# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_106 - 213 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.00059 12.7 0.1 1 1 6.7e-06 0.0009 12.1 0.1 12 48 46 82 40 188 0.71 # 78627 # 79265 # 1 # ID=1_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 1_13 - 447 KaiC PF06745.8 227 8.4e-12 38.0 0.8 1 3 0.016 1.1 1.6 0.1 85 142 74 132 35 182 0.61 # 7604 # 8944 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_13 - 447 KaiC PF06745.8 227 8.4e-12 38.0 0.8 2 3 3.9e-12 2.6e-10 33.1 0.1 2 170 191 378 190 406 0.64 # 7604 # 8944 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_13 - 447 KaiC PF06745.8 227 8.4e-12 38.0 0.8 3 3 0.012 0.79 2.1 0.1 64 137 341 412 334 432 0.65 # 7604 # 8944 # 1 # ID=1_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.476 1_36 - 358 KaiC PF06745.8 227 9.7e-06 18.1 0.0 1 1 2.4e-07 1.6e-05 17.4 0.0 13 46 41 78 20 93 0.76 # 30237 # 31310 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_36 - 358 RecA PF00154.16 323 2.1e-47 155.0 0.0 1 1 2.7e-49 3.7e-47 154.2 0.0 22 281 16 306 10 331 0.80 # 30237 # 31310 # 1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_31 - 1174 HHH_3 PF12836.2 65 0.00011 15.5 0.0 1 2 0.0087 1.2 2.6 0.0 19 40 793 814 791 817 0.91 # 23711 # 27232 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_31 - 1174 HHH_3 PF12836.2 65 0.00011 15.5 0.0 2 2 5.9e-05 0.0078 9.5 0.0 17 48 898 930 888 932 0.82 # 23711 # 27232 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_106 - 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