40 62 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 2_4 - 187 HTH_23 PF13384.1 50 3e-05 16.9 1.3 1 1 1.5e-06 3.8e-05 16.6 0.1 10 39 151 183 148 184 0.82 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 4_1 - 155 HTH_23 PF13384.1 50 4.2e-05 16.5 0.3 1 1 1.6e-06 4.2e-05 16.5 0.3 5 39 115 149 111 153 0.87 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_12 - 226 HTH_23 PF13384.1 50 0.0012 11.9 0.2 1 1 0.00024 0.0062 9.5 0.0 10 35 22 51 14 64 0.75 # 7397 # 8074 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_22 - 209 Fer4_NifH PF00142.13 273 9.5e-05 14.9 0.2 1 1 2.3e-06 0.0003 13.3 0.0 8 38 9 39 2 46 0.89 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 2_4 - 187 HTH_7 PF02796.10 45 1.6e-16 53.3 0.3 1 1 4.7e-18 3.1e-16 52.3 0.3 1 44 141 184 141 185 0.98 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 4_1 - 155 HTH_7 PF02796.10 45 1.9e-13 43.4 0.6 1 1 7.4e-15 4.8e-13 42.1 0.1 1 44 110 150 110 151 0.97 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_96 - 432 YjeF_N PF03853.10 169 0.0013 11.6 0.0 1 1 2e-05 0.0026 10.6 0.0 7 70 289 353 284 410 0.73 # 84051 # 85346 # -1 # ID=1_96;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.562 1_79 - 383 NB-ARC PF00931.17 287 0.00072 11.7 0.0 1 1 1.1e-05 0.0014 10.8 0.0 18 49 156 185 145 193 0.79 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_2 - 423 HTH_29 PF13551.1 112 2.3e-06 21.0 2.2 1 1 4.3e-08 2.8e-06 20.8 0.3 13 77 39 109 27 133 0.79 # 111 # 1379 # -1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 4_1 - 155 HTH_29 PF13551.1 112 8.3e-05 16.0 0.7 1 2 0.021 1.3 2.5 0.3 24 55 83 117 63 126 0.60 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 4_1 - 155 HTH_29 PF13551.1 112 8.3e-05 16.0 0.7 2 2 1.5e-05 0.00098 12.6 0.0 4 35 120 150 117 153 0.90 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_6 - 565 Glyco_trans_4_4 PF13579.1 160 0.00025 14.5 1.7 1 1 4.2e-06 0.00055 13.4 0.1 2 26 276 306 276 340 0.70 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 3.7e-05 16.8 2.8 1 3 0.0081 1.1 2.3 0.1 1 41 101 135 101 162 0.81 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 3.7e-05 16.8 2.8 2 3 0.034 4.3 0.3 0.0 134 155 218 241 202 242 0.72 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 NAD_binding_9 PF13454.1 156 3.7e-05 16.8 2.8 3 3 6.6e-06 0.00086 12.4 0.1 112 155 321 366 311 367 0.85 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 GIDA PF01134.17 392 3.3e-08 26.0 6.6 1 3 3.5e-10 4.5e-08 25.5 3.3 2 187 100 279 99 302 0.72 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 GIDA PF01134.17 392 3.3e-08 26.0 6.6 2 3 0.038 4.9 -0.9 0.0 3 31 273 301 271 315 0.84 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 GIDA PF01134.17 392 3.3e-08 26.0 6.6 3 3 0.018 2.4 0.1 0.1 349 385 393 429 387 433 0.77 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 NAD_binding_8 PF13450.1 68 4.5e-05 16.7 1.2 1 2 3.5e-07 4.5e-05 16.7 1.2 1 35 102 135 102 155 0.90 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 NAD_binding_8 PF13450.1 68 4.5e-05 16.7 1.2 2 2 0.041 5.3 0.5 0.2 1 25 274 298 274 303 0.81 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_1 - 235 DDE_Tnp_IS66 PF03050.9 271 3e-12 39.5 0.3 1 1 3e-14 3.8e-12 39.2 0.3 5 132 10 144 6 174 0.87 # 64 # 768 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_79 - 383 PhoH PF02562.11 205 0.00012 14.6 0.0 1 1 2.3e-06 0.0003 13.3 0.0 15 60 153 198 141 230 0.86 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_43 - 768 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 6.5e-07 21.5 0.2 1 2 0.00021 0.027 6.3 0.0 11 32 132 153 126 164 0.80 # 33195 # 35498 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_43 - 768 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 6.5e-07 21.5 0.2 2 2 2.5e-06 0.00032 12.6 0.1 260 332 452 525 435 578 0.75 # 33195 # 35498 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_22 - 209 TIGR01968 TIGR01968 261 2.2e-11 36.5 0.8 1 2 6.4e-11 8.2e-09 28.1 0.5 3 39 2 38 1 42 0.97 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 TIGR01968 TIGR01968 261 2.2e-11 36.5 0.8 2 2 0.00018 0.024 6.9 0.0 100 135 65 100 60 149 0.83 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_79 - 383 AAA_18 PF13238.1 129 8.4e-06 19.4 0.0 1 1 2.3e-07 1.5e-05 18.6 0.0 2 42 161 197 161 242 0.78 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_94 - 503 AAA_18 PF13238.1 129 0.00094 12.8 0.2 1 1 3.4e-05 0.0022 11.6 0.2 1 18 232 249 232 267 0.86 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_23 - 424 IMS_HHH PF11798.3 32 6.1e-09 28.9 0.3 1 1 1.3e-10 1.7e-08 27.5 0.3 3 32 172 201 170 201 0.93 # 16857 # 18128 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 1_29 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.001 11.9 0.0 1 2 0.045 5.8 -0.3 0.0 53 79 4 29 2 32 0.90 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 1_29 - 228 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.001 11.9 0.0 2 2 4.2e-05 0.0055 9.5 0.0 3 31 166 194 164 209 0.86 # 22921 # 23604 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_4 - 187 HTH_psq PF05225.11 45 0.00016 14.5 0.0 1 1 2.5e-06 0.00033 13.5 0.0 21 39 166 184 165 186 0.91 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_79 - 383 DUF87 PF01935.12 229 4.5e-05 16.6 0.0 1 1 1.3e-06 8.3e-05 15.7 0.0 28 51 162 186 161 192 0.83 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_43 - 768 DUF87 PF01935.12 229 0.00039 13.5 0.1 1 2 5e-05 0.0032 10.5 0.0 16 40 130 153 120 168 0.80 # 33195 # 35498 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_43 - 768 DUF87 PF01935.12 229 0.00039 13.5 0.1 2 2 0.082 5.3 0.0 0.1 111 173 640 701 622 729 0.63 # 33195 # 35498 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_2 - 423 HTH_28 PF13518.1 52 3e-08 26.9 0.1 1 1 9.3e-10 3e-08 26.9 0.1 1 46 26 78 26 87 0.76 # 111 # 1379 # -1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 2_4 - 187 HTH_28 PF13518.1 52 6.2e-05 16.3 0.1 1 1 1.9e-06 6.2e-05 16.3 0.1 9 34 158 183 147 184 0.84 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 6_1 - 235 HTH_28 PF13518.1 52 7.5e-05 16.0 1.2 1 1 1e-05 0.00033 14.0 1.2 22 36 40 54 13 55 0.76 # 64 # 768 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 4_1 - 155 HTH_28 PF13518.1 52 0.00013 15.3 0.0 1 1 1.3e-05 0.00041 13.7 0.0 8 33 123 148 117 153 0.82 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_12 - 226 HTH_Tnp_1_2 PF13022.1 142 0.001 12.1 0.0 1 1 1.2e-05 0.0015 11.6 0.0 22 77 24 73 5 79 0.76 # 7397 # 8074 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_10 - 145 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 1.7e-20 66.5 0.2 1 1 6.1e-22 3.9e-20 65.4 0.2 1 65 51 113 51 113 0.95 # 5686 # 6120 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_5 - 121 MerR-DNA-bind PF09278.6 65 0.001 12.8 7.4 1 1 2.5e-05 0.0016 12.1 7.4 1 64 47 108 47 109 0.85 # 2391 # 2753 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 2_4 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 1.5e-05 17.8 0.2 1 2 0.055 7.1 -0.3 0.1 3 18 124 139 123 154 0.71 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_4 - 187 HTH_10 PF04967.7 53 1.5e-05 17.8 0.2 2 2 8.6e-07 0.00011 15.0 0.0 27 45 165 183 162 185 0.93 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_6 - 565 TIGR01292 TIGR01292 300 2.1e-19 62.3 2.9 1 2 3.8e-05 0.0049 8.6 1.1 3 39 100 136 98 142 0.89 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 TIGR01292 TIGR01292 300 2.1e-19 62.3 2.9 2 2 1.1e-18 1.4e-16 53.1 0.0 142 296 270 428 213 430 0.81 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_94 - 503 PhnA_Zn_Ribbon PF08274.7 30 0.052 6.7 6.0 1 2 0.00014 0.018 8.2 0.6 19 29 379 389 378 390 0.88 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_94 - 503 PhnA_Zn_Ribbon PF08274.7 30 0.052 6.7 6.0 2 2 0.036 4.6 0.5 0.6 8 25 408 424 408 425 0.62 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_94 - 503 DEAD PF00270.24 169 0.00093 12.0 0.0 1 1 1.1e-05 0.0014 11.4 0.0 2 41 215 256 214 325 0.82 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_94 - 503 T2SE PF00437.15 272 1.2e-37 122.5 0.0 1 1 2.9e-39 1.9e-37 121.9 0.0 66 269 161 378 97 380 0.87 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_79 - 383 T2SE PF00437.15 272 4.3e-35 114.1 0.0 1 1 1e-36 6.4e-35 113.6 0.0 109 261 142 292 23 309 0.78 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_2 - 423 HTH_Tnp_Mu_2 PF09039.6 108 9.7e-06 18.6 0.0 1 1 1.8e-07 2.4e-05 17.4 0.0 37 101 100 163 83 166 0.91 # 111 # 1379 # -1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 1_79 - 383 NACHT PF05729.7 166 0.0013 11.7 0.0 1 1 1.8e-05 0.0023 10.8 0.0 4 27 161 184 159 193 0.84 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_22 - 209 AAA_17 PF13207.1 121 2e-05 18.7 0.0 1 1 1.2e-06 5.3e-05 17.3 0.0 9 77 11 84 9 205 0.75 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_79 - 383 AAA_17 PF13207.1 121 0.00014 15.9 0.0 1 1 8.3e-06 0.00035 14.7 0.0 3 39 161 200 161 251 0.72 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_94 - 503 AAA_17 PF13207.1 121 0.00022 15.3 0.2 1 1 1.4e-05 0.00061 13.9 0.1 1 32 231 264 231 401 0.84 # 82016 # 83524 # -1 # ID=1_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.548 1_6 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 5.5e-06 18.6 4.7 1 3 4.3e-08 5.5e-06 18.6 4.7 2 32 100 130 99 137 0.90 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 5.5e-06 18.6 4.7 2 3 0.034 4.4 -0.8 0.1 143 204 311 369 297 388 0.72 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 FAD_binding_2 PF00890.19 417 5.5e-06 18.6 4.7 3 3 0.074 9.6 -1.9 0.0 376 402 388 408 377 424 0.82 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_1 - 236 AAA_25 PF13481.1 194 6.7e-25 80.8 0.0 1 1 2.1e-26 9.2e-25 80.4 0.0 48 193 1 140 1 141 0.86 # 137 # 844 # 1 # ID=3_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.679 1_79 - 383 AAA_25 PF13481.1 194 6.3e-07 22.2 0.0 1 1 2.3e-08 1e-06 21.6 0.0 21 73 146 196 127 236 0.80 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_22 - 209 AAA_25 PF13481.1 194 0.00015 14.4 0.1 1 1 9.3e-06 0.0004 13.1 0.0 42 87 10 44 3 90 0.78 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 VirC1 PF07015.6 231 4.4e-09 29.0 0.0 1 1 7.1e-11 9.2e-09 27.9 0.0 3 172 2 164 1 206 0.74 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_10 - 145 MerR PF00376.18 38 1e-13 43.9 0.2 1 1 3e-15 1.9e-13 43.1 0.2 1 38 9 46 9 46 0.99 # 5686 # 6120 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.593 1_5 - 121 MerR PF00376.18 38 1.6e-06 20.9 0.0 1 1 3.9e-08 2.5e-06 20.3 0.0 1 38 5 42 5 42 0.95 # 2391 # 2753 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_79 - 383 AAA_33 PF13671.1 143 0.00078 12.6 0.1 1 1 1.8e-05 0.0023 11.1 0.0 3 21 161 179 159 194 0.90 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 2_4 - 187 CENP-B_N PF04218.8 53 3.7e-06 19.6 0.0 1 1 5.4e-08 6.9e-06 18.7 0.0 17 43 156 182 152 186 0.92 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 1_79 - 383 RNA_helicase PF00910.17 107 5.1e-05 16.7 0.0 1 1 8.3e-07 0.00011 15.7 0.0 2 28 161 187 160 202 0.83 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_6 - 565 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 3.1e-05 16.9 3.1 1 2 0.00051 0.066 6.0 0.8 15 50 92 127 89 130 0.90 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 3.1e-05 16.9 3.1 2 2 2.1e-05 0.0027 10.5 0.1 16 58 265 307 257 339 0.84 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0041 10.0 6.4 1 2 0.0047 0.61 2.9 2.4 1 30 99 128 99 134 0.93 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0041 10.0 6.4 2 2 9e-05 0.012 8.6 0.1 2 39 272 309 271 348 0.73 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 Glyco_transf_4 PF13439.1 177 7.9e-06 19.0 0.1 1 1 1.3e-07 1.7e-05 17.8 0.1 13 40 276 303 272 356 0.82 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_1 - 235 DDE_Tnp_IS240 PF13610.1 140 9.8e-53 171.2 0.0 1 1 1.1e-54 1.4e-52 170.7 0.0 4 139 75 212 73 213 0.99 # 64 # 768 # 1 # ID=6_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.532 1_104 - 214 TIGR00922 TIGR00922 172 0.00039 13.3 0.0 1 1 3.6e-06 0.00046 13.0 0.0 54 104 105 155 57 176 0.87 # 92872 # 93513 # -1 # ID=1_104;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.542 2_4 - 187 HTH_11 PF08279.7 55 0.00016 14.6 0.1 1 2 0.076 9.8 -0.7 0.0 33 47 74 88 72 95 0.66 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 2_4 - 187 HTH_11 PF08279.7 55 0.00016 14.6 0.1 2 2 1.3e-05 0.0016 11.4 0.0 20 37 166 183 162 184 0.91 # 2548 # 3108 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.578 4_1 - 155 TrmB PF01978.14 68 6e-05 16.0 0.0 1 1 8.2e-07 0.00011 15.2 0.0 19 44 124 149 118 150 0.89 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_6 - 565 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1e-43 142.8 0.0 1 1 3.2e-45 4.2e-43 140.8 0.0 2 199 100 410 99 412 0.96 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 DFP PF04127.10 185 0.001 12.0 2.4 1 2 0.00039 0.051 6.4 0.4 28 51 105 128 99 156 0.83 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 DFP PF04127.10 185 0.001 12.0 2.4 2 2 0.0014 0.18 4.7 0.1 32 53 281 302 276 336 0.77 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 DAO PF01266.19 358 5.4e-09 28.6 11.7 1 3 1.4e-08 1.8e-06 20.3 0.7 1 38 99 134 99 190 0.84 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 DAO PF01266.19 358 5.4e-09 28.6 11.7 2 3 0.032 4.1 -0.6 0.1 3 31 273 301 271 307 0.75 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_6 - 565 DAO PF01266.19 358 5.4e-09 28.6 11.7 3 3 9.4e-07 0.00012 14.3 0.5 152 208 314 372 307 433 0.74 # 2771 # 4465 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_65 - 1015 AAA_10 PF12846.2 304 2.4e-31 102.5 0.0 1 1 1.5e-32 4.8e-31 101.5 0.0 8 303 502 898 498 899 0.89 # 55009 # 58053 # -1 # ID=1_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.566 1_43 - 768 AAA_10 PF12846.2 304 1.9e-06 20.7 0.1 1 1 1.2e-07 3.9e-06 19.7 0.1 2 292 137 506 136 516 0.69 # 33195 # 35498 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.542 1_79 - 383 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-06 20.1 0.0 1 2 3.8e-06 0.00012 14.8 0.0 3 27 159 183 157 197 0.87 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_79 - 383 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-06 20.1 0.0 2 2 0.015 0.47 3.0 0.0 193 248 290 348 256 352 0.78 # 70080 # 71228 # -1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 1_22 - 209 AAA_10 PF12846.2 304 0.0002 14.1 0.0 1 1 1e-05 0.00033 13.4 0.0 11 39 11 39 3 66 0.90 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 4_1 - 155 HTH_20 PF12840.2 61 6.8e-05 15.9 0.1 1 1 1.2e-05 0.00079 12.5 0.1 2 43 78 146 77 149 0.92 # 2 # 466 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.527 1_12 - 226 HTH_20 PF12840.2 61 0.00031 13.8 0.1 1 1 3.6e-05 0.0023 11.0 0.0 21 46 30 55 18 63 0.85 # 7397 # 8074 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_22 - 209 ArsA_ATPase PF02374.10 305 5.6e-08 25.4 0.9 1 3 1.2e-09 1.5e-07 24.0 0.1 3 48 3 48 1 69 0.85 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 ArsA_ATPase PF02374.10 305 5.6e-08 25.4 0.9 2 3 0.053 6.9 -1.2 0.0 121 135 69 85 47 86 0.75 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 ArsA_ATPase PF02374.10 305 5.6e-08 25.4 0.9 3 3 0.075 9.7 -1.7 0.0 205 234 132 161 118 202 0.65 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 AAA_31 PF13614.1 157 5.5e-06 19.6 0.0 1 2 2.5e-07 3.2e-05 17.1 0.0 2 42 2 42 1 55 0.88 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 1_22 - 209 AAA_31 PF13614.1 157 5.5e-06 19.6 0.0 2 2 0.055 7.1 -0.2 0.0 109 127 68 86 62 113 0.68 # 16027 # 16653 # -1 # ID=1_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.429 3_3 - 272 Pterin_bind PF00809.17 210 1.5e-60 197.4 0.0 1 1 1.4e-62 1.8e-60 197.2 0.0 1 209 10 216 10 217 0.98 # 1990 # 2805 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b1 (May 2013) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/9fc1fe03-f24d-4a5c-b9c3-eaebe59f9218 # Target file: checkm_output/bins/pm1718/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1718/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/9fc1fe03-f24d-4a5c-b9c3-eaebe59f9218 checkm_output/bins/pm1718/genes.faa # Current dir: /mnt/data/azomer/reads-for-assembly/files/output/allcontigs/output_1512029421078392887 # Date: Thu Nov 30 09:50:23 2017 # [ok]